TCONS_00047162 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00047162
Unique Name	TCONS_00047162
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	5569

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_123:57466..66929+

transcript sequence

>TCONS_00047162 ID=TCONS_00047162|Name=TCONS_00047162|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5569bp
ttttaatttaattttgagaaacaaattgttttaattgttttgtttacatt
tgataTACAAAGGATCATTGAACTTTTATTGAATCTCAGACAAAAAGTTC
TTCCATTTGAAAGACCTTCAGCACAATTCTTAAGGTGAAAACCACTCAAG
CGTACCATatctcatcaattattcatAACccattcaaattttcaataatg
TAAAATTACAATTCGGCATATTCTTAAGACGTAGAACAAGAAAGTTTAGA
TTCCTTTTAATTAACTTTAATTGGATGAAGAATTAACCCAATTTAGgggt
tcaaattaaaaaaaaatgaggcTTAGGCTGCTAGTATTATTACTAGCCCT
AGCTTTATGCTTGACAAATGCAAAACCACTGACGGATACCCAAACAGAGG
AAAGTCCCGATGCAACTCCAGAGAAGAAAGACAATACTCCTGAACCAAAC
ACTGAACAATCACCAGATGAAGACCAAAAGTCAACAGAAGAGGTTGATCA
ACCTTCTTCATCAGAGAAAGAAACATCTACTGAATCACAACCAGAAGAAG
CTTCAGAATCTGAATCCACCAAGGAGGTAGAAGAATCGAATGATGATACT
ACTGAAGGTGCCAAGAAGACTGAAGTCCCTAATAagGACGCCGAAGCATC
TGAAGAATCGTCAGACGATGTCGCAGATACTGAGGACAACACTGATGATG
CTGCCAAGAGGGATTTCGGCGGTGGACATGAGGGTGGTGGCCATCACGGA
GACGAAGGTGGTCACGAAGGCCAACACGGTCATCACGAACACGACAATCA
TCATCACGGTCACCAACATCATGATCATGGTTATGAATTCTATGAAGAAT
GGGGAGAGCATGGTGGTCATGAAGGTGAACATCATGGACACCACGAAGGA
GGACAAACGTGAGAAAGTTGacaaaaccaaaaccaaaactGCTACCCCTC
AAAAAGCTGAAGATGCCACTGACGGTGAAGATGCTTCCAAGAAATGGTGG
TTAGTTGGAGATCACTGGGGAGGTTGGGGTCACTCCCACTGGGGACACCC
TCACGCTATTGGTGATGGTGGTGGCTGGCAATGGGGTCACCATGGCTTAC
ACGGCGGTCACGGTGGTGGCTACGGTGGCGGCTATGGCGGTGGTTTGGGT
GGATACGGTGGCGGTTATGGCGGCGGTTTGGGTGGATACGGTGGCGGCAA
CGGAGGCTACGGAGGAAATGGCGGTGGTTGCGGTCATGGTGGCTGCGGAG
GAGGATATGGTGGCTATGGAGGTCATGGATATGGCGGAAACGGCCATGGT
GGATGTGGACACGGTGGTTGTGGTGGACACGTTGGTGGTCACTACAAGAG
CAAAATCCCTGACTGTTGCAAATCCAAAGATCCAAAGGTCACCAAGAGAT
GTGGATGCCATTTGGGAACAACTGGACACGGTGGGTACCATTTTAGTGAT
CATGGTTCAGGGCATGATAACCATGATCATCGCATCCAAGGCCCATGGAG
TTTCGGATATGACCATTTCGGGGATGATTGGTCTGACTGGGATCATAACA
CGCATTCGTTCCGTTATTTGACTGATATGACTCACTTGCCACATGATGAT
CATTGTGGACATGGCCGTGCATGTGTTCCATTGAACGGTGTTCACCGATT
