XLOC_032648 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_032648
Unique NameXLOC_032648
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_202:766379..824153+

Legend: gene
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>XLOC_032648 ID=XLOC_032648|Name=XLOC_032648|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=57775bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_202:766379..824153+ (Clytia hemisphaerica)
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TCCCGAAACGATAATCTAACAATAACGCATACTTTCAAATCCGTCAGGTT GAGATCAATTGCGTAGACAACGAAGACGGAACATGTTCTGTGGACTTCAC ACCATCCGAAGCTGGACAATACCTGATCAATGTCACTTATGCTGATGCTC ATGTACCAGGGTCACCATTCAAATGCCGAGTTGGTGATGGACCGGTAAGT GCCTGGATCTTTTTATCCGGTATTTTTCCGGTCTTATCTCTCTTCTCGGA GTATACTGCACTCTAGGGCCGTCCATCCCTATTCCATAAActaattttct ctctttttgaaGTGTTTTCCTCTTTTCACTCGCTTcagtcttttattttt atctcgCGATCAACGAAAATCGACGATTTCTTTGAAGCTGAAAGACTCTT ACTTACAAAAGATTGGTGATTTCACTGTAACtggtttttacattttaaaa gtCCATTCAATCTACTAAATCAACTTAAACTCAAAATNACCCATATTTGC AATGTTCTATCCAAACTTCATAATCATCCTTTTTCAAAATTGCTTCACTC TTTCCAATCCGTCAGGTGGATGAGGAAATCATTCCTGTCACTGAGCAAGG TGTCCAAGAAGAAGCACCAGACATGTTCTCCGACATGTTAGCATTCCCGT CATCTAAGGCTCGATCTCCACAAGACTTTGTCATCAAGTTCAGTGGAAGT GGAGACCTTAAAGCATCCGTTACACGACCATCGGGTATTGAGGATGATGC CGAGGTTGTCGAAACTGGTAAGTAGTGTAAATAGACCTTTAATGGTAACT TTAGTAGCTAACGTGAGAAGAGTTTCGATTACTTGATAATACTGTTAAAC GATTCTTTAATTATATTTATACTTTTTCACACTGCGTTTAAAGGTTCTAT AACTTAACAACGATTAGTTCAACGTCTTAAAATTACGTAACTTGTCTATG AAACTAGATTGCCTATTTAGCATCTTTGTCTATCTTGGTCCAAATATCTT GAAAGGCAGATTTCAGTATGTCATTcagcaaaatttccaattttgaattt ttttccaggccCTGACACCTACACAGTACGTTTCGTTCCTCGCGAAACAG GCGAACACTTGGTCAACGTCAAGGCACGCAGACGTCATATTCCCGGATCC CCATTCAAAGTGTTGGTGGAGGCTCCATCGGGAGGTGCGGCCGCATGTAA AGCCAGTGGACCTGGATTGGAAGGTGGCATCTGTTGCCAACCAGCCAGTT TCACTGTTATTACCCGAGACGCTGGACCAGGAGGTATGCTTTTTATTATC TTTCTATTAAATTCTCCTGACAGTCCTAGTTCTGATGTGCCTGAAGTGCT CTTTGGAAGATCAGAGCTGCTATTACGTCGTTAAGAATAAGATTTTTTGG CTGTTAGTCGTCGTTCATATAGACAGAATGAATTGGTCTTAACAACGTTT GAAATGCTTATATTAAAAGGGTTAGCTAATTACGAAGTTATCATTAAACA ATATTGGATGCTTGCCTTAAGTCTCCTTCTAGTGTTTGAGTTGTATTGAT TTATAACATTTTCATGGTTGATGAAAGCCCTGCAACTTTTAAAATCCTAT ATCTAATATATCATCCTATCCCGTATTTGCAGGTCTCGCCGTGGCAGTTG AAGGCCCTGCAAAGGCTGAAATCCAATGTCATGACAACGGAGATGGCTCG TGTGACATCACGTGGTACCCTGTGGAAGCTGGGGAGTACACAGTGCACAT CCGTTTTGCCGATGAAGCTATCCCTGGAAGCCCTTACAAGGTATGATGAT AAAAAACTTTGTTAAAGATGTCTTACCAAAATTACGACAGTAATTAAGTG TTAAGCACCTCATCAATGAagccaaaaaattatttaactctgctgttttt tttcacttaatACCTTACTTACACCCAATCTGCTGTTTTGGAAGTGGCCT AATTTCCTCATTTTAGAGCAGTGTCAATCTCCTTGGCCTAAAATCTTTAA TGCCATTAGTATTTGGACAATATGcataaacaaaaacataaaaaacatgt CAAAACATACACAGAGGAATGAAAATCATATATAATTTaaccaaatattt caaatttttcgtctTGCGTGTTGCGACGTTAGTAATGAGTTGTCATTAGT TTCATTACTCATTAAAACTATTTTCTTCGttatattcttttttcaaaata tcggaTGTTTACCTGAGGCAAACATTGTTTGTTACCCCCGTCAAAGTTTG ATAAAATCGTTGAAAAATACTACAAAAACCAATCTAAAGCCGGGGGATCT CTCTTGAcacgaaattcaaaactttaccCCCGTTGAAGCAGGTCGAAGAC CTCCTAAACTTCTACCAAagacatttaaaacaaatttaaaaccgGGGGtt atttctttctatttttctaGGTCAACATCCTGCCTGCCGATGAAGGAGAA GCTATGTCTATGGACAAATTTAAAGATCAAGTTTTACGTGTTGGACAACA AGCATCTTTTGCTGTTCAAATGAAAGGAAAGAAAGGAACAATCGCCGCTA GTGTCAATTCACCATCTGGAGAAAGTATCGAATGTTCTGTAGCTGAACTC GATGAAGGTAAGTTTTTTTAATGTTATTGCACCGTAGTTCAGTTTTCcat tttcgctttttttcgaTTCTTGACATCTGTTATTTACGATTGtaaatcaa