XLOC_029989 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_029989
Unique NameXLOC_029989
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_12:9219..21004-

Legend: gene
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>XLOC_029989 ID=XLOC_029989|Name=XLOC_029989|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11786bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_12:9219..21004- (Clytia hemisphaerica)
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GTTTGCTTACTCGTCAATTCTAATTCCCAAGCTTTTTCACATGGATTGAC ACGGATGTGGAGCAATATTGGTCAGAAACATTTTTTTACTAATATCAATA TAATATAACAAGCTGTCCTGATATGAAATATGTGTCTGATATGAAACGGG AACACTTATGTAAAAACAAAACCTTTAAGGGAATAAATTTTCTCAGAATT AAAAAAATCACCTTTAAAATTGGTCATTTTAGGCCAAAATAGGTCATATA AATCAACCGTTATTCTCTCAACCGCGAAATTAAATTCTGCGAAACTACTG AATTTTGAGATGCAAACCGCGTGAAATTAAATCCCGCAAAAATTTCTTCC CTTAAAGGTATCAAAAAAATTTAGAAGAAAGCTTTGCGAAAAGAAATTCC GATGTAATTTGATCAATGGATCCCCAATCTCCTCAAATCTCATAAGTCTC GTGCCTCGTGCTTTTCCCTCCTATAACTAATTCACATTACACCTTGATTG ATTTCAAGGTCACATATGAATACTACAAAGAAACCAATAATGCAAGCATC GCGAGTCGTCTTTGATGGTTTTCTAACTAAGCTCTTGGCGCTTTCTAGTG GTTTTGGGTAATACTGTCCCATCATTCATTAGAACACCTCCTTCTCACAA ATAACAGACCATTGGGATCGATGTTGCCATATTTATTTTCGCTGGGATTT GAATTTCATTGTTTTCGAGCCAGAAAAGACAGTGGAAATGGAAAAAATAC CGCAATATTTTGCAGTGAGGATTAGCTTATCTAATTATTTTCAGTGGGGA CAAAAATTAGAGTATACCTTAAGTGGATAAATTTTGGCGTTGATTTAATT TGGCGATTGGCCAAAATACGATTTTTGGCGGGGATTTAATTTTGCGATAG ATCAATTTCGTTAAATTTGGCGGGGATTTAATTTGGTGAATTGGAAATTT TGTCACACTGAAATTAAATGGGTGAAAATTACTCAAAAATATACTAAAAA GTTGTGATTTTTCACATAATTCTCTTTTTGTTAAATTTGGCGGGGATTTA ATTTGGTGAATTGGAAATTTTGTCACACTGAAATTAAATGGGTGAAAATT ACTCAAAAATATACTAAAAAGTTGTGATTTTTCACATAATTCTCTTTTTG TTAAATTTGGCGGGGATTTAATTTGGCAAATTGCCGAATTTGGACATTTT GGCGAGGATTTAATTCGCCAAATTTAATCCCCGCCAAAATTTATCCACTT AAGGTAATTTTCAACTGAGAACGATATTTTAACCAATTTTTCCAGTGGGA AGGGTTCCTGGTGGGTCTACGAGAAGGGGGGTGTATTACATTTCGTATTC ATTTTTGTTTTGTTTGTTTTTTATTCATTTAGCTTCATAACAAAGAACTG GCGGAATGTCGCGAACGATTCGAAATTTTACACAATGAAAATACTGAGAA AGAAACAAATAATATTCAAAAGAAGCAGAAACTCATTTCATCGGTGAGCT TGATAGCTTAATATGTCAAGCTTAGAGCTTAAAGTTTTAAAACCTTGTTT CACTAAAAAAAAAAGTTTTTCTCACTAGATGATACTAAGAGTATAGAAAA CTAACGTCGAATCACTGACCTTTATATACCCTGGACAAAGTTTCTCAACC CCGGCCAAACAAAATCTTTGATCGGAGTTTTTTGAAAGTGGTACCCTAAT