XLOC_042921 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_042921
Unique NameXLOC_042921
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_49:475468..487511-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_042921 ID=XLOC_042921|Name=XLOC_042921|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12044bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_49:475468..487511- (Clytia hemisphaerica)
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TTAAAGATGGCGCATTATTTAGCTCCAGTCAGGAACGAAGTGGCTCATTT AGTGTTTTATTTAAGGTTTCTGTTGACCCTCTGCAATACATCTAGAATTA ATTGACAATACTATTGACATATTATTGGGCAGTATTTGCGAAAAATGTTC ACGTTCGATACAAGACAAGGGGAAAACAGCGGGAATATTTTTGCCTTGCT TCTAAGCGAGGGTCTAATTAAATTAGATTTATCAAAATTTCATACCATGA CCATTCTACCTTTTGTTTCTTAGTTGGACGATCTTGTAATGCCAGACTTT CTTGGCAAAACTATCGAAGAAATTGGTATAGGAACCTATGGAGACATTGC AACGGTACCCTTTGTTTTAATTTGTTTTGTATCCAGCAAATCATTGTGTT TTATTTCTTACCAAGAGTATTCAGACACAAAACGGTTCAATTTTCAAGGT TTTGTTGATTATTAGTAAAACATTTAAAAAAAATCATATTTAATTACAAA AACTTTTTTCCCAGCATAAGGTATTGAGGTACTGAAAGCGACTGAGTTGT CGCCGAATATTATGGTAATTTTGATTTACATTTTAACTGTGATTTTAACA TGCTTTGTTTCTTACTATTAGATAAGTCCAACAGCAAAACTGATCGAAGC ATTGAACATGTTTCACGAAAGGAAAGTGTCAGCACTGCCAGTTGTCGGAG AAGATCGAAAATGTGTTGATATCTATTCAAGGTTTGATGTCATGGTATGT CTCTCTCCAAAGATTTCTCCAAATTGTTCTTCAGATAGTTTATTGTAGTA CGTAGGTGTTACATCAGGTTCCACTCCGCTCAGAATTACACCTACCTCTA ACTTTAGCTGCTGTATTTCTCTAAATGTTCTTCTATCTGCTCAATAGTAT GTATATTTTCGCTTTGATATAATATTTCATAATATTTCAATAAATGACTA CATCTTACTATACTAAATGAGTTTATGAAAAATGTGTGTAACGCAAGATG GTAGCTGTTTCGACGACGGGAACCGTCTAGTGACCACTAAAAAGTTTTTG TTTATTGAATATATTTTTAGTCACGTCTCTAGGTTCTAATATCTTGATAT TTCTTACCTTTAGAACTTGGCAGCCGAAAGGACGTACAATAATTTGGNTC TTGATATTCTTACCTTTAGAACTTGGCAGCCGAAAGGACATACAATAATT TGGACATAACCGTATCAGAAGCACTGTCTTACCGTCAAGTCAGGGTGGAA GGTATTCACAAATGTTATCCACATGAAACGTTCTACGCAATCATTGATCG CATCGCAAATGCTAAGGTATATTGTAATATCTCTCCCTACATATTTAATT GACCAATACAGCTATCAACCACTGACCTTTAATACCATGGACCAAGTTTC TCAAACTCGGCCAAGCCAAATTTTGGATTGGAGTTTTCTTTTGAAAAGTG GTACCATAGTGGTAGCACTTCTCCTCAATAGCGGTGTAAATGCATCGAGA GCGTTAAAACTACTTTTCCTCTGATACTTTAATGATATAGCTCCTTTACA CTTTGTGTGGTTTGTATAAAAGTCATTTTACGGTTGAAATCAATCATGTG TAGAATCATGACTGTCTGTATCCAATAACGACTACTTCGCATCGGTTGGG AAAAAGTTTTGGAGCAATAGGAAGAGGTTTATTGATTCTGATAAACCATG AAGTTACAGCCTCTATAGTATTCCAATCCTCCTTCAAATATTATTCAATA GGAGGATTCAAAGAATTCTGTATCAAAAATGAATTTTCTAGCACTAAAGA ATACACCGTTTAGGAGTCTCGCTATCTTCACGGTACTCCATTGCAGAGAC CGGTAAAAATGGTAGGTAAAAATGCACACTTTAGTACTGTGAAAGGTTAG AGGAATGTAAACATTGTGAATTTTTTTCTCTCCTTTAAAGAGAATGATTT AGATATTTGAACATGATATCAATGATAATTTTATAAGTCTCTCCTGAAAA