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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00002125 ID=TCONS_00002125|Name=TCONS_00002125|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4645bp
aattttgtcaaaagtgcAGAGTTCGTGGAAAACTTAATAAGAGTAAATCA
ATATAGACGAATGAATTACAAAGCTGATAAACGTGTCTTCCCTGTATGAT
ACATGAACTAAAAGAGACCCTGGTCATATGGACCAGGATATAAATGATAA
ACTCTACATGCCCCCTTTTGGGGATCATAATGTCGTTATTAACAAATGAC
TCAATCGTGTGATTGTCCTGACATTTTTGGAGACAAGGCTCTCGGTGGTC
TTCTCTCTCTGGTACTTCTTCTGTGTGTCGGGACTTCTTGCTGTGCCCCT
CGTTGACCCCCTTCGTCGGCGGTCTTTTGTGGTGGTTGGGAGGGTTGACA
GCTTGGCTCATCACGGTGTAGTAGGGGTGTTGGAGTTTGTTGTATTTGGG
GTGGATCAATGGTGACCTCGGGTCGTCGGCACGATTCCAGTATCGGTCGA
AGGAAACGTCGGTTTCTGAGGGTAGCTCTGCGACTGCCATCCACCATGAC
TCGATACTGGCGGTTTGGAAGTGTCTCTGTGATGTAACCCGTATTGTGCC
ATTTCGTTGGTTGGCTTCCTTTCTGGTTTTGGATCTGGACCGTGTCCCCG
ACGTTCAACGGGTTGAGGGGCTTTCGGGAATGATCGAGAGCGATGTGTTG
TTTTCTCGCCATGGCTTGCTCGCGATAGTCGGCAATCTGGTTCCAACCGT
CTTGAAGGCGAATTTCTTGAATCGGTAAGTGGTCTCGAACGGGTCTTCCA
AAGAGGGCTACCGCTGGTGAGGTTCCAGTTTGTTGACATGGGGTGTTTCT
GTGCGTGAGTAAGGCTTTAACTGCTTTTTCGTTGTCAAGCCTGCCTGTTT
TAGGGTCGACGTTTCCTAGAAGAATTCTCTTGGCTGTTTTGACTCCTACC
TCAGCCCTACCATTGCTTTGGGGGTAGTATGCAGAGGAGAGCCGGCGGTG
AATGTTCCAGGTAGTCAGGAAGTTACGGTATTCAAACGAGTCGAACGGTG
GTCCCCCGTCTGATGCGAGTTCTCGTGGGACCCCGAATATGGAGAAATAC
ATAAGCAATACTTTCTTTATGTATTCGAATGTGGAATAATTAATGGTTGC
TACTTCTATCCATCCAGAATACGCATCTACGTAGATAATGTAGCCGAATC
CGGAAAGTTTGAAGAGATCTATCGCAACTTGTTGAAAAGGGTATTCAGGT
GGGTCGGTCGAGATTGTCGGTTCTTTGTGTTGGGACGGGGCTTGCTCGTT
GCACTGACGGCATCGATCTCGTAAGACACGGACGGCAGCATCAAGTCCTG
GCCAAAAGAACCTTTCCCGGGCGTTGGCGAGCATACTGCTGACTCCTTGA
TGTGCCGCGTGGAGGCCTTCTAACACGGTTTGACGTAAGGATGCGGGGAT
CAACATCTTCTTTCCTTTGAAGGGAACGCCTTGGATGAGGTATAGCTCGT
CTTTCATGCTCCAATAACTTCGGATATCCATGGGCAGTTGGTCCTTTGAC
TTTGGGAATCCGTTGGTGATAGATTCGGCGAGTAGCGAGCATTCTTCGTC
AAAGATTGCGTGGTTCTTGACGGTTTCCCATGAGACATTTTTGACACCGT
TTCCTTGGGTATTGGCAAACATCACTGCTGCTATTTCGCTAGATTCGTCG
TCGTCTGGTTTGACCGGGTTTCGGGAGGTGATGTCTGATACCTTCATTAC
TTTCGATTTTCCGGGGAAGTGGATAATGTTGAAGCTGTACATAAGAGTTT
TCTCTTTAAAATTTCGTACTCGGGGGTTCTCTATCGTTGACAGTTCTCGG
TCATTGAATATGTTGATGAGTGGTTTGTGGTCTACCACCACGGTTAAATC
GGGTGCACCCATTACAAACATACGACAGCGCTTTAGGCCAAAGGCGATGG
CCAATGCTTCCCCTTCAATCGGTGCGTAACGACTTTCGCTATCTGTGGTG
AAACGAGAGCCTGCAAAAATTAATTTCCAGTGTTCTTTACCGCAGNTGCT
