|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at scaffold_234:417652..426466- Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_033980 ID=XLOC_033980|Name=XLOC_033980|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8815bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_234:417652..426466- (Clytia hemisphaerica) TTCAGATGTTAAATCAAATAGATTAAAATAAATGTAAATACATCTTGTGA
ATTGCTATTACTTGGAAAATGGTTAAAATGAATTTGACTACCATCTTTAT
TTGTTTATTCTGGTTGCTAATGGTAACCTGGGCACAAGTGGACGAAGAAG
AAGTACGGGCATCCCATCAAAAGTATGCGGAAATGATGAAACACGATGGT
AAAAAGAGGGTAAAAGTCATCACTCAAAAGAACGTCAAATCCTTGATGAA
AAAGAATGAGATTTTGGTTGTTTTCTTTTGGGTGGACAATGATAAGAAAT
TGGAAAAGTTGAATGAGCAGGATATGTACTTTCTGGAGGTAAAATGATTA
TTTCTCAATTTATTTTCCTGGTAAATTTGGGTATATATACGTCAAGGTCT
GCTTAATCAAACAGCATTTCTCTCTAAATAAGTTTGAATTCATTGACCCA
GTGATATCCATATTTGAAGCCTATCGTAGCTTGGATCATGAGATTTACGT
TTGGCTTGCTGCTTTTCATGATATTTTTCTCAAATTATTTCTGTTTAATA
ATATTGAAGGGCTATGCAGTCGTTGTATAGAAAATTCATCAGAGCAACGA
CTGTGTTACAACCCTTCTTAAAAATCTACAATACCAACTAAGCAGTCTAT
CTGTTCCTTGATTCGTTACCGGGCTGCAGAGACAGGTTAATGTTAGATAT
AGCCGGTTATTATTTCAAGTCGATATCCCAGTTATCTAGGACTTGCCTGG
AACTTCCGCCATTATGGAAGCAAACGTTCGATTTGCGTAAGGGATTGCCC
TCTACAGATTCGAACGTTTGCTTCCAAAATGTCGAGGATATTACGTAATT
TAACCAAACATATAAAAAACCTCTACACAGTCTTACGATTGTTTTCACGT
GAGGTCCACGGCCAGCTGTTTCGGCTCGGGTGTAAACTCAATGTAACATT
GAAGAAGGAGTTGAGATTTGAACCGGGGACCACCCCTTGACTGTGACGCT
GACGCTTTAGACCATCACATGATTCTTCCCTGAATATTATAGTTTACTTT
ACTCGTATTTTTATTGACAGACGGTAGCACAATCGTTTGAACTACGCAAA
GTTGTCATAAGCACTTGTGAAATCATGGCTAACCAAGAATTTGCTTCAAT
AGCAGGTATGAAAAAGAATGAGATGTTTTTTGTAAAGTTTTTGATTTTTC
TAGCTCGGATAAAATTCGGATACATTCTTTTAAGGTGTTTTTTTTCAATT
CTGTGAGAGTTCTATCCGAAGCTTGGTTTTGAAGCTCTCTAATTTGCTGA
AAGCGATTTCGGCATGTATAGCCGTTCCAGTAACTGTACCAAGGGAATTA
GACGCGGGAAATATTTTCGGCATGATATAGCATTATTTCGATTTATTTTT
CAATTTTGTTATTTAGAGCTTCGATTCAGTGGGATGATAAAGATTTTCCA
TAAAGGCAAAGTTCAAACATACGGTGGACAAAGGTAAGGCGTATAATTTT
TGCCAAGACGGTAAATAATAAGCCGATTCCGCATGACGTCATTTTCACCC
