TCONS_00002744 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00002744
Unique Name	TCONS_00002744
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2751

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at sc0000021:1043278..1055467-
coding sequence from alignment at sc0000021:1043278..1055467-

transcript sequence

>TCONS_00002744 ID=TCONS_00002744|Name=TCONS_00002744|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2751bp
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TTTACTTTCCATTACTGATGATgaatgtttgaagatctttgtTCATCTTT
ATGGAAGATGCTTCCAGCTTGGCAATCAACTCAGTGATATCCAATACGTG
GAGGGCGCACCACCTAACGCCAACCCGCCCCATTGTCCAGATTTCATTGA
TCGTGTATCATGGCAGTGTATACCAAGGTCTCATATCGATCAAAAAAGAA
CACTTAATTGCACACGACCGGGATTCTTAAATCCAGgagaaaaatttgaa
tcacaGTGTGTTGTTGATATTGAGAAACGACAATTGAAATATGATCTATC
AGATATGAACGATAAATGTAAACGACCTGAAggctctgatgacgtcatta
aggAGAACCAATTATTGTTCATGTCAGAATTTGGTCTGTCTTCAAAAAGG
TTATTTGAATACAATGAAGATGTTAGGTGGCATCAAGACGCAATCGAAAA
AATTCACAAGACGTTTCGTTTCTTGGATCTATTCATTTGTGTGGCTGCTT
TCATTGCGCTGCTGGTTCTGATtCCTATGAAGAATGAAAGAGTGATGCTA
CATCGACATTTATTACTAGCTTTTGCGTTCAATGATATCATTATACTTTA
CATGCTGTTCAATTATTCCAGTAACACCAATGCTAATTTTTTCACGGCTA
TGCTGAACCGAAGCATTCAGgaagatAACGTGGACTGTAGCATGGTACAC
GTCGTGCATTATTATTTCTTCTTGTCACAAATTACTTGGATGTTTAATGA
GCTGTTCTATCAATTCCGACAAATCTTCAACGTCTTTACAGTTCACAAGT
CTTACATCTGGTTGTATATTGCCGCTGGGTGGGGATTTCCATATTTTGTT
GTGTTTGGTTTATATTTGCCCTTCAATTGGCATAATCCACCTGTTGATCA
ATTTCTAAGCTGTTGGTCATAccattccactcacgaatataaTTTCATCG
TTACTGGTCCAGCAATATTTCTACTGGCGttGAATGTGTTCATGATGACA
TACTTAATGTGGATTATTTGGTCCAAACTTCGCATTAATCCAACCAAGGA
ATATGTCAATTCAAGAAAATCGGCGCGCAGTTTTTTAGTTATTTTGGTGT
TACTTGGTGGTGGCTATCTCTTCACAATTTACGGACCTTCCGGATGTATT
GAATTCGATTATTTCATCATTCTGGTTTTACCCATCCAGGGTTCTTTGAT
TGCGATTTTTCACGTGTTTTTGAGTCGAGAAGTGACGGACTCGATCAAGA
GACGTTTTAGACATTGGCAATCAGATGCTGAGttccGAAATAGTGAATAC
TCGCAAGGACGTCGTATCAGCTTGTTCGGGTACCGAAGAGGTAGTCGTAA
CACGTCTATCACAACTCTATCATCCTTCCCTCCATCAAGAAAAACGTCTC
GCAAAGAAAGTACTATATCGTTCCCGTCAATAATCGAAAGTGATATGGAG
AACTCAACCGCAACTACAGTCTACAAGAACCAAAATGCGACTGATAATTC
TATAGCATCCAGAAATGTAGCCGAGGACGGCTTTCTTCCACCAGCACCAC
CCCCTATTCTAGGACCCATGTCTTATATACGTGACCGAGATTTCGATTCT
ACAGGTGGTTTTGAGAAGGTGGATGTCAATATGAATCGGACTGATTCTTT
GACAACACCTTCTGGTGATATTGATGCAGAATCTAAACTGAACACTGATG
ATCTGAACAATAATATAAGTTTTCAGAATGATGCTTTTGTGCAGGAGGAT
GAAAGTAGCGTCGTTGGTTAGTGGCATTTACGCTGATAACTACACGTGTT
TTATGttgtaaaaaaattgataatttgtGGCATAGAGGAGACTTGTATGG
TGATGGGTGGCAGTGACCTAAAATGCCGAACGAGATTGCCGGCTGGTGAA
AGGTTGAGACATATTTTGCTCCATAATGTTGGAATTTGATAATGGAAAAA
TATTCTATTCTGCAGTGGGTGTTTTATTTGGTGTGGAGCAAAAAGCAAAC
CTTATAAACTTCACTTGTTAACTTCAGATTTGCTTATGCTATGGTCATAA
TCTACAATGGTCGTCACAGTTACACAGTTACAAAGAAAACACGACAATAT
TCTATGTATGAAAAGTTTTTCATGACACGTTTGTAACGAAATGTAATGTA
TCGACGACTCTCATATGAATCATTCAATTTTTCGAATATTCCCGTTATCG
GTTCGGAAAGATACCTGATACTGGTACATATGGGAATTGATAAAATGACT
TTTGTTTATGTACACTCGTTAGCAGAGAAGATACGCAAAAGCCTAAGGAC
AACATTTCAATGaaatataagcccgaagggctagaatcgaatctttaacc
tttctcaggcaagaaaaagtggaGCCTTGAATATACgtcgtatttttgat
gacggattggaCTTAGTAATTTGTTTGTTTCGGAGTGGTATATTTTTGGT
TATGAGTGGTTTATTTTTCAATCcggaatttgtataaaaaccacacgggc
cgctcaaggccgcgcaactttggtacgatttaagtggcttcaaatcctac
caaggagattcgattctagcccttcgggcttatacttcattgcttAACTT
ATTAACAAGTAGACaatgagaattaaaaaaaatttgtaatatTTTCTAAG
CACTGTATATAGAAAGTTTCGGATTCAATttaagaaattatatttttgaa
a

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00002744-protein

>TCONS_00002744-protein ID=TCONS_00002744-protein|Name=TCONS_00002744-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=606bp
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EGAPPNANPPHCPDFIDRVSWQCIPRSHIDQKRTLNCTRPGFLNPGEKFE
SQCVVDIEKRQLKYDLSDMNDKCKRPEGSDDVIKENQLLFMSEFGLSSKR
LFEYNEDVRWHQDAIEKIHKTFRFLDLFICVAAFIALLVLIPMKNERVML
HRHLLLAFAFNDIIILYMLFNYSSNTNANFFTAMLNRSIQEDNVDCSMVH
VVHYYFFLSQITWMFNELFYQFRQIFNVFTVHKSYIWLYIAAGWGFPYFV
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TGGFEKVDVNMNRTDSLTTPSGDIDAESKLNTDDLNNNISFQNDAFVQED
ESSVVG

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000021:1043278..1055467-

Legend: exonCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00002744 ID=TCONS_00002744|Name=TCONS_00002744|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=12190bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000021:1043278..1055467- (Clytia hemisphaerica)
GCGTGTTATGCGCAAGGACAGCCAGAGATAAAAGATCTTTTGGATTGCTC
TTTACTTTCCATTACTGATGATGAATGTTTGAAGATCTTTGTTCATCTTT
ATGGAAGATGCTTCCAGCTTGGCAATCAACTCAGTGGTAAGTCTGTACTT
TCGTGAAACGGCCGTAGCTTAAAGGTAGAGCATCCAGCTGCGATGCGCAA
TGTCGTGAGTTCAAACCCTAGGCTGGGTCATACAAAAGCTTTCGTACAAA
ATTGTACTTGATGCCTCTCTGCTCTATGCTCAACAATTAAGGGAAGGATC
AAAAGTAAGTGGAGCAATCCAAGGAGAAAGAGTGATGCCCTCCCTGACTT
TCGGATAGTCGGCTATCGAAAGATGAGTCTTCCGGTCGCCTCCCTCTGAC
TGTGTTTGCAGACTTACTTCTCAAAACAATGAGCATTAGAATATGTATAT
AAATTATCTCAGATTTAATTATTTTCAATAGTCTTCCGAACAAACGCCAA
AAGGTTGTTGATTTTAGAGGACTTTCAATTTAGGCCAAATTGTACCTTTC
AGGACCGAAGAATAATACCAAAAATGAGCATTTTCGGGTAAAATTTTAAA
AAAATCAGTCGATGACCTTGGATGAGATTCTGCTAAGTTTGAACTGCCTC
GAAAATCAAAAAATAAACAGAAGATGGATATTGTTTTAGCGGTCAGTTAG
CACAGAAAAGTGCTGTTCCAGAAATAGTCTGTACCCCCTTTGTTGAGGAG
ATGTGACGTCCAGGGTAGTCAGGCAAATAAAAAATCCAGGGGGTCTGGCT
TTTCGGGTGGTCAGTTAAATGAGGTGGAAAATCTAGGGTGATCAGTAAAA
CGAGGTCGAAAATCCAAGTAGGTCCAAAAAATTTTCAGAAAATTTAAGGA
GGTCACCTTTCCCAATAAGACCTCCTCAACATATAGAGGTACAAATCTTC
CCTGAAACAGCCCTAGTCAAAATACATGCATTTTCTGTTTTAGATATCCA
ATACGTGGAGGGCGCACCACCTAACGCCAACCCGCCCCATTGTCCAGATT
TCATTGATCGTGTATCATGGCAGTGTATACCAAGGTCTCATATCGATCAA
AAAAGAACACTTAATTGCACACGACCGGGATTCTTAAATCCAGGTAAGTG
CTGTATCAATGGACCAATTAACTGTGATGTCATTATGTTTTGGTTTGTCT
TGTTTAGTCTAGCGAATTTGCATTGAAAAACAGAATAATGGAGACAAATG
CCCTCAAGCTTGCCCCCAATTTTTGTCTCTTACCTTTGTTTTCAAGCTGA
AAATCAAAATAAAAGTGAGACTTAGCGAGATCACAAAAACAAACCAAACT
AAGTGAGAAGTGGTCAATAAAGATCTCTTAAGTTTGATCAAGTCATATTA
TTTCCTCCATTATGGAAAGACTTCTTGATAACTTGAGTGTTTGTTTTGTG
CATACTCTTAGGTTCCAAATAAACGGGGGGGTTCGAATAAACGGNGAAAA
AAATTTAATTGCGATATTGACACTTTTTTTTTGTTTGGAGTTAGTGCACA
AAGGTTTCTAGACGACTAAAATTTACTTTTTTGCTTTATTTCTAATATAT
CTGAATTAGTCGTCTAGCTTGCTAGACTACCAAAAAAGTCAACATTCTTC
TCTTCCGTGTTACTCTTAGGTTCCAAATAAACGGGGGGGTTCGAATAAAC
