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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00002353 ID=TCONS_00002353|Name=TCONS_00002353|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4277bp
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TTCAAGAACAACCAGCAAGATGGCTTCACCAGTTAAAACCAACAAATTGT
TTATACGAAGTCTTCCTGACGAGCCCAACCTCAAGATCAATTTCAAGTAT
AATAATCAATGTATGGAGTTCAATCGACAAAAAACTGATACTgtcaacaa
aacaattcaaagaatcTCACTTAAACTCAGCGGAGGAGgaaagaaaaaga
agaaaaacaagaagaatGTAGCATCAATGGAATCCAAGGATCGATCATCA
GGAAACATTGACATCAAACTCCTTGATAACTCTGGTAACGTTTTGAACCT
TGAAACCACCTCAAACGAAAACGCTTTCGTCAAATCTAACCAGTTCCAAA
TAACCAATGATACAATTTTGACTGTCTATAACATGGTTTTCAACGCACCC
AATGTCATCGATATTAAACCTTTGAACACGGTAATGGCCGGTTTTCCTGT
TTTCCCAGAGCTGACATTTGAGTTTGGACAATCTGAATTTTCACAATTTC
AATGGTATAAAAAGTTGCCAGATAGCACTGATTGGATTCTTGCAGGAGAG
AATTTGATATTCACGCCAAGTGTTGAAGATATTGGATTTGAGTTGAAATT
GTCTTGCCAGTCTGGTAACGAAGACGAGATTCGTGAGGATTTCCAAGAAT
TTGTATTTACAGAACCGATATCTGCCGGCCCTGGTCAGTGTTTATTTGAT
AAGAGGCATATGTATACACGCAAAAAGCACGATTTGAAAAGCAATGAGCT
ACGTGTCGTATGTTACAACGTACTAGCAGACATATTTGCAACNCACGCAA
AAAGCACGACTTGAAAAGCAATGAGCTACGTGTCGTATGTTACAACGTAC
TAGCAGACATATTTGCAACGTCTGATTATGCACGTAATACGTTATTTCCT
TACGCCCCGGAGTACGTTTTATCGTTGAGTTACCGTAAATTGTTATTGAT
CAAAGAGTTGTTAGGCTATAATGCTGATTTGATATCTCTACAAGAATGTG
GAATGAAACTTTTCAATTCTTATTTGAACCCAGTCATGAATCTAAACGGT
TACCAAGGGCTTTATTTTGGAAAACTTGGAACAATGCCGGAAGGCGAAGC
ATTATTCTATCGAACAGATCGATATCGACATATCAAAGAATTATCGATTC
CTATCCGTGAGGTGTTATACTTAGAATGTAATATAGAAATTCTTTCGGCT
CTTTCAGAGGTTCCTGAACTTTTAGAGAAATTCCACAAGAAGACTGCTGT
TGGTCAAATACATATTCTTGAAGAGATCGAAACTAAAAGACAGCTCTGTA
TCTTCAATACTCACCTCTATTATAAACGGTACTACCAGCATATAAGAGTC
ATGCAAATTGCTGTGTTAATGAACTACTTATCCACGAAAATTGATGCTTC
AAAAATGTCTGTTATTGTTAATGGAGATTTGAACAGTCTTCGCAATGATG
ATTTGTTACCGTATTTGAGTGGCACTGAAATTGACAGTCACTCTCCTTTA
TGGCACCCTATTAGAGAGACAAACCCTGATTTTACTCTCTCCTTAAAATC
ACCCATCCTGCTTCAAAACGCAAGTGGTTGTCCACCGTACACCTCCTTCG
TGCCCCATTGTATGGAGACTTTAGATTACATATTTTGTGATTCAGATTTT
GAAGTGACTGCCTTATTACCAATGCCGGAGCCTGAAGAATTTGAACCATA
CGTCGGATTGCCGTGTATTGGGTCACCATCGGATCATTTGGCATTGGTGT
TGGATTTGAAATGGAATAAGAAGAAAAACTGacAAACACAGAAgatttaa
aacaaagaaaagataacagTTTCTGGTCAACATTGGTTCACCGTTCCAAA
TATAaaggaaattttaagaaaaacatctCATCGCTTATTCGCATTTGTAA
TTCCGGATTCTCGAAAGTAAAACAACTTAAGGATTTACAGAGGAAAAACA
TCAGATTTTAAGATCAGTCTAATGAAATACAAATTGCGACTGTGAATTTT
ATGGAAAGCACATAATGTGGAATTCAACAGCTTTGGAATCCATCTTACCC
TCACCGTCGTCGTCATTCATAGAGACCAACACAATACTACCGTCATCGGC
TTCAGTATATTTTGATCAATATGCATCCAGCGAACCGACACCCGTATCGT
CGCATACATCCAGTGAAACAAGAACGCTTCAATCATTAATGTCGGATCGT
AGTTATTTAACTACAAAAACATTTAGCGCATTAACGTCTACAATAACTCC
CTGCAGCGCTTCCATTTTAGCTGACTCAGCATCGTCATCGATATTCAGTA
ACTGCACTACATACCATAATGAcagtttcaaaaacaaaacaaccgCTTCA
CCTCCGATGAGTAATGATGTAACTGGGCCTTTAAATTCGGAAGAGATTGC
TTTACTTTTTGCTTTCACTTTCATATTGATCATCGGTACCCTTGGTAACG
GATATATTTACTATTATTTTGGAATTCGTAAAAAATCTAAACGTACCATT
CCGGAAATGTTGTTTTCCTATTTAGCCATCACCGATTTCACGGCTTCCGT
TCTCAATCCGATATTGTATATCAATTTCACGGTGAACCGTAATAAATGGC
TTTACGGTGAATTCCTGTGTAAAACAAGCTTAACCCTGGGAGCGGCTGTA
ACGACGATTTCCGGTGGTATATTCATCATTATTGCATTCGATCGTGAGAG
ATGTATCGTGTTTCCGTTCAAAAGTCATTTCAAACCGCGAACAATCAAGA
TTTGTGTGTTTTGTTCTATATTGTACGCCATGTTCATGAATTTCCATTAT
