XLOC_000094 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_000094
Unique NameXLOC_000094
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000001:471270..481845-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_000094 ID=XLOC_000094|Name=XLOC_000094|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10576bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001:471270..481845- (Clytia hemisphaerica)
GTCTGTTAAATGACTGCTTTAGGGTCTGTAAATTATTGCTCATTAGTGTT TCAACTCGTAATCAGTAAAATGAAGTTAACATGGTGCTTCATATCATTTT GAATATTAATGAATGTCAACTAACTTTTATAGAGAATGAGAACTGTAAAA ATTATCTTTAAATGTGATAAAACGGATTAAAACAGAAACAAATTAATCAA CCTTTTGTTAATCTTTACAGACTTTATTTAGATGTTCAACCACGCACAGA CTATATCAAAGATTGCGTTTTTACATGCGAAATATGAAAACATAGTGCAG AGTTTTTTGCCAAGGCACTCAGGACTTGTCGTTGAGTCGAACCACCCATT CGACCCAAAAATCTTTATAAACTCAAACTGGATTGTGTCAATTGATTATT TCCTTCTAGATATGAAATACAGAATGATTACTTTGTTCAAATTTATGGTA CTACTTTATGCTGGAAGCCAGGTAATATTTTTTAGCCTATTACAGTTATA AGGTAATTTTTTTGCATCTTATAAATTTTACCATTGCAAGCGCATTGGTT TTACCCATTTCTGAAATCGGCGATTTTTCCTCTAGAGGAGGGTGTATGTG GAGTTATTTGTTACTATAAGTTGCTCTAATGTCGACACCCTTCTTCTAAT TTCAACACCCTTCTTTAGAGATACAGTAGGAATAATTTGGCGACCATCAA ATAATATGCTCTGTTCACATCGCTTGACCAACTCACCTTCAAAACATAAA ACTGGAGTCGGCCCAGTCGTAATAATGCACAGCTGTCAACTTCGCTTTGA AAAAATGAGTGAGAGGCTTCACAAGTCAGAAAAAATTTTCCTGATGATCC AATTTTTCTGAATCGGAAAATCAGGAAATCAAGGGAAATCAGGGATTTTT TTGTCCCAATTTTTCAAATCCAGGAAATTTTGCCATGCCGCTTTTTCAAA ATCTGAATGATTTTTTAAGGGAGGTCGAAAATTTTTAGAGATGCAGGAGA AAATCCTGAAAATGTGGGAGATTTGGCTGAACTTTTTTCCTGCGGGATTT AGGACCACTCATGGTATATACCTCGGAGGGCCGTAAATTAGGTCCAGTTT TAAGGTCAACGCATTTCACTGGATTTATTATAGCAAATTTAAACAGGGTG GCAAGAGATTATATTTTTTGCCAACTGGATTCTTTGGGATTTATTAAATA TAAAAAATTCGACAACATTTGCTACCGACCGACCAACTGAATTTGGGGAT ATNTGGATTCTTTGTGGTTTATTAAATATAAAAAATTCGACAACATTTGC TACCGACCGACCAACTGAATTTGGGGATATTTATGACGCAAACGGAACAT ATTATTGATATACGCCTATGGGAAGGTCGGAATCACTGATTGAAACTATT TTTCTTTGCTTAGTGATGAGAGAGGAATAAATCTTTTGTCTATCAGTGAT TCTGACCTTCCTATTATTTCTACCTCTAAAGAAGGGTGTCAAAATTAGAC