TCONS_00003783 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00003783
Unique Name	TCONS_00003783
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2313

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000031:119638..138776-

transcript sequence

>TCONS_00003783 ID=TCONS_00003783|Name=TCONS_00003783|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2313bp
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ACGGAGGAGTTAAAACGCAACCTCAGAAGAAGAAGACATCAGCAAATGTT
TTTTAAGAGTTGTAACTACTAGATACCACACAAgcgcgaaaaattttttt
cttgtgatATTTTGTGATGAGTTTATTCGTTAGATGTATTATAAAGCTAA
GAGGAGAACATTGTTAAAAGATTTAAGCTATTGGTGCTGTGAAATTGTCG
TACGAAATTGTGGTTACCGATAAACTAAAGAGAGTTTACAAAAATTATCA
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TTAACTTATATTTGGGGTAGTATTAGAGAGCGAATGCAAAAATGCGAGTC
ATACAACAGTCTCAGCAGCAGATCGTTGATTTGAATACTTTTAATCCTTT
ATGTAAAGTCCAACAATCACTGGATGGTCAATTGTACGTCAAAATGATGC
TTCATCAAAACACAACACAGTACCAACAACCAACAGGTCACATGCAAGAA
CAAGTAAACGATCACCCAACACTCAAAAAATATATCGATGGATGGCTCGA
GTTCAAAGAGAAGAAGAAGGTCAAGGGAAGCAAGTACGAGAAGTATTGGT
TTGTATTGAAAGGGCAATTACTGGGCGGTGGAcagctgacgtcagcattt
ttattttgcttcaaagaTAACATGACGCATGAGAAGTCGAAGTTCATTGG
TTCAACGCAAATCGATATTATTGACCATTCAGTCGAGTTACACAAAATCG
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GGAAAAACAAAATTACAATTTAGGtcaCAAGACAACATAGAACGTGATCG
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AATTACCAAACTTGAACAATGGAATTCGGCCCAGTCCTCGAATCAAGCTT
GGTTCATCTATGCGTAAATTACCACGTGAATTGAAGGACGCTATGGTGGT
TAACGATCCGATGGTCATCAATAGAATCCATGGACGGGCATCGATGCCCA
ATATTTCAACACCACCAAATATTGCTTCGAGTATAACGCCACCTGTCAGT
CCAAGGACCAGCAACGAAAATGATTACAACCGATCACGTGACATACCATT
ACAACAATCACCACAGAATATCACATTGAATGGTAGAAGAATCGGCGAAG
TACTTGATAGTCgaagAGCAACGATAGCTACACCCTCTCGAGTTTCATTG
CTGGCAGAATCACGATCGACATTCAAGACATCTCTTGGGAATTGTCCTTT
CTATTACGGCCCAATGAGTCGAAGCGAAGCAGAAAATGAGCTAAAGTCGC
AACAAATAGGCAGCTATCTTCTTAGAGACTGTCAAAGTAAACGTGGTTGC
TTCACACTAACTTTCAAagATAAAGAGAAGATCAAAAACCACATGATTGA
ACCACAAGCAGGGAGcaataaatttcaatttaacGGCCCTGAGTTCACAC
GGATGTTTACATCTCCGGACGAAGGTGTTATTTATTACATGGATATGAAA
CGAAATCGAAATTTCAATCCCATCCCCTATATCAAGCGTCTTCCAGGAGA
TGGCCAAGAAGAGGATAATAGCTACATAGAAAGTGAAgAAATCAACCCAA
CAACAGATATACTTAAAACAAAGAAAGattttcgtcCACCAATGATGAAG
TCACCCTCATTACCAGAACAATACCATCCACCAGATCTGGACTACTCGTC
CATCGCACACCCATACCAAAATTCAATGTCTGCAAGAGAATCCTTCCTCA
ATATTGGTACATTGACTAAGGCTGCTTCTCTCACCCAACTCAGTGTACTA
GAATCACAACTGAAAAACGGCAGAAGAGTGTCAGCTATAGAACGCCCTAC
ATACGAGCGTCGGCTAACTAGTCAAAGTAGCCTAGACGACCATTATGTGG
AAACGGACTGTCTTCCAGTCTTTTCACCAACCAAGAAATCTCTACCTGCC
GAACCTCAAATGAATGATGACAAATCACCAAAAGTACCGACATACGCTAA
TTCACCGGCAAGTCCGAACGGTGAAGTCAACAGAAACAAGCGAAAAACAA
GTGGCTACAATGCGCCTTTACCACCAACTCCTGAGAAACCAGAATTCACC
CTGGGTTCAGTTCCTGATACTCCACAGGAAGATGATAATGGTTATATAGT
CACCGATTCCCCTGCTGTTTTCAGCGATTCCCCTGCTGGCTATGTTGTGA
TGGATAGCGGTGA

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000031:119638..138776-

Legend: exon

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>TCONS_00003783 ID=TCONS_00003783|Name=TCONS_00003783|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=19139bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031:119638..138776- (Clytia hemisphaerica)
CATGCTTCGAATACCACTACCTATTCTAGTACATTAGTTGAGACTTCATT
ACGGAGGAGTTAAAACGCAACCTCAGAAGAAGAAGACATCAGCAAATGTT
TTTTAAGAGTTGTAACTACTAGATACCACACAAGCGCGAAAAATTTTTTT
CTTGTGATATTTTGTGATGAGTTTATTCGTTAGATGTATTATAAAGCTAA
GAGGAGAACATTGTTAAAAGATTTAAGCTATTGGTGCTGTGAAATTGTCG
TACGAAATTGTGGTTACCGATAAACTAAAGAGAGTTTACAAAAATTATCA
CAGACATATTTATTGATTGATAGACTGGTGGTACCAGCTGTTAACAGAAT
TTAACTTATATTTGGGGTAGTATTAGAGAGCGAATGCAAAAATGCGAGTC
ATACAACAGTCTCAGCAGCAGATCGTTGATTTGAATACTTTTAATCCTTT
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TTCATCAAAACACAACACAGTACCAACAACCAACAGGTATTCTTCTATTT
TTTAATGTTGACCACCAAATTTTACAATACCGAGCTTATGTATGTGCGTT
TTTTCTGCAATGGTAACTGTAAGAATCTAATTTGACTACATCCTGACCAG
CTGGGATGACGGTAAACCAGCACTTTTTACCGTCCTTAATTTTGCGGGTC
AGAACTGTTGGTTATTCAAAATTGCTTCAGTTACTCTACCGTCCTCAAAC
GTGCAAATATATAATCTCGCTGATAAAAACTAGAATTTTCTTTTCAAATT
CTACTCTTCTCTTGCCATTAATTTCCAAGATTGCAGCTAGCCACAAACGT
TGTGTCAGTGGCAATGCAACGTGAATTCAATTTTATTGGCTTTGGATCGA
CATTGAGTTAGAGACACGGCCAAATAGGGACCTACATTCTCGCTCAGACG
CTCTCCATACATATAGATCATTCCATTCTTTATTTTAGAATTTAGTGAGG
GAGACCCATAGCTATTTTACTTTTCTCTGCAGCAATAGATTTTGAACTTT
TGAAATTTGAACCCAGACCTTTCTATATAGATCGATGAATTTATTATTGT
TTTTTTCGGCGCTTCGTACAGGGCTTTCTAGAAGAGATGAAAGTAAAATG
ATTATACTTTTAGATAAAGTTATACACGTTTGAGTTTACAATTTTACAAT
TTTGTATTACGCTTGTAGGTCACATGCAAGAACAAGTAAACGATCACCCA
ACACTCAAAAAATATATCGATGGATGGCTCGAGTTCAAAGAGAAGAAGAA
GGTCAAGGGAAGCAAGGTACCTTAAAGATTTCTTTCATATGTCTGACTTT
TTGAGGAACTTTTAGGAAATCCGTCATGCTTGGAAGTAAGAAAGAAACTA
TACCAATCTTATTTGGGAAAACTTCTGATTTGTCCATTAACATAATTTAG
CTCGGCAATGTTTGCATATCCATGACCGTAATTAACTCCTAAAGAGAGCT
GATGTTTTGCATAGATACACAAAATTGTATATAACTTTTTAAGAACTCTC
TGCTTGTTTTCACGGGGTCACTAAATCAAACTTACTTAGTTTGAATTTAC
CCTAAACCATAATTTTAGACGTAACAGTAGGAAACTTCAAAATAAATTAT
ATCTGAGAAAATTCTTTGTGATATCTTTGTAAACACTGTGGAGTCCTACA
ATGACTCAAACACGCACGGAAAACGCAAATTTGTTCGATTTGTGGAAATT
TTGTTTGTTAGAAGCCGTTTGTTGACATTTACTGAAGGCTACTTGTTCGA
ATCAAGAAGAAATTTAAGTTTATAGAGGATTAAGTTATGGAGGCTTTGAT
GCATATGATATTTGTTGCTTATTTGATTCGTTTTGAGGAGGAAGAAAGTC
AAATTGGTCATTATTCGACCATCTTGGTGATAGAAATCATCTCTAGGCAA
TAAAATGATAAATCTCGTTTATTCACTTCTTATACCCGCAACAAGTAAAA
GGTTGCATAAGAAATGGGTTACGTAATTTCATTCTTTCTACAAGACAAAT
ATATGTCCAGCCTTTTTTTCTCTTCTATGGATAAAACTTGATTTTTAGGA
