TCONS_00046817 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00046817
Unique Name	TCONS_00046817
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4179

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_117:509026..541986-

transcript sequence

>TCONS_00046817 ID=TCONS_00046817|Name=TCONS_00046817|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4179bp
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GCTGAGTGACCAAGAGTTCAACCAGCCACCAAAACAAACGGCTGCTGGTA
GTCTACCACCTCGAATGAGTAGCTTCAAACAAAAACGACAAGACGGTAAT
GGACCATTGAAGTCACCGCGTTCACCGACAAAGTCACCACGAAAATCTCC
TTCACATAAATACCCTGCACCTCCACCTCCTCCTGAACGAAGTCTCTCTC
ATGACGGTCAACAGAGCCACGTTAATGGGCGTGAAACACACCGTTCATTT
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CCAGACAACGAACTTCAAGTGGTGGTCAGGAGGGCGTGAAAGAGAACGAA
GATTCTCGAGGGCGAACGCAAAGTGCTGGCCGTGATTTCAGTAAAGCCCT
CAAAATGGCGATCGGATCTCGCGTTGAGCgtgaaaaacaaacttcaaagc
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GCAAATTATGCCGAGATTGAATTCGCAATTGCCGATAAATCTTCGCCTAC
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GAGAGTACACGACTGTATATTTTAGTGACGAGTCTGACCGAGGCCGAGTG
GAttcttcaaatcaaaaacaaactttcaataatagaGACGCTTTAAATTC
GCAAACAAGCTATCACGGTAATATAGAAGTAGAAACGAAATCAAGCATAC
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AATTACGAACCAATGGAACTTAAACAACGTACAGACTCATATAAATTCCG
ACCAATTGTTCCGGGTTACGAGGATATGAATACCGAGTTTTCATCGGCTA
ATACGAGTCACTCTACGCCACCTCCCGAACTACCTTCAAAAGGTCCTCAA
TTACCGATGAAACGTGCGAACACGTTACCAACCCACCGACAACAAACGAA
CGATCAACGTCAATCGGATATCCCTCGTTTCCAACCCCCTCCACCACCTA
CCTCGTCGACTTCGTTGAAATCCCGAGAACGCTCGGTTTACGAGAATTCT
GAAATTAAAACATTCGGTACACCGAGAACAAAAAGTACGGGGAGTGGTCG
GACATCGCCATCGGATCTGAGAGCTTCCAAGACGGAGCAAGAAGTATTCG
ACTGGTTGACCGAGCTGAAACTAGCCTGTTATTTCGACTCATTCAAGAAA
CATGGTTTTGACATGGCCAGTATGCAGGCTATAACACCCGACGATTTGAA
TTTCTTAGAAATTCATAAAACAGGACATCGTAAAAAACTTTTATCGGAGA
TCGCTAGATTGTCGTTTTCAGAGAGGTTGCCCAATAATAAACCTCGTGAC
GTAGGTACTTGGCTTGGTCTTCTAAACTTACGACAATACGAACCAAACTT
TGTTGAGGGTGGTTTCGACGATATGGATTTCATCAAAGATCTTGATAAAA
ATGACCTTGAAATGATCGACATTAAGAAACGAGGACATCAGAAGAAATTG
TTACTGGCTGTTCAGAGGTTGAACGATCTGGAGTTAACAGCGGTACTGGA
TATTGCGGTGCTCGAAAGTCCAACAAAAAGAGCACACAGTTTTCGAAAAA
CCCGTGAAAACAGTAATAAAAGTTCGACGCCGGAACCGTCACCGTTACCG
ACACAAATAACAGAAGATTCAAACGTCTTCACATTCCCTGCTCCTCCACA
AACCGATTCTCACAATCACCAACAACAAACGAGTAGAGATTCTCACACTG
AACAATCAACATTGCACCTCCGGAATTCGTATCTGGACCAGGAGCCTGAT
ATAGCAGTCGTTGAAACTGTTACTCAAAACCAAAACTCTTTCACAGAGGC
TActcattttcaagaaaatacaaTCTCAAAATCAATAAATTATCAACAAC
AGTCTTCCTACACAGACGATTCAGATATGTCCACAGCCGCCTTAAGCCCA
CGCGCCCCACCGCCCTTAGCATCAAAACCTGCTAAGCCCGCCCCAACACC
TAAACCAAAGCCCGCTGTTCCTCCACCGGTTGCCGCCCGTAAACCATCAG
TTGGACCTTCAGTAAAACCGAAACCAAAGCCGCCCGTCAAACCGCCCCAA
GAACAGGCGGTGCCAAGTTCACCTGCATCGAAAGTGACATCGGGGGAAAT
GCAAGGTAGTCAGGAAGAAGTTGTTAGATCATCGAAATCAAGAGattttt
tcaaGCAAGTTGAGAAGAAAGTGTTAGATGATAATAACAGTCCGACCAAC
