|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000025:961699..972865+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_001738 ID=XLOC_001738|Name=XLOC_001738|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11167bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000025:961699..972865+ (Clytia hemisphaerica)
atcctctctaaatcgaaatctattggaattaatagggtattttcttattc
ctaatgaactaaNCATGTCAAACTACATGAAGCAGAACGTGCAGCAGAGG
CCCAAGGTAAGTGTTTTTATAAAGCAAACTATTTTACACTCCAAAAAGTC
ATGATCTCTAGTATTATAAACAGACAATCATACAGTTTTTGAGTATTCTC
AATTCTCACCATGATATTTTAAGCCTTATCcaattttaataatttatacA
GCTCCCTTTCTCTGAATACGctcaaaaagaaaatcttatgtcaaaaagaa
aaaaagttttctccaATCTTAACAATAGNaatagtccatttcaatattta
ttgttctaagttagatattttaacgaaaatgtttgacctaccttttgggg
ttagttgacctacaatttgggggcCTTTGTAACTCGACAtaaaaagtttg
tcaaattatataaaacttttttgttgtactttcataacatgaaagtatta
cctgagagatgattaatgttggcattttaagcttttacTACGTGTCCCAG
ACCANAACCTTTCATCAATGGGTCTGTTAAAGCTTTCTTTGAAGAGAAAA
CCTTATTGAGTAGTTATTTatcaatttgtttttcttttgaaatgtcTTAT
CTTATCAGaatattttgattaattttatctactttctaaTTTGGAGtatt
cttttttaaatgttgTTTGGAATTTACTTTATGACTTTATGTTTAATTCA
TTGCATAGAAAATAAAGACCAAAGAGTTGTAGAGCAACCACCCTCGCCAT
CAGATGATATAGTAAAAGAGCCTCCAGATGAAGAGAATTCAAACGGTGAA
AACAAAAAGCTGCAAGGTTAGCTTTGGATAGCCGNATTTTAACACAGAat
cttcaacctacaaaataaaaacaactttcttgtctcttcttttcgtcctt
tcttttacttttcatcatttgtagcactataaaattaatatctttgttaa
ttttttgtcagagtatatttctaaagtatgaatttcacttagagaacaaa
actttccgatgaatactgaaatttcgctctcagcaaccgaatcttttcac
ctacattcttgGGGCTAAgagcgaaaaaatccaattttcagaataccaaa
agctctttagaatattgttttggcaaaaaatatttctaaaatttcctgtt
ataattaattcaattgaaaaaatatcaacattttactataaCTAGATTTA
AAGCCCATAGTTCgaccccccccctttcttaaggggggggatgacacctt
ccaaaaaagtgaagaatcagggggatcagaaattttcattaaaaaggggg
ggatagcaaggaggggggatcgtttaagaaggggggcttacatatattgt
aagttattttccagcactgttatgaaatttggtctgcatgaaaggaagtt
ctttattttcactaaaaagtggtatatatttgccagacttaatttttctt
tactgtttcccctccctttttaccataaaaaatttagcccaaaacccttg
ggggataggcatttttaaaggttgtgGGGATGTCAAAAaggggggatcat
ttaagaaggggggggggtcagacccctttccgcactatgaagccataaaa
ccaaacctacattctgggggttataacgatAATTATAAGTCAacttcaaa
gaccaaagaaattagcctatctatcaaaagtaatgaaactaacccctggg
aaaggattttgggagttcaaatttcgtttaaaacattcaatattttttta
aatgcaaatctacatctctcaggtctgattcaaatttcacctacattctc
ggggtcaggtgctgtaatattttgattatttttataatcagccaacttgt
ttcattgttttcaactagtcggaactaactatcatctgttttcaagtggc
aagtggaatgttatagtaggaatcggaatcttacgtgatcctacggtaag