CAACTTAGTATTCAATATATCACGTTCTCCTAAACAACTATTCATCGTCC AGATATCCCAGGCTTTGTTTACATTACTGATTGACGCCAGAGAATACCCT GGTGTTGGCTGATACAAGGAACTTCTCAAAACAATACGTCATAAAAAAGT CTGCCCTTATAAAGTTACACTGCAATGCAATGGTTTCAAACCCAGAAACA AATGAAATCTGACGTTTTGTTTTGAATTACGTAATCTTATGCGTTCGAAA AACAGTAACCAATGCCAGGGTATTATCTAGCACTATCAGTAAGCATAAAA AAGCTGATAAATACGCAGTTAACAAGGTTGGCCGCAATCAAATACCACCA TTCCACTTAAGATGGGCCAAACCTCCATCAATTGTTTAAACCTCCCCTGC TCTAGTGTAACTTGTAGAGTTTTATTGGAGACTATAAACCAGCTTTTGCG AGAATAAAAGTCTTCTGGAAAACAAAAAAGAAATCTAAGACACCTGTAAC ATTTTTTCTAAATCGGAGGATGCAAAATTGAAACGGTGGAATTTAAAAAG ATGGAATTTAAAAAGATGGTGATGTGGCAATGTATTATGAGTTTCTTGCT TGTTGCCTTTCTAGACAAGCTCCAAAAGGACAGATTTCAAGTAAAAGCCT TTTAAAACAACACAGTTAAAATGTAGATACCAAAAGAGCGAGTATAAGAA GAAGACATCAGCAAAGATTTTTATTAAACATTTAAAGAAGGGTCTCTGAA TCTCTACATGCATTGAGCATGGGACCTGTGCATTTTCGTATTCCTCACAC AACTTTTGACCAATTTAATCATTCGCCCATTTTTGATTTTCAGAAAAGTT TCCACTCATTTTTCCATTTGCCTGGAAATAATAGAAAATTTTTTAAACCT TAAAATCTGGTTAAAATTTAAAAGTTAAAGTTTTATTTAAAAGTAAATTC AAAATCAATAACTTTCTGCTAAGTTTGATCAATTGATTTTAAAAAATTAG GTCAATTAAATTCTAATAATAATTTTATTTGTTATTTTTCAGGTCTTGGC TCAAACCAATATTCGAAAAGATGGCTATTGTGTCATGTATGGTCAGATGG CACCAGGAACAGAAATTGTCAACCCTTACAATGGACCTGCTAAAAACTTT TCAGAAGAATCTTATAAAATTCTTGCAGAAACATGCCCACATCTTGCTCA TGGAATTAATGAAACTGTTGGCTGTTGTGGTATTGGTCAACTTAAATCAT TGGAAAAGAATTTGAAGACTGCAGCCACCTTGTTCTCTAGATGTCCCTCT TGCTCTAAGAACTTCTATAACATGTGGTGTGACTTCACTTGTTCACCAAA CCAATCAGAATTTATGGATTATACCTATGGAATGGCTACTTATTATGTTT CTGATAAGTATGCAAATGATCTTTATGGCTCTTGCAAGGATGTCACATTT CCTGGAAGCAATGGAAAAGTTATGGATTTGATGTGTGGTACAACTGCCAA GTTATGTACAACCGAAAAATTCTTGAAATTTGTTGGAACACCTGGAAATG GAGCTCCTTTTAATATTATGTTTAATATTGGACTCAATGTGTCAGGTGTT GAAAACCATGACGCACATATGGTTGGATGCAATGAAACCTATGCTATTTC AAGTGATAAAAACAGTACTGTTTGCTCTTGTCAAGATTGTCAACCTTCGT GCCCTGTTCCTCCTTCCCCGCCACAACCAAAACCAATCAAATACATCATG GGAATCAGAGAAACCTATTTCATCACTGGTGTTGTGCTTCTTGTTTGGGT CTTTGTTTTTCTTGCTTTTAGTGTATTTGAAATCTTTCGATCTCGTGATT CTTCTCTTGAGGCACGCGCTGATGCTGTGCACAGTGGATCGGTATCTTCT AATGGATCAGGCTATCACAATTCAACTACAGCCTTGTATGGTGGTTATCA