XLOC_044093 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_044093
Unique NameXLOC_044093
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_58:241606..256380-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044093 ID=XLOC_044093|Name=XLOC_044093|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=14775bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_58:241606..256380- (Clytia hemisphaerica)
TAAAAACTGATTTATCTGATGAGTTTCTGTCCAACTTTTTTCACTGAGGG GATTTGGGTGTCAGAGTGCAGCGTACGTTGTTTCTCGACCTACACAATAT CAATTTTAATTGCATTTTTTGTGTTATTATGTTATGTGTTATATGTTAGG GTTATTTTACAAGCATTATAATTCTTGGAACTTTAGTCCAAGTTTATACC TGATATATTATTTAAATCTTTAAATCATACGATATTTTTATTGACAGTGT TTTAAACGCATACCTAAGGTTATCTTTCAGTTTTATGATTCTGGGTCGAT GGATGTGTAATCAAAATAAAAAGTAATTCTTCAAAAACTTCATTTTACAT TTTGACTCGATTAGCCGCTATTTGCAAAGAATAAAGGTTGTAACGGCAAA AACATTTCTTACAGGTTTTTACTTGTTCTTTACCTTTTTAGAGTCTCATT TTATAAATCTCGAAATTTTCTATCTATAATAGTTTAGTGTAGATGTAAAC TTTTTGCTTTATAATCTACCCAAAGACGTGCTTCTTCATCGTTTTCAAGA CTGGCATTCAGTGGCGTTGTGGCAGGGGGCCGGGGGTATAAGGCCCCCCC AGCGGAGCTTTTTTGAAGGGGCGCCGACGAGCAAGGGGCGCCGACGAGCA AGGGGCGCCAAAAGAGATTTTTTAAATGCCCCGATCTTGAAAATCATACT TTATGCGCCTTAAATTGCGCCCCAAGACCAATTTTACTGAGATAATTTTA AATTACTTGCAATTTTTTCGCTCGCAATAAAGTTAATTGGTAACTTCTTT GTAATCTAGCTAAGTTTTTTTTGCACAATACAGTATTATTAAATGAAAAT CTAACTGCACCCCAAGACCAGTTTGCTGAAAACAATATTGACATCATAAA ACATAATTTTTTTCGCTCGCTTCACTCGCATTACACATTGTTTCTTTAAG 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GGAAAAAGTTCCAATCTTGTTCAAATTTACACACGAGCTACATTTTAGTC TCCATTGCCATATTCCATTTAATCGGTATATATTTGAAATAATTCTGTGT CGTGTTTGAAAAATCAAGCCACCAATCGTTAAACGAAACAGATCCAGAAA CAACAATTTTCACACGTAGTATCATGGAAAAAGTTCCAATCTTGTTCCAA TTTACACATGAGCTGCATTTTAGTCTCCATTGCCATATTCCATTTAATCG GTATATATTTAAAATAATTCTGTGTCGTGTTTGAAAAATCAAGCCACCAA TCGTTAAACGAGACAGATCCAGAAATAACCATTTTCACACGTAGCATCAT GGAAAAAGTTCCAATCTTGTTCCAATTTACACATTAACTCCATTTTAGTG TCCACTAACAAATTCCAGAATCAGTTTACTTGAAATAATTCTGTGTCAAG TACGTTGTCGAGTTTGAAAATCATGCCACGTCCCACTGTCACTGTACTGA CCGTTGTTTAACAGCCATGGATCCAGAAGCAACATTGTGTCTTATTTAAN TGTACTGACCATTGTTTAACAGCGACAGATCCAGAAGCAACATTGTGTCT TATTTAAATTTACACATATCAGTTTATTTATTTCTATATTAGAAGCCATT ATTTCCTAAAAATAAAGTCTTTTTGAAAACAAGAAACTTAAAATGACAGT