GCGATCAGCCATTTTTTAAGAAAATGGTACAAACAACATGTCCAGGATGA
TTTAGTAATACCTTGATAGCTCAAAGAGTTCAAATGTTTCCCGTTTGGAC
CTGTGTGTAGATTTTTGCTTGTTTTTGTTTCGTTAGTGAAATTTATGTCA
GTTAAGAACAGGTAGCTTGCTTGAGGGTTTGCTTGAAGATAGTCCCTTAA
TGGATTTTGCCGAATTAGTCTATAGTTGACTCTCGCTTATTCGAATTCGA
ACGGGGAATCTTATTTGTTCGAATTACAGAGATTTGAATTATTATAGAAA
GTATTTTGAGAGGGATTCTCCTTGGCGGGGACTTGGAAAAAGTAAATAGA
TAAATAGATTCGTATAAAAGAAGTTCCAATAAGCGAGAGTCTCAAGGAGT
AGAAAAAGGAATTAAAACCATGTTTTTTATGACAAAATACTTGAAAACTT
GAATATACAAATAAAATCTATCGAATTCATAATTCTTCACAGGAAATTTT
AAAATGATTTGTTCTACATTCAGTTTAATCTCCTTCAATCACTGCTGATA
TTCTGAAAAAAAAATTATATCTTTCTTACCTAGGTCACCAGACGTTCTTA
TTCCGTTCATCTTTAAGGTTGGTAGTCTGCAAAAAAAACTTATCAAAGTA
CAGAAGTTTACATAACTTTCTAGCTTGTCCTACTCCTACCACGGGTGATT
CTCCTCAAAGGTTTTCTTGAAATTTATGCTCGCGCGGCGCGGGAAGTAGC
AAAATTCGTTATCTTTTCCAAGCTTCCCAAAGTGTACTGTAAAGGTCGAA
AAGAGCAGAGATGAGAAAAATTGCACTCTAAGACTGTAAAATTAATAAAA
TCTGACCATATTTTGCCTTTAAATGCTCAAACATTTTCAAAATACACACC
TTATGGGTCATTTTTTTGCCAAAGTTTACTCAAATTCGGCTAAATTTTGG
GCTGCACGTACGGTCGTTTTTGAATCGAGTAAACAAAGGGTAAGAGGTAC
TTTAAATGATACTCTTTAAAACGACGATAATTTTGTATTTACCATAGATG
TTGACACCATCGGTCATTCAAATTAAGAAGAAAGCAGAAAAGAAGAATTT
TGACGATATTGATCTGGTCAAAGTCATTGCTTACGTCGATAAAAACAGCA
AAGGTAAACCATAGTCCGCATGGAAATTTTTGGTTTTGATGTTGGACCAT
TTATAGTAGTTTGAGCTTTCTGTGCGAATTTTTTTGGAACATATGTTCGT
AGGATTGCAACAAAATCCGAGGAAACATTTAATTTCGAGGAATTTACTTT
CTCATCCTACCGATAAATTATTATTCTTGTGCAATATAGGAGGACCGAAG
GGCGAACTTTTAGAAAAAGTCACTCTTAGGAGAATCTCTTTACGTCCATT
CTATGAACTTTCGTTTTAAAAGTGTTAAAATACCATTTTTCTGAGTTAGA
CCAGAGCAAAGCTGAATAACAATACTGGAATAACTAGAAGTATGTATCGG
TTCTTTTTTCTTCTTCCACCATCAGAATACAAAGGATTCGAAGAAGCTTC
TTACAAGTACCATCCGTTGATACCATTCTACTATGTCACCGATGCCAAAG
TAAGCTCTACTCAAATATTTGGAATATTAGTGATATCTTCGGTGACAATA
CTGTTGCTGTTGGATTAGCTTAAAATGGCTTGGTGACTTTTGATTACAAC
GGTGACCTTTAGTGAGTTTTCGAACATCTAGTTGCAGCCTGAAATATAGT
GGCAGTGCCCCTGTCAATTTCTGTGAGGGGTGTTGAAAGACAAAGGGCTG
TGTAAGGGGTGTGTAATCTCTCTAGGTTACTTTTCTTCTCCTTAGCTTCT
TTGTTCTAAACTGTGTATGAAATGGCTGCCGCATAGTATGATCATACCCA