GCAAAACCCTGGAAAATGTGTTGGTTTGGGAATCAAAGCTGAGGAATTTC TGCAGAAAATCTTCCAGAAATGGGGAACGTTATGTGCCAGTCATCCATGG AAAGTCATTCTTGGTTCACTTTTCTTTATTCTTGTTTGCTCTTTGGGACT CTTGAAATTTACAGTCATCACAAACCCAGTTGAGTTATGGTCGTCACCAA CTACCCAGGCAAGAATGGAGAAGAGCTATTATGATGAAAAATTCACCCCA TTCTATCGTACAGAACAGGTTATCATCACCAGCACTGTAAAAAATAATAC AGAAGAATTCTATCCATACCAAGTTTCATCTCCAACAAACTTTTCTGGGA TCATGACTAAAGAAATGCTTTTTCGAGTAAGTATCATATTCTTTTCTCAA AAGGCTTTGAAAACCAATATCTCTTTTCTAGCGATGCTATCAAGCCAAGG TTTACTTCCATCTCATTACTATTTTTCAATAGTAACAATAAATCAAACTT AAAAAACAAACAATATAACATTATTAAAAATACACTTTTCAGGTTCTTGA TCTTCAACTTGATCTGATGAATCTTACTGCTGAATACAATGGAGAAACAG TTGCTTTGAATGACATCTGCTATCAACCACTCTACCCTGATAATAAAGAT TGTGCTGTCATGAGTGTTCTTCAGTATTGGCAATTGGATGCCAAAAAGTT AAACATGTGTATAACTAATATGGATTCAGACTGTTCTGCCGGTTTTGGTT CACGTGCTGCTGATTGGCATGACCAATTTTCTGGTTGTACCAAGTAAGTC TTTATTATGCCAATTTTCACAAGTGCATTTAAAACTGTATGAAATTAAAA TGAAGTTCAATTTTTGGAACGCCATATAATTAGATAAAGTCTTTCATAGA AATTCAAATTAATTTTTCCCTCAATTTTAACTTGAGATTTATGGGAAAAT CAAGTTTTTCTTTCATACATAATAATGCAAAGCAAATTTCTTATGTCTAC AGAAACCCAACTGCCATGGAATTGGAACCACACATGAAATTACCTTGCAT GGGTAAATTTGGTGGACCTGTCACTCCTAAACTTGCACTTGGCGGTTTTG AGGGCGATGACTACAGCACTGCGACAACACTCATCATTACTTTTGTTGTC AACAATCACAGAGATGAAAGTAAAAATAAGAAAGCGGAAGCATGGGAAAA AGTGTTTATTGATTACCTTAAAAAATGGGAGCAAGATCCGGAGTTGAGTG CTAATCTTACCATAGCATACACAAGTGAAAGATCAATTCAAGATGAAATC ACACGTGCCAGTGAATCTGACGTCCTTACGATTGCTATCAGTTACTGTCT TATGTTTTTGTATATCGCTGTTGGTCTAGGACAATTTCGATCGCTTAGTC GTATGTTGGTGAGTATAAAAAATCTTTTTTGAGGAAAGAAAATATTTGAG GAAATTTATATACATACATAGTTTTGATCTAGGTTTGATAGGTCTTAAAA GATTTCAACTTGTAGATTTAATTTAAGAATAAGGTTTTTCTTCTAGATTG ATTTCTCAGTTAATGTTATGCAACACTATTCTCTATTTTCAGATTGATGC AAAAGTCACAGTTGGTATCATTGGTGTTTTGATTGTCTTGCTTTCTGTTG CCGCATCATTGGGGGCTTGTTCATACTTTGGTACACCAGCCACATTGATC ATCATTGAAGTCATTCCCTTCTTGGTTCTTGCTGTTGGTGTGGATAATAT CTTTATTTTAGTTCAAGCTCTTCAACGTGATATCCGATTGCCAGCTGAAA ATACCTCAGAACAAGTTGGACGTGTTGTTGGTGTTGTGGGTCCAAGCATG CTTCTTTCTTCCCTCTCTGAATCTGTTGCATTCGGTTTCGGTAAGTTTTG ATTGTGGCAATTTTTTATTATCTCATGAATTTTTTTGTGTGCTCAACAAT