TCCCCTTCAATCGGTGCGTAACGACTTTCGCTATCTGTGGTGAAACGAGA
GCCTGCAAAAATTAATTTCCAGTGTTCTTTACCGCAGTCTGGTTTCGATG
GTTGCGGGCAGTTGCAATGTTTTTGGATCAGGTGGAATCCGATACCTGTC
TTTGACCAATCTGTTATTAGACATGTTGGTCGTTCTCTAACGAAGGTCTC
GACTCCGTCTTGGACAAGCTTAATGATCTCTGCTTTTGATTGGATAAAAA
TCTGTTCGATTTGCTCGTCCCAGTAGAATGTTTTTGACGAAAGCAATTTA
CGGAAGGGTTCCATCACTCTGGCTTGTGCAAATGAGTAAGCTAATTGGTT
GACTAAACCGAACCACGATCTAACATCTGTAATCGACTTTGGTGTTGGAA
AGTTTTGAATTGCTTCGATGATTTTCCGCAGAGGTTTATAACCGTCCTTT
GTGATTTCGAACCCTGCGAACTCGGCTGTTTCTTGAGCGAATTGGAACTT
GTTTGTGTTAAATACAATTCCGTTGTCGTTGCAGAGTTTTAAGTAATCGA
CGGTGTGCCAGAACGATTGCTCGATGGAGTCATCCCATAACAAAGTGTCA
TCAATGCAACGGACTGTTTGCTGTACGTCGATTGTGATGTCGTCGAACCT
TCTGGTGTATGCGTCTCCTGACACGTGGAAACCCATGGGCGCTCTTCGAT
ATCGATATCTGCCCCATTCAGTGATAAATGTTATCGCGTTTTCGGCATTT
TCGTCTAGAGCGAGGCTGTGGTAGCCGTTCCACGCGTCAACGACTGTTTT
GCGTGTGGACGGAGGGATGGTTGAGACTAGATCGAATGGGGTTGGTGTGT
GGTGAGTTTCGCGGAGGGTTGCTTTGTTCAACTGCTGTAGGTCAACTGTG
CGTCTCGGGTCACCGTTTTTCTTGGCCGTGACGACCATACGGGCGCACCA
TTCGGTAGGTGTTCCTTGTGGTACTTTCTCAATAATGCCCAAACGAACGT
CTCTGTCTAAGTCTTGTTTGACACGCTCTTTCCAATGGTGGGGTACGGGA
ATTGGGGTGTGGACCGCATACGGCTTACAATCGTCCTTGAATTCGACTTT
CATTGGTTCCCCAGTCATTTGCGGTAGGGGTTGGTGGTTGAATGCGGATG
ACTCAAAAGTTTTAAGTAACCAATCTTTCAGTTTCGGAACATTACTCTCA
ATAGGTTCAAACGGTATTTCTGTTGGTCTTGGTGGCGTTGGGGTACGAGG
AATACATGGGCACGACTGACCTTGTGCACATGCGGATGACTGTGTGTTTG
GAAAACTCTCCTCTACAATACCTAAGTCCTTCATTGCTGTCTGTGATAGG
TAGAGTCCCTTGCAATTTTTGGAGATGTACACCATTTGGTTACTCTGGTG
GTCATTGAGTTCGATTTTCAGAAAGAGAGCCCCCATGATCTCGAGTGGGG
ACCCTGTGATACCAATTGTCTTGTGTCTTGTCGATATCAAGTAGTTTTTG
GGACAGTTCAATAATGATAAGATTTCTGGTCCTGCCGTGCAGGTTTGGCA
GCCAGAATCTGCTACCGCTTGCGTTGCACCCTGTTTTAGTGATGAGGGTG
TTGTCTTTCCAAAACGTTCATGTGTTTGTCTTATAATGTCTACTTTAATA
TAAACATTTGGTGGCGGTTCGGGTCGTTGAGTACTAAAAGATTGATCTTT
CCACTCCATGTGAGATTGGGTTTGTGTTATCTTCCCCCCATTGTATAAGG
GGCCAAACGAAAATCCCCTTGGAGGTTGGCTGATGCGATGGATGGGGGTT
CTTCCATTTCCTCTTCGGTGACTGCATTGGAGCGAGAAGTGGTGTTTGAT
CTCTTCTGGCAGACGGCTTGGAAGTGTCCTTTAATCCCACAATTGTTGCA
TGTTTTATTGAAGGCAGGGCAGTCCTTTCTTGCCATAGTTTTACCCTCGT
GTTGTGTTCTGCCACACCCTTTACAGTTCTGGGTGCTTTTACTTGAGGGG
CTGAATCCTTTTGAACGGCGGTAGGCGGATCTGTTTGCGGCACTGATGCT
AGGCTGAGAGTCAGTGGCCCTCATGAGGTCGGTGGACTCTTCGGTGGCTT
CAAGGCATTGGAGACGTTCGACTTTCTGTTCAAGTGTTGGTAGCAGCGGA
GACTCTGATAGAATACGGGATTGGTGTTGTTGGTTCTTTAACCCTGAGAT