GCCTTGCATTTGACCGTTGTGCCGGGTCAACAACGTTGTACTGTTGAAAA
CGTAACCAATATATCTTACTGGCTTCCGACCATCATTTGTTTTGTGATTC
AAGATTTAACGCTTATTTTTGTATTCGCCTTCACCAATATGCGTATCTTT
GATCACATCAAGGCTAAGGACACTTCTCTAGCTTTAGGTGCATTCCTCGG
CAAACGAAAGAAAGACAGTGCGAAAATTATCCGATTGTTGGTGGTGTTAG
CAACTGTGTTTTTCGTGTTAACTCTACCGAGAGATTTATTTATAAGCGCG
CATATGATGTCTTGGGTGTTCAGCCCACCTGGAATTAAAGTGACCCCTAC
CGTCAATAGTGCGTATTATTTCATCAAAGTGTTACACATTGCGAACTCaa
gtgtcaatattttcatttattatCATATGCATCGAGGCTTCCGACGACAT
ATGAACCATCATTTATTGTGTTGTATATTTGGGCCACCACAGAAATTGAA
AACTCATTTCTTAGACACTATCACTCGGTCAACTGAAGGATCACCTAACC
TGATACAGAAACTGTCTCCGCTTTCAATACGGTCATCTTCACGCAGCCCG
CACATCAAGCGCAGCAGAAACGCAGCTGTTAATGAACGCATGATTGACGA
GTCAAATATAGGACGTAAAAGGAACGCTCGGGATATAGCAAGCCCGAAAT
CTGAAATGAAACAACTTCTAAACATTCCAGATAATGGTTTCTTCTCTGCA
TCTAGTGATTCTGACATTAGTATTTAAGTATTAAGATTCCTCCGACAGTT
AGGAATCATTCTGATTTTGTGCTAATCTTAAAGCTTGGAATaccgatgct
atcgtccgtatgatatattattatcatataacatagtttgtatattataa
aacgtaatatgttgcgcggcggaaaatagagtctgtgtttacgacATTGA
GCCCCCTCCGCGGATAAAATTACCGCCGAGCTTTTTATTTCCCGCAAGCA
TAGTCTAAGCTTGGAACTGCCATAAGGCCTTTAGCACCCGTTGAACATTA
TCATATACACCCGGTcgtattttttcaaaaggtaTACCAAAATTGGAGTG
CCGAAAAGGTGAATTGGATCAAAATTCTTTCAGAGACCTAACTCAtatgg
aaactttttgactcATAAATGAATTACTCTATCCAGACGGCAAATCATAT
GTTGCCTTGTTTTTTGCTGTCTCAGAAATCGAACCGATAGAACTCTTATC
ATCATTTAACGTGTAAAATTCATTTTACGAATTACCTACTGTTAAAAAAC
AACGTCAACAGTttgtataatatatattttgtcTCTTTAGTTTGTGCACA
ATTTTTCATATCAAATAacaattgaactattttaaagatatttattttca
gaatacGTTTTAAATGTCAAGCAATTG Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00002353-protein >TCONS_00002353-protein ID=TCONS_00002353-protein|Name=TCONS_00002353-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=520bp
MWNSTALESILPSPSSSFIETNTILPSSASVYFDQYASSEPTPVSSHTSS
ETRTLQSLMSDRSYLTTKTFSALTSTITPCSASILADSASSSIFSNCTTY
HNDSFKNKTTASPPMSNDVTGPLNSEEIALLFAFTFILIIGTLGNGYIYY
YFGIRKKSKRTIPEMLFSYLAITDFTASVLNPILYINFTVNRNKWLYGEF
LCKTSLTLGAAVTTISGGIFIIIAFDRERCIVFPFKSHFKPRTIKICVFC
SILYAMFMNFHYALHLTVVPGQQRCTVENVTNISYWLPTIICFVIQDLTL
IFVFAFTNMRIFDHIKAKDTSLALGAFLGKRKKDSAKIIRLLVVLATVFF
VLTLPRDLFISAHMMSWVFSPPGIKVTPTVNSAYYFIKVLHIANSSVNIF
IYYHMHRGFRRHMNHHLLCCIFGPPQKLKTHFLDTITRSTEGSPNLIQKL
SPLSIRSSSRSPHIKRSRNAAVNERMIDESNIGRKRNARDIASPKSEMKQ
LLNIPDNGFFSASSDSDISI Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000019:1076222..1095548- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00002353 ID=TCONS_00002353|Name=TCONS_00002353|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=19327bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019:1076222..1095548- (Clytia hemisphaerica)
TTTTGGCAACCACTGGAAACTTCACTCTCCCCCGTAAAAAATGGTAGGTA
AACATTCAGTTCTCATAAGAAAACCCAGCAGAGAAATGGTAGGTAAAGAA
CTCCTTTCAATCATAACTTCTTTTCCTCTAGACGAATTTTTGTGAAATTT
TCAGGAGAGATACATAAAATTGTCATTAATATCATGTTCAAACATCTAAA
AAAAAATGGCAATGTTTACATTTCTCTAACCTTCCACAGTACTAAAGTGA
GCATTTTTACCTACCGCCTCATCTACGGTGGAGATGGCGAGACTGTTAAA
CGGTGTATTGTTAATAAAACTGATTTTTGCAACTGGAACTTTCTTTTTCT
TTTTTCCCTACTCCCCTTCCCTCTCCCCACATCAACAATTAATGATGAAT
TAAATGCGTTATGCATTTTCGCTAAGCGCTATATTTTCTGACTGATTGTT
TACATTTTTCTCCTTATTGCTATCTAACTTTCATCATCAGGTAGGTCCAT
TCAGCATCTAGCTTGTTACCAATGAGTTTACCCCTGTTCATTACCAACTT