GGCTGAGACAATTATATTTCTAACAAAGTTTTTTCTTTACTCAATAAGGG AATTTCCTTTTTTAAGGGTTTATGAATAAAAAATGTTGTATCCAGAATGT ATCTAAAATGAAACGGTTTATTTGAAAATGATATTGATTTTCTTTTTCAG GTGCCCTTTCAACTATGCCTGCAGTTCATACATTCGCCGTTTTTGCATGC TTTGCTGTATTTTTCAACTTTATTCTTCAAATGACAATGTTGGTTGCTGT GGTAACGTTGGACAAAAAGAGACAAGATAACAGCCGTTATGACATCTTGT GTTGTGCATCGGGAGATAAAAATGCTCCAAACAGTGAAGAATGTTGTGAA GGAGGAGTTCTACACTTTATTGTCAAGAAAATTTATGCACCCACTCTTAT GTTATACCCAGTCAGAGTTACCGTTGTAAGTATCTTGATTGTCTTTTTCT GCAGCAATTTCCAACTTTCACGGTCCAACTTTCATTGAATTCACTTCCGT ACCTGGTCTCATTGGAATCCTTCTGATTTTTATCTCTGTGAATTAAGGAA TGTCCTAATATGACTTGGACTTAATAAATAAATTAAGTTATATTAGAAGA CATTCCATGACTAATATAAAAATGATCACAGTGCTATTGCCTTTATCAGA CATTTTACTGGCCTATTTGGTATTGTTTATTTCCAGTTATACAGCAATAA CTGTTGCTCATTACTCATAATCATTAGCCAAGTAATATATTTAATTCAAA GAATAATCTTATTGAGACTTCACTGACCCAAAATGTATTCAATTTTATTT TCAGATCTTGGTGTTCTCCATCTATCTCGGAATCAGCGCCTGTTTCATTA CAAATCTCAGTCTTGGAATTTCTCAAACCATTGCTCTACCTAGAGACTCT TTCCTAATGAATTATTTTGGAAACTTGTCAACATACTTGAAAACTGGTGC CCCAGTATACTTCGTAGTCAAAGATGGATTTGATTACTCAAAGGTTGAAA ATCAGAACTTATTGTGTGGCTCTTCAGGCTGTAATAGTAACTCATTACTT GGAGAAGTGTTTTTCAGTTCGTTGAATCCCAACTATACATCAGTAGCATT GCCAGCTTCATCTTGGCTTGATGATTACTTTTCGTGGTTGGACCCTGACG TCAAATGTTGTCGCTTAAGAAATGGTAGCACTCCACTTAACATGAACTTC TGTCCAGCAACAGATCCATTAGAATGGAGGAATTGTACCTCTTGTTTACC GAAAAACGAATCAGCACAGAGACCACGACCAGCTGAATTCAGGAAATTTT TGCAACAATATTTAAAAGATAATCCATCTAAAGATTGTAGTAAAGGAGGT CATGCAGCTTACGGAGGAGCAGTTAAATTGAACGCACCAGTCGATGGAGA ATATAGTGTGGATGCTTCCTACTTTATGACCTATCATACTGTATCAACAA CATCAGATGAATTCACACACTCCATGAAATATGCTCGTGAATTGGCTAGC AACATGACAGAGCGTATCAACCACGATGTTTTCGCATACAGTGTTTTCTA CGTGTTTTATGAACAATATTTAACCATTGTCAGTGACACTTGGAAAGATT TATTAATCTGCGCATCTGGTGTGTTTGCTGTCACCTTCTTGCTTATGGGA TTCAACTTTGGATTAGCTTTCTGTATTATTGTGACGGTTGCCATGATTGT TGTAGACTTAATGGGGTTGATGTACCTCTGGAATATAAGCTTGAACGCAG TGTCATTGGTCAATCTTATGATGGCTATTGGTATATCAGTGGAATTTTGT GCGCACATTGGCCGGGCATTTAGTACCAGTCCTTATTCATCACGTGTCAA GAGAGCAGAAGATGCCCTGGGCACTGTTGGTAGTAGTGTAAGTATTTTTT