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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00051237 ID=TCONS_00051237|Name=TCONS_00051237|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1360bp
ATCATAGAAGTTCGGAAAGATTTGATGATTTGGAATCGGTTGTCTAAGAC
ATACTATTGAACAACACTCCCCTACAACAAAATACAACGTTGGAGAATTT
GGTAAGCAGAAAGATTACACAAGCATGCTAGACAGacaaaataagaaaga
aaatttggttgGCATAACAACACATTGTGGAAAAGAAACATTTATACATT
TGATCAAACTAAAGAAAATGGATATCATCAAGAAATTCAAAATCCGACAC
AAAAGGAGATCAACACCAGCTACAATGTATGATTTAATAGATCATTGTCA
TGAATACGAATCAGGGATGCGATTTCACGATCAAGGTGGTGAAAATGATT
ATCAAGATGGATTCTGGAAAGTGTTCATGTTAAACGAGAAACCTGGTAAA
GCAACACGTTGTTGTGAGCGTTCATCTTCCTTTAACACGCATGGATACCA
AGATTCCAAGATGGCGGACGTTGCTACGGCGGAACCATGTTCAGCTTCGT
GTTATTGTATGAAACATTCAAAAACAGCAAGAAGGAGACGTTTTAAGAGC
CAATCAGGATACTATTTGGCAATAATGCCCAATGGACAGATAATGGGGAT
CAAAGATAAAAACAGCCCTTACATTGATATAGACGTGATACCAGTAGGTG
CAGATTTGGTCAAAGTATGGGGTGTGGAATCAGAGCTATTTCTTATGATT
GACGATCAAGGACAAATGAGAGGCACTgatgTTGATAGCGCGGAATGTAT
CTTCGAAGAAACGTTAAcagaaaactttttcaatgtcTACTACTCAGCTA
TGTATTTGAATAAAAGATGGTGCATAGGATTACGTAATAAACAACAAACC
AGGAGTTTTTATCGGAAACCGAAACCTGCAAAAGACACTTCTTTTATGAT
TGAGATTGTACAGCGAAGAGCTTCAACCTCATCCGCATGCGATAGTGATG
ATAGTCGCGTCAGCTCTATTTGATGAGCGCGGAAAAGTGAGAATTGAGAG
CAGGGGATTTCATTGAAACCTTCTTGATGGAGAGAAGTGTTTATGGGTTT
AAAATGAAAGGAATGGAGCTTTGATTTGGTGCGATTTGTTTGGAATCGTT
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tttttgatccatTGCCGCGCCGTTTGGCAAAAAACTATTTTAAACATTTG
TCACTTTGGGGACACAAACACAAGATTAATATTACAAATAAAGATTTAAA
GaaatgaacatttttaaaatctcATTTTATTTGGAATTGTGGTAATCAGT
AACAGgattttatgttattttttgcATTGTTAACGTCAGGATACGAGACC
GAATTTCCAC Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00051237-protein >TCONS_00051237-protein ID=TCONS_00051237-protein|Name=TCONS_00051237-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=282bp
MLDRQNKKENLVGITTHCGKETFIHLIKLKKMDIIKKFKIRHKRRSTPAT
MYDLIDHCHEYESGMRFHDQGGENDYQDGFWKVFMLNEKPGKATRCCERS
SSFNTHGYQDSKMADVATAEPCSASCYCMKHSKTARRRRFKSQSGYYLAI
MPNGQIMGIKDKNSPYIDIDVIPVGADLVKVWGVESELFLMIDDQGQMRG
TDVDSAECIFEETLTENFFNVYYSAMYLNKRWCIGLRNKQQTRSFYRKPK
PAKDTSFMIEIVQRRASTSSACDSDDSRVSSI Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_20:118552..163761- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00051237 ID=TCONS_00051237|Name=TCONS_00051237|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=45210bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_20:118552..163761- (Clytia hemisphaerica)
ATCATAGAAGTTCGGAAAGATTTGATGATTTGGAGTAGTTTTGAAATCCA
GTATTGAAGGCTAGGAAGGCCCTAAGGAGGCTATTCGCTCTTATTGATGA
CAATTTCCATTAGAGACCAATAAACTTTAGGTTAATACGTTTCTGGTAAA
ACCAAGGAAGAACGTCATAGTTCAGGATCCTGACATCGTTCCATGAAATG
CTATATTCTGTTGAAAACAAGAACTTCTTTTAAAACTATGATTTTAATTT
TGTGGTTGTAAAAATTCTAGTGGTTTTGTAACCGTCGTTTTTTCGTAATA
TCTCTTTATCAACTTTCTTATTTGTAGATCGGTTGTCTAAGACATACTAT
TGAACAACACTCCCCTACAACAAAATACAACGTTGGAGAATTTGGTAAGC
AGAAAGATTACACAAGCATGCTAGACAGGTAAGATGTGATTTCATTTTTT
GTGACCTTCCTTCAAACTAGTCTGTCTTATGGCTATCTTTAGTCTGTATG
TGTCCTAGCCTGCACAAGACGAGCACCGCTTTTATTTACGCATTCAACGT
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GTTGTAGCTTAGGCTTGCTTTGTTGCTGATCGTAATTTTAACAATACCGC
TTTTCTAAACAGTACCGCCCCGCTATTTTTCAGTATACTGCCATCATGGC
TGTAAACTTCGCGCGTATACATTACCGTGCCTATTATCCCTCTAACGGAC
GATATAGCACCGTGTACGATTTCATTCATTTACCTATGTCTAGTATGTGC
AATGTAAAAAGTGGTCTAGCTGGGAACCCCTACTTTGTTTTTCATCAGGT
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TAGCGACTCATTAAGAATTAAACCTGATTAAACGCTTTTCTTAACGAGCA
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TGGCGCGTGTGACTTCATATTTCCGTTTTTCTGGTTTCCGTTCTTTTTTT
GTGTCTGACCGAAACTTTTTTTTGTGTGTTATTTCTGTATGCAATTCATC
AATCCGTCGAGTTTTTTAATGGTGATGGATTATTCTTGATGTCTCTAATA
GAACGTGGTTTTGTCTGTATATGATAAAAATACTGGATTTTTGGTTAGTA
TAAGTAATGTACATTCCATTTTAAGTTATATCTTATCTGTTTTTTTACGG
CTCAAATAGATATATTGAGAATTTATCGTATACCTAATTGTAAACCTTAA
TATTCAGTGTTTTCCTTATGTTGTGATATTGAGTCTTCTTTGACTGTCCC
TCGTACGCGCTTTTTTTTATAAGAATGGTGTAAATCCATTTCTGTATTTC
ATCATGGATATCCTTAACTTTTTTGGGAAAATCATCCTTAAATATTCTTA
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TAAAATAGACCTTAGATTTTGTTTTGTTTCCACTTGCCTTATGTATTACA
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ACCAATAGAAATTCTCAATGATAAAAAACCGCGTAAACCACATCTTTAAA
AAATATTGTTTCATTCGACATATTAAACATCCAACAACAACCTCCTTTTT
TGAATTTAGACATGGCTTTGAAAGGCTCTCTTATAAGAGCGATGTTCAAA
TTCCAAACTATCTTATAATCATCTTATTTTACAGTGCTTGGAAGGTCGGT
TTGTTTCACACGCTAACGTATAAATATTTTAGCTCAAATAGGATTCCCGG
TTTTTCCTAACACTTGAGTAAAACTGGCGGTCAAAATGAAAAGGTTGATA
TTCAATATTTCTAGCTGGTTTCTTTACAGAGTTCATATTTTGTAACATCG
TTTTATTTTCAGATTAATCTTTACCGCAACAAAATTCTTTTATATACATG
TTACATTGTTAAATCTTGTTATCAAGTCGGTTAACCCCAAAAATCTTAGC
ACGTGTGAAAAAATGGCTTGTTTTGTCAGGAAAACCCAGTGATTCGTCTC
TTAGAATATTTACGATCATTTAGCCTACTAATATCCTAATACGCATGCGT
AGTATTCAAATCCTGTAATAAAACAACTTCATTACAACGAAATTCAATTC
AATAGATCGAATCTGCGTGACTTCACCATCACCCATTTTATTGAGGAATA
GCAGAAAAGATATGTACAGGATTTAGTTACAACTTGCTTGGCACAAGATT
GTAAATATTTTCCGTACGCACCTTTGCATAGGTTTTAGTTTGTTTTTCAG
TTAGGCACAGACAGCTTGCTTGAGTTTTGGTTGAAAACAGTCCCTCGCTG
GATTTTTCCGAATCCTTATCTATTTAGTCCTTCTGTGTTTGTAAATCTTT
TTTTTTTTGGAATCGTCACTTTAACATTGAGTACCGGAACAATAAAATCT
TCCCCTAGAAAGGATTCTTGATGAAATCTCGATATGATTAGTGTATCATA
TATTAGTATATGATGGAACATTTTGATTGATTAATTGACATAACAGTGAG
AGAGACTTTTAACTCCCTTTCCAACGATCTTAAACCATTATTTCTTTGAC
CAATAGAGCTTGGAAGAAAAATATCTAGTACTCTTGTATCATTCTTCGCA
ATATACACCTTTTCGACCGTAGCCGCCAGTTCCCGCGCGGGCATTTTTAT
CCCATTAAAACCGCCCCAGTCCGTTTTTCGCACCTATAGACAGTAGAAAA
ATGTGTCAAAAAAGGNCCCCAGTCCTTTTTTCGCACCTATAGACAGTAGA
AAAATGTGTCAAAAAAGGACTGGGACGGTTTTAGTGGGATAAAGCGGACA
AAAAATGCCCGCGCGACAATTGGTGGCTACGGTCGAAAAGGTGTATTGTT
GGTAGGATAACGCCGTCTGATAGCACTTGCTCAAAAATCATATCATTTCA
TTTTCGATCAATCAAAATTAAAGTCAATCAATAAAAGATTAAACAAAAAA
ATCATGCTAAATCTTGCCAGAGGATGAAAGATTGTTTTTATTTTCGCGAA
CAAACAGGCGGACGGATGCCATCAAGTTTTTCTTGTCTCTATTTTCGTTG
AAACACTGTTTTTCTTTATACCAATGAAACAACAGGAAAAATTTAAATCT
TTCACTGATTGAGTTTTGTACGAGACACAAGTAGAATACAATTTTTTTAA
CTTCATAAGGAAGTGAATGCTAATGTGAATTAGTAGTATGGTATGATGTT
GGTGAATAATAATTGATGTTGTTTGGCAAGTAATGATAGCCGTTTATTTT
GGAATCGATGATGTTGATTTATCCAGGGCTATAGAAGAGAAGGCCTGAGT
TTTAGAAGGTATGGCGAAGAGGTGTAGACGGTAATTTATGATGCTTTCTA
TGATCACCGTATCACCGCGAATGGATATTACATATCATGCTGTGAAGACA
AATACCAATTTAATTTCATTTTTACAGTTTGTCATAGTTTCTTCCCCCCT
ACATTTAGGGGGGTCTTGGGTTTTGATGAACCAAAAGCAAGGGGGGGGGT
GTTAAAAGTATGACTTTCCTAAGGCCAGTTAAGGGGGGGGTCTTCTTAGA
TAAGGGGGATCTTCCTTTAATTATGCCTCTTGTACAATCGTTTATACTGA
TTTTCTAAAGGGGGGTGTGAAATTTTAAATGAATTTCCCAAGGGGGGGTT
AGCACTTAAGGGGGGGGGGGTCCTCTTACCTAAGGGGGGTCTTGACCCCT
CTAGAAACTATCTTTGTCTGCACAGCTTAATTTCAGAGAAGCTGTGGTGT
TCACGGTAACTGCAATGACTTTCTTTCTTTTTTCTACCCTGAATGCTGTA
GAAAAACAGCATTGGTGTATATCCTGAATACTCACTAACAAGGTTTTTTG
GGAGGTATGATTCAAGGTATATTGACTTCAATTCACTCATTGTTCCTTGG
CTGCTGGCTACGAAAATGATCATGAGAGACCTTTTATTGGAAGGATTTCT
TACAAAGATTTCAAAGGAACATGAAAAAAATTGACACAATTGTTCGGCAT
ACATAAACAAGCCCTAAGAAAACAAAATAGTTTTAATCATATAATAGCTT
AATTAATTGACAAGGTATTTAAACATACAGTATCTTTTCTTTAATATCAT
TAAAAAGTATGTAGTCTTCTTAAAAGCCAATTCATTTGTCTAGCGAAGGT
ATCAATATATACTTTTAAAGTATATTGATTGTAATCTCTTTAGCAAGTTG
AAAACATGCAGTTATAGTATTATTATGTGGTACAGTGAATCATGCTTTAT
AATGCTTTATGTTTGATGTTGGAAATTTTGTTGCAAGCCTTCTTGTTTAT
GTTTATTTCTATGTTTTGTTTGTTTCGTTGTTTCATTGAGTTTAAAGCCC
GTAAGGCTAGAGAGGAATCTTCAACCCTCTTCAATCAAGAAAAAGTGAAG
CCGCTTTTGGATTTTTGGATTAAATCTAGCACTTTCTTTGTTTTCACGAG
ACATGGTGATGGCTAAATGTGGTGATGGATTTTACTTTCAATCTGATGTT
TGTGTAAAAACCATTCGGGTTACGCCTTTTAAATGGGAAATATGTTGCTT
CATTTACCATCCAATAGTTTCAACTCTAACCCCTTCAGGGCTTTGAACTC
AATGCCTGGAAGAGCCTCATAGTCGATGCCAGGGGTCTGATAGATTTTGT
TTGTTATGATGTTGTGAAAGTGTAATAGTTTTCGATACCGGCAGATTACA
ATTAGTAAGTGCTTTCCGTAAAGTTTAAACATTTATTTGACAGTATCTTC
CATTTTTTCTCATAGTCGAATGCGTTTTTTTTATGATTAAGTACGTTTAC
TTTAAGGTAGATTCGCCTCGTCGATTGGCGAATTTTCAAATTCAAATTTT
GACAAACATGTTAATAATCAAGGCAAATAGTCTGATAACGGATCATCGTC
AGACTTTTGAACAAATACAGAATTATATAACCTGCAAGCTAAATTTTATT
AATTTAAATTTTGAGAAAAAAAAGAAAAAGTGCGTCATCAAAGCTAAGTA
GATTTACAGTACAGTTATAAGGATGTACACACGTTTATTTTTTATAAGAC
CAAACTACATAAGAACGTAAGGCTTCGATGACCAACATTTTAAGAACAAG
TCAATAACATTTTAAGATTTTGTGGACTCTAAAACACCTATTTTCTTAGA
AAAATAGACAAAAACACTCACAAAATGGTGAAAATAAGAACATGTTAAGA
ACATTCTTAGGCTTGAAACCCAAAAAGTTAAGAACATCCAAAAGCTTCAA
AAAATTTGGATGCTCTTTTTAAAAAAACGTTTACACAGTTTATTGGAAAT
ATTATTTGAAACGTCTCAAAAAATTAATTTTTTTTTCTTGCTAATCATAT
TACCACACTGTAAAAAAGAGGAAATTGATTTGATTGGTTAAATGTTATCA
ACGGTTGATATTTGATTTCAAATAATCGGTTTAAATGAATCAGTACTTCT
TGGATTTATACGTTTGAAGTTGTGTGTATCAATTTGATAATCGGGTTGAT
GCCGAATTGCCGATTTCTTTCTGGCAAACTTGCAGTTAGTTTCAAAGAAG
GTTCTAGGTAAATGCAGGGTACGGGTATGTGCCACCCTTTAAGGGTGCCT
TTTTTTCGACCCACTAAGGGATTTTTGACCCAAAGTTTTTCAGATTTTTG
AAAATCGGGCGGCACTTACGTGATCGGGCTACCCCTTAAGTTGATTGAAC
TAAACTTTCTTAGACATAAAACTTACTTTTGAATACGTTTCTGGGTAAAT
TGAGGGTACGGGTATGTTCCACCCTTAAGGTTTCCCTTTTTTTCGACCTT
CAAAATCCCACTAATTGGATTTCGGCTTTTTTCCTCGATTTTTGACCCAA
TTTTTTCCCGATATCCACAAATCGGGTGACTTTCATCTATCAACCCAATA
ATCCCCTGAGTTGGGTGACTTAGACATAAAACTTACTTTCTCTTTAGTCA
GCACAGCAGGACACCTTTAACCACCTGAACAGATTTCAGTAAGATGCGTC
ATCAAAGGTCGCTTTCTGTCTTCTAACAATGTCACATGATAAATAAGGAT
ATCGGATTGTCTTCGAAAAAGATTTATTCTTTTGAAACTGCCAGTAATTC
ATATTGATATTTTAGATTAGTATGATGTTTATAATGCTTGTTGATATAGC
TGTTTCCTCTTATCTTAAACGAGTTCACTCTTGTTTTTTAGCCAAGCATT
TCATAACGTTCGTGATTTTGTAATTCTAAAACTTTTCCATCGTATTGACA
AAGCATGATTTGAACTTTTAACTTTGAATCTTTGGTGCTGGCTTTTGTGT
GGTAAATTTTCATTTTTAATTAAATTTCTGGAAGATATGGCGTTTGCAGC
CTGTCTTTTAAACCATGCCTTCAATACACTTTTTCGACCGTAGCCGCCAA
TTGCCGCGCGGGCATTTTTTGTCCGTTTTACCACCATAAACTCGATCCAA
TCCTTTTTTTACACCTTTTTCTATTGTCTATAGGTGCGAAAAAAAGACTT
GAACGGTTTTAGGGTGGTAAAACGCACAAAAAAACGCCCGCACGGCAATT
GGCGGCTACGGTTCAAAAGGTGTATTGTTATTCTTCATCATTCGTCTGCA
ATACTTTTGATTTTTTGTCATTCTGAATATCTTTCCAACGAGCACAAAAC
GGTCTTCTATAATTCGAATTGTATCACAAGCCACATGCATTTTTTGGTGC
CGGTACAATGAGTTATATTGAGACAGACTCTACTCGCAATCTCTATAGTA
TGAACAGTTCTCCGTTTCCAGTGAGCACTTGAGTTACAAAAAGTGGGAGA
ACTACAAGATAGATTTTACTAACTCGGGAACTGGAAGTTTGAGGAGAGGA
ATCTTTCAGTAAATGCCCCCTAAATTCAGGTATGACATTTATGGGCACTT
GTTGTTAACGAAACGATTTATTTCGAAATCAATTATCTCTGTAACCATGA
ACAATTTGCCCGGCACAAATTCATTAATTACTGTATGTTTCTATGTTGTG
GCTTTTTGTCAATTTTCTCTTAAAGCAGAACTCACTCAAAAAATCGTTTG
TTTCGGTTGCGGTGTTTGTGTTAATACATGATTCAGTATTCTTGTAAACT
GGATAAGTCATTTATAATACGTGTAATACAATAATATGGGCGTTATATGA
TAATTGCTATGGGATAATATCAGTGTGTATACCTGTCGTGTATACCACAA
TTTAGCCTTAGTGTTATTTTTTGCTTATTTTCTACTATGTCTGAATTTCT
AATCGTCTAGCATGTAGACTAGGATTCTTTGCTTCTCGTAGATTAAAAAG
CGCAATATCTAAGGATATAAGCTGGGTTATATGCTATAGTAGTCTCTCTT
TCTCTTTCTCACGAAAAGAAATGCTGGAAATCTGGAATGTTCCAAGAGGT
CAATATTATTATAAGAAGGAAGCAGTATCAATAGATGAGTTGAATTCGCT
GACGATTCTTGTTACAGCATTTCAGCCATGAGGAAATCCTTATCATTGGT
TATCAACCTCCATTGGTTAAAATCTTACAGCCGAGCGCCTGCACTAAAAT
GTTACAGTCATGCGCCTACACTAAAATGTTACAGCCATGCGAATACACTA
AAATGTTACAGCCATGCGCCTGCACTAAAATGTTACAGCCGTGCGCCTAC
ACTAAAATGTTACAGCCATGCGCCTGCACTAAAATGTTACAGTCGTGCGC
CTACACTAAAATGTTACAGCCATGCGAATACACTAAAATGTTACAGCCAT
GCGAATACACTAAAAAGCTTGATAATAGCGATTCAAGACATCGTAAAAAC
GTTTATACCCAATTGATGCTGTTCGTTACTTTTGCAACGTTTTTCTTTTG
GGACAGAATACTGGGAGCCAGTATTAAAAATATTTTTGTCCTGGCAAAGG
AGAAACTAGCAACAGAATCTCTCAAAATTTGTCGTCGCGTGCGGTAGGGT
GTAAAAGTTTTTCTTTCTTTTGTTTAAGAATTCTGTGTACGAAAGGACTT
GGTGTAAATAAATGGTAAGAATGGTACGTTAAATGATGCCTTTTAAGAGT
GATTGATCCACAAGAAACTTCAGAAAGAGGATCGACCCAACTTCCTGTAA
TTCTTATCTCCAAACACTAGATTGACGAAAATTGCCAGTATTGTGGTCAC
CTTGAATATCATACATTGCGCAAGATATTTATTGTCATACCCAGGAAACC
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GCATTGCTTAAAGTAGTCGGTACTACTATAGCCCGGGGCCGCTTATCGTT
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TGAGTTTATTTTCGATGATCAAGGTTTTTTAGGTCGAGTCAATATTTTTG
TCACAAAATAGTGATATCATCGTATCATCATCATGTTTTCATTCAAAATT
TTCAAAAAGAATTAAAAACAAGCCAAGATTTTTTTATAGACTGTGTTTGT
TTTTTACGTCAATTATGTGAATTAGCCTAAAAACTCTAAGATAAAATAAC
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ACGTGGTTTATGATGTTATATTATAAGTGGGCATCATTTTATGCTTGGTA
ATATTGCCTAAAGCTTGAATTTGAACGTGAAGGGAGAAGGTAGCTTGAGG
ATGATTTTTAGTCTTGAATCTTAATCGAGTTTCTGGTCCATCTTGGAACT
GCTGGGACAGTCATTTCGAATGGCAAGATAGATACTAATTATTGCAGAAA
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AGATTAAATTTGTGAAGTATTGTTCAGACTTAATTACAAGATAATTTGAT
TTCAATTTGTAACGAAAACCAGTGTTTAATCAAGTGGTGATTAACTTCAA
ATTGGAAGAGTACAAGTGATGTGTGGAGCGATCTATGTGCGAAGCTTGGC
TAATGGTCACTCATCATCCAGTTCGTAAAAGTGTGTTTATACTTGCAATA
TAGTCTTGACATTACTAATGGTAATGGAGGGGTATGAATGGAAAATTTAG
ATGCTTTCCTAGCTGTCCTACGTCCTAAATTCTTAAAGCCTTCTGATGTT
CTTAAATTTTTGAGTTTTAAGCCGTTGGCCGTTTGAGTTTTTTGTGTAAT
TTTTGAAGGAATTAGGTATTTTAGAGTCTTCAAGGCTTAAATATTCTCAA
TCTGTTCTTAATATTCTGGATATTGTAGCCTTGTGTTGTTATATAGTTTG
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GAAAAAGGTGACACATGCAGTTAAAAAGTTTGGCAGTACTAGCAATAGCA
GCAAAGATATATGAAGGACTCCCAAAAGGTCATATTTGGCGGCAGTTTGT
ATGCTTTTTAATCACATTGTGCTCCTGTTCACAAATGACAGTTCTCAAGT
TTTCAAGAAAACACAACAAAGACTTCATATGCAAACATTGTTTATGTTGC
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GCTTTGAGGCTTTGATATCTAAAGGATATTACATTTCTATAACATTGTTG
TTTTTTGATGAGCAGGGTTTAACATGTCTAAGTGAAATGTCCCCCTCTCA
ATAGTGAGGTTGTTCTCTCTTATACATGAAAGGTTTTAATGGAATTAATT
AAACTGGGTTTCTTAAATGGATTTGAAGTTAAAGAGTAACCTTCTGAGCA
ATAACGTTTAAGCTGATATAACTTTATGTAAAAACGTCTTACATGGCTGG
TTTTAATTAACATATTCAGATTAGAATTTTAAGTGATGCTGCTAAAACCC
AGCCCGTTAATTTCAAAAGCGCCCTGGTAGGTTCTGCATCATTTTCGTGA
CTGTACATACAACTTTGGGAACGCCAATGTAAGGCTTTGACCATCGCTGG
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GTCCAATCATCGATAAGGCATTTTCGTTTTCGGGCGGAATATAGATGCAT
GAGTGATGTATAGTACATGAGCTAGTGAGAAATTTATGTACGTGGTTAGA
TAAATTGGCATAGCTAAATGTTATAATATCTATAGTGATAGAAGTGGAAT
TGTTTATAGTACCAAAGCCCAGAAGGAATCTAAGAGTTTGTTTCTAGTTG
GAGTAGAATCTCAGGGTATTTTTCTTACCGGAACATTTTTCGGTGGCTGA
TTGGTCAAATAAGTAGAAGGTTCCACCGGAGCTGTGACACGGTGAAGGAT
TATTAGACAAACGAAGAAAGTAACATAAGATACGAAATTGATAACAGGGC
AAAGGAACAGTCAACTTCAATGACATCTTTCAAATAGGTCTCAAAGGATC
TTGCAACCAGTGTAATGTTTACGATATTTTTGACACTCAAATGTCTTGAA
TGTGACATTTGAATCAATATTATAACATTTTATATTAAACTATTTCCAAA
AAATATGATATTCATAATTTGTCCCAGCAGCTGATACGAATATTTTGATT
TTAATATTGAGAAGTAATGAAAGGATTTCAGGTTGGTTTGCGATTACGAT
TTGACTTTGCCAGCTGCATACTTAACTTGAGACTTTTCATCCAGCGTACC
AGATCAATGTGTTGCTCGTATTGCAGCTAAAAATCTATGTCTACGCTGGC
GGACCAAAGTGGTGAACTTTGGGTTCTATGAAATGAATTCGACAATAGCA
CTAAAAAGAAAAAATCCTAGAAATTTTTAACAGAAAGATCTTCTGCCCTG
GCATTCTTGTTTATCCACTAAGGAAACAAAATTCCATCTTTTAAATGTCA
AAGCTATTAGCGTTCCAAGTTTTGTGTGTATTTTGTAGAACATGTAAAGG
CCTTATTAATCCTTCCGAGATTAAGGTAAAATTTTAACTTTGATCAAAAG
GCCTTGATTGTTTGTTTTATCGAGCAAAAAGACGGAATCGAGGCTTCTCA
TGTTTATGTTGATAAAAAACACTAAGATTCAAACAAAATGACGTCATCGT
AACTTTTTTTCTTTTAACGGTCTCAAATTCTTTATTAGAGGGTCAAATTT
TCCTTTAAAGTTGATTTACATGTCTGATGATTGAATTTCAGAAAAGGTTT
GATTTACTTCTCAGGATTTATTCTACGCATCTATATCTTCTTGTGTTTTG
AGTTTGGAGTGTTTTGTGGAGTTAATTATTAAGCGCCTGCTTTCAAAAAC
AATATACTCGATCGGGGCTCTTCATTAATAATACCTTTTCTTTACTTTTT
CAGCATAAGATTTTGCAATGTATCTAAAATCTTTTTTGTCATTTGGTCCA
TCTTTAAACAAATGTCTTCTTTTAAGCTATACTACTCTTGGGCGTTGCAT
TTGACAGGTAGACCAACTAAATAAAAGGAAAGTCTAAATTTTTATTCGCG
CAGATTTTTGGTATGAGCCTGTTAAGTTTGCCCTCAAAATAGAAGATTTC
TTGAAGAAGTTGGGGAATTCATTTCCTCAATCTCCGCTTTGTAAACTCTC
CACGGAAGTTTTCTCCACGCAAGGTGAAGCTTCGATGAAGTGTTAAGCAA
AGAAAATAAAGAAAACATCAACATGCTAGTGTAGATTTTCTTGATGCGAC
CGTAAAAGTTTTGTTTTTTATATATCCGAATTGTTTCAGTCCGAAATGCA
CACTTTTTAGGTCAAAGACCAAAATAATTGCCGAAACAGATATTTTTAGA
TTTTTCTATAAGAAAAGGTAAAGTTTGTACCGGGTACGGGCACTGAGCAA
GTTACGTTTGTAAAAGGGTCTCTTATTCAAAGTGTCAGAAATTAAAAATA
GTTAGGCTCTCTTAGTCTTCATTTAAGAACTTTGGGCAAGAGCTTCAGAG
ACTTCTTCAAAACACCCCTGTCTCAGTGCCCCGGTGGAACCTGTTCCCAC
AGTGGGGATGAAAATTTCTATCGAAATCCCAATGGGGATAGAAAATCTAT
TGTTTCCAGCTCAAAAATTCCAGTGGGGATGGTTTTTGGAGTCCAATTTT
TTCCATTCAATTTTCAATGGGGATAAGATCATAGGGCAATTTCCCAGTGG
GGTTGAAAATGTAGGGTATTTTTTCCACCGGGGACAATTTTTTGGCCTAT
TTTTCCACCGGGGTGGGGGGTCCACCGGGTCTGTGACACAGGGGTGTTTC
AAATAGCAAATTAGGTTGGTGTCCAGAGCAATGCATTAGTTGGCTTAATG
CCAGAATATAAATCACCATCATTTAGAAACATTTGATTGATAGCTATTTG
TCATCAGCTTGTTCATTCGTGTATGCTTCAATGACGTATTCTTAAATTAA
AATCGTCGCTGCATTTTGATTTTGCCACTGATTTCAATTTAGTCACTCTA
CTTGCTTTTTTAATAAGAGCCATTAAATCTTGGCTCAGGCTGGGTTGTTC
TTATTTTTTTAATTTCCAGGTTTAAATGTTCTTACGATGTTCTTAATACG
CTTAGTTCCTTTACTTAAAAACTTAAAATGGGTTTTGGTTCTGTTTTGGT
TATCTTGGATGCATACGTCACTGTGTGGAAAAAATGTGTATATTGATTTT
CTGGCACTTTTTTAGGAAAAAGGGCCTATTTTTTGGTATCTTTCTAAGAA
AATGATCAATAATAATTTTCGCGTGCCACGAATTTCAACAAGAAAