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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00004706 ID=TCONS_00004706|Name=TCONS_00004706|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2044bp
CCAATAATGGATGAGCTAGGTAAGTTTgtctcaaaagtttttttaggcTC
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ttttggacaaaaatgtccttcatcCATCTGCCACattaaattcccgctaa
atttaatttttcgagttaaccgccaaattaaattccctctgaaaaaactt
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cttgccaatgtcggatatatccgacatcaaatttttttacctaa Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000047:113129..115172 Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00004706 ID=TCONS_00004706|Name=TCONS_00004706|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2044bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000047:113129..115172 (Clytia hemisphaerica)
ttaggtaaaaaaatttgatgtcggatatatccgacattggcaagtagagt
gaaaatttgcatgtcggatatatacgacatcggcacggaaagggttaaaa
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gtacaatCGAATACTGTATTTCCCATgcgtcagcaaaattttgaccatta
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GTCTTATACTATAATCACTTAAACGcaactctcccattctcgcatgaagc
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GTATTTCAAGACAGAGTGCTTTGAAATTGAACCCTCGTTctctatttttt
tcattttaaaatatttaactttcaaagtcaccctcgaatgtccCAAGTTG
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cttttaccatttttaaagacagaagccattttgaaaaatcaacttggtga
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ttttgcttataaaaagtgACTTTTATTGCCAAAGATTCATTTTCGAgcct
aaaaaaacttttgagacAAACTTACCTAGCTCATCCATTATTGG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00004706-exon-sc0000047-1491911889:113129..115172 | TCONS_00004706-exon-sc0000047-1491911889:113129..115172 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00004706-exon-sc0000047-1510915933:113129..115172 | TCONS_00004706-exon-sc0000047-1510915933:113129..115172 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00004706-exon-sc0000047-1575043694:113129..115172 | TCONS_00004706-exon-sc0000047-1575043694:113129..115172 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000047 | supercontig | sc0000047:113129..115172 . |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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