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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00003805 ID=TCONS_00003805|Name=TCONS_00003805|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1800bp TCTTTAAGACCATGCCCAATACCTCGAACTAAAAGGGTGCGTTGAAATCG TCAGTCTTCCCGCTTAAAACGGCAATCAAGCGTTCATCTTTGGGGAGGTT GGAGATAGCTCTAAAGCTCAACTCTAATACCGACTCGCTAACGCAAGGAA AGAGAGACAATCAAAAAGAAGTACTTTACTCATCATTAACAATCGACGGT CAATGTCAgcttataaataaagaaaaaaaattgtcattttgtgTTTCGTG TGTGAGTGTGGAAGaggatttttgttttgttgctgtcgacagaaaatgac ttTCATCAATGATCAGTCATCGAATAGATAGATAGTGATCACACACGTGG ATGCTTGCTCAGATTGGCTGTGCATCCTGATTGGCTAAGACTGTGATTTC GTAACCATTGAACATACGTGGGTGACTCGTTAATAAAGAGATTTTAAATT CACATTCATTGCATTCAGTTATTAAAGAAGCatcaatatgaaaatatttt ggattgcTGTTTTTGTTGTATTATCAACCATCTTTGGATCACGTATTGAA TCGTATAGCACCAACTGGATCAAATGTCCGGCCGATTGCTCTAGAGTTAT GTGTAACCATTATAAGACATTGAAACGTTTTTGCCAGTATGGCACAGTTT TTGATCATTGCGGATGTTGTCAAGTTTGCGCGGTTGGTCCGGACCAAGTC TGTGGTGGTCCGGGCGATGTTTATGGTAAATGTGGACCGGGAATGTATTG TTTTCCTGCGGATAGACATCCAAGCCAGACCGGACGTTGTATACcCAACC CAGTGTGTCCCGTAGCAAGCAATTTCACTCATTTGAGAGGCAACTTGGTC GAAGAAATGTGCATGCCAAAATGTACCCCGGAATTCTGCTCTAAATGTCC GCATTCTATCTGTTCCGCTATTGATAATGTCATCATCTCACGCCGATGTC AAAAACCGTGTCAACACACGGTCTGCCAAGCGTGTTACTTCAAAACGAAA CGTGAACCGCCGTGTCCGCGATGCTCGTTAGACGATTTTCAGTGCatgaa aaaattctcaaaatgtgTTCGTAAGGATACATGCACACGACATAAGTATC CTTGCGAACCACATCAAAAGAAACGGAGTGACGGCAGATTCGTATGTAAA GTTCCTGCTTGTTTGAACTAATTGTTCAAATGTTGTTTTGGagttggaaa aagtttttgtttttaaagagaaaaaatgaaatagtaTAACAACTTGGGGC TGTTAACGATAAACGCTGCTATGGTGCTGTGAGGCTGATGACTTGAATCT CATGGTCCACTTGCTTGGGATTGCCTTCGATAATTTATGCATCAACCAGT ATGACATCAGTAATTTATGCAAAAGATGACGAGTAAAGCGACAGATGATG GATGGTATTTAATGTAaaaacaaatttagaaaaaactaGCAGGTGTCATT TCCAAATCACCCTATTTTATAAGCGATCAAAAAATTGATAACATCACAAT AACAAAGACTTTAATCTAAATATCGATATGGTCATAATGACAATGAGTTA ATTGCTAATTGTAACCTAGATACAATTTAAACAAAATATTATGAGTTATT CTTTCATTTGCGTAAAACGATATTTCTTTAATATGGAATAGTCTGTACTT TAGGTGCAGGTTATATTTAATGGATCCCTCTGAAGGATCATGTCAATTCT CTCACATTGAAAATACGATCTCGTCAACGAATTAACCCTTATACAATGGC CAATGATGTCCGCCCCCAGGGCGTTTCTTTTCGTATATCAATTTTGGTGA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000031:575578..590003- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00003805 ID=TCONS_00003805|Name=TCONS_00003805|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14426bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031:575578..590003- (Clytia hemisphaerica) TCTTTAAGACCATGCCCAATACCTCGAACTAAAAGGGTATTAATCTTTTT
TTATTTGGTGTTGGTATACAGAGTTTATCAAGCATCATCCCTTGTGTCAC
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CTCTAAATGTCCGCATTCTATCTGTTCCGCTATGTAAGTAATTTTTTAAA
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AATCACGGTAAATGCAGTAATAATGTGCTCTGATAATAACGACCTTTTAG
TAGTCTCAAATTTTGCGTTCAACCAACGGGAAGCCGCCATGATTACCCAC
AATTCATTTCGACCGTGAAATGACACATGCTGCTCGTTTTAATAGATCAT
TCATTACCCTGAATGTATTTATTAAGGTTCTTGAAATCAGAAAAATTTAT