TCCTTGGAACGAAGACGCAGTTCTTCATCTTCGGCCTCTTGGAACGATCG
AAGAAGTTCTCATAGTTCTACTGGATCCATTTCTCCAACAGGTACCATCA
TTAAGAAGAAACCTGTTCCTGCGCCAACACCCAAACCGAAACCAGTGGTT
GAAGAAAAGCCACAACCACTTCCACCACAACCACACGTGGATCCGCTATA
CCCACCAGCAATGCTGGCTGCACAAGCGCCGCCAGTAGCCGCTAAGAAAG
CGCCACCACCTGCACCACCGAAACGAATCAACAGTCAGATAAGTGAAAAC
GTTGTCCTTCCCGGTGTCTCGCCCGCATCCTCGCAACCGGAAATTAACGC
CAAACCGGTCGCCACTGTGGCTCCTCAACCTCCACCACCAGAAGAAGAAA
TTTGTTTCTCTCCTCCAATGCCCGCCTTTATCCCACCACCTCCACCCACT
GAAGAATTCGTACCTGAACCGTTGGATGATCTTCCACCACCACCGTCGCC
TCTAGATCTACCAGCACCACCGCCCGAGGTTTTAATGGCGCCCGATGAGA
TAGAACCGCCCAAAGAAGTAGAGACGCCAGCAGCTCCTGTTgttcaacaa
acaacaacaacaacgactacGGCAACCACAGGAACAGTGGTCAATGACGA
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TAAAAGAACGATTATAAACTTACAACAATAGAAATAGATGAATCTTTGAA
CAAGAAGCTGTTGTCGGAAAAGTAAGAGTGTCTGATCAGTTAGAGGCTAC
AAGATGATGGTTGGTGAATGATACAGGGGTGTCAACGTTCGATCATTTTA
TTTGGTGGAAAATTGATACATGGGTGTCAATTCATTCGATCATTTTATTT
GGTGGAAAATTGATACAGGGGTGTCAATTCATTCGATCATTTTATTTGAC
GGAAAGTACCTTGGTTCTTTCACATGATTCTATCATTGATCAAGCTATTT
GGCGATGCCACAAAGTTTCATGACacttcgttgaaaagatatttcattAG
AACCCACCACAGTATGAGTAGGTCTTAATTACGTCCCAAAGAACAATANA
TTTCATCAGAACCGACCACAGTATGAGTAGGTCTTAATTACGTCCAAAAA
GAACAATATACAAGTATAtaaacaaaataagaaattttcatCTACCAAAA
GTATATGGACTAATACAAGGCTTTGGCTCTTTTGTCAGCCAAAAAATGGC
TCATATATTTTTGAGATTCATGATTTTTGTCACCTAATGTTTTATATGGA
AATAAATAGCTTAAAACACTCGGGCGTTTACAAATCATTTTATCGTTTGA
AACTCGATAGTAATCCTGCAGTTTTTTCCatataaaagattacgttgTGA
ATATTATGAGGTTAGATCCTAAATACAAAAAAGGGAAATGCAGaagttta
tatatttttctttttcttcgaaCGCAACATCATGTATCATATACAAAAAT
GTACCATATTTTAAATAGAATTTTAGGCTACGctgtttttctgttttgtt
tcaatttttcttgtatATGTATCGCTGTACTCTTTAtgttaacatttttt
ttgtaaatttaccACTATATATTTTCAGTAAATGACTTTCACCGCGATTG
ATTTTGTACCGTACCGTAGAGTACATCCGCCTGATCTAAAGATCAATTTA
ATTAATCatcgtacccagagccactcNAA

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transcript from alignment at scaffold_117:509026..541986-

Legend: exon

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>TCONS_00046817 ID=TCONS_00046817|Name=TCONS_00046817|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=32961bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_117:509026..541986- (Clytia hemisphaerica)
ACAATGATGCAAGACCAGACCAGCAAATTCTTGGCTCTTCTCAATCAAAA
GCTGAGTACGTTTTTTGAACAGTTAAATCTTTCCATTTCATATGATACAC
ATGTTTTTGACCAGTGTCTCCTTTTAAAATGTAAATGACTCTTTCAGTTT
CTTTTGAGTAGAAATCCAATTTAATCTCTCTAAGTCATGGGTCTTGATGG
TTTTATCTCGGTGGGTAAATTCTAGGGCAAGACAGGCTATATTGTAAACA
AGATTCTCCCAATCGCGAAATTAAACTCCGTGGAACTTACGAATTTGGAG
TTGTGAACCGCGAAATTAAATTCCGCAAAAGTTTCTTCCCAGATAGAATC
ATGAGCTTTAAAAAAGTCAAACGTTTTTGAAACAAGGGAATTCTAATCCA
CTGTTAGTTAACTACGCTGACGTTCCTGCCTCATTCGATGATCGATATTT
TCTCTGATCACAGTGGATTCTCTTTATCTCGAGCCTCTATAACTCGAACA
AGTTGTATGGTCCCTTCAGTTAATAACACCTTAAAAACCAATCTTCATAA
GTCGAAATTTCCTTAGCTCGAACAAATTTGTGTTCGGCCCGTGGGTGTTC
