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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00002339 ID=TCONS_00002339|Name=TCONS_00002339|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1708bp
ATTTGGTTCTGCATGGAAACTAGGGttagaaaaaactaacaaataaaaaa
acagaaCGGAAAACCGCCGACCAATAtaaagaaaacaacaacaacttcaT
CAAAATGAATTGTATTGGAATGACACTTAAGACTCTGGTTACTTTAATTC
TGGTCAATGTCAGCTTCAGTTTCTCCTTACTTTCAATGACAGctcgaaat
atgtttttgagtAATTCGAACGATAAAATGGACATAAAATTATTACCAGC
CTTGTTGAAATATTTACCAAAACCAACACTCGGTGAAGAAGATTATAAAA
TTTTAACATTCCAACTTGGTAATTCGTTTAAACCGGAATACATGTCTATT
GGTGATCCACGCCAAGCGATGGATGATGTTGGGCGGAATAACGAGGCGGA
TGACGCCCAAGAGGATGATATGCAGACACACCCTCAAATGAGTAACGAAC
TTAAAGAAATGACTCTAAAGAAAGTTTATTCTAAAATGCCAAAGTCGCAT
CGTAAGCGTGCCACATTGGGTAAACGTACATCACACCGTATGAAAAATTG
GTTATGGAATTTATCGAAATGTCCTGTATATTACACATGGATGGACCTTG
GTAAGAATATATTCCCAAGATATATAAAACGTGGTGAATGCTCTAAGAAA
AAGACATGTTCTTATCCAGCTGGCATGAAATGTCAACCTAAAAGCTGGCG
AGATGTTAATGTGTTAATATACGTCTGTCTAAAGGAAATTAACTCTGTAA
AACTCGGATGCAAATGGCGACAAATGACTTTGAATGTGCTAACCGAATGT
CAGTGTGGATGTAGTAAAAAGCAAAGATAGGTCTCCAGCGATGACACAAA
GACACGCTTTTTACCATGTGCGAATGCATTAAGAGGAAGTATGAAGGCGG
TGCTACACACAACCAATCGAAAGTCTTCGCGAGAATAAAGATCGATTTTA
CATACATCagtcaaaaagagaaaaaaatctgtCATGAATGGGAAAAGGAC
CTTTCAATGTAAAGTAGAAGGAGGAGGCGATTCTGTCAGATTTGTAAAAT
AGGTGTGACATTCTTTGGTAAATGGATTTGTATTGGGTTGGGAAACGGAT
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ATAAAAATGACTCCTGTGAAAGATGAACAACCTGGGCTGAAAATACGATC
GAAAAGGACCGCGAATCATATTGGTAGAAGAAATTCAAAGTATTCAAAAA
CAGTGacattttaaaaacgaaaaaaaactcTGAATACTACAACCGTACCG
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AAATTTATAGCAAGCTGACTGAGAGGGAAGACCTTTTGGCAGACCCTGTG
AGAATTTCAAATGGGCTCACTTTCTTACGACAAAACTTTCCTTGAAAAAT
GTATAGATAATTTATTATAAGACTCAAGAGCTTTGTACAATTTTATCCTA
CCCCCAAGAGCTatttatttaagaaatatttttatataccGTAAAGAGAA
CTTAATCAATATGTACAGTTTTTACTTTTAAACCATACATACGAATCTTG
TTTTCACTTCTTCACTGCTAGGcccccaagcggttttcgtgatgacgtga
tagggacttttttgcagcgttatttgtaatttttttcttcatgatTGCGT
TATCAGAG Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00002339-protein >TCONS_00002339-protein ID=TCONS_00002339-protein|Name=TCONS_00002339-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=241bp
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LKYLPKPTLGEEDYKILTFQLGNSFKPEYMSIGDPRQAMDDVGRNNEADD
AQEDDMQTHPQMSNELKEMTLKKVYSKMPKSHRKRATLGKRTSHRMKNWL
WNLSKCPVYYTWMDLGKNIFPRYIKRGECSKKKTCSYPAGMKCQPKSWRD
VNVLIYVCLKEINSVKLGCKWRQMTLNVLTECQCGCSKKQR Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000019:932193..951742- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00002339 ID=TCONS_00002339|Name=TCONS_00002339|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=19550bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019:932193..951742- (Clytia hemisphaerica)