ggtctcaaaatcagaactgatgaagtctaggtttgaaaggactattttgc
aagtataagctttaaaacgacGCTTTTACAAGGAGGACGAGAGCAAATGC
TTGCTTTGTTTGATTACCTATGTTGTGTGGGAAATGCGCAAGGCTCAGAA
GGTTTCGATTTCGAACTCGAAAAgaatacaattttcaaaaaagaattccG
GAAACAATGTTGTTAGTACCACTATTCAGCTGGACATTTATTCTAAATAG
TTCAATAGAGATATCTTTGAAATTAGCCTCGATCCCTTTAAGAGGGCGCA
ATGGCGGGCGTGTGGTGCGAGAAAACAGCAGCAAAGCGCCTGTGTTGGCC
GTGTgataagtatttgcaaaaagctgtttGCCCCTCGCAGGGGTCTGCTC
ACCACCGTNNGCAATTTTAGATACCCTGTCAGTAATTCTGCAacactgaa
aaaggtaccctgaccagcggcacgtccccgtacctatttttgcctaagtg
ccccccccggggccgaaataattttattttgaagcaagTTGTACAAAAAT
GATAGGTATTGTAATGTCTTGTGAACTGAGTTCaggcaattaaaatttta
attgaaatggTGATGACAAAATATAATATAACACACATGTTATTGTATGC
TTGAATGTTTACCATAGATTCCAGTGATTCAGAGGAAGCGCGTGATATAA
CTGAACAGCTGACTGAACCCATTCATCGACAAGACAGCAAAACAATTGAT
GATAGAGAGATAACAATGGATAACACATTGTCAACAACAATTGAAAGAAG
TGATGGCGTGATAGAACAAAATGGTTCTGATGCTGGTGAGGATGATTTGG
ATGTCAGGCATGCAGTAAATGATGTTGATGAAAGAAATGTCgaaaaaaac
gatcaaaatgATGGTATAGTTTTGAATTTAATAAGTAACCTTTTATTGTT
TGAATATTAATTTCTAAAATATAGACTTCTCTCTAGtttagacagccaac
ttttTGCCATGGCTATTTTAATTTGCTTCAGTATGCAAAAAGTGTACACA
AATATGACAATTAAAAGCTTTGTTTAGAAAAGATTGacagaagtcattgc
attggcGCCAAAGGAGGGAAATGCAGTATTTACTTTTTATAGACAcccaa
tattttggccatttgaATTCGTAGGGGGGGAAATTGGCCGTCTAAAAAAT
TTCTTCTCACTTGCAAAGTAGTCATGGCGCATACTGTACCTAAAAAATAC
CTCacacaattttcaaaactttcaagtTGAATTATGTTTTGTTATGAATT
AtgaagtttttgtaaaaaagctgATTATTTTATTTCCATTTAATTTAAGT
GAGGGCTGTAGTGAGATCACCTTCACCCTGTGTCTCAGAAGAAATCCCTC
ATCCATCACCAAGACAACCAGAAGAGGACGAAGATGAAAAACCGATTCAA
AAAATGGATGAAGAGGGGTATGTTGAAGATAAAAGACAGATTGAAGCAGA
GGACAACAATATGGAAAGAAACGGTGTTAAAGAGGATGAAATTGAAGCTA
AGAGCGGTGTTGATAGTGATGCTGGCGATGACAAAGAAAAGTATAAACCC
ACCattattcatatttttttcaaacatcaGATTTCAAACATTGTCTTTCT
ATATTTTAAAAGTGATTGCTAAAACAATGCTTGTGTTTTGGTATCAAGGG
GTCCTGCCCTGTTTTTTCGAGTACAAATGGCAGTAAAAAAGATACTTATA
ATTCTTTGCTTTTAAACAAATACTTTTGCTATATGTAAAAATTCTTTTAT
AATCTAATTCCTTCGTTTTTTTAGGAGTGAAGAAGTGGATAAACCAATTA
CGTCAATTCTTCACGAAGAAGAGGCATTAGATTATGAAgattttgaagaa
gaagaaaatattgttcaaggtaaaataatatttcaataaaaaaagttttc
ttcaaaaagccctttttttgtagttttttttgtaatggacgggaatttta
tacacgatacgtaTCCCATATAtcaaacatatcagaggggatgtgagAAT
CCTATATTTCCTCACATGCAAGGATGACGAGATATAATTGTTGTGAAATG
TAAATAATGATTGCATTCTAAGAACAGATACAACAAATTCCTTACTCAGC
TGACTTGCATTTAAACAGATCTTATTTTTTGAGTCAGTCATTTGTATGGG
CTACTTAGTATTGGTACtttagtatttattttttttgtatttaggTTTTG
CACTCTATTTTTAAGTATAATAGGGTATCAAGCTTAAAATACCTCAGTTG