ATGATGACCCGTCATTGCTTTTTCTATTTTCAACGAATCGGTTAAAGATT
CTTGTTGCCGATTTAAGTGATACTAAAATACAATACACTTTTTGAACCGG
TCAGGCGCGGTCAGGCGCGTGCCACTTTAATTTTTAATTTACCACCCTAA
ACTTGATCCAATCCTTTTTTTACACTTTTTTCTATTGTCTTTAGATGCGA
AAAATAAATTTGGACGGTTTTAGGGTGGCAAAACAGACAAAAAATGCCTG
CGCGGCAATTGGCGGCTACGGTCCAAAAATCGTATAAAGTTATCAATAAG
AGGAGGGTGTTTGGAAAATTTGATTTCATCCCCATCTGAAATTCAATAGG
AAAAAATGCACTCTGAAACCACCCCACTGGATTTTTTATGTAAAAACAAT
ATGATTTCAATCCCCACAGGAATTTCGAAAGAAATTTCACCCCCGGGAAG
AATTTCCTCCGGGGCTGTGAGACAGGCCTATTCATGAATGAACGTTAGAT
GAACATTGAAATAACGATTCATGCCACATGTAGAGGGTATGATGTTATCT
ACTGACATTATGGCAACATAACTAATCTTCTTCGCCCCCCCCCCTTCATT
TCAAAAAAAGCAAAATATTTTCAATAAAATAAATTGCTGATTCACTTTTT
ACTTTTAAAAACACGTCAAAATCTCATAATTATCCTTAATCTGTTCATTT
TACTTTAGTTTCAATATAGCCACACGTGACTTTTTACCATTTAGAGCATC
ACTGGTTGGTTAAAAACTCATTTATTCGCCTCAAAGGCTCGTTCTTTGTA
ATAATTACCCTTTATCTACTATAAAGTGTTCATTACTTGTACAGGCAAGA
TACCCATTAGAGTAGTTTTTACGACATCGTAAAACTGAGATTATTATGGT
TCACTTGAGTACCCAATTATTCGATTTTCCTTTCATTTTCACTATCTACC
GTATACATATTAATACTTCACCTTTTTCAATTCTGGAAGAAAAAGCAGGC
ATGGAAAGGTAATTCAAAAACTTAAATATACTTGTTTTTATAAGAATAAA
CTATATTTTTATAAGAACAAGTTGAGAACATTTTAAGGCCTTGCGAACTC
TATTACACCTGATTCCTTAGGGAAATGGAAAAAAAACTATATGGCGAAAA
CATACTCCATGGTGAAAATTAGAACATTTTAAGAACATTTTTAGGCTTCA
AATTGAGATTTTCGATGAAAAAAACGTGTCGAGGTGGGAAGCAGATTTTC
GCTTTCTACATACGACGTATCTGTACTTCACCTTTTTCGATTCGAGAAGA
AAAACCACTTCAAACATACAAAAGTAATTCAGAAACTTAAATACTGCAAT
AAAAAATTGAAAATTAGCCAAAAAAACTATTTTTAGATCAGACAATCTCA
GTTTGTTTCTGTAACTTTCTTTTTTGATTTTCCGAAATTTTGGCAAGCGG
ACAGAAACGTGCGCGTCATATGACACGGTATTTGTTGGAGAAAATGATTT
AATTTTTAGAAGCTGTCTATTAAAAAGTACCAATTATTATCCTCATTGCA
ATATATCTATCTATTTTCTTAATTCTCACCAATCAAAATTGAAAGTTTTA
AAATGCCATGTTTTTAGAATCAATCGAGAATTTTTCGTTACCGAATTATA
CTTAATTGGCAATGAATTAACACTATAATTGCATTTGATGGTAATGCTGA
TCAAAATACCACTGTTTTAAAAAACAGATTTAATGTACAAAGCATGAAAG
ATTTTTTCCTTGGACATGGACTTATCTCTTATTTATTTTGTACCTGGAAA
ATCAATCAGTCAAGCAATGCCTTTGGAAACTAACAAAAAGGAATTCTCAA
AATGTTGATGAATCTAATATAATTTTATGGAAAGCCTTCTTTTGTTCTTC
TATTTCCTGGCAAAGGGAGTTTTCAAAACAAAACAAAGATATTAAAGAAT
TTCCTATATTGATTTCTTTTTTGCCTTATTTATTTCCCGCTTTGGTTTAT
TTGTAAACAAAAACATTCCATGCCAAAATGACTTTTTCTTCCTGTTTTTT
GAATTAGTGTCTGAACAGTTGGCGATTGTTTGCCATAAAAAATGTTGAGT
CTCACAATTAGGCTGTCAATTGTCAAATGCAATGGAGTTTTCATAACTCG
AACCTCTACACTTTTTTTTATAAGAACAATGAGGCTCAAAAATGCCAAAA
AATAAGAACAATTTAAGAACATTGGAGAGGCTGAAGTTAGAGAGTTATAG
CAAAAAGAATAACTGGTTTCTAAAATCCTCTAAATACTAAAGTAAATAGC
CATCAAAACTTGTTTTTTTTACCTTAGAAAAAATAAGAACAAAATAAGAA
CAATTCAAGGCTCAAAGTGCCAAAAAAATAAGAACATCCGAGAAAAATTT
ACTGGTTCTTATAAAAAAAAGTGTAGCTCAAATGCCTCATTAACTCAAAC
AGACTCTATGGTCCCTTCAGTTAACAATGCCTTATGAGCCAATCTCCATA
ACCTGAAAACTTCTACAATTGGAACAACTTTCTGTTCCCCAGTGTGCCCG
TGTTATTGATACTGTGCCTTTTTTTATCACCTTCATAAAAGTGTTTTTTT
