TCONS_00049105 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00049105
Unique NameTCONS_00049105
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length4791

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00049105 ID=TCONS_00049105|Name=TCONS_00049105|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4791bp
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TAAATAGACTTACTTTTACACGAGGATCTAGTATTGTATAG
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_152:41868..46821+

Legend: exon
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>TCONS_00049105 ID=TCONS_00049105|Name=TCONS_00049105|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4954bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_152:41868..46821+ (Clytia hemisphaerica)
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tccctcgtctaattctgacactcttctttagagaaaggaataatatgaaa
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GTGACTCTGGGTCTGTCTACCTTTGGTCAAAACATATTTGGAATTTTGCT
TACACCCTACGTGACCTTTGCTCTAACATCTATTTCTAGTCTCTTAGCTT
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aaatttaaacGTGTCCTACAATGCTATAAAGATCCATTGCCAAGTTTTTC
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ATAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_031209XLOC_031209Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00049105-exon-scaffold_152-1491911889:41868..46005TCONS_00049105-exon-scaffold_152-1491911889:41868..46005Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00049105-exon-scaffold_152-1510915933:41868..46005TCONS_00049105-exon-scaffold_152-1510915933:41868..46005Clytia hemisphaericaexon
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TCONS_00049105-exon-scaffold_152-1491911889:46169..46821TCONS_00049105-exon-scaffold_152-1491911889:46169..46821Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00049105-exon-scaffold_152-1510915933:46169..46821TCONS_00049105-exon-scaffold_152-1510915933:46169..46821Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00049105-exon-scaffold_152-1575043694:46169..46821TCONS_00049105-exon-scaffold_152-1575043694:46169..46821Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_152supercontigscaffold_152:41868..46821 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00049105 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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