XLOC_042993 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_042993
Unique NameXLOC_042993
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_491:343950..387545-

Legend: gene
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>XLOC_042993 ID=XLOC_042993|Name=XLOC_042993|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=43596bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_491:343950..387545- (Clytia hemisphaerica)
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ATTTTTCTTTTTAATAATATTTCACTCCTGTTTGTCTTTTCAACAAGCAC AAAACCGCTATTAAATTCGAACTTTATCAAAAGTTATAGCCTTTTTTGTC TCCACTGCAAATTATTTTGAGACTTTAGTTCTGTATAATGGAGTACTTGC ACACAAACATTCCTACTCAATGACAAACTATGGATACTTTTTTTCCGGAC ACCCTGTATAATTAAACACGCGTGTTGCTGATATACTTTTCCTTAGGGAA TACAGAGAGATCAGAGACTATGAAGACTTGAAGTCTTTACATGCTCCTTT GCAAATACGAAGATAAGATGGACAAATTTTTTGAAATGTTCAATATAAAG GCAGGGCAGCTTGGTAAAAAGTAACGTAACGTTGACGACTTGACGTATAT TGAGAATATGCTGGTATAATTTTCCTTTGAAAATACAAGAATAAGATTTA TGATTTGAAGTATGTAAAGTTTTACCTGGTGAAAAAAAATAAAAGGAATT TGTTCATTCATATGAATCCTGTGACTTTCCTTGCAAAATCCAGGGTTAGA TTTTTTTTTATAGATTTTCCTTTAAAAATACACTTCTTTTCTTCGAACAA TTTGTAAACAAAATAAGCATGAGTTAGTGTTATCATAATAACTTAGCAAA ACCATAACAGTAGACTAGTAAACTAGTCGGTTATTACTTATAACCTTATA ATAAAACTGTCAATCAAATAATGTAAACACTAATTAAATATTCAGCGTGC GTGAGAGAAAAGGAAAATAGAGACGTAACTTCACCCCTTCGATTCTTTTT ATTTGGATTTGTATATCGGTCTGTTTTCAACGACTAGTTAACTAGTCTAC CATAACAGAGAAAAGAGAATTGCGCGATTATGATAGCTTAAGTCAAAAGG GAATTTCCCTTTTAACATATTTTACAAACCACAAGTAGTTATTTAGCGTA AATGATATGTGTCAAAATTGAATGTTTACAGGTTAATACTTACTTACTTA CTTGTGTTACTTTAAGTAACCCCCAATGCCCACAATGCATTGGAATTTTT GTTGCGCGGCCTTATGGCGCATTTAAATTTAAATATAAATACAGTGGAGT CTCTGTAACTCGAATCTGTACATAGAGAACACAAAATTGTTTGAGATTAT GAAATTCGTTATCTGATCTTTGATGATCTAATCTGAAGTTTAGCCCTCCA TATTTTGTACTTTTTTTTGAGGATATTTCGAAACCACTTTTTTGCAACGT CAGCCCAAATTTTTTTTCTATATAGATAATTTACCATATATTCTTTATGA TAAAAAATCCACCATAGCATTTTTTCCCATGTGCAAAAAAGGACCACACG ATTTCAAAAAAACTATGTTTGAAATTGAATCATTGCAACAGTACAGAAAA CTTGGTTTAAACATAGCGTAAAAGCATCTTGCTGGACTAAAAATTTTGTT CTGATGTCCATTTTTTCTTCGTTTTGATTCTTACAGTGACTGAGTGCATT CATTTAAAAACTCCCATTCCAACTTTTTAATTTTAGGAAATAGATACATC AGAGTGAATTTCGACAAAGTGGAAGAAGGTTTGTACGATAATAGTTTCCC TTAAATTGTCTCATACTTTTTTTAAACATTAGGGATTGTAACATTGTAAA TTATTCTGTTCAAGAAAGTACCAATGTTTTTCATAAGATTCCACTCCCCG CGCTTTTAGTTGTCTGAAGATTGTCACAAAAGTGGCATGAAACTGCCAGT AGCAGAATAAAAAAGTGTCTTTTCTTCCTGACTCTACTTATGTATCGAGC ACTGTAAAAGACTGAAGAATTACTTACACTCCCCGCACTATAATTCCACT