TAATCACGATTCTCAATTCTTTTAACAAAGTATGATCTTTCATGGAGAAT
CCTTTTAAAAATAGCAAAGATATTAAAAGCAACCAGAAATGCATACGAAG
CTGAATATTCAGGTAAAAAAGGTATCAGCTTCTTTGGCAAGACACAATAC
AAAGCATGAAGCCAATATGGGACCTTACCTTCCCCTTTTGGTTTTACCCT
GGACAAAGTTAAAGTTGTTATCTAATACGCTTATTGATATTTTTAATATT
TTGGGTAGTGTCTTCAAATTTTCAATGAAAAACATTTTAATTACTGTGGG
ATAAACTCATGATTTTAATGTTCTTTCCAGTGGTCACAGCCGAAAATTAT
TGCGGAAAAATTCAAGAATTCATTTTGCTAACAACTATCTTTTTTTGCAA
ATGATTTTCTTTACAATAATGAGGTCTAATTCTAATGATAGGGAAGTGAT
TATATTTGATTATCAGGTTTTCTGTTATGTTGGAAAGTAATCAATATCTT
TCTATGAGTGTGAGTCTAAAATATTGTTTTGTCGTAACATCATAATACCG
AAATTCAAGTCGAGTCTTTCTAATTCTATAACAAAAGGCTAAATAATTTA
AAGATTAGTGAAAACGCCCTTCTCTCACAGCTCCGGTGGAACTTTTTTCC
TCAGTGGGGATAAAAATTCGTTTTGAAATCCCAAGGTTGAAAAATCCAGT
GGGGATGCTTTTAAGAGTGCAATTTTTAAACATTAACTTTCGAGTGGGGA
TGAAATCAAATTAATTTGTCATTAGTTCAGACGTTCCAAAGTATTTTCCT
ACGGGACGGGGGATGAACTTTTTCCCAACACAGGGGTGTGAATAATTGGG
ATTTTCAAAGCTGAGAAGAAAAAATATCTTTACAATTCGACTGTGCTTCC
CCAAAGTTTAACCCAGAAGAACAACATTGCAGTTTTACTCACAGCGTTCT
TGTTCTTTTGATATTACTTGCATAGTAGAGAAGGCGTCAGCTCACAAACC
ACAAGTCTTCTTGGTTTGATTTTTTGCTTTTCCATGTTCTGTTCTGTATT
CTCATAGACCACTGTTGATTCCTTGGAAACAATGGAAAGGCTGTCTAAAC
TTAATATTCAAAAGTTATCCTCGTAAAATGATAAATCCATACTTCAAACT
TTGTTTTTAAGGAACCAGTATATATTTCCCCTGTTTATATTTCCAGTGTC
TTTTAGGGTTCGTGTCCTCGTTCTATGTTGAGTTATTTTTCAAGGGTCTT
AATATTTAAAAAGAAAGCAATGTCTTAGCCGAACCTGAAATCTGAGGCTT
AGATTGCGTTGTTGCTCAAAATTAAGCCATGTTCTTTTTTAAATAAGACT
GGGTATTAAGTACTTTCTGAGACGGTTCACTTACTGCACAAAAAGGGACG
TGCCAGGAACGGGACGTGACAGGAAAGGGACGTGACAGGAAAGGGACGTG
ACAGGAAAGGGACGTACAGGAAAGGGACGTGACAGGAAAGGGACGTGACA
GGAAAGGGACGTGACAGGAACGGGACGTAACTTCTTACAAGGATTTTGAG
TTACTGAAAATATCTAACATAATATTTATTTTTCTTTCCAGTACGAGAAG
TATTGGTTTGTATTGAAAGGGCAATTACTGGGCGGTGGACAGCTGACGTC
AGCATTTTTATTTTGCTTCAAAGATAACATGACGCATGAGAAGTCGAAGG
TAAGTTATTATCAAACTTTTTGGAAAATTACACCCCTGTCTCACAGCCGC
GGTGGAACTTATTCCCATAGTGGGAATAAAAGTTTCTACCGAAATCCAAA
TTGGGATAGAAATTCTATTGTTCTTGAGTAAAAAAGCCAGTGGTGATTTT
AGTTCAATTTTTTACATTGAAAATTAAATAGGGATGAAAATCTTTAACTT
TCCAGTGGGATGAAATTTGTAGGGCATTTTTCCCATCGGAATATGAAAAT
ATAAGCTAAGGCAATCTTGACGTGTAAAAATCGATTCCTTCTCATAAATT
AAATTCACTTAAGGAATCTCATTTATCAAATTTTCGCAATCAGCAAAAAC
TGAAACTGAATTTTGCGATCTTTGTCTGCCTAGTCATTTATTACTCAAAC
AGACAGATTGCATTTCAAATATCCTGTCAAGTTTGTGGTCCCATTAACCA
TACACTACGCCTACATGTTTAGCATATAATTAATAGGTGTAACAAACATT
TAGTGGATAGGAAATTATGCAAAATCTATTATATCCTGAGTTGATGAGCA
ATCTGGCTTTTTTTTTTGTCATCATGGAATCTTCGTTTTTTGCTGATTCA
TTTTTTTCCTACATGCTGACAAAATGTCGTCATTTGCTATTTTTGACCTG
CTGACGTAGTATCTTGGTTAATTCAAGGAGTAGAGACCCCGTTAAGATAA
TGTTAACACCGTCCAAATAGCAGTAGATTAAAATTGTTTCACCTGGGAAC
GCTGAAATAACGTTATATATCGGACACACAAACATCTAATATAAAACACT
AGATAAAGCTACTCTATCTTTTTCTAGCAATGGCAGTTGAAGAAAAATAA
