XLOC_003050 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_003050
Unique NameXLOC_003050
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000052:781138..811081-

Legend: gene
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>XLOC_003050 ID=XLOC_003050|Name=XLOC_003050|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=29944bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000052:781138..811081- (Clytia hemisphaerica)
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CGGCTGTAAACTCCGAGAGCATATCTTTTCCCACGCTATATTTTCCCACC TTTCATGGACGATAGCATCCTTTAGAATAGGTCCTATTCTTCCTTGATTT ATCAAAATTGCCAAATCACCAGATCTAGTTTTGTTTTTGAATATTGGAAA ATCCAAGCATGGTGAATATACTTCAATTTTCCACTTAATTCTTTTTTTGG TTCAGGTGGACCGCGAGGACCTGAAGGTCGATCTGGAGATGACGGGCCTC CAGGAGCCGATGGTGCCAAAGGAAAGATCGGACAACAAGGGGCGCGTGGT GAACAAGGAGAACCCGGTTTTGGTCCGAAAGGAGATATCGGGGATATCGG ATTACCGGGATTGATCGGAGACACTGGAGACAACGGATGGCGAGGTAAGA AGGTTATCGGAAATCTTGAAATACAAATAAATGACAACGTCGTCCCTGTG TATCCCAGGCTGTATTTACGTTGCTGATGAATGCTAGAGAAAATTATCTG TTGCTATCGGTTAGCAATCAAAAAGCCGATAATACAGAAGGACCGAGGTC GAGTAAATGAAAATATTGAAGTGACACTTTGATATCAATTGAGTTTAGAT TTTAAATGTTCACTTCAAGGTGAAGGTTACCAAAGGAATATTTTGCTCTA AGAACAAAGCACCTTTATAAGAAATGATTTAACGATAAAATTTTTACTTG TTTTCTTTTAGGACCTAATGGTTTAATGGGACCCAGAGGGCCGATCGGAG AGCAGGGAAGTGATGGTCCTCGAGGTCCGAAAGGAGAAAGTGGATTCGTA GGTATCGATGGAGACCCTGGACCTAAAGGTATGATGAATCATTTTCCCAT TTTCTTGATAGTCATAATGTTATGTTTTCACCCTTGTTTTCGGCCAGGCT ACTGGGAAATTTGTTAAACAATTTTTCTCTAGCTTGAATTTGCCACAACT AGAAAAACTGGGTGTTTTCATAAAACAAATTGAATATAATGAATTGTTGT TTGAAACAACGGACAGCTTATGTTCCTTTTTGAATTATTTTGAAGTCTAT TCATTATACTAGAACTTACTAGCCTTCTACTGAGTCGTTGATTGGCTCCT GTCCAGAAAGTTTGACCATGTACATTGATTGGGGTCGAACAATTTGTTTG ATATAAGTTAGATATATCCCTGTACATGAAATATCATGAGATGAAATGAG TTTTTTGCTTTCCATTTCAGGACCATTGGGACCCAAAGGAGTGCGTGGGG ACGACGCCAAAGGACAGACTGGTTTAGATGGAGCACCCGGAGCGCCAGGA CCAAAAGGAGAAACCGGAGATCCGGCAGAATTACCGGAAGGAAGTGATTT GAAAGATCTGAGAGGTGATGAAGGTAGGATGAGTTGTTTTTCTCTTTTCA TGCAACGGTTACACTCCACCTTTTCTTGCCTTTTCACATTAAAGTAAAGC TTTGGTAAAAATAATAAGATCAAACGCAAATTAGTTTATCAGCTTAAATC ACCCTATCTGACAGAAGGGGGCTTTTAGATTATCATTTCGAAAATCCGGT