GATTTACAAGGTAGAATTTTCACCCCTAAAGCTTTATGAAAACTTGAGCA AAAACTATAAGATATGACAGAATGTTGAAAAAGGCTTACAAAGAAAAATC ACTAAAAAGTTTCTTTGGTTTGAAAGTCTCTAAAGCAAACAAAATGTTCA AGAAAGTATGAATCAACACGAATCAATTTCCTCGCTTCGACCTAGTTGGG ATCTTGTTTTGTTTTGAAAACATTTGTTGTTTAAGGAGCGCGAAATCAGA AAATATATCTTTTTTAGCCAGTACCCGACTTTAGCAAGCTTTTCCCTGTC CAGACGGCAAAAAGTGTGGTACTCGTATTAAGCGCCGTTTCTACCAAAAC GGACAGACAGAAGGAAACACGGACAAAAAAATAGTGAGACTCTCATTAAA GGCCCACTCGCTAGCGCTGGGCCAATAATGACCCCGGGGCCCCACCATTT CATGGCCTTTATGCTACGAAGTGCCAAAATTGGTCAAAAACTTTCATTTT CCAAGGGATTTTTAGTAAAATCAGGTCAATATTACTTAATTATGACCCCC CCCCTCAATTTTGTTGATTTTTATCTGTAGTTAAGCACACAAGAGTACCA TCAGAGGTTTAGCGTTTGGGTAGGAAATTTCTCCATCGAGTATCATACTA TGAATTCTTATTCATATTTTCTTTCAGGATTAAAGGTATAGTACTCATGG TGGTCGGGATTGTATTATCAATTGGTTTGAAAGGATATGTTCTTTACTAC TACCATGCTACACCTCTTTTCAATACTGAAACATATCGAGATGGTATTGA GCAAGAAGAGTAAGGTCCAACTTCTAACGAAAAATTTCTTCTCACATGCC GGCGAATTCAGACTAGAATGTCACCATTAGCTGTTCTTGTATTTAGCCTA AATTCTTCTGTTAAAGAATTATTAGTTTTATTTCTTGAAATTACACCTTC ATCCTGTGCTTTCAAACTGGAGCTTGTTTTCTATAATCTTCTTAGTGTCG AAAGCTAGTTTACTACTCACATTTTGAGGTTTAAACGATTCAGCCTGCAG TTTTGACCCGAAAAATCCTCGAAAAATCTAGGCGCCTATTCACCGTTGGC CTCGATCAGTCGAGATTAGAGCAATGAAATACTAGGCGTCTACCTTTGAT ATTTTCACATGATGAATGCTCTTTTGTACTTCATTGGAAGAGTGGGTGGA 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CATATTGGCTACGCAGGTGAGTGACCACTAGTGAAAATTACGAACCCAAT CAAAACGGACAATGAGATCCTCGGACGCTGCATCAAGCCTTTGATTTTTA ATTCAGGTCTTCGGCCGTTGATTTAGGTCTTCGGCCGCTAAATCAGGTCT GCGTCCGCTGACGGAAAAAAGATCTGCGTGGCCACTAGTGAAAATTACGA ACCCGATCAAAACGGACAGGGATATCCTCGGGCTCTAGGAAGAAATGCTT AAACAGTTTTACTATAGGTTCTATATGAGCCGTTCCTTTCGGCCTGATGA TACCCTTGTCTTTTATGGATTTCAACTTTGTAGGGGGTCAATACTTGGAT CCTGTAATATCTTTTATATCAATTCAAACCAGGGCTCCCTGTATCTCGAT TCTAATTCGTGGATGTCAAATTTTGTCCAAATCGTACTAAGTGGAGGGGG GGCCAAGCTTGAGATCCCGCAACATCTTTCTACTAAGGGAGTAATGTAAT GAAAAGAATTTTTTGCTCGAAATTCCATGCTCTTTCAGCTATTGCTACTT TTCCAATCAGAAAATCATATCTAATGCTCACATTTTCATTGTAGTTATGC CTATAGCGTCACATTTGTTTGTTCAAAAAAGATGTCGGACCTAATTTACA ATGTTTTGAATACTTTATACTTTCTAATAGAATAAGTTTGGTTTGGTTTT TTAAAAGATGTCACGGGATTTGAAGCTTGGCCCCCTCGACCAATTGAGCC ATGACAAAAAAAAAGATATGATATGATTAATTTATTCCATTCCTTCTTCA CAGGCATTATTGCAGATATGTTATGCAGTAAATTGTTCATACCATTATAC