TGCCCCATATTTGTGAAGACCACAGTTTGGTACCGGCAACTATAAGAAAT
AGCAAGTCTTTGTGGGAAACGAGGAGGCGAGAGAAAGCTTTTGATTGGTC
AAATCGCTGCCCGGGGGGTACTAGGGTTGACGGATGAGGGGTATGTCCTC
CGAAAACCAACCCTTAGAGAGACTGATTTTAGCTGAAAAGTTGACCATTA
GAGAGACTTAAAAAAAAATTTCTCCCATTTTTGCAAAAAGTCCTACCCTC
TCGAAAACAAAAGAAATTCCTAAAAATCGTGATTTTCCCGACCCTAGAGA
GACTAATTCAAAACTCTCCGATTTTCTCGACCCTTACAAAGACTTTGAAG
GGTGAAAAAACCGACTCTTACCGTCCACACATTCCCAGCACCCAATTTGT
ACCCCTCCCCGGGAATCGCTGTTACCAACTGTGGTCCATTCAGCAAAAAA
TGGTGCATTGTTTTGCCTCAGCCAGGGGTAGAGTTATTCTATTTGAGTGC
TTCATGTAGGATATCTGTGATAAAAAATGTTACTACATATTTCATGTTTA
AGTTGCATATGTGAAGGATATATGTTCTAAAGTAGAAATTGATTGGTAGT
TATAAATTCCAAACACAATTTGTGTGGGCACACCTATTTCCGGGTATTTT
ACTTAAAATCTCATTTACCACGGCTTTTTTCAAAAGGAAATTAGTAGTTT
CCTAACTGATGACAGTTTCCTAACTGATGATTATATAGATTTATCATTAA
CATTAATTTAATTTTGATTTATCATGACATTACGACAAAATGTACAACAA
AATGTATATTTTGATGTGCATATCAGTATTTCCTGATTGGAGCTTGTTTT
GCCGGTCTATTGCAAACTAGGAAATTATACAACTTAGACTTAAAGTTTTG
GAAATGACTCATCGGAGAGCCACGAGTCTCTACCTAACGAACTTAAGAAG
CCAAAAAATTCGAAGAATAATTTAGGTTTCATATTTTGCGTTATAAAACC
TTAAGAAATTGAGAAATAACTCGAGACTCAAGAAGCAAAATAGCTCGAAA
GTTTAAATGTAAAAAATAAGCGAGTAAAAACCGTGAAATAATTTAAAGTT
ACGAAAAAAGTTGAAGATGAATTGAGAGATGAAAAGAATTAAATTAAGTA
AATAAATTGAGAATGACAGCATTATGACATCATGATTTTTCAAATATCAC
GGCATAACTCAGTTTTCTGTAACTTAGTTTTAATAACTCGGTGAAAATAA
CTCGGAATTTCTTAGTCCTTTTCATGAATTAACATGAACCTTTCCTTTTT
GTTTCAACAGTTCATTGGTTCAACGCAAATCGATATTATTGACCATTCAG
TCGAGTTACACAAAATCGAAGGAAATGAACAGAAACCATGGAAATGTGAA
TTCTCAGTCAAAGTTAACGGAAAAACAAAATTACAATTTAGGGTTAGTAT
GATTTGATCTTCATCTTTAAATATCTTTTCAAGATGGACGAAGAATAATC
AACATATTTTTGTACCTTCTATCATTCTGGTCTTTGGGACTAAATAATTC
TAGAAATAGGAAACCTTTGACAAACTAGAAATAGCAAAAGAATTTTTCAA
CATTTGCACTAACACGACTCTGAAAGGAGAGAAAGTTGTTCTTTCTTTGT
TTGAAATACTTTGTGAGCAAATACCAGGATATTCTAATTATTACTAATCG
AACAAAACTTCCAAACGCCATATCTCAGTATTCTGATTCCAAGCTTCACT
CAGTTTTCCTCATACCTTCCGACGAGTCCTTATTTCCGTATCTGTTCGAG
TTGTTAGTTATTTATATATACACACACAGCATATACATTATATAACACTT
TTCTTGTAAGAAGAACCAATATTAAACCCTTAAACTTAGAGTCAGTTGGG
TACCCTCATACAAATTTCGCGAATCGACCTAATTTTATCCACTCAAGATA
AGTAATTTCTCTTTTTATTTTTTCAGTCACAAGACAACATAGAACGTGAT
CGATGGATATACGCTTTGGTCGACCTCGTCGGACAGCAATTACCCCCGTC
CGAATTACCAAACTTGAACAATGGAATTCGGCCCAGTCCTCGAATCAGTA
AGTGACAAACTATTGATTGTGAACGTATTCTATGCGAAAGGAGCACGAAA
ATTGATTGAACTAAGGTATATGTTTAGCAAAGAGAGAATTCGACTGTTTT
CGCGGACAAAAAAATTTCTCAAACCGATTTCTTCAACGTAAGTTAAAGGG
CGATAATCAGAAAAGTTGAGATGTTTGGCATGTGGATAATCTCTTTGGCA
TCTTTGGCAGTGACAAATTTCTCAAAATGTTTTTGCTAAGTTACCGAGTT
TTAAGTTTTTGAGTTTTATTAACATTTGAATGTACGAATCGTATGCAAGA
ACCAATCTTTAGAAATTTTAAATTTGTGATAGAACTCTCGATAGTCAGAA
AAGAATACTTGTAGATTTTACTTAGAACCACAGAAGGTAATTACAAGCCA
AATATCTTAAACAATCTTTTTAATCATCCTTTTAAACAAACCTAAACTTT