TTAATGAATGGCAATGTTAGGTTTGTTAAACTTCTTCATCACTTTTTAGG TTACGTAGGACCTCTTGGTGAAATTGGCCCAGAAGGTCCCAAAGGGAAGT TATTCACAGAGCCAGGACCACCAGGGTTACCTGGATCAAAAGGAGATCAA CCAGGGCCTGGAGATCTTGGCGATTCTGGCGAAATGGGACCGATTGGACC GCCTGGTTTCAAAGGTATAGCGGGCGCTTACTCCTAAAGCTGGACACCCT ACAAAGTTTTTCCTTAAGAATTATTAATAACATTTTTGTGAGAATCTTGA CACTTGTTTTTCGAATCTGCTAAATAACATTAAGTTCTTGGAAACCCTGC 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TCGTTAATTCAATAATTTTGAGCTTCATAAAATAGTTCTTTAGCAAAACT TTGGAAAATCTTAGAATATTCCTGTCTATCAGCTCGCCCACACACCTTAT TTCTCTGTAGTCAATATTATTATTGCAAAGGATTGAGATGAACTTGAAGA AATCATAACTTTTCCTCTGTTTCAGGATTGAAAGGCCGTGCTGGTACCGG TGGTGATCCCGGATCGGATGGGAAATCGGGATTAATCGGGGAAAAAGGTG ACCCAGTCCCACCAGGTGATTCAGGTGATGTTGGTGATATCGGGGATATC GGGCTAACCGGGCGACCTGGATTGAAAGGAATAGGTGGATTACCAGGTGA GAGATTTTATATTTTTTTGTGTATTACTTATTTCCTCTCAAGTTTTGAAT GAATTCTTCCTGAGGAAAATTAACGGAACTTTATCTGCTGAGTGAAGACA TGATCCAGTCTTCTCAACTAAGTTAATAAGTCGAAAGAAATAAAACTTTA AAGATATGTAAGTTTATTGGGTAAGCCTGTCATTTTTACAAGACTTTTAC GCACTTTCTTTGAAGGTATCGACGGAAATAGCGGTCAGAAAGGACAAAAG GGTGCTGAAGGTCAAAGTGGGTTTCCTGGCATTGTCGGCTCTCAAGGGCC AACCGGACCCAAAGGATCGCAAGGTGTTGATGGTGCTGCTGGTAACAATG GACCCGTCGGCCAAAGTGGGCCAGTTGGACCAGATCGTATTCCCGATTCA TTCGGACATTATATTGTGAGACATGCGCAGGACGCATATGCGCCATCTTG TCCAAATAATTATCAAGTGATGTGGGAGGGGTATTCCCTAATGTACACAG TGGGCAATGGACAAGCGCATGCGCAAGATTTGGGCGATGCAGGATCGTGT GTACGATCTTTCAGGTAATATTTAGCTTTTCGTTCGGAAGATTATCAAGA TTATGTTATGAAAGAATTTATTTTGAATATACCATCAAAAAATGTTGACC TGGTTTATCCATTGTACAAATATGTCGTACTATCTACTTCTTTTTTGCAC GTTTTTGTAACAGAAGAACTCTTATATCTTCTAACTTTTTACAATTAAAG TTATGAAAATTTCTCAATTTCTTTTCCATCACAGCACTTTGCCATTCTTA TTCTGTGAAATGACCGGCAACTGTCAATACGCAAATCGAAACGATTTTGT TTACTGGCTGTCTGGTGATATCCGTAACACGCCAATGACGCCCGTCTCTA ACGCCGTTATCGAGCCGTACGTCAGTCGTTGTTCCGTATGTAAAGCGCCG GACATCAGCATTGCCGTGCACTCACAAGACACCATTGAACCGGTCTGCCC CAAAGGTTATGATTCCGTATGGGACGGATACAGTTTCCTTATGGTAAGCA AACCCTTTTTTGCCCAGTTATTCTAAATGTCCTGTCTCTGACCTGTTTCA ATCATTGGACTTAAAGCCCGCCGGAATAGAGCAGAATCTCTAACCTTTAC CAAGCAAGAAAAAGTGAAGCCTGAAGACTTCTGCTGCTTAGGATGACGTG CTTTCTTTTATTTTCGATTGGCAAAATTTTGGAATTCTGGCGTTTGTGTG AAACCATGCGTTTTGTGTGGTGAATCAGTAGCTTCANNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGGCAAGTTTCTGCGTAGCTAGCCGGGGT