AAGTAATGGGGGCTCCGCCGTACTATTTTAGGAAACTTAGCACGCTACAC
TTTTAATGATAAAAATGATAACTATAAATCTAATGTTATTCATCTTGGCG
TTTAGGTGTCTTCTTTACACCGCTACACTTTTGTCGGATGACAAAAAATC
TTTTAAAAAATCTAACCAAAGAATAAAAACCATTGATAATTAAGATGATT
TTTAAAGATTTTTTTGTTATGTTTTCTTAACCAGGTGACCAAGAGTTCAA
CCAGCCACCAAAACAAACGGCTGCTGGTAGTCTACCACCTCGAATGAGTA
GCTTCAAACAAAAACGACAAGACGGTGAGATGTTTATATATATTATGTTA
AAAAGGCTTATGTACCAGTTTTATCAGGAGACAAATTTATCGCAACTTTG
AAACAAATTTGTTTGCGACCCAGTTGAATGTGACCCGAAGGTTCCTATTT
ATTAGCTGTCTACTGGGAAATATGTGCCGCATCCCCAGTAGGATTCGACT
ATCTTTGGTCGTAAAGCTAAAAGCATTTTGGTCAATCCCCGGAAACGAGG
GCTGGGTTAGCAGACTTCCCGCTGCAAAATACGTAAGAAGTTTACTCGAT
TTAAAAATTAACACTTATAGATCTAGGGGATTTAATCACCTTGGTAATAG
GCTCAAAACGAGGCAGTCGTTGCACTCAAAATAAATTATAAAAAGGCCTT
TTCTTGTTTCTACAGGTAATGGACCATTGAAGTCACCGCGTTCACCGACA
AAGTCACCACGAAAATCTCCTTCACATAAATACCCTGCACCTCCACCTCC
TCCTGAACGAAGTCTCTCTCATGACGGTCAACAGGTCAGATTCTTATATA
GTTGAGTCTCTCTTAACTCGAACCTCTAAAACTCGAATGTCTCCTTAACT
CAAACAAGTTTGCCTGTCCCTTTAGAGTTAACAAAAAACCTTACTCTATT
CATGATATGCACCACTGCAATGTCTTCTGACATTGCATCACGTTGGTTGT
AAGTGACGTAAAATCAGTCAATACGTCACTTTGAACCAATCAGCTATTAG
GTGGAATGGAAGACATTGCAATGGTGCATATCACGAATATCTCAAAATTT
GAATAGTGTGTTGGAGTTATAGAGACTCAACTGTAAAATAAATCTTTACG
CGGAGTAATTTTTTGAGGTCTCGCTCATCTGAAAATGCAATGGAGACTCT
ATAACTCGAACACGGAAGGGGAACGCAAATCGAGATATAGAGCAAGGTTT
ATAAAGCTATTGTTAACTGGAAAACATTCGAGTTATCACTGTATCATATA
TTCTTATAAATAATACCGTCAATACCTGAAAATATTTTACTTTTTCATAC
AACAGAGCCACGTTAATGGGCGTGAAACACACCGTTCATTTTCGGAGGAA
ACGCCGCCCTCTTCGCATAGATTCGAAGGAGAACGCCCTCCACAACGAGC
TATGACAATCAACCCCCAAATGATGGGAGGCCGTAACGTTCCCAGACAAC
GAACTTCAAGTGGTGGTCAGGAGGGCGTGAAAGAGAACGAAGATTCTCGA
GGGCGAACGCAAAGTGCTGGCCGTGATTTCAGTAAAGCCCTCAAAATGGT
ATGATATTTTTTTCCGCTATAATCCGAAAGAAGAATTCCTTAGACTCTTA
GAAAAAGACTAGTCGTTACCTGGCGTCGCTTTTGCCGTTCGAACGGGATA
AGCTGACCACATCATAAGTCCTTTGCTGTAAGGGCAAGCGTGATCATGAT
CCTTTTCACCATTTTCCAAAATTAACAACTATTCTAAAACTAACCAACTC
CAACGAAGGGTTTTCCAACAATTAAACTTCCTCTGTGAAAGTCGCGTCTA
TTATATCTTATTTGGCAGGTCCTAACAAAAATCTTTTTTGCGTCATTATG
ACGGGTTCTTCCAATGACCAGGGCGCGATGCCACTTGTCCAAGCCCGCCT
AATTTTTAGCTCTTAACCTCCTATTGGCTATTATAACTTTTCTTTATTAT
TGTAGGCGATCGGATCTCGCGTTGAGCGTGAAAAACAAACTTCAAAGCAG
CACAATGCGCCCGTATCTCCCAACCAACTGCAGCAGAATTCAGGAGGTGC
AAATTATGCCGAGATTGAATTCGCAATTGCCGATAAATCTTCGCCTACTA
TTCGTTCACCGAGAATCGACGACAATCAAAACGACAAAGATGCGAAAGGA
GAGTACACGACTGTATATTTTAGTGACGAGTCTGACCGAGGCCGAGTGGA
TTCTTCAAATCAAAAACAAACTTTCAATAATAGAGACGCTTTAAATTCGC
AAACAAGCTATCACGGTAATATAGAAGTAGAAACGAAATCAAGCATACAG
CAAAATAATACAAGAAATAGTTTAAGAACGAAAAATGACGAACAACCGAA
TTACGAACCAATGGAACTTAAACAACGTACAGACTCATATAAATTCCGAC
CAATTGTTCCGGGTTACGAGGATATGAATACCGAGTTTTCATCGGCTAAT
ACGAGTCACTCTACGCCACCTCCCGAACTACCTTCAAAAGGTCCTCAATT
ACCGATGAAACGTGCGAACACGTTACCAACCCACCGACAACAAACGAACG
ATCAACGTCAATCGGATATCCCTCGTTTCCAACCCCCTCCACCACCTACC
TCGTCGACTTCGTTGAAATCCCGAGAACGCTCGGTTTACGAGAATTCTGA