ATTTGGTTCTGCATGGAAACTAGGTAAGATATAAATTCATTCATCAATTT
CTCAAATTTGGTATTATCTTATCAGCCCTTTATACGCCGGCCCTTATTGG
CGCTGTTTTTTTCTCGCTGGGTGAGGCTGCTAAAGAGCTGGCGTAAAGGG
GTCGGGATTAGATTATGGCCACCGTAAAAAGGGTCCAATAAGACAGCGTT
ATGTGCCAGCTGCTTCTTTCATTTTTTTTGAATGTTTTATTTGGGAATGT
AGTGAAGTTTCCATAACTCGAATGTCTCCTTAAATCGAATGGCTATTCTA
GTCTCTAATTCTTCGCACCCTTTTATTATACAAATTTCTGCAACTCAAAT
CATAATAGTAAAATTTTTAGTTGGAGCTAACAAGTTTTTCTGGTATTGCT
AGCTGACCACCGAAGGCGCCACGGTCGCTCTTTCTCAAAAAGCCAGTTAA
TAAAAATTTGATTGGCACGTTCCCGCGATAAATTTTGATTATGAAATTGT
AACTTTCATAACTGTTAAAAAGTATGGATCTTAATTTTTCGTAACCAGTA
GTTACGAGCAAGAAATTTTCAAAAATGTATTACAGTATCAAAAAAAGTTT
CTATATAATTCGCTAAATACAGATCTTAGATACGGGACACAGAATTCGAT
CACCTTTGTTTTTACATCACAACTGGTACATAAGGTCCAAATAACGTCTA
TCAAACATCCAATAAATGTTCAAAAAGCGTTGCGTGATTCAGTTTGGGTC
GAATAGTTCAATCTATAGAAGATAGGAAAGGAATTCTGCATTGTGGTGTA
GAATGTTGATTTCCATATAAGGAATAGGGATGATTGAAAAACGCTTCGTC
GTCGATTTTAAAAACCCTCTTCATCCCCTATTTGTAAGACATGTAACCAA
GTTTTTGACCCTCGTTCAAATTGATGATGTCTAAAACAGATAAAAGGTGA
TCGAAGAAAAGAAAATCACGATTAGTATTGATGACTACCTTGGTTTTGCT
TTGGATTTCGAGATATCGGGGCAGCATACATAGGCGGTTTTAGACCACGT
CGAACTTATCAGAGAAAGAGATTTGTGATTGTAATTTTATTGTCTTTTAA
CGAGCGTTGCACTGCTTCGTATGTTTCCGACATACTTGCTCTATTGTCTT
AAATCCGCCAGTGACATAGTTGGGAAATAGGTTTTACGAAAGCGAATCTG
TTTATTTCTGTAGGAAAACTTTTTGGATCGGCACACCGACGCAGAAGGAA
CCGGTATGTAAGATACACTCTTTTTTTATAAGCATACTTAGGCTCAAATT
CGATAAAATTTTCATGAATCAACCCAAAGAAAATCAATAATTCGTAGTTA
AAGCATATAAATAATCATAAATTGCTAAGCATACTGAGCCTCGACCGGAA
TTTCCCGTATGCTTATATAAAAAAGAGTGTATCCGTTTGTCTGCACTTTA
TTGTATTATATGTTTGTTTGTTTTCGCTGTAAAGTTAGATGAAATGGTAT
GGCGTCACTCGCTATTTTCAATTAAGGCGGAATAATATTTGGCTTTCCAC
CCGCTTTTCATTATAATTTATAATTTGGGCAGCCGGTGGTGTGGTTAATA
TAAATCATTTTGAGATTACCGTTGTTTTTTCTCAAGTGCATACTGTGTAA
TGAGATTAATGGCAACCATTAATACAATATTTTGTAGCGTTAATAGTATT
ACAGGTTATTTTTGATTAGGGCGTATGCAAAATCCACTTAAAATAATTTA
TTGAAATCTGTCGAAAGAAATTAATGTTCTGTAGACTGGTAGGATATCAG
CCTAGTAATCGCCGGCGAGAGACACTTTAGTAGATTCTTTTTAACCGACT
ACTTAGCCTGGGTATCCAGACTCAAAATTTCAGAAAAAAAACACTCTTAC
CTCAACATACAAAGTTTCTAAAATTTTAGAGTCTGGTGTAACTAAAAAAG
TTGGGTACAGTTTGTTTGATACTGCCTGTGAGTGAACCCTTGTTGACAGA
CTATCAAAACTTTGTAAACCCAGGCAGACACACATAATTAACTTACTATA
AAACCTCCTCTAAAAGCTCAAAAAACTTTCAAAACTACTTTAAGCTACAT
CAAAACATCAGCCACATTTATAAAGGCTCCTTTCCAGCGGCCATTTTGTT
TAGAAATGAACCTCCGTTTTCATTTTCATTTGTTTATCTTTTTTTGCAAG
GTCAGCTTTTTCCATAAATTATGCGCGCGCATCGAAAAATATCAAAAACC
CCGCGAAAATTCTGCCCAGTGACTTACCGCGTACTGACCAATTAGAGACA
CTCGCACATGCAGGGACAGATATCCCTGCAGACGAGTTAGTNCTCAGTGA
CTGGGCGCGTACTGACCAATTAGAGACACTCGCATATGCAGGGACAGATA
TCCCTGCAGACGAGTTACTTGGACCAGACCGTAAACCAGAGACAAGATAT
AAAAAACTAGACGGTGAAATAGTTTATGGTCTGGATATCCAGGCTAGACT
ACTTTGATTAAAATTTTTTATAAATTTATCTAATAGGTTCGAATCTAGGT
CGTTCCTACAGATCCTCAGGATGGATATTGGGAAAGATATAAAAGGTTAC