TTTCACAAAAATTCATCAAGATGAAAGAAAGTTATGATTAAAAGGAGTTC TTTACATACCGTTTTTCTGCTATGTTTCCTTATGAGAACCAGATGTTTAC CTACCGTTTTTTTACGGAGGAGAGTGAATTTTCCGTGGTCGCTAAAATCA AAACAATAGAAAATTGGATTGACGCGTGCGCAGTCGACACTCCTAAACGG TGTATTAAAAGTTTTTTTCTTCTTCTTCATTTTTCATCTTCAAAACTTTA TGACTTATTATTCTATTATGCTCTTTATAATCATTTTATCTGTATATGAT TTGTTACATTTGAAGCAATAGGAATAAAAATAAAAATTAGTGCACACTGA AAGCGGATGGACTTTAATCTTCTACATAAAACTTTAATTTGATTCACTGT CGTATTGATTTTTTAGGTACATCGTTTAATTGTGGAAGACAGTGATCATT GCATCAAGGGTATTGTATCATTATCAGACATTCTCAGGTTCTTGGTGGAC CCTCCTAAAATGGCAGAAAGTTCTGTTTCTTGATGTCTACTCTAAGATTC TGTGTTGTTGCTGCTACATGAGATTGGTTTTGATTAATTTGACGTCCTCT CAATTTGATTGGATGGTGGATTTGCTGGTGGATTGGCTTTATCGAGGATT AATTGAGAATATGACCCGAATCGAATCATCAGACTTGAATGGGATCATCA TCCGACACGAAACGATATCCAATTATTTGATTGTCTTCAATACATGAGGC AACCGGCAATTGGAGGAGAAAATACGCATCATTACGGCTCACTCCACAAC CTGCACCTTGTTTTTATACCATTCGTTAACCCACACTACGTCTACGCCGT TTAGATTGTAGAGATTGATTTAGAGATTTAGAATAATTAGAAAAAACATT ATATAAACAGTATCCATGTTAAGAAATCAGCAATTTTTACAAGTTTTATT CAGTTCGATTTTAATAATCTAATTTATTGCTCTTTGCTCAAATGATTATA AGGAATTACAATACCTACACACGTACTGCTGGCTACGATTGACCATTTTA TGCTTTTTAGAAAACGTTCGAATGATTTTTTTTTTGAAATTTTTTGAATA TATTTCAATATTCTTTAAGTGGATAAGAAGAAGGAACTTTTAGAAAGTTG CCAATCCATTTTCTAGATATATAATAACATATTAATAGTCATTGCTATTT ATTTTTATACCGGGTGTGCCACAAATAAGTTACCCTCTTTGATTTGATAT TGTAGGCATTTGACTTGATATTTTTCAAAGATTATTTCGGAATCATTCAG AAGAAAGCCTAACTTAAAATTTGGTGTATTACTTCTAATTTTAATTCATT AGTTCAAAAGTTATGTTCAAAAACCTAAAATATCAATTAAAAAAATGACA GAAAAAGGCGAAAAACGAGAGTATTTTAAATTGGTTGTAATAAAAAGAGG CACAAAACGATTTTATGCATCAGAAAATGTATTTCCATTATGTAAAAAGC ACTTATTTACAAGATTATGCATCTCTGTAAATACATTCCATCATCTGTGA ATCGAGATGAGCTGCAACAGTTCAAACGAAGCATTTTTCTCAAAACTTTC ACCTTCTCCACCTTTCTCAACGATGTCACACAGCAGAAAAACTTCTGGAA ACTCATAGGAAGATGTTGAAAATTTTGTGGGGCTTGAAGCATTCGGCATC TTGTTTATGCCCAAGGGAAAACAGAAGTAAAAAAAGACAATAGAGATAAA GAAAACATAAAGAGTGTTACAAGGCAAGACATTGTACTTTAATGTTTTGG 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00068873TCONS_00068873Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00068872TCONS_00068872Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00068872-proteinTCONS_00068872-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_49supercontigscaffold_49:475468..487511 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
PRKAG15'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1 isoform 3 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
15.34 13.98 7.74 7.77 10.43 7.75 10.11 10.67 6.92 6.71 6.47 6.13 6.17 5.83 4.9 5.05 7.56 6.99 3.91 4.75 7.06 7.51 15.81 15.55 6.89 7.64 2.88 2.96 9.23 10.18