XLOC_040688 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_040688
Unique NameXLOC_040688
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_425:173796..195415-

Legend: gene
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>XLOC_040688 ID=XLOC_040688|Name=XLOC_040688|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=21620bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_425:173796..195415- (Clytia hemisphaerica)
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CTTTTCTGTACTCGAGAATATCGACAAACCAATTCCATCAACAACCCCAC GTATTGAACTTGATAAAGATTTGAGAGAACTGAAAAACATGAGCTTTGTT GACGATACTCAAATAAAAGACATTAATGATGAAGTCGTTCATCCAAAACT TGAGAAACCATCTTCAAAAGACATTGTATCAAACACAGAACTCGACTCTG TTAAGGACGAGCTGATAATCGAACCATTGCCCACCCAAGTGATTAACTTC GATTCGAGAATTGAAAAAGACAATGAATTAGATTCACATTCTGAATCAAC GAAATCGTATTCAAAGAACATTGTTGTTGATGAAAATGACATTGAAATTG AATCGAAAGATGATCCTATTCTAGAGATCGATCTTGAGGATCGTCTACAG AGAGATGAACTTCAGAATCTAATTGAAATTGACATTGACAACAAAACAAA CACTTTCGAACTTGATATTTCAGACGAGGAAATCTTAGACCCTTCCACAA GAGAGCAGAAAGAACTTTCCGAAAACGATTCTTCTCTAGAAGATGTTTCC TTCATAACTGAACATTTAACACCTCAAGTCATTTCAATTGCTACCGAGAA TGAGGAAACATCAACGCGTGTAGAACATCACCCAAAGTCAATCTCCATCG ACAGACAACCGATTCTTGAGGACGATAATGAAGTTCAAGTTGATTCAGAC GAGACAAAAGATATTATTGACTTTGACGAGTTTACCAAACAACAGGAAAT CGAGGAAGGAGAAAACGCGTTGAAAGACTTTGTAAGCGCTCACGATAACC AGCGGGGAGTCGGAGATGTTGGTATCCTTGATAAAGAAGAAATCTTAGAC CCTTATTCCAGAGACAGAAAAGAATTTCCACCAAAAGACTCTTTTGATTC CGATACTGGTTCCGAATTAGTCCATTGTTTAGCTCCCGAAGCCATCTCCA TTACTCAACCAGAAGACACCGACAGAAGTGTTGATAACGACAGACTTCTG AAGAAGCCGTCCGTTAACCGAGAGCGAATCCAAGAGGATGATATTAATGA ACGCTTCGACGAGACCAAAACAAGCATTATCGACCTCGAGGAGCTTGTAA AACAGCGAGAGATCGAAGAAGGTGAAAATGAACTCAAAGACTTTGTAAAT GTTAACAACGGACAAAATGAATATAAAAATTCAAATATTGACGAAGAGAA TGTTTTAGATGTGACCACTAGAGATAAAAGTAATATCAAAATTTCCAAAC GACATGTTGAAAAAGTTGACACGCATGCGCATCAAAACATTCGCAACGTG TCAGTGAACATCATGCATGAAGAACACAATACCGTCATCACACGACCAAT CCCGACACGTCGTCCACGCAAATCGTCTTCACAGTTAAAACAATTAATCA CAGAAGATGAAAATATTGAGATCAAGCAAGACTCGACACCTTCGAATATT GATCTTGATCTTTTACTGGACGAACAGCCACCCGTACGTAAATCGTCCAC GCAAACTGAATTCCGTATTATGTACAAATACAAAGAGACTGATGACCAAC AGGAGCCAGAGTCACCAACACAAATCGATCCTTCATCCACCTCCTCCAGT GATTCTCCATCATTCACCAAAGTCACTGTCAGATCGCAGCAAAAACCAAG AAGCAAATCTTCATCGTCCTCCGTCACCTTCAAAGTCAACTCCAAAAACG ATAAACGTGATTATGATATTGACGATAATGATTGGCAGGAAGCTTTTGAC