XLOC_043906 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_043906
Unique NameXLOC_043906
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_56:652763..698628-

Legend: gene
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>XLOC_043906 ID=XLOC_043906|Name=XLOC_043906|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=45866bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_56:652763..698628- (Clytia hemisphaerica)
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AACAATAATCGTATTATCATATAACGCCTATACCACTCTATTACACGCAT TATAAACGTAATTGCTTTTACAAGATGGCGGACGGAGCTGTGTAGAAGCA AAACAACAACATTGATATACTTGAAGTTTTCGTTCAGACGTATGTACAAC TTCAGAGTTCTTCGTATTGTGTTATACTGTTATCTCCGACGGAACGACCA AACAATCAACCAAGGGCCAACCTTACAAACCACATCAATTCAAAACAAAC CTGAAAATACCGAACCTAGAAACCAAATTTGGGGACTTCATACAAAAGAC GATTTACTTCAAGTAATAAACTCTTGCTATGAGGAGATTGTTTTTTTTCG CAAGAATCTTTTTCTCCTCCCATCTGGCAGAACCGGTAAAGAGTACATAA ATGAAATGATAAAACTTATAACCTACTGGAACCAAAACTCAAAAGACTTA TCTAACATTTCGGCAAAGATGCTCATGTGTATGCCTGCTCTTCTGCTCCA GAAGCCACATCAACGCTCAAAAAGCAAAGAGCACACAACAGCTTTAGATA GAAGACTGACTGCATGGAAAGATGGTGACTTTGATAAATTAATGAGAGAA GCCAGAGAAATCCAATCACGTATGAAAAACTCCCAAAAGCAATCTGCCTT TTCAATCACAAAGGAATTCACAAAACACATGCTTCGAGGCAATATTCAAG CAGCACTTAGACTTTTAGAAAACTCGTCATCCAAAGGAATTCTTGACCTT GATACCAACACTAAAACCATTCTTCGTGACCTTCACCCTTCCAGTTTGGA GCCAGAGCCAGACGTCTTACGAAATGCAGATATCATTGAAATCGATCCAA TTGTTTATGAACAAATAGACAGTTGTGCCATACTCTCTGCTGCTTTAAAA ACTAAAGGGGCTGCAGGCCCGTCAGGTATGGATGCTAATGGATGGGGCAG AATATTGGCGTCAAGAAACTATGGCAAAACCGGAGAGGACCTACGGACAA GCTTAGCTAACATGCTCAAGATACTATGTCGACATTCTATTAACCCTGAA TCATCGGAAAGGGATCTTGAAGCTTTCCTCTCATGTCGTTTGATCCCCCT CGACAAAGATCCTGGGGTTAGACCCATCGGAATTGGGGAGGTGCTGCGTA GAATTTTTGGTAAAACTCTGATTTCAATTGTCAAGAACGATATTATGAAG GCTGCTGGCTCTCTCCAAGTATGTGCTGGCCAGAAAGCTGGTTGTGAAGC AGCAGTACATGCCATGCATACTATCTTTGAGGAAGAGGCTACGGATGCCA TACTTTTAGTAGATGCTTCAAATGCGTTCAATTCTTTAAACCGAAAATCT TTTCTACATAATATCAAATCGCTTTGCCCCGCTATTGCCACCTATGTATC GAACTGTTACTCTAGAAAATCGAGACTTTTTGTTAGTGGTGGTATGGAAA TCAGTTCAGAGGAAGGTACTACCCAAGGAGACCCCCTTGCAATGCCAACC TATGCCATCGGTCTCCTTCCCTTACAAGAACTTATCCAGGAACAACTAGG