XLOC_045590 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_045590
Unique NameXLOC_045590
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_92:12021..20823-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_045590 ID=XLOC_045590|Name=XLOC_045590|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8803bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_92:12021..20823- (Clytia hemisphaerica)
ATTTCACAAATAAAAGATATAAGTTACTGCGAATTCCAATATAATCGAAT
ATTTTTGCATGATTTTTGAAGAAAAAGTAGTTTTTGTAAGAAAATTTTAG
AATTTTTGCCTGTTCGGTAAATTCCGATATTATATGTTGCGCTCACATGG
CGTAACATTTTCGAATAAGAGACATGGTTCTGTTACCCAGGCTCCTTTCA
GTCAAATAGTCAAGCGATAGCACAGAAGCAGCAATATGCCTGTATGTAAT
TTATTTGGTATTTTGGTTGTTATTGTTTTATTCTGGATTATTTTTGGAAT
ATTTTGGAGTTTGATGTTGGTATCATGTGTTGAGTTTGTTATTTCTTTCT
TTTTAGCTGTTCAAAGACTTGCTAAACCCATCCCTTGAGGAAGAACGAAG
AAAACACAAGTTTTCAAGGCTAGTGCCCTCTCCCAACTCATATTTTATGG
ATGTTAAGTGTCCAGGTAATAAAACTTTACAACATTAAATCACATTTAAA
AGTAATGGAGTTAAGACCTACTGAACTTGTTACATAAAATATCTTTGATT
TGCTGAGTTAGCACTTTTCTCTGCTGACTTACAAATTCAGTATTCAAACT
AGCCACTTAAATCACTCACTCATTATTTGATTCTGGTACAATTGAATAAT
GAAATAGAGGAAGGCTAGTAATTTTTACATCATCATTAGCCTCATTTGGG
TGTGCGACGAATGTACGATAAGTATAAGACAATCCAACCTAATTAACCAT
TTGTGGATAAAGGACCTTGATGCTTTCCTTAGTGCTGTGGAAAGAATGGC
AGAATTCAATCTAACATTCTATGTCTGGTGGTAAAATTTGCAATTTATTA
ATTATGTTGGCGCGTGCGCCTCTTTTCCCATCTTGCACCCTTATTGAAAA
ATTGAATGTTGGTACAAAAGAAATTTTGCTTGGCGCGAGGCTTGCTGCAC
GGAAAAATATCTTCGGCGCGAGATTTCGTGGAATCCATACTGGACAGTAT
GTATTGTTTGGTTGTGTATAATATTCTCAACTTCAGTTGAGCTACAATCT
GACAATGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTCTGTCTGTCACAAAAA
CTTTAGGGCAGCCTGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGGTCAG
AGCCTTTGACGCTAAGAAATTTCAACAGAATATTGATTTTCAAACCTGTA
ACATTTTGTATTCCGTCCTTCGCTACACCTGCCATCTTATAATTCAAATG
CATAAAATATAACAGAGATGATATCCAATACTCTTCCGTTACGTTTGTAG
GAAAATGTTATTATCTCCCTAACCATAAAAACAGAGATACCGCAATAAAA
AATAGATGGGCCGTATTTTGATATACAAGGGCCGCGCTGATGGACCGTCT
ACATAAATATGACAAAATAAGGACCCGTTTGTCTGGGGACAAACAAATGT
GAAAGTCATAAGTCAAAACCACTGTTTTAAAACCAAGCGAAACGAAGCAC
AAAAATTAATGTGGCTGGAATATCAATATCTGTAATAATATAGAAGAAAA
ATTACTTTCATCGATTTTTGCTATAATTAATGTAAATGACGCTAAGAAAG
AGGGGTGGGGGGTTCTTCAGATAGTGTCACAATGACGTTAGTTGCAGGAA
AAATCAATATGCGAGTGACCCCTAACTGTTATTTGGCAAAGTTTTAAGTC
AATTTTGTAGGGTATTTTAGTTTGAAAACCAGACCCCCGCGCTCGATAGG
ATCGGTCATCAGAACGGCTCGATGACTGATCGATAGATTACTTAGCGATC
CGGATAGGAGATCGATAGAGGATCGATACTCAAGATTTTTTAAGCTTATG
ATTAGTTATCGATCTATCATCGATCTTTTATCGATATTATCGACCCTATC
GACTCTTTCTAAAAATTGTGCTTTAATATTAATTGATCTTTCTTTCTATC
GATTACCTATCGATTTACGATCGATAAAAAATCAATTAACGATCAATGAT
GAATCGATATACTCGATTGAAATACTAGCTCGATAATGGATCAACAAAGG
ATCGATACTCAAGATTTTTTAATGGCTGAATCTTCCATCGATCTCCTATC
TGGATCGTTAAGTTAAGTAATCCATCCATCACATATCGAGCCGTTCCGAT
