XLOC_038675 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_038675
Unique NameXLOC_038675
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_36:989117..998667-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038675 ID=XLOC_038675|Name=XLOC_038675|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9551bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_36:989117..998667- (Clytia hemisphaerica)
TTGAGTTGAAAAATCCATTGGTTTACCCCCTGACTCACAGAGAGCGAGTA TCGCCATTGACGTCAATGTGACGTCAATCAAATTCGCTTTAAACAGCACG ACAAAGTCGCTGTTCTCCCGTTAATTTTCCACCAATCAATTTACTTTAAA ATATGTATAGTGCGATTTTGTATCGTCTTCCAAGAACTCAAGGTTCGAAT TCTTTCGCGGTTTTTTGAGACGCGAGTAGCGAGGTTCAAAATGTCCGATT AAAAACAAAGATGATCACTGTGTTGACAGTTCCTTGTTGGTAATAATTGA TGGCTACAGAGAGATTCAAGGATGGACAAAAATAGGTAAGCATTATTTAA AGTCCAGGAATGATGGATCAATTTTTTATGGTCAGTATTGTTTCTGTTTT GTTTCTTATTNCCCAGGAATGATAGATCAATTTTTTATGTTCAGTATTGT TTCTGTTTTGTTACTTGATGAGAAGTCTCGTTGAGATGTGACGACGGAAA GTTGAAAAAGAAAAAAGTTGTCACCTCAAAAACTGTTGAATTCCACCCAA AATAATTAGCTGATTACCCCAAGGTGGGTGTAAACTTTAGCTGGGATTAA AGCTAGAGCTAGCTCACCTGCAAGATTTTAAGATTTAGCAGGGACTTGAT TTTTCTCATCATTGGGCCATTCCAGAATTTGTCTGTAACAGGAGGCGGAC GACACGGGATTTCCGAGGGCAAAAGTTTTCACCAAAATTCTAAATTTCCA AGGCGAGAGAAGAAAATGTATGTATTTCCAAGGCAATTGAATTAAAAACG GTAAAAAAGAGTGGAATTTCTGACATACTTTGTGAAAGTACATATATAGA TTTTTATCGGAATTTCCGACCACCGCTGAAAAAAAAATATTTCCGAGGCT AGAAAAAAATTTAAAATGTACCGTGAAGTTGGGTAACTTGCATCAGTGGA 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TTAGCAAAGGCAATTTAGGTGATATAGATCTAGGCCCTTAAGCTAAGGCT AGCTTTACGCTGATCTGCTTGAAAAACTTATCATGAAGAATGTCTGCAAT TACCAGTCAAAAATTTTTGCAATTTGAAATATATTGCAGCCAGCCGCCAA AAGAAATCTCATCAGTAAAGTCTTAGTTTTAGACTGTGATTCTGTCATTG AAAGAGTTCACTTTTTGGTTTGCAGGCTAAGCTACCAGAGAGGACGACGA CTATCGCAGATTCAACGCTTGCACTCTTCGGTATTGAACGAGAAGTTCTC GGAATGGAAAGTCTTACTGTTCGATGGAATACACATTTTTTAGAAGGCGG GTGAGTAGGGTTTATGTATATTTTCTTTGATTTCACTAAATAAAAAGTAT TTTATCAGGACCACCAAATTCTTCCCTTAACTCTGCCCATGTTTTAATAG CTATGCAAAATGACACTGGGGGTATCAATTCCTGATTTTCGTAAAAATCA GCTCTTTGGTAACAAATATATATATTCCTATTTTGACTTGTTTAATTTCA AAGTTATATGGCAACTCGAGAGACGATTGGCTCTTCAGTCCGCATGCAGC TTATCCAATTACCTACTAAAGATGGTCAGCCAAAAAAGGGTAACGATTCT TGTTTAGCCATTCATCTCTTTTTACGATTTTTTCATGGAAGTTAACATTT AACGTTTTTGAGAATTTCGAGAAATCCTTTTGTTTATTCTTTTTTGTCAG CAAGAGGTGCGCCTCTACATCATAAAAACAATCAAACTTGCTCTTTTATA CAAGTTATGTTGCTTGGTTTATATTATCCGGTGGTATACTTTACCAAATT ATTAAATTAATTGTTGTTCCTTTTTCAGGCGAAAAATCTGTGTCCGCAAG AAATGATTTACATTGGGAGGCAGATATGCAAATGACGTCACATTACATCG AAAGAAAGGTAATAGATGGATAAGGAGGGAATAAAAAGTAGATCAGAGAA GAATTATCAGGGGTGGAAAAAGGTGGATTTTTTTAATTCAAAGGAGCAAT