AATTAAAACATTCGGTACACCGAGAACAAAAAGTACGGGGAGTGGTAAGC
AAATTCTCTCCTGAAGTTGTCTTAACTAATTCTTATTAAGGCTTCATTTT
GTCCCAGATTTTCTTCGGAGATGGGATTCTTTGTGACCCAGGCTTTTTTC
AGGGGAAGGCGAACAGGGGGTAGTTCTGAACACTGAAAATTCTTTCGTTT
GCAGTCATTTTAACGCTTAACTGTTACTAAATTTTATAAGTTTTAGTTTC
CGTAATTAACAGTTTCTACTTTCCGACTAGATCAATCTAACTTTTCTTTC
TAACCCTAATAAGCCTATTTCATAGGAATCGTGTATCTGTTACATGCTTT
TCTCTATTCAATTTAAAGGGGAAAATGCACAAATCTGTGCAGATTTCCCT
TCGAGAAAGACGTTGAAAAAATTGAATTTCTTGTAATCTTATAATGTCAA
TTTGCAAAAGAGTGCTCAACCATAAAATACTGATTACTGCAATGACGTAG
AAAAATATCATGTACTAAAAACACGAATCCTATGAGATAGGTNACTGAAT
TTTATAAGTTTTAGTTTCCGTAATTAACAGTTTCTACTTTCCGACTAGAT
CAATCAAGCTTTCTTTCTAACCCTAATAAGCCTATTTCATAGAAATCGTG
CATCTGTTACATGCTTTTCTCTATTCAATTTAGGGGAGAAAATGCACAAA
TCTGTGCAGATATCCCTTCGAGAAAGACGTTGAAAAAATTGAATTTCTTG
TAATCTTATAATATCAATTCGCAAAAGAGTGCTCAACCAAAAAAAAATGA
TTACTGCAATGATGTAGAAAAATATGATGTACTAAAAACACGAATCCTAT
GAAATAGGCTAATAAGCACTAGCATAAATAACACCAGCACCACTCACTAA
CAACAATACTTACACTCACTTATATTACAACACAGCAGGATCTATCTCAC
CATCGGCACGTTCACCCAATCGTTTACCAAATGCTTTTCCTGTACTCTTA
CAAACACCAAACTCACCTAATGGTATTATTATAATCTTCAGAATTGAATG
AATAATCATTTTCATACCATAGGTGAAAATAAAAAAATGTAGTGTTTCCG
GAATGCGGGTGAAGGAAAAAAGCTCTGATGCGGCCGGCCGGAAAAAAAAT
TATTTTGCTATTTTTAACGAACAAAACTTGATTTACAAGCGGGGATATCT
AAACAAACGACGTTTGATAACTGGAACGGTCAACTTAATTGATGAACCCA
TAGTCTGCGGCCGGGTCAGAAAAATTATTTTCTTCACCCGGCCGGTTTCC
GGAAACACTGCATTTTTTATTTTCGCCTAACCTTTCTTTCTTTTCTACGG
GAAAATCTCAATCAATACCAAGTCTGTACATAACATTCTTTCCACGTCTA
TCTAACGACCTCCTGCTGCCATCAACGCAAAAGGTCTGAAAGGTTCAAAA
TTATTGTCTGAGAAAACTGAGATTTTCTACTTCGGCTAACTTAATATTTT
GACATTGACCATTTCTTTCTTGTATATAGGATCCTTCTTACCACGAGAAA
AGGGTTAATCACAATTTTTTAAGTTAGTAAAGCAAGAAAGATCTCAGTTT
TCTCAGACATTAATTTTGAGATTGGACATTTTGCCTCGATGGCAGTGGGA
GGCCGTTATAGTCGGAAAACGTTAAAGCAACGTTACATGCCATCGTTTGA
TTGTCTATAATGGATCGTTGACTAATATTTCTTAACTACAGTTCTCGCAT
AATGACTAATTTTAAAAATAAGCACATCGAGGCTCAGCCCAAATTAAGTT
CTAATGGGCTATTCCAGAAAAAGTCTGTACCACCTATGTTGAGGAGGTGT
GACGTCCAGGGTGATATGTAAAATAATAATCCAGGAGGTTTGGTTTTTCG
ATTGTTAAAATCAGTAAAATGAAGTTGAGAATCCAAAGTGGTTCCAGGGT
GGTCGGTAAATGAGGTGACAACCCAGGGGGGGGTCAGTAAAACGAGGTAA
AAAATCCAGGGTATTCCAAGAAATGAAAAAAACTAAATCCTTTTTTCAAA
ATGTACCTCCTCAATATTGGAGGTACAATTGTTTTCTGGAATAGCCCACT
TTAAAACACGAGTATTTACTCTTCTTCTTGATATCACGCAACATAATTCT
TCTCTTAGGTCGGACATCGCCATCGGATCTGAGAGCTTCCAAGGTACGGT
TTTAATTTTTTATGAGAATGAGTTTTCCTTTTACAGATGAAATGCATTGT
AGTACAGTGGACTCTCTTTAAATCGAACTTCTATAACTGGAATGTCTCTT
TAGCTTAACTTAATTTATCCCATTCAAATCCTTACCGAATCACTATTGCC
TTTCATAGACGGAGCAAGAAGTATTCGACTGGTTGACCGAGCTGAAACTA
GCCTGTTATTTCGACTCATTCAAGAAACATGGTTTTGACATGGCCAGTAT
GCAGGCTATAACACCCGACGATTTGAATTTCTTAGAAATTCATAAAACAG
GACATCGTAAAAAACTTTTATCGGAGATCGCTAGATTGTCGTTTTCAGAG
AGGTTGCCCAATAATAAACCTGTGAGTGCTGTACTAAGAATTTTTAGGAC
TTTTATTAGACAATGGTTAGACGTTACGGTTTCATATCACTCCGGTACGG
TTTCAGGCCCGGCGGAAGCGTCTCCCCACTTTTGAGCAAATTAGATTTTT