CGTGTAACTTATTCCGCCTATTTATGTCACGTGCTCGTTATTATTTACTT CTTCGGATCACTTCAAACCCCGATACACTTTAATGACACAACTTTTGTAA GTATGCAAAAGCATCCGGCGATGACCTTTTTTTTGAATATCTGCTGTTCG ATCATAAGTTAACCTAGATTTTTGGATCTGTTGTTCTGAATTCTTTGGAA TCCTTACTCCTAGAAATATCTATGTGATGCTTCTTTAAAATGTCAAACTA AATTTAGGACCCCTTCTCATAGATATTTGAATCTGTTTTTCCAAATCTAC GTCTCTTCCTAGAAAAAGTGAATAAAATCTGCAGTTCTGTCTTTCTCCAT TCTCTTATCTATTGTACCGCTTGCTGGCTCGCTTTATTGAAAATTCATCT GTTGGTGTTTTCTCATTTTACCTGACCTAAATACGAGGCTCGGAATTCCC GAGTTATTTTTTCCGAGTTAAAAAACCGAGTTACGAAAAAAACGAGTTAT CCCAAGTTATGACGTCATTTTTGGAATTTAGTGACGTCATTTTACATTTC ATAACTCGGTTTAATTTGCTTCCTTTAACTTTCCGAGTTATTTTCCATTT TTTAAGGAGGGATAACTCGGTTTTTTCGTTTTTTAACTTGGGAATTCAAG GCCTCCCTAAATACGATGTGCAGTTCATCAAATGCGTCATCATCTAAAAA TTATTATCTGGTGATACAGGATTATATCCTTTATCTAAAAAAATATTGTC TGCTATTCTTCGATGATCTCTTCTCCTGTAAACGAACAGCAGATAAATTG AAAAAAACAAGCAATCTTAGAAAATGGGATGTGCTGGTCAGTTAGAAAGA AAAATCCACCACCTGGGAAAGAACAGCAGATATTTTAAATGGCTTGCCGG ATGCTTCTTAGTATGAACGACCAATGAGAGAATCCAAAAGCTTCGATACT TAAAAGATATTTGATTCAGTGAATGCTGTATAGAAATTAACAGAGTTTGA ATCTTAAAGAGCTGTTTAAAATAATTTTTTGGTCCAGTCCTTTTCGAAAT CTTCTCGTTAATATGCTTCTTTAAAGTTATACATGATTTGGTAAAAACGG TGGGCGCCACAAAAATATGTTTTGGACTTGCCTTAACTCATCTGAGAGAA AAACAAGTTCATGCAAAGTTTTCTACATTTTGGTCAAAATTATGATAACT GGTGGCAATTTTTAACCATTAATAAATGTATAGCTTTTATTCTTTTTTAG GGAACGGTATTCGCAGGGATGTTGGTGGTCATTTACATTTCTGGTTTTCT CATCGCCGTGTTTGTTGAATTCCCTGTATATAACTTAGAGAAAGTTGCTC CAAAATGGGCAGGCATATATTTTGGCATTTTTCTTGCTTTTTTTTCGATT ATTATGCTTAGTAGCAATATGACCTCCCTCTCACTAATTTAATATGTTAT TGGTAGAAAATTCATCGGGAAAAAAAATCGTCGGCAAAAAAATCGTCAGT GGAAAATTTCGTGACAAAGCGATTATTTTAGAAAGTTCAGTAAGCTAATA TTTAAGTTTAAAATTTTTTAAGAGT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070940TCONS_00070940Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00070939TCONS_00070939Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070940-proteinTCONS_00070940-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_58supercontigscaffold_58:241606..256380 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.95 0.89 0.86 0.84 0.12 0.07 0.37 0.26 0.75 0.82 3.58 0.96 7.57 7.44 15.93 18.81 5.19 6.98 14.34 12.32 2.49 3.2 3.51 4.72 9.52 7 2.45 3.81 12 8.87