TCONS_00046818 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00046818
Unique Name	TCONS_00046818
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4227

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_117:509026..541994-

transcript sequence

>TCONS_00046818 ID=TCONS_00046818|Name=TCONS_00046818|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4227bp
CTGCCGTAACAATGATGCAAGACCAGACCAGCAAATTCTTGGCTCTTCTC
AATCAAAAGCTGAGTGACCAAGAGTTCAACCAGCCACCAAAACAAACGGC
TGCTGGTAGTCTACCACCTCGAATGAGTAGCTTCAAACAAAAACGACAAG
ACGGTAATGGACCATTGAAGTCACCGCGTTCACCGACAAAGTCACCACGA
AAATCTCCTTCACATAAATACCCTGCACCTCCACCTCCTCCTGAACGAAG
TCTCTCTCATGACGGTCAACAGAGCCACGTTAATGGGCGTGAAACACACC
GTTCATTTTCGGAGGAAACGCCGCCCTCTTCGCATAGATTCGAAGGAGAA
CGCCCTCCACAACGAGCTATGACAATCAACCCCCAAATGATGGGAGGCCG
TAACGTTCCCAGACAACGAACTTCAAGTGGTGGTCAGGAGGGCGTGAAAG
AGAACGAAGATTCTCGAGGGCGAACGCAAAGTGCTGGCCGTGATTTCAGT
AAAGCCCTCAAAATGGCGATCGGATCTCGCGTTGAGCgtgaaaaacaaac
ttcaaagcaGCACAATGCGCCCGTATCTCCCAACCAACTGCAGCAGAATT
CAGGAGGTGCAAATTATGCCGAGATTGAATTCGCAATTGCCGATAAATCT
TCGCCTACTATTCGTTCACCGAGAATCGACGACAATCAAAACGACAAAGA
TGCGAAAGGAGAGTACACGACTGTATATTTTAGTGACGAGTCTGACCGAG
GCCGAGTGGAttcttcaaatcaaaaacaaactttcaataatagaGACGCT
TTAAATTCGCAAACAAGCTATCACGGTAATATAGAAGTAGAAACGAAATC
AAGCATACAGCAAAATAATACAAGAAATAGTTTAAGAACGAAAAATGACG
AACAACCGAATTACGAACCAATGGAACTTAAACAACGTACAGACTCATAT
AAATTCCGACCAATTGTTCCGGGTTACGAGGATATGAATACCGAGTTTTC
ATCGGCTAATACGAGTCACTCTACGCCACCTCCCGAACTACCTTCAAAAG
GTCCTCAATTACCGATGAAACGTGCGAACACGTTACCAACCCACCGACAA
CAAACGAACGATCAACGTCAATCGGATATCCCTCGTTTCCAACCCCCTCC
ACCACCTACCTCGTCGACTTCGTTGAAATCCCGAGAACGCTCGGTTTACG
AGAATTCTGAAATTAAAACATTCGGTACACCGAGAACAAAAAGTACGGGG
AGTGCAGGATCTATCTCACCATCGGCACGTTCACCCAATCGTTTACCAAA
TGCTTTTCCTGTACTCTTACAAACACCAAACTCACCTAATGGTCGGACAT
CGCCATCGGATCTGAGAGCTTCCAAGACGGAGCAAGAAGTATTCGACTGG
TTGACCGAGCTGAAACTAGCCTGTTATTTCGACTCATTCAAGAAACATGG
TTTTGACATGGCCAGTATGCAGGCTATAACACCCGACGATTTGAATTTCT
TAGAAATTCATAAAACAGGACATCGTAAAAAACTTTTATCGGAGATCGCT
AGATTGTCGTTTTCAGAGAGGTTGCCCAATAATAAACCTCGTGACGTAGG
TACTTGGCTTGGTCTTCTAAACTTACGACAATACGAACCAAACTTTGTTG
AGGGTGGTTTCGACGATATGGATTTCATCAAAGATCTTGATAAAAATGAC
CTTGAAATGATCGACATTAAGAAACGAGGACATCAGAAGAAATTGTTACT
GGCTGTTCAGAGGTTGAACGATCTGGAGTTAACAGCGGTACTGGATATTG
CGGTGCTCGAAAGTCCAACAAAAAGAGCACACAGTTTTCGAAAAACCCGT
GAAAACAGTAATAAAAGTTCGACGCCGGAACCGTCACCGTTACCGACACA
AATAACAGAAGATTCAAACGTCTTCACATTCCCTGCTCCTCCACAAACCG
ATTCTCACAATCACCAACAACAAACGAGTAGAGATTCTCACACTGAACAA
TCAACATTGCACCTCCGGAATTCGTATCTGGACCAGGAGCCTGATATAGC
AGTCGTTGAAACTGTTACTCAAAACCAAAACTCTTTCACAGAGGCTActc
attttcaagaaaatacaaTCTCAAAATCAATAAATTATCAACAACAGTCT
TCCTACACAGACGATTCAGATATGTCCACAGCCGCCTTAAGCCCACGCGC
CCCACCGCCCTTAGCATCAAAACCTGCTAAGCCCGCCCCAACACCTAAAC
CAAAGCCCGCTGTTCCTCCACCGGTTGCCGCCCGTAAACCATCAGTTGGA
CCTTCAGTAAAACCGAAACCAAAGCCGCCCGTCAAACCGCCCCAAGAACA
GGCGGTGCCAAGTTCACCTGCATCGAAAGTGACATCGGGGGAAATGCAAG