TTCTCAAATTCCTAGCAAATTTTATCTCATTTTGAGCCTTCAGCCTCCCC
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GTTCATACTGATTTCGGAACGTTTTGGAGCAACCAAACGGAGTAGTTCCG
TTCCGATAAAAGAAAAAAAGTGGAGCAAAACCGTTCCTATCTGTTTTGCT
TTGTAACAAATTTTGACGTTCACACTTGTTTCTGAACCGTTTCCTTTCGG
AATGATGTGGAACGGTAACGTCTTAATACGGTCATGGATAGCCTTTCGAT
TGCATTCTTGGATTCAGCGAGACTTTACATGGTGCCTAATTTTCAGGATA
TAATTTAGCTGGTTGATTGGCAAAAGCATCGACCATTATGATACAATGTA
TAGAGCCTTGATTATAGTATTTAGAAACATTTGTCGATTGTTTTCTAATC
CAATGGGCTATTCCATTTTATATTCATACAGGGAGGGGGTGGACCCTCAC
TTTTGAGGTATCAAAAGATTATTCCAAGGGTTCTTTTGCAAATTTTACCA
TTTTTAAATATCCGCGAATCTCTAAGAATCTTTTTTTTTCTGGTTCGTCT
AATAAAAAACGTGTTATCCATTTCTTTCTAAATCCAATGCTTTTCTCTCT
TTAGCGTGACGTAGGTACTTGGCTTGGTCTTCTAAACTTACGACAATACG
AACCAAACTTTGTTGAGGGTGGTTTCGACGATATGGATTTCATCAAAGAT
CTTGATAAAAATGACCTTGAAATGATCGACATTAAGAAACGAGGACATCA
GAAGAAATTGTTACTGGCTGTTCAGAGGTTGAACGATCTGGAGTTAACAG
CGGTACTGGATATTGCGGTGCTCGGTATGTGTTTCTTTGTTCAATGAAAA
CGACGTATCAAGAATCCGGGAAAGGGACTATTTTAGACTTTCAAAATCTT
AGCAAAGGTCGTCAAAAATGAATACACCTTTTCGACCGTAGCCGCCAATT
GCCGCGCGGGCATTTTTTTTGTTCGTTGTCCCAGTCTTTTTTTCGCACCT
AAAGACAATAGAAAAAAGTGCAAAAAAAGGAATGGATCGAGTTTAGGGTG
GTAAATTAAATAATAAAATGGCACGCGCCTGACCGCGCGGTCGAAAAGGT
GTATGTTCGGTCATTTGTGTCTTTCTGCAAACTCGTTACCAGCTCCCGTT
ACGTTAGCTCGTTGTTTTTTCTGGTTCTCATAGCTTTCACGAAAGGTGAA
TTGTATCACATCAAACATCATATTGGTCTTTCTATCCTTTCTGTATTCTT
AACTTCAGTTGAGCTAGAATTTGAGAATGTCTATGTGTGGGCGTGTGCAT
TGTGTATATGTCCCTACCCAAAACTTTAGGGCAGCCTGGAGACTGGTCTG
ATTTGAAATTTGGCACACTTATTCCTTGGGTGAATATGCGGGGGTTTTTT
ATTTAATTTTTCAAAAATTTAGATTTTATAACGAGGCTAAAACTTTAGGC
CTAAAAAATGGTTGGATTTGGCTGAAATTTGGCGCCCTTTTTTTTGGTTA
TTATATGTGGAAGTTTTTTTCATTTTGAATAATTTGAATCTACTGATAGT
TGAGCCCAGTGTGTTGTGCACGTTCGACTATAAGACTATAAGTTTATGTT
CATATGGAAACACATATAATGTTTAAAATATTATGTCATGACAATCACGA
ATTGACAGGATTTAGCTTTTTGTTTCGTATCGTACCCTAAAAGTTCGTAT
TACCAAAAGTTTCTGCGAAGAAGTTTTTTGGGAAAGTATTTTTTTTCAAC
CATCTTTTAGTTTTTAGTAATTGAAGTGTTTATGAAACGATTATAAACAG
TGTTTACGTTTCAAAAAATGCAGCAAGTTGGTTATACAGTGGTATTGTCT
TTCAATGTGTACAAATGAAAGTTTGTTCAAGGAGATGTAAGTTCGTTCGA
ATATATAATACAGTTCAGTTGAGTCTCTATAATTCGAACCCGCACAGGGA
ACACAAATTTGNCGAATATATAATACAGTTCAGTTGAGTCTCTATAACTC
GAACCCGCTAAGGGAACACAAATGTTTTCGAGTTATGGAAATCTCGAGAT
ATGTAGTAAGGCTCATAAGGTTTTGTTGGTCTTTGTTAACTGAAGGGACA
AGAATACTTGTTCGAGTTAAGGAGACATTCGAGTTATAGAGGTTCGAGCT
AAAAGACTCTTCTACACTACACTTGAATGAATGACTTTTATACAGGAATG
TTGTTTTTAATTTAGTGAATACCAATTTATTGAATGGAAACTAGGCAGTG
GATTGATGTTTTTAGACACCCCTGTCTCATAGCCCCGGTGGAACTCTCTT
TCTCAGTAAGGAGAAAAATTCCTATTGAAATACCAATGGCGATAGAAATT
TCTATTGTTTCAAGGTCAAAAAATCCAGCGGGGATGGTTCTGGATTGCAA
TCTTTAAACATTTAATTTCGAATGGGGATGAAATTTTTGACAGATTTTCC
AGTGGGGCTGTGGCCCCAGTGGGTCTGTGAACATGGGGTGAGGTAATACA
TTCCCTGAAAATAGAGGGCTTCAACGTTACTTTACACAATTCCTGCATTT
TTAGCTTCCATGCTGTGACAGAAATTAGGGAAATATGGGAATCGGGTACA
CCTTATTTTATAAGAACATCCAAAATTTTTTAAGCTTTCGGATGTTCTTA
ACTTTTTGTATTTGAAGGCTAAAAATGTTCTTAACATGTTCTTATTTTCA