GAGTTGTTGTGTTATCATGTCATTGGAATAGTTTATTTCAATCTCAGGTT
CGTGTGTCGTGCAGGTAACTTTGAACTGGCAAAGAACAGCTTGGGATTTA
AGGCGGGCAACGTACTGGGTAACTGTCTCGCCGTCCATCTGGGTTAAACG
GAAGAAGTTAATTCGGTGGACCTCTTTGTGGGTACCTTTGACTGCTACAC
GTTTGATGTGTTCGAGTAGGTTTGCTTCGGATGATGTGTCGAGGGTATCA
GACCCAATGTATTCGAATAAAAGTTTATTAACCTCCTGGGAGCATGATGC
ACGAAGCTCCATACGTAAAATGTTGTGATCAGTGATACCTGTCATTGCCT
TGTAACGGTTCCAACTGTCTTTAAACAATTCCCATTCTCGTTCGTCAGTA
TTTATGTTGATAATTGGGCGATCCGGGGCTTTGGTTTTTTGCCTT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000018:257112..261814- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00002125 ID=TCONS_00002125|Name=TCONS_00002125|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4703bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000018:257112..261814- (Clytia hemisphaerica)
AATTTTGTCAAAAGTGCAGAGTTCGTGGAAAACTTAATAAGAGTAAATCA
ATATAGACGAATGAATTACAAAGCTGATAAACGTGTCTTCCCTGTATGAT
ACATGAACTAAAAGAGACCCTGGTCATATGGACCAGGATATAAATGATAA
ACTCTACATGCCCCCTTTTGGGGATCATAATGTCGTTATTAACAAATGAC
TCAATCGTGTGATTGTCCTGACATTTTTGGAGACAAGGCTCTCGGTGGTC
TTCTCTCTCTGGTACTTCTTCTGTGTGTCGGGACTTCTTGCTGTGCCCCT
CGTTGACCCCCTTCGTCGGCGGTCTTTTGTGGTGGTTGGGAGGGTTGACA
GCTTGGCTCATCACGGTGTAGTAGGGGTGTTGGAGTTTGTTGTATTTGGG
GTGGATCAATGGTGACCTCGGGTCGTCGGCACGATTCCAGTATCGGTCGA
AGGAAACGTCGGTTTCTGAGGGTAGCTCTGCGACTGCCATCCACCATGAC
TCGATACTGGCGGTTTGGAAGTGTCTCTGTGATGTAACCCGTATTGTGCC
ATTTCGTTGGTTGGCTTCCTTTCTGGTTTTGGATCTGGACCGTGTCCCCG
ACGTTCAACGGGTTGAGGGGCTTTCGGGAATGATCGAGAGCGATGTGTTG
TTTTCTCGCCATGGCTTGCTCGCGATAGTCGGCAATCTGGTTCCAACCGT
CTTGAAGGCGAATTTCTTGAATCGGTAAGTGGTCTCGAACGGGTCTTCCA
AAGAGGGCTACCGCTGGTGAGGTTCCAGTTTGTTGACATGGGGTGTTTCT
GTGCGTGAGTAAGGCTTTAACTGCTTTTTCGTTGTCAAGCCTGCCTGTTT
TAGGGTCGACGTTTCCTAGAAGAATTCTCTTGGCTGTTTTGACTCCTACC
TCAGCCCTACCATTGCTTTGGGGGTAGTATGCAGAGGAGAGCCGGCGGTG
AATGTTCCAGGTAGTCAGGAAGTTACGGTATTCAAACGAGTCGAACGGTG
GTCCCCCGTCTGATGCGAGTTCTCGTGGGACCCCGAATATGGAGAAATAC
ATAAGCAATACTTTCTTTATGTATTCGAATGTGGAATAATTAATGGTTGC
TACTTCTATCCATCCAGAATACGCATCTACGTAGATAATGTAGCCGAATC
CGGAAAGTTTGAAGAGATCTATCGCAACTTGTTGAAAAGGGTATTCAGGT
GGGTCGGTCGAGATTGTCGGTTCTTTGTGTTGGGACGGGGCTTGCTCGTT
GCACTGACGGCATCGATCTCGTAAGACACGGACGGCAGCATCAAGTCCTG
GCCAAAAGAACCTTTCCCGGGCGTTGGCGAGCATACTGCTGACTCCTTGA
TGTGCCGCGTGGAGGCCTTCTAACACGGTTTGACGTAAGGATGCGGGGAT
CAACATCTTCTTTCCTTTGAAGGGAACGCCTTGGATGAGGTATAGCTCGT