TTCCCTTCTCCTTCTAGAGCTTGGTTCATCTATGCGTAAATTACCACGTG
AATTGAAGGACGCTATGGTGGTTAACGATCCGATGGTCATCAATAGAATC
CATGGACGGGCATCGATGCCCAATATTTCAACACCACCAAATATTGCTTC
GGTAAGTTCATATTTGCGTTTTATATCTTAACAAATATTAATGGAATCAT
TTTTTCAGGGACGAAAATTAGTTCTAAATTCTTACGATATTTTCTATACT
ATTTTCTCCACTACTAGTACATGGTAAGATAAGAGTCTTTTATAATCCAT
GTAATACAGTAATATTGGTGTAACACATAATAATACAAAAAGAGTAATGG
GATAATATTAGTTTGTATAATATATCCATTCCACAATTTTGTGGTTATGT
TTGGATTAGTCGTCTAGCATGCTACAATCAATGCCGAACTTGGCACAAAA
GGGAAATTCCCCACGAAATTTTAAAACCACAAACAATTTGGAAGTGCTCA
AAAATAGGTTGGAAGGGTAGAGTTGTAACATTAGACTTAACACTTAGGAC
CTTAGGATCTGAGGATCCAAAAGTTCAAAAATGGCCCGGTAGGGCTTGAA
ATATAGCCTAGAAATTAATAAATCCCTCCCAGATCGAAATATTCGATGGA
ACCAAGTTGAAGGCCCAAAACTGACATTCTCGTTCGAACTTCAATTTTCG
AAAAATGGTAAAATAGCTAAAGTTGTCAATATCTTATGGCACTGATTGTA
GATTAGTAAACAGTGTACTTTCTGTTTCAGAGTATAACGCCACCTGTCAG
TCCAAGGACCAGCAACGAAAATGATTACGTAAGCTTTTTTGAAATAGGTT
ATACCTTGGGACATAAAAGGACTGGCGAAATTTGTAAACAAACTGTATGC
AGCGGGATACAAAATCCAAACAAATGTCACATGTCAAAATAAAGAATAAA
AACAAATATGGCTGATTTCGATTGTTTCAATTTTTTAAAACAAGTTTGTT
TTGGACACGTGACTTTAATTGTTCTCTTTTAATGACATGTGGTTCGCGCA
ATGTTTACATTTTACTACTTTTATGTCCCTTTAAGCTGTCCTCAACCTTA
ATACTTTTTGTGGAGGGGCAGTAAATAAACCAGTCTCCAAAATACCATGT
GATTTAAAAAATGAAACTTGGTGTTTAAGGACCTCTTAAGACCAAACCAA
AGGTCTTGCTAAAACTCGAAGTTTGGTCTCAGGAAATGGCAAACGTCTGA
AGATGCTTTTGAGTCACACGAAATTTAAGCGACGAGTTCTCAATAAACAA
TACCCAACTCGATTTATCAAATCGCAATACAGTTAACTCTCTCTAGTTCG
AATCTCTATTTTTCAAATCTTTCTGTAATTCGAATTGGAATATAAGTCCC
ATCAGCTGGAATATGGTTTAAATAACTCTCTTGTAGTTCAAACTTTTCTC
TAATTCAAGTAAAATCTTTGGTCCTTTGGAGATTGAATTAGAGCAACGGA
TTAGAGAGAGAGTCAATCGTAATAGCTAATGAAATACCATCTAATGTTTT
CTACCAATAATATATTATACTACTAACGAATTTTATCTGTAGGCGACACG
TTTTCCAACGGCTGCACAAGCACAACAACCACTTTATCGCGGCACACGTG
TTAGTATATATCTTGCACCTTTTTCACGCACTAACTTATCTTTATTTTTG
CAACTATGACAGATCCTCTTATTGGATTTTTTCACTCGTCAGCCTTTCTA
ATTAATATTTTTTGTGTCGTCAAAAGATTCTGGTTTCTTTAATACAATAA
GCACTTTAACGTCGGCAAAGAACAACTTTACGTCGACATTTGCGTCAGCA
ATGGCCGAATTTCGACGCGAATTAAAATTTCTAATCACTTACTACTCATG
ATCTTTTAGAAAATTCCAAAAAGGTCGAGGAAGACTTTCTAGTTCATTTT
TGAACTTTTCAAGTAAAATGGTCTTGTGGGACTAAGCACTTAGTAACTCT
TTATAACACTTTTGTACTTACCAATTCTCAATTTTCCATATTCATCACTT
TCACATATTCATCACTTTCACACATTTTGCACTTGATTTTCTACAGGTTG
CACACATGAGCTTAGATTCAGGAGTAATGGTATGTATAAAATGAGCTTCG
ATGATAGCAACTTAAAATTTTAGTTGCAACAGTTAGGTTGTTTTCTTCCT
TTATTTACACTTTTTAAACGACATTCTAACTTTTGCTAGTTAACCATTTA
AACCCAAGAGATGTGTATAGACGTTCTAAATTTGCCGAGTCCAAGTCTTA
AGGCTAAATCTCAAAACCACTTGACTTAAAGGGGCAAAATCAAGAAACTT
TCAAATTACAAGCTTTTATGCCAGTTTGAAACTTTGGATTTGGAAACTAA
ATTTGCCAATATACCAAGTCTATGACTTAAGGGTATAACTCCTGAATAAG
ATTACATAAACTAAATGCTTTTAGTTAAAAGTTCAAAATTTTCACAATTT
AAAAAAAAATGTTGCACGCTAGAAAGGTTAAAGGATTGACCGGGACACAT
TGAAAGAAGGGTACCGACATCAAACCTAAGGGTATTCACCAAGCTTGTAA