GTAGTCAGGAAGAAGTTGTTAGATCATCGAAATCAAGAGattttttcaaG
CAAGTTGAGAAGAAAGTGTTAGATGATAATAACAGTCCGACCAACTCCTT
GGAACGAAGACGCAGTTCTTCATCTTCGGCCTCTTGGAACGATCGAAGAA
GTTCTCATAGTTCTACTGGATCCATTTCTCCAACAGGTACCATCATTAAG
AAGAAACCTGTTCCTGCGCCAACACCCAAACCGAAACCAGTGGTTGAAGA
AAAGCCACAACCACTTCCACCACAACCACACGTGGATCCGCTATACCCAC
CAGCAATGCTGGCTGCACAAGCGCCGCCAGTAGCCGCTAAGAAAGCGCCA
CCACCTGCACCACCGAAACGAATCAACAGTCAGATAAGTGAAAACGTTGT
CCTTCCCGGTGTCTCGCCCGCATCCTCGCAACCGGAAATTAACGCCAAAC
CGGTCGCCACTGTGGCTCCTCAACCTCCACCACCAGAAGAAGAAATTTGT
TTCTCTCCTCCAATGCCCGCCTTTATCCCACCACCTCCACCCACTGAAGA
ATTCGTACCTGAACCGTTGGATGATCTTCCACCACCACCGTCGCCTCTAG
ATCTACCAGCACCACCGCCCGAGGTTTTAATGGCGCCCGATGAGATAGAA
CCGCCCAAAGAAGTAGAGACGCCAGCAGCTCCTGTTgttcaacaaacaac
aacaacaacgactacGGCAACCACAGGAACAGTGGTCAATGACGATATTA
ACGATATTGACAAAGCgtTCAAGAATACAGATGACATAATGTCAAACCTA
TTGGCAGATCTGGATGATTTCAGCTCTCAAATTGATGACATGTTTTAAAA
GAACGATTATAAACTTACAACAATAGAAATAGATGAATCTTTGAACAAGA
AGCTGTTGTCGGAAAAGTAAGAGTGTCTGATCAGTTAGAGGCTACAAGAT
GATGGTTGGTGAATGATACAGGGGTGTCAACGTTCGATCATTTTATTTGG
TGGAAAATTGATACAGGGGTGTCAATTCATTCGATCATTTTATTTGACGG
AAAGTACCTTGGTTCTTTCACATGATTCTATCATTGATCAAGCTATTTGG
CGATGCCACAAAGTTTCATGACacttcgttgaaaagatatttcattAGAA
CCCACCACAGTATGAGTAGGTCTTAATTACGTCCCAAAGAACAATANATT
TCATCAGAACCGACCACAGTATGAGTAGGTCTTAATTACGTCCAAAAAGA
ACAATATACAAGTATAtaaacaaaataagaaattttcatCTACCAAAAGT
ATATGGACTAATACAAGGCTTTGGCTCTTTTGTCAGCCAAAAAATGGCTC
ATATATTTTTGAGATTCATGATTTTTGTCACCTAATGTTTTATATGGAAA
TAAATAGCTTAAAACACTCGGGCGTTTACAAATCATTTTATCGTTTGAAA
CTCGATAGTAATCCTGCAGTTTTTTCCatataaaagattacgttgTGAAT
ATTATGAGGTTAGATCCTAAATACAAAAAAGGGAAATGCAGaagtttata
tatttttctttttcttcgaaCGCAACATCATGTATCATATACAAAAATGT
ACCATATTTTAAATAGAATTTTAGGCTACGctgtttttctgttttgtttc
aatttttcttgtatATGTATCGCTGTACTCTTTAtgttaacatttttttt
gtaaatttaccACTATATATTTTCAGTAAATGACTTTCACCGCGATTGAT
TTTGTACCGTACCGTAGAGTACATCCGCCTGATCTAAAGATCAATTTAAT
TAATCatcgtacccagagccactcNAA

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transcript from alignment at scaffold_117:509026..541994-

Legend: exon

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>TCONS_00046818 ID=TCONS_00046818|Name=TCONS_00046818|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=32969bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_117:509026..541994- (Clytia hemisphaerica)
CTGCCGTAACAATGATGCAAGACCAGACCAGCAAATTCTTGGCTCTTCTC
AATCAAAAGCTGAGTACGTTTTTTGAACAGTTAAATCTTTCCATTTCATA
TGATACACATGTTTTTGACCAGTGTCTCCTTTTAAAATGTAAATGACTCT
TTCAGTTTCTTTTGAGTAGAAATCCAATTTAATCTCTCTAAGTCATGGGT
CTTGATGGTTTTATCTCGGTGGGTAAATTCTAGGGCAAGACAGGCTATAT
TGTAAACAAGATTCTCCCAATCGCGAAATTAAACTCCGTGGAACTTACGA
ATTTGGAGTTGTGAACCGCGAAATTAAATTCCGCAAAAGTTTCTTCCCAG
ATAGAATCATGAGCTTTAAAAAAGTCAAACGTTTTTGAAACAAGGGAATT
CTAATCCACTGTTAGTTAACTACGCTGACGTTCCTGCCTCATTCGATGAT
CGATATTTTCTCTGATCACAGTGGATTCTCTTTATCTCGAGCCTCTATAA
CTCGAACAAGTTGTATGGTCCCTTCAGTTAATAACACCTTAAAAACCAAT