GCTGGCACACAACGTTGTTTTAACGTCCAAATAACGTTATTTGGACGTTA
TGAACGTCACATGGACGTTGTTTTGACGTTGTGTGCCATCTGGGTATGCC
TTGATTATTCTAATACACTGTTTGTCTCTTTTTATTTTTACTTTACAGAT
TGCAAAAGTGTTTCACTTGAAAAAGAAGAACTCCTTTCAGATCATAAAAC
CATTTGAAAAATCCATCAGTTTTCCTGCAAAGGTATTACAGTAGACTATC
TTTATATCAATCTCGTAAGGGAAGCAACTTTTTATTCGAGATAGTCCTTG
GTTAATATGGATAGTGCGGTGTCCTGTACTAAGTAGACCATAGATTTATT
AAAGCCCAAAGAACTATGTCGTACTTTTGCTGAAAAGTGTGCCTTAGTTA
GGTAGGAAATCCTACCAAGGTCACGTATCATTACAATAGAATTTCAGTAC
TTGACCAATCAGAAGCTTTGCAAGCTTTCGAAAACAATATAGACGAGCGG
CCGAGCTAGTGAATTTTCACTTCGTAGGGCACCCCTTAGATCAGGGCAAA
TTTTTGATATTATGCTCCTAATAGGGTGTAGAATTGACGAAAAAAATTTG
CCCTTCGAATCTCCTGCAGTTTTCGAGTGAATCGATTTTTAGTTAATCGA
TAGAACTTATCAAGGGTCCCCCCTTTACTAACGGTTTTTTCGAAGTCTGA
AAATCAAATATCTGATGCTACCAACTGATTCAGCTTGAAAAGTAGATAAA
AAATGGGGTTATTTTTTAAGTTTCGTTCACCTGGTGCCGAGAAACGGCAT
TTTAAGGCGAAAAATCGACGTTTTGGGCGTTTTCCGATGACGTCAGCATT
TTCCTAGAAGCATTTTCAGAAAAAATCTTTCCCACGACTGGATAGCCCTG
AATTAGTAGTATCCAAAAATGGTATGCTTTGTTAACTTTCTATGTCTAAA
TCTCGAGATAATTCATTTTTAAAAAGGTGGGTAAATAAATATGCTGAAAA
ACTGCTGACTCAGCAAAAAATATCGATAATTTTCAATATTTAAACCAAAA
TATCTCGATTAACTAAAAATGGATTCACTCGAAAACTGCAGGAGATTCGA
AGGGCAAATTTTTTTTGTCAATTCTACACCCTATTAGGAGCATAATATCA
AAAATTTGCCCTGATCTAAGGGGTGCCCTACGAAAACCATTTTTAAGGCC
TTTTCTGAACCTCGGACGCTGGCCTAATAGCAGTAATTTTCTTTGCGATA
TTCATTTTTTTTTTTGCTTGGAAGAGCTTAAAGCACGACATCTAGCCATT
CAGGTTTTACAAATCTGTGGAGTAGACTTGCTATTAGGTCTTCGTTTTAT
CCGACCACCACGCCACCAAGTGGCAAATATTTAATCGGTTTCCCTTTTTA
AAAGTTCCTGATTTTATCATCCATTGTATTGTTATTGATTTCTAGGGTAA
ATTGACTTATGAGTCCATCGTCAAATTCATGAACACCAATAAACAGTAAG
CTATCTCACAGAAATATTAAATTCACAGAAATAAACCGAATTGATAATAC
TTACTTTAGGCGTACAAACTTTCGCGAGCAGAAACTTTCGTGAGGTCGAA
GAATTGCGAAATTTACGACATTTACTTTCGCGAATTTGGGGAAAAAATTT
TTTTACGCAAGCATAAACTTTTGCGAAATCATTAGATGAAAAAGAAAATT
ATAATGAAAATTGCCTTAAAAGTGAAAGATATTCCTTGAATCTGATAAAG
AGGGTTGCTCTTCGACTTTAAAGAGGCATTAAAGGATAAAAATTGGCCAA
AAGTTTTATATTTATAACGATTTCGAGGTTTTATAGATTTCCCTTTTTTT
TGAGAATTTTTCGCGAGCATAAACTTTGGCGAATTGCTCTGTTAATAATT