CTCACGATTTTATCCTTCTCTTCATTTTGAAGGTCCAGCTGGTAATGGTT
TCTTCGGAGGACTCGGTGGTGGATACGGAGGACTCGGTGGTGGATATGGT
GGACTCGGTGGTGGATACGGTGGATTGGGTGGTGGATATGGTGCAGGATC
TGGTGGGTTTGGCCTTGGTGGCGCTGTCGGAGGTTGTGGATGCAATGCCG
GTGGTTGCGGTTGCGGCCCTGGTTTCGCTCTTGGTGGTGGCTTGAACAAT
TACGGTGTATATGGACATTCCGGATGGCCAGTACGCAAATTCGACAACTA
CCGTGTTTGTCATAAATGCCACGATCTACCAAGCGGTGGATCACGATGTC
TGTGCAAGAGTGTTCGTCATCATCCATTGTACTTACCTGTTGTTCATCGA
CCAGCTCACGTCTACATTGATTGCGATACCAGTGCACACAAATTCGGACA
CAACAGATGTTACGCCAGAGCTGATATTCCTACTCCTGAAGAAGAAAACA
CAGAGACTGGTGCAGCCAAACAAGGCGTGTTCTATCCATATGCCAACTAT
GGTCCATGGTCTGCCTACCCATGGTGGGGAGACTGGTGGGGTGGTCACGG
TCATCACGCTTTTGGAGAAGGTCACGGTTCGGGTCACGGTCAGGGTCAGG
GTCACGGTGGTGGATGCGGTGGATGTGATGGTTGCGGTAATCACGCAGGC
GGTTGCCGAGGTAGATGCTCAGGTTGTGGACACCACGGTATGGGACGAAA
TGTTGGATTTAGCTTCGGTCATGGCGCCCATCTTCAAGCTTATNTCATAA
CACGCATTCGTTCCGTTATTTGACTGATATGACTCACTTGCCACATGATG
ATCATTGTGGACATGGCCGTGCATGTGTTCCATTGAACGGTGTTCACCGA
TTCTCACGATTTTATCCTTCTCTTCATTTTGAAGGTCCAGCTGGTAATGG
TTTCTTCGGAGGACTCGGTGGTGGATACGGAGGACTCGGTGGTGGATATG
GTGGACTCGGTGGTGGATACGGTGGATTGGGTGGTGGATATGGTGCAGGA
TCTGGTGGGTTTGGCCTTGGTGGCGCTGTCGGAGGTTGTGGATGCAATGC
CGGTGGTTGCGGTTGCGGCCCTGGTTTCGCTCTTGGTGGTGGCTTGAACA
ATTACGGTGTATATGGACATTCCGGATGGCCAGTACGCAAATTCGACAAC
TACCGTGTTTGTCATAAATGCCACGATCTACCAAGCGGTGGATCACGATG
TCTGTGCAAGAGTGTTCGTCATCATCCATTGTACTTACCTGTTGTTCATC
GACCAGCTCACGTCTACATTGATTGCGATACCAGTGCACACAAATTCGGA
CACAACAGATGTTACGCCAGAGCTGATATTCCTACTCCTGAAGAAGAAAA
CACAGAGACTGGTGCAGCCAAACAAGGCGTGTTCTATCCATATGCCAACT
ATGGTCCATGGTCTGCCTACCCATGGTGGGGAGACTGGTGGGGTGGTCAC
GGTCATCACGCTTTTGGAGAAGGTCACGGTTCGGGTCACGGTCAGGGTCA
GGGTCACGGTGGTGGATGCGGTGGATGTGATGGTTGCGGTAATCACGCAG
GCGGTTGCCGAGGTAGATGCTCAGGTTGTGGACACCACGGTATGGGACGA
AATGTTGGATTTAGCTTCGGTCATGGCGCTCATCTTCAAGCTTATCATTG
TAAAGATCAAGTTGAGAAAGTGAATGGAGCTGATGACCACGAAGATGCAA
CCACCAAGCGATTCTGCGTTCCCATTGGATACAATGGTGGATACGGTTTC
CCATACTTTCACGGATATCCAGGAGTCGGTACGGGACTATGGGGATGGGG
ATGGCCTTGGATCAAGAATAAGGTCCCTGGANGACTCGGTGGTGGATACG
GAGGACTCGGTGGTGGATATGGTGGACTCGGTGGTGGATACGGTGGATTG
GGTGGTGGATATGGTGCAGGATCTGGTGGGTTTGGCCTTGGTGGCGCTGT
CGGAGGTTGTGGATGCAATGCCGGTGGTTGCGGTTGCGGCCCTGGTTTCG