CTTCATAAGTCGAAATTTCCTTAGCTCGAACAAATTTGTGTTCGGCCCGT
GGGTGTTCAAGTAATGGGGGCTCCGCCGTACTATTTTAGGAAACTTAGCA
CGCTACACTTTTAATGATAAAAATGATAACTATAAATCTAATGTTATTCA
TCTTGGCGTTTAGGTGTCTTCTTTACACCGCTACACTTTTGTCGGATGAC
AAAAAATCTTTTAAAAAATCTAACCAAAGAATAAAAACCATTGATAATTA
AGATGATTTTTAAAGATTTTTTTGTTATGTTTTCTTAACCAGGTGACCAA
GAGTTCAACCAGCCACCAAAACAAACGGCTGCTGGTAGTCTACCACCTCG
AATGAGTAGCTTCAAACAAAAACGACAAGACGGTGAGATGTTTATATATA
TTATGTTAAAAAGGCTTATGTACCAGTTTTATCAGGAGACAAATTTATCG
CAACTTTGAAACAAATTTGTTTGCGACCCAGTTGAATGTGACCCGAAGGT
TCCTATTTATTAGCTGTCTACTGGGAAATATGTGCCGCATCCCCAGTAGG
ATTCGACTATCTTTGGTCGTAAAGCTAAAAGCATTTTGGTCAATCCCCGG
AAACGAGGGCTGGGTTAGCAGACTTCCCGCTGCAAAATACGTAAGAAGTT
TACTCGATTTAAAAATTAACACTTATAGATCTAGGGGATTTAATCACCTT
GGTAATAGGCTCAAAACGAGGCAGTCGTTGCACTCAAAATAAATTATAAA
AAGGCCTTTTCTTGTTTCTACAGGTAATGGACCATTGAAGTCACCGCGTT
CACCGACAAAGTCACCACGAAAATCTCCTTCACATAAATACCCTGCACCT
CCACCTCCTCCTGAACGAAGTCTCTCTCATGACGGTCAACAGGTCAGATT
CTTATATAGTTGAGTCTCTCTTAACTCGAACCTCTAAAACTCGAATGTCT
CCTTAACTCAAACAAGTTTGCCTGTCCCTTTAGAGTTAACAAAAAACCTT
ACTCTATTCATGATATGCACCACTGCAATGTCTTCTGACATTGCATCACG
TTGGTTGTAAGTGACGTAAAATCAGTCAATACGTCACTTTGAACCAATCA
GCTATTAGGTGGAATGGAAGACATTGCAATGGTGCATATCACGAATATCT
CAAAATTTGAATAGTGTGTTGGAGTTATAGAGACTCAACTGTAAAATAAA
TCTTTACGCGGAGTAATTTTTTGAGGTCTCGCTCATCTGAAAATGCAATG
GAGACTCTATAACTCGAACACGGAAGGGGAACGCAAATCGAGATATAGAG
CAAGGTTTATAAAGCTATTGTTAACTGGAAAACATTCGAGTTATCACTGT
ATCATATATTCTTATAAATAATACCGTCAATACCTGAAAATATTTTACTT
TTTCATACAACAGAGCCACGTTAATGGGCGTGAAACACACCGTTCATTTT
CGGAGGAAACGCCGCCCTCTTCGCATAGATTCGAAGGAGAACGCCCTCCA
CAACGAGCTATGACAATCAACCCCCAAATGATGGGAGGCCGTAACGTTCC
CAGACAACGAACTTCAAGTGGTGGTCAGGAGGGCGTGAAAGAGAACGAAG
ATTCTCGAGGGCGAACGCAAAGTGCTGGCCGTGATTTCAGTAAAGCCCTC
AAAATGGTATGATATTTTTTTCCGCTATAATCCGAAAGAAGAATTCCTTA
GACTCTTAGAAAAAGACTAGTCGTTACCTGGCGTCGCTTTTGCCGTTCGA
ACGGGATAAGCTGACCACATCATAAGTCCTTTGCTGTAAGGGCAAGCGTG
ATCATGATCCTTTTCACCATTTTCCAAAATTAACAACTATTCTAAAACTA
ACCAACTCCAACGAAGGGTTTTCCAACAATTAAACTTCCTCTGTGAAAGT
CGCGTCTATTATATCTTATTTGGCAGGTCCTAACAAAAATCTTTTTTGCG
TCATTATGACGGGTTCTTCCAATGACCAGGGCGCGATGCCACTTGTCCAA
GCCCGCCTAATTTTTAGCTCTTAACCTCCTATTGGCTATTATAACTTTTC
TTTATTATTGTAGGCGATCGGATCTCGCGTTGAGCGTGAAAAACAAACTT
CAAAGCAGCACAATGCGCCCGTATCTCCCAACCAACTGCAGCAGAATTCA
GGAGGTGCAAATTATGCCGAGATTGAATTCGCAATTGCCGATAAATCTTC
GCCTACTATTCGTTCACCGAGAATCGACGACAATCAAAACGACAAAGATG
CGAAAGGAGAGTACACGACTGTATATTTTAGTGACGAGTCTGACCGAGGC
CGAGTGGATTCTTCAAATCAAAAACAAACTTTCAATAATAGAGACGCTTT
AAATTCGCAAACAAGCTATCACGGTAATATAGAAGTAGAAACGAAATCAA
GCATACAGCAAAATAATACAAGAAATAGTTTAAGAACGAAAAATGACGAA
CAACCGAATTACGAACCAATGGAACTTAAACAACGTACAGACTCATATAA
ATTCCGACCAATTGTTCCGGGTTACGAGGATATGAATACCGAGTTTTCAT
CGGCTAATACGAGTCACTCTACGCCACCTCCCGAACTACCTTCAAAAGGT
CCTCAATTACCGATGAAACGTGCGAACACGTTACCAACCCACCGACAACA
AACGAACGATCAACGTCAATCGGATATCCCTCGTTTCCAACCCCCTCCAC
CACCTACCTCGTCGACTTCGTTGAAATCCCGAGAACGCTCGGTTTACGAG