GGTAGCACTACTCAATGATGATGTAATGCATCGAGAGTGATAGATCTACT GTTCGTGGAATAATTTTGATGATGTAGCTCCGTTAAACGTTAATTCTTAA CATTGCAATGGCTCCTTTGCGAGTACCATCTTCAAAAAAATCCGATCAAA GATTGCGGATATAGCTTTGTCAAGGAATATATAAACGTCAGTGCGTCTAA 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TTTTGCAAGGGTTGCAGAGTTTATTTGAAGGTTTTTAAAGATATTTTCCA ATTTTTTTACGGAGAATTTGGATTAATTTTGACAGAGTTTTTCTCCATAT CCCACAAGACCTTAAAATTAGGCTATTTTATGCAATTTCTTTCGAAGCCG TGAATCTGATCGGCTCATTGATACAAGATTATACTAATCATCGTGTTTTT TTCTTCTCTATATAGACGTACTTACAAGATCGCGAAGATGTGTATCAAAT GACTTGCCAGTTAATACAACAAAGTTTACCTCAACAACCAACGCAAAATT CTTCCAAACCTTCAACTCAATCCTCAACACGCTCTTCAAGGAGCAGGTGA CATTACTTTTAACGACATCGTTATCAATATACACTCCCTTCTCACAGACC TGGTAGGATTTTTTCAGCCAGTAGGGGTGAAAGTAACGGACTGAAACTCG ATGGGGATTGATATTCCCGTATTTTTTATGGCTGGGGATTTCAATTCTTT TGTCAGAAAATTCAGTGGAGATGGGAAGAAAAACATCATATTTTGCAGTG AGGATTGGTTTATTTGATTATTTTCAGTGGGGACAAAAATTGGAGAATAA TTTTCCACTGGGGACTATATTCTAGACAATTTTTCCAGTGGGAAGGGTTC CCAGTGGGTCTGTGAGCAGGGTTGTATATCCCGCCACACTCTCATACTAG TCACGAAAATATGTAAATAAGCACCGTGAAGTTTCCGCAAGATATTATTT TATTTTACATACACATTTTTAGATAATACTTATTTTTAGTCCTTGAAATT AATTTATTCTTTTATAAACTTTGTACGATAGTCTAGATTTGTTTTGAACA TTTTAAACCTCTCCCTTCTCACGTATGGTAGACCTACTATATCTGCTTAT TGACGGCGTTGCCTTTGTCGTAATACGTAGACCTACTATATCTGCTTATT GACTTATTTTCTTTGTCGTAATATACTCTCTTTCACTATCAGTAACAAAG AAAAAAGGAGTTGAGCTCCGGATCTTGAACCTTTGATAAATCATTGCTCA TTTGCACGATTTTTGTACTCGTGAAACATCCTCAATTTTCTTGGGATTCA ACCATTGAGTTTCAAGCCCGAAGGGCTAGAGGCGAAACTTAACCCTTATC AGGCAACAAAAAGTGAAGCCACTTATTTCCCATCCAAAACGCGCGTAGAA CGCGCCGTAATCATGACGACGGGTTGTATCTAGCGGTTCCTTTATTTTCG AGGACTACATTTTTCGAAATCTAGCGATAGATTTTAGTTTCAATCCGGCG TTTGTGTAAAGACTACGTGCGGGCGTTCTGGATGNN
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00047002TCONS_00047002Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047001TCONS_00047001Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047000TCONS_00047000Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00047002-proteinTCONS_00047002-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_12supercontigscaffold_12:9219..21004 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.39 2.66 2.78 2.11 22.79 18.12 13.71 13.75 9.32 10.53 8.72 8.71 4.44 3.94 4.11 5.43 3.74 3.84 5.08 5.02 4.25 5.46 6.27 6.89 3.67 3.77 3.9 3 4.62 4.92