TCONS_00002623 (transcript) - C. hemisphaerica

transcript sequence

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AACATCTAACTAAAGATTTTTTGATGATAAAGGCAACTAATCaacaaaaa
aagatcaaatcaTTGAAGCGTAGCCTTGAGTCCATGAGAACCTTTGTTAG
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AGTCCTATCCACTTGCTTTGGGAACAACAGAAAAAGCAGGTGTCATTGGA
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TACCCATAACACTGGATTCAACCCTGATGTATTAGAGAATCTACTTCGAT
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AAGATAAAATCTGGTATTGTCTACAGTAAGAATTCTGGCAAGATTGTTGG
ATTTTGTGATCTCGGAGATATCAATAATGAGATAACCTGTTTTGATCGCC
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AAACATTATTGATGGGGTTGTTTACTCGACGATCAATAAGTTCGACCCAA
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GGCGGCTCAAGTTTTAAGCAAATCAGTTGCTGATGCCATGGAACAGCACA
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GACGTTTGGATTGGTTGGAGACAAACTTTCTCAAATTCTTGAACGATTGG
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GTTTTGACCGACCGCTTTAATCAAGATCCAATTGAAGAACATTTTGGTAA
GCAAAGAGCAAGACTTGGTGGTTGTGACAATCCTAGCCTAGGTCAATATG
GATCAAGTGAAGGAAAACTGATAACTGCGAAGGATCAAGCCATTCTTGTC
ATGCGTGGTAACAGTTCTGGTAggaataaagtaaaacaaaaacctCAGAT
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ggaagaagaaaaaagatgacgatgatgatggtCTATTTGGAAATTTAGCA
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ttttcttgCTTAAAATCAATATATAATGGATCTTTTAGGGCAATTTGCCA
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protein sequence of TCONS_00002623-protein

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K

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AACATCTAACTAAAGATTTTTTGATGATAAAGGCAACTAATCaacaaaaa
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TCAATTGGTTGAAAGTGAAGGATGTGCTGTAGAGAACAATCTATTGAAAG
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ataaaagtttcaattttctttgcttttacCCAAAAATATTCAACTTTTGA
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TCCACTTGCTTTGGGAACAACAGAAAAAGCAGGTGTCATTGGAAAACAAA
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AACACTGGATTCAACCCTGATGTATTAGAGAATCTACTTCGATTAACAGA
GAACCAGCAACATTTGCATGTTGGTCTTGTGCATGACGAAATGAAGATAA
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tttttttgatttgacaaTCATTATCTGATGAAACCTTTTTGGTGTCTTTT
TAGTAGAATTGGTTTGTAAATGTGGAGACTTTTCATATTTCTAGGTGTGG
TTTGTTGTCAGTGATGGGGCTTCACCAAACAGGAAGTTTTACAACTACCA
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AGTTCGACCCAACTCGtcgaatttattttatttgtgaCGTTCCTCACTTA
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CAGAGAACTCTTTGTAAGAATATCATTTAgtatgtttcaataaaaactca
