XLOC_034904 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_034904
Unique NameXLOC_034904
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_253:93661..116103-

Legend: gene
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>XLOC_034904 ID=XLOC_034904|Name=XLOC_034904|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=22443bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_253:93661..116103- (Clytia hemisphaerica)
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CCACCCAAAGAATTTCGAACATTTTTTTTGACGTTTTGTTTTCACTTTTT GTATTGAAAGCGGAGAAAGAAGAGCTTGCAAACACAGTCAGTCACTCATT AATACGAAACAATAGATCTGTCAATTAAGTGGGTGATTTATTGTTTTAAT GATGCTTTATGTTGTAATTACCTAACACGAGAGTGACGAATTTGTTGATA TAACTATCTGTCAACTACTGGCCAGTCAGTTTATTACTTGATAACATCTC GCAGAAGAAAGGCGCCTGCTGCTTATCTCGTTCGCACCACTCCAGCACTC AATTTCACGCGAATTACTCATTGAATATTTATCTTTTGGCTGAGAATATT TCAACTGGAAGTTTGTTTAGTATATGGTTGTCGTTTTGGTTTGAGGCACA TTTAACGTTTAAAAGTTAAAATGAGAAAAGAATCGAGTTTTCTGTACGAC TCGGATTCGAGTGATCATTACTTTGAGGTAATTTTATTTTTCAAAATCTT GCAATTTGTGTTTTTCCATTATATGTGTATGTTTTTCTGTAAAAACAAGG TACTGAACGGTTATTCGCCCTTCCCTTTCGTCATTTTTTGAAAGTCATAA GCAAACGCTATTCCGTAGATTAATCTTGAAGTATTTGGGGATTGGACTAA AAATTGTAGTCAATAACATGTCGATGTAAATAAGTATTTATTTCACTGAT CAGCGTTTATAATACTACTGAAGCAGTTGGACCTGAGGCTGAGGAAATTC TTCAAGTCACGACAAGTTTTATTTGAAAGTTTCTAATTACTTAACACGAG TATCACTTAGCATCGAATCTATTTATATCTTTTGTCGTGTTGAAAATCAA TGTTAAACACATTAGCACGCATGCGACCAAAATAGAAATCAAGAAATCTT AAGAGAAATCCTTACTGTACCTGCAGAAAGCACACACTTATCATTGTTTT CCGCCTGAGAAACACGTGCTGACGTAGAAAGGAAACTGGTCTATATCTTC AAAACGTGTTGACATGGCCATGTTGTTTTTCCACCATCTGTATTAAGCTA CACGTTTTTTTTTATAAGAACAAACTATATAAGAACATAAGGCCTCGAGG CCCAAAAATTTAAGAACATTCTAAGAACATTCTAAGGCTTTGGAGACTTA GAAACATGTATTTTCTTAAGAAATTACATCAAAATGCTCAAAAAATGCTG AAAATAAGAACATTTTAAGAACATTTTTAGGCTTCAAATCCAAAAAACTA AGAACATCCGAAGGCTTCGAAAATTTTTGACGTTCTTATAAAAAAAAACG TGTATAGTGTTTTTGTCGGTTGAGAGGGAAGAAGGCTCTTATCGTTTTCT GTTCTACGTCACATGTATGTGTCTGATGTCATACATAGGAGATCAACCTG CAGTAATAAGTCATTCCATTTGTTTGTCACTGTTTTGATTGTGTTTTTGT TTTTTTTGGGTCGAGCGGAAAATAATTAACGGTCTGATGTCAGTGCAGTT ATTGATTAGAGACTAATTACTCTCGTTCTAACAAACAGAAACACCAGTTT TGAAATTCAGATTTTGTGTTTAACGAAACCCATAGTTGACGCTCTTTAAT TCGATTTTCAAAGGGAATTAGCTTTTCATCGATTAAGGGAGCGTGTCAAG TAGAAGAGCATCAGCCTATATACAAAGTTTTATTTACCCTGTCTATTAAA GCCTTCATAATGATTCTCGATCTAAGCAAATCTAATGACAACTTCTTATT TTCTTTACTCTATAGGACGACACACCATGTTGCAGTCTCGTCATTTTACC