CAAGCCATAATTCACGTCATCGTTCAAGTAAAGGAGATTTTGACACTGGC
TAATGTCTTCTGCCATTTCTACATTTTCATAGTAGCGAGTTTGCACTGCA
AGTGACGTGACTGGAAAGTTACGTATTTTTATAAGATCGTTGCAGGGGTG
CATATCATTATAATTTACTTTGTAAACATTATAATTTACTACTCTTTGTC
GACAGAACCGATCACGTGACATACCATTACAACAATCACCACAGAATATC
ACATTGAATGGTAGAAGAATCGGCGAAGTACTTGATAGTCGAAGGTTTGT
TTTTTTATAGAATAACTATTTACAACAAATTTCGTCTAGTTTTGATGTCA
TTTTAGAGTCTAGCTTCTGGTCCTCGATATAAACAGAGCTACAGCTTTAC
TAGACAACTAAGTCTTTACCTAAATTGGGCAAGAAACTTAATTCCATATC
CCTAAGAACAGGATGTATTTAATTTGCATTGAACTACATCCTCCTCCATG
TTGTCCCATACATGAATTTCTAACTACTTCTACCGGTCCAATTTACTTGT
AGAATTCAATGTCGGTGTTAATGTGCTTTTATCGTTTGCTAATGGTACTT
CTGTGAAACCATTCATATTTAATTCATTACAGAGCAACGATAGCTACACC
CTCTCGAGTTTCATTGCTGGCAGAATCACGATCGACATTCAAGACATCTC
TTGGGAATTGTCCTTTCTATTACGGCCCAATGAGTCGAAGCGAAGCAGAA
AATGAGCTAAAGTCGCAACAAATAGGCAGCTATCTTCTTAGAGACTGTCA
AAGTAAACGTGGTTGCTTCACACTAACTTTCAAGTAAGTTAATAGAGCTC
GAGAATATATTTCGTTAAATCAAAGCATCACCGACAGCTACGATATTTGC
ATAAATTTTAAGCGTGTATATATTTCAGTCCTAGTTTAAACTATAACTTT
TCTCAGCATTAATCCCTCTCGAGGAGAGGAGGTTTGGATTAAAAATTGAA
ATTCAAATATTGGACGCAGAAGTTCTAAATTTTAAGCTTTTTATTCATTC
ATCATTTGGTAGCAATTTACAATAAAGTAATTTTTGATAACAATAAGTGT
AGTATATCATTATTTTTTCATCATTTCTATCATTATCAAGCGGACCTCAG
GTTACGGCTTTATTATACATACTACTACCGGTATACTGTAGGATTTTTTT
TAATTTTCAAAGAATTTAACTCGATGAAACTTTTACAAATTATTATTTTT
CTTTTAGAGATAAAGAGAAGATCAAAAACCACATGATTGAACCACAAGCA
GGGAGCAATAAATTTCAATTTAACGGCCCTGAGGTATGTTTTACAAGCGA
TACAACATAAACGCCCTAAAATTTTGATGATCAGCAAGAATTCTGAAAAA
ATATAGCCGGGACTAATTATGACAGACTTGAAAGTAAATAGTTTTTTGCC
ATGCAATGAGCGTAAGAGACATGAATCTTGGAAGATTAGGTCAAAATTCG
ACTAAAACTTATTTTAATAAGAAATTCGCAAAGTTAAGTTCCCGCCAATA
TTTTTACCCTGAAAGTATAGTAAATTATTTTACGAATCATATATCGTCTG
CATCATCTTTCAGTTCACACGGATGTTTACATCTCCGGACGAAGGTGTTA
TTTATTACATGGATATGAAACGAAATCGAAATTTCAATCCCATCCCCTAT
ATCAGTAAGTCATTAATAGTATATGGCAAAGTACTTTGAAATAATTAATC
ATTAGGGATACGCGCCAATTACTTGCTTTATATCCTTTTTGCAGATATGA
TAAAATCAAAGTCATCAATGAATTTTCTGCAAACTTTTTAAGCCGCCAAT
GATTTTTGAGTGGTGTAACTTACTCCGGGATTGTAGATTTCCAAATCTGA
ATTTTAACATTAGAATTTAACATTTCAAGACCTTAGGATGTCAGGATTTA
AAATTTCAAAAGTATTTCAATAAGGCTGAGAATATTTACCTGGAAAACCA
TAAACTCCATAATCCAAAATGTTCATTTTCTTTCCAATATGATTGTATTT
TGACTTTAAAAAACAACATTAAAGACAGTAATCGTACATAAAAATCACCC
TTTTTTCCATAGAGCGTCTTCCAGGAGATGGCCAAGAAGAGGATAATAGC
TACATAGAAAGTGAAGGTGAAAAAACATTTTTTATAAGAACATCCAAAAT
TGTTGAAGCCTTCCTATGTTCTTATTTTTTCGAGTTTTAAACCTAAAAAA
GTTCTTTTCTTGTTCTTAATTTCACATTTTTTAGTGTTTTTGAGCAATTT
ACTAAGAAATTGGAAGTTTTAGAGCTCTTTAAGCCTTAAAATGTTCTTAT
AACTTGTTCTTAATATTTTAGCCATTGAAGCCCTATGCTCATATATTGTT
TGTTTTTATGAAAGACATGTAGCCTTTGAGAGGTTATTTTTTCCTCCTGC
TAATAACTTTGCCGAGAAGTATAACCTCCTAATGCTATTTTATATGTACA
CACCATGAAAAAGTTTAGATTTGAATTTACATAACTTTCCTTAACAAAAA