TTCAAAGACACTTACCTTCGCGAAAAAGGCTAAAATTTGCGAAAATCGCG
AAAGTTTCTGCTAGCAAAAGTTTGTACGCCCAAAGTAAATATTTTCTTTT
TCATTGACCCTTGGGGAGATGGAAAATTGGCGTTTAGAGAAATATTTCCT
TAAGTTTTGATGAAATTTTCAGGACCTTTTTAGAATTTGAGTCGGTTTTT
CATTTGAACGAGATTTAGTTTATGGTGTGAAAAAGGTACCTTCCGCTCGC
ACATACTTTATTGTTATTTTCTTATTTATAGAAGTATATTTCTCAGGTCT
ATTAACCTATATAAAATAATCATTTGTTATTACAATTTATAAAATTATAT
TTCCATTCCATCCCCTTCCCGAACTCAAATTATACCATGAAAAATCGGGT
TTTTAGGTTCTTAAGCTATTACAGGTTCGCTTTGAATTTATACCGTATTT
ATTCTTCCAGGGAAAGGTTGGTTAAATTGCGTTTGGAAAACATACATGAA
ATTTGGGTAGGTATCTTTTTCTTCATTAGGTATTGGAATAGTTAGGTTAA
GTGTCGAGTTTATATAAGTTGCGAGCTTGCTTTCCGGTTAGCCTGTAGAA
TAGATCCGGAGCTTGAACGAAGGCTAGAGAAAATTCGTCCGTCGTCGTGA
TTTATCTATCGATACTTAACCTCACTAATGCTTAAAGGTTATGTAACAAA
CCCATCATTAATTCCGGCCAAGCCATTTTATTTGATGACCCAACAAGGGA
ATCTCATCAGCAACAAATATAAGTACCTTAAAATTTGCTAACCTAAACTC
GAGAATAGACTGCAGTTAGTTTCGACTTTAAACCACCCCAGAAAATCAAA
GTTATAACATCCCACGTGAGGGCTAAGAATGTTAAATCTAAGTGATTGAT
TGAATTTGTACCTGTGAAAGAATACCGTAGATATTTTCCTAAAGTCGCCA
CTCAATGTAATTAAACACGATTATCTTTCTCAATAGGCAATTGATCTCAA
AGGCTATTTGGTAACCATATTCGCCAATGTCAAAACTCAAGGTATGTCTC
TTCTCTCATTCTAAATAGATGGTCATCCGATATACTTGGTTTGAATTTAT
TTTATGACTTGTTCGTGGCTTAAATAATTACGTGCTATCAAAATTTCGAA
GGAAGAGAGGGAAATTTTCAGTCGTTACCTTTATCATTACATTTCTTTTA
AATCATTTAGGTGGCTCCAATTTCTTTGGCAAATGTAAGAAGCTCAGTAA
ACAATTCGAAAAGAATAGCAATTTGACTTTTGTTTGGATTGAAGCTGAGC
CGTTCCCACAGGTTTATATGGAAATATTTTCGATTCTAAATGTTTCTCGA
CACCTTAAAAACAAAAGTTTTTCAAATTAGCTGTCAGTAGAAAATTGCAA
TTACGAATAACTTTTTGAAGTCAATCAGTGATTAACCTTTGGTTTTACTA
ACTTTAACACTCAGCATTTTATGGTTCCCTATTGTTCTTGTTTAATTAAT
TAGCCAATCAAAAGAGACCATAAAATGCTGAGTGGGTAGCGGCCTTAAAG
AACTTAAGTTACTGAACACGACTACAAAACCTATCCTAGACGTAATTATC
AACATCTACTTAACAAGTGAAGCTTGAAATATAGGTACCTTTTTGCCTTG
AAATTGTGTCTAACCGGCACATAACTGGAGTTTCGGAATTTTCGAGGCTT
TTGTGACCTTTGCTTTTATATATATTCTGTGAATCCTTTGTGTTTATCTA
AACAGATATTTTTTTATTCACATTTATTTTATTTATAACGTTTTTGTCTA
ATTCTTCCAAAGATGATTGATTACTGGAGAAAAAGTTTTCGAATCGATCC