TTCTCTTGATTTGCTAACTCATTTTTTCTGATTTTTTGCATGAAGATATA
AGACGTAAGCCCTTGAATGCGGAGGCTGATACCCAATTTTTGAAAAGATC
ATTTGGGCAAATCCTTGCCATGTTAACAGTTAAATATATTGACTTTTTGC
AGAATTATTAAATTTCCGTGCTCAATGTTTCAAGCCAGCTCGACAGAATA
TAAAGTGTGTGAGGTCTGAATCGCTATCGAAAAAAACTTTAACCAGGTAG
GCCCATAACAATTATAACTTGTTATTATATAGGTAGAATTTCAAGAACAA
CCAGCAAGATGGCTTCACCAGTTAAAACCAACAAATTGTTTATACGAAGT
CTTCCTGACGAGCCCAACCTCAAGGTAAGTGTGAAAGAGGTTCAAATTAT
TTGTCTGTATGTGTAAATATTATGTTATGGTCAATTTATCAGACTTCCTT
TCATTGTTCAGGCAGACTCAGGAAAAAGTGGTAATTGAAAACTTTTTATA
AGTAATAAAGGGAAAACTCTTTTTCACATTATCAGTACAGTAAAAAACGT
TTTAGGGTCTAGAGTATCAGATACTTCAAAATTAACTTCCTTTGTGGCCC
CTCCTTTCATGTCTTAAAAAGAGGTCACACATATTCTTAAAAATTGATAT
TAAATGGTACAGAATACACTTAGCTCGAGGCTAATCAATATCAACTACTT
AAAATATTTATCTTTGCCCTAAACAAATATACCTTTCTCTTACTAGATCA
ATTTCAAGTATAATAATCAATGTATGGAGTTCAATCGACAAAAAACTGAT
ACTGTCAACAAAACAATTCAAAGAATCTCACTTAAACTCAGCGGAGGAGG
TATGCTAGACAAAGTATTATTTTTAATTGATTTTTGATTTTTGGATTACT
TAGAAGGTTAGTTTTTGGCATAATTTTTATTTGACTTTACAGGTTTTAAA
GTTATAAATACCAAAACTTAAGTTAGATCTGGATACATTTTCCTCTCTAC
AATGAAAGGATATCTTGTCAAACTTATTATCCTTTGTTCTCCACTTGGTG
CATCCCTCCCAAATTGTGCCCTTTTCCATTTATTGTTTACTATAACGAGT
ATTTTGTTGTCCGTATTCAGAGAGTTAAAAACCCAATAAATTACTTTTTA
TCGCGTTCTATCTAATCTAATCGTGTACTTATCAGCCATACCCTAAGCCT
CACAAGTGAGTTTTGCTGCAAATCATTTTTCATCGTTTCTTGCTCAAAAG
TCATAAAATTGTAATTTCACAATGACTTTTTCCATATTTTTAAAGGAAAG
AAAAAGAAGAAAAACAAGAAGAATGTAGCATCAATGGAATCCAAGGATCG
ATCATCAGGAAACATTGACATCAAACTCCTTGATAACTCTGGTAACGTTT
TGAACCTTGAAACCACCTCAAACGAAAACGCTTTCGTCAAATCTAACCAG
TTCCAAATAACCAATGATACAATTTTGACTGTCTATAACATGGTTTTCAA
CGCACCCAATGTCATCGATATTAAACCTTTGAACACGGTAATGGCCGGTT
TTCCTGTTTTCCCAGAGCTGACATTTGAGTTTGGACAATCTGAATTTTCA
CAATTTCAATGGTATAAAAAGTTGCCAGATAGCACTGATTGGATTCTTGC
AGGAGAGAATTTGATATTCACGCCAAGTGTTGAAGATATTGGATTTGAGT
TGAAATTGTCTTGCCAGTCTGGTAACGAAGACGAGATTCGTGAGGATTTC
CAAGAATTTGTATTTACAGAACCGATATCTGCCGGCCCTGGTCAGTGTTT
ATTTGATAAGAGGCATATGTATACACGCAAAAAGCACGATTTGAAAAGCA
ATGAGCTACGTGTCGTATGTTACAACGTACTAGCAGACATATTTGCAACN
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AACGTACTAGCAGACATATTTGCAACGTCTGATTATGCACGTAATACGTT
ATTTCCTTACGCCCCGGAGTACGTTTTATCGTTGAGTTACCGTAAATTGT
TATTGATCAAAGAGTTGTTAGGCTATAATGCTGATTTGATATCTCTACAA
GAATGTGGAATGAAACTTTTCAATTCTTATTTGAACCCAGTCATGAATCT
AAACGGTTACCAAGGGCTTTATTTTGGAAAACTTGGAACAATGCCGGAAG
GCGAAGCATTATTCTATCGAACAGATCGATATCGACATATCAAAGAATTA
TCGATTCCTATCCGTGAGGTGTTATACTTAGAATGTAATATAGAAATTCT
TTCGGCTCTTTCAGAGGTTCCTGAACTTTTAGAGAAATTCCACAAGAAGA
CTGCTGTTGGTCAAATACATATTCTTGAAGAGATCGAAACTAAAAGACAG
CTCTGTATCTTCAATACTCACCTCTATTATAAACGGTACTACCAGCATAT
AAGAGTCATGCAAATTGCTGTGTTAATGAACTACTTATCCACGAAAATTG
ATGCTTCAAAAATGTCTGTTATTGTTAATGGAGATTTGAACAGTCTTCGC
AATGATGATTTGTTACCGTATTTGAGTGGCACTGAAATTGACAGTCACTC
TCCTTTATGGCACCCTATTAGAGAGACAAACCCTGATTTTACTCTCTCCT
TAAAATCACCCATCCTGCTTCAAAACGCAAGTGGTTGTCCACCGTACACC
TCCTTCGTGCCCCATTGTATGGAGACTTTAGATTACATATTTTGTGATTC
AGATTTTGAAGTGACTGCCTTATTACCAATGCCGGAGCCTGAAGAATTTG
AACCATACGTCGGATTGCCGTGTATTGGGTCACCATCGGATCATTTGGCA
TTGGTGTTGGATTTGAAATGGAATAAGAAGAAAAACTGGTAAGATTATTT
CAGATTATTCTTTTGTTTTACACTGGAGTCTCCATAACTCGAACCCGTAT
GGTAAACACAAAATTTGTTCGAGCTTTTTAAGGAAATTTTGAGTTATGGA
GTAAGCTTTATAAGGCATTGTCAACTGAAGGGGCCATTAAACTTGTTCGA