TTAGTGTTTTCCCCCTCTGTTTTGTTGTCTAAATCGAAATACCTTATAAT
CACTGGATCAAAATTAAGAAAGGTACTATCATACAATGAGGCTGAAATTG
AGAATgactttgttttattttacatttaaGCTTGATGGGAAAGAGATTAG
CTGGCAGCATGTCATTGGACTTTTGGAATACGACGTTGGTATAGATCGTG
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ACACCAAGAGCCAGGATGAATGTTGCCTTGGCGGCTCAAGTACGTATTTT
TGAGGAGccataaaaatttgatttcagaATTTTAGACAAAACTTTTCACA
CAAAACGTTTTAATATTCAGTTGTAATTAAACTGTCTCTACTATTGATCC
CTAGCTTATACACATGTCTCTTGTTTTAGGTTTTAAGCAAATCAGTTGCT
GATGCCATGGAACAGCACAACCCTGATGTTACTGTCTCGACCAGAAAACT
ATTCCTTAAAATAGACGAATTTTTTGGTATCATGAACGTCAAATCTACAG
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AACCCTTTAAAACAAGATGGACGTTTGGATGTAAGAATATATTTATATGA
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CCCTCAAACTCTAACTGGATTACGAATTACTGGTATTTATATTTTCTGCA
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taaaagaaaattaagaatGTGCCTTTCCCCTCAAACTCTAACTGGATTAC
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TTGCATGAAATTACGTTACTGATAACATAATTTCTCTACTTGTTTAGTTC
ATTCTACAATCAGATTGATTCCGATACTTCTCAAAGAACCGGGAATAGAA
TTCGTTTTGACCGACCGCTTTAATCAAGATCCAATTGAAGAACATTTTGG
TGAGTAAACACATTCTCCTCAAAACAGTAAACTTTCGTTGAGACTCACCG
CTCTTATTTTTCAACACCTGGAATTGCTTTGAAACAAATCTAACGAGGGC
TGTTATTGATTGTTCTCATTTTTGACACTTTGAGTCCCTTACACTCATAT
AATTAtctcaaaatattgaaagataTACTACTTTCTTGAAGGTAAGCAAA
GAGCAAGACTTGGTGGTTGTGACAATCCTAGCCTAGGTCAATATGGATCA
AGTGAAGGAAAACTGATAACTGCGAAGGATCAAGCCATTCTTGTCATGCG
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aagaaaaaagatgacgatgatgatggtCTATTTGGAAATTTAGCAAAATG
ACTTTTTAATTGCACGTAATcaaaggaaaaaattaaaatgataatttttc
ttgCTTAAAATCAATATATAATGGATCTTTTAGGGCAATTTGCCATTTCT
ATCTTTTGTTTCAGTCTCTTTTAATGCTTATTTCATTGCCTTAATTCTTG
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GAGTAAACACATTCTCCTCAAAACAGTAAACTTTTGTTGAGACTCACCGC
TCTTATTTTTCAACACCTGGAATTGCTTTGAAACAAATCTAACGAGGGCT
GTTATTGATTGTTCTCATTTTTGACACTTTGAGTCCCTTACACTCATATA
ATTAtctcaaaatattgaaagataTACTACTTTCTTGAAGGTAAGCAAAG
AGCAAGACTTGGTGGTTGTGACAATCCTAGCCTAGGTCAATATGGATCAA
GTGAAGGAAAACTGATAACTGCGAAGGATCAAGCCATTCTTGTCATGCGT
GGTAACAGTTCTGGTAggaataaagtaaaacaaaaacctCAGATTAACAT
TCATGACATGACACCTCTGCCAAAACGTCCAAAAACCGAAcaaaggaaga
agaaaaaagatgacgatgatgatggtCTATTTGGAAATTTAGCAAAATGA
CTTTTTAATTGCACGTAATcaaaggaaaaaattaaaatgttaatttttct
tgCTTAAAATCAATATATAATGGATCTTTTAGGGCAATTTGCCATTTCTA
TCTTTTGTTTCAGTCTCTTTTAATGCTTATTTCATTGCCTTAATTCTTGT
ACTTTGTCAGCcattttggttttatttttcattagacttatatatgtata
agaattttCAGTGTTTTCAGGAACATTTCGAACCATTAATTAAGAGACTA