CTCTTGGTGGTGGCTTGAACAATTACGGTGTATATGGACATTCCGGATGG
CCAGTACGCAAATTCGACAACTACCGTGTTTGTCATAAATGCCACGATCT
ACCAAGCGGTGGATCACGATGTCTGTGCAAGAGTGTTCGCCATCATCCAT
TGTACTTACCTGTTGTTCATCGACCAGCTCACGTCTACATTGATTGCGAT
ACCAGTGCACACAAATTCGGACACAACAGATGTTACGCCAGAGCTGATAT
TCCTACTCCTGAAGAAGAAAACACAGAGACTGGTGCAGCCAAACAAGGCG
TGTTCTATCCATATGCCAACTATGGTCCATGGTCTGCCTACCCATGGTGG
GGAGACTGGTGGGGTGGTCACGGTCATCATTCTTGGGGAGAAGGTCACGG
TCAGGGTCACGGTGGTGGATGCGGTGGATGTGGTGGTTGTGGCCATCACG
CAGGCGGTTGCCGAGGTAGATGCTCAGGTTGTGGACACCACGGTATGGGA
CGAAATGTTGGATTTAGCTTCGGTCGTGGCGCTCATCTTCAAGCTTACCA
TTGTAAAGATCAAGTTGAGAAAGTGAATGGAGCTGATGACCACGAAGATG
CAACCACCAAGCGATTCTGCGTTCCCATTGGATACAATGGTGGATACGGT
TTCCCATACTTTCACGGATATCCAGGAGTCGGTACGGGACTCTGGGGATG
GGGATGGCCTTGGATCAAGAATAAGGTCCCTGGATCCAAActcaaagaaa
agaaagtgACATCCAAAGATAGCTCAGCATCCAAATCTACCAAGGATACT
GCTTCTAAAGATACAAAGAAGAGTGCTATCCCAAGACGACAAACCAAAAA
ACAAACCATCCATGTTGGTTACGGATACGCAAGTGGCGACAATTATCGCC
TCGGATACGGAATGGGCGGCATGGGTGGCGTGGCTGGATTCACATCACCC
CACGGTGCACCTTTAACACAGTTCGCACGCTCACGAATTCCAGCTGCTGA
ATCAACGAAAGATGTCACCGGTACCAAACGAAACATGGCTTTTTCTCAAG
AACCATCATCTACAGGATCAATGTTAGGACATCCAGTCACACACCCAGGG
TTTACAACCATGGGATTCCCAGGGCACGCTGATTCATCTATCGAAGCACA
AAAATCAAGGATCCCaaagaaattgtaaatttatcGCAATCACCAACCTA
ATGTCTAACCTATATTTGTATTACATCCATCCATCCACTCACCATACAAG
ATGATGTTATCCTGTTATTAATTGGTGTTATAACGTCCCAATAGTACCAT
AGTTCGTCTTTATAATTGTGTTATTCTGTAATACGTAGCTCTTGTAATAA
CCCCATATTTGTTAATGTAGTTTTATGTATGTTTTATTATGTGTGTTAGA
TCATTTGTAAGATCACTCATTATAttattaggcgagaccaatttaatttg
ttgttctacgggcccgaccgaccctattttcactaaaatcaaaaaaataa
taatattgaattcccactacaatatattttacacactagttatttgtaag
aatcaaatttgaatataacGATCTGCccttagaacaacaaattaaattgg
tctcgccttatttAACAAAATAGTCGTGTTATATGATTTTAACCATTTGT
ACAATAGATTTTATTCTAATAGAAAAattaatcaaagtcaatttcacaTT
TTATATTATCTCCAAGAGTGCAGGTCAAATTTTATCTCAGCCGCAACCAa
aacttttttcccaaaattgctATCCCgaaaaatctcgttttttctTCCCT
ATGAGAAGTCAAAGTTACCTCACAAGATTTTAGCATTTCCTAGAATGCTT
CGTTTAAGTCAAATAGCAT

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_123:57466..66929+