GTTAAGGAGAGATTCGAGTTATAGAGGTTCGAGTTGAGTAGACTCAACTA
TAGTCTGTAAAATTCTTTTCTAACAGCTACTCGACAGCTATAAGAATTTC
TTTACCACTAGGCCGGTTTAATATTTTGTTTGGTAGTGTAATGGATAATA
TTAATGATTGACACATACTGTAGAGTGCAGAGTTGTTTTACTATGCCGGT
AAATAAAAGATTGACTCTGGGGAGCTTTTAGCAGATATTTAATGCATTAT
GTCCTTGTACCGATGAATGAAATATTCGGACCGGATAGAACCGCATTATT
TTTTTTGCGTCTCAGGCCGGTGAAATTAGCTTCTCACTAGGCCAAAGGAC
GACCACTGCACCTGGGTATTTTGGCTCTCTTTATCCTGTTCAAAAGAGGT
TCTAGTTAATTTGGATATCGATGAAAAACAACCAAAAAGGAAAGGGATGG
GGTCGAATAGAAAGTAGGAGGTGGGACTCAGGAAGAGATATTTTTTGCGA
AAAGCAGTGAGAGTTTTCCCATAAGGACGAGATAGAAACCAAAAACATGA
GAAACTTGTCTTAGTTAGAAAAGGACCTTAAATAGAAGAGAAAAGTTCTT
TAACCTCTCGTAAAATATATTGTGACATTCGGAAATACTACCCATATTTG
GTGATATAGGTCTTTAGGGTGTTTGCTACTTTTAAATATTCCATCCAACC
AAACCAACCAAACCAACCAAAGTTCTTTAACCTTTCGTGAAATATATTAT
GATATCTGGAAATGCTACCCATATTTGGTGATATAGGTCTTTAGGTGGTT
GTTAAATGTTCCATCCAACCAATGAAATTGGACAATGGTAGAGTTTCTGA
AGCCGGCTTTTCACTTTAAATACTGACAAGATACCATTATTGATGGTATT
GTCTCGTCAAAGTTTTTTGATCAATCTTAATGATGCTTATAAGGGCTGTC
AATGTGTGATTATTGAACGATGACCTCCTGAATTAATATAGTATTAGAAA
AATAGGAAAAGGTTCATTTAGACTAGAGTTTTTTTTTACTCACTATTTTG
TTCGTGCATTGAGAAGTCAAAATGAAATTATATATACTTGAAATTTTCAG
CTGGAACTGGAACTGGAAAAACTTTCTCAATTACTGTGTATCAATAGTCA
CAAATGGTCCATCTATAGTAAATTTTGAAGAGTTGATTTACTTTTACTGT
CTTGACAGTGTATGGTCTTGGGAAAACTAAGTATAAAAGAGCTGTGCACT
ATGCTTTTGACGTTTTTTACTTCACTGTAGTCTGGTGTGGTGTGGTCTTT
TAGAATTAGCCCCACCAACTGCGGGGATAGATAGACAACAAAAACTGTGC
TTAAATGAAAACAACTACAAAATTTGGGAAAAAAATTCTAAGAAATTCTG
TCAAATGTTTTTTTTGAGTCATTTCCGCGGTGAATTTATTCGAAAGGAAA
CAAGACCAGCCAATATTATTTAAATATTCCTTTATCTATGGAGATTTTCT
AATTTTACCAAGGCAAGGGTCACTTTCATTTACAAGCTTTAATGAACTAC
TCTTTGAAGATTTTGTTTTCCCCTTGTTGAAGTGTTAATGAGAAATAGTT
TACTTGAAAGATGAGAGCTAAATGTTAATTCAAGTGTTAACAAAAAACAG
CGTGTTTTTTCAATTTCATTTTTTAATGTTGTTGATGAGATTGGGCTTCC
TCTCTTTAAAATGTCTATTTTATACAAAAAAACACCTTGCTTTCACATAT
TCATCCATCACATTGATCTACCCGGCCCACTTTATTTTCGAGAGAGCTCT
AATTTTTAGGAGGTTTTTATTTTTTTGAACTATTTTTTGAAGTATTATAA
TATCTCGACCTCCTACCATTTATCGTTTTTTTAATGGGAAAAGATTCCCT
TTACACTCTCTGTTTTATAAGAACAATTTACTCTTTGTCAAGGCTTGGTT
GTTCTTATTTTTTGGCTCTATCAAGCTTCACTTGATCTTATTTTTAGGGT
AAAATTAAGGTATTTTAGGGTTCATAGGCTAATCTTTACTCTTTATTTTC
TACAATTTCAGCCATTTCGAATTAAAGGTATTGATTTGATTTTTACTACT
TTTGAGCTTCTCCATTGTTATGAAATTGTTCTCATAAAAAAAATATTAGC
GCTCCATATCTTCTATGCCTTCCTGGACAAAATTACATCCTGAATATCGT
CCTTTTTATTTTTTTGTTCATTTTAATGTTGATCGTTAATATTTCACGTC
ATCTTTCAAAGTGAAGATTTCATTATTTATAAGACAGTAAGATAAGATTC
ATCTGCAAACATCTTATGGTATTGAAGTCTATCAGTGCTGAGTCTAGTGG
AGGTTTTGAAAGAAAGGTTTCAATGATAAATTTATTTGTTTTTGTTTTGC
TTCAATCTTTTTTTACTGTCACTGTAACATGGATTATTGCAAGGCTGATC
TGTTCTTTGTTGACAGCCTGTGTTCTGCTAACCTGCTCCTGTGTAAAAGT
TTATTTTCACGGTTTTGAATTACCTCAAGCTGTAAATTCTTGATATGCGT
AAGTAATTTTTCTAGCGGAAATACCCAAAAAAATCTGAGATTTGACCCCT
CTCTGTTACTAAAAATAGAAACACAGAGGTCAAAATCCGGCTTTTTTCGA
GTGCTTCCGTTAAAAAATATGACGTCATTTTGACTTACCCATATACAAGA
ATATACAAAACAAAAATCCAATTTCTTATTTTTTATTGAAGAATCGTTGA
TTAAGTTTATACGAAATATGAAGAACATCAGACTTGTGAAATTTTCATGA
TATTGTAAGAAGGTTGGAGAAAGACCAATGTGAGACTTGGAAATGTTTTA
TTTGGAATATGTTATGGCTATGTGAATGTTTCTATTTCCATCATTTTTTA
ACCATTTGCTTATTTTGTTTACAATTCTCCGTCTAACCTGGTCTGGTCTT
GGTCACTTTATAACATCTTGAATTCTTATACATTAATTCTGAATTATTTG