CCATTTGTGAGTATTTTGTCCATTTTCCTATGAAAATACACGTTTTTTAC
AAGAACATCCAAAATTGTTATAGCCTTGGAATGTTCTTAACTTTTTGAGT
TTTAAGAAAAAATGTTCTTAACATGTTCTTATTTTCGCCCTTTTTGAATG
TTTTTGTCCATTTTTCTAAGAAATTGGGTGTTTTGAGGTCTGTAAAGCTT
TAAAATGATCTGAACTTGTTCTTAACATTTTGGCCATCGAAGCCTTATGT
TATTATATAGTTTGTTCTTATAAAAAAATGTGTATCATCTGAAACCAACC
CTTGCCAAAGTTAGCAAAGTTTTTGCAGTAATTGCTTCATTGGGCTACTG
TGTCTTGCATTGCCGTTAAATAATATAATTTTCGTGTTATGTTCGAGTTG
GGAAAACATTTCTAAAGAAGGTCGTAATTACATCTTTAATAAATTTAAGT
ACCTTCTAATTAAGAAATACAAAAAAATCAATTAATTTTCGAATTATTAA
TAGACTCATTTTACAATTTGCCTCTTACATAAGGCTATGATAAAACAGAC
CATTTGATGTAATGTGTGTTGTGTGGAAAAGGTTGAGTTTGCGAGTTTGG
TGCATGGGTGTATCTGTCAATATACAATATACTGAGGAAATGCCTGGCAA
AGTTACATCAATGAAAAGTTTGCCATTCGTGAATTGCTCTAGTTTCTAGC
AATTTAACCATTACTTGCCTAATTTTGCAATAGGCTTAAACTATGAAAGA
AACGGACGGTGTTGTGAAATACTGTAAGTTGGTCTAATGTCGACATCCCT
CATATAATCCCGACACCCTTTTCATCAGCTGAAATTGATAGAAAGGTTGA
CATTGTTTTTCTTTGCTTAGTGGTCAGAGAGGAATAATCTTTTTTCAATC
AGTGATTCAAACTTTCATATTATTCCTGTCTTTAAAGAAGGGTGTTCGAA
TTAGAAGAGGGATGTTGACATTAGAGTCTAACGCTAGGTTGTCTACCATT
ATGCTTCTTGGTTGGTCTATAGGAGCAATTGTTTCATAGGTTTTTGTTTT
AAAAATGTAAGAACGTCAGTTTTAAAAGGTTAAGCGTTTTATTGCTATTG
TTGAAAGCTTATCAGTTTCAGCTCAGATTTCAGTTTTTACAGCTTTTGAA
AAATCTTTTCTATGTTTGTTTTTTGTGAAAGAAATATGGAAAAAGAGTTT
ATTTTTCTAGAAGAACTTTCTTCTTATCGAAGAGTCTGCGGAGGTGTGTT
TGGACGATTTCTTTTTCGGTCTTTTGAAACCGACTTTACACTTTGTCAAT
ATTTAAGTAAAATTTTAAAAACTTCAATTTTCTTCTTCTTTTTTCCATAT
TGATAAGTATACGGATGGTAAGGAAGATAAGAATGTTGTAGTTTTGAAAT
ATTGAAGATATGCAGAGAGTGTTCGTGTAGAGGTGAAGGAAGAGTCAAAG
ATTGAGAACTGAATATTATTCGCTAGCCCCCTTTGGCAGAAAAAAGGGAA
TAATTTTAGATGTTTTTGTATAGTTCTCACTACACACTCAAGATTCTAGC
AGTCCAAGAAATATCATAGAAAGCAGAATGACTGTTGGGTTGAGATAACT
CAAATCTTCAAAACTCGAATATCTCCTTAACTCAACGATTTTCCTGGTCC
TTTCAGTTAACATTGCCTTATAAACGGCCCCAGTGGTTTGCGTGAATGGG
CTTTTTCACTTGCTTGACTTGGTAAACTTTGCGTGAACAGAAATTACGTG
AATGCGTGAATTGAAGGTCCGCTAACAGTCCTCATAAACCAGTCTCTTTT
TAAACTTAAAGTTTCCATAAATCGAACAAATTTGTGTTCGTTGTGCGTGT
TCGAATTATGGAGACCCTACTGTGTAACGGATTGAGTTGATGTTAGTCAG
GAAAGCCTTCTTTGGAATACCATATGTGTAGCGTGGTGTACATACATCGG
AAATTGTCTTTCTATATTGCCAATTTATTATGGTTTCCTACCTACATATA
AGAACAAATTTTTAAAGCCTTCGGATCTTCTTTTTGAGTTTTAAGTCTAA
AAATTTTCTTAATGCATGCTCGTTGAATTACTTTTTAAATACTCCAAAAA
CTGACAAACTCGGCTTCAATAGTCAAATATTAAGAACAAGCTATGAACAT
TTTAAGGCTTTNGTTCTTAACTTTTTGTATTTGAAGGCTAAAAATGTTCT
TAACATGTTCTTATTTTCACCATTTGTGAGTATTTTGTCCATTTTCCTAT
GAAAATACACGTTTTTTACAAGAACATCCAAAATTGTTATAGCCTTGGAA
TGTTCTTAACTTTTTGAGTTTTAAGAAAAAATGTTCTTAACATGTTCTTA
TTTTCGCCCTTTTTGAATGTTTTTGTCCATTTTTCTAAGAAATTGGGTGT
TTTGAGGTCTGTAAAGCTTTAAAATGATCTGAACTTGTTCTTAACATTTT
GGCCATCGAAGCCTTATGTTATTATATAGTTTGTTCTTATAAAAAAATGT
GTATCATCTGAAACCAACCCTTGCCAAAGTTAGCAAAGTTTTTGCAGTAA
TTGCTTCATTGGGCTACTGTGTCTTGCATTGCCGTTAAATAATATAATTT
TCGTGTTATGTTCGAGTTGGGAAAACATTTCTAAAGAAGGTCGTAATTAC
ATCTTTAATAAATTTAAGTACCTTCTAATTAAGAAATACAAAAAAATCAA