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00047162 ID=TCONS_00047162|Name=TCONS_00047162|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9464bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_123:57466..66929+ (Clytia hemisphaerica)
ttttaatttaattttgagaaacaaattgttttaattgttttgtttacatt
tgataTACAAAGGATCATTGAACTTTTATTGAATCTCAGACAAAAAGTTC
TTCCATTTGAAAGACCTTCAGCACAATTCTTAAGGTGAAAACCACTCAAG
CGTACCATatctcatcaattattcatAACccattcaaattttcaataatg
TAAAATTACAATTCGGCATATTCTTAAGACGTAGAACAAGAAAGTTTAGA
TTCCTTTTAATTAACTTTAATTGGATGAAGAATTAACCCAATTTAGgggt
tcaaattaaaaaaaaatgaggcTTAGGCTGCTAGTATTATTACTAGCCCT
AGCTTTATGCTTGACAAATGCAAAACCACTGACGGATACCCAAACAGAGG
AAAGTCCCGATGGTATGttcaatttttattgttttgcttctttttcattt
ataacTGACTGGTTTCAGCAAAGTTGTTTTTCTAGGGTAATATTTATTCC
tgagaaatttttcttgaaagcaTTCCTAATAAAGTCTTTTCTCTTGATAG
ttgatttttttcgtttttctctTAATTGTATTTGCATACAGATTCCATTA
AATCATGAGTTTTGAGCTTGTGGACAACGCACTTTTTCGTTGTTTGAATT
TTCGGTTGGCTAATAAATGCTGAAACTTGCCAGAAAATTATCTTTAATTG
TATCAGAAAGAACCGAgaatagattttaaaattgGACTTCGTTTCCTCCG
AAAGCTTAAGTTAACCAAGATCAAATACCAAGCTTCTCCAAAAACCTTCT
TATAAATTCCCTGGTTATTTCATCTTCTATTCACACATTACAGCAACTCC
AGAGAAGAAAGACAATACTCCTGAACCAAACACTGAACAATCACCAGATG
AAGACCAAAAGTCAACAGAAGAGGTTGATCAACCTTCTTCATCAGAGAAA
GAAACATCTACTGAATCACAACCAGAAGAAGCTTCAGAATCTGAATCCAC
CAAGGAGGTAGAAGAATCGAATGATGATACTACTGAAGGTGCCAAGAAGA
CTGAAGTCCCTAATAaggtatttttcttttcttatacaAGTTTGTTGCCA
ATCTATTGGCATTTTTAAAATCTATGGCTCAAACATGAGGTTTGAAGTAC
TCACAATTTAGTTAAGCACGAGAATGTTAAAAAAAGACTTTCGAATTCTG
TTTGATTATCTGTTTCATTACAACACTCTAAGTTGAACCGTTTATGGATT
TAGAAAATCACACTGTTATACAAAATATCCAGTCATGGCATAGTACAGTT
TGTCGGAAAGATATATTCTACAAAGAAATACACCAGCAAACATTAAATAG
TTTTCATGTTTTAAGTAACTAGATGATTTTCGTCCTGAACAAGATGATag
gcaaaaaattttctttcttttccacaAATGGAATGCAGTCAACGGAGTTG
AtgagaaaaaaactgaatttcggTTTTCTGAAAATACTTTTTGTTAATAG
TTAGTAGTTTTTTCACGTAACCTTTCCCCATGAAAACAGCTCTGTTGGCT
GCTTTTGATCAAACTTGcatgtttttatcaaatgatgTATATCAATTTGC
TGTCCAAAAAAAGCCAATTTTTATGGTGAAAGAATCCTGAAGATTATCCT
TTATTGATCTGGAATGTTCTTAGTTCCCGACCGAATAAGGTACGTGCTTT
TCAAAAGCAGCAGTCAACACGGGTTGTTTTTAATGAGAAAGGGCTGTCTC
TATCACACAAacaatttgaaagttttaataatAATTACAAGTCTCAAAGT
TTTATTGGGCACAGGCTTTCTCGTAAAGACAGCTCTGTTGATTGCTgacc
ttttgtttcttttcacttttttttctaatttctgaaaattttgatcAGTT