ATCTATAAGGCTGGAACACCGGATTCTTCCAGTCGTTTATACAAACTAAA TCCCGTATTATCATTATTAGCATTGGTATTATTAGTATTACACGCATTAT AAACGACTCCAGTCTATATGTCGAGTTGAAAAATTGTATTTATATTTTTA GAAAAAAATCAAAGGGAAAAATCAAAATATAATAGCCGCATCCTTCTTCA CCGTTATCACTGCTATAATTGAGGAGTTTTCTAAAATTTCTTTTGATCTT TACAAACAAAACAAGTTTTGATTTAAAACAAATTTCAACATTACGACACG CAAGTATCTTCGCACGCACTTATTATTCCCATACCCCAGATAACATATAA TTGGATTTTGCCACAAAAACATTATTGACTTATCTCAACCTTAAATGAAA ATCTGATATTTTATATCATCAAGATATAAAAAAACCCACACACTTTTCGA ATAATTTTTCTTTATTCTTTCTTGACTACAGGTGGCAGGTGCAGGCAAAA CAGGTGCAGGGCAACCTCTATCATCGACTGGATCATGTCTTGAGAAATTC CGCCCTCAACCCTTCCTGGAATGTCAAGGATCACGTGGTACTTGTGCATT CTTCTCCGATAAATTCAGCTTTTGGCTCACCACAATAGAACCCACAAAAG AGTTCGAAATCCCCGAACCAAAAGTTTTAGACACCAACAAAGGCGATCAA CTCACCAATCGCGTTTCGCGGTGTAAAGTTTGTCTGCGGGTGCCACGAAG CAACCGCCCTGATTCACCGAACAGCACCCCCGCCAACAAAGATGCCTCAT CTCTTCTCGACCGTGTGGCGAGAAGGATTAGGAACTGGTTTTAAAGAACT TTGAAATGTACGGGTGGACGGGCGGTACCTGACACACCATATTATCTACG CCCCTTACCTAAAATTTATTCCCCAAAAATAATGCAAGACTTTCAACATT TATACATACAATACATATTTATGTTAATATTTTTATTTGCGCAAACTTAT TTATTATTTTGTAATTTTTTGAGAATTTTTCTACTTTTAAGATATCACTA TTTTTCTTACATTCCGGTTGCTTTGATCATAAAACGAGTATAGTTTCTGA AATAAATAACATCTTCNGAGGAGTTTTCTAAAATTTCTTTTGATCTTTAC AAACAAAACAAGTTTTGATTTAAAACAAATTTCAACATTACGACACGCAA GTATCTTCGCACGCACTTATTATTCCCATACCCCAGATAACATATAATTG GATTTTGCCACAAAAACATTATTGACTTATCTCAACCTTAAATGAAAATC TGATATTTTATATCATCAAGATATAAAAAAACCCACACACTTTTCGAATA ATTTTTCTTTATTCTTTCTTGACTACAGGTGGCAGGTGCAGGCAAAACAG GTGCAGGGCAACCTCTATCATCGACTGGATCATGTCTTGAGAAATTCCGC CCTCAACCCTTCCTGGAATGTCAAGGATCACGTGGTACTTGTGCATTCTT CTCCGATAAATTCAGCTTTTGGCTCACCACAATAGAACCCACAAAAGAGT TCGAAATCCCCGAACCAAAAGTTTTAGACACCAACAAAGGCGATCAACTC ACCAATCGCGTTTCGCGGTGTAAAGTTTGTCTGCGGGTGCCACGAAGCAA CCGCCCTGATTCACCGAACAGCACCCCCGCCAACAAAGATGCCTCATCTC TTCTCGACCGTGTGGCGAGAAGGATTAGGAACTGGTTTTAAAGAACTTTG AAATGTACGGGTGGACGGGCGGTACCTGACACACCATATTATCTACGCCC CTTACCTAAAATTTATTCCCCAAAAATAATGCAAGACTTTCAACATTTAT ACATACAATACATATTTATGTTAATATTTTTATTTGCGCAAACTTATTTA TTATTTTGTAATTTTTTGAGAATTTTTCTACTTTTAAGATATCACTATTT TTCTTACATTCCGTTTGCTTTGATCATAAAACGAGTATAGTTTCTGAAAT