XLOC_043439 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_043439
Unique NameXLOC_043439
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_507:238749..243856+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_043439 ID=XLOC_043439|Name=XLOC_043439|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=5108bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_507:238749..243856+ (Clytia hemisphaerica)
GCTGAATTGAccaaaaaaagtccaaaaatatgCTTTAAAATAACAAGTCT
TTAATAGTAACAAAAAAAGACCATAAATATGGTTTAAAATAACAAGTCTT
TAATAGTAACAAACTTTCCCTCTCTAAAAGacaataaaacaatgcaatat
GCCATTATCCAAAACAAAGTAATGACATGATTTCATGAGTGAACCTTTAG
ATGTCCTTGGAGTCATCATGATTTTGTAACTTTTGTATAACTCTCCTTTT
GTCGTAGAAAATGTCAACTTGGTCCATCTCTAATATACAATCCTCTAACT
GATCAACATTTAGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNCATTTTATTTGTGAGAGCATCTGAATTgcattttattttagtga
atccgtggttcacattaaaaatataattttactacgtttaaaaaagttaa
tggaaatgaatttaattgaaacaacatttgaattgtattttctttgCTCA
AGTTCAACGCAATCTTTTATTATACATTTATATGTAATTTAAAGTCTAGA
ATTTAAATACATTTTGATACCCAATGAattagaaattcatcaaagttttg
aacctagaattttattctattttaatgCATTCTATattcgttttcaatgg
aatacgAGCATTTAGTTTCCGTAAGGGTTGGTCCATCTGTAATATACAAT
CCTCTAACTGATCAACATTTAGATTCTCACCAAAAAAGTTGACAACCACA
TCATTAAAGGCTGTTAAGGTAGTTTGGTTGTGTGCATAATCAAAGGTTAT
TTCGCAGATGGTGGCAAGTTTGCACCTTTTTAAGGGCATAGAACGTTCGC
ACGGCCCACATGAAACTTTAGAAATCTTGCTATTGGAAGGTCTTTCTAGT
TTCTTCTTGCAGAATATACAGATGAAATACTGCTCAACTTTGGCAGCTAA
TACAGTTGGGCAGCACATAGATTTGTTTTCATTAATAGGAATGTTGTCCC
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNgggactcgaaatttgcgaaa
aaagagaccctgaatgggactgaaattccaaaattttctcaaattttcta
ctttttccccaaattttccaaaaataggcacccgacgagggactgatttt
tctattttcgtgtttttgcgaccctaccagggactcgtggaggttaaaaa
aggtaccctgaccagcggatcatccccgtaacccattttgccttagtacc
cccccgggcacATAGATTTGTTTTCATTAATAGGAATGTTCTCCCATGCA
TAGCTTACACCATCCTCATCACTGTCTTCAGTTATATCTGAATCCCATGT
GGTCGTCAAATTAACTCCTCTAAAGTGCGAGACAGCTACTTTTGTGAACT
TGAAAGTTTTCATGGTGACAGCTTTCTCGATAAGTCCACCCCAAATAGAT
ATGTTGATTGCATCTCCAGCTTGATCCACCAATTTCGCATGACGCACAGA
TTTGTTGTAACCATTTCTCATTATAGAACGTGCTTCACCAATCCACTTGA
TTTGACCTTTCACGGTAAATGTTCCATCTGGCTCTTCGTTTAATATGTCG
CTTACAGAAATAGAAGTGAATACGGAATGGTCAAATGGCAAATTTTCATG
AAGCAGAGTAGCACTACTGCCCAGAAGCTCATTAAAAAAGATTTTTCCAT
TCTTTGTTGGTGAAAGTGCCTGGAGGTAAACGGGTAGCTTTTTCGTCACA
AGGTTTTTAAAATATCCAAGATCATACTTTTTGGACTTCATGATCCTGAT
TTTTGAGGTGACAGTTGAGGATCTTTGGAAATCAATGTCGAAATAAATAT
TCTTCTTATCACTTTTGCTTGTGCATTCATCACCGATCTCCACCGCGTAT
CCAAGAAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00069762TCONS_00069762Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00069763TCONS_00069763Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_507supercontigscaffold_507:238749..243856 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.91	3.12	1.19	1.47	25.23	22.95	16.14	16.45	9.08	9.81	4.97	5.92	2.92	3.1	2.07	3.54	5.18	2.69	2.77	3.36	14.39	12.8	6.17	6.34	2.56	6.5	5.76	4.37	3.37	3.04