ATATCTGACAAAGTCCAATCTTTTTCAGTCAGGCTCTAAATTTGTCAAGT
TTTACTACCAGAGCTTAGTCCCCGTCGGCCGTCAAAATCAGTACCCCTTT
GGCTGTACTACTGTCATTGATTGATCACAAACGCGTGTTAGCGTTACCCA
CCCAATATCTATTACGTATTCTGAAGTGTAGGATAAGTAAAGAAAAGCCA
TACATTTTAATCCATTCCTGAGACTTTGAAAATAAATTGTTAACTAGACC
ATATCTATAATCTGTCTACATAAATTTATTTGTTAATAATATTGACCGAT
GGATGAGGTTGTTTTCGAGTCCATGCGAATAGACCATGCAAACAATTCAA
GTCAGACAAGTAGTGACTTACACGCTTTTTTTATAAGAACATCCAAAAAG
CCTTAGGACGTTCTTAACTTTTTCAGTTTTAAGCCTAAAAACATTCTTAA
CATGTTCTTATTTTCACCATTTTTGAGTATTTTTGTCAATTTTCCTAAGA
GATTCAGTGTTTTAGAGTCCACAAAGCCTTATAATGTTCTTAACATGTTC
TTAACATTTTGGCCATCGAAACCTTATATTCTTATATAGTTTGTTCTTAT
AAAAAACGTGTATTTTTATTGAATTGATATTGAGGGTCAAATGGATAGAT
GCAATAGTTAAGCTGCTAAACGCTGTCCAACATCTTTATCGTTGATAATG
TCTGATGTAATGGAGTAATCCTCGTGTGAAACCTAAAGCTCTGTCTCCAA
CTCTTTATCCTAGCTAACAAATTGGCTACTCGCATTCTGATTGGTTGATG
TAAATGATAGCTAGAATGCTTTTTAACACCCCTTTCTCACAGACCCACTG
GGAACCCTTCCCACTGGAAAAATTCTATTTGAACAGTGGCTTGATGGCAT
GGGCGTTGAAAGACATGGGATGCCAAAATCACTGATTGTCACACCCCTTT
CCTTTTTTTGACCCTAAAATTAGAAATTATTTTTAGGTCGAAGCTGAAGA
GAAGGCTTAATTATCCAAACAATTTCATAATCACTTCACTCGCATACTTT
TCTAAACAAACAAAATCGCAATTTTTTTCAACTTGCCGCTCAAGGTACTG
TTATGGTATTGTTTCCGAGACACACACACACACGTACACCAGTAGAAAAG
GTCTCCACCAAGCTTCTTCATTATAAGCGAGGTTCTTTCTACCTTGCTTA
TCTGTTGCTCTACGAAAAACGGGAAGAATATTTTTATAGAGAATACACCT
TTTCGACCGTAGTCGCGCAGTCAGGCGCATTGCTAAACTCGATCCAGTCC
TTTTTTTACACTTTTTTATCGTATTTAGGTGCGAAACAAAGACTGGGACG
GTTTTAGGGTGGTAAAACGGACAAAAAATGCATGTGCGGTAATTGGCGGC
TACGGTCGAAAAGGTGTATTAGTGAAAATGGTAGCGTAGGCTATGGGTAA
TCATCAAACAAAATAATTGCATCATTTAATAACACGTGTTTATACGTGCT
ATTAAAGTGGGCTAACAAATGCTTGAAATATCTCTAGAATTCGAAGAATG
AAAACTACAAAGGGATATTCGGTTAATATAATCATAATAGTCAAGAGAAA
TGAGGGTTAGATGTGAAAACCAAAACAATTTAGCGCAAGAGACAGATTAG
CAGAGGTTTTATAAGCGACAGGAAATTAAGGCATTGTGTCATACAGCATA
AAAATCTGTGTTAAAACTCCCCCCGTTTTTCATTGTGATTTTTGTCTTTG
TAAGAACAAAACAAAATTTAAGTTGTTGGAGGGTATACCCCGGCATACGT
ACCTGCCTAAAGCAAGACTTGCATACTATTTTCGAAGGGTAAGACTCTTT
TAGATGGTTATAGCATATATGAAAAGAAAAATGGAAACACATGCAATATA
TTAGCTTAGCTGTGTTTTTAGAGGTTTTTAAAGTATTCTTTGGCCAGAAG
TGAGTTCTTATGAAATAAAGATCTCAAGGAATGCATTAAAAACTGACCAA
TATTTTGAATTCGCTTGTTACTTCATGCTTAAAGATACGTCAAACAAGGC
GGTGATTCTACTCATTCAACATTTGACTATGGTCACTTTCCCTTTGCTGG
TTAGCTTTAAAAAATCGTTTAGAATGTGAAACCATGATCTATTTGATTTT
GAACGCATGGTAGTGAGCGATTTAATGTTGAAATATGGTGCGATATATAT
AATTTTATGGCAGGAGTATCCATAATTTTCTGAAGGATGGGTGTTAAAAT
TATTTGATTTACATATGGAAAAAAATGAGGATTTTTCAAACCGTAATAGT
AATTGCTGTCAAAAAGGTTTAAATTTCAAGGAGTGGATGATGTTTTTGCT
TTTTGGTTAAGTTTAAAATGATTGGTGCAAGGACAAAATCAATGCTCAAC
GTGGACGTTAACATTTGATGGAATGTATCAGAGTTGTACAAAAATCGGTC
TAATATCGACATCCCCATCTAATTCCGTCACCCTGTAAGTTGGAGTCAAA
GGAAAGTGAGAATAGTTGATTGAAAAATGATTTTTCCTCTATAAGCAAAG
AAATATAGCTCTAGTTTAGACGGCCCACTTTTTGCCCTGCCTATTCTAAT
TGTGGCTCATATATGCTACAACCATCAAACCAAAAACTCTAACAGTTAGA