ttttgatttctgaaaaattctGAAACAATCTTTAAAATATGGTTTATTGC TTCATGATCTTCTGTCCTCATCatgtttttaaatcatttttctcttttac tCTTCAGGAAACTATGCTGTTCGATTCGTTCCACGAGAATTAGGAGATCA TTTAGTTAGCGTGTTCTTAGATGGACATCACATCCCTGGATCGCCCTTCA CTGTCAAAGTTGGAGGTCTCGAAGGTGACCCAGGAAAAGTCGTTGCATAC GGACCCGGTCTTAAAGGTGGAGTAGCTGGATTACCTGCTGAATTCACTGT CAATGCACTTGATGCAGGCTCAGGTGCTTTAGCTCTGTCAATCGATGGAC CAGCTAAAGTCAAGATGAACTGCGTTGAACAGGACGATGGCACATACAAA GTTATCTACAACCCAACTTTGTCGGGTGTTTATGAAATCTCAATCCGATT CGCTGGTCAACACATCCCAGGAAGTGCATACAAGGTTCGCATTGTAGAAT CTGAGGACCAATTAGACGCCGCCATGCGACTCGGTGATGCCAGTAAATGC AACGCATCTGGGGACGGTTTAAAGAAAGCTCGTCCTGGACAAGCTGCTGA ATTTAAAGTTGACGCCAGTGGTGCTGGGCGTGGTTCCTTAATGGTCGGAG TTGAAGGGCCAGAAATTCCGGCAAAAGAAATCATCGTAAAACACACTGGC GGAAACATCTATAGTGTGAACTATGTCTTAGAAGAACAAGGTGATTACAT CTTGAAAGTTTTATGGGCTGATAGTCATATCCCAGGATCACCTTTCCATG TTACTGTATAAGATGACTTTTATCTAGTCGTCGCCCGCTGTTGATGGAAG AGATGTGATTTAGCTCTGGAGCTGAACATTAAGCTGAGAGCCGTGCTCCG GCCATAGAGAACTCACCTTCAAGATTGTGAGATCTTTGTCTTGAGTCGAA ACAAATGAGCTCATGGCGAAAAAAAATGGCGAAATCAAATTTGCACtcag ataaaaaaaatatgacAGACAAATGAACATGGAAAACAAATCGCTCGCCA AAAATCTTAGGAAAACCTTTTaaccaaaatattttataaaaaatagcaaa atattttttgaaaccaTTTTAAATCTACAAGCACTAAGTGAAGTCAGAAA ACATGTTTAGATTTTACCACAAACAGATCCATtggatttgaaattgaaat gaactGAAATATCTAGTCACGCCTTTTATAGTTTTTGGTCAATCAccaat tttttgttgttttaaaatattttcattttcttaattttcattttagcctt ttttctttttgtgcttGATATTTTAGCCTTTTGTTGATAGAATGTATTTT TGCTTTTAgtttaatctttttttgtttatataccttttaagaaaaattaa tttgtcacattttttgttttgtttttgtcttttttagacAATAACCTTGT AAATAGACGAATCTTTCTAAATgcaaaaagatttcttttgtacTATGTTA GCTAGCATTTAAAAAAGAACGCGCTAAAAAACGTTTTATTTATAATGGAT CAAAATTCCAActttgaaattggaaaattctcatttcttcgAGGGTTCAA GAGTTCAATTTAGCTCAGTGCAGTTTTCACGTgaatccgccatcttgaat cacGTGAAGAGCGAAGATTGAAGTTTTCGGCTCTCGTAAGTTTTGAGTTT TTTGTTTAACtacaaaaaatttcttcctttgaaattATGCGCGtaatatt attattttgttagatGCTTTTAGTACTATTTagtattgtaaaaaaaaagt tcataatttttgTTGCCCTGatcttttattatatgtaactaAAGAACGAA AGAAATAGACAAATTCGAAATTCAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00051518TCONS_00051518Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00051519TCONS_00051519Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00051520TCONS_00051520Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00051526TCONS_00051526Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00051529TCONS_00051529Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00051530TCONS_00051530Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00051531TCONS_00051531Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00051532TCONS_00051532Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00051533TCONS_00051533Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00051534TCONS_00051534Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00051529-proteinTCONS_00051529-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_202supercontigscaffold_202:766379..824153 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
FLNCfilamin-C isoform a Homo Sapiens
FLNAfilamin-A isoform 2 Homo Sapiens
FLNBfilamin-B isoform 1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
41.35 36.34 127.88 131.31 68.46 51.03 111.15 145.9 72.25 82.91 48.9 62.03 178.49 183.51 67.06 133.39 262.86 369.71 216.67 246.33 280.03 240.42 169.93 201.27 183.9 207.6 807.01 960.01 795.02 856.72