CTTTAAATAACCTATTTACCTTTCAACCATTGCACAAAAAGGTTGCATGA
AAAAAGGTTCTACCGAGGGTCGAATAACGTTAAACGGAGTATCATTGCTT
TGCGTTAACGGAGTCGGTAGTACTGACATTTGACGTCATCGACCCTTGTA
AATTGCTCACACTTATTTCAAGTGTCTTGTTGCTTTTTTACTCCTTTGGT
GATTATCGAACGCCGTTGAACGCCATGAACTTGTACTATTAGACAAAATT
CTTATCTTAACTTATCTGCTGCATTTTACGCACATTTACTTAATTTACAT
TTACTTCATAGCGGAACCAATCTAACCCCAGTTCTTTTATCGcattctct
tttttttcatttttagaaaccgaagaagaagaagaaatcttccaaaagca
aGAAAACAAAATCCAAAGCCAAATCTACTAAAGAAATAGACCGTCGATAT
GGTATGGGCGGTTATGGCGGTGGTATGGGCGGACATCATATGGGTGGACA
TCACATGGGTGGACACCACATGGGACATCACGGTCACCATGGACACCATG
ATCACGATCACGGACATGAGCATTATGAAGAATGGGATCACCATGGAGAG
CATGGAGACCACCACGGTGGAGGACACGGACATCACCACGGTCACCATGG
ACACCACGATCACCACGATCATGGTCACCATCATGGTTTCCACCACGATT
GGCATCATGATCATGGAGGTCATCATGGTGGACATCACGGTCATGGAGGT
GGAGGAATGATGGGAGGTGGAGGATACCGTCGTGATGAGCTGACTGCTAA
CAAGAGGTTTTTCATGCCATTCAGTCCTTTCAGTGGAGGAAATCCTGGAC
CCTTCAATGAGGGAATAGTTGATGTTTTTAACATGAATCCACTTCAATGG
CCCAACCCCTGGACACGAAATTGGATCGGTGCTAACGAAGGAGGACCACC
TGTCTCTGGTGTCTTCAACACACAATACCAAATACCCGCACTTCCTGTTG
TAGCCGCTTTGAATTCAGGATTACTAAGCAATTCAGCGGGATCATGGGAA
AGTCCGGCAGTGTTGGCTGGTAGCAGAAGATCATTAAAGAGCACTGGATG
TCAACCAGGAGATTCTGGTAAACGTGGATGCGGATGTGCTGGTAATCATG
AGAAATGCGGTGGACAGGGATACAGCGGTGGGTTTGGTTTGAACCACGGT
GATCATTATGATGATGGCTTCCACGGTGGCCTACATTTCCCACTTGGTGG
ATGGTATGGTTGGGGTGCATGGCCATGGGGCACTTACGGTGATTTTGTCG
GCCACCATGGTAATGCTGTACCATGTGATGTACCACACCACGAACATCAT
TTAGATAACAACAGTGGTTATGATGAAGGTGAAGGACGAGTTGGTCATAC
CGGTGGCTACGGTGGTGGTGAATACAGCGGGCATCACGGTGATTGTGGTC
ACGGACACGGCGGTTGTGGAGGTCATGATGGACACCATGGATCAGGATAC
GGTGGATATGCAGGTCATCACGGTGGTCACGGCAGCTACGGAGGAGTTGG
AACACAAAGCGGACACGGTCATCACGGAGGTGGTCATGGTCACGGCGGCT
ACGGTAACCACGGAAGTTACGGCGGCCATGGACACGGACATTGTAGAAGT
CAAATTCCTAAAAGCACAATCGATAAACCATTCTTACCAATGTCAGCTGT
TATGGAAGACTTTTAGATCAATCAAATAATAATAGCCAATAAACACTATT
TATATAACCGTCatagtattttttcattgattAATATTTAATCTTTTGTC
ATCCTGTGTTTCGTCTTGTAAATATTCTAGCATCcattattcaaaaagaa
aagaagtatGTTTTTGTTAATTATTTTTGAACACGTTTTGATTCGGACAG
AACCGGCGGATAGAAGAAGAGATCTCGCATTAATTTTGAATTCGCATTTT
ATGCTTTTTCATCAACTCCGTTTACTACAATGAAAccttttttaagctaa
aaacaTTTAGACCACATATCAAATATCTTCATAgttattcaaaatgaaat
taaatttttaaaaaccaacACTTTCGTAAGGACCCCTTTTTAGCCTCATT
TTCAAGTATTGCTTTCCCTTATGACTtgtcaaggaaaatgaaaaacagtG
TACTGTAAACACTGTAAATCTTCTATCTTTCTTAATCAGGACGCCGAAGC
ATCTGAAGAATCGTCAGACGATGTCGCAGATACTGAGGACAACACTGATG
ATGCTGCCAAGAGGGATTTCGGCGGTGGACATGAGGGTGGTGGCCATCAC
GGAGACGAAGGTGGTCACGAAGGCCAACACGGTCATCACGAACACGACAA
TCATCATCACGGTCACCAACATCATGATCATGGTTATGAATTCTATGAAG
AATGGGGAGAGCATGGTGGTCATGAAGGTGAACATCATGGACACCACGAA
GGAGGACATCACGGTGAGCACGGACATCATCACGGTGGTCACCACGGTGG
CGGCGGCGGATACAAACGTGAGAAAGTTGacaaaaccaaaaccaaaactG
CTACCCCTCAAAAAGCTGAAGATGCCACTGACGGTGAAGATGCTTCCAAG
AAATGGTGGTTAGTTGGAGATCACTGGGGAGGTTGGGGTCACTCCCACTG
GGGACACCCTCACGCTATTGGTGATGGTGGTGGCTGGCAATGGGGTCACC
ATGGCTTACACGGCGGTCACGGTGGTGGCTACGGTGGCGGCTATGGCGGT
GGTTTGGGTGGATACGGTGGCGGTTATGGCGGCGGTTTGGGTGGATACGG
TGGCGGCAACGGAGGCTACGGAGGAAATGGCGGTGGTTGCGGTCATGGTG
GCTGCGGAGGAGGATATGGTGGCTATGGAGGTCATGGATATGGCGGAAAC
GGCCATGGTGGATGTGGACACGGTGGTTGTGGTGGACACGTTGGTGGTCA
CTACAAGAGCAAAATCCCTGACTGTTGCAAATCCAAAGATCCAAAGGTCA
CCAAGAGATGTGGATGCCATTTGGGAACAACTGGACACGGTGGGTACCAT
TTTAGTGATCATGGTTCAGGGCATGATAACCATGATCATCGCATCCAAGG
CCCATGGAGTTTCGGATATGACCATTTCGGGGATGATTGGTCTGACTGGG
ATCATAACACGCATTCGTTCCGTTATTTGACTGATATGACTCACTTGCCA
CATGATGATCATTGTGGACATGGCCGTGCATGTGTTCCATTGAACGGTGT
TCACCGATTCTCACGATTTTATCCTTCTCTTCATTTTGAAGGTCCAGCTG
GTAATGGTTTCTTCGGAGGACTCGGTGGTGGATACGGAGGACTCGGTGGT
GGATATGGTGGACTCGGTGGTGGATACGGTGGATTGGGTGGTGGATATGG
TGCAGGATCTGGTGGGTTTGGCCTTGGTGGCGCTGTCGGAGGTTGTGGAT
GCAATGCCGGTGGTTGCGGTTGCGGCCCTGGTTTCGCTCTTGGTGGTGGC
TTGAACAATTACGGTGTATATGGACATTCCGGATGGCCAGTACGCAAATT
CGACAACTACCGTGTTTGTCATAAATGCCACGATCTACCAAGCGGTGGAT
CACGATGTCTGTGCAAGAGTGTTCGTCATCATCCATTGTACTTACCTGTT
GTTCATCGACCAGCTCACGTCTACATTGATTGCGATACCAGTGCACACAA
ATTCGGACACAACAGATGTTACGCCAGAGCTGATATTCCTACTCCTGAAG
AAGAAAACACAGAGACTGGTGCAGCCAAACAAGGCGTGTTCTATCCATAT
GCCAACTATGGTCCATGGTCTGCCTACCCATGGTGGGGAGACTGGTGGGG
TGGTCACGGTCATCACGCTTTTGGAGAAGGTCACGGTTCGGGTCACGGTC
AGGGTCAGGGTCACGGTGGTGGATGCGGTGGATGTGATGGTTGCGGTAAT
CACGCAGGCGGTTGCCGAGGTAGATGCTCAGGTTGTGGACACCACGGTAT
GGGACGAAATGTTGGATTTAGCTTCGGTCATGGCGCCCATCTTCAAGCTT