ATAGGCAGGGCAGAAAGTCGGCCATCTAAACTAGAGCATAGTTTCAATCA
GCGATTCCGGTCTTCTTATTATTCCTATCTCCAAAGACTTAGATGTAGGG
TCTTGAATTAAGACTAATTTACGGTATACCAGCTGAGATGTTAGTGAGTA
AAAGGTACTCCTACACTGCGACTCGTATACTCACTTTTCCAGAAAAACCA
TGCTAGGCCTAGGTGGTGTACCATTCTAACCTATATTCATGATATGCACC
ATGCAATGTCTTCCACGGACCCGACAGCTGATTGGTTGAAAGTGACGTAT
TGGCTGATTTTACATCATTTACAACCAATCAGCTATTGGGTCCCTGATGT
AATGTCAGAAGACATTGCAATGGTACATATCATGAATAGATTTATTGACT
TAAAATGTTAGAAATACAACGAGCATGTTTTGTTTTGGGTAAGAAGACAA
GTTCAACCTGCTGAGTTTGTTGTTTTGAATTTCAGAGTTATTTTGAACAT
TTTAAACTGATCGGATCGGATCAGATTTGCGTTTTAGGATTTAAAAATTC
CATATTTAGTAAGTTTATAGGTCCATCTTAATTATTCTTTAGGTCAACTT
CATCGACTTTTGACGTTTTAAATATCATGAGATATTAAGGGAATCTGATT
TGATCTGCTCAACATTGCTGACTTCCATGGTGATGGAAGGATTTCAAATA
TTTTAGGATTGTTTAAATTTTTAGGAAAAACATTTCTTTTTTCCACCTTT
CATGGTCATTAATAAATTATTATCCATGTTAAAACGATAATAGTTTTTGA
GTCAGGATTTTCATAGATCCCTTCTTTATAGCAAAAAAAATATCGAGTTT
TTTCTCACGGTTATCAATGTCAAAGATAGTAGATCTGTTTTTTCGCCAAT
GACGGATTCAATCTGTTTAAATGTAGTTGACAAGTGGTCGAGGAAAGGAA
AAACATTGTTGAATCATACTTTTTTGAAAATTAGAAAAAATTGTCACATT
CTCTTATCATACACCCCTAACAGTACAAAATTAAGATTAACACAAAGCCT
AGCTACTATTCCAGTGGAAAACTGAGGATCTTGACTTCCAAAGAATTTTA
GAGATACACCCAGGATTTCTACAGTCATTGGGGGTGAAAAACGGACTAAA
TCACGACGAGGACTGGCGATTGAAATTCTTTTGTTTTTGTCAAAAAATTC
TGTGGGGATAGGGGAAATAGCATAACATTTTGCAGTGAGGATTGGTTTAT
TTGATTATATTCAGTGGGGAAAAAAATAGGAAGGTAATTTTCCACCGGGG
ACAATATTTTGGCCAATTCTTCCAGTGGGAAGGGCCACAGTGGGTCTGTG
AGAAGGGGATGTACCGAATAAGAAACTTCTTTTTCAATTATTTCCAAAAT
ATTCTCTAAAACAAAAAAAAGAACCCATATTTTAAGACCGACGAAGACCG
AGCACTATTAAAGCCCAAACACTTGAACGTCACACCCCTGTGCATGCTCT
CCTTTCTCAAAATGAACCGGAATACAAAATCGGCTGAATTTATGACATCA
TAGATATTATAGAAGATAGTATGGGGGTGCGTCATAAGTCACTTATCATG
CACGTCCATCCCTTGCAAAACAATTTTCATTGAATTGAAATGTTTTCAAT
GTTTTCAGTTTTAAAACATGATATGCAACAGAATAGATTATCATACCAGT
GTGAATTCGAAATGAGATGTTCGAGTCAAAATGAAAGGAATGTTTTCAAG
GGGTCATTGGTAGGAAATACGTATAAAGATACGATTTCGGATTTAAATTC
AAAGTAACCTGACTGTTCAAAGGTATGTTGAAGCTCTCTAATTCGATTTT
CAAGGGGAATTGGATTTTCATCGAATAAAGAAGCGTATCGAATTGTAGAT
CGTCGTTTACGAACGTCAAGTTAGAGAGCGTCATTTGTAATTTGAGTCTT
TATTCAAAGTAGCCTGGTCTTTTTAGCATGTTAGTCTTTAAAGGGTAAGT
TATTAGAAGTTTGAGAATGGCTATGGTACTTACAGAACCATTCTAAAACG
CAGATTGATCCATAAATTTAATTTGAGGAGATTATGGAGGGTAGATCGAT
TTTGTTTTTGGGTCAAGTTGAACATTTACAAGAATTTTTGTCATTGGATT
GGTCGTTAACTATTCAAACAAAAACTTTTATTATATTTTTCTAAAGAACG
CGTCATCTCTATTGTTTTGAATAACCAATTATGTGAGCATCTTGTAAAAA
CTTCAATACAACTGTTTGGAAGCAACGTTAGAGTCGGTATGCCGATGCAT
TTGAATTTTTTATGCATAAATTACCTTGACCAAATATCTGAAACATGCTA
CACTGATTCTCTAAGAAATTTACCATAAATATACTAACTACACTCGAAGG
TAAGCATCATGATTTTTTAAATAGAACTTAAAAGTCATGACTTAGCTTTT
GAATGATGCGTAAAGCAACGATCTACGTAAAACATCTATTTTTTATTTCC
TTTTTTACTTGATAAGTAATCCTTTGGCAGCTATCGCTTACTTGTTTGCT
TGTCAATAATTATAAATGGTGCCATTTGCTAATAGTCGCATGTGCATATG