AACGACCAATCAGAACCCATCGACGATTCAACCAGCCAATCAAGTTCTCC AACCACCAAAATCTCCACAACTAGTCTCCGAGTATCGTCAGGAAGACCGA AAACTGACTTCTTACCCACCACCACTGAGCATGATCAACAAACATCACTA CAAACAACACCAGGCACAATCTCTTTTTCTGTCAAAGATCAAACACCAAA AAGACATTCGGATTCTTATATCGATTTGGACGGTGACGAAAATGGCTCAA TCGAATCCGATCCGAAACTCGAGAAGAAGAAATCGATCAAATCGAAAGCC AAGAAATTCGTTCTCCAGAAGCTTCACAAACAGCCTGATGCTGAAGCCAC TGATGTTGAGACTACCAAGAAAAATCGCAAATCGAGTTTCAAACGATTCG GCTCATCGATCAAAGCTAAGATCAGTAAGAGACATTCGATCGATAAAACA GATTCGATCGAACAACGCGATTCATCGACACCAACAAAGAAAGGGTTGAT CGGGATTCAACGATTGAAATACGATGATGAAGAGGACAATCGAGTTTCAG TCTCTGAAAGAGCTCAAATGTATCGTCGATTTGAATCGATTGACGAGACC GATGTTGCGAAACCAAGGATGGTACGATCTAGAAGTTTCGATTCTATTCT TGATACCCGAAGTGTATCTGAACTAGAAAAAGTACGCAATGAACAAGAAA GACGTCGCCATTTAGCCGGATACAGCTTCGTCAACCGTGACGGGATTNAT GAACAAGAAAGACGTCGCCATTTAGCCGGATACAGCTTCGTTAACCGTGA CGGGATTCCGAAATCTACGGCTATAGTTAAAGGCCGTGATTACAGTACAA TAGACGCTATTTACCGTGAAACGGAGCACGAACTTACGTTGATACGTCAA CAGCGTCGACGTAAGATAAACCCCGACTACTCACGTAGTATTGAACTGCT AGACGATATCGAGGAAGATAAGAAACGAGAACGTGAGCAAAACACGGAAC GTGAGCTACAAAAAGTACGTAGCGTACGACGTAAGAGACCGACGTCGACG AACAAACGCCAACAAAGTATGGACGTTCCTTTATCTGCCTTACAACAAAT GAGACTTGTTGGGCGTGTTGACATTCCGGGCGTTTTTAAAGGATCACCGC CCGTTGAGAGACACCCTCATGAAGAGGGTGGTAAAAAACTTGATGGTGGA AGTGTCGGGAGATTGAAAATTCCGAGAGCTTTCTCTGTTGAGAATCTACT TGATGATTAATCATATTTCTTTGAGTTCGTATTTTAAATTTATTTGATTT ACTTGGGCGGTATATTTGTTCAAATTCCAATTTGTTCCAAATGTGTATGG GTAATCTTTTAAAGGAGTATTTTTTCGATTTTTCATTCCTTTGTGATTTT TGCGCACTTGAAATTTGAACCATATTTTATAACTGTATATCCCTGAAAGT CGCAGAAACTTATGAATAATCAAAGCACTCTGTCGTACTTTAATAAAGTA GATTGTCTTACTTTTAGTAATTTTAGGTTCGTATTTAACTTTTTCAAACT TGTAAATATTTTGCTTAAAATAGTATTTGATATTTTTGCTTAGAATTGTT AGAATTTCGGTCTGATATTAAAAATCGTTATACATATCAGTGAGACCCAT ACCAACATCAAGAAATTCGTGCCGGTACTACATACTTATACTAGAAAATG GCTCCAAGTTTTTCAATTTGAAAAAGCTAACGTGTTTGGAAAAGAATTTC AAAATATTGAAAAAGTCTTCTTGCAATATGTACAAACAGTCCAGACAGCG TGTTTTTCGAAAAATCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00064872TCONS_00064872Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00064872-proteinTCONS_00064872-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_425supercontigscaffold_425:173796..195415 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.29 0.3 0.23 0.17 3.49 3.65 15.29 15.1 4.46 7.03 3.38 3.63 13.06 8.55 15.26 11.13 5.25 10.53 16.68 33.31 1.76 1.75 2.06 1.98 3.5 2.86 4.9 2.02 3.66 3.29