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transcript sequence >TCONS_00002499 ID=TCONS_00002499|Name=TCONS_00002499|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1990bp ATAGAATTAAAGGAAAGcattgaaaatgatgaaaataaatggaaaaaata attgataTAATGATATGGATTGATGGTGGAAAAAAAGATGAAATCAAGAC CTATCAAAATCCTGAGGTCTGGCTACAGCATACCTACATCCAGAAATACA TGCTATTCATGGGTATCCCTTGGAAATAGTAATTTCTGTTGAAGAACTTT ATTTTAAATTCCAAGAAGAATATGGCCTGTACAAGATTTTCTATGTCTCG CACCTCTCTGATTGGATTTATGTCACATGGTAAATGGATAATGGTACCTA TATAAGCCAACGACATGGATGTTGATTGTTCAGTCACGTGATGCAAGAAA GTGGgtaAAAAGTTGAAGAAGAACCAATAATGTTATCGTTTAAATGGTGC TTAATTATGGCTGCATGTACACTTTGTTTGATACACAGCACAGAGGCCAA ACTACATTGTAATTGTCAAGCGAAACGTTGTGTGAAACCAACAAATTGTA AAGCTGGAACACACAAAGACGCTTGTGGCTGCTGTGATGTATGTTCCAAA GAAGAGGGTGAGCTATGTGGTGGTGAAGAATATAACCAAGGAGAGTGTGG CCAACAATTACAATGCATGGTCAGACATATTAAAGATAATCGAAATCGTG ATAAGAAGACTGttagtgatttgattggtcgatgCGAATATATTCCATGT CATTACCAATCTTGTCCATTCGGGCAGCTATGCACTATGGTTAAAAATCT CCCGACATGCACTTGTCCGAAATGCAAAGACATGATTATGTCACCGGTAT GTGGCGAGTTGAACGGTGTTACGTATAAGAACGAATGTGAATTGAGACAA GCTGAATGTTTACAAGGAAGAGAAATAAGAATGACACGTGGACCATGTAA AGCTAAAAACATCAGTCGTGTGGTATGCCGTGAAGATGGGATGAGAATCG AAGTGTTGAAATCCTTCGTTGGCAATGAACAAATCACTCAAAAACGCTTG ACGTTATTGGACAGTAACTGTGTCTTCAAAAGCAATGAAACCCATCTCTT CATTGAAACAAAGCTAAACGAATGTGGTACAAAAGCCAACTTTGCACTAA CCTCTGTTATCTATTCAAACACAATTCGTACAGAGATCGACCCCAATGCG GTGATTATACGAAATAAAGATTCCGTACAGATTCCAGTTGAGTGCTTTTA TTCAATAACCGGTAAAGGGAAAGTTGAAATAGCAAGCCGTGGAAAGTTTG GAGACCGTATCGAGGAAAGATTACGTGGGAATGGTATCGGTGTCCGGATT AAAAGTGATAATCAACGGAAATACCGGTCAGctcaagaaatgaaaatttc tttggaTAAGGAATCGAAGTACATTGTTGAATTGAAAGCAAAAGCCTTGA AAGTACCTGCTCAAGCACATCTTTATCCGAAGTTTTGTTACGCGACTCCT GTCGACCGTAGCGATCGTTGGATGAGATACACATTGATCAGAGATGGATG TCCTACTGAGGAAAGTGTTGAAATAATGGATTCAAAATCACCATACATCA AACTACTTATACCTGGTATCGAATTTGACAACGCCAAGCGTACTGGATTC CTTGTCCGCTGCAAGATTCGAGCATGCTTCCCACGTGATCCTAACAACAA AGCTATGTGTTTACCACAATGCAATTCGAATAAAAACAATAATGGTGACC GAGTTGTTGTAGATACCAATAATAATCGGCAGAAACGTGAGTTGGCTGAG TTTGGGAAGCGGAGAGCCAGACGTAGTGCTGTAGAAAGGTTCTATATTGA TTTAACGGCGGAAGAAATTGTTGAcatgtaaataaaaatgataaaaaatg gtTTTTACTTGAATGGATACTATCTATCTTTCTAAGTATGAAGAAAGTAT TTCGCTTGAAATATTATAGAGAGCGTACCATTCATTCCTTAATGAACAAT GGGGTTAACAAtgacacaacgtcgtttcaacgtccATGGA Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00002499-protein >TCONS_00002499-protein ID=TCONS_00002499-protein|Name=TCONS_00002499-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=483bp
