XLOC_043598 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_043598
Unique NameXLOC_043598
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_512:314717..319124+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_043598 ID=XLOC_043598|Name=XLOC_043598|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=4408bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_512:314717..319124+ (Clytia hemisphaerica)
GGGTGGAAATGTTTGgaaagaagacaaaaatatttcaaaagcaaaatttc
tttaaaaacatttttaaaacttaCTGAATATCTTAATCAACAATACTTTG
AATCTAGGAAGTAAGTTGCAAGCATNcaaaaagatttcaaaagcaaaatt
tctttaaaaacatttttaaaacttaCTGAATATCTTAATCAACAATACTT
TGAATCTAGGAAGTAAGTTGCAAgcttttttgaccaaaattttcaaacaa
taaaTGTAAAAATTCCCGCCCATTATCCGCCACTTGCGAACATTGGAAAA
CCGAAGTCAAAAACACGAGGGGAAAGATTCAGTCGCCATCTTGGAAGGAA
GCCATGATAAAAAATCTTGACAAGCAACAACTTTAAAAGGCAAGTATaaa
tgtaatgttttttttttctgttgcttttattgttctaaggttTTTTGCTT
TGAGATGCTTTCAGTCATGAAGAGTTTTTCACAGATTtgtctgtttgttt
ttgttttaaaagctATGTCGAATGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAGAGGAAAG
TCAAATTaatttctatcattgttgatCTCTCATGCATATAATACTGACCG
TGTTTTATGGGAAGTACTTGCTTATCTCTGACCGTGGGTATGGTAAGAGA
TGAAAGGTTCAACATGATTCTCTTTTATCAgaagttaaagaaaaattatg
aacttttagtcaaaatattttaatatattaGTTAAGAGGAAAGTCAGATT
aatttctatcattgttgatCTCTCATGCATATGATACTGACCGTGTTTTA
TGGGAAGTACTTGCTTATCTCTGACCGTGGTTATGGTGAGAGATGAAAGG
TTCAACATAATTCTCTTTTATCAgaagttaaagaaaaattatgaactttt
agtcaaaatatttaaatatattaGTTAAGAGGAAAGTCAAATTGATTTCT
ATATCATTGTTGATCTCTCATGCATATAATACTGACTGTGTTTTATGGGA
AGTACTTGCTTATCTCTGACCGTGGTTATGGTAAGAGATGAAAGACTCAA
CATTGCCATTAAATTTAACAACTTCTTTAAATCTATTTATTATCTATTTC
TGGCTCATTTCTGTTTGTTTTAAAGTGTGTGCTAACCACTTGGGAAATTG
TTTCTTTgcattaaaaaaaaagcaaaaggaCAGTATAGATATAGATGTGa
atttttactcaaaatttcaaaaatctgaaaacaagtttttatttcatttc
ttcAGGTTGGGATGCTCAAGAGAAAACTTACTATAATGGATTCTACTTTC
AGGCAGAAAGAACTAATGGTAAGCAAAAGAAACTCTTTTCCTATTTTGTA
TCTTGGATCTGGGCTGTCAAATTTTATGTCCCATCTGTACAGTacactac
aatcatggacaaaaggttgtagacaaatgaaatttcagtgaaaaattatg
agaaatagagcaaaatgacacTTCGATGAGTCTGAAAGGggagggaagtt
aagaaaaatacttttgaagtcgttgcattacttttgaattgcttttgagg
gaaccacaagcaaaaaatcagcgttttgatactggtgtaagccagttaat
caagcccttgNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNcaagcaaaaaatcagcgttttgatactggtgtaagccagttaa
tcaagcccttgtggttagcccttgtggttagactgcagtgggtgactttg
aaagacttgaTAGGTtaggaaagcacccagaacctcttggaaacttgttt
ttgatcgatattgaagtattttgcaaatattgcagaagtctacaaacctt
ttttCCATGACTGTACAAGACATTTTAAACCTAACTTCGCCAATCATATA
AACTAGCCAATCATTAGGCTGTTAgtaaaatgtttcagttataggTAATA
AATGCTTtacttcaattttcaggaaaaacTATATGGTTGACCCTTTCCTC
AAGACACC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070029TCONS_00070029Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_512supercontigscaffold_512:314717..319124 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
4.69	4.91	1.56	3.36	17.39	9.7	15.95	16.3	10.82	9.79	7.96	9.14	4.91	5.11	4.34	4.58	5.27	4.37	0.74	1.86	3.63	2.97	7.81	7.27	12.98	13.37	1.96	2.24	1.08	3.55