AATTCTGAAATTAAAACATTCGGTACACCGAGAACAAAAAGTACGGGGAG
TGGTAAGCAAATTCTCTCCTGAAGTTGTCTTAACTAATTCTTATTAAGGC
TTCATTTTGTCCCAGATTTTCTTCGGAGATGGGATTCTTTGTGACCCAGG
CTTTTTTCAGGGGAAGGCGAACAGGGGGTAGTTCTGAACACTGAAAATTC
TTTCGTTTGCAGTCATTTTAACGCTTAACTGTTACTAAATTTTATAAGTT
TTAGTTTCCGTAATTAACAGTTTCTACTTTCCGACTAGATCAATCTAACT
TTTCTTTCTAACCCTAATAAGCCTATTTCATAGGAATCGTGTATCTGTTA
CATGCTTTTCTCTATTCAATTTAAAGGGGAAAATGCACAAATCTGTGCAG
ATTTCCCTTCGAGAAAGACGTTGAAAAAATTGAATTTCTTGTAATCTTAT
AATGTCAATTTGCAAAAGAGTGCTCAACCATAAAATACTGATTACTGCAA
TGACGTAGAAAAATATCATGTACTAAAAACACGAATCCTATGAGATAGGT
NACTGAATTTTATAAGTTTTAGTTTCCGTAATTAACAGTTTCTACTTTCC
GACTAGATCAATCAAGCTTTCTTTCTAACCCTAATAAGCCTATTTCATAG
AAATCGTGCATCTGTTACATGCTTTTCTCTATTCAATTTAGGGGAGAAAA
TGCACAAATCTGTGCAGATATCCCTTCGAGAAAGACGTTGAAAAAATTGA
ATTTCTTGTAATCTTATAATATCAATTCGCAAAAGAGTGCTCAACCAAAA
AAAAATGATTACTGCAATGATGTAGAAAAATATGATGTACTAAAAACACG
AATCCTATGAAATAGGCTAATAAGCACTAGCATAAATAACACCAGCACCA
CTCACTAACAACAATACTTACACTCACTTATATTACAACACAGCAGGATC
TATCTCACCATCGGCACGTTCACCCAATCGTTTACCAAATGCTTTTCCTG
TACTCTTACAAACACCAAACTCACCTAATGGTATTATTATAATCTTCAGA
ATTGAATGAATAATCATTTTCATACCATAGGTGAAAATAAAAAAATGTAG
TGTTTCCGGAATGCGGGTGAAGGAAAAAAGCTCTGATGCGGCCGGCCGGA
AAAAAAATTATTTTGCTATTTTTAACGAACAAAACTTGATTTACAAGCGG
GGATATCTAAACAAACGACGTTTGATAACTGGAACGGTCAACTTAATTGA
TGAACCCATAGTCTGCGGCCGGGTCAGAAAAATTATTTTCTTCACCCGGC
CGGTTTCCGGAAACACTGCATTTTTTATTTTCGCCTAACCTTTCTTTCTT
TTCTACGGGAAAATCTCAATCAATACCAAGTCTGTACATAACATTCTTTC
CACGTCTATCTAACGACCTCCTGCTGCCATCAACGCAAAAGGTCTGAAAG
GTTCAAAATTATTGTCTGAGAAAACTGAGATTTTCTACTTCGGCTAACTT
AATATTTTGACATTGACCATTTCTTTCTTGTATATAGGATCCTTCTTACC
ACGAGAAAAGGGTTAATCACAATTTTTTAAGTTAGTAAAGCAAGAAAGAT
CTCAGTTTTCTCAGACATTAATTTTGAGATTGGACATTTTGCCTCGATGG
CAGTGGGAGGCCGTTATAGTCGGAAAACGTTAAAGCAACGTTACATGCCA
TCGTTTGATTGTCTATAATGGATCGTTGACTAATATTTCTTAACTACAGT
TCTCGCATAATGACTAATTTTAAAAATAAGCACATCGAGGCTCAGCCCAA
ATTAAGTTCTAATGGGCTATTCCAGAAAAAGTCTGTACCACCTATGTTGA
GGAGGTGTGACGTCCAGGGTGATATGTAAAATAATAATCCAGGAGGTTTG
GTTTTTCGATTGTTAAAATCAGTAAAATGAAGTTGAGAATCCAAAGTGGT
TCCAGGGTGGTCGGTAAATGAGGTGACAACCCAGGGGGGGGTCAGTAAAA
CGAGGTAAAAAATCCAGGGTATTCCAAGAAATGAAAAAAACTAAATCCTT
TTTTCAAAATGTACCTCCTCAATATTGGAGGTACAATTGTTTTCTGGAAT
AGCCCACTTTAAAACACGAGTATTTACTCTTCTTCTTGATATCACGCAAC
ATAATTCTTCTCTTAGGTCGGACATCGCCATCGGATCTGAGAGCTTCCAA
GGTACGGTTTTAATTTTTTATGAGAATGAGTTTTCCTTTTACAGATGAAA
TGCATTGTAGTACAGTGGACTCTCTTTAAATCGAACTTCTATAACTGGAA
TGTCTCTTTAGCTTAACTTAATTTATCCCATTCAAATCCTTACCGAATCA
CTATTGCCTTTCATAGACGGAGCAAGAAGTATTCGACTGGTTGACCGAGC
TGAAACTAGCCTGTTATTTCGACTCATTCAAGAAACATGGTTTTGACATG
GCCAGTATGCAGGCTATAACACCCGACGATTTGAATTTCTTAGAAATTCA
TAAAACAGGACATCGTAAAAAACTTTTATCGGAGATCGCTAGATTGTCGT
TTTCAGAGAGGTTGCCCAATAATAAACCTGTGAGTGCTGTACTAAGAATT
TTTAGGACTTTTATTAGACAATGGTTAGACGTTACGGTTTCATATCACTC
CGGTACGGTTTCAGGCCCGGCGGAAGCGTCTCCCCACTTTTGAGCAAATT
AGATTTTTTTCTCAAATTCCTAGCAAATTTTATCTCATTTTGAGCCTTCA