ATNTCATAACACGCATTCGTTCCGTTATTTGACTGATATGACTCACTTGC
CACATGATGATCATTGTGGACATGGCCGTGCATGTGTTCCATTGAACGGT
GTTCACCGATTCTCACGATTTTATCCTTCTCTTCATTTTGAAGGTCCAGC
TGGTAATGGTTTCTTCGGAGGACTCGGTGGTGGATACGGAGGACTCGGTG
GTGGATATGGTGGACTCGGTGGTGGATACGGTGGATTGGGTGGTGGATAT
GGTGCAGGATCTGGTGGGTTTGGCCTTGGTGGCGCTGTCGGAGGTTGTGG
ATGCAATGCCGGTGGTTGCGGTTGCGGCCCTGGTTTCGCTCTTGGTGGTG
GCTTGAACAATTACGGTGTATATGGACATTCCGGATGGCCAGTACGCAAA
TTCGACAACTACCGTGTTTGTCATAAATGCCACGATCTACCAAGCGGTGG
ATCACGATGTCTGTGCAAGAGTGTTCGTCATCATCCATTGTACTTACCTG
TTGTTCATCGACCAGCTCACGTCTACATTGATTGCGATACCAGTGCACAC
AAATTCGGACACAACAGATGTTACGCCAGAGCTGATATTCCTACTCCTGA
AGAAGAAAACACAGAGACTGGTGCAGCCAAACAAGGCGTGTTCTATCCAT
ATGCCAACTATGGTCCATGGTCTGCCTACCCATGGTGGGGAGACTGGTGG
GGTGGTCACGGTCATCACGCTTTTGGAGAAGGTCACGGTTCGGGTCACGG
TCAGGGTCAGGGTCACGGTGGTGGATGCGGTGGATGTGATGGTTGCGGTA
ATCACGCAGGCGGTTGCCGAGGTAGATGCTCAGGTTGTGGACACCACGGT
ATGGGACGAAATGTTGGATTTAGCTTCGGTCATGGCGCTCATCTTCAAGC
TTATCATTGTAAAGATCAAGTTGAGAAAGTGAATGGAGCTGATGACCACG
AAGATGCAACCACCAAGCGATTCTGCGTTCCCATTGGATACAATGGTGGA
TACGGTTTCCCATACTTTCACGGATATCCAGGAGTCGGTACGGGACTATG
GGGATGGGGATGGCCTTGGATCAAGAATAAGGTCCCTGGANGACTCGGTG
GTGGATACGGAGGACTCGGTGGTGGATATGGTGGACTCGGTGGTGGATAC
GGTGGATTGGGTGGTGGATATGGTGCAGGATCTGGTGGGTTTGGCCTTGG
TGGCGCTGTCGGAGGTTGTGGATGCAATGCCGGTGGTTGCGGTTGCGGCC
CTGGTTTCGCTCTTGGTGGTGGCTTGAACAATTACGGTGTATATGGACAT
TCCGGATGGCCAGTACGCAAATTCGACAACTACCGTGTTTGTCATAAATG
CCACGATCTACCAAGCGGTGGATCACGATGTCTGTGCAAGAGTGTTCGCC
ATCATCCATTGTACTTACCTGTTGTTCATCGACCAGCTCACGTCTACATT
GATTGCGATACCAGTGCACACAAATTCGGACACAACAGATGTTACGCCAG
AGCTGATATTCCTACTCCTGAAGAAGAAAACACAGAGACTGGTGCAGCCA
AACAAGGCGTGTTCTATCCATATGCCAACTATGGTCCATGGTCTGCCTAC
CCATGGTGGGGAGACTGGTGGGGTGGTCACGGTCATCATTCTTGGGGAGA
AGGTCACGGTCAGGGTCACGGTGGTGGATGCGGTGGATGTGGTGGTTGTG
GCCATCACGCAGGCGGTTGCCGAGGTAGATGCTCAGGTTGTGGACACCAC
GGTATGGGACGAAATGTTGGATTTAGCTTCGGTCGTGGCGCTCATCTTCA
AGCTTACCATTGTAAAGATCAAGTTGAGAAAGTGAATGGAGCTGATGACC
ACGAAGATGCAACCACCAAGCGATTCTGCGTTCCCATTGGATACAATGGT
GGATACGGTTTCCCATACTTTCACGGATATCCAGGAGTCGGTACGGGACT
CTGGGGATGGGGATGGCCTTGGATCAAGAATAAGGTCCCTGGATCCAAAc
tcaaagaaaagaaagtgACATCCAAAGATAGCTCAGCATCCAAATCTACC
