XLOC_002012 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_002012
Unique NameXLOC_002012
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000030:264251..274476-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_002012 ID=XLOC_002012|Name=XLOC_002012|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10226bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000030:264251..274476- (Clytia hemisphaerica)
CAGTGGATTCTTGGCTCCGGTGGATTGAGGTACTGTATGTTACTCTCTTT TTTTATAAGAACAAACTATATAAGAACATAAGGCTTCGAGGCCCAAAAAT TTAAGAACATTCTAAGAACATTCTAAGGCTTTGGAGACTTAAAAACATGC ATTCTCTTAAGATATTACATCAAAATGCTCAAAAAATGCTGAAAATAAGA ACATTTTAAGAACATTTTTAGGCTTCAAATCCAAAAAACTAAGAACATCC GACGGCTTCGAAAATTTTTGATGTTCTTATCAAAAAAACGTGTACGTACA CTCTTTTTTTTATAAGAAACAGTAAATTCAAAAATATAATTCTGTAATTC TGTAAATTAATTTCAAGATAAGAGTATTTTAGTCTCAAAATTATCAAAAA ATATTATGTGCATCCAGCAAAAAAAAACACTTGTATTTATTCGCTTTTTA GGAGATTAGTACTCAAGTGCCAAATAAACGGGGGGGTTCGAATAAACGGG GGGGGGGCTGGAAAATTTTTGAGATTTTAATAAACGGGGGACCTAATTGC CGGGGGGGTCGGAAATTGTACTTCTGAAAACCCAAAAGTAAGTTAAATAA GGCTAAAATCAGGCTATTTAGAGCAATATAAGGGGCCTTCTCTTTGACAA CTGAAAATGTTTTTAAAAATTAATAAGCGGGGGGTCCTAAATGTTAAGGT CCGGGGGGGGTTGGAAAATTTTCGAAAAATTAACAAGCAAGGGGGCCCAT TTATTTGGCACCTAAGAGTATGATCCTTAATTTATTCATTCAAAATCTAT TTATTTCAGTCCAAGGGTTACTGTACCTATTAGTAAATTTGTCTGTTTTT TAGCCTCCAAAAAACTACTGTAGATCGGCAAAAATTTCCTCTGATAATTT CGGTTCACTTTACTCTGAACGAGTTTCAAGTAAAAATATACTTTAGACCG 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CATATCGCGAAAGTTGCAGACTTCTATAAAATGAACATGTCCAATCTGAA GACCTTTGTTTTCCGAGAAACCGAATTTTTGGCTGTCACAGCCTACCAGA ACGAAAAGGTTTGAATAGATTCTCTGTTATTTTACTTGTACCGTCGAGTA TGTATTATATACACTTCTTTTTCTTATAAGAACAATGAGCCTCTAAATCG CCAAAAAATAGAAATTTAAACAATTTAGAGATCAAAGTAGTAAAGATTTG GTATAAAGCCTAAAATATCTCAATCACACCCTATAACTAAGAACAGGATA AGAACAATTTAAGGCTCAAAGTGCCAAATATGAGAACAACCGAGCCTCAT CAAAAATCTACCAGTTCTAATAAAAAAAGTGTTTATCAAACTGTGAATCA AACTGTGTTATCAAACAGTTTATTCTTTTTTTATAAGAACCAGTAAATTT TTGTTTCTATCATGTTCGCTTATTTCTAGGCGAAACACCTTGTCTGATCC TTTTGTATAAAATTTAGCTAGAATTGTTCTTATTTTTTGGTACATTTTGC CCTCATCATCCTGATAAGAATATTATTGTAAAAATAAATATTTTAAATCT TACGGGTTATAAAGAGTAAAAGAGCCTACACGTTCTTTTTATAAGAACAT CCAAAATTTTTGAAGCCTTCGGATGTTCTTAACATTTTGAGTTTTAAGCC TAAAAATGTTCTTAACATATTCTTATTTATACTATTTTGTGAGTATTTTT AACCATTTTTTTAAGAAATCGGGTGTTTTTAGTTGTTGATCTTAATATTT TGGCCATCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTAAAAGAACGTG TACTCAAAATAGATTAAAAAATGAGGTTTTCCCTTGCCAAAGTAAAAGAG CCTTTAATTCTTTCAAAACAATATGAAGAAACTGTACGTAAGAACATTTT TGATAACACTTCCCTTCAGGTGACAAAACTGAAGATCAAATACAATCCAT TCGCCAAAGGTTTCCGTGAGGATGGAGCTGCTGGTAAACGTATTTCAAGG TATCTATCTAACTTTGTTTTGAAGTTTTTAGTTTTACATAAGTGTTCCTG TTGCATATCAGATACATGTTTTATATCATTGCGGTGTCTCCTATTGTTAT ATTGTGTTCGATTTTGTGCTGAATAAACCAATATTGCTCCACAATGTGAG AAAGATTGAAGTTTAAATTGATGACTAAGCAAATGATATCAACTTTGATC AGTATACATATATTTTAAATCACTTTTCTTCAGAATCGAGAATAACGAGA GTGATGGTGAAGAAGAAAAATCAACTTCGCATCAAAACAAGAAAACCAAA TTCTCACCAACACCCAATGAACTAAAAGGAAAACACAAATTAGACGGTAT GTATGCCTAATATTTTCATTTAGAGGATTACCACATGAAAAGTCCCTGAA