CTTTCATGCTCCAATAACTTCGGATATCCATGGGCAGTTGGTCCTTTGAC
TTTGGGAATCCGTTGGTGATAGATTCGGCGAGTAGCGAGCATTCTTCGTC
AAAGATTGCGTGGTTCTTGACGGTTTCCCATGAGACATTTTTGACACCGT
TTCCTTGGGTATTGGCAAACATCACTGCTGCTATTTCGCTAGATTCGTCG
TCGTCTGGTTTGACCGGGTTTCGGGAGGTGATGTCTGATACCTTCATTAC
TTTCGATTTTCCGGGGAAGTGGATAATGTTGAAGCTGTACATAAGAGTTT
TCTCTTTAAAATTTCGTACTCGGGGGTTCTCTATCGTTGACAGTTCTCGG
TCATTGAATATGTTGATGAGTGGTTTGTGGTCTACCACCACGGTTAAATC
GGGTGCACCCATTACAAACATACGACAGCGCTTTAGGCCAAAGGCGATGG
CCAATGCTTCCCCTTCAATCGGTGCGTAACGACTTTCGCTATCTGTGGTG
AAACGAGAGCCTGCAAAAATTAATTTCCAGTGTTCTTTACCGCAGNTGCT
TCCCCTTCAATCGGTGCGTAACGACTTTCGCTATCTGTGGTGAAACGAGA
GCCTGCAAAAATTAATTTCCAGTGTTCTTTACCGCAGTCTGGTTTCGATG
GTTGCGGGCAGTTGCAATGTTTTTGGATCAGGTGGAATCCGATACCTGTC
TTTGACCAATCTGTTATTAGACATGTTGGTCGTTCTCTAACGAAGGTCTC
GACTCCGTCTTGGACAAGCTTAATGATCTCTGCTTTTGATTGGATAAAAA
TCTGTTCGATTTGCTCGTCCCAGTAGAATGTTTTTGACGAAAGCAATTTA
CGGAAGGGTTCCATCACTCTGGCTTGTGCAAATGAGTAAGCTAATTGGTT
GACTAAACCGAACCACGATCTAACATCTGTAATCGACTTTGGTGTTGGAA
AGTTTTGAATTGCTTCGATGATTTTCCGCAGAGGTTTATAACCGTCCTTT
GTGATTTCGAACCCTGCGAACTCGGCTGTTTCTTGAGCGAATTGGAACTT
GTTTGTGTTAAATACANAACCCTGCGAACTCGGCTGTTTCTTGAGCGAAT
TGGAACTTGTTTGTGTTAAATACAATTCCGTTGTCGTTGCAGAGTTTTAA
GTAATCGACGGTGTGCCAGAACGATTGCTCGATGGAGTCATCCCATAACA
AAGTGTCATCAATGCAACGGACTGTTTGCTGTACGTCGATTGTGATGTCG
TCGAACCTTCTGGTGTATGCGTCTCCTGACACGTGGAAACCCATGGGCGC
TCTTCGATATCGATATCTGCCCCATTCAGTGATAAATGTTATCGCGTTTT
CGGCATTTTCGTCTAGAGCGAGGCTGTGGTAGCCGTTCCACGCGTCAACG
ACTGTTTTGCGTGTGGACGGAGGGATGGTTGAGACTAGATCGAATGGGGT
TGGTGTGTGGTGAGTTTCGCGGAGGGTTGCTTTGTTCAACTGCTGTAGGT
CAACTGTGCGTCTCGGGTCACCGTTTTTCTTGGCCGTGACGACCATACGG
GCGCACCATTCGGTAGGTGTTCCTTGTGGTACTTTCTCAATAATGCCCAA
ACGAACGTCTCTGTCTAAGTCTTGTTTGACACGCTCTTTCCAATGGTGGG
GTACGGGAATTGGGGTGTGGACCGCATACGGCTTACAATCGTCCTTGAAT
TCGACTTTCATTGGTTCCCCAGTCATTTGCGGTAGGGGTTGGTGGTTGAA
TGCGGATGACTCAAAAGTTTTAAGTAACCAATCTTTCAGTTTCGGAACAT
TACTCTCAATAGGTTCAAACGGTATTTCTGTTGGTCTTGGTGGCGTTGGG
GTACGAGGAATACATGGGCACGACTGACCTTGTGCACATGCGGATGACTG
TGTGTTTGGAAAACTCTCCTCTACAATACCTAAGTCCTTCATTGCTGTCT
GTGATAGGTAGAGTCCCTTGCAATTTTTGGAGATGTACACCATTTGGTTA
CTCTGGTGGTCATTGAGTTCGATTTTCAGAAAGAGAGCCCCCATGATCTC
GAGTGGGGACCCTGTGATACCAATTGTCTTGTGTCTTGTCGATATCAAGT
AGTTTTTGGGACAGTTCAATAATGATAAGATTTCTGGTCCTGCCGTGCAG
GTTTGGCAGCCAGAATCTGCTACCGCTTGCGTTGCACCCTGTTTTAGTGA