AAGGATACTGCTTCTAAAGATACAAAGAAGAGTGCTATCCCAAGACGACA
AACCAAAAAACAAACCATCCATGTTGGTTACGGATACGCAAGTGGCGACA
ATTATCGCCTCGGATACGGAATGGGCGGCATGGGTGGCGTGGCTGGATTC
ACATCACCCCACGGTGCACCTTTAACACAGTTCGCACGCTCACGAATTCC
AGCTGCTGAATCAACGAAAGATGTCACCGGTACCAAACGAAACATGGCTT
TTTCTCAAGAACCATCATCTACAGGATCAATGTTAGGACATCCAGTCACA
CACCCAGGGTTTACAACCATGGGATTCCCAGGGCACGCTGATTCATCTAT
CGAAGCACAAAAATCAAGGATCCCaaagaaattgtaaatttatcGCAATC
ACCAACCTAATGTAAGTTTACCTCAGATTTATAATTTGGCTTTATACAGG
GAACTAATTACGTTACGTTTATGAGAGAAACCTCCTTAGGCTAAAATCAA
ATGTGATATTTGTAGATATTTTTTTCTTCGCTTTTGTTATTAAATTTGGA
CTGAAGTTTTGATTTTGttattgaaaactttttgctttCAATTGATTTTT
CATTGACCAATCAAACAAAAGAATCAATCATTATAATTGGTATTGTGATT
TATTTTCCTATATTTTATCTTTACAGGTCTAACCTATATTTGTATTACAT
CCATCCATCCACTCACCATACAAGATGATGTTATCCTGTTATTAATTGGT
GTTATAACGTCCCAATAGTACCATAGTTCGTCTTTATAATTGTGTTATTC
TGTAATACGTAGCTCTTGTAATAACCCCATATTTGTTAATGTAGTTTTAT
GTATGTTTTATTATGTGTGTTAGATCATTTGTAAGATCACTCATTATAtt
attaggcgagaccaatttaatttgttgttctacgggcccgaccgacccta
ttttcactaaaatcaaaaaaataataatattgaattcccactacaatata
ttttacacactagttatttgtaagaatcaaatttgaatataacGATCTGC
ccttagaacaacaaattaaattggtctcgccttatttAACAAAATAGTCG
TGTTATATGATTTTAACCATTTGTACAATAGATTTTATTCTAATAGAAAA
attaatcaaagtcaatttcacaTTTTATATTATCTCCAAGAGTGCAGGTC
AAATTTTATCTCACCCGcaaccaaaaaattttttcccaaaattgctATCC
CgaaaaatctcgttttttctttgtcaatttGATTTAGGTTCACATTTATG
TTGTCTCCAAGAGTGCAGGTCAAATTTTATCTCAGCCGCAACCAaaactt
ttttcccaaaattgctATCCCgaaaaatctcgttttttctTCCCTATGAG
AAGTCAAAGTTACCTCACAAGATTTTAGCATTTCCTAGAATGCTTCGTTT
AAGTCAAATAGCAT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_030066	XLOC_030066	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_123	supercontig	scaffold_123:57466..66929 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0	0	0	0.0401493	0	0	0.0370749	0.0476272	0.0236625	0.0246571	0.0204041	0.0220106	0	0.0274267	0	0	0	0	0.0369693	0	0	0.130272	0	0	0	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00047162 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00047162 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00047162 (transcript) - C. hemisphaerica