TTTGAAATCGAATCTTGGGGTTGTTGATATACATACGGTAAGTGGTTTTG
TATACCTCACTTTCTTTCTTGAAATTATTTGGCCCTACAGTTGACTCTCT
CTAATTCGATCTTCATGAGACCAAAAATTTTCTTCGAATTAGAGAAATAT
TTTAATTATCGAGAGAGTAATTTAATCCACTTTCCAGTTGAGGGGACCAA
TATTTTAGTTCGGATTACAGAAAGATTCGAATAATAGAGGTTCGAATTAG
AGTGGGTTGATTGTATTTATAAGGTAAGTAATGTAATGAAAACGGCAGTA
ATGAAAATTACTATACTATATTACGTATTCGGAAAATTCATTCAATTAAT
ATTTCCTTGTCAAAAATTTCTACAGTTTAAAATTCAAATGTTCGTGTCAT
TCAACTTTTTTTCAGCAAAAGTCAACTTGGTTTGAACTTGCTGAAGGTGC
AAGTGATCAAGAAGAATTCAAATCAATGACCAAATGGTTGTCATCTGTTT
ATGATGGACAAATTGAATTTGTTGCTATGCGACCAGCGGAAGAAGTGAAA
AAGGAAATGATGGAAGAGGCGGAAGTGAAGAAACGAAAATTACAAGAGTA
CAGCGAAGAAGAAAATGAAGAAGACGTTGAAAAGGATGAGTTATAGTTTC
TTTCTTGGCTAGGGAATTATTTATTTTAGTACTGCCCCTTACATTGTTTG
GAGTGACAGGATATTCGAAATTCTCTCAACGTCATTTTGAAATTGTCACA
TCATAGAAGTCACGTGTGTAAAAACAAGAAGAAACGAAAATTAAAAGATG
GTGAAGATGAAAAGGGTGATTTAAAGTTTAATGGTAGAGCCTCTTGTTTG
GAAATTATTTATTTTAGCTATAGTACTAGTACTGCTTATATATTAACTAA
GAATTTTTCTGTTTGGCTAACTTTAAATTTTGAGATTGACCCTTTTTCAT
GTAGATGGGATTCCCCTCACTATGAAAAAAGGGCCAAGCTCAAGTTTAAG
GCTAGCCTAACAGAAAAATTCTCAGTTTTCTCAGGCACTAATTTTGAGAT
TGGACCTTTTGCCTTGATGGCAGCGATATCTGTATTACTTGACAGGCTTC
TCTACAGCAATGAAAAAGAAAAGGTTTATAGTCTAACTTCTCTTCTCATA
CGTTTCACTTGGAGAATTATTTGTTATAGCTTGTGCATATAATGTAGTCT
GTACACAGACCCGATATCTATGGCTAATTTCAAAAATTCATTGCCGTAAA
GGGTCTCAAGATTCGATCGCGTTCGACAATCGAATTTCAATGGGTCGATT
GCGTTCGATTTAGTTCGACTGGTGCGATCGTTGATTCCATTCGATTGAGA
TTGTCTGGTATTAGGTATTTCTTTTGAAGAATTTTAAGTTATTATAAAAT
TAGCATTATAAGGCATTTTACATTTTTTATATGAAATAGTATTTTATATT
TTAGATTATAATGGGCTTAAACTCAAAAAATACTTACTATGCAATTTATA
GATTATTCCTTTTTCTTAACGTTAAGGATAATTTTGACTCACACCCAGGG
TCGAACATTTTTCACTTTGTAACTGGGTAGACACGGTTGATTTAGTTAGT
TTTCCAAGAAAGAGC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_234 | supercontig | scaffold_234:417652..426466 - |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog Name | Description | Organism |
CASQ2 | calsequestrin-2 precursor | Homo Sapiens |
CASQ1 | calsequestrin-1 precursor | Homo Sapiens |
|