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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00005714 ID=TCONS_00005714|Name=TCONS_00005714|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2492bp ctCCTAGATTCAATCCCTGCTAGCCAGTTCTAATACTTAATTTTCAAAGC TATCAGATTGGAAACTTCCTTACTGAATTCAGGGAAAGGAAAACGAGTTC CAAAATTGGTCCACCGGTTTTGGCCTTATATAACATGCTAGATTTTTCAG AGTTTATCAAGCTTTTCGACGACATTTCCTTCTCATCCCCACAAAACAAT TCCGTTAAAACATTTGAAATTCTAAAACTCAAGTATCTACGATAACACCA CCCAACTTTCCGAAATCCCGCTAAATTCCCGAAGCTCGGAAATTAAAGCG GAACTTTGGAAAGTTGGACAGTGCTACGGTACTGAACAGTATGTTACAAT CTTGGATAGACGTGTTGTTTTTCAGAGTCGAGCTTTCTACGAAAAGATCT ATCTTCGATTTTTTACAAGGCGATTCAAATAGAATTGGTGTTTGACTGCA AACAAGACACATATGCAAATTTCTCGATAAGATAGAAATACGCGGGAAAG GGGATGGATCCGACCAAAAATAAAGCCGGAAAGCCGAGATTTCGGGTAAG AGTGAAAATCGACTGTGTTATTTCCATCCTTTATTTCAAGCCGTACTCTT AACCGTAATTTTCACATATATTTATTTCTGCAATCAAATTTAACATTAAT CAACGAGTATTTCTGGAAGTAACGAAAGTTCTTTTCCGATTTTCTTTCAA ACGCACTAATCGCAAAATCACTAAGAATTATGCGCGATTAAACCAGTGTT TTCAGGCGATGCTGATACTGTGGCTGTGTCTGCGGTAATTCTTAAAATCA AaatggatgggaaataaagaATTAAGCGATCTAAGCTATGCTGCTGAGAA GCGAAAATTAGCTGAAATTCTGTTCAAATAAAATGCGTTAGCTTTTGGCG CCTTTAGTAGATATTTGATCAAAACAGGATCAAGCAAGGGGTGTATTTAA GATTTAGAATGCCTGATTAGAAAGGTCGCGAATCGTGGTAAATCTATAAA AGAGAGCAGGATAAATTTTCACTTATCATGTTCACTGCCTTTATCAAAAG GATTTGGCCAATGTTGGGACCTTATGATTTTAAAATTGTCGTTAAACAAG TCAGACGATCAGCTGCGGGAAAACCGGGGGCGTGTAATAGGTTTGAAAAG TTCACATGGGTTAGGtacaatcaaattttgttaaaatatccCAGGTTAAg aaattaccttaagggaagaaattttcgcgggaatttaatttcgcggtttg tcaaattattttttttcgtgggaatttaatttcgcagttcagcaattttc gaaaaattcgcgggaatttaatttcgcggttgcaggatatttttggccaa aagcgttattaaataagcaaaaaacctgttttaaggcttgaaatagaaGG AATTTGGGGGAATacgtgaaataaattaaatttcgcgggaatctaatttc gcggattgacgattttgtaaaattttgcgggaacttaatttcgcggtttt aggcaaaatccgcgaaagccgcgaaattttgttcccgctaaaatttcttc gCTTAAGGTAATCGGATTGATATCCGCAACATTAAATTTTGCGAATCCCC TTTTCCTGAAAGTAAACCTCGATACTGCTACTCATTGAATTGATAAATCC ACGCAAAGTTTTCTAACATGCAATATTAAACGCTGTTAAACaatgtaaaa tttaattttccgGCTAAAACTTTTAGGGttgttttatgatttccaaaaaa tgcaTGGCTCATTGGCCGACATTAAGTTaacgcaaaattttttaaaacgc TGATTCACGAAATAAAATCCAAaagaatttgttattttttgttgttgttg cgAAATCCACCCAAGACGCACCCGAGGCTTATAGGGAGCACAGGAGAACA AAAAGGAAAACCGAGAGATGGGAATGATCAGGATTAAATAGCCCGAAAGT CCCCGGGAATAAATGCTAAACATTCAAAAGCTGGGGGATGAAGGTCATCC CACGGGTTATTGAATTAACTAATTTTAGCGGCAATCAGAAATCAATTGTC ACTAAAGTCCGAGAAATACAGACAAAATTATCATTGTTAGTAACCCCACC CCTGTTTCAAATTGATTAATGGCAGTGAACATGTTCATCTATAATTAGGA ATTGGTTATTCTATAGTATAATATTTTCCTTGCTTGATGCTGAGTTTTAA ATCAACGCGTAGATCCGCGGCTTACTTCTATATTCTCAAtcaattttgct taaaaacaaaaaaaaaactgttttgtcTACGAGTTATACAATCgattttc tatttcttcattTTGATAGTTTATCACACGACAGTTTTAAACTTTTAGGC CTGGGAATCTTAAAGAAAATGTGCGATACGatcgataaaaaattttcaaa taaatttcaagaaacCCTCTATCCTCTATAACAAGTATTTCTTGTTTCGG AAACACTCAAGGTTACACTCTTGGGTAAAGGGTTTGGAAAAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000054:768943..771434 Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00005714 ID=TCONS_00005714|Name=TCONS_00005714|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2492bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000054:768943..771434 (Clytia hemisphaerica) CTTTTCCAAACCCTTTACCCAAGAGTGTAACCTTGAGTGTTTCCGAAACA
AGAAATACTTGTTATAGAGGATAGAGGgtttcttgaaatttatttgaaaa
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AATTAAGTATTAGAACTGGCTAGCAGGGATTGAATCTAGGag
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00005714-exon-sc0000054-1491911889:768943..771434 | TCONS_00005714-exon-sc0000054-1491911889:768943..771434 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00005714-exon-sc0000054-1510915933:768943..771434 | TCONS_00005714-exon-sc0000054-1510915933:768943..771434 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00005714-exon-sc0000054-1575043694:768943..771434 | TCONS_00005714-exon-sc0000054-1575043694:768943..771434 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000054 | supercontig | sc0000054:768943..771434 . |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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