AAATAACATCTTCCGTAGATTTTTAATCTAATGCAAAAATTGAAGCCTAC AGGTGGTGTTTTATAATTTTTCATCAAATATTGAAAAAGTTTGATATCAA ATAAGTGGAACACTAGAGTCCTTTTATCCTATAGGTGTGAGAAAGGGGCA AAAAAGGTAATATTCATTGAAACGTATTGTTGCAAACAAAGTTTCACAAA GAAATCAAAGTGTTCCATTTCCTCAAACAATGAATAAATATTCAAAATTC ATGAACATCGAAATTTGACTTTCTTTTATTTGAGCTCATTTTTAAGTTAG AGGCCTTCCAGAGAACATCTCATAAGATATGGTAAGACAATTTCGAGCTA TAATAATCTAGGAATTTTCTAAGAATTTGAAGTTTCACGGCTACTATTTC ACCACTTTTGATTTTTTTCAGTTAATTCTTATTTAGAACAAAGAGAGTTT TTAGTATCACTTGTTTTTTAAAACAGTGACCGAGCAACGATTTCATGAGA TGATAAGATTTTTCTACTTTTCAGTTTTCTATCATTTTTGTGGCAATTGT TTTGGTCGTCGCACCAGCTCAATCGAAGGTATGTTTAAAATCAACTTTTC TCACCTTTTTTTCGACCCATCAACACGCTTCAATGTAGCAAAGAAACTTC TCTTTCCTACTTTACTCTCTCTCTAACTTTCCTTTTTTACAGAAGTTTTA TCTTGTACCACATGACCCGGGCGGAATATCAGATAAAAAAACGTTTTTAA AATAGATCTACTCGGAATATCAGATAAACTCAGCTCCAAAGATGTATTAT GCNACAACTTCGCTACGACACAACACTCTGCTCTGAGGATTGGGAAAATT TTAACATAATTTTGATATATTGACCTGCTACTTAGAACTTTAGTGTGCGG TCGACAAAGCGCTATCGGAATATCAGATAAACTCAGCTCCAAAGATGTAT TATGCCAAGGGATAGAAAGTCTGTCCTCGCTCGTATGAGTACATCAGGTC CTAGAAAGTCTATACAGCAGTCAAAAATAAAAGAAGCATTTACTGTGCTA AACCTAAATCGAGCTCTATCTCTGCCTCCATGTGTTTTGTTGCTGGGAAC GTTTTGAGAAGGTTTTCATCTTTCTTCTTGGTACGAACGAATCAAGTGGT GCTTCCCGTAGCTGCATCAGAAAACTATCGAGATATTCTTGATATGCGTA TATGTCATATGTAATTTTCCCATCGGAAACACCCGAAAACACCAGAATTT GAGTGTTACTAAAACTAGCAACACAGGGGTCAAATTCCAGTTTTTTCGGG TGTTTCCGTTATAAAAATGACGTAATCTTGACTTTTACATATCAAGAATT TTTGTTTTAGAAATGCAATTTGAAGATAGAAGAGAAAGGATCTCTACCAT TTGTGGAATCCATTGAGATCAAGGATACCAAATATGGAAAAGCTGTCATC ACAGAGGTCCCTTCACACCGAAACGGTGAGCTTCTCTCTTCTCTTTTGCT TATTTTTTTTTCTATGGCGAAATTTCTTTCAGTAGTATTGCAAGCGTGTG TTGGAAGGCTTTCCAGCAGGGAAAATCTTTTGTAGACCAAAGCCATCCAG ATCGCATTTTCCTGGCCAATATCCCCAAATCTGTAGGTTTTCTGTGTAGC CGACGTACAACCTCGTTCCCTGCGTATTATCAGCTTTTTTCTGCTTATTG ATAGCGCTAGATATTCTCTGGCGTCAATAAGTATAACGTAAATAAAGCCT GGAATACACGGGGACGAGGTTGACCGACGTATTTTATTTTTGAGTACTTT ATTCTGATAGCATCTTACCACGAAGATTCTATTGACCCGTTATAAATTGT TCCTAAGAGGCTATAGGAGGAGAGTTTTGTTGAGGTGACTGTGTATTATA TTTTAAATTCTTAATCTTCCATATTTTCCAGGTGAATTGAAAGCCGTCAA ACACATTGTTTACGACAAAATGGGATTGGAGATCGACCTTCTCAAAGAAT TTGGACCGAAGAAAGTTTCTGTATGTTTGGTCCATCATCGAACCATGGAC