GGGGGGGTTGGAAAATTTTCTACATTTTAATAAACGGGGGGGACCTAATT
GCCGGGGGGTTGGAAATTGTACTTTTGAAACCCAAAAATAAGGTAAAAAT
AGGCTATAATCAGGCTATTTAGAGCAAAATAAGAGGCCTTCACTTTGACA
GCTGAAAATATTCTTACAGATTAATAAACGGGGGGGTCCTAATAAGGTCC
GGGGGGGTTGGAAAATTTTCGAAAAATTAACAAGCGGGGGGGGCCCGTTT
ATTTGGAACCTAAGAGTACTTTAATATGATCTTAAGGATCTTATAAGAAA
GTTGTGTAACTTAGCAAATATCTGCTGCCATTATGGTAGAAAACATTCGA
ATTTAAAGAGTCGATCGCTTACCGAAACCGAATGCTCCCAGCTGGCACAC
AATGTTGCTTCAACGTTAATTTGATGTTCACAACCAACGTCCATATTACA
TGAACGTTAAGACGACGTTGTGTGCCAGTTGGGCTTCCTTTCATAATGAC
GACCAACCTCGTTCCTTGCGCGTTATCAGTTTCTTGTTGTTTCCTGATGG
CGCTAGGGTATTCTCTGGCGTCAATCAGTAACGTAAATAAAGCCTGATAT
ACACGGGGACGAGATTTAATGACTACTTACTGAAAGATCCACTAATTAAC
TTTTAGGAGAAAAATTTGAATCACAGTGTGTTGTTGATATTGAGAAACGA
CAATTGAAATATGATCTATCAGATATGAACGATAAATGTAAACGACCTGA
AGGCTCTGATGACGTCATTAAGGAGAACCAATTATTGTTCATGTCAGAAT
TTGGTCTGTCTTCAAAAAGGGTGAGTGTCTTTTTAAATTCATTTTAAATA
CAGTCGACGCTCTCTAATTCGAGATTCTTCTATTCGATAGGCTCCTTTAT
TCGATGAAATTTAAAGTCCCCGTCAACAAGAATCTCTCACAAACCACGCT
CTAATATCCGATAAGCTCTCTTATTTGATTAAAATCCGATTCCCCTTGAA
GATCGAATTATAGAGCGTCAACTGTTTAATTTTGACCTATTTGAAATTTC
GTTCGTAATTTTCTTGACACATTTGTTGCGATTTCCCTCCATTGCGTGCT
CGTCGGCTCTGCTTTTAAACATACTGGAAATGTAGGCATGAGTTCGAGCC
GGAATATCCGAAAACCGAGAGTTCGAGACAAATTTTAGCAGGATGTGGGC
AGCGTACCATTTTAAAAACATTTTCTACTATTTATTAGAGGAAAATTCAT
GACTCCACATCCGTGCCAATTCAATGTGAAAAACAACCTGAAACTTCGGA
GCTGATAAACTAAATTCAAAATACCTATAATCATGGTCGAAAAATATTGA
GATTTTAGTGTGTTTTAATGTTTTTCAGAATTTAAAATTCGGGCGAGAAT
TCCTTTTTTAGCACTTCCACTTTCTTTCTTTGAAATTTCGATTTTGGAGG
GGTTCAGTGGCTTCTAGGCTATATTTCAAGCTTTATTGGAGCAAATTTGA
GCTTTTAAATCCTGAGAACCTAAAAGCTTAAGTCTCATGTGGTTAAAACT
CTCTACTTTCCAACTGTAGTTTAACGCGTTTAAAAACCATTTGCGCGGTG
TTTAAATGTCTCAAATGTTTTGTCCATGATTGTAGTTTTCTCTTTTATTC
ACACAACTACAACTTCGGCTTTTGAAGTCAGGTGTATATGAAATCCTCTT
CCTTTACCGTTTTTCTTTTAGTTATTTGAATACAATGAAGATGTTAGGTG
GCATCAAGACGCAATCGAAAAAATTCACAAGACGTTTCGTTTCTTGGATC
TATTCATTTGTGTGGCTGCTTTCATTGCGCTGCTGGTTCTGATGTAAGTA
TAGTTAGGTCTCCATAACTCGAACACCCACGCTGGGGAACACAAATTTGT
TCGAGTTATGGAAATTTCGAGTTATGGAGTAAGGTTTACTTTGCATTGTT
AACTAAACGGATGAGAAAACTTGTTCGAGTTATAGAGGTGCGAGTTAAAG
AGGTGCGAGTTAAAGAGAATTTACTGTATCATGTCATCGCTGATAAGTTG
ACTATCACACCTCTGTCTCACTGCCCCGCTGGAGCATTTTCCCAAAGGCG
ATAGAAGTTCTATTGTTCCAAGCTCACAAAACGAACTGGGATGATTTTGG
AGTACGATTTTTCTATTGAGTTTCAAAAGGGGATGAAATCAAATTCAATT
TCCCAGTGGGCTGAAATTGCAAAATCTTTTTTTCACCGGGAAAAAGAGTT
TGACCAAAATTTTCAGTGGGACTTCCAGTGGGTCTGTGACGCTACACGCT
TTTTTTTATAAGAATACACTTTACAAGAATGTCCATAATGAAAATGGCCA
AAAAATTAAGAATAATGCTAAGACCATCACCATCATGGAATTTTGCTACT
CAAGCTAAGAATGCCATTTTTAGAGCATTTTTAATTATAAATTGTCAATT
ACCCCCAAGGAAGGCTCACTCCTTTCACAAAAAAGCCATTTTATGCTTGA
GACGTATGTACTAAATGTTTAATCTAGTCTAAATTAGGATCCTAACTTAA
GAATGCTGTAAGAATATTTTAGGATGATTTTCCCAAAAAAGTTTAGAATA
AAATATAAAATCGCTTTTTACTGGGGAATAATTGACAATTTACAGCTAAA