GCAAACTATGAATAGCACCATCaagatatttttttgctttcacatacaaa
aaatacacattttttataagcaaccgagttgctaagggc

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000021:446381..451419+

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tcaaaataacaaaaattacgAAAGAATCAAAAGTGATCGGAAATCCTTCT
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GGATCTGAGCAAGTTTGGGGATCCTACTTACACTTTTGCTTTCATTGATA
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CAATATTAGGGCTAGAATTGAAAATGATAACTTATCAGGTGTGGATGACC
TCACAACGATCCGTGTCAAAGATTGTGAGTTGATGGTGAGGAATGATGCT
ATGAGGTGCCAGCCATGCATAAAATACCGCCAGTATTTGCATAATACTGT
TTATCGGCGCTCAATGAGTCCAGAAGTACCATCCAAATTCACTGCAAACA
AACATCTAACTAAAGATTTTTTGATGATAAAGGCAACTAATCaacaaaaa
aagatcaaatcaTTGAAGCGTAGCCTTGAGTCCATGAGAACCTTTGTTAG
TCAATTGGTTGAAAGTGAAGGATGTGCTGTAGAGAACAATCTATTGAAAG
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AGTCCTATCCACTTGCTTTGGGAACAACAGAAAAAGCAGGTGTCATTGGA
AAACAAACGGACTATGAGATGGCACCCTGTGATGCTTCGATGGTGCATAT
CCATTTACCTTAAATCTTCTGGAACATATGAGCATCTACGAAATTCTGGT
TTTTTGGTCCTGCCATCCAAAAAAACCTTGGATAAATACGTCAACTTCAC
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ATTTTGTGATCTCGGAGATATCAATAATGAGATAACCTGTTTTGATCGCC
GTGTAACTAACCAAGACGAGCATCCTCCTATTGCTACTCACGTACTCACT
CTAATGGTCCGTGCCATTAACTTTCATCTCAATTACCCTGTCGCCTATTT
TGCAGGAGCTGGTGTCAAGGGATATGAACTGTATCATATCATTTGGGAAG
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CTCGtcgaatttattttatttgtgaCGTTCCTCACTTAATCAAAACTACA
CGAAATTGTGTAGCAAATTCACATGCTCATCAAAATACCAGAGAACTCTT
TCTTGATGGGAAAGAGATTAGCTGGCAGCATGTCATTGGACTTTTGGAAT
ACGACGTTGGTATAGATCGTGATGCACCTGGATTTCATCAAACTAAACTG
ACTGTTGAACATGTGCGTTTGACACCAAGAGCCAGGATGAATGTTGCCTT
GGCGGCTCAAGTTTTAAGCAAATCAGTTGCTGATGCCATGGAACAGCACA
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GACGTTTGGATTGGTTGGAGACAAACTTTCTCAAATTCTTGAACGATTGG
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aatGTGCCTTTCCCCTCAAACTCTAACTGGATTACGAATTACTGTTCATT
CTACAATCAGATTGATTCCGATACTTCTCAAAGAACCGGGAATAGAATTC
GTTTTGACCGACCGCTTTAATCAAGATCCAATTGAAGAACATTTTGGTAA
GCAAAGAGCAAGACTTGGTGGTTGTGACAATCCTAGCCTAGGTCAATATG
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ATGCGTGGTAACAGTTCTGGTAggaataaagtaaaacaaaaacctCAGAT
TAACATTCATGACATGACACCTCTGCCAAAACGTCCAAAAACCGAAcaaa
ggaagaagaaaaaagatgacgatgatgatggtCTATTTGGAAATTTAGCA
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TTGATACCGGTTTTGTGATCGGGTTCAGAGTGGAAGTGGAGATCGATGGC
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TTTAAAATGTCTACCTGAGGTAATTGATTTGGAAAATGCCTTGTTGATTT
TTGAAACGCTAAGTAAGTGCAAACTTTGTCAGGGAAATGATGACTTTGAG