ATTAGTCTAGTGGACAATAGCGCATAAGTTTTCCCCAGGTTATTCCCAAG
TCCTAGAGAAGACTTTCTTCCATTAATTTTACAACTCAGTTATCAAACAT
TGTAGGAAGGTAATAATAAATACAGAAACAAAATGAAATATATTGGATCG
TAGTCTAGCAAGCTAGACGACTAATTTATACATAGTAGAAATAAAGCAAA
AAGTAATGAATGGAACAATTTTAGTCGTCTAGAAACCTTTGTGCACTAAC
TCCAAACAAAAGAGAAGTGTCAATATTGCAATTATAATTTTTTCCTGCTC
AAACTAATTCTTGAGAAAAAAAATATGTATGGATTTGTGTATTGAAAGTT
TTTCATTTGAGTTGATTTCGTTTTGAGAGTTTGTTGTTGCTTGATAAATT
GTTTTCTCGCTACGCAAGTTTCTGCGTAGCTAGCCGGGGTATCTATAAGG
CTGGAACACCGGATTCTTTCAGTCGTTTATACAAACTAAATCCCGTATTA
TTATTATTATTGTTAGTATTGGTATTATTATTATTACACGCATTATAAAC
GACTCCTGTCTAATTGGATCGAGACAAAAAAATACCATTAGATGCTAGAA
ATTTCCAACATCTCTCGGCCAGGGCCGTTTAAAAAAAGTCGGGTTGGACT
TTGAACTATCGAAAAATTCTAAAAACCTTTATAAACATTAGCAGATTTTA
CGTCAGTTCGGTGGAAGATTTATTGGAGAATGAGCAAATAACAATGGTTT
TAACATTAACATCGCTGAACAGTCTGATTTTAGGAAGACCTACATTTTGG
GGGCCACAAAGCGGTATTTTGACGAACAAGGGACCAGACTACGGTCAAAA
TGTTACATCTTTATCTAAAAAATATCTTGAGAAATCGCAAAAATACTTGA
CCTTAATATTTTGGGCAATGAGAAAAAAAAGTTACGTAAGTTTACTAAGT
TAAAGGACTGGAAATTTTTTTCGAAGTTATAACTTTTGAACAATAACTTT
TGGGAAAAAAGGAGGAATGCTGAAATTTTAAATTGAGGAAAGTTTTGTGT
AAAATATCTTTTCCTGTGGATTTAAGAGTGTTTTCAAATTTAACCATATT
GGAAGATGATAGAACGAAGATGATTTTGAGTTTCTTCCCTTTAGTTTGGG
ACAATTTCATACCCAGCAGTGGCGGCCTGGCAGGGGGTGCAGGGTGTGCA
GTGCACCACCCAGAAAGACCTGAGAGGGGCGCCAAAAAAGCTTTTCAAGG
GGGCGCCAAAATTTTTTTTGATCTTTGGTTGGGCGATTTGGCGCCCTTTG
GCACGTTTTTAGTGCCTTCTATAAGTGCAATGTAAATTTTTTTTCGCCTG
CGGCGCTTCCTTATGTTTTACGAATTTTTTCAAAACTATTATCAACATTG
AATTGCGAAAAGTCAAAGCAAGAGGAGTGTTGTGTATCCCCCAGGGGTTA
AAGAGGATGCTCACCCCAAAAATGAGAGATTGATCGAAACTGCTCGCTGT
GGTTTTTGCGGTCTTATGCGGACTAACTTTCACCTATTTAGAATATCTTT
TGAGCTGTTTGACCTTTCATACACCAAATTTTTTTGCCTGCGGCGCCAGA
ATTACAAAGAACCCTTATTCCTGCCAACTTTCTGAATTTTAGGGCCTCTT
TCATCCATTGATATCTAATGGAGAGGAAAGTAACACCAGGAAATAACAAG
GAAATAGATATCAAGTTATCATTACCACCACCTTCGTATAAATAAAAGTT
GGTTAACTCAGAGATTCCGGACGTTACTTTCAACCAGTCACTGCTCTTAC
AGTTTAATATTTTCACTTTCTGGTGGAGGGCGCAAATAAGGACAAAAATA
CCAGGGGCGCCAATTTCATAGTTTGCACCACCAAGAAAATTAAGCCAGGC
CGCTACTGATACCCAGTAGTGTATAGTTATAGAAAAGGGGGTACAAGACT
AAGTCATATTAGGTTGTTTTAAAGAAAAACACACAATTTTCGTTTTTGGG
CACTACTCTTCTAATATCAGTGGTGTGAAGGTGAAACTTGACAAAAAGTA
GTTCTTTTTAAGTTGTTTTTTGTTTTGTTTTGTGAGAGCTTAAAGGCCAA
ATACAAAATATTTCTTATAAGAACCAATAGATTGACCTCCACGTTTTTTG
AGAATTTCAGGCTTGAAATTTAAAGGTTTTATTTTTACATGTAATGTTCC
CGTTTCATATCAGACACATATTTCATATCATGACAGTGTATGCCTATTGT
TATATTATGCTGATATAAGCAAAAAAATGTTTTTCTTTTTCTGACCAATC
TTATTCCACATCCGTGTCAATCCAATGTGAAAAAGCTTGTGAATTAAAAT
TGATGAGTAAGCAAACGATATCACTCTTATTTAAAAACAAAACCTTTAAG
TTCAGTTTTTTGGTAGTTTGAACATGACCGAATCTGTGGATTTAAGGACC
TCACGTTTTTATAAGAAAGGCTGTGTGTAGTCCCAATATAATTTTATGAA
CATTTTCTCGCTCAAGTGTTTGAATTATTTATTTATTTTGCAAACTGCGA
TTTTAGTTATTTTAAAAACATCCTTTCACAATTTCAAGCTTCTCTGCTGA
CGTTTTTTTGGGGGGAAAGAAAATTTTGGGCAAAAAATGATTTACACCTT
TAAAAGGATTAAGTTGAAAGACTTGTCAAGCTATATCTAATGGGTGTTTA
ATCACTGATTAAGGATTATCGTGAAAGTTGTTTTAGCTAAAAAAGGTATT
ATGGCTTTACGAAAAGTGTACTATTTGTTTAATTTGATTGATTACAGGGT
TTTAGAATTTTTAGTCTCCATTTAATTTGGTTTGAGCACCGAGCTTTAAT
AAACTCTGGACGCAGTTTCTCAAACCAGGCCAAGCAAAATCTTTTTGATC
GGAGTCTTTTGAAAGTGGTACTAAAATGGTAGCACTACTCAATAGTGGTG
TATAATACATTGAGAACGCTAAATGTGCGTGTATATGACCTTTGTGTTAC
AGTTATTGAGTGTCCAGATGACTTGTATCGCATTGCTCGTGGAAGGAGCA