AATATGCTTTAAAATTGTCGTTCTTAGGTTTTCATTTTCACTTTCTTTTT
TATTTCTAGTCCTATGAAGAATGAAAGAGTGATGCTACATCGACATTTAT
TACTAGCTTTTGCGTTCAATGATATCATTATACTTTACATGCTGTTCAAT
TATTCCAGTAACACCAATGCTAATTTTTTCACGGCTATGCTGAACCGAAG
CATTCAGGTATGATAATATATTTTATATGTTTATGAATATGTCAGAAAAA
AAACACAAAATCGCTCTGGAGTCATATAATTTGAGGCATTTGCCTGAATC
CATGAATTTCGTTTTCAAATTCAACAAAATTCTAAAAAATTCGAAAGATC
TTGCCTAATGTGTTGTTTGAATCCCATTTCCATCTAAATGTATAAGAGAC
CGGGTAGCTCAGTCGAAAGAGTATTTGTCTTACAATCCAAGAGCTGTGGT
CTTGCGCGATTGCCCCGATCACTGTCCACTCAGCGAATGAGTAGCTTGGA
TTGGGTAATCGGATCTATACAGTAAGTTACTGGGAGCTGAGAGTAGGTGT
GGTACTCCACCCTAGCCATTTAACCTTTCATGTCTAGCGCAAAAAGAAAA
GGGGATAGAATGCCTTACTCCCAGCTCCGCCGACAACTACCAGATGAATA
TACGTACTTTACTCATAGATTTATAAAGCCCAAAAGGCTAGATATCGTAC
TTTTGCTGAAAAATGTGCCGTAGTTAGCTAGGAAATTCTACCTAGGTCAC
GTGACATTACATCAGAATTTCAGCGTTTGACCAATCAGAAGCTTCGCTGG
TTTTCGAAAACAAAAGCAACAATGTTTTTTTCGATATTCAATTTTGTTTG
CCTGCGGTGGCTTAAAGCACGACATCTAGCCCTTCGGGCTTTATATAAAT
CTATGACTTTTTCTCACTTCTATCCGAGGCTAAAAACTTTATTTTAACCA
ACTGATTTCTTTATTTTTATCAATAGGAAGATAACGTGGACTGTAGCATG
GTACACGTCGTGCATTATTATTTCTTCTTGTCACAAATTACTTGGATGTT
TAATGAGCTGTTCTATCAATTCCGACAAATCTTCAACGTCTTTACAGTTC
ACAAGTCTTACATCTGGTTGTATATTGCCGCTGGGTGGGGTAAGTGACCT
CTGATATTGGGCTATTCCCGGAAAAAAATTGTACTTCCTATGTTGAAGAT
ATCCATTTTGGAAAGGTAACCCCTTGGATGTTTTTTTTTCGATTTTCAGG
ACCCTCTTGGATTTTCAATCTCTTTTTACTGACCATTCCGGGTTTTTACA
TTCGAAAAACGAGACCAACATAGGGGTTTACAAACCATTTCTAGAATAGC
CTATTTGATCTCTAGGAAAATTTTAAAGTATTAGGGCGTTGATACCACTT
TTTGTGAACGCTATTAGAATCCCAGCTGGCACACAACGTCTTTTCAACGT
TTATCTAACGCTCACAACGTCCATGTAACGTTAGATGAACGTTGAAACAA
TGTTGTGTGCCAGCTGGGATAATAAAAAAAGTGAACTAAGGGACTTGCGA
GAAGTTTGAAGGGTCATACATGGGACCCTTAATTATTGTCTGCACATACG
GTAGTTTTCGGATCAAGTCCCCTGCTCCCAACTGGGCACACACTATCTCA
GAATAATCTCTTGTGCATACAGCATTGTTTTGACTTTCATTTTTTAGGAT
TTCCATATTTTGTTGTGTTTGGTTTATATTTGCCCTTCAATTGGCATAAT
CCACCTGTTGATCAATTTCTAAGGTATTCTATTTATTTTGCGCTAGAGCG
CCAGATACGATTTGTATCTCCCCGGGGGGGGGGCTAGGGTTGAGGGATGA
CACGGGTATGTGCAGCCCAGACCCCTCAAATCCGACCCTTTTGCCAAGAA
AGTGACCCTTAGAGAGACTTTTTGAAAAACTTTCTCTCAAATTTGCCAAA
AAAGAAACACTTTAAAAATTGAGATCCTTTAGAGAGACCCTTTTGATTTT
TACTGTACTTTACGACCCTTAGAGAGACTTGAGAAAGTTGAAAATCCGAC
CCTTGGGCCGCACATACCAGCACCTATTTTTGCCCACGTTCACCCTCGGG
TATCTCCACATTTCATATTTTGTTACAGTAAATATTAATTTAACACAACG
TTGCTTCAACGTCCATCTAAAATCCATCTAGTTTAAATAATAGACGTTGT
CTTGAGGTACCAGTAAGGGTACAATCTTCTTTTTAAAAGAATAATAAGAC
TAAAAGAAATAAGTATGATATAAAAATGATGGTTAGCCTGAACTTGTTGA
ATTTCAAACAAATTAAAAGGTTCAAATTAATAAATATAAGGTTTTGAACC
TTAAATTCTCAGTTTTGCCCTAGAAATAATAACAAAAACAATTTTAAGAT
CAAAGTGTCAAAAGGGAAAAAACAGCCGAGCAAGCCTCATCAAAAATTTA
CTGGTTCTTATAAAAAAGGTACCTATTCTACACAATTAAGTCCAATTAAG
TTCAAGCTATACATTTTTCTGACTATCATTCTTTCTCTTAGCTGTTGGTC
ATACCATTCCACTCACGAATATAATTTCATCGTTACTGGTCCAGCAATAT
TTCTACTGGCGGTAAGTGTTTTTACTGTAAACACCCCATGTAGCCCCATG