AAACTTATTAATGAAAAAGTTGATCCTAAAGAAAGTTCTTTTAAGGACAA
GCAAGGCAATATTAGGGCTAGAATTGAAAATGATAACTTATCAGGTGTGG
ATGACCTCACAACGATCCGTGTCAAAGATTGTGAGTTGATGGTGAGGAAT
GATGCTATGAGGTGCCAGCCATGCATAAAATACCGCCAGTATTTGCATAA
TACTGTTTATCGGCGCTCAATGAGTCCAGAAGTACCATCCAAATTCACTG
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caaaaaaagatcaaatcaTTGAAGCGTAGCCTTGAGTCCATGAGAACCTT
TGTTAGTCAATTGGTTGAAAGTGAAGGATGTGCTGTAGAGAACAATCTAT
TGAAAGAAATATGCAACAACGTAGTTTCAACAAATGATTCACCTTTTGAT
GAGGACAGTCCTATCCACTTGCTTTGGGAACAACAGAAAAAGCAGGTGTC
ATTGGAAAACAAACGGACTATGAGATGGCACCCTGTGATGCTTCGATGGT
GCATATCCATTTACCTTAAATCTTCTGGAACATATGAGCATCTACGAAAT
TCTGGTTTTTTGGTCCTGCCATCCAAAAAAACCTTGGATAAATACGTCAA
CTTCACTACCCATAACACTGGATTCAACCCTGATGTATTAGAGAATCTAC
TTCGATTAACAGAGAACCAGCAACATTTGCATGTTGGTCTTGTGCATGAC
GAAATGAAGATAAAATCTGGTATTGTCTACAGTAAGAATTCTGGCAAGAT
TGTTGGATTTTGTGATCTCGGAGATATCAATAATGAGATAACCTGTTTTG
ATCGCCGTGTAACTAACCAAGACGAGCATCCTCCTATTGCTACTCACGTA
CTCACTCTAATGGTCCGTGCCATTAACTTTCATCTCAATTACCCTGTCGC
CTATTTTGCAGGAGCTGGTGTCAAGGGATATGAACTGTATCATATCATTT
GGGAAGCCATCCGAATTTTAGAATTCCTTGACTTCAAGGTGTGGTTTGTT
GTCAGTGATGGGGCTTCACCAAACAGGAAGTTTTACAACTACCACAAAAG
AAAGGAAAACATTATTGATGGGGTTGTTTACTCGACGATCAATAAGTTCG
ACCCAACTCGtcgaatttattttatttgtgaCGTTCCTCACTTAATCAAA
ACTACACGAAATTGTGTAGCAAATTCACATGCTCATCAAAATACCAGAGA
ACTCTTTCTTGATGGGAAAGAGATTAGCTGGCAGCATGTCATTGGACTTT
TGGAATACGACGTTGGTATAGATCGTGATGCACCTGGATTTCATCAAACT
AAACTGACTGTTGAACATGTGCGTTTGACACCAAGAGCCAGGATGAATGT
TGCCTTGGCGGCTCAAGTTTTAAGCAAATCAGTTGCTGATGCCATGGAAC
AGCACAACCCTGATGTTACTGTCTCGACCAGAAAACTATTCCTTAAAATA
GACGAATTTTTTGGTATCATGAACGTCAAATCTACAGTGGCAGGAATTCA
CACGAACAAAGAAAACTTGAAGCCGTTCAAAAAACCTAACCCTTTAAAAC
AAGATGGACGTTTGGATTGGTTGGAGACAAACTTTCTCAAATTCTTGAAC
GATTGGCAAGCAGAAATAAAAGCAATTCCTGATGTTGACGataaaagaaa
attaagaatGTGCCTTTCCCCTCAAACTCTAACTGGATTACGAATTACTG
TTCATTCTACAATCAGATTGATTCCGATACTTCTCAAAGAACCGGGAATA
GAATTCGTTTTGACCGACCGCTTTAATCAAGATCCAATTGAAGAACATTT
TGGTAAGCAAAGAGCAAGACTTGGTGGTTGTGACAATCCTAGCCTAGGTC
AATATGGATCAAGTGAAGGAAAACTGATAACTGCGAAGGATCAAGCCATT
CTTGTCATGCGTGGTAACAGTTCTGGTAggaataaagtaaaacaaaaacc
tCAGATTAACATTCATGACATGACACCTCTGCCAAAACGTCCAAAAACCG
AAcaaaggaagaagaaaaaagatgacgatgatgatggtCTATTTGGAAAT
TTAGCAAAATGACCAAGCATTCTACTTCTGACTCTCTACCAATTTTCCAA
GCTCACTCAGATACTGCATGTAATATTTGTAATTTGCCAACAGTGCGCCA
TACATaagggattcaaaataacaaaaattacgAAAGAATCAAAAGTGATC
GGAAATCCTTCTAACACAAATATTTCTTCGCTAGCTGAAGCCGCAAAACA
ATGCAATTTAGTGGATCTGAGCAAGTTTGGGGATCCTACTTACACTTTTG
CTTTCATTGATACCGGTTTTGTGATCGGGTTCAGAGTGGAAGTGGAGATC