AATTGTTGAAATTTGTAAAGCAAAAATAACAACGTTGGTTATTCATAATA TTCATTACTTTCATTACTTATTATTCGACGGAAAGGCCCACATCATGAAA TTGAAAGTGGGGGGGGGGGCAATGAATATAAAGTCTATTGAGGTGCAACC AAGAATTTTCAGATTGCAAAAAATTAGCTTATTTTACCATATTTTATCTC TATAGAATCACCAGAATCTGGAATTTCCAGTTTAAATTCAACTCCAAGCA AGATGCGTTTCAAAGACACAATTTCACCTCCAACACATATATCGTCTTAC GAAAGTCACATCAAATCACGACGTTTCCTTTCCCCGACAGCCATGTTTAC TTCATCACGTGATCAATTCTTCTCATCACGTGATTTTTCACCACGTGATG AGTTCCGATATCATTATAACCCGGCCGCATCGCCTTCCCCATCCCCGAGT TTCGAAAATTATCTCCCACAAAACACTTCAGCGAATTCAGTATTACCAAT GGTCCTACCCGGATCTATTTATTCGTCCGGAAATCCTCAAAATACAGTGA ATACACCCGGTACTGAATATAATAACGGGGCGAGTTTCCACGATCACGTA GGAGCAGGAAAATCGCTTAAAAAACAATTACAACTCAATACGGAACTTTT ATCGAGTACTTCTTCTCAATGGCAGAATTTTGGCAGTTATACCACACCAA CTACCAATGTCGGATCACCTTATACACAAAACAATTATTTTTCATCGACC CCCAATTACGGACGGTATGGAAGCACCCCTCTTTGTAGACACGGGCTGGC GCATTGTGCAGTTTGCTCATATAGTAGCTCTATTTTAAATTCAGCTAATT TATAATGATTATTTTTGTTTCATTTCGATTTTCGTCTTTTTTGTTGTTGT GAATATTTTTCATTTTTGAATTTTTTGTAAAAAGAAACTTTTAAAAAGAG AGGCCAGAAATAGGACAAACACGTTTTTTTATAAGAACATCCAAAATCTT TGAAGCCTTGGGATGTTCTTAACTTTTTGAGATTCAAGCCTAAAAATGTT AATTAACATATTCTTATTTTCGCCATTTTTTGAGTGTTTTTGTCTATTTC CCTAAGAAATTCAGTATTTTAGAGTCCGCAAAGCCCTAAAATGTTCTTAA CTTGTTCTTAACATTTTGGTCATCGAAATCTTAAGTTTTTATATAGTTTG TTCTTATAAAAAACCGTGTAGTAGTAATTTGCAACTTGGCGACGCTAGTC TTAAGTTATGTTTCAAAGACTTTAACTTGTAAGCTTTTTCAATACTGTGA AAAAGTCCTGTAAAAGTCGATGCCTCTTGTTGTTAGAATTTGCTGATGAA CTTTGCAAAGAATATTTGCTAATAGCAAAGTTAAGTGTAAATAGGGAGTT AATGTATCAGAGGATTTCGAGGGCAACGATAAAGTGAAGTCGATGCAAAA CAAAGTCGATAGTTGATGTACGGCTCTATATCGCCGTTGCTCACCTAAAC AGATGACGGTATTTTGGGTTTTTTACCTTCGTGAGGACGGCGATTTTGGT GACATGTCAACTTTGCTTTATATCGTCTCCTTCGATTTACATAACTTTGC TAATAGATAAATCACGAACGAGGACGGACGAATTTCCACTAGCCTTTATT CACAGTAAGGAACTTTTTCTACAGGCTAAGTACAAAGCAAGATAGACTTA CCTCGCGTAGTATATCCGCTTTGTAATTTTTCTATCGATACTTTAACATC GCCAATCTAATGTTTTTAAAGGAGAGCGAATACAAGTGAGATAAATTCTG TTATGAAATATGTACCAAAACCATGATAAATAAAGTCTTAACGAAATAAG CTTGCGTCAATTTTTTTTGTTGCGTTCTCATTGTATGACTTCATTTTTAA TGTTATTTTTAATTGAACTTTAATTTACTTTAAATCTTTTGTTCATAATT TATTTCAAAATATACGATAATTTTATTTTTTATTTATCCATTTTGTGACC TTTTGGGCACCTTTTTTTATTAAATACAATTTTAAAATTTACATATCACT ACAAATTGAGCTGTATATTATATCTTTAAAATTTTCAATAAAATCGTTTT TCTGAAATATTTCAATTAAATTGTAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00003610TCONS_00003610Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003609TCONS_00003609Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003608TCONS_00003608Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003607TCONS_00003607Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003606TCONS_00003606Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
T-box transcription factor 2-3TCONS_00003610-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000030supercontigsc0000030:264251..274476 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.41 2.94 6.99 9.34 104.02 84.57 43.26 47.91 10.76 16.41 12.82 11.25 1.46 1.89 0.39 0.33 0.2 0.36 0.5 0.53 0.38 0.56 1.26 1.42 0.5 0.44 0.31 0.45 1.03 1.41