GAACCTTCTGAAAAAGACATCGAATCTGCTCTCAACGTAAGCTACCTGTC AGTGCCACAGTGCCGCGGGAGGGGAATTTTTTCATAAATCTCAATTAAAT CTCACAAATTGCTGATTTCTTATTCTATTTCCTCCAATTAATTCCATTTC GAGTGTTTATTAACAGAAGCTCTTCTTGTTCATTTTCTAAAATTTATTTG TATACGTTTCGGAGAACAGAGAACCATCCACAAATAAATTTTAGAAAAAT TAACAAGAAGCTTCTTTTAATATACACTTTCTTACTAAAGATGTATCAAA GGATTGACTTGTTTAGTCAATTAATTTCTGCATTACTTTGAAACTTAATT GATGAGAAGTTGATTGAACGTTCACTCAGATTATAAAGAACGGAACCCTG GCGCCCCTTTTCTCTGAGAAATTTTAAGCTATTAAGGCTTGGGGGCACGA GAAGTTTCTTTCGCGTTGGCGCAATGCAACATGCTCCACCCCACCAATAC AAGAAGAAAATGCGTGTCTTATGGTTTCTTTTTTTGTTTCATTTCTCAAT TCCTTTATATTTCGTCTCTTTCTCAGCTTGGCGGTTGCGGTAACAAACTT CCCAGACGCGGATCACGTAGCGATTATTATTACCTTCCACGACACTGCAA CGGAGTGCTGAATGAAGAACAAATGAAGATCGCAAAGGAGGAGTGCGATG ACGTCACAATGGTTTGTGGAGCGGACGTGGAGGAGAATGTTGAGACACAC AGCAAACGAGCTCTCGAACTCGCCATCGGTGAGTACACGTTTTTTTATAA GAGCAAACTATATAAGAAAATAAGGCTTCGATGGCCAAAATGTTAAGAAC AAGTTAAGAATATTTTAAGGCTTCGTGAATTTTTAGAACAATAGGTAAAA ATGGTCACAAAACGGTGAAATTAAGAACATGCTAAGAACATTTTTAAGCT TAAAACCCAAAAAGTTAAGAGCATGCGAAGGCTTCATAAATTTATTTGGA TGTTCTTTAAAAAAAACGGTTATGCTTATGGTCTCTGTTTGCTAGCAAGT AGTCTGCTACGAGCAGACGAATCAAACAAATTTAAAGTTGCCCATTTTAA GGCGAAAAAGCTTTTTACAAAACTCCTGAGATTCTTCAGTGTTTTTTTAT ATGACTAAAATTGTTGCAGAAATAACATTTTAAGGTGTAACAAAAATCAG TGGTATTGAAAAGTCTTTGACCCCTCATGTTGTTGTTTAATCGCGTAGAA CCTCTGCCAAAGCCCTTTCTTACCGATAAATGAATTCCCCGGCTACTCTC AGGTTCCAAATAAACGGGGGAGTGGTTTGAAAGTTTTCGAGATTTTAATA AACGGGGAGGACCTAATTGCCGGGGGGGATGGAAATTTTACTTCTGAAAA CCCAAAAGGCCCCTTATTTTTCTCTAAGGTCCGGGGAGGAGGGGTTGGCA AATTTTCGAAAAATTAGCAAGCAGAGTGCCCGTTTATTTGAAACCTAAGA GTAACTTCTTCCGTGCAGAATCAAAATCATCTTCTCTTTCCTACTCAGAC 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00005376TCONS_00005376Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00005375TCONS_00005375Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00005375-proteinTCONS_00005375-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000052supercontigsc0000052:781138..811081 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.05 2.82 1.15 0.98 1.21 1 3.54 4.12 1.24 1.98 2.03 1.56 45.99 52.02 1.39 2.66 5.23 6.37 97.47 92.9 11.95 12.3 5.08 7.12 14.44 14.17 1.91 1.78 1.11 0.88