GCCTCCCCACTTTTACCGTTGTTCGGCCGGGCCTGGGTTTTCGTTACGAA
TAGGAAGTGTTCATACTGATTTCGGAACGTTTTGGAGCAACCAAACGGAG
TAGTTCCGTTCCGATAAAAGAAAAAAAGTGGAGCAAAACCGTTCCTATCT
GTTTTGCTTTGTAACAAATTTTGACGTTCACACTTGTTTCTGAACCGTTT
CCTTTCGGAATGATGTGGAACGGTAACGTCTTAATACGGTCATGGATAGC
CTTTCGATTGCATTCTTGGATTCAGCGAGACTTTACATGGTGCCTAATTT
TCAGGATATAATTTAGCTGGTTGATTGGCAAAAGCATCGACCATTATGAT
ACAATGTATAGAGCCTTGATTATAGTATTTAGAAACATTTGTCGATTGTT
TTCTAATCCAATGGGCTATTCCATTTTATATTCATACAGGGAGGGGGTGG
ACCCTCACTTTTGAGGTATCAAAAGATTATTCCAAGGGTTCTTTTGCAAA
TTTTACCATTTTTAAATATCCGCGAATCTCTAAGAATCTTTTTTTTTCTG
GTTCGTCTAATAAAAAACGTGTTATCCATTTCTTTCTAAATCCAATGCTT
TTCTCTCTTTAGCGTGACGTAGGTACTTGGCTTGGTCTTCTAAACTTACG
ACAATACGAACCAAACTTTGTTGAGGGTGGTTTCGACGATATGGATTTCA
TCAAAGATCTTGATAAAAATGACCTTGAAATGATCGACATTAAGAAACGA
GGACATCAGAAGAAATTGTTACTGGCTGTTCAGAGGTTGAACGATCTGGA
GTTAACAGCGGTACTGGATATTGCGGTGCTCGGTATGTGTTTCTTTGTTC
AATGAAAACGACGTATCAAGAATCCGGGAAAGGGACTATTTTAGACTTTC
AAAATCTTAGCAAAGGTCGTCAAAAATGAATACACCTTTTCGACCGTAGC
CGCCAATTGCCGCGCGGGCATTTTTTTTGTTCGTTGTCCCAGTCTTTTTT
TCGCACCTAAAGACAATAGAAAAAAGTGCAAAAAAAGGAATGGATCGAGT
TTAGGGTGGTAAATTAAATAATAAAATGGCACGCGCCTGACCGCGCGGTC
GAAAAGGTGTATGTTCGGTCATTTGTGTCTTTCTGCAAACTCGTTACCAG
CTCCCGTTACGTTAGCTCGTTGTTTTTTCTGGTTCTCATAGCTTTCACGA
AAGGTGAATTGTATCACATCAAACATCATATTGGTCTTTCTATCCTTTCT
GTATTCTTAACTTCAGTTGAGCTAGAATTTGAGAATGTCTATGTGTGGGC
GTGTGCATTGTGTATATGTCCCTACCCAAAACTTTAGGGCAGCCTGGAGA
CTGGTCTGATTTGAAATTTGGCACACTTATTCCTTGGGTGAATATGCGGG
GGTTTTTTATTTAATTTTTCAAAAATTTAGATTTTATAACGAGGCTAAAA
CTTTAGGCCTAAAAAATGGTTGGATTTGGCTGAAATTTGGCGCCCTTTTT
TTTGGTTATTATATGTGGAAGTTTTTTTCATTTTGAATAATTTGAATCTA
CTGATAGTTGAGCCCAGTGTGTTGTGCACGTTCGACTATAAGACTATAAG
TTTATGTTCATATGGAAACACATATAATGTTTAAAATATTATGTCATGAC
AATCACGAATTGACAGGATTTAGCTTTTTGTTTCGTATCGTACCCTAAAA
GTTCGTATTACCAAAAGTTTCTGCGAAGAAGTTTTTTGGGAAAGTATTTT
TTTTCAACCATCTTTTAGTTTTTAGTAATTGAAGTGTTTATGAAACGATT
ATAAACAGTGTTTACGTTTCAAAAAATGCAGCAAGTTGGTTATACAGTGG
TATTGTCTTTCAATGTGTACAAATGAAAGTTTGTTCAAGGAGATGTAAGT
TCGTTCGAATATATAATACAGTTCAGTTGAGTCTCTATAATTCGAACCCG
CACAGGGAACACAAATTTGNCGAATATATAATACAGTTCAGTTGAGTCTC
TATAACTCGAACCCGCTAAGGGAACACAAATGTTTTCGAGTTATGGAAAT
CTCGAGATATGTAGTAAGGCTCATAAGGTTTTGTTGGTCTTTGTTAACTG
AAGGGACAAGAATACTTGTTCGAGTTAAGGAGACATTCGAGTTATAGAGG
TTCGAGCTAAAAGACTCTTCTACACTACACTTGAATGAATGACTTTTATA
CAGGAATGTTGTTTTTAATTTAGTGAATACCAATTTATTGAATGGAAACT
AGGCAGTGGATTGATGTTTTTAGACACCCCTGTCTCATAGCCCCGGTGGA
ACTCTCTTTCTCAGTAAGGAGAAAAATTCCTATTGAAATACCAATGGCGA
TAGAAATTTCTATTGTTTCAAGGTCAAAAAATCCAGCGGGGATGGTTCTG
GATTGCAATCTTTAAACATTTAATTTCGAATGGGGATGAAATTTTTGACA
GATTTTCCAGTGGGGCTGTGGCCCCAGTGGGTCTGTGAACATGGGGTGAG
GTAATACATTCCCTGAAAATAGAGGGCTTCAACGTTACTTTACACAATTC
CTGCATTTTTAGCTTCCATGCTGTGACAGAAATTAGGGAAATATGGGAAT
CGGGTACACCTTATTTTATAAGAACATCCAAAATTTTTTAAGCTTTCGGA
TGTTCTTAACTTTTTGTATTTGAAGGCTAAAAATGTTCTTAACATGTTCT
TATTTTCACCATTTGTGAGTATTTTGTCCATTTTCCTATGAAAATACACG