GTCACTTTTCTAGTGAAAAAAGACAAGACTTAGGGTAGTTGAAAAATAAG 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GGAGTATTAGATTTTCGACATTTTAATGCGTACGTACTGTGGACGGCCCC GTATTACAATATACTGTTTTGTACGAATATTAAACGATTCCAGTCTGTCG TGCTATAGTCTACAAACATCTCTTACTTACTATTTTCTTCAGGTACGATC CATTCTCCATAATGCATTGCAACCATCATGCATTTAACGAAGATCGAGAA GACGAAACCATAGAATCACTTCTACCAAATATTCCCAACAAAATATTAGG ACAACGCTTAGGCTTGACGGCTTTGGATGTTATGAAGATCAATCAAGCNT CCCAACAAAATATTAGGACAGCGCTTAGGCTTGACGGCTTTGGATGTTAT GAAGATCAATCAAGCATACGTAAGTTTGATCTTTTATCTTTTTCCTTGAG AAAATTCTCGAGAAAGTTGATTGAGATGGTTTACTGAAAGACAATTTTCT CTCACTAAATCGAACTCGAAATGGAATCTAATTTGTTCGAATTACAGAGG GATTCGAATTAAAGAAAGTATTTTAGGAGTGTTTTTTTTTTTTGACAGGA ATTGAAAATTAACTTGAATAATATAAGTTCGAATTTGCGAGAGTTTACTG TAGGAATCTAAATCAACGATATATGTTCAAATAGTTAAATAATAGTGAGG TTTACTATCGATAGATAAATCACGACGACCAATGAAATTCTAGCCTAGGT TCGTGCAACGATGGGAAGTAAGGGAGATTTACTGGCTTTGCTATAAGAAC GAAATATCAAGCGAGACTCAGTTCTAGAAGCAAGTTAATTACTTTGCGGG GTAAGGCTGTCTTGCTTTCGGGTTATCATGTAGAAAAGTGCCGTAGGGTG AACGAAGGGTAGAGGAAACACTAATCTTAAAGGAAAATTTCCGGTTAATC TTTTTGCGAAATATGATTTGTATGTCATATCCTATGATGGGAAATAGTAT GACATTTCAACGAGAGATTTAACTAGAATTTGAATGAACCGGCATATTCT AACACCAATAATTTTACAGTGTAGAACAACACCTGAAGTGATCGTGCAAC CATCCTTACAACTCCAACAACCGCCATCGATCGTCCTTGACATCCCACAA CGTGATGAAATGGCTTCAACAACCACGACGACAACCACCACACCACCGAC TACAACATCAACCTCGACAACAACAACCACACTGACCACGACCACCCCGA CAACGACTACTTCAACGTCAACGTCTACAACACCAACAACAACGACAACA ACAACAACACCATTTTTCATTCCACCCATACTCCTACCTTTACTCTTTCC AACGACAACCACGACAACTTCCACAACAACAACATTAGTCCCAGGACAAG AAATCGAAGACGATCCGATAGACCCCAACAGCGACGACCCAGTAACCACA ACGACAACTGCAGAACCGCTATCAGAATTAGACCAAGCTACCACTACTAC AACAGAGACCCCACGAATCGTTATACAATTTCCTCTTTTAACATCTTGCA TTCCAAATCCACTTTGCGTGACTCCACCTTGCAACGCACAGCCATGTCTT CAACAACCCTCGCCACCACAACCTCAAGTTGTACAACCTTCACAACCGTC TGACGAGAGCTGTGATAAACCACCTTGCGAAACCAAAGACAGTGAATGCA ATTCTCCTTGTAAGTAGACAACTTTCTAAAAATTCTCAAAGTTTTTTTTA ATTATAAACTAAAACAAGGCTATTTTGAGCAATTCAGTTTGTGATAGCTG AAAATATTTTCAAAAGTAAATAAACGGGGGAGGGGTCCAAAAGTGGGGGA CGTTTATTTGAGACCTTAGAGTAGGATATAGCAATTTGACCTCCTTTTTA GTATAGTCACTGCATAGAAAATCAATGCTATGAATTTGGGCTAAAAGCTT TTAAATGTTACTCCAGCTAATTGAGTGCTTTTTTTAATCTTCTGTGAAAG ATTCTGTGCAGCTTTAGAAAATGTTCTTTCCACTTTCCAGATCCATGTTG GCCGCAAAATTTTGAATGGTCGAATGTTGGTTTTCCGCAATCATGTGATT GTCACAATGACAATCTCTCTTCATCCGCACCTCCACCTGGGCCACCAATA TCTATTATTCCAGACAACGCACCTGAAAATGACAAAAAGTGTCAATTGTG CAGATGTACACCAATGAAGTCAACCCAAACACCAAGGGTTTGGTCAAATA