ATATTTTTGCAAAATCTTATATGATGTTTTGATGAACCCATCATCAAGTT TAGAGCTTGTAATTTTCAAATGTGCTGTTTATGGCTATGTATTAGAGGCT TGTCGCAACATTTAGGATGTGCATCTTTCAGAAATTCTTCCCTATCAATC TGGGGCAAACATTATGAAATGCCACATTCTTATATTTGAAATCTCAACAA AAATTTTTTGTGGTTTGGCTTGAGGTGTTGAAATCTCATGCAATCTCCGT TTGTTTTTGTTACTCAATAACATTTGATATTTTCATGTCATCTCGTGATC TTGTTACCGATTCTTTTGTTATCGTCATGCTAAAAGGTTTTGTAATTATA ACCTCACCCTATGTTTGTCTTGGATACATGTTTCATCACTTTAAATAACT CTCAAAGAAAAATTGACAACTTGTTTAACACAATTTTTTATAAGCAACTA TGTTGGTCTAATTTTTCATCTCGTAATTAAAAGCTTTTTAGATAATTTAA CCATTGCAAACGATAGCTTTTGACCCAAAAAGCATAATGTAGTATAATAT CAGGGTTGTTAAAAAATATAAGAAAATAGCCAGAATGTGTGACCCGAAAA TTGTAGTTGCTTATAAAAAAAGGTTTTATTCTTCTTTTGTTTTAGGTATT AAGCGGTATCACTATTACAAAGTTCGTTGGAGTCTTCGTATTGTGGTTTT CGAAATCCGAGCTTTTTGAGGTGAGTGTCAACATTTTAAAACATGCCTGT TTGTTTTCTTGAAATATGACCTGTTCCAATGGGTTTTATTTTNTTTAAAC ATGCCTGTATGTTTTCTTGAAATATGACCTGTTCCAATGGGTTTTATTTT TGTTTTATTTTCTGACACTCGTGAGATTGGCCCAATCAAGAAATTGAATC TATCGTTGCTAAAATGTAACATGCTCAAACTAAGATAAATCTTATCAGAT TCCACAGTGTTCAAAGTTTTTCCGTTTCAAACGGATTTCTGTCTCAGCGA GGTACAAAAAGAGGCTTTTCCGTCTCCGAATTCAACAAAATTTCCATAAA ACATGAAGAATCTGGCCAGATTTATTGTTTGAAAACCATTTCCGTCTGTG ATGAAAGATTTGCTTTGACCACTGATTCCAATGGGTTTTTATTTTAAAAG AAAGAATGCCATCATCTGGAAGCTTATCAGAGATTGATCAAGAAGTTGAA TCTATTGTTGCATAAATGCTCAAACTATAGTAAATCTTATAAAGGGTTTG AAATTTTGACGACCAGTCGAGAGATAAACAAAGTATCTGTACAAAGAAAC AGAATATCTATCAACCTCAAACATGACAAATAAATCAAGCTTAAACATGT TTTTATATTTACAAAGTCATATGTTTGATTGACCCCCAAAGCACTAAAGA GAGAAAAAGGCCCACATAAGAAATGCCACACACATCACGCGATAATGTAT CAAATTCTTATCATCAAATTCGATATTCTTTTCTTTACATAAATTGGTTG CAAATGGCTAGAAGCTAACCTTTGCACTTTTTGTCGGTCGAACCCGAGTT TGTTCGAATGACGTTTTGATGCCGCCCGATTTTTGAAAATCGGAAGTTTT AGGGTAAAAAAATTGAGGAAAGAATTCGAAGGGAATTTTTGGCTCTGTGT CATATCCACTACCTTTTTGGATAAACCTTTGCTATAATAACGAAACTTGG TCTATAAATAAGAAGCAAAAAGCTCATTACCTTAAAGGGAAGAAATTTTG GAATCGGCCGAAACCCACAAAATTCATTTTTTCCCGCCATCTGCCGAATT AAATTCCTGTGAAATTTAAATTATTGCATTCATTCCCTAAATGTGTGCTA TTTCAGGCCTTAGAACAGGTCTTTTCTTATTTGATAGCGTTTTTGGACCA AAAATATTATTCATCCGCCAAATTGAATTCCCCCTTAAAAAACTTTTCCA