AGAAGATCCCATCAAAAGTGTTGCCTTTGCAGATGATTTAGCTGGAGCGG GCAAATTGGAGGACTTGTTAAAATGGTGGACCATCATAAATCGTATTGGC CCACTCATAGGGTATTATCCTAAAGCGACTAAATCCTGGTTAATTGTAAA GGACAAGGAGAAATTAGCAGAAGCTGAACAGATTTTCTCAGGGACAAATG TGAAAATTACTGTGGACGGGAAAAAGTACCTGGGAGGAACAATTGGAGAC AAATCATACAAGCGAACCTATTTCCAAGAACGTGTTACTGACTGGTGCAA GCAGATCGAAATCCTGGCAGACATAGCTAAATCACAACCACAATGTGCAT 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CATCAAAATACGAAAACGAATTATTAAGTTACTTGGCTTACCGTACTCAG ACTGTGTTAAAGGGCCAGGATCCCATTCTCAAAACAAATTTAAAGGGAAT TACACCGTTACCAAATGCAAAAAAGGTTGCTATTTGGAGAGAGTCTTTCA ACAGTGTGGTGCTATTCCACCTATGTACAAGAAACATTTGCGAGAACCAC GTCAATTTGAAAATAAGACTTTAGTGAACAACACATTTGGAAAAGCTTGT ATGAATACGATCATGAACGATGAGAAAGTAACTTCAATATGTGACTCCCT TTGTGAATTACGGCCATGTTACGAAGAACAGATAATCACCGAGGCGGAAT TTAATCCATTTATCGTTCCAAACCTTGCAGATATAGCATTTTCTTTCCCT TCTTTTATGGTAGAAATCATAGAAGAAGTACCAGCGTACACTTGGCAAGA TTTGTTTTCCAATTTCGGTGGTTGTGTTGGTCTAATGACTGGAGCATCTA TTCTCTCGCTTTTTGAACTTGGAATTTTCTTAGGATTGTTGATTTTTGAT TATTTTGATATTTACACTAAATTTTGGTCCAGCAGAAAGTAGATTTTTAT TTAAGTGCTGTTTTTCATTTTTGCTATTTTATTATTGTTTATAAGAGGAT GTTCGATGAAGAGGTCGTGTTTGTTACTGTGACCAACGGTCTTGTTTTTA CATGTGTTCTCCTCAAAATTTCGGGTCTGCGTTTTCTTTGGATTGCTAAT CTTTGCTTATTATTATATTTATACTANTCAGAAACTTTCCATGAAGCGAC AGGACTAGCTCACTGGACGAACGACGGGTTTTATAACATCAAAATACGAA AACGAATTATTAAGTTACTTGGCTTACCGTACTCAGACTGTGTTAAAGGG CCAGGATCCCATTCTCAAAACAAATTTAAAGGGAATTACACCGTTACCAA ATGCAAAAAAGGTTGCTATTTGGAGAGAGTCTTTCAACAGTGTGGTGCTA TTCCACCTATGTACAAGAAACATTTGCGAGAACCACGTCAATTTGAAAAT AAGACTTTAGTGAACAACACATTTGGAAAAGCTTGTATGAATACGATCAT GAACGATGAGAAAGTAACTTCAATATGTGACTCCCTTTGTGAATTACGGC CATGTTACGAAGAACAGATAATCACCGAGGCGGAATTTAATCCATTTATC GTTCCAAACCTTGCAGATATAGCATTTTCTTTCCCTTCTTTTATGGTAGA AATCATAGAAGAAGTACCAGCGTACACTTGGCAAGATTTGTTTTCCAATT TCGGTGGTTGTGTTGGTCTAATGACTGGAGCATCTATTCTCTCGCTTTTT GAACTTGGAATTTTCTTAGGATTGTTGATTTTTGATTATTTTGATATTTA CACTAAATTTTGGTCCAGCAGAAAGTAGATTTTTATTTAAGTGCTGTTTT TCNCTTTGATTATTTCGATATTTACACTAAATTTTTGTCCAGCAGAAAGT AGATTTTTATTTAAGTGCTGTTCTTCATGTAGGGCATTATTTTTGCTATT TTATATTGTTTGTTCGATGAAGAGTTCGTGTTTGTTACTCTGACCAACTG