TGCTctagaaataagaacatgattttaaagaacaatttaaagctcaaaat
gtcaaaaaaaagaactTCCAAACGTCGCCAAAAAATCtactgtttttttt
aaagagtgtAATTCCTTTTACTTCATCCTAAGGTTTGGGTCAGAAAAGTC
TTTTATTATCTCTTTATCTTGAAAgaatatatttcttttttctattgatA
AGCTCTGGAAGTAGCTTGGGGATTATTATATTGATTTCTCTTTTATTAGC
AATTCTTTCTTCCAAAACTAGCAAGCAAACAAAAAGAGAAgaataaaaat
cttgaaatgaaaaataaaggaaaagtTGAGAAACCCAGAGTTTTACTTAT
AATGAATTTCTACTACGAACATGGAAAACCTTGTCTGATTACTGTCTTCA
ATTTTATATTCGACGACTTGAGTTTGTTTAGTATTTGACAttgtttttgt
tcaaaaaatattttcgggcAGCATATAGAGGCTTGTTTAGAATAGGCCAA
GACTCGTTTGTCGTTTGTATCCCTTAAAAAGCAACTTTTTGTGTCACACA
GAGAAAATGCCACAAATCGACGGTGAAGAGGAGGAAGATcacaaagaaga
agaaaaggaagaccAAAATAAcgaagaagagaaagaagaaaaagacgAAG
AAATGGAGGAAGGGGAAGTCGAATCACCGACTGTCAAAACACAAGAAGAA
AAAGTAGAGAAACCTCAACCGGTCAGTTGTCCATCCCTCTGTCTATATAT
CTTTTCGTTTCAGAAATTCGTCTACAGGCTATCTCAAATATAATCTACAG
CAGaaacaaaaaaggctgtaacttctGATTAAGTAGAATCAAAAAGCGAC
TTTGTGCTCATTGAAAAGGTATTCAGAAtatttcatagatttttttgaGA
CATACATTCAGTTGGAGTTTTTGTATCTCCTTAGATTCTTTCTGATTCCC
TTTCTAAAAAGATTATTATTAAGGAAAGTCACTAAAAAGTGTTATTCACC
TTTCGGAaccattttcttatttttttttagaaacctGTACAGTTGAAGAA
AGGTCGTGTTTCGTTGGCAGGTAAGATTGATctggaaaattttgagtttg
aaaGCTAAAATTGATACAGCGCTCATCCTCTACCTAACAAGAAGATGTCT
GtttttatcattattacatGGGATACCAAGTTATCTCTTgacattgaaat
atttattttgatttctaGCTTCAACAGAGACGGCCGAGGAGAGGGCAGCC
AGACGTAAACGTCGATGGGGCTCAACTACTTTGAAAAATTCATCTGCTCC
CGTCAGTTCTGATTCTATCAAGGTAAAGAAATCAACCACCACTTTAGTCG
ATCAAACCATTTATTCCTTTGCTTAAAATGTATACGCCTAAACGATTGTT
GTACTGgaggaaaattacaaaatggtAATTTTTTATTGTCCAATACACAA
TTACAATCTATTACAATGACTTCTggcattacatcatggacccaaaagct
gattggttgtaagagACGTAAAATCAgacaatacgtcactttcaaccaat
caactgttgggtccgtggaagacattgcaatggtgtatatcatgaattaa
cCCTTGCTACACGGGGGTTGGGATCAAGATTCCCAGGGTTGGATGACGTC
AACAATTTGCATAATCTGAGCTTGTTATTGTAATGACTTTAGACAAATGA
CGTCAACCCTAGTAAACGGGAACTGAAAACCTCACCTTCTTTCGAATTTT
ACAGTAATGAgttctttattttattatttgtaaCAGAAATTGATACCGAA
TGTCACAGTGGATGCACAAGATGTCCCAGAGACTTTAGATTATGGTTCAG
ATAGTAAGTTACACTTAAAGCATAAACATTCTTTTCATATGCGTAGGTTA
TGCGTTAAAACAGCTCTTTGGCCTGTGTTGCCATATGTGATATTTTAAGG
CTGGGTCAAACATAAAAACATATCTAACGTCATTCTCGACTTTTAGGTGC
AGCTGATTTGGATAAGAAGATGCGGACGGTCAAGCTAGACTCTGGTAAAA
AAGTCACCTTAAAAAATACTAACAGGGCTGATACTTCTGACCCCGTAGTT
ATCGAACTCGATAAAGGTTTGTGTACATTGTATGATTTTGTAAGGCTTCT
TTTACATGTTATTGTGTTTTTTTGGGACTCAAGCTCTCAGTCATTTACAC
TCACGATTGCGTTCTTTTGTGTCGTatgcaataaaaaattctaaaaaaag
acAATATTCCAGCGAAATGTATTTGTCTTGAAAGATATCCTTTAACACAG
TTTACGATGACTGAGAGTTTGTCGTCCAGGGATGATGACTTTCATTATTA