CATGATCATTTTTCTGGAATTTATTTAATAGTAAGCAAAGAAAAAAGTTA
TATTTGATTTCACTCTCAAGGTTTTAGTCCGAGGGCAGTCTTGCCCCAGT
CTTGCTTGATCCTGAAGAGTAGTATTTAAGTTTGAAATTTTGCTGATTCA
ACATAAAAGAGCCAAAATCGCTGAAAACCCATAAATCAGCAGAATTTCAA
ACTCAAATAAAATATCTCAAGATTTAGCCATTGAAGTCCTATAAACTAAT
CGATTGATTTCTTCGAGAACTTGTTTACCTATTTGACTTTTTTGCGTTTC
CAGTTGAATGTGTTCATGATGACATACTTAATGTGGATTATTTGGTCCAA
ACTTCGCATTAATCCAACCAAGGAATATGTCAATTCAAGGTTAGTATTTC
TGTGTAAGTTGCCGCGGGGCTGAAGCATTGAATCTTCAATCTTGTTCAGG
CAGGACAATTATTATTATTTATATTTATTTATACAGGTTAGTCTGCGTCA
GTAAATATACAATATATACAAATTAATTATATACAAGTATAATAAATACT
GTTATCAATGAGAGACCTGTGTGAAAAACGAAAGAAACAAAAAAGAGATA
AGTCAAGGGGCTAAACAAAGGCGAAAAAGCTAAAAAATCGGATTGAAGAC
TGGGTATTACTGTGATGATTGAGCTCTTCTCACAGCCCCACTGGGACTCC
TTCCCAATTAAAGAAATTATTCAAAATATCAACCCCAGTGGAAAATTATA
CTTCAATTTTTGTCCCCGTTGAAAATATTCAAATCAACAAATCCTCAAAA
TATTGTGCTATTTTTCCCATCCCCGCTGAATTTTCTGAGTTGAAAGCAAT
GGAGTTCAAATCCCAAGCCGTTAAAAAATGGGAGTATCAATCCCCATCGA
TTTTCAGTCCGTTATGTTTACCCCACTGGCTGAAAAAAATCCTACCGGGT
TTATGAGAAGGGGTTTGTCGTGGTAAGGAAAGAAGTGGGTTCACTCCTCA
GAAGGCCTTTAAATTCAATGTTTTAACGCCTCCTGTTTTCCAAGGAAAGT
TTAACATGAGGTTCATTTAAAATTCAGTGAGGTGAAAGTATAATTCTTGA
GAGAGTGAGGTCTCCTTTGTCTCCTCGGCTTGTACAGGTTATGCTTCTTA
TTTTTTCTGAAGGTTGGCTGAGTATTTATGAATATAGAAATGAGGCCTGC
TTCTAATGCTGACATAGCAGAAGAAACAAAAGGATTGCTCATAATTTAAC
CTTGCACGGCGCAGGATTGGGGCAGTTGTTCTTCATTTTGTTAAAAAGAG
CTTTGTAAACAATTGGCAGGAGATACGTTAATGATAATGTTCTCTTAATT
TAATGTCCCGTTTTTTTTAAGTACGAATTGGGCTTTTCAATTTAATTCCA
TGCAGGGGTTGGACAAACCTTTTCACCTTTTCAAGTCGAAAAAAATTTGT
TGAAATGTGTAGCTACGCCCTAATTCTTTTTCATACCTAAAAAGCGAGGG
TTGACGAACTAAACTATTCTTTACCCTCTGGAAAGTTTAGAATAACTTTC
TACCCGCTTGAAAAAATGAAAAAAAATACCCCCTGGAAATTTTACCCGAT
TACTCTGGAAATGTTCATCCCCCCCCCCCCCCCTTGAAAAAAAAAAAAAA
AAAGCCCCCCCGGAAATTTTTCCCGATTTCCGTGGAAAGCTCCCCCCCCC
CCCCCCCCTTGAAAAAAAAAAAGAAAAAAACACCCCCCTGGAAATTTTTC
CCGGATTATCGGGAAAATTTTTCCCCCCCCCCCCCCCTTTATGGATATAA
AATGGAATGACGCATTGAATGAATAGTTTTTGTATAGAAATCATTATTTC
ACTACCATATTTACTTCTCTAGAAAATCGGCGCGCAGTTTTTTAGTTATT
TTGGTGTTACTTGGTGGTGGCTATCTCTTCACAATTTACGGACCTTCCGG
ATGTATTGAATTCGATTATTTCATCATTCTGGTTTTACCCATCCAGGTAA
TAAACTACTTACATTCTCTGAAGTTAATCTGTTTGAATTATAGTCATCTT
GATTTTGTAAACTTCAACTGAAATTTTAGCCACAATTTACGTTTTTATGT
TTCTTTCTTCTACAATGTATATTGCGTTTTTGTTACAGATTGTCATGGTT
AGTCGCTAGTTTGTATTTTCTTCAGTGTATATAACTACACTAAATTTCCT
GAGCCAGTAAACTTTGACTCAGCCTATCTATAGGCTTTTGATAGGTTGTT
AGAATGTTTTTAATATGCTTAATTTAAAATTACTTAGAGTCATTAGGTCA
GTTGGCAAACGGTTTGGTATTTTTAAAATTTGACAAGTCGCCTAAATACA
ATATTTTCACAGATGATAGAATTACGAAACACTGCCCAGAAAAACAGTTA
TTAGCCTTCTTTAAATGTGATATTCAAGGGACCAAAAAGCCGGCAGCCGA
GGTAGTGAATTGTGTCACTTCGTAGGACACCCCTTAGATCAGGGCAAATT
TTTTATATTAAGCTCCTAATAGGGTGTAGAATTGACAAAAAAAATTGCCT
TTTGAATCTCCTGCAGTTTTCGAGTGAATCGATTTTTAGTTATTCGAAAA