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ACTGCGTTTCGTTACAGAAGACTGGGAATAACAACAAGGTTGCAATATTG
TTTAAAAATAGGGCGCCATATGAGAAAAAAGTTTAATTTTTGACATTCTG
GCGTAAAACAAGATTCTTGTCATAGAATTGACTATTTTCCTCAGATGATT
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GTTAATTTAAGTTAATAAATTGACTCTCACCTCATCGATAATCAACTCGT
TTTTCAGTGATAATGTCATCATCTCACGCCGATGTCAAAAACCGTGTCAA
CACACGGTCTGCCAAGCGTGTTACTTCAAAACGAAACGTGAACCGCCGTG
TCCGCGATGCTCGTTAGACGATTTTCAGTGCATGAAAAAATTCTCAAAAT
GTGTTCGTAAGGATACATGCACACGACATAAGTATCCTTGCGAACCACAT
CAAAAGGTAAGTGTAAACAGGGCTATAAGTATTTCATGGGTGTCATCTTT
CTCTCTAGAACAATCTGGAAAATTTCTTGCAAGGTTTTTTCTATCAGCGA
GTTTATGCTCTTATACCGTCTGCATTTCGCAGGTCAAAACTGAGAGTCGT
TTCAAACCGTTTCAGTCAATTCCAGTCCTCGTAGCGAGTACCTTAGCGAG
CACCTCACTAAAGACCGGGATTTTTCATCTCGTTCCACTTTGACAATTTT
GGAAAAATAGAAGCCTTTCAAGTGCTTTGACGCAAATTCGATTTTTTCGC
TACTGAAAAATTTCGAAAAAGTCGCAAAGTGGAATAGACGTTAATACGTC
TAGTATAGGCTACTTTCTTCTTAGTGGTAGATACATAAACTCGCTATTGT
TCCAAGTAGTACTTGCAGACAAGCGGCTTTTTCTGTGGTTCAGACTTTGA
AATCCTCAGAGGCTTTGTAACTATACTCAGGGTCTTATGTTGGTTACATT
GGAGTCAACACTTTTTACGTGGATATCCCTAATCTCGCACTTTTACATAG
TCTTTCGTTTGTTTTCATGGGGTCAACGGCCAACCGGCTTGGCTATCTAT
GAACTGAATGGAACATTGGAAAGAGACGAATCAGGAACTTTTTTTTAGTG
ATCAAGCCTTAAACAACTGGAAAATCGTTCATATCCCAATGTCCAATATT
AAAGTCGACGTTACAATACTAATTCCCTCGAAAGAGGTTTCTGTATGGTA
GCAAATGAGAAAGCAAATTTTAAAACAAATGGACTTTCTGTCAGCCAGAA
ATCCAATCCATAATCTCAATTTCTTTTTATCTTTCTTTTCGCTTAGAAAC
GGAGTGACGGCAGATTCGTATGTAAAGTTCCTGCTTGTTTGAACTAATTG
TTCAAATGTTGTTTTGGAGTTGGAAAAAGTTTTTGTTTTTAAAGAGAAAA
AATGAAATAGTATAACAACTTGGGGCTGTTAACGATAAACGCTGCTATGG
TGCTGTGAGGCTGATGACTTGAATCTCATGGTCCACTTGCTTGGGATTGC
CTTCGATAATTTATGCATCAACCAGTATGACATCAGTAATTTATGCAAAA
GATGACGAGTAAAGCGACAGATGATGGATGGTATTTAATGTAAAAACAAA
TTTAGAAAAAACTAGCAGGTGTCATTTCCAAATCACCCTATTTTATAAGC
GATCAAAAAATTGATAACATCACAATAACAAAGACTTTAATCTAAATATC
GATATGGTCATAATGACAATGAGTTAATTGCTAATTGTAACCTAGATACA
ATTTAAACAAAATATTATGAGTTATTCTTTCATTTGCGTAAAACGATATT
TCTTTAATATGGAATAGTCTGTACTTTAGGTGCAGGTTATATTTAATGGA
TCCCTCTGAAGGATCATGTCAATTCTCTCACATTGAAAATACGATCTCGT
CAACGAATTAACCCTTATACAATGGCCAATGATGTCCGCCCCCAGGGCGT
TTCTTTTCGTATATCAATTTTGGTGA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00003805-exon-sc0000031-1575043694:589968..590003 | TCONS_00003805-exon-sc0000031-1575043694:589968..590003 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003805-exon-sc0000031-1575043694:580291..581048 | TCONS_00003805-exon-sc0000031-1575043694:580291..581048 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003805-exon-sc0000031-1575043694:577921..578047 | TCONS_00003805-exon-sc0000031-1575043694:577921..578047 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003805-exon-sc0000031-1575043694:577098..577296 | TCONS_00003805-exon-sc0000031-1575043694:577098..577296 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000031 | supercontig | sc0000031:575578..590003 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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