AGCAATCTGTATGTAATCTTTTCATTGTCAAGGTGTATTTAACCCTTTAA CAGGCATTTAACTCTTACTCAGATTTACGTCATTTTCGGGGAAGATAAAA CCTAGAACAAGGTACTAATTCATGATATTCATGACGTAATGTTTTTTACG GAAATACCCCGGTTTTAACTTTAAACCAGACAAAAGTTGTATAAAATTTG CCACTACTGGCAAAAACTGAGGTCTTTCCGTATAAAATATTACGTCATGA ATATCATGAATAGCCATCCATTGACTACCTTAAGTGGATAAATTTTGGCG TGGATTTAATTTGGCGATAGATTAATTGCGTAAAATTTGGCGATGATTTA ATTTGGCGAATTTGAAATTTTGTCACACTGAAATGGGTGAAAATTGCTCA AAAATATAATAAAAAGTTGTGATTTTTCACATGATTCTCTTCTCTTTTTG TTAAATTTGGCGAATTTTGGCGAATTGCCGAATTTGGAAATTTTGGCGAG GATTTAATTTGGCGAATTTCAGCAAAATTCGTCAAATTTGCCAAATTTAA TCCCCGCCGAAATTTATCCACTTAAGGTACGTCGACATATTTTTATAGAT TTTATTTGGTTGCAGGAGAAGCTCATTAACGACCATAAAACCTACGTCCG CCATAAACCCGAACTACGAGCTTTGCTAGAAGACTTCTGTCAATTCGTGT TATTGAGAAAGCCAGACGACGTCTGTTCATTCGCGTCCGATTATTTCGCT TCCTTCTCAACCAAAATAAAACCGCCAACACTACCTTCGAATGCCGAGGA AAAACAACGATTGAGTCCTTGAATGTATATTTGTATCTTGTATCAAAAAG TTGGGACAGTTTTGCATACATCCATCGTGTTCCAGGATTGGTGTTCAATA ATTCTCTGGGTGCACTACACGTCATGGTTTTAAAAGATTTTTCTGATGTT AAGAAAAATTAAGAGGCTAACTAGTATTTTTGGTACATGTTTTTGTAAGA ACTTTCAAACGCGAGGCTCAATTTCGTTCAAATTCTTGAGAAAATTGAAA GCAAACTAAAGCTCAGAACACAGATCTATTCTCTTCAATAAATCATGCAA GCATACTTTGATAACTGTTTTTAAATACATTTTAACCTGTAAATGCCAAG AAAGAAATTAAGAAAAATTGGAAAGTCTCGGATAAACTTTGCTAGTTCTC ATGCAGAAAAGGTGTGTAGTATTGTCAGATGTCTATGGGACTCTAAATAC AGCATTAGTTTAATCTCCCCATAACATTATTTTTAAAATTTGCATATATT AGACAGTCAAAACATTTTTTATATATTAAACCGCACCATTTTCAGTTATT GACAGTGGGAATTAATTGGGAAAAACTTGACTACCTAATAACATGTTCCT GAAAAGCACACACGAGGATAAGGTTTAATATTCAGCATAATATTTTTTTC GGAAATCAACAGTTAGTTATACTTTGAAAAAATTAAAAAAAGTTCCTATG TTTTTTATGCTCAATCTTCATGGAGTTTACAACATATTGGACAAACGAAT TTTGAAAAACTGAAAATAGTTATGTTTTTGCTAAAATTACTCTTTCCATT TTTCTGAAAACTTGAAATGCTGGTATCCTTTTCTTTTTATATGACCAAAA TGCCTTTCCACCAGTCAACTTTTCGATATCATAAGAGAAATATAATAACT TAAATAGCTTTAATAATGATGTAATGAACATTGTAATTTTAATGTTGCTA GTGTATATATTTTATTTTTGTTTATGACAAAAAATTATCATTTGTTCATA TATATTATTGAAAAAAAAGTTTGAAAGACACTACGCTAATTTGATTAAAA T
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00061676TCONS_00061676Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00061675TCONS_00061675Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00061676-proteinTCONS_00061676-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_36supercontigscaffold_36:989117..998667 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
CATIPPREDICTED: ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
18.97 17.43 9.25 6.73 67.86 51.95 36.81 39.92 31.79 52.99 32.2 34.19 31.46 37.89 20.79 21.85 32.33 49.33 34.85 38.27 49.65 46.77 31.49 25.09 104.54 74.14 42.38 32.21 44.09 41.61