GGAGAAGACTAACATTAGACTTTAAGTTGGTCAAATGGTTTTTTTGACAA
ATTTGAAATAACGGTGTACTGTACAACAATTCTGGGATGATTTTGTGATT
AGTACAGCAATGCCCTCGCAGATTCTGTTAAGTTTGTTTGCGACTGCAGC
CGGAAGCGACATGAAAGCTTCTCTTTTCAATAGCTAATTTACAGAAGGCT
GTAAAGGTGCAAAATTCAGCGTATATCGGGCCGAAATAACCAAAAAGACA
GATATGCAGTGTTACAATGGATTAAAAGGTGGAGAAAATTTGGTGTCAAG
TTTATTTATAGTACTTAATGATATCCTAATTATTTGAGGGGCATCTAATC
CCTTTGAAAACGTTTAGCGCATATCATATCCTGTCTCCTGATAAAGAACT
AACTTCTCTTTCGTACAGACTGAGGAGATAAAGATATGATGGATTTCAGG
CTAGACGGAAGCAAAGGTGATTAGCCTGAGCGAACGTGTCTACTTTAAAC
GAAATGGCGTGGATAAACATAAACTAAATACTTAGCCTTTCACAAGTTAA
GATTTTTCAAAATGTGAAAATACGCTGGTAGCGGGATAATATAGCGGCTA
ACCATTGCTATACAGAAAAAGTACAGACAGTTAAAAATGTGAGTTGGCTA
TAGATTATATATGCGACATTCAAAGTAGTTTGATGATGGATGAGCTAAGC
AGTCTCAGTTAAATCATGCCTTTTCTTTATAAGAATTTATGAGGTTTTGC
AATTAACGTTGATCTACGCTAATTAATTATAAAGATTCACATAATAAACT
AATTCTAACTTCTTGAAGCAAGCTTCAAATTCATATCGATTTTATTACAC
TAAAAAGTTCTTTAGTTTTCACTTATACTTTTAATCCGCACCTTTAGAAA
CATGACGGAATTTCTTACGTTTAATAGGTATTATTACTTGTGATGAAATT
TTGCCAAGTTATTTCACATTTCTGACTGCAACATAATTCTTTAATTTGTC
TAGCTTGAAAATCGTCACGCGTCGTTCTGTCTGTCTGCGAAGAATAAAGA
CCACAGGCCGAGCCAAGGGTAAACCACTCACAAAAAGTTATACATGAATT
TTGTTTTTGAGTGATTTACCGTTCGGCAAAGTCAGGATACGCTGAGAAGA
TGGTCGTTTTGAGATTTACTTTAACAGGATGAAATTCGAGGAAATTTTCT
AAGTTTTCTGGATTTAATATCGTGGTAATGATCTTTTAAATTTACTTTTT
CAACCGCAATTTCAACCGTTTTCAAGAGACATGGACCTCACCCTAAGTTA
GAATGTAATGCAAATATTTCAGGGACTGGCAAATCTTAGTTTCTAGCATA
TTTTTAGATGATGCATTTCTGCTGCATTTTAATTTACAATTTTGTGATTA
AAAGAGATCGAAATAATATTGTTTAGGTCTGGTTTTGGCAAGGTATAATA
TCATTAGGAAGTCAAGGCCATTTCCTGTGTCTCGTGGACACAAGCCTCAT
TTTAAACTTATTATCAATTTGAACATTCCAATCCATACCTAATGAATTCA
AAATTGGTTTGTGGGTTTATTGAGCCTAGTTATCAAGTCATGACTATAAC
GAGCTTAAATTGTTTTTAATTTGTAATAAGGTCTCAAACGAAAACATGTA
TGAATAATGAGGGATTTGGGGTTAAACAATCTTGTTACCTTATTTAAAAA
AATGCTTTCATTTTCTGTATGATGTAATACCATTGTAGGGAGGAATTTCA
TAAATTTAAAAACAACAATTTGAACTGTAATGGAAAATATGATTGAATGA
TGAACTTAACGAGCTTAAGAGGAATTTTTGTTTACGTATATCATAACAAG
CTTTGGGGAGGGAGGGAGGGGTTGCTTGTGCCTATAAGTTGAGTCTCCTA
TATATATAGGTTCTGAAGCCACTTATTCCCTACATAAGTTACGCGGCCCG
AGTGTGTTGTTTTCATTCGTAAAAGCAATATTTTGAAGTAACATTTACCG
CCAGAATTTGAAAAAATGTAAAAGCGCGGTTCTCAGTAATCCCAACCTAA
CCATCACGCAACGTTACTAGAAAGAGAAAGTGCAGAAAACCAAAAACTAT
TTTTTGCAAGACTTTAATACTTGCGCAAAGCATGTAAGCATTGATGGTAT
TTTAATCAGTCATTTAAAACAAATTCCTAGAATATTTATCATACTTTTGG
CATTAGTTGTTGGCGTTAATTCAATTACAACTAGCAAGTCTTCCAGTCTT
TTGCAACAAATTTTTTTATTGAAAAAACTACCGACTAGAATACCATCTTT
ATTGTACGGAAAACTCTTTTGGTGGGTTAGGTGGGATTGGGGGATGGTCA
GGGGATGGGCAAGAACTTTGGGAAAGAGGAATACCTAAGCAGATTTACGA
TGCGATCTTCAGGGTCTTAAAAATCATAAAGTATGAAACAAAATCTTAAA
CAAAATTTTTGATCGGAGTTTTTTGAAAGTGGTCACCTCTCGGGTCCCCT
TTGTTGGTGAAAAAAAATTATTTAAACAATAAATTTCATTGAATTATCTC
ATTATAAATTTACCCACGTCGATTAGTGTTACCATTATGGTACCCCGGAT
GGCAGATAAATCTTGGTGTCCAGGGTATATAAACGTCAGTGGTTTTTCAC
