XLOC_038643 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_038643
Unique NameXLOC_038643
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_36:925789..941117+

Legend: gene
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>XLOC_038643 ID=XLOC_038643|Name=XLOC_038643|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=15329bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_36:925789..941117+ (Clytia hemisphaerica)
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TGGAGCGAGGGATGGACATCATCTCACAGCTCAACACAGCTTGTGAAAAA GAACAAAACGCAAACAGAAGAAGGAAGATTAATTCACAAGCATCATGTTG GCAATCTATATTCTAGCCGTTGCTTTGGGTAAGTGCTTTATCAAGCCTTA AACAGTATCTCAGTACTTTGATAGAGTTTCCAAAGACACCCCCGTGTCAC ATACCTACTATGGAACCCACGTCCCtggaaactgaaaaatttgatcaagA TTTTATCCCCAGTGAGAAAATTACCCTACAAATTCAGCCCTAAagcgaaa attgattttatacccatttgaaaaataattgaaatcccaAACCATCCACA CTGGATTTTCAATTTAGGAGCAATAGAATGTCTATCCCCATTGATGTTTC CCACTGTAAGAAAATTCtcaccggggctgcgagacaaAGGTGTTCTGATC CATGAAGCTTAGACAATACCTGATGGAAAATGTAAAGTGTTAGGTAGATG CTGATTTTAAATtctattttttacattttacattgGATTTTTTGagtgaa acaaaaatttgtttccAATCGAAAAAGCTACCTAGATTCTTATGGATACG GTTGAATAATTGCCTTTTTGTATATCTAATTCCCTCTCTATGTTATAGTG ACGATCCAAGTGCAAGCCAGTGCTCATAATCCTTTCACATACGAAGACAA TTTGGAAGCTGGTAAGTAGGATTTTATTATGAATTGAGGGAAGACAATAA CGTTTAAGTTGTAGTCTTGAAGAGAGCTGATAAAGTGTCAAAGCTATGCA ATTTGAGTGTATTTTTTGCTTTAATGGTGGGATAAATTTTcgggaattaa atttcgtgGATGGCGCTACGTACTATATTTTGACGATCTTGTGCCTTTTT ACACCAAATTGTGCATGTCGCTTCTTTGATAATAGTTAAACATTCAAATA CAAAGGAGTTACTTGAcattattttgagttttcatCAAAactatttcgcg gatgaggcttttccaaattttcattgggacttaatttcgcgaatgacaCC AAAATCAGCGTAAACAACTGATAAAACCATTCTCCTTCTTTTTTTTGAGT TATTGAGAAATTCATCATcactttaattcttttttttacatttcagtCGA TGCATAATTTTGTAGGGGAAAATCTGGCAATTATCGCCATCCTAATGGAG CCTGTGATCACTACATAGCCTGCGGTGTTGGAtgtaaaaatgctaaaaac agACGATCCTACAAACACCTTTGTACACAAAACATCATGCCGTGCCCAGG TGGTCTTTTCTACGATGAGAAAGCTTATGGAGGATATGGAGCTTGTATTT ATAAAGCTGAATCTAATTGTCTTCAATTCCAAGGAGAAGTTTGCTATGGA TCCACTCAATAGTAAGAGTCATAGTAAGTACGTTTCGAAAAATAAAGCGA CCGTCTTATAAGAAACAAGCCATTATCAATCCAAAAATATTAGGGCGGGT TTTTATTGAATAAGATTCCTTGCTTACTTTTTACGAACATGAAAACAAAG GCTTTAACTGATTTGATAATATATATTGAATCATTGAAAGTTTGTCAATG AATCACTGACTTGATATTTCTTGATATTCCTTCCAGTgaaatattgtttt ttattgatttgataCTTAAGAATTTCTGTCTTCTGAAGATCTCATTTTGA GCACCTCGTTGATGACATTCACCAAAGATAAAAGTTAATAAATGTTTTGT TGTTCTCACAGTGGCACTTACACCCATCAATGTACTGGACAAGTCACCTT ATTGAAACTCGTCTCCAAATCTGGAAGTGTTAGATGCGAGAAAGGTGTCA CGCNTGGACAAGTCACCTTATTGAAGCTGGTCTCCAAATCTGGAAGTGTT GGATGTTACAAAGGTGTCACGCCTGGTTACTGGGGTGGATGTCCAAACGC CCCACCAATCAACGTCTGGATCACCGAGCACAGAGGTGACAACTtcaaat acgtcaaaaaatcaTACTACGACATTAAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00061595TCONS_00061595Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00061596TCONS_00061596Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00061597TCONS_00061597Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00061598TCONS_00061598Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00061599TCONS_00061599Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00061600TCONS_00061600Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00061601TCONS_00061601Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00061602TCONS_00061602Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00061603TCONS_00061603Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00061596-proteinTCONS_00061596-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_36supercontigscaffold_36:925789..941117 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.7 0.58 0.46 0.2 3.73 2.63 1.97 2.36 2.82 2.4 4.58 4.75 46.44 19.07 1218.92 241.69 5.39 4.13 2.58 1.18 0.96 1.06 1.11 0.69 0.76 1.91 0.6 0.95 0.64 0.69