TGAGGGTGTTGTCTTTCCAAAACGTTCATGTGTTTGTCTTATAATGTCTA
CTTTAATATAAACATTTGGTGGCGGTTCGGGTCGTTGAGTACTAAAAGAT
TGATCTTTCCACTCCATGTGAGATTGGGTTTGTGTTATCTTCCCCCCATT
GTATAAGGGGCCAAACGAAAATCCCCTTGGAGGTTGGCTGATGCGATGGA
TGGGGGTTCTTCCATTTCCTCTTCGGTGACTGCATTGGAGCGAGAAGTGG
TGTTTGATCTCTTCTGGCAGACGGCTTGGAAGTGTCCTTTAATCCCACAA
TTGTTGCATGTTTTATTGAAGGCAGGGCAGTCCTTTCTTGCCATAGTTTT
ACCCTCGTGTTGTGTTCTGCCACACCCTTTACAGTTCTGGGTGCTTTTAC
TTGAGGGGCTGAATCCTTTTGAACGGCGGTAGGCGGATCTGTTTGCGGCA
CTGATGCTAGGCTGAGAGTCAGTGGCCCTCATGAGGTCGGTGGACTCTTC
GGTGGCTTCAAGGCATTGGAGACGTTCGACTTTCTGTTCAAGTGTTGGTA
GCAGCGGAGACTCTGATAGAATACGGGATTGGTGTTGTTGGTTCTTTAAC
CCTGAGATGAGTTGTTGTGTTATCATGTCATTGGAATAGTTTATTTCAAT
CTCAGGTTCGTGTGTCGTGCAGGTAACTTTGAACTGGCAAAGAACAGCTT
GGGATTTAAGGCGGGCAACGTACTGGGTAACTGTCTCGCCGTCCATCTGG
GTTAAACGGAAGAAGTTAATTCGGTGGACCTCTTTGTGGGTACCTTTGAC
TGCTACACGTTTGATGTGTTCGAGTAGGTTTGCTTCGGATGATGTGTCGA
GGGTATCAGACCCAATGTATTCGAATAAAAGTTTATTAACCTCCTGGGAG
CATGATGCACGAAGCTCCATACGTAAAATGTTGTGATCAGTGATACCTGT
CATTGCCTTGTAACGGTTCCAACTGTCTTTAAACAATTCCCATTCTCGTT
CGTCAGTATTTATGTTGATAATTGGGCGATCCGGGGCTTTGGTTTTTTGC
CTT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00002125-exon-sc0000018-1575043694:259300..261814 | TCONS_00002125-exon-sc0000018-1575043694:259300..261814 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002125-exon-sc0000018-1575043694:257112..259241 | TCONS_00002125-exon-sc0000018-1575043694:257112..259241 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002125-exon-sc0000018-1510915933:259300..261814 | TCONS_00002125-exon-sc0000018-1510915933:259300..261814 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002125-exon-sc0000018-1510915933:257112..259241 | TCONS_00002125-exon-sc0000018-1510915933:257112..259241 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002125-exon-sc0000018-1491911889:259300..261814 | TCONS_00002125-exon-sc0000018-1491911889:259300..261814 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002125-exon-sc0000018-1491911889:257112..259241 | TCONS_00002125-exon-sc0000018-1491911889:257112..259241 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000018 | supercontig | sc0000018:257112..261814 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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