AGAGAATACACGCTTTTTCTAAGGACATCCAAATTTTGCGAAGCTTTCAG
ATGTTCTTTACTTTTTTGTTTTAAACCTAAAATCGTGAGTATATTTTGTG
TAATTCCCTTAGAAATTGAGTCTTTTAGAGTCCATGAAGCCTTGAAATGC
TCTTAACTTGTTCTTTATTTTTGCCATCGAAGCCTTGTGTTTTGTATAGG
TTATTCCAGTTTATTCTTATAAAAAACCGTGTATTACATTGTTTTTGAAA
AGGGCAAGGGAATCTGAAGATGTTTCCCATGGATAAAACACTGGGGGATA
TTAGGGGCTCAGATAGGAAATTGTGTTTAGAATTTTTGGCGTCGAATGTT
GATAGAAGAAAATTACTTTTCCTCAAGTTTTCAATTATTTTTTCCTCCCT
TTTTCAAAGCCTCAATTTGGTATAAACCTCGGAAATGAATTCTTAAAAGA
GGCCTAATTTTTTAAAGTATTTTTTTGGAAGCGGTGCATGTTTGAAAAAT
CACATGCTTAATCGTCGTCTTGTTTTGACCAATAAATCTTTTTTGGTGAA
TCGGAAAATAGTTTCATCCTAAAATTCCTTCGGTCGAAATGTTTAATGTA
CTTTGAAATTTCATCTTTTGTAAGATTGGATGGGCTTGAATCTTTATAAG
AAATGTCCCTAATTGCTCATTTGAAGTAATAGAGTGGTACGTTCTTTAGA
AAAAGAAACAAAATTCATTACATTTTAAACACCAACCAAATCAAGTAAGA
GATTGTAAAAACTTCATCTTGTGACTTAAAGACGCGTGGGGGGACTCGTC
AAGGTAAGCGACTCACCGTAGGAGCGGCCCGGTGCTTTTTTCAGGCTTCC
CAAAGCACATGTAAATTCCAAAAGGGTGGGTTAATAGGAAGTTTTCTCTT
AAAGGGAGGATGACCTTAAATTTTCAGGAAGGGGAAAAAGCTTTTCTAAG
AAGGGGATAAAAAAATTGCTGACGTCAGCGAAATTTTCCTTCGTAAAAGA
ATAAAAGATCTTGGAAGGGAAGTGTAAGAAAAACCTGAGTCAAAACTTTA
CTTGATAAAGCTTTATGGATCGTTAATTTTATCCTATGTTTGTCTTAGAA
TTAACAAGTCAACACATTTAGTATTATAACCTAATCCCCCGCTAGACTTA
ACATAATCACAGCTTAATGAGCTCTTGATTCCGTGATTAAAATACTCATT
GCGTGTCTAAAGTCCTAAAGTTTTTAAAGGCTCATTGCCCAATCCACCAA
TCTTTCATAGATAAAATGGAACTCGATGACTAAGGCTACAACAAATAGCT
TTCAGGTAAAAACTTTTGTACCGTTGGAAGTGGGGTTTGGGTCTTTCTTT
TCTAAAACAGCAGTATATTTTGAAAATCTGAGCTATACCATTCTGATGGA
TCACTGGTGAAAAGTTTTTTAGGGCTTTTGGGAAGTCATGGATTTATGCT
CCTTATATAAAAGGTTTAGATTGTGCGATTTGGATTGGGGAAGTCAGTGA
TTTAGGCTCTACTCTACTTACTATCGACGATTCTTTCTTTTATAAGAACG
ATTTCCTTGATAAGGGAGGCCAAAGTTTGTGCAAAACCTATAGTTCTTAT
AAAAAAGATAATGTGATAATATAGATCTTCATAATGTGCCCTAAAACATG
TCCGATTTTGTTAAAAAAGAACCAACTTTTTACAACATGTCACCATCCAT
CCTGTCACTCGTATTATTTTGTTTTTCTTTAAATGTTTATTATGAGGCTC
GTGGATGTTTTTTTGTTATTCCTCATAAGTTTTGACGTCAACTTACAAAG
GGAGTCCAATAATATTACACGTTTTTTTATAAGAACATCCAAAATTTTTG
AAGCCTTCGAATGTTCTTAACTTTTTTAGTTTTAAACCTAAAAATGTTCT
TAACATGTTCTTATTTTGACCATTTTGTGAATTTTTTAGACCATTTTCCT
AAGAAAATAGCTGTTTTGGGGTCTGTAAAGCCTGAAAATGATCTTAACAT
GTTCTTAACATTTTGGCCATCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTTTGTTC
TCATAAAAAAACGTGTATGACGACTATCTTATATCTTTCTTTTTTGAAAG
GGGTAAAATTCTCTATTCTCATTCATTCCTGGCTTTTCATAACGATTTTG
ATTTATTTTTGAATTTATTCTTCAGAGAGAGATTTTAAAGTTTTTAATTT
TGGACTTGTTGGATGATCTTGTTGGATGATCTAGTTGGAGGATCTTGTAG
ACGGCTCCAAGCAGTCTAGATTGGGTGACAATCAGATTCAAATTAAAAAT
CTAACCCGTTTAGTCCGCTCTGTCTGCAATTTAGATAAACGGGTGGAATA
TTAAACTTTTTGGCCGTTAATTAAATTGATGATTTTTTGCGCTCAAGTCA
GGCGTGAATGTAAGTTAAAACTTAAAGTAAAAAGTAGTGACGTCGAAGGG
AATCGAGAATTGTTTTTAACACTCTTCCCCCGTTTACATGAGAGTAGTAA
ATTATGATTTTAACATCTCTCCCTTTCCTTAAAAATTAGATTGGAATAGA
TATTGGAATTTCTTTGGAATCAGATGGTTGATATCTCAGTTTTATACGTT
TTCAATCTTTCTTATTCTTATCTATTCTTCTTTCTTATTCTTGTTTATTT
ACACCAACATTGCCCTTACAAAGCATGCTTTTTCTATAAGAATATACTCA
GAACTATTACTAAAAGCTCCTGAAATAATAGGGCTTTTGCCGTGAAATTT
TCTGTAAATTCCTAACTTTTATTTAGCTTCAAAATAAAAAAAAATTTGAC
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ACTTTTCCAATACAAATTTATTTTCATTGTCAAATATATCGTTAAACCGT
AATTTATTGAATATTTAGGATAAAATGAGCATTTTAAACTCAGGCAACTT
TTTTCTAAAGTATTTGTTACAATACAATAGCTATTTATAAGAACAAAGGA