CGTCTACTTATCATGAAAATTATTCTAAAACACCCGATATCTTAGGAAAA
TGGACAAAAATACTCAGCAAATGTTGAAAATAAGAACATGTTAAGAACAA
TTTTAGGCTTAAAACTCAAAATATTAAGAACATCCGAAAGCTTCAAAAAA
TTTTACATGTTCTTATAAGAAGCGTGTAACTTTTGAAAGATTCAAAAATG
AGATGAAATACATCTCTACCTCTGCCTCGATCGAATCAGAATATGAGAAG
GAAATAGAAATGTTGGTTTATCGCTTTATCGTGAGATTGTTTATTGATTT
TTAGTTCCACTTGTTTTTGAAAAATACATTCAAGGGGAAAACCCTCAAGT
CTGTTTGCACTTTGCGGTTTTCAAGTCTACAAAATATCAGGAACAACAAG
AAATATTCTAAGTGAGATTGACAAGATGATTGTTCGCTTGTATCCATCTA
TCTAACTTTTCAAAGTATAATGATGTCTATGAATATACTTTAATCTGGTT
AATTTTTGCGAAATTTGACTTCGCGTTTTCGCGAATATTTGACTTCACGT
GAGATCCCTGGCTCGCGAAATTTCAAGATCAGAGTTTCACCTTAAAATTG
TTAGTAAATTTGCTATTTATGAAAAAAAATTACAATTTCAACTCCATTTT
CAATTCATTTTTGACTGATTCGCGAAATTAAATCCTCACGAAATTAAATC
TAGCGAAATATTCGCGAAAATAGCACCAGAAAATTTTCCAGTTTCTTATT
TGTGGAGAACGCTTATACCTACTGACCCAGCTAGCACACAACGTTGTTTC
AACGTTCAACTAACGTTATTTGGACGTTGTGAATATTAGATGAACATTGA
AACAACGTTGTGTGTCAGCTGGGGAGAGCCGATTTTCTACAAATTTTTCC
AATGTCTGTGTAATGCTGTGATTAAGCTGGGAAGTTCAGACCACTCAACA
TTTTTTTAAGTATCAACTTTCAAAGAAATACTATGATTGACTATGACGTG
TCTTTTATATGCAGTTTTTCTGTGACAGAGACAGTTAGTTTTGATTTGTC
TAGTTCCTGATTGACTGAAGACGACGGCTAATCAGAACGCGCCGCTTGAC
CCGTCTTCGATTTTGCAGGTAAAAATTGCGGGTCAAATAATTTCAGTCAC
TCCGCTGTTCTCAAAAGGATAGGGATGTATAAACCCGCTAGTTACAACGT
TGAGGTGAAATTCTAACCCACTAAAAATATGTGAGACCGACTAAATTTTT
GAAAATGGAATGACTTCATTTTGAATAATTTTTGCGTTTAAAAGGTTAAA
GAAATTCTAAAGAAAATCATAAAACTTTTTTTAAGCCCATGTAAACTTTA
AGACACTAGTTTCAGCTGATATTTGTTTTCGTGACCTTTTAAAATTCATG
AAAATGTATTTTTATCATCTACGTATTTTCATTCGCATAAAGCTGTCAAA
AATTCTTGAGTACATCGATATGTATGAATAAAATGTTGTACGAGATGAGA
AATACAGATCGATGGTGACAAATAATACACTACAAGAAGGGAACCTTACT
TTGAAACATCTTAAGGTATGACTTTTTTGATTTCCCATAAAACATCCCTG
TGTCACAGACCCAGCCCAACTGGAAAATTTGGCTAAAAATTCGTCCCAGT
GGGAAAATACCTTGGAATTTCAGCTCCACTGCGAAATTGACTTTGATTTC
ATCCCTAATCGAAATTCAAAGTTTAAAAATTGCACTCCAAAACCATCCCT
GCGGGATTTTTCAACATTGGAACAATAGAATTTCTATCCCCATTGGGATT
TCAAAAGGAATCTTTATCCCCACTGAGAAAAAAAGTTTCACCGGGGCTGT
GATACAGGGTGTCATAAAGTTATCAAAATAAAAGTAAATTCAAATATATA
AGTAACTTCAGTTGATGCTCTTCTAATTCGATTTTCAAAGGGCATTGCAA
TTTCATCGAATTAGAGAGCGTATGGAAAATCCTAGAACATTAAATTAGGG
GGGTGTCAATTGTAGCTATTTTAAGAAATGCGGCAACTGTTCAGTTTTCA
GATATCAGAGTCTTATTCCAAGATCTAGCGCAGTATTTGACATTTTCAGA
ATTCCTGGCTGTCTTTACAATAATCTTGCACAGTGCGGCAAAATTCAACT
TTATCTTTACAAAGATGCTCAAAAAATCACTCGCGTGGCTCTAAGTCAAC
TAAAAAATTAAACCGATCAATCAAAAAAAACATTCTTTTGAAAAAAGTTC
AATCTGACACTTTCTAAAATGTAAGGTTTTAGAAAAATTGAATTCGATCA
CTCAATCAACCCCCTTCAATATCTAATCCGTAGTGGCTACATAAATAAAC
GCAACAAACAGAACCTTCAACGTCAAAACATGCTGGCTCCAAAATATGAT
TCTTATTTGCTCTAAACACCGTTCAGTCTTTCGTCAGTCAGTCAAACAGC
TATCTTTAAGTATAATGTTTCATTTTTTCTTGCTTAAAATATTAAGACAT
AGAGGTTTTATGAAGAGATTTATTCATCGATCAAAGATGTTCAGATATGT
TCTTCATGTGGCATTCTGGTTGATACGTCGTTGTGCTCAGAACGCGATGG
TATTGTTGAGTCTATACTCGAACTCGCAGGGGGTACCCAAATTTGTTTGA