ACGCCAAAAACGTCAAAAATGCCATTTCTCGGCACCAAGTGGTAGAAACT
TAACAAATAACCCCATTTTCTTTATCTACTTTTCACGCTGAATCCGTTGG
TGGCCTCAGATATTTCATTTTCAGACTTCGAAAAAACCGTTAGTAAAGGA
TAAGTTCTATCGATTAACGAAAAATCGATTTACTCGAAAACTGCAGGAGA
TTCGAAGGGCAAATTTTTTTTGCAATTCTACACCCTATTAGGAGCACAAT
ATCAAAAATTTGGCCTGATCTAAGGGGTGCCCTACGAAAACCATTTTTAA
GGCCTTTTCTGAATCTCGGACGCTGGTCTATACAGAGAGTATTTCAGCCT
ACGGGGCTGATGTTTTGGTTAGAATTAACAGAGATTCGAATTAGAAAATA
GGTGACTGTATTCCGAAATAAGCTGATGACGTGTCTTTGACTAACTTAAC
GGACCTATTCACAGTCAATTAATATTCGAAGAGCTAAACAAGTCCATTTG
ATTTGTATTTTATAGGGTTCTTTGATTGCGATTTTTCACGTGTTTTTGAG
TCGAGAAGTGACGGACTCGATCAAGAGACGTTTTAGACATTGGCAATCAG
ATGCTGAGGTAAGAATGTTGTATTGTATTTATTACAAGCTTCATCCACAG
ATTGTCGTGATGGGACCTCGACATTACCTTTATGTCAGAATGTAAGAGAA
TAAAGCCGAAAAAGTTCGAAGATTTTTAAAGCTACATTGACGTACCAACA
TACCCGGGTTATTAATTTTGGAAAGATTTTCGGACACTTCCTCCGTTTAT
TTACCTTATCGGGGAAAACTTCGTCGGGGAAAAGTGACGAATATTTTTCC
CCAACGAAAATTTTTCCCGACGAAGTTTTCCCCGATAAGGTATTTTGAAA
AAATTTCCAGTTATTAAAAGCTGAATTACTCTAAATAACTTGTTTTGGTC
TGTTATATCCTTATTTTGGGTTTTTAAGGGGTACAATTTCGAATCTCCTG
GCAATCAGATCCCCCTTTATTCGAACACACCCTTCCCTATCATTCGGGAC
CTTACAGTATTGTGTCATATTTGTAAACTTCCTCAAACTTACTAATGCAA
TGCTTCTTACTTGTTTTAAGACCCTTAAGCTTGCGTATAAAGCTCTTCTA
AAATTGTTTTTTCATTTTCAGTTCCGAAATAGTGAATACTCGCAAGGACG
TCGTATCAGCTTGTTCGGGTACCGAAGAGGTAGTCGTAACACGTCTATCA
CAACTCTATCATCCTTCCCTCCATCAAGAAAAACGTCTCGCAAAGAAAGT
ACTATATCGTTCCCGTCAATAATCGAAAGTGATATGGAGAACTCAACCGC
AACTACAGTCTACAAGAACCAAAATGCGACTGATAATTCTATAGCATCCA
GAAATGTAGCCGAGGACGGCTTTCTTCCACCAGCACCACCCCCTATTCTA
GGACCCATGTCTTATATACGTGACCGAGATTTCGATTCTACAGGTGGTTT
TGAGAAGGTGGATGTCAATATGAATCGGACTGATTCTTTGACAACACCTT
CTGGTGATATTGATGCAGAATCTAAACTGAACACTGATGATCTGAACAAT
AATATAAGTTTTCAGAATGATGCTTTTGTGCAGGAGGATGAAAGTAGCGT
CGTTGGTTAGTGGCATTTACGCTGATAACTACACGTGTTTTATGTTGTAA
AAAAATTGATAATTTGTGGCATAGAGGAGACTTGTATGGTGATGGGTGGC
AGTGACCTAAAATGCCGAACGAGATTGCCGGCTGGTGAAAGGTTGAGACA
TATTTTGCTCCATAATGTTGGAATTTGATAATGGAAAAATATTCTATTCT
GCAGTGGGTGTTTTATTTGGTGTGGAGCAAAAAGCAAACCTTATAAACTT
CACTTGTTAACTTCAGATTTGCTTATGCTATGGTCATAATCTACAATGGT
CGTCACAGTTACACAGTTACAAAGAAAACACGACAATATTCTATGTATGA
AAAGTTTTTCATGACACGTTTGTAACGAAATGTAATGTATCGACGACTCT
CATATGAATCATTCAATTTTTCGAATATTCCCGTTATCGGTTCGGAAAGA
TACCTGATACTGGTACATATGGGAATTGATAAAATGACTTTTGTTTATGT
ACACTCGTTAGCAGAGAAGATACGCAAAAGCCTAAGGACAACATTTCAAT
GAAATATAAGCCCGAAGGGCTAGAATCGAATCTTTAACCTTTCTCAGGCA
AGAAAAAGTGGAGCCTTGAATATACGTCGTATTTTTGATGACGGATTGGA
CTTAGTAATTTGTTTGTTTCGGAGTGGTATATTTTTGGTTATGAGTGGTT
TATTTTTCAATCCGGAATTTGTATAAAAACCACACGGGCCGCTCAAGGCC
GCGCAACTTTGGTACGATTTAAGTGGCTTCAAATCCTACCAAGGAGATTC
GATTCTAGCCCTTCGGGCTTATACTTCATTGCTTAACTTATTAACAAGTA
GACAATGAGAATTAAAAAAAATTTGTAATATTTTCTAAGCACTGTATATA
GAAAGTTTCGGATTCAATTTAAGAAATTATATTTTTGAAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000021:1043278..1055467-