AGGCAATCGGTCAGAGGAAGATTATCTCCGTAGTATTTACAGCCGGATTA CCACGCCTTCGCCTGTATGGAAAGAATCAATATCCATCGAAACATTCAAA AGCAATGGTCGGCAAACTGCCAAACATGCCCACTTAATACCACGTTGCTG TCGCGAGGAGGAGGTCACAACATCCAATAAAACTCCTACACAAAGTTTAA GCGTCAATTTCATTCTTCGCGAGGAACTTATTGGAAATGAAGTTCATAAA ATCCGTCGTTTATTTTTCAATAATCCGTGGAAATTTCATCACACGTTTCA GACGTACGACGTCGAGAGAAAGAAAGTCGTCGCCAAGCAACCTTATTACG AACTGACGGAAGAATATCCACTCATGTCGCCGTCAGTCTGCCATCAAGGT TCTTCAGTTTTACGGTATAACATCTTTGTGAAAGAAAACTTTGACGAAAT GAAATATTTCTATATGGATTTACTTCGCTCACAACCGATGTACGAAGAAG AGAATTTTTGCTATTTCACCATCTTCTCAAAAAATGGAACTGAAATTCAA CTGTCATTAAAACATTCCAAACAATTACATATTGTATCCACCAAAAGAAC ATTCTTAAAAGTCCACTTAGACAACCTTTATGAAACTGTACACCAAATGG GTGCCAAAATTGAAGAAATCTTTTGCAGCGATTGTGGGATTCTCGTAACG CGTGACCCTGAAGGAAATCCGATTCTGATCACAGGTAAGAATCCGTCTAA AAACAATCCACACAGTCGACAGTCTTCAGGTAATTCAACGTTATTACGTA GACAACAACAAGAGAAAACGCAAAAACAACAACGTAGATCTTTGGACGAG GATGTTTGGAGTGATTGCTCAGATTGCTCAGAATGCTTACGTCAGCAAAA ATACAACAACAATAACAACATTAATAACTATCGTCAACCGAGTAAAAACA CTAACAAACGAGCCAGTCGTTATTTTTATCAACCCGATCAAAACGATTCG GGTTATCATAACGACGAACTATCCTCAACTGACGAAGAAGACTGTTTATC TTTTTCGCCCCATTCTCCTAAAAACGGTGGCACCTACTCAGCCCATTCTC CTAAAAATGACAGGACACTGACATCTCAACAACGCAGAGATCATAGTAAT TGCCCAAGAGGTATCACTCAATTGCACTTTCCTACTTGCCCGAATACAGG ATGTTGTGATCGATACGGCAGACCCTTCACCTGTTGCGTCGTTAATGTTT AATCGGTCTTGCAACAGACTATAGAAAAGACAACTAGACATAAGTCTAAG AAATGTTTATTTTTGATATTACTTTTTGACGATTTTTTTTTACGAGCAGA AATCTTTTGTTCTATGAAAGTATGTTCAGAAAATGAAAATCTATCCTATG CATTTCGATGCTTTCAAGTAATTAATCTGACTTTTGTTTTAATTAATCGA ACTGTTTTTGACATTTTCCTATACTAATTTCCTTTTTGTAATTGTTTACC TGCGATTTGTTCGCTCGTTGCCAAGTAAAGAAACTACCTGATTCTTGACG AGATCTAGTTAATCTTGATCGTATAACAAAGTGGAATAAGATTCGAATGT ATATACAATAGAATTTATTAATAAAGCTTATCGTATGATTAGA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00055472TCONS_00055472Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00055471TCONS_00055471Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00055470TCONS_00055470Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00055472-proteinTCONS_00055472-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_253supercontigscaffold_253:93661..116103 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
8.13 8.05 2.8 1.48 7.61 5.79 6.06 6.32 3.47 4.25 3.17 2.93 36.8 28.39 22.6 26.72 19.31 26.25 24.82 20.5 6.52 6.38 8.4 8.29 6.58 7.99 1.4 1.12 4.69 4.42