AATTTTCGGTTTTTGCTCACTCTGGGCATGTTGAGTGACGTCATCAAAAA
TCTTTTTTGTCAAAAGTTACCTTACGTCACAAGGATCTTGTGTGCCAAAT
TTCATCCAAAAAGAACCACTAGATCAAAAGTTAAGGGGTGGTACAGGAAA
AGCCCCCCCTAGTTCTGAACCGCCCCTAAAAGCCTAGGTTGAATAGGGTT
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TTTTAGGATGATTTCCCCAAAAAGCATATCCATGATGAAATACATCGTTC
TTATAAAAATGCGTATACTTTTCAGCTATCAATAACGGCCATCTTTTTCA
TTAAAAGGTGTCGATTATATAATTTTGTCGGAGTTTGTTTATAGCCATAG
ATATTGGATCTGTTCTGGTGATAACGGAATTCCAATTTCAAGGGAAGCTA
AATTGAGACAATTAATTCTCCTTATCAGGGAAAAAGAGACAGAAAAATAG
TAATTTTTCTTACGTAATTTTTCGTAACTTTTTCACCCCATTTCACATAT
AACGGGCATTTTATGGTCCAGACGATATCAGACCAAACGTTCACGCAGAA
TAAACCGAATACTTTATGAATGAAAGACTAAAGCTTTGGGAATCATTGTA
CTAGAGAAGAAGAGTTATTTTGCAAAGCACTCTTTTTACTTATTGGTTTA
TTTCAAATCGCAGAATATTATTACGAAGGTTTTTCATTTCTTTCGAAATA
TGTAAGAAATACGGAATTCCCTATCCACTGAACTGTAACGGTCTAGCTTT
TAAGCGCGGCGTTTTTGCCTTTTTTGTAATGCTTTGACTTGAATACCAAA
AAACGTAGCCTCAACCTTCTTATCAGGGGTATCACCTCAATTTTTGCGAG
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TCTTCTCTTCCATATTCACTGGTTATTGAGGTACATCTCTATTATCGTTC
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ATTTTTCATCACTTTGAACTCCAGGCGCAACATTTTTCTTAAATAGTTCA
TTTTTAGCTCATAGGCATTTTTGGACCTCGTTGTACTTATAAAATTGTTC
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TGTCATTCACGAATTTATTTGTATACCACAGTAATTTCAATAATTTTTAG
TTAATTCTAGCCATATTTTGTTCCATAACTCAGAGGCACTTAGGGAAAAC
CATTTTGATTCTGCCTGAATTTCTTTCTCTGGTAAGTATGGGATGATTTA
CCGTCCCGCTATTTGTTATAACCGAATTTATGTATCGGAGGATATCGAAG
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CTCTATATCGCCTTTGCTTACCTTAACGGATGACGGTATTTTGGTGTTTT
TACCGTCGTCGAGCAAAGTGGACTGCGATTTTGAAGACATGTCAACTTTG
CTTTATACCGTCTCCTTCGATTCATCTCGAATACATAAACTCGCTGTAAT
CGATTAGAAGGGAAACACTCATACGTGTAGTATATGATTGTGTAGAGCGA
ATATAGCTTTATTTTAAGCCAGGTCCTCGAAAAAAGAAACTAAGAATATT
ATAAGAACATCTTAAAGACATAACACACCTTAAAAATTCTGAAAAATGAG
AATAGTCGAGGCTGAGTTAAAATTTACTGGCTCAGTCAAATAGACCACTT
TATGGATATCACGCTTTTTCATAAGATGTGTGTTTTTTATTATTTTGTAT
AAATTTTAAATTTTTCGGGAAAATCATTCTAAAATATTCTTACGGTATTC
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AACCAAAGGTTATGGCACTTTCGTGAAAGTCTTGAGCATTACTTGGAGAT
AATCGAATATTGATTGGTGAAAATACTCTAAAAATAATAATCTTAGGTTA
CGTCGTCAAATTCTACGATGCTGATATTTGNTAAATACTCTAAAAATGAT
AATCTTAGGTTACGTCGTCAAATTCTACAATGCTGATATTCTTAAATGGA
TAATCAAAGTGATTTGGGATATTTGGCATGTGGAATCCTTCTATTGTTCT
GAGCAAAACCTCAAAATATTTTTGCCTAAATATTTCCCAAAGTCGAGATA
ATTAAAAGCATATTTTTGATATTTTTTGACCTATTTCATCATGAATATTC
TTATAGAGTATATTATTCTAGCAAAAACGTGCATTGTTGACAATATTATT
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TCCAAAATAGTAGTTCGGTGTTTCGCTTGGAATGAAAATTTAGCTATTAG
TTTGAAGCTTGGCACACAACTGACTCAATTTATTTCACCCTTACAAGTAA
AAGAACAAGAATTTATTAAACGTTTTCTGTTGAATGGGACCCTTCGGTTC
AAACCACACTGGGCACGTTCTAGCTTGAAGCCACGGGTTTTAAACATACA
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AATTTTATTGCAAGTATTGGACGCAAGTAAGATAAAATCTTGCACGTTGT
CAGAAAATCCCTTTTATCTCAACGGAAATAGAAAAAAAATGCCCACGTTA
GAGAGACTAGAAATCGTAACTCGAAGTATATCTTGATAAAATTGAAATTC
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CGTGCATTACTTTACATTACCAAGATTACACCTATAAACAGGAAATTAGT
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TAAATATCGTCGTTGTTGTAAAGTGGTGCATAAGTAGTAAAAGTTTTAAC
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TAATCAGGATCACTTCACGGGAAATATTGCAGTTGACGCTCTCTAATTTG
ATGTTCTACGATACGCTCCATTATTCGACATGCTCTTTTATTCGACACAC
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CTTTGAAAATCGAATTAGAGAGCGCAAACTCTAGTTTAAAAGATTGATGA
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ATGATAAATGATTGATATTTTATTTCATTTTATCTCTTATCATTTAGTTT
CCCCCATAAACCACAAGAAATCGTGAGTCCGAAACCTTTAAGTTTCCTTC
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ATGGAAAGCACATAATGTGGAATTCAACAGCTTTGGAATCCATCTTACCC
TCACCGTCGTCGTCATTCATAGAGACCAACACAATACTACCGTCATCGGC
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CTGCAGCGCTTCCATTTTAGCTGACTCAGCATCGTCATCGATATTCAGTA
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CATATGATGTCTTGGGTGTTCAGCCCACCTGGAATTAAAGTGACCCCTAC
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AACGTCAACAGTTTGTATAATATATATTTTGTCTCTTTAGTTTGTGCACA
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ATTCATAGAGACCAACACAATACTACCGTCATCGGCTTCAGTATATTTTG
ATCAATATGCATCCAGCGAACCGACACCCGTATCGTCGCATACATCCAGT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000019 | supercontig | sc0000019:1076222..1095548 - |
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
|---|
| GO:0007186 | G-protein coupled receptor signaling pathway |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0004930 | G-protein coupled receptor activity |
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
|---|
| GO:0016021 | integral component of membrane |
GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
| Category |
Term Accession |
Term Name |
| biological_process |
GO:0007186 |
G-protein coupled receptor signaling pathway |
| cellular_component |
GO:0016021 |
integral component of membrane |
| molecular_function |
GO:0004930 |
G-protein coupled receptor activity |
Blast
BLAST of TCONS_00002353 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: PDE12 (2',5'-phosphodiesterase 12 OS=Homo sapiens GN=PDE12 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 159.458 bits (402), Expect = 3.115e-40 Identity = 109/319 (34.17%), Postives = 171/319 (53.61%), Query Frame = 3
Query: 876 LRVVCYNVLADIFATSDYARNTLFPYAPEYVLSLSYRKLLLIKELLGYNADLISLQECGMKLFNSYLNPVMNLNGYQGLYFGKLGTMPEGEALFYRTDRYRHIKELSIPIREVLYLE-CNIEILSALSEVPELLEKFHKKTAVGQIHILEEI-ETKRQLCIFNTHLYYKRYYQHIRVMQIAVLMNYLS-TKIDA-SKMSVIVNGDLNSLRNDDLLPYLSGTEIDSHSPLWHPIRETNPDFTLSLKSPILLQNASGCPPYTSFVPHCMETLDYIFCD-SDFEVTALLXXXXXXXXXXYVGLPCIGSPSDHLALVLDLKWN 1817
+R V YN+LAD +A ++++R L+PY Y L L YR+ L+ KEL GYNAD+I LQE +F+ L P + G +G++ K EG A FYR ++ + + I E L + + E+L L P EK ++++V Q+ +L+ ++ +++C+ NTHLY+ +IR++Q+AV + ++ D + VI GD NS + + ++ I W E +SL L++A G P YT++V LDYIF D + EV ++P+P EE + LP + PSDH+ALV DLKW
Sbjct: 295 IRTVSYNILADTYAQTEFSRTVLYPYCAPYALELDYRQNLIQKELTGYNADVICLQEVDRAVFSDSLVPALEAFGLEGVFRIK---QHEGLATFYRKSKFSLLSQHDISFYEALESDPLHKELLEKLVLYPSAQEKVLQRSSVLQVSVLQSTKDSSKRICVANTHLYWHPKGGYIRLIQMAVALAHIRHVSCDLYPGIPVIFCGDFNSTPSTGMYHFVINGSIPEDHEDWASNGEEE-RCNMSLTHFFKLKSACGEPAYTNYVGGFHGCLDYIFIDLNALEVEQVIPLPSHEEVTTHQALPSVSHPSDHIALVCDLKWK 609
The following BLAST results are available for this feature:
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