TCCATCTTTCCTAAGGCATGCTTCACTATACTTTTCATAAATTACGTTAC GAACATCACGTTTTGAAATTATTGCCATGGTGATTAACTCCCAGTGGATT TTATTAAAAGTACATGTTTTTTTCTTTTATAAGCATAACGTTTATAAGCA TATGCAGGCTCAGTTTTGGGTACCTAAACAATGGCTCTATTGTTTGAAAA CAATAGAATGCTAAGCATAATGCGAGCCTGATGTAGGGGCAGGCGCTTAT TAAAAAAAAACATGTACTTTCTTTTCAAAAGAAATTATTTAATGTCTAAA GCGACATAATCACCATGGTAATTGTTTGAAAACGAGGCAAGTGATGTTCG TGACATAATTTATGAAAAGGTCTATTAAATTAGGGAAATCTGAAGAAAAA CTGAACAGTACCATTTATCGTACAACATTATCTATATCACTGTATAACTA TTATATTCCTGTATAATTTCTATCTTCCATGTACAACGCTGATATTACTT ATACCCTTATAGCTATTATAAACGACTTCAATGTCAAATTCATTCATAAT AATTCCACCTTTCTTTTTATTCTCGTTCACAGATTTACTACTTCCGAATG TACATGGGTATAATCATTATGGGATTCCTTCACGGGCTCGTCTTTCTACC CGTATTTCTCAGTTACGTTGGCCCGGCATCCCGTGCAACGGAAGAAGACG TTAAACGTGCCTCCATGGCAACCAACGCCCATCCAGCTGCAAGGGAAAAG AAATTAATAAGCGCGTAAAAAAACTTAAAAAGAGTGAAGTTTGTGTAAAA TTAGTAAGTATTGATTGTCCGGGGAAGGTGAAAAATTCGTTGTGTCCGGA AATAAGCCGATCTGAACTTGATTGATCAAAATCTTTGAGTTTGAATTTAT CATTATGAGATGCTAGCTCTTTCTTTTCCTGTCAAAGTCATTTCTGAATG AGTGTTATTCATTGATTATCTTAGAGACCTCTGATTAGCGTTCTAAACTT CATCGGACAATCTGTACTTATAGCATTTTTAATGTTTTTTTTTTAATAAT ATAAGTAAATCAACTAAAATGATATAGGAGATAAAATTTTGAATTTTAAC TATAAACGTAGAAACTGAACGTAATTAAGAATTTTATTTTTAAGTTATTT TGTGCCATTTTTTAAACTGTTAGCAGTGATTGTTTCCAGTTTTCATTTTA GCGAAAGCCAAGCCAAGATTGAATACTAATGAGTACGGGTCTTAGATAGA TCAAAATACGTCTCTAAAAATTCGAACGGGGAGACAAAGCTAAGGTTATT TCCACTAAGAGCCCCCCCCCCCCCCC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00000162TCONS_00000162Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00000162-proteinTCONS_00000162-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000001supercontigsc0000001:471270..481845 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
NPC1PREDICTED: Niemann-Pick C1 protein isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
49.99 47.76 101.34 111.91 142.76 104.17 138.57 168.9 246.13 214.25 492.48 209.76 203.01 214.46 167.97 243.85 139.35 207.13 174.23 223.1 404.35 444.52 104.83 129.6 424.91 405.15 100.58 99.48 336.44 272.12