XLOC_035593 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_035593
Unique NameXLOC_035593
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_276:441252..450810-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_035593 ID=XLOC_035593|Name=XLOC_035593|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9559bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_276:441252..450810- (Clytia hemisphaerica)
TTTGTTGTTTTATTATGCCTGTTTTGAATGCAAGAAGATTTCTAATCGAA AAGTGTATTGTGCAGTTTAAAGTGATACAGTGCAAAAAAGTAAGAAAGAA TGTTATCAACTTACCTCCATAAGATATGTGACTTGTTGTTCGAGCATGTT AGAATGTTCTTGCGAAGAAGCCAACAGCTCTAAATTCTTCATAAAATGTC CAGTCAGTTGTCCATAATCCAGTGGTGCCCAATAATAAAATTCTTGTCCA TTGTTGTAGTTTTCCATCATAATTTTTAAACTTTTTTCACTTTAATAAAC AAAACGCTTTCTAACGTGCAGTCAGAAATCGAAATTCACTAAGAATGAAG AATTTTTGTCACTTTCTTTCTTATAATTCGTTAAAAAAGTGACGTTAAAT TTATTTTTCTCCTATTTGACGTCAAATAAGTCTAAACAAAGAATCGAACG TTTGTAACGGTTTTTTGAAACGTTCGAATTCCACGTGACTCCATGTGACT TGAGAAATTCCACGTGACTTTTTACACGTGACCATTTTGATAACTTTGTC CAATTTCAGCCTCAATTTTGCTTTTTGACAGTAATTCTCAAAGTTGTTGT TGACGTTGGTATGGCGTTACCAAGGCGTTGGTATGATGGCGTTACCAAGG TGCTAGTTTGGTGTTGTCAAACAGATTGTATAGTGTAACCAAGGCGTTCG TAGGGCATCATGAATTTACTGACATAGCGTTACCGAGACATCGATTTGGT GCTACAATAAAGGCGTTGATATGACATAACCAAGGACTTGACATAGAGCT ACCAAATTTCTAGTGTTAAAAGATCCCATCCGACTCTTTATGGTAAGATT CATGTCTCAGAAATTTGCTTGCTTTTTGTATAAGACTAAGCCATGCGCTT TTTATACATATTTCAGCAGGCTTTTTCCCATGCCATTATACACTTCGGTA 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ACAGTAATGAATCGTAAAAAAAGTAAGTATGTTATCAACTTACCTCCATA AGATATGTAACTTCTTGTTCGAGCATGTTAGAATGTTCTTGCGAACAAGC CAACAGCTCTAAATTCTTCATAAAATGTCCAGTCAGTTGTTCATAATCCA GTGGTGCCCAATAATAAAATGCTCGTCCCTTGTTGTAGTTTTCCATCATA TTTTTTTAAATTTTTTACACTTAAATAAACAAAACGCTCTCTAACGTGCA GTCAGAAATCGAAATTCACTAAGAATGAAGAATTTTTGTCACTTTCTTTC TTATAATTCGTTAAAAAAGTGACGTTAAATTTATTTTTCTCCTATTTGAC GTCAAATAAGTCTAATAAAGAATCGAACGTTTTTAACGGTTTTTTGAAAC GTTCGAATTCCACGTGACTCCATGTGACTTGAGAAAATCCACGTGACTTT CTACACGTGACCATTTTGATAAATTTTGTCCAATCTCAGCCTCAATTTTG TTTTTTCGACAAAATGTTAAAGCAGAAATTCTCAGAAAAGTGCCATTGGT AAAATGCATATTTCATCTTAATTTTCACTGATTGTTTTTCTTTGGCTCAA ATTTAAAATCTCGTAATTTCTTAGGTATCTATTGAGTTGCAAAGTTGCGG TATCTAGACGTTGGTATGGCGTTACCAAGGCGTGAGTAGTGTGGGTATAA TGGCGTTACCAAGGTGTTGGTTTGGTGTTGTCAAAAAGATTGTATAGCGT AACGAAGGTGTTGATACGGCATCATAAAGTCATGACATTGCGTTACCGAG GCATCGATATGGTGCTACCAAGGTATTGATATGACGTTACCAAAGACTTG GCAGTCAAACTTCTAGTGTTAAAGGGTCCCATCCAACTTTTTATGGTAAG ATTAATGTCTCAGAAATTTGATTGCTTTTCCTAAACTAAGCCATACGCTT TTATCCGGCTTTTATACATTTTTTTTTCCATGTCACCATGAATTTTTATT TCTATCTATTTATTTGTATACGCCTAAAAAGCTAACATCACACAACTGTA