TCTTGTTTTTACATGTGTTCTCCTCAAAATTTCGGGTCTGCGTTTTCTTT GGATTGCTAATCTTTGCTTATTTTTATATTTATACTAATTTTAAAGTCGG CAAGACAATGACCCTTTAACAATCAGTCGGTGACACTATATTGCCATTAT GTGATCTAAAGTTTAAGAGTTTTTTACGTCTAGCAAACCGTTAAACGCAA TCAGTTCTAATTACCCATGATTCATATCGACTGTAAAATGGCCTAACATA CCTTAGTACATGCTCTTACCCGTCTCAGTAACTGTATCGAGACAGAGATC CTTCGGTATCGAAATTAAGGGTTTGTCTGGTTAAAAAAAGGACTAATTTA TTCCGTCATTCAATAACTGAAATATGCTAATATTTTTCAACTTACTAAAC ATGCTTTTAAAAAATTGTTTCGTCGGTGGATATTATCGGGATATTGATAT AATGATGTGTTCACTTTACATTATATCTATCATTACATTAAATCTATCAG ATTTATCTAACCTTCTCCCTATTCTGTTTCCATTTCAGCACAACTCGCTG TACGCTGATTTCCAACATTTCGAAGAAACAATCGGTCGCCTTGACAACAA CCTCGTTTTGGTAAAAGAATTACACAATGCCGTATCCGATGAAACAGTCG TGACCAATCAAACCAAAAACCTTCTTGTCCGTGGCCTCACCTTCACAAAC TCACTCACACAATACATCAACAAGCTAGAGTCTTATCGTCTCTATGAAGA TTTGACCACGACTCCGATCGCTGCATTAAAGAATTTACAGAATGGAATAT TGCTTCTCCTCAATCAATTGAGAAAAAGAATCCAGGATGAAAAATTTACC ACGAAATCGAAATTGACACCTGCAGAATTCTGCTGCAAATTACTAGATAT TATTTGGTATCTTCCCTCAGAAGCTCACAAAGCCTTGATCGAACCGCGCC TATTCGCTGCTTCCAAATATTTAACGTCTTTAGAATCCAACAAGCTGACC AGCCTTCCTCACGACCTTCTTTTAATGTCATTACAATGTCTGCAAAATGA CTTCCAACAGAATTTGAATATTCGATCGACCTCTCAAACAAAGAAGGAAT CAATACAACAGTTTCGAAACGTCATGTCTGCTTTCTATCAACTCTGGTGT AACCGAAAACAATACGAGTTAGAAGAAGAAGCGCGCAAAGCATCACTTTA TAAATACAAGACCAAGGTGCATTGCGAAAGTAAGACAGAAGAGGAATCAT CGGACGAGAAAACGAAAGAGCTTTTCCCAACTTATGATAACACTTATGAA GATGTCATCCCAAGAGATATCCTCAACCAACAAAAAGAGATCGAAAACGA GGCCACCGAAGATGACGTCAACAATAAAAGCGAAGCTGCCGCACCACGAG TTGACGAGAGACTGGTGTACAAGGCTATGCGTTCGATCTTCTTTAAGAAA GATGTTGTTGAGCAATCCGATGTGTTGATGGAAGTGTACCATCAAATGTG GTATCTGTTGAAGATN
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070550TCONS_00070550Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00070549TCONS_00070549Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070550-proteinTCONS_00070550-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_56supercontigscaffold_56:652763..698628 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.08 2.82 2.15 1.19 6.39 5.06 3.23 5.68 2.53 3.01 4.66 2.83 5.31 4.77 3.97 6.04 7.1 8.32 1.22 2.52 8.03 7.11 2.06 3.91 10.42 9.87 2.09 1.91 2.99 2.65