TTAATTTTCGAATTATTAATAGACTCATTTTACAATTTGCCTCTTACATA
AGGCTATGATAAAACAGACCATTTGATGTAATGTGTGTTGTGTGGAAAAG
GTTGAGTTTGCGCGTTTGGTGCATGGGTGTATCTGTCAATATACAATATA
CNGTCCTTAAAGGTATTCTATAGGAATAAAAGGAGCCTTTTTTATGCAGT
CTTTATGCTGAGCCAGATAAATCAAAGCTACTTTTTTACGCAACGATATC
CTGTAAACAAGTGAAAGATCAAAATTTGTTTCGAGATGTGACCTCGCATT
CTTTTGCTTTTGTAAACAAAAAAACTAAGTTGATTTCGAGCAATTTTACA
ATCGAATGTTTTGATTATACATAAGATAGGAAACGTTCTATTTATTATAA
ACATAAAAAGATTCGAATATGTATCAGTAAAAGTCTGAGGAANTAGGCTT
AAACTATGAAAGAAACGGACGGTGTTGTGAAATACTGTAAGTTGGTCTAA
TGTCGACATCCCTCATATAATCCCGACACCCTTTTTATCTGCTGAAATTG
ATAAAAAGGTCAAATGTGTTTTTCTTTGCTTAGTGGTCAGAGAGGAATAA
TCCTTTTTCAACCAGCACTACTGGGTCAGAAACCGTTCGATTCGGACACA
CGAACGCTTTTCCATGCGTGACGAACGGGTCACCCGTTCGTGACGAATGC
TTATGATTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCATCATCAGACCT
TTCAATCAAAACAAAACCTTTAACAGAGGTTTTCCTCACATTGACTGTTT
TTAAAGTTTAATGATGATAAAAATAATTTGATTTTTTTGACTTTAAACGG
AGTCACTGAGACAGGGGTGTATAAGGAAAGTTTAATAATAATTAAAATCA
TTTGATTATTCTTTGACTTCAGTTGGAGTCACTGAGACAAGGGTTGTAAG
AAAAGTTTAATCTACTAAGGATGAAAATCATTTCATTTTATTTTGACTTC
AAACGGGGTCACATGGTGTAAAGAAAGTTTATTTGATACTGATGAAAATC
ATTTGACTTTTCTTTAACTTTTTACATTATTNTTGACTTCAAACGGGGTC
ACTGAGACATGGTGTAAAGAAAGTTTATTTGATACTGATGAAAATCATTT
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AGGTGGTCTGAGAAATTTTATTTGTTTTCTTGCCGAAAGTTAGAATTTAA
TTTGTAACTCTGTATTTCGAGTTTTTTAAAGTTTTGCTCAGGATCATGGA
AGGAAGCTACAAGAAAAAGATCTCAGAATCTTTGAACAGAAATTTCTCAG
ATTTCTGCCATTCCCAGAATAGGCTTTGAAAATGTAGGCTACGCATGCAA
GCATACTTTCAAAAACCACTTTCCTTCGTTGACAACTGATTACTTTTCAC
AAAGACGACTTTGGAATATTATTAGTGAGGATAAGTAAATCGTTGGACGG
ACGAAAATACACCCCTTCTCACAGACCCGCTGGTACCTCTTTCCACTGTA
AAAATTGGCCCAAATATCGTCCCTCGTGGAAAATTATCTTACCGGGTCTG
TGAGAAGGGGGCGTAGAAATATAACAAGCCTGTGAGTTTCAACCAATCAA
ATTTCGTTTGGTGACTAGCCTATAACAATTTTCTTCCGTTGTTGCAATTA
TCCTGGCATTCTATTAATAAAGGTTGTCAATATGTTTCTCAAAATATTTT
TTCATTGTNATTAACGCCAAACCGGTCGCCACTGTGGCTCCTCAACCTCC
ACCACCAGAAGAAGAAATTTGTTTCTCTCCTCCAATGCCCGCCTTTATCC
CACCACCTCCACCCACTGAAGAATTCGTACCTGAACCGTTGGATGATCTT
CCACCACCACCGTCGCCTCTAGATCTACCAGCACCACCGCCCGAGGTTTT
AATGGCGCCCGATGAGATAGAACCGCCCAAAGAAGTAGAGACGCCAGCAG
CTCCTGTTGTTCAACAAACAACAACAACAACGACTACGGCAACCACAGGA
ACAGTGGTCAATGACGATATTAACGATATTGACAAAGCGTAAGTTGGGAT
TTTTTTTTGTAGTACTGTGTCGTTATCAAGCTAAGATTAAAACACATGTT
ATTTGAAATTCTCCATTCAAAGGGATAATCAGGTGGTCTGAGAAATTTTA
TTTGTTTTCTTGCCGAAAGTTATAATTTAATTTGTAACTCTGTATTTCGA
GTTTTTTAAAGTTTTGCTCAGGATCATGGAAGGAAGCTACAAGAAAAAGA
TCTCAGAATCTTTGAACAGAAATTTCTCAGATTTCTGCCATTCCCAGAAT
AGGCTTTGAAAATGTAGGCTACGCATGCAAGCATACTTTCAAAAACCACT
TTCCTTCGTTGACAACTGATTACTTTTCACAAAGACGACTTTGGAATATT
ATTAGTGAGGATAAGTAAATCGTTGGACGGACGAAAATACACCCCTTCTC
ACAGACCCGCTGGTACCTCTTTCCACTGTAAAAATTGGCCCAAATATCGT
CCCTCGTGGAAAATTATCTTACCGGGTCTGTGAGAAGGGGGCGTAGAAAT
ATAACAAGCCTGTGAGTTTCAACCAATCAAATTTCGTTTGGTGACTAGCC
TATAACAATTTTCTTCCGTTGTTGCAATTATCCTGGCATTCTATTAATAA