>TCONS_00002744 ID=TCONS_00002744|Name=TCONS_00002744|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=21852bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000021:1043278..1055467- (Clytia hemisphaerica)
TTCCGAAATAGTGAATACTCGCAAGGACGTCGTATCAGCTTGTTCGGGTA
CCGAAGAGGTAGTCGTAACACGTCTATCACAACTCTATCATCCTTCCCTC
CATCAAGAAAAACGTCTCGCAAAGAAAGTACTATATCGTTCCCGTCAATA
ATCGAAAGTGATATGGAGAACTCAACCGCAACTACAGTCTACAAGAACCA
AAATGCGACTGATAATTCTATAGCATCCAGAAATGTAGCCGAGGACGGCT
TTCTTCCACCAGCACCACCCCCTATTCTAGGACCCATGTCTTATATACGT
GACCGAGATTTCGATTCTACAGGTGGTTTTGAGAAGGTGGATGTCAATAT
GAATCGGACTGATTCTTTGACAACACCTTCTGGTGATATTGATGCAGAAT
CTAAACTGAACACTGATGATCTGAACAATAATATAAGTTTTCAGAATGAT
GCTTTTGTGCAGGAGGATGAAAGTAGCGTCGTTGGTTAGGGTTCTTTGAT
TGCGATTTTTCACGTGTTTTTGAGTCGAGAAGTGACGGACTCGATCAAGA
GACGTTTTAGACATTGGCAATCAGATGCTGAGAAAATCGGCGCGCAGTTT
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CCTAACGCCAACCCGCCCCATTGTCCAGATTTCATTGATCGTGTATCATG
GCAGTGTATACCAAGGTCTCATATCGATCAAAAAAGAACACTTAATTGCA
CACGACCGGGATTCTTAAATCCAGGCGTGTTATGCGCAAGGACAGCCAGA
GATAAAAGATCTTTTGGATTGCTCTTTACTTTCCATTACTGATGATGAAT
GTTTGAAGATCTTTGTTCATCTTTATGGAAGATGCTTCCAGCTTGGCAAT
CAACTCAGTGTTCCGAAATAGTGAATACTCGCAAGGACGTCGTATCAGCT
TGTTCGGGTACCGAAGAGGTAGTCGTAACACGTCTATCACAACTCTATCA
TCCTTCCCTCCATCAAGAAAAACGTCTCGCAAAGAAAGTACTATATCGTT
CCCGTCAATAATCGAAAGTGATATGGAGAACTCAACCGCAACTACAGTCT
ACAAGAACCAAAATGCGACTGATAATTCTATAGCATCCAGAAATGTAGCC
GAGGACGGCTTTCTTCCACCAGCACCACCCCCTATTCTAGGACCCATGTC
TTATATACGTGACCGAGATTTCGATTCTACAGGTGGTTTTGAGAAGGTGG
ATGTCAATATGAATCGGACTGATTCTTTGACAACACCTTCTGGTGATATT
GATGCAGAATCTAAACTGAACACTGATGATCTGAACAATAATATAAGTTT
TCAGAATGATGCTTTTGTGCAGGAGGATGAAAGTAGCGTCGTTGGTTAGG
GTTCTTTGATTGCGATTTTTCACGTGTTTTTGAGTCGAGAAGTGACGGAC
TCGATCAAGAGACGTTTTAGACATTGGCAATCAGATGCTGAGAAAATCGG
CGCGCAGTTTTTTAGTTATTTTGGTGTTACTTGGTGGTGGCTATCTCTTC
ACAATTTACGGACCTTCCGGATGTATTGAATTCGATTATTTCATCATTCT
GGTTTTACCCATCCAGTTGAATGTGTTCATGATGACATACTTAATGTGGA
TTATTTGGTCCAAACTTCGCATTAATCCAACCAAGGAATATGTCAATTCA
AGCTGTTGGTCATACCATTCCACTCACGAATATAATTTCATCGTTACTGG
TCCAGCAATATTTCTACTGGCGGATTTCCATATTTTGTTGTGTTTGGTTT
ATATTTGCCCTTCAATTGGCATAATCCACCTGTTGATCAATTTCTAAGGA
AGATAACGTGGACTGTAGCATGGTACACGTCGTGCATTATTATTTCTTCT
TGTCACAAATTACTTGGATGTTTAATGAGCTGTTCTATCAATTCCGACAA
ATCTTCAACGTCTTTACAGTTCACAAGTCTTACATCTGGTTGTATATTGC
CGCTGGGTGGGTCCTATGAAGAATGAAAGAGTGATGCTACATCGACATTT
ATTACTAGCTTTTGCGTTCAATGATATCATTATACTTTACATGCTGTTCA
ATTATTCCAGTAACACCAATGCTAATTTTTTCACGGCTATGCTGAACCGA
AGCATTCAGTTATTTGAATACAATGAAGATGTTAGGTGGCATCAAGACGC
AATCGAAAAAATTCACAAGACGTTTCGTTTCTTGGATCTATTCATTTGTG
TGGCTGCTTTCATTGCGCTGCTGGTTCTGATGAGAAAAATTTGAATCACA
GTGTGTTGTTGATATTGAGAAACGACAATTGAAATATGATCTATCAGATA
TGAACGATAAATGTAAACGACCTGAAGGCTCTGATGACGTCATTAAGGAG
AACCAATTATTGTTCATGTCAGAATTTGGTCTGTCTTCAAAAAGGATATC
CAATACGTGGAGGGCGCACCACCTAACGCCAACCCGCCCCATTGTCCAGA
TTTCATTGATCGTGTATCATGGCAGTGTATACCAAGGTCTCATATCGATC
AAAAAAGAACACTTAATTGCACACGACCGGGATTCTTAAATCCAGGCGTG
TTATGCGCAAGGACAGCCAGAGATAAAAGATCTTTTGGATTGCTCTTTAC
TTTCCATTACTGATGATGAATGTTTGAAGATCTTTGTTCATCTTTATGGA
AGATGCTTCCAGCTTGGCAATCAACTCAGTGTTCCGAAATAGTGAATACT
CGCAAGGACGTCGTATCAGCTTGTTCGGGTACCGAAGAGGTAGTCGTAAC
ACGTCTATCACAACTCTATCATCCTTCCCTCCATCAAGAAAAACGTCTCG
CAAAGAAAGTACTATATCGTTCCCGTCAATAATCGAAAGTGATATGGAGA
ACTCAACCGCAACTACAGTCTACAAGAACCAAAATGCGACTGATAATTCT
ATAGCATCCAGAAATGTAGCCGAGGACGGCTTTCTTCCACCAGCACCACC