MLSFKWCLIMAACTLCLIHSTEAKLHCNCQAKRCVKPTNCKAGTHKDACG CCDVCSKEEGELCGGEEYNQGECGQQLQCMVRHIKDNRNRDKKTVSDLIG RCEYIPCHYQSCPFGQLCTMVKNLPTCTCPKCKDMIMSPVCGELNGVTYK NECELRQAECLQGREIRMTRGPCKAKNISRVVCREDGMRIEVLKSFVGNE QITQKRLTLLDSNCVFKSNETHLFIETKLNECGTKANFALTSVIYSNTIR TEIDPNAVIIRNKDSVQIPVECFYSITGKGKVEIASRGKFGDRIEERLRG NGIGVRIKSDNQRKYRSAQEMKISLDKESKYIVELKAKALKVPAQAHLYP KFCYATPVDRSDRWMRYTLIRDGCPTEESVEIMDSKSPYIKLLIPGIEFD NAKRTGFLVRCKIRACFPRDPNNKAMCLPQCNSNKNNNGDRVVVDTNNNR QKRELAEFGKRRARRSAVERFYIDLTAEEIVDM Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000020:383816..405142- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00002499 ID=TCONS_00002499|Name=TCONS_00002499|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=21327bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020:383816..405142- (Clytia hemisphaerica) ATAGAATTAAAGGAAAGCATTGAAAATGATGAAAATAAATGGAAAAAATA
ATTGATATAATGATATGGATTGATGGTGGAAAAAAAGATGAAATCAAGAC
CTATCAAAATCCTGAGGTCTGGCTACAGCATACCTACATCCAGAAATACA
TGCTATTCATGGGTATCCCTTGGAAATAGTAATTTCTGTTGAAGAACTTT
ATTTTAAATTCCAAGAAGAATATGGCCTGTACAAGATTTTCTATGTCTCG
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TCTAAGAAATTGTGTTTTAAAGTCTGCGAACCCTAAAAATGTTCTCAAAT
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TATAAAAAAACGTGTATCTCTGTTTTTCAATTTGACTTTCCTGTTTAATC
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TTGTGGAGACTGCTTTACAATGTATTGTCAAGTGAAGGGAATAAAAACGT
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AGTGAAGAAATCGAAAAGTTATATAGTATCAGTAGTGGAGTCTCCATAAC
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ACTGCATTGCCCTCTTTTAATGACAATGCAATGACTTCAATCTATTCTAG
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CCATCCGTATTTTCTTTAGCCTTTCGAGCATCTGCCTATGTGTAGTAAGG
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TTGGGATGCAAGGTCAATTTTGACTAGAAATATTCACCAATGATGAATTT
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TAATGCGGTTATAATATGCCATTAAAACATAGCACTCAAGTTTGTAATAG
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CACATGTCTAGGAAATTGACCAGACGTTTTGACCTTTTAGAAAATTTGTT
GATTTTCATCTGTGCTGAAATGAAAAAAGTATATTTGGTGTTTGGTTTTA
AGTAGAGCAGATTGTTAGATAAGGGGTTATCTATGTTTATAGTTTCTTCC
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TACGGTTAATAGTGAATCAGTATTTGGGTAGCCCGGGGCCACTCAAAGCT
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CTCGATTTTTTGGCTCTGCTTGAGGTAGTACCAAATCCAGACCACTAGAT
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TTTCAAAATCAACTAAAATCTGCAAAAAGCAAAAGCATATTACTATATAC
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TGATATATAGAAAGTGCTAGATTTAATCAGTCATTCTAAATGCGACGCAA
ATCTTAAGGCTTCACTTTTTCTTGCTTGAGAAAGGTCGAAGATTTATCTT
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TGACAGGANCTTCGAGGCTCTAAACTCAATGCTTCTCCTTTTAATTATCG
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TTTGTAGTTGGGAAGAAAACTTTCCTTTTTTGATCATTAAACGATACTTC
TGCCGGTCTTGCTAAGCGAGAAATTCTGATATTATCCCGTAACAATAATC
GTATTATCATGTAACATCCATATTACTGTATTACACGAATTATAAACAAT
TCCAGTCTAAGCAACATTACCCTTTCTCCTTCATTGTGTCCAAAAGTCTG
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TGCTTTTCGGATCTGTTAGAATTTCCGTTTTCAGATATTGATACGAACTG
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ATCATTTTTGTAATGCTATTATTGGTTAGTACTTCGTGGATAATGCACAG
TGTTGATGCACAATTACGAAGATTAATTTTAAAAGAATTTTACATTCCAG