TGTCTGTATAATGTTGAACTTGTTTTCTTGCGTTGTAAAGCCTCACGAAG
TGCCACTACTACTGACGACAAAATCTCAATCAAAAGTTGTTATGAAAATG
TTGAATTTCTACGCGAAATTTCGACAACTATTCAAAGTTTAATAATTACT
TGAATACTGCTTTAAAAATGAACTACGTTACACTGcagtatgaaaaaata
tttatgtgaagaaattcaaaatgtgAGTGGGATACCGTCGAGAGAGCTGT
TACTTTCCTTGATATGAACAATGCTACTGGAAAGTaaccaaaaagaaaat
tgtCAGAGAGAGTCAACACTCTGATTACTACATGAAACCCCCACAACGTC
ACTTTTTTATGAACTATGCTATACTAAGTGTCCATCTATATCGTCAATTG
CTCAATGATATCCTTGCTGGGTTGCCAAATTATGACAACCGAAACTCTTC
ATCTAGTGGTGTTACGCAATGGTCCAACAATCCTGGAAAGTATCAATGCC
CTTCGTTCCTGTAttgctgaaattttgaattgtgaACTACGTTTTGTTTT
GCTGCAAAATGTTGGATTGTAAACTACGAATTGTCTTGCTGTGGAATTTG
TTTGATCGTAGTACTATTTTTTCTGGAACTGAACTTTGCATGCTGAATTT
GGAGATTGTTTTTGTGTCGTTAGTTAAGAGTTATGTATTGCTGTTTACAA
TTTTATCCTGACTCAAGAAGAAGAAAGTTTCCTGCATACATCAATGAGCA
TCGTATAATACCAAATCTACACCAATGAACTACATTTTGATTTCGCTGTT
TTGGTTGGATTTTGTGGGCAACAAGTCGGTTATTCAAGAGAAATGATCTT
CAATGAACTATGTCTAAACAATAGATCATTTTCATACCAGGCAGACGACA
AGCTAATAATCATAAACGAAGTCACAACTGAAAGCTGCATAACTGCGAAA
GCATTCTTTATGAACTACGAAACTACAAGAATTGCTTACAAACaaagtca
ttaataaataccGTTCAAAACGCCTGAAGAAGTATTTCAAATTCCATGGA
ATAATATCTCTTAAAGTGTCTCAGCCAATCTTATGAACAATGTCTATAAC
AAGATTGCAGCTGTCATATTTACACGTTATACAAAAAGTTATGATTGAGT
TCACGGACCTTCTAACTGACCTAGATTGAGAGAGAGCAGAGTTTTTGACG
GTGGCAAATAAAGCTCCCAACGCGAGATTTCAATTGCCATGTTTTCtcta
agatttttcaattcagCAAATGTCTAACCGACGCAAGTAAGGATTGAAGA
GACCTCCTACtagtataaatttttatttcgttTCAGGGCCTTGACCTAGC
TAACCTTAAAGCCCTTGCTTTTTGGAACTTCTCCTCAAATCTCCCATTTT
CCGGGTTTGAATTCGCGTTGATGCCTTTTATCCAGGTGTTGACTTCCCTT
TGACAATGTGTGAGGTTTTCATGACCCCTTTTTTTACTGATCCTTGAAAA
CATCCGTAGCTTCACGCTTGATTTTCTTCATTGATTTTTTAATGCGAAGT
CTCCCAAAATTTTATTTGCGTATTCTTGATGCCTATATCGTAGGAAACTT
ATCTTTCTATTCCCAATTCGAATGCCAATATCTTCTTTCTTTCACACAGA
CTCGGCATCAACTACTCCTAAAAAGAGACCACGAGTCTCGATATCCCTAG
ATCTTCAAGAGGAGGATCAATTGGAATCTCGGGATGATCGAGACAGATCA
CCAAGCCCACCAATGAATGACGTTTCAGTGTATTTAATGATCATCAATTT
GGTTCGACCCTTCACCAACAACCAATTGAAAGCCTTGATTTCGAAGACGG
GAACGATTGAAGATAATGGATTTTGGATCAATTCAATCAAATCACATTGT
TACGTAAAGGTATGTGTCCATCTCTGTGAATACgcattatatcaatgcag
tcaaaacatgcgattcctcgaaaaagttcacatgattttattcccatgtt
acttgttTTACAACTTACaactgataactttattagtgtcaatgaATTCG
AACCAAtaagaaataaatgtcatgtaatcagcacataaaaatttcgagta
aaagcgtgatttgtcttcagactttaattttgcaaccttttGTATTGATT
TAATTTTCTTGACGTTACCCTACCATGGTATTAAACGTTAGCTATTTGAA
CAATTACGACAACGGTCTTTTCCCTGAAGAGTTGGAACAAAATGAGAATG
ATGATTTTAGATTAAGCAGGATTAAGTTCAGTTGAAAAGCATCAATTAAT