AGGTTGTCAATATGTTTCTCAAAATATTTTTTCATTGTTTTTTTTCTTTC
CAGGTTCAAGAATACAGATGACATAATGTCAAACCTATTGGCAGATCTGG
ATGATTTCAGCTCTCAAATTGATGACATGTTTTAAAAGAACGATTATAAA
CTTACAACAATAGAAATAGATGAATCTTTGAACAAGAAGCTGTTGTCGGA
AAAGTAAGAGTGTCTGATCAGTTAGAGGCTACAAGATGATGGTTGGTGAA
TGATACAGGGGTGTCAACGTTCGATCATTTTATTTGGTGGAAAATTGATA
CATGGGTGTCAATTCATTCGATCATTTTATTTGGTGGAAAATTGATACAG
GGGTGTCAATTCATTCGATCATTTTATTTGACGGAAAGTACCTTGGTTCT
TTCACATGATTCTATCATTGATCAAGCTATTTGGCGATGCCACAAAGTTT
CATGACACTTCGTTGAAAAGATATTTCATTAGAACCCACCACAGTATGAG
TAGGTCTTAATTACGTCCCAAAGAACAATANATTTCATCAGAACCGACCA
CAGTATGAGTAGGTCTTAATTACGTCCAAAAAGAACAATATACAAGTATA
TAAACAAAATAAGAAATTTTCATCTACCAAAAGTATATGGACTAATACAA
GGCTTTGGCTCTTTTGTCAGCCAAAAAATGGCTCATATATTTTTGAGATT
CATGATTTTTGTCACCTAATGTTTTATATGGAAATAAATAGCTTAAAACA
CTCGGGCGTTTACAAATCATTTTATCGTTTGAAACTCGATAGTAATCCTG
CAGTTTTTTCCATATAAAAGATTACGTTGTGAATATTATGAGGTTAGATC
CTAAATACAAAAAAGGGAAATGCAGAAGTTTATATATTTTTCTTTTTCTT
CGAACGCAACATCATGTATCATATACAAAAATGTACCATATTTTAAATAG
AATTTTAGGCTACGCTGTTTTTCTGTTTTGTTTCAATTTTTCTTGTATAT
GTATCGCTGTACTCTTTATGTTAACATTTTTTTTGTAAATTTACCACTAT
ATATTTTCAGTAAATGACTTTCACCGCGATTGATTTTGTACCGTACCGTA
GAGTACATCCGCCTGATCTAAAGATCAATTTAATTAATCATCGTACCCAG
AGCCACTCNAA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_029869	XLOC_029869	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_117	supercontig	scaffold_117:509026..541986 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
4.9614	7.753	21.3385	26.0427	1.60781	0.0032574	11.3366	9.42345	3.54905	3.4072	6.43193	1.57777	9.8279	9.30563	5.5475	3.83389	9.9306	8.48825	9.13437	8.86052	12.8807	11.5334	6.65687	6.17234	8.72165	7.95787	0.000826822	2.44172	6.40527	3.35985e-05

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00046817 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: CSKI1 (Caskin-1 OS=Homo sapiens GN=CASKIN1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 129.798 bits (325), Expect = 4.982e-30
Identity = 55/136 (40.44%), Postives = 88/136 (64.71%), Query Frame = 1

Query: 1276 SKTEQEVFDWLTELKLACYFDSFKKHGFDMASMQAITPDDLNFLEIHKTGHRKKLLSEIARLSFSERLPNNKPRDVGTWLGLLNLRQYEPNFVEGGFDDMDFIKDLDKNDLEMIDIKKRGHQKKLLLAVQRLNDLE 1683
             K+ + V  WLT  +L  Y  +F   G+D+ ++  +TP+DL  + + K GHRKK+ +EI+ LS  + LP +KP ++  WL ++ L QY    V+ G++++DFI D+   DL+ I I K GHQKKL+LAV++L +L+
Sbjct:  471 GKSSEAVSQWLTAFQLQLYAPNFISAGYDLPTISRMTPEDLTAIGVTKPGHRKKIAAEISGLSIPDWLPEHKPANLAVWLSMIGLAQYYKVLVDNGYENIDFITDITWEDLQEIGITKLGHQKKLMLAVRKLAELQ 606

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00046817 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00046817 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
CSKI1	4.982e-30	40.44	Caskin-1 OS=Homo sapiens GN=CASKIN1 PE=1 SV=1	[more]

You are here

TCONS_00046817 (transcript) - C. hemisphaerica