CCCTATTCTAGGACCCATGTCTTATATACGTGACCGAGATTTCGATTCTA
CAGGTGGTTTTGAGAAGGTGGATGTCAATATGAATCGGACTGATTCTTTG
ACAACACCTTCTGGTGATATTGATGCAGAATCTAAACTGAACACTGATGA
TCTGAACAATAATATAAGTTTTCAGAATGATGCTTTTGTGCAGGAGGATG
AAAGTAGCGTCGTTGGTTAGGGTTCTTTGATTGCGATTTTTCACGTGTTT
TTGAGTCGAGAAGTGACGGACTCGATCAAGAGACGTTTTAGACATTGGCA
ATCAGATGCTGAGAAAATCGGCGCGCAGTTTTTTAGTTATTTTGGTGTTA
CTTGGTGGTGGCTATCTCTTCACAATTTACGGACCTTCCGGATGTATTGA
ATTCGATTATTTCATCATTCTGGTTTTACCCATCCAGTTGAATGTGTTCA
TGATGACATACTTAATGTGGATTATTTGGTCCAAACTTCGCATTAATCCA
ACCAAGGAATATGTCAATTCAAGCTGTTGGTCATACCATTCCACTCACGA
ATATAATTTCATCGTTACTGGTCCAGCAATATTTCTACTGGCGGATTTCC
ATATTTTGTTGTGTTTGGTTTATATTTGCCCTTCAATTGGCATAATCCAC
CTGTTGATCAATTTCTAAGGAAGATAACGTGGACTGTAGCATGGTACACG
TCGTGCATTATTATTTCTTCTTGTCACAAATTACTTGGATGTTTAATGAG
CTGTTCTATCAATTCCGACAAATCTTCAACGTCTTTACAGTTCACAAGTC
TTACATCTGGTTGTATATTGCCGCTGGGTGGGTCCTATGAAGAATGAAAG
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TTATACTTTACATGCTGTTCAATTATTCCAGTAACACCAATGCTAATTTT
TTCACGGCTATGCTGAACCGAAGCATTCAGTTATTTGAATACAATGAAGA
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TCTTGGATCTATTCATTTGTGTGGCTGCTTTCATTGCGCTGCTGGTTCTG
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TCTGATGACGTCATTAAGGAGAACCAATTATTGTTCATGTCAGAATTTGG
TCTGTCTTCAAAAAGGATATCCAATACGTGGAGGGCGCACCACCTAACGC
CAACCCGCCCCATTGTCCAGATTTCATTGATCGTGTATCATGGCAGTGTA
TACCAAGGTCTCATATCGATCAAAAAAGAACACTTAATTGCACACGACCG
GGATTCTTAAATCCAGGCGTGTTATGCGCAAGGACAGCCAGAGATAAAAG
ATCTTTTGGATTGCTCTTTACTTTCCATTACTGATGATGAATGTTTGAAG
ATCTTTGTTCATCTTTATGGAAGATGCTTCCAGCTTGGCAATCAACTCAG
TG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_001475	XLOC_001475	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00002744-protein	TCONS_00002744-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000021	supercontig	sc0000021:1043278..1055467 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
4.51117	3.85918	1.61217	1.45234	0.419936	0.276311	0.333514	0.510504	0.746128	0.649892	0.763972	0.926424	16.2436	13.454	1.22787	1.27646	0.92761	1.22158	20.1747	19.0305	1.7603	1.08619	2.18091	1.96518	1.89268	2.14372	0.780282	0.709813	0.930074	0.982935

Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR000832	GPCR_2_secretin-like
IPR017981	GPCR_2-like

Vocabulary: **Cellular Component**
Term	Definition
GO:0016021	integral component of membrane

Vocabulary: **Molecular Function**
Term	Definition
GO:0004930	G-protein coupled receptor activity
GO:0004888	transmembrane signaling receptor activity

Vocabulary: **Biological Process**
Term	Definition
GO:0007186	G-protein coupled receptor signaling pathway
GO:0007166	cell surface receptor signaling pathway

GO Annotation

GO Assignments

This transcript is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0007166	cell surface receptor signaling pathway
biological_process	GO:0007186	G-protein coupled receptor signaling pathway
cellular_component	GO:0016021	integral component of membrane
molecular_function	GO:0004930	G-protein coupled receptor activity
molecular_function	GO:0004888	transmembrane signaling receptor activity

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00002744 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00002744 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00002744 (transcript) - C. hemisphaerica