TTGGCTTGGGAATCTGTGCATTTGACATATTTTGTTCTATGATTTCTAGA
CcccttgaatatttttataccACCATGATTgcattttatttctattctcg
TAGCTTTCAACGATAGAAGAAGCAACGAACACTCGCAAAGCATTACATAA
TTTGAAATGGCCTTCTGGGAATCCCAAATTGATGAAGGTGGATTTTGCTG
TCATGAATGAGGTGAGATCTAAGATATTCTACCCTTAACATGTAAATTTT
TTCCTATTATTATTTGTTCCTCGAAATGCTTCATTCAATCGATACAATCa
tcttttacaattttacatCGAAACATTATCAAGCTCGACTCCTTCAGTTC
CATCATTATTGACTGAGACTCTTAGAGGGTGAGTTTTATATGGATGTGGT
GACCGAAAATTAAATCGGATTTTTCGGATTAGGTATCAGTACACTAATAT
TAcaggtaccttatcggggaaaaaaatgtcggagttttatttagtcgggt
tttttttcgtcaggaaaaaatttcgtcacctagaggcattttcgtcactt
ttccccgaccaaaatttcaaattcgtcactttcacccgactaaattgtcc
aaaagaaatggtttccttcactagctcgaaaatggatcttgtaattcgac
gtttaaatcactaatttcggtaaataaaggtgtaaaaaaattagatttaa
attttggtTGCGGTATAAAATTTTGGGTAAATGTTTGGGTTCGGGATAAA
AAAAATCGGGTAccagttttggtcgggtgataaaatgtcttggaaatatt
tcgtcggggaaaaatttcgtcaccccatcaaaattttcgtcactttcccc
cgacattttttcccccgataaggCAACTCGAACTCGAACAGGAAGtctaa
tttgttcgagttacagaaagatttgaattattGACTTTGACAGAGAATCA
GTTCAAATTAGCCAGATTtcatagaagttcgaattagccaGATTCCACTG
TATGCTTACTgaactttgaaaagaaaattatttatgaAGTCATCttctga
ttttcattttcaatttcattttgattttttcatgtcAGATGTACCGCGAA
ACGACCGGACAACTCGGTGAGCGACCGAAAGTAGTCGTCGAAATTAACGA
CGAAGAATCGGCTGACGACGTCGTCTTTACAAAGCGTCGGCAACGTGTTG
CTGAAAACCGACGAAAAAGTACCGGCGACGAACGAGAGACGACAGAGAAG
AAACGAGAGAAAAGTCCTGTCAAATTATTGGATGACTTATTTCGAAAAAC
GAAAGCTCAACCTAGTATATATTGGTTACCGCTGACAGATGAAGAAGTAA
GCACGTCTCTTTTACAATCCCAAAATCGGTGTTTTAAAAATGACTCTTCA
TTGCCAATCTGGGTTTATCATTAGGGGAGGGTCAAGGTTCAAGCTCTTTC
ACTTTCTTGAGTCAAGTTgaacattttacaagaatttttgtcattggatt
ggtcgttaactattcaaacaaaaacttttattatatttttctaaagaacg
cgtcatctctattgttttgaataaccaattatgtgagcatcttataaaaa
cttcaacaCAACTGACTTTCTTGGAGTTGTTAAGCCACAAAATTTTGTAC
CTTTGTAACCCTTGTTTTGATATTATAATGTTACAGTTGCTTCTTTCTCA
TTCatatgacaaatttttttttttttctatttaattcagatcaagaaaaa
gaaagaacgCGACGCTGCAAACGCAAAAGGTACGCGCGATCGTGGTCAAG
CGGACGAACGAAGACGCTCACCCGAAAGACGAAATAGATCACCTGAACGT
CGAGTGCGTTCTCCAGTACGTAGAAATCGTTCGCCTGACAGACGCTCCGG
TCGTAGTTGGAGGTAGCCGGCTCACCGTGACAATAAGGAATCAAGTCTTT
TTATGACAGGTATCAATGTCTGTTTTAGAGATGTAAATAACCTGAAGTCT
GAGCTACTACTCTTAGAGAAACAATGATCGTAAGATGAATCTTAACGGCG
TGCGGACGATTGAATTACCGCATGGAATGTCCGCGGTTTTATtccctttt
ttatattttggaatgtaaatgtaaataaaaatggATCTTAACACTAAATT
GAACAATTTTTAGTAAAATTGGGctaaagacaaaaagaaaatgattattt
taTATTATCTTTTAAAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000025 | supercontig | sc0000025:961699..972865 + |
|