TTTTTTACAAGAACATCCAAAATTGTTATAGCCTTGGAATGTTCTTAACT
TTTTGAGTTTTAAGAAAAAATGTTCTTAACATGTTCTTATTTTCGCCCTT
TTTGAATGTTTTTGTCCATTTTTCTAAGAAATTGGGTGTTTTGAGGTCTG
TAAAGCTTTAAAATGATCTGAACTTGTTCTTAACATTTTGGCCATCGAAG
CCTTATGTTATTATATAGTTTGTTCTTATAAAAAAATGTGTATCATCTGA
AACCAACCCTTGCCAAAGTTAGCAAAGTTTTTGCAGTAATTGCTTCATTG
GGCTACTGTGTCTTGCATTGCCGTTAAATAATATAATTTTCGTGTTATGT
TCGAGTTGGGAAAACATTTCTAAAGAAGGTCGTAATTACATCTTTAATAA
ATTTAAGTACCTTCTAATTAAGAAATACAAAAAAATCAATTAATTTTCGA
ATTATTAATAGACTCATTTTACAATTTGCCTCTTACATAAGGCTATGATA
AAACAGACCATTTGATGTAATGTGTGTTGTGTGGAAAAGGTTGAGTTTGC
GAGTTTGGTGCATGGGTGTATCTGTCAATATACAATATACTGAGGAAATG
CCTGGCAAAGTTACATCAATGAAAAGTTTGCCATTCGTGAATTGCTCTAG
TTTCTAGCAATTTAACCATTACTTGCCTAATTTTGCAATAGGCTTAAACT
ATGAAAGAAACGGACGGTGTTGTGAAATACTGTAAGTTGGTCTAATGTCG
ACATCCCTCATATAATCCCGACACCCTTTTCATCAGCTGAAATTGATAGA
AAGGTTGACATTGTTTTTCTTTGCTTAGTGGTCAGAGAGGAATAATCTTT
TTTCAATCAGTGATTCAAACTTTCATATTATTCCTGTCTTTAAAGAAGGG
TGTTCGAATTAGAAGAGGGATGTTGACATTAGAGTCTAACGCTAGGTTGT
CTACCATTATGCTTCTTGGTTGGTCTATAGGAGCAATTGTTTCATAGGTT
TTTGTTTTAAAAATGTAAGAACGTCAGTTTTAAAAGGTTAAGCGTTTTAT
TGCTATTGTTGAAAGCTTATCAGTTTCAGCTCAGATTTCAGTTTTTACAG
CTTTTGAAAAATCTTTTCTATGTTTGTTTTTTGTGAAAGAAATATGGAAA
AAGAGTTTATTTTTCTAGAAGAACTTTCTTCTTATCGAAGAGTCTGCGGA
GGTGTGTTTGGACGATTTCTTTTTCGGTCTTTTGAAACCGACTTTACACT
TTGTCAATATTTAAGTAAAATTTTAAAAACTTCAATTTTCTTCTTCTTTT
TTCCATATTGATAAGTATACGGATGGTAAGGAAGATAAGAATGTTGTAGT
TTTGAAATATTGAAGATATGCAGAGAGTGTTCGTGTAGAGGTGAAGGAAG
AGTCAAAGATTGAGAACTGAATATTATTCGCTAGCCCCCTTTGGCAGAAA
AAAGGGAATAATTTTAGATGTTTTTGTATAGTTCTCACTACACACTCAAG
ATTCTAGCAGTCCAAGAAATATCATAGAAAGCAGAATGACTGTTGGGTTG
AGATAACTCAAATCTTCAAAACTCGAATATCTCCTTAACTCAACGATTTT
CCTGGTCCTTTCAGTTAACATTGCCTTATAAACGGCCCCAGTGGTTTGCG
TGAATGGGCTTTTTCACTTGCTTGACTTGGTAAACTTTGCGTGAACAGAA
ATTACGTGAATGCGTGAATTGAAGGTCCGCTAACAGTCCTCATAAACCAG
TCTCTTTTTAAACTTAAAGTTTCCATAAATCGAACAAATTTGTGTTCGTT
GTGCGTGTTCGAATTATGGAGACCCTACTGTGTAACGGATTGAGTTGATG
TTAGTCAGGAAAGCCTTCTTTGGAATACCATATGTGTAGCGTGGTGTACA
TACATCGGAAATTGTCTTTCTATATTGCCAATTTATTATGGTTTCCTACC
TACATATAAGAACAAATTTTTAAAGCCTTCGGATCTTCTTTTTGAGTTTT
AAGTCTAAAAATTTTCTTAATGCATGCTCGTTGAATTACTTTTTAAATAC
TCCAAAAACTGACAAACTCGGCTTCAATAGTCAAATATTAAGAACAAGCT
ATGAACATTTTAAGGCTTTNGTTCTTAACTTTTTGTATTTGAAGGCTAAA
AATGTTCTTAACATGTTCTTATTTTCACCATTTGTGAGTATTTTGTCCAT
TTTCCTATGAAAATACACGTTTTTTACAAGAACATCCAAAATTGTTATAG
CCTTGGAATGTTCTTAACTTTTTGAGTTTTAAGAAAAAATGTTCTTAACA
TGTTCTTATTTTCGCCCTTTTTGAATGTTTTTGTCCATTTTTCTAAGAAA
TTGGGTGTTTTGAGGTCTGTAAAGCTTTAAAATGATCTGAACTTGTTCTT
AACATTTTGGCCATCGAAGCCTTATGTTATTATATAGTTTGTTCTTATAA
AAAAATGTGTATCATCTGAAACCAACCCTTGCCAAAGTTAGCAAAGTTTT
TGCAGTAATTGCTTCATTGGGCTACTGTGTCTTGCATTGCCGTTAAATAA
TATAATTTTCGTGTTATGTTCGAGTTGGGAAAACATTTCTAAAGAAGGTC
GTAATTACATCTTTAATAAATTTAAGTACCTTCTAATTAAGAAATACAAA
AAAATCAATTAATTTTCGAATTATTAATAGACTCATTTTACAATTTGCCT
CTTACATAAGGCTATGATAAAACAGACCATTTGATGTAATGTGTGTTGTG
TGGAAAAGGTTGAGTTTGCGCGTTTGGTGCATGGGTGTATCTGTCAATAT
ACAATATACNGTCCTTAAAGGTATTCTATAGGAATAAAAGGAGCCTTTTT
TATGCAGTCTTTATGCTGAGCCAGATAAATCAAAGCTACTTTTTTACGCA
ACGATATCCTGTAAACAAGTGAAAGATCAAAATTTGTTTCGAGATGTGAC
CTCGCATTCTTTTGCTTTTGTAAACAAAAAAACTAAGTTGATTTCGAGCA
ATTTTACAATCGAATGTTTTGATTATACATAAGATAGGAAACGTTCTATT
TATTATAAACATAAAAAGATTCGAATATGTATCAGTAAAAGTCTGAGGAA
NTAGGCTTAAACTATGAAAGAAACGGACGGTGTTGTGAAATACTGTAAGT
TGGTCTAATGTCGACATCCCTCATATAATCCCGACACCCTTTTTATCTGC
TGAAATTGATAAAAAGGTCAAATGTGTTTTTCTTTGCTTAGTGGTCAGAG
AGGAATAATCCTTTTTCAACCAGCACTACTGGGTCAGAAACCGTTCGATT
CGGACACACGAACGCTTTTCCATGCGTGACGAACGGGTCACCCGTTCGTG
ACGAATGCTTATGATTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCATCA
TCAGACCTTTCAATCAAAACAAAACCTTTAACAGAGGTTTTCCTCACATT
GACTGTTTTTAAAGTTTAATGATGATAAAAATAATTTGATTTTTTTGACT
TTAAACGGAGTCACTGAGACAGGGGTGTATAAGGAAAGTTTAATAATAAT
TAAAATCATTTGATTATTCTTTGACTTCAGTTGGAGTCACTGAGACAAGG
GTTGTAAGAAAAGTTTAATCTACTAAGGATGAAAATCATTTCATTTTATT
TTGACTTCAAACGGGGTCACATGGTGTAAAGAAAGTTTATTTGATACTGA
TGAAAATCATTTGACTTTTCTTTAACTTTTTACATTATTNTTGACTTCAA
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CGCCATATTAATGTAGGAATTGTTAGTCGCACTCACTGCTAGACACTAGT
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TTATCAAGCTAAAATTAAAACACATTTTATTTGAAATTCTCCATTCAAAG
GGATAATCAGGTGGTCTGAGAAATTTTATTTGTTTTCTTGCCGAAAGTTA
GAATTTAATTTGTAACTCTGTATTTCGAGTTTTTTAAAGTTTTGCTCAGG
ATCATGGAAGGAAGCTACAAGAAAAAGATCTCAGAATCTTTGAACAGAAA
TTTCTCAGATTTCTGCCATTCCCAGAATAGGCTTTGAAAATGTAGGCTAC
GCATGCAAGCATACTTTCAAAAACCACTTTCCTTCGTTGACAACTGATTA
CTTTTCACAAAGACGACTTTGGAATATTATTAGTGAGGATAAGTAAATCG
TTGGACGGACGAAAATACACCCCTTCTCACAGACCCGCTGGTACCTCTTT
CCACTGTAAAAATTGGCCCAAATATCGTCCCTCGTGGAAAATTATCTTAC
CGGGTCTGTGAGAAGGGGGCGTAGAAATATAACAAGCCTGTGAGTTTCAA
CCAATCAAATTTCGTTTGGTGACTAGCCTATAACAATTTTCTTCCGTTGT
TGCAATTATCCTGGCATTCTATTAATAAAGGTTGTCAATATGTTTCTCAA
AATATTTTTTCATTGTNATTAACGCCAAACCGGTCGCCACTGTGGCTCCT
CAACCTCCACCACCAGAAGAAGAAATTTGTTTCTCTCCTCCAATGCCCGC
CTTTATCCCACCACCTCCACCCACTGAAGAATTCGTACCTGAACCGTTGG
ATGATCTTCCACCACCACCGTCGCCTCTAGATCTACCAGCACCACCGCCC
GAGGTTTTAATGGCGCCCGATGAGATAGAACCGCCCAAAGAAGTAGAGAC
GCCAGCAGCTCCTGTTGTTCAACAAACAACAACAACAACGACTACGGCAA
CCACAGGAACAGTGGTCAATGACGATATTAACGATATTGACAAAGCGTAA
GTTGGGATTTTTTTTTGTAGTACTGTGTCGTTATCAAGCTAAGATTAAAA
CACATGTTATTTGAAATTCTCCATTCAAAGGGATAATCAGGTGGTCTGAG
AAATTTTATTTGTTTTCTTGCCGAAAGTTATAATTTAATTTGTAACTCTG
TATTTCGAGTTTTTTAAAGTTTTGCTCAGGATCATGGAAGGAAGCTACAA
GAAAAAGATCTCAGAATCTTTGAACAGAAATTTCTCAGATTTCTGCCATT
CCCAGAATAGGCTTTGAAAATGTAGGCTACGCATGCAAGCATACTTTCAA
AAACCACTTTCCTTCGTTGACAACTGATTACTTTTCACAAAGACGACTTT
GGAATATTATTAGTGAGGATAAGTAAATCGTTGGACGGACGAAAATACAC
CCCTTCTCACAGACCCGCTGGTACCTCTTTCCACTGTAAAAATTGGCCCA
AATATCGTCCCTCGTGGAAAATTATCTTACCGGGTCTGTGAGAAGGGGGC
GTAGAAATATAACAAGCCTGTGAGTTTCAACCAATCAAATTTCGTTTGGT
GACTAGCCTATAACAATTTTCTTCCGTTGTTGCAATTATCCTGGCATTCT