ATCATTTTTGTCACCCTTCAAAAAAGAAAGATCCCAAGTTTCAACTTCTA AGAAGTGGTATGTTTTGTTGAATTTTGTCAAATTCGTATCCAGTCCTTAA GCTCGCTTTTTGATGATTCTGAAAGCGCTCAACGAAAGAGACTGAAAAAG TGGCCCTGGCTTCGAGATTGGAATTTTGCGGTCGCTTGTTTTATTCTATG AATGAGACATCATTGCATCTTTTAGAAAACATCCCTGTCTCAATGATCAA CTAAGAATTAAGGAGCTAGATGCCGATGGAAATGAAAAAATTTGACATAT TGGCGGGTTTCGAATTGCATTAGAGTCAACCTCTATTATTTGAATCTTAC TAAAATATTGGTCCCTTAACTAAGACTGGAATGTGGTTTAAATTAGCTCT TTGTAATTCGAATCTTTCTCTTATTCGAATAAGTTTTTTGGTCCTTTAAA GTATACTATAGGCTGCGCGCATCCCCAGAATTTATTTTGTTAAATCAAAT CATATCAGAGGGGATGCGTGCAGCTTAAGTATACTATAGAGAGTCAGTTG TACCATTTACTGCTCAAAGATCAAGCGAGATCCAGAAACTTTATTGTTAG AATTATGTGAAAGTTCAGCATATTTTTACCACGGGGACAAAATTCCAGGG TGTTTCTCCAACGACGATGTTTTTTCAGCCAATCTTCAGATACAGGGGTG TTAGAAAGCTACGAATCAACTAGACCCTTCGGTTTACATGATGATGATGA CATAACTTAGATTTTGGGTGCAATCTCAACAACAATCAAGGCAAGGAATA GAAACTAAAGTTTACTAAACAATAAAGCTCCTGGATTGTTTCGCACCCTC CTCCTTTTGTAATGATGTTCGAGGAGGGGGGAATTATAAAGAGGATTAAA GGTTATGTTTTTGAATAAGAGTGATATCGTTTGCTTACTCATCAATTTTA ATTTACAAGCTTTTTCACATTGGATTGACACAGATGTGAAGCAAGATTGG TCAGAAAAAGGGGTTAAATAATTTTTTGTTTATCTACCAAGAAATCGAAC ACAATGTAACAATAGAAGACACCGGCCTGATATAAGACATGTACCTGATA TGAAACGGGAACACTTACAGTATGTAAAACTAAAACCTTTAACAAATCTT TTTATTCAATTTTCTATCTTCTTTTCAGGATTTGTGCCAGGAAAACGTTG TTTACTAATCGACGAGTCCAAAGAGTGGGATAACTTACACCTTTGTTTTG ATAAAGCAGCTCCTTACGATTTGATGTGGTCAACTGTTGACCAATTAAAA GAAAATGGAAAATCAAGATGTTTGAAGATGGAGGAACCACAGGATTGGGT CTGGAATAAAAAATATCTTTGTGATAAGAATAGTATATAAAATTTTAAAT TTAAACCGTTTTAGTTTAGTAAAAAAAGAAGAAAAATCACTCATCTAATT TTCGGTTGACACTACTTACTGTATTATTCTATTATAGAGAAGATCA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00069002TCONS_00069002Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00069001TCONS_00069001Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00069000TCONS_00069000Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00068999TCONS_00068999Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00069001-proteinTCONS_00069001-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_491supercontigscaffold_491:343950..387545 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
MYO3APREDICTED: myosin-IIIa isoform X1 Homo Sapiens
MYO3BPREDICTED: myosin-IIIb isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.83 1.24 1.84 0.8 2.2 1.35 1.4 3.27 2.76 1.7 4.36 5.95 10.22 7.47 9.82 14.19 6.74 8.53 7.46 6.63 4.21 5.78 1.78 3.57 4.47 5.38 2.53 0.79 5.02 4.3