TGATTCAAGATTTTCCTCTGGTCCTCAAAATATTCACATGATTCACGTGA
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AATGACCTGGAGCTTTTGTGAGATACTCAATTACTTGGTCATTTGAAGTA
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TATGTTTGGACCGTTTCTTTCCCAATTTTAGATTTTCGTCCACCAATGAT
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AAAGTAAGTTCCAGAACAGATATTTTACGAGATCTAGTCTTCCTTATCTT
TAAAATGTTATGATTCTTATTAACAGCTGAATTTGAGGAAAATCATTCTT
GTAGGTCGATTCTCAAAACATTTTTTCAAAATCAACTGTTCACAGTACCC
TTCATGCCTCATTTCTCTTTTTTTTACAGAACAATACCATCCACCAGGTA
TGCAAAGAAATCTTTGTTGGCGCCCGATGAACAAAACTGAACTCTTGCAT
TTCTTCTTCTGTTTTCACACCTTTTTGAATTTGAAACACTTCTATTGTCT
TCTACCTTAAGGGAACTTATTTTGGCGGGAACTAATTTTGGCGAATTCGG
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TTGCTCACTCGCCAAAATAAGTTCTCGTCAAAATCTTTGGTATTTTGCCT
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GTATATAATTATTTAGTAACAGTATACTCACTAACAATGTTTAGATTGTA
GCTACAAGTTCTATCCAGCCGACTGTTCAACTATTTTTGTTTTATACTAT
TCAGTGTCATTGTTACTATGTTGTGTTTGCTATACTGCTTTTCTATCTTA
TACACACTATTCACCTTATAATGACGCACGTATAATTTTACACAATATTC
ACGTACTACGCACTTATAACATAATATGCACCCTTATTAGATCTGGACTA
CTCGTCCATCGCACACCCATACCAAAATTCAATGTCTGCAAGAGAATCCT
TCCTCAATATTGGTACATTGACTAAGGCTGCTTCTCTCACCCAACTCAGT
GTACTAGAATGTAAGTTGATAATATGATGTAATATAATATCCTATAATGC
AAATACATAGTATTGATATTACACATAATATAATATCCTATAATGCACAT
ACATAGTATTGATATTACACATAATATGCACTAATAACATATAAAATTCG
TCCCAGAAAAATGGTAGTCGTAATATTTTCACAAGTATATTTTGCAAGTA
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CTTACATTACTAATCTTTAACCTGCACTACTAGCATAAAACATTTGAGTA
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TGGCATTGAAATCTTATTTTGACAGGTGGTATCTTGACCCAAAAATCGGC
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TATCAAATTGTTTTATTTTAAAGGATGAAAGTCTTGATTTTTTGGCCTAA
AGGTCTTAACAGAAACCTTCCTTTTGACCCAGTATTCAGTATTCTGATTC
TCTATTATTGGAACTGAAAGCTTTTTAAACAGAAAAATTAGATAACCTTT
AAGTTCAATGTTCATTTTCAGATATTTCAATTTTGGGAAATAATTTAATC
AAAAAAGATTAGAGGCTACTTTATTGACTGTATTGGATCTATAAGTCAAA
TATTGAAATAATTTCTTTATGTTTAGGTGGCTACAATGCGCCTTTACCAC
CAACTCCTGAGAAACCAGAATTCACCCTGGGTTCAGTTCCTGATACTCCA
CAGGAAGATGATAATGGTTATATAGTCACCGATTCCCCTGCTGTTTTCAG
CGATTCCCCTGCTGGCTATGTTGTGATGGATAGCGGTGA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_002108	XLOC_002108	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000031	supercontig	sc0000031:119638..138776 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3.03675	4.0613	0	0	0	0.862384	2.46468	2.56944	0.608601	0.886916	0.431739	0.403781	1.22737	3.26866	0	0	0	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00003783 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00003783 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00003783 (transcript) - C. hemisphaerica