ATTAATAAAGGTTGTCAATATGTTTCTCAAAATATTTTTTCATTGTTTTT
TTTCTTTCCAGGTTCAAGAATACAGATGACATAATGTCAAACCTATTGGC
AGATCTGGATGATTTCAGCTCTCAAATTGATGACATGTTTTAAAAGAACG
ATTATAAACTTACAACAATAGAAATAGATGAATCTTTGAACAAGAAGCTG
TTGTCGGAAAAGTAAGAGTGTCTGATCAGTTAGAGGCTACAAGATGATGG
TTGGTGAATGATACAGGGGTGTCAACGTTCGATCATTTTATTTGGTGGAA
AATTGATACATGGGTGTCAATTCATTCGATCATTTTATTTGGTGGAAAAT
TGATACAGGGGTGTCAATTCATTCGATCATTTTATTTGACGGAAAGTACC
TTGGTTCTTTCACATGATTCTATCATTGATCAAGCTATTTGGCGATGCCA
CAAAGTTTCATGACACTTCGTTGAAAAGATATTTCATTAGAACCCACCAC
AGTATGAGTAGGTCTTAATTACGTCCCAAAGAACAATANATTTCATCAGA
ACCGACCACAGTATGAGTAGGTCTTAATTACGTCCAAAAAGAACAATATA
CAAGTATATAAACAAAATAAGAAATTTTCATCTACCAAAAGTATATGGAC
TAATACAAGGCTTTGGCTCTTTTGTCAGCCAAAAAATGGCTCATATATTT
TTGAGATTCATGATTTTTGTCACCTAATGTTTTATATGGAAATAAATAGC
TTAAAACACTCGGGCGTTTACAAATCATTTTATCGTTTGAAACTCGATAG
TAATCCTGCAGTTTTTTCCATATAAAAGATTACGTTGTGAATATTATGAG
GTTAGATCCTAAATACAAAAAAGGGAAATGCAGAAGTTTATATATTTTTC
TTTTTCTTCGAACGCAACATCATGTATCATATACAAAAATGTACCATATT
TTAAATAGAATTTTAGGCTACGCTGTTTTTCTGTTTTGTTTCAATTTTTC
TTGTATATGTATCGCTGTACTCTTTATGTTAACATTTTTTTTGTAAATTT
ACCACTATATATTTTCAGTAAATGACTTTCACCGCGATTGATTTTGTACC
GTACCGTAGAGTACATCCGCCTGATCTAAAGATCAATTTAATTAATCATC
GTACCCAGAGCCACTCNAA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_029869	XLOC_029869	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_117	supercontig	scaffold_117:509026..541994 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.450508	0.360905	0.0182389	0.0898858	8.14998e-05	0.0241223	1.08309	0.000236601	1.53285	3.43802	1.52645	1.95497	1.20777e-06	1.60961e-06	0.000300238	0.000247102	5.37395e-06	1.83689e-05	1.40018e-07	6.6129e-09	7.86628e-05	0.0873505	0.023332	0.00128496	0.000758372	1.03662e-09	0.365785	0.621529	3.43522e-05	0.312202

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00046818 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: CSKI1 (Caskin-1 OS=Homo sapiens GN=CASKIN1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 130.183 bits (326), Expect = 3.867e-30
Identity = 55/136 (40.44%), Postives = 88/136 (64.71%), Query Frame = 3

Query: 1371 SKTEQEVFDWLTELKLACYFDSFKKHGFDMASMQAITPDDLNFLEIHKTGHRKKLLSEIARLSFSERLPNNKPRDVGTWLGLLNLRQYEPNFVEGGFDDMDFIKDLDKNDLEMIDIKKRGHQKKLLLAVQRLNDLE 1778
             K+ + V  WLT  +L  Y  +F   G+D+ ++  +TP+DL  + + K GHRKK+ +EI+ LS  + LP +KP ++  WL ++ L QY    V+ G++++DFI D+   DL+ I I K GHQKKL+LAV++L +L+
Sbjct:  471 GKSSEAVSQWLTAFQLQLYAPNFISAGYDLPTISRMTPEDLTAIGVTKPGHRKKIAAEISGLSIPDWLPEHKPANLAVWLSMIGLAQYYKVLVDNGYENIDFITDITWEDLQEIGITKLGHQKKLMLAVRKLAELQ 606

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00046818 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00046818 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
CSKI1	3.867e-30	40.44	Caskin-1 OS=Homo sapiens GN=CASKIN1 PE=1 SV=1	[more]

You are here

TCONS_00046818 (transcript) - C. hemisphaerica