AGATTATAGAGCTTGGTCCTAGAGAATGAAAGTGCAAACCCGTGTTTACA AAACCTTCCTAGCCAACCCAGGGCAGCAAAACAGAAATTAATTGCATCTG CCACCATGACCAGCCATGTTTTCTTGGAAAATGAGCTTTCCTGGGTGTCT TCTTTTTCATGTTTTCATGTAACAGAAAGCTGTATTTTGACTAGCAAATG CTGGGTTACCCTGTTTTTGTTGCATAATTTCTCCGCGATATGTAGATCTG CCCTTACGGCAAGCGGACTGCATTTTCATACGAAAATGCAAATCGCTCTA GAGAGACCAGGCTGTAAACCAGAACATAAAATATCAAAAACTAGACTATG AAATAGTTTACAGCCTGGATATCCAGGCTAACCTCGGAGGTCCTTTAATT TAACCTTCGTTCGTTAGCCTTCTAGCTATAAATTATCATAAGTGCTAAAG AAGCTCCCTGTAATAGGTGCTACAAGATTCCGTGAAAACATTTATGTTCC CTGGTTGTTCTTTGAATTGAAAATTAATGAAATTAGCCAAAAAATTGAAA GTAACGATTATCACCATCGTTGAATTAGGCAACTAAACCAACCTTAGAAT GGGCCATTTCAGAAATACTTGTTAATCAGGTGTGATTAGGTTGATAATCC AGGGTGTTCAGTAAAACGAGTTCAAAATCCAGGGTGGTCAAAAGAAATGA GAAAAAAATCCAGGGGTCATGGCGGGAATTTAATTTGGTATTTAAGTTTT TTCAGAGGAAATTTATTTTGGTAGAAAAAACTGCGTATATCCCACGCGGT TACTAAATTAACTGCCATCTTGAGTTCAAATATAGACCCGTTTGTGTGAG TGGAGCAAGCTACAATTTCAGCGATTCAGCTCTCTAACCTAAATGTAAAT GTAACACCCCTGTCTCAGTTACCTGGTGACATTTTTTTTAACTCATGATA ATAGCCAAATCTCATCTAGTCACATTTTGAAGTCTCAAAATTTTCCAGAT TCATCATTCAGATCATTTTCGGCAATTATTTTGCTAGTATAACAAGGGGG CAGGTATGACCGAATCACTGATACAGGGTTGTAGTTTGACTTGAGAGGAC ATACTGCACATATTTTTTGCAAGCATAACGAAAGGCTTAAACTCGGTGAA AATTGGGCAAAATGCTAAGCATACATAATACATCCAAGCTGAAATGCAAA AAAAAACTTGTGCAGCTTTTCTCAAACCAAACCAAAGATTTTTGCCTGCG GCACCAAATTACAAAAAAACTATAATTTTTTGAGCCGAATTAATGTTCCG ACTTAACAATTCGAGATTCCCATGAACCCAAAGAAAATCAACAAAACAAA GTCTAAGCATATAAATAAGCATAAATTAGGGCTGAGAATGAGATTTTGCT AAGCATACGGAGTCTCGAACCGATTTTTCCGTATGCTTATAAAAAATGTA TACTTACTAATACTGAAAAAAGTTGCTATAACGAAACGCTTATGTCAATA CAAACTTTTTGTCTTAGGGTGAATTCTCTGTCTTTCTCGAATTAACTACC CTGTCACGAAAAATCTCTTGTTGCATATTCTTATTCACTCTTTTGTTTTT CTTCTATTTTCAGGACCACCACCGAATACCTAATGCTAATAATTTTTTCA AACGCGAAAGCACGAATGCAAAAAATGGGAAGGCTTTTCGAAAGCAAACG AACAAACATAAGATGAAAAAGAAATGATGATTTTTCTATTCTTTTGAATA GGATACGACACTTTCAAAAACGGAAAACACCGTCACCACTTCAATATATT TCATGTAAAACGATTACAATTTTAATAGATTTTAAATACATATAGCGACG AAGAGCTGT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00056505TCONS_00056505Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056504TCONS_00056504Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_276supercontigscaffold_276:441252..450810 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

min expression (0 tpm) - - (65.39 tpm) max expressionaGrOo_1GrOo_2FGOo_1FGOo_2EG_1EG_2P1_1P1_2P2_1P2_2P3_1P3_2PoPr_1PoPr_2St_1St_2GO_1GO_2PH_1PH_2BMF_1BMF_2MMF_1MMF_2M_1M_2GEC_1GEC_2GEN_1GEN_2
Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.12 0.04 0.18 0.13 0 0 0 0 0.03 0.17 0.67 0.05 0.92 0.06 0 0 0 0.51 0 0 0 0 0 0.13 65.39 42.94 0 0 0 0.09