GATCGATCTTATCGAGCGCGGGGGTCTGGTAAAAAGTACAACTGTTCCCC
CTTCCCATCCAGAGCCCTATAGCAAACTCTAATTTCACACATATTTTTCA
AAATTTGTACATTCACACATATTTTCATGCTCACGCAAACCTGTGTCACA
CAAAATTGGTAAACTTTTTGGGAAAATCAGATAAGTTGGATGTGATAAGA
CAGTCACAAGCAGATTTGTTTGCGATCAGGCGTCTGTATAACTGTATTAA
AAACTTGTTGAATGGAGGTTACACACCTTGCCTGACTCTCTGGTTACCAA
AGCACAAGACTTAATATATTCATCCATTTTCAGGATTATTTAAAATGCTG
TAAAATGTATGAAATTGTGATGAGAAGATTAAAATTGCCTTACAGGATAA
CTCAAACTTGATTTATTTTTTTTACAGGATGTTATAAAATCACCACCGTT
TTCAGTCACGCACAAACTGTAGTCTTATGTGTCAGCTGCTCAACTGTTTT
ATGTCAACCAACTGGTGGAAGAGCCAGATTAACAGAAGGTATTAAATAAC
TTTATTAAAAAAAAAAGGGTTATTCAAAACAAAGGGGTAACCCATTTTTT
TAACCTTGCTTTCCCAATGTAGACTTTATACGTATAGAAAGAAAAAATTT
TAACTAGAGATTTGTCAAAGTCAGATTGACAGTCATGGAAGGTCTGAATC
ACTTTACCAATCTTGCAAAAAAGAGTGAGCAAGAATAGAAAAAAATTTTC
TAAACATTTTTCATTTCTTTTGGGATATCAGCACAACTTTGAGGTTAAGA
AGCTGTATAATAGTAATAAAAAACAAATATATTTTAAAAATATCTTTAAT
ACTGCTTCTTTTGGTGATTTTGGTCAAGCTGTCACTTTTTATGGGTTGCA
GGAAACCCAAACAATCATAAGATGACTGCATTGAATCTGCAAGAAATATT
TCTATTGAACTAATCTTAAGGACTGTCTTTACACTTGATGCAGCTTGATG
TATGGTGTTTGTTTTTTCGATTTAACTTTTTTTCCTGAAATTTTTTCATG
ATAAAGGTATATATTTCTGAAAGCCAATAAAATTATCTATCAAATGTAAT
CAATTAGGATTATTATGCACAAAGTGAGTAGAAATTACAATGCTTTGAAA
AATATAACGTTTGTTAACTTCAAAGAGTTCAACTTGCCCAACCACTTACT
TTTTGGACCTACCCTAAGGTAGTCCTTTAAATTAACCCTTGTCCGTCCGT
CCGTTCGTCTGTTGCCAGCTTTTCTCGGGATCGGCTCATCATTAGTTTTT
TCTAATTTTTTGCACAATGATGCAAAATGGCAATACCCAAAATGTGACGG
AGCCCGATTTTCGAAAAAAAATTATTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAATAT
GCCGGAAAACCCGTTTTTTTGGCATTTTCTCAAGATTTCATCATTANNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTTGTGCTAACAGA
CCTCACATATAAATGAATTTGTGTTGCAATTTTGATTACTTTTAATCCTG
AAGAGCTTTCCTAGGAAAGAAACAAATTTAAGGTAGCTTCAATAAGAATA
TTTTTTGACTGTCCACGTGAGCAACTTGCAACAGTCTTAGTTTCGTATGA
TTACCTGGCGTTAAAACTATAAATTTGACTAGGCTTAATAAGATTTTCAT
TATTTTTCAATCAGGGTTAATTTTTATAATTTCATTATTAATTTTTCACC
GGACTGGCGGCTACTTGCCCTGCCATATTTCTCACCAAATTTGTTTTCTT
TTTTTTTACTAGGGTGTTCATTCAGGAAGAAGCCACAATAAATTCGATCA
ATGAAATGAGGGGATGTCAAGCGTAAACCGTTTGCCAACTTATCACCTGA
AGGATTATATACACCTACTGATGGATATCACTCGAAATATATCATTTAAA
ATAATATTTTGTACATTGTAAAATTCAATCCTTAATGAGTTGGGAAAAGA
TTTGTGCTTGAGATTACTTTTCAAAATATTTCGTTTCAATTCTTTTAAAA
GTTCTGAAAATGCATGTAGTTAACCATCGTCAGATCACAAGCAAAATCAT
TGAATCAGATGCATCTGGAAACTTTCTTCACTATTTTGACTGCACAGAAT
CAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00073455TCONS_00073455Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_92supercontigscaffold_92:12021..20823 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1176.03	1223.59	1303.79	1429.9	983.26	821.8	1276.14	1372.21	2437.19	2000.14	2670.26	3136.54	3044.93	3230.41	2949.83	2791.35	3148.85	3218.86	1832.89	1951.6	3073.81	2963.55	2005.37	1947.96	1798.49	1783.06	2985.19	3066.1	1738.52	1784.4