GATGGCAGATGGAATTTATACCATGGAAAGTACTTGATTAAAAAGGATCA
TAACATTTTAAAATGTCTACCTGAGGTAATTGATTTGGAAAATGCCTTGT
TGATTTTTGAAACGCTAAGTAAGTGCAAACTTTGTCAGGGAAATGATGAC
TTTGAGAAACTTATTAATGAAAAAGTTGATCCTAAAGAAAGTTCTTTTAA
GGACAAGCAAGGCAATATTAGGGCTAGAATTGAAAATGATAACTTATCAG
GTGTGGATGACCTCACAACGATCCGTGTCAAAGATTGTGAGTTGATGGTG
AGGAATGATGCTATGAGGTGCCAGCCATGCATAAAATACCGCCAGTATTT
GCATAATACTGTTTATCGGCGCTCAATGAGTCCAGAAGTACCATCCAAAT
TCACTGCAAACAAACATCTAACTAAAGATTTTTTGATGATAAAGGCAACT
AATCaacaaaaaaagatcaaatcaTTGAAGCGTAGCCTTGAGTCCATGAG
AACCTTTGTTAGTCAATTGGTTGAAAGTGAAGGATGTGCTGTAGAGAACA
ATCTATTGAAAGAAATATGCAACAACGTAGTTTCAACAAATGATTCACCT
TTTGATGAGGACAGTCCTATCCACTTGCTTTGGGAACAACAGAAAAAGCA
GGTGTCATTGGAAAACAAACGGACTATGAGATGGCACCCTGTGATGCTTC
GATGGTGCATATCCATTTACCTTAAATCTTCTGGAACATATGAGCATCTA
CGAAATTCTGGTTTTTTGGTCCTGCCATCCAAAAAAACCTTGGATAAATA
CGTCAACTTCACTACCCATAACACTGGATTCAACCCTGATGTATTAGAGA
ATCTACTTCGATTAACAGAGAACCAGCAACATTTGCATGTTGGTCTTGTG
CATGACGAAATGAAGATAAAATCTGGTATTGTCTACAGTAAGAATTCTGG
CAAGATTGTTGGATTTTGTGATCTCGGAGATATCAATAATGAGATAACCT
GTTTTGATCGCCGTGTAACTAACCAAGACGAGCATCCTCCTATTGCTACT
CACGTACTCACTCTAATGGTCCGTGCCATTAACTTTCATCTCAATTACCC
TGTCGCCTATTTTGCAGGAGCTGGTGTCAAGGGATATGAACTGTATCATA
TCATTTGGGAAGCCATCCGAATTTTAGAATTCCTTGACTTCAAGGTGTGG
TTTGTTGTCAGTGATGGGGCTTCACCAAACAGGAAGTTTTACAACTACCA
CAAAAGAAAGGAAAACATTATTGATGGGGTTGTTTACTCGACGATCAATA
AGTTCGACCCAACTCGtcgaatttattttatttgtgaCGTTCCTCACTTA
ATCAAAACTACACGAAATTGTGTAGCAAATTCACATGCTCATCAAAATAC
CAGAGAACTCTTTCTTGATGGGAAAGAGATTAGCTGGCAGCATGTCATTG
GACTTTTGGAATACGACGTTGGTATAGATCGTGATGCACCTGGATTTCAT
CAAACTAAACTGACTGTTGAACATGTGCGTTTGACACCAAGAGCCAGGAT
GAATGTTGCCTTGGCGGCTCAAGTTTTAAGCAAATCAGTTGCTGATGCCA
TGGAACAGCACAACCCTGATGTTACTGTCTCGACCAGAAAACTATTCCTT
AAAATAGACGAATTTTTTGGTATCATGAACGTCAAATCTACAGTGGCAGG
AATTCACACGAACAAAGAAAACTTGAAGCCGTTCAAAAAACCTAACCCTT
TAAAACAAGATGGACGTTTGGATTGGTTGGAGACAAACTTTCTCAAATTC
TTGAACGATTGGCAAGCAGAAATAAAAGCAATTCCTGATGTTGACGataa
aagaaaattaagaatGTGCCTTTCCCCTCAAACTCTAACTGGATTACGAA
TTACTGTTCATTCTACAATCAGATTGATTCCGATACTTCTCAAAGAACCG
GGAATAGAATTCGTTTTGACCGACCGCTTTAATCAAGATCCAATTGAAGA
ACATTTTGGTAAGCAAAGAGCAAGACTTGGTGGTTGTGACAATCCTAGCC
TAGGTCAATATGGATCAAGTGAAGGAAAACTGATAACTGCGAAGGATCAA
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aaaacctCAGATTAACATTCATGACATGACACCTCTGCCAAAACGTCCAA
AAACCGAAcaaaggaagaagaaaaaagatgacgatgatgatggtCTATTT
GGAAATTTAGCAAAATGACCAAGCATTCTACTTCTGACTCTCTACCAATT
TTCCAAGCTCACTCAGATACTGCATGTAATATTTGTAATTTGCCAACAGT
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