GTTCAGGAAATTTCAAGACATGGAGTAACGGTCATAAGGCATTCTCAACT
GAAGGGACGAGAAAACTTGTTCGAGTTATAGAGGTACTACGGTACCTACT
ATACGTTATATAATTTTTTTGATGATTTTCAAAATGCATAATTTGCGCAT
GTGGAGTTAAAGCATTATGCTCCAAGGGCTATGCAAGATTATAGTCTAAG
AATGTTGGTTCTCAGAAAAATTTGCAGTTTGCTATCGTCTGACAAATTTT
TAAGAACAAATTATATAAGAACATTAGGCTTCGATGGCCAAAATATTAAG
AACAAGTTAAGAACATTTTGAGGCTTTGAGAAATTTAAAAAACCTAAACT
GTACAAAAATACTTACAAAATGATGAAAATAAGAACATTTAAAGAACACT
TTTAGGGTTGAGACTAATACTTGATGGCTATAGTGCATGTTTAAAATATC
TATCAGAATCTTGTTTATATTTTTAACTCCTGAGCAGGATGCTCTTAAAA
GTCGGTAGCTTTGTAGGAAGATTTAAAGGGAACGTTCGTTACATTCTAAA
TTCTTGTTTTGAACAGCAGAGGGATAGNTAGCTTTGTAGGGAGATTTAAA
GGGAACGTTCGTTACATTCTAAATCCTTGTTTTGAACAGCAGAAGGATAA
AGAAAGAGAAGGATAGATGGAGACAAAACATAGGTTGTTTATTTGCATGT
CAAGGTTTGAGTCTTGTTGAAACTCTATTTCCTAATCCCGTTAAACGCGA
GCCATAGATAGTGTTATCAGGAGTAAAGATATTATTTAAACCCTGTTGAC
TGTCTATACAGTCAAATAGCCGGCCTTGTAGACCATAGAACTTTATTTCC
GCCCCGTATAGAGGCGAGATATTTCATTTGTCTCCGTTTGTCTAACAAGA
TTGGAAAATTCGTGCTGTCTTAACTACAAAATAGTTTTCAGGCATAACAT
AAACGGGTTTCTTTGTATTTTGATTAACGAAAAGGACCTAAATACAGGGC
CTGATACCTTTTTGTGAACAATGGACTGATTTTCTTTAAAGATTATCGTC
GGCAATTAAAAGCTTATGATATTGATAGTTTCGTTTATAAAAGGGTAGAT
TCATTCGCTTTGTGGTTTAATGGGTCAAGGAACTGGCAACGTTAGGACAT
CTTAAAGAAATAGGAAGTTCACGACATGAAGCATTTCTTTCTTATCACAA
TTGCGGCTGTGATGGTCAGCCGGTGGTACACAGCGGCGCTCATACATCCA
TAGAGAGTTTATGTATTTCTACTTTTGAGGACGGTAGAGTGACTGAAGCG
ATTTAGAATAGTCTGCAGTTTTATGACCCACAATATTGAGGATCGCAAAA
TTTCTGATTTACTGTCGGCCTAAATCAATCAATCAGGATCTGGACAAATC
AGAAGCTGACCGTCTCTGAAGAACAAAACACAGTTCATAAACTCGCTAAA
TGTTAAACGAAGGTTGCGTGAATTCTTTTGCAGTTGCAGAGGGTGGCTAG
TTATAAATTATGGACACTTGACTTGACGACGTGGTCTCCGAGATAAAAAA
GATCATTTTCTTGGAGGATACAAGTTTATATATGGTGTGAATGTGGACCG
AAATCATCCAGAGAGATAAGAATAAATCCGTTTTTTCTTACGTTTCTTTA
AATAAATCAATGTTTGTTATTTGTGAGCTCAGTTCTTATTGTTGTTCAGC
ATAACATTGCCAACGGCTACAAAACGTTTTTCAACATCTTTCGTACGTTC
ATAACATTCTTAAAACGTCAGATGAACGTTGAAACAACGTTATGTGCCGG
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ATTTGTTCGAATTATAGAGGGATTCAAATTATAGAAAGGATATTAAGAGA
GTTTCTCCTTGACGGGAACTGAGAATAAGTTCGAATTATAGAAAGATTCC
AATAATGGAAGTTTGAATAAGTGAGAGCCGACGTTAGGGTAATTGATACA
AGTAAGCATTTGCAAAATAACTTAAGACTCAACTATATTTGTAAATGATA
AAGCTGGGTAAAATCTTCCTTAGGGAGCCCTGTAGACAGGTTACATGGTA
TTTCTATCTGTGAGAAAATAAGGAAGGTGTCTTATCAGATATCTGGAGAC
GACTACAAAAAAGACCACAAATTCGATTTATAGACAATTTTGAACGTAAA
AGAATCTTTGATGGAGAGTGTTGGTTTCCGTATAAGGAATATGAGAGACA
GCAATTTACCCTCCATTGCAGATGCGATGGACGATAGTGCAACGTCTACA
TAGACTGTCCCTAAAAAATGACCAGTGATATTCTAGCGCTAAACGTGATA
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CGTTACAATTGAATTCCTAACGGAAAATTAACGCTCTTTCCAATACGTCA
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CTTTATAAAGAGGAGGAAAAATATGTCGATGAATTATTCTCTTTCTCTTC
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TAATAATTGATTACTAAAATTCCATGTTTACTCATTGATGTTTACCTACA
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GTCAGCTTCAGTTTCTCCTTACTTTCAATGACAGCTCGAAATATGTTTTT
GAGTAATTCGAACGATAAAATGGACATAAAATTATTACCAGCCTTGTTGA
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GTAAAGTAGAAGGAGGAGGCGATTCTGTCAGATTTGTAAAATAGGTGTGA
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TTATTCGTTATTCACAACATAGTAGATACAATACTCATATCCATAAAAAT
GACTCCTGTGAAAGATGAACAACCTGGGCTGAAAATACGATCGAAAAGGA
CCGCGAATCATATTGGTAGAAGAAATTCAAAGTATTCAAAAACAGTGACA
TTTTAAAAACGAAAAAAAACTCTGAATACTACAACCGTACCGTATAAATT
ACAAGAAAAACGAGTAGGGTGAACGCCTAGAAGCTATTACGTAAATTTAT
AGCAAGCTGACTGAGAGGGAAGACCTTTTGGCAGACCCTGTGAGAATTTC
AAATGGGCTCACTTTCTTACGACAAAACTTTCCTTGAAAAATGTATAGAT
AATTTATTATAAGACTCAAGAGCTTTGTACAATTTTATCCTACCCCCAAG
AGCTATTTATTTAAGAAATATTTTTATATACCGTAAAGAGAACTTAATCA
ATATGTACAGTTTTTACTTTTAAACCATACATACGAATCTTGTTTTCACT
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TTTTTGCAGCGTTATTTGTAATTTTTTTCTTCATGATTGCGTTATCAGAG
Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000019:932193..951742- >TCONS_00002339 ID=TCONS_00002339|Name=TCONS_00002339|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=726bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019:932193..951742- (Clytia hemisphaerica)
ATGAATTGTATTGGAATGACACTTAAGACTCTGGTTACTTTAATTCTGGT
CAATGTCAGCTTCAGTTTCTCCTTACTTTCAATGACAGCTCGAAATATGT
TTTTGAGTAATTCGAACGATAAAATGGACATAAAATTATTACCAGCCTTG
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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|---|
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Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000019 | supercontig | sc0000019:932193..951742 - |
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
| Term | Definition |
|---|
| IPR029034 | Cystine-knot_cytokine |
Blast
BLAST of TCONS_00002339 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: NOGG (Noggin OS=Homo sapiens GN=NOG PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 89.7373 bits (221), Expect = 7.806e-20 Identity = 50/176 (28.41%), Postives = 83/176 (47.16%), Query Frame = 3
Query: 300 ILTFQLGNSFKPEYMSIGDP--RQAMDDVGRNNEADDAQEDDM---QTHPQMSNELKEMTLKKVYSKMPKSHRKRATLGKRTSHRMKNWLWNLSKCPVYYTWMDLGKNIFPRYIKRGECSKKKTCSYPAGMKCQPKSWRDVNVLIYVCLKEINSVKLGCKWRQMTLNVLTECQCGC 812
+L LG + P +M+ P R D A+ D + + M +E+K + + ++ K+ L K+ +++ WLW+ + CPV Y W DLG +PRY+K G C K++CS P GM C+P + VL + C + C W + +++EC+C C
Sbjct: 65 LLRSLLGGHYDPGFMATSPPEDRPGGGGGAAGGAEDLAELDQLLRQRPSGAMPSEIKGLEFSEGLAQG-----KKQRLSKKLRRKLQMWLWSQTFCPVLYAWNDLGSRFWPRYVKVGSCFSKRSCSVPEGMVCKPSKSVHLTVLRWRCQRRGGQR---CGWIPIQYPIISECKCSC 232
The following BLAST results are available for this feature:
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