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TTTTTTTATACTTTGACCAACAACTTACCTTAAATGGATTCGGTCTCGGA
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GTTTTATTTAGTCGGGTTTTTGTTTCGTCGGGGAAAAATTTCGTCACCTA
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GTGTAATTTTTGGGTTTCCATACAACGTTCTTGGGAAACTTTATCCGACT
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TGTTTGAGACCGCCCTTACGCCCTGACTCTACGCATACGATAGCATCGTC
TAGTTTGAGCTGTGAGCTAGTAAATGTTGTAAAAAGGCTTGATGTAACCC
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TGTGGACGGCAAAATTTGTCGTTCTTTTTGTCTATTTTTAGTAATGCTGG
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TATTATATGTGCGACATAAACTTTGTTCGGTTCGATTGTAATTGAATACA
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GTATTACCCTCTGGTGACAAATCAAAGGATTGTTGTCTTTAATCAACTTT
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TTTTTTTTTGTGTGTTGTCTTGACGTCTCAGCTTCGCTTTTTAAAGGTTT
TTAAAGGGTTTTCTTGTTAAGCTGCTCATAGTGCTTTGGCTGTTCACGTG
GAGCTGGATGGTATCTTCTCACCTTTTGATGGTCTTTATTTTATAGTTAA
TACCGTAGGATAGCTAAACTTTCTTATTCCTGGTGAAACACTCCTGGTGT
TTTTTCTGGGCACACCGGCAAAATTTATGCAAAGGCCTTTTTTATATTTT
GTGAAATTTGACGAAAAATTCCAGGTGATTTATAACGTCATAACTACGAC
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ACCGTTGAGTTTCAAGCCAAAGACTAGAGGCGAATATCCAACTTCGCCTA
GACAAAGAAAAGTGATACCTTGAATTATGTGCTGCATTTCGGATTACAGA
TTGAATCTATTACTTTGTTTTTGCGCTTTACTTTTTTCGAATTCCGGTGG
TAAATGTTGCTTCCAATCTATCGTTTGTATGGAAATCACGCGGGTCACCG
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GGCTATACTTTATTGACTGGGACATGTGACTCATGCTATTCTTCCTGGAG
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TCTGTGCTTATATATTTCTCGCATTTACTATCTCTATAACGGACGATAGC
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TTCAATATTATCGAATAATGGAATATGTCGAATAGTAGAGCGTGTTGAAT
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ACATTGTCATTCTGTGTTCGGTTCATAAAAATTATAAATAGGGGTCTCTT
TGCTCAGAATGATTCTATATTCTATACTCTACAACCTCGTTTGCTGCGTA
TTATTAGCTTTTTGATGCTTACTGATAGCGCTAGATAACCAGAGTATTCT
CTGGCATCCATAAGTAACGTAAATAAAGCCTGGGATGAACGGAAACGAGG
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ATGGAAGGAAAATCAATTGGTCAAGCTACTTAATTTGCTGGATGTGCCAT
TTAATCACTACATCATTTGCACCGAGGGGGGTCTACTTAAGATTAATTTA
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CCACTTACCCTTGATCCTTCTTTTGATTGCTGAGCATCAAGGAAAGAGGC
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AACGCACATCCTTGCGCACCATAGCCAGATGCTTTACCACTGTAGTACGG
TCGCACTAGGACTTTCTACAGTTCTCCAGTTCTTAATAGTTCCATAAAGT
CACCTTTTACTGAAATATTTGAGAGATTACATCACCCAGCTGGCACACAA
CGTTGTTTTAACGTTCAAATAACGTTATTTGGACGTTATGAATGTCACAT
GGACGTTGTTTTGACGTTGTGTGCCGTTTGGGCAGAATCCTTCCTTACAT
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GGTTCTTTTGAAAAGTGTAATGCCATTTTTTAGTAATTAATGAATTTTTT
CGACCTTTGTGATCCTGATGAGAGCAAAATAACTCTCATGATGGCTTAAT
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AAAAGTCCAAAAAAATCACCTTGCTTTGCGATTTTTACACCAACCATGAG
GTGCTCCTCTCCTAAGATTGTATTCAGTAGACAACTAGTTACACTTCTAG
TCAATTAGTTTTCTAGAACTAGGGATTTAACACATAGGATACCATTAATA
ACTAGTCTACGTACTCTTCTGTGCTTAATTGTAGGGGGAGGAATAAGTGG
GGAAAGCAGGACTTTGGAAGAAAAATCATTAAATGTAGAGGTCATAATTA
TGTCATATTGGAGTGATTTTATTGACTTTCCTTATGAAAAATAAAGGTTT
TTGACACATTTTGTCAAAAAGTCATAAAATAGGGGGGGGTTATTGTAAAG
TGATTTTGGGGTTTAAAAAATCGAAAAAATGGAAAATAATTCTCCTACAA
TTAAGCACAGAAGAGTTCTTTTTTTCCTTCTTATTTTTCCTCCTATTTCC
TTCCTCTTAGTAATACGGCGTTAATGGGTGGTAACTATAAATTAGTCCTT
TTCTATAAACGAATTTATTTCATACTAGATTTTCGCCGATAAGGTAATCC
AACTTATCCACACGATTTTTATAAGAACAATTATACAAGAACATAAGGTA
TCAAATTATAAAGAACAAGTTAAGAACAATTTAAGACTTTATGAGCTCCA
AAACTCCATTTTTTGGGAGATTGCATAAAAATGCTCACAAAATGGTGAAA
TTGAGAACAATTTTAGGCTTAAAACTCAGAAAAGTTAAGAACTTCCGAAG
GCTTCAAAATTTTGAATATTCTTATAAAAAACATATATCCGTTAGTCGAC
GAATTGTGGTTCCTATAGCAAGAGATAATAGGGATTTCTAAAGGACGGTT
ATCTGTACCTGCCTTATGTATTCAACATTCATTCAAAGTCTGTTTGAATG
TTTAGTCAGCTACCCTAAGTATGCTCATGATTTTTTTACCCTAAGTAGTA
TAATTTTGAAATGACATAAACAAAGGCTTTCTTATTTGACTTTATTCGTC
ATAGTTTGTCTTGACATAGCAGATCGTCTAGTCTTGACAATACCTATTTT
CGTTCAATAATGATTTCGAGTTTGACGTTTGAGCGTTTAGTTTGGAGGAT
GATACACTTTTTCTTGGATATAAAAGGTCTATAAACCTGCTTTTTATGCG
ATCTTTAGAATTCAAATTAATAGCGAGTTTATATATCTGTGTTTCTCTGT
GGCGGGGACGGTTAGTGTTTGATTTGGCTAGATCTTGATCAACTGAGGAC
GGAGGTACCACAAAAGCGTAAATATATAAACTCCCTAATTAGCGATTAGG
ACACAATGGTGTGTTTTGTACGTCCAAGTTTAAGTTAGAAGGATAGGGAA
AACGCGGGAAAAAAATTCATGGGCGGAGGACACAGCCATGGTAGATGTAA
AAAAGTAGTGGTGGTAAGGTTTTGGACACTATAAACACCTCCGTCACTGT
TTAGTTTGCCCAGGACTTACTTCTGTTTCTCAAATTTATCCCCTCTCCCA
AATTATTCCCTTTTTGTGATTTTGTGTAGACGATAGGACCGTTTAAGTCA
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TAAAATTTAGTGCTAGAGGCACGGTTCCCTAAATCCTCCAACCCTTACCA
CCGCGAAGCTAGTGGTGATTTAATGTATTGAGAATCTACTTGATGGGTTT
GCTTTCAAAAAAACTTTTAAATTTGTTTGGCAATCAAGAGTTCATTAAAA
TGCCATCTGATTATATATGGAAGTTAGAAGGAAATAAATTACACCATTTT
AATGAAAAATGTTAATGCTTCTTAATGAAGTTGGTTTTCTATTCAAACTC
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TTGAAAACGAGGACAACAATAAATTTATGCATCTCAAAAAGTGTGTATTA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000020 | supercontig | sc0000020:383816..405142 - |
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0005515 | protein binding |
GO:0005520 | insulin-like growth factor binding |
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0005576 | extracellular region |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0001558 | regulation of cell growth |
GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
Category |
Term Accession |
Term Name |
biological_process |
GO:0001558 |
regulation of cell growth |
cellular_component |
GO:0005576 |
extracellular region |
molecular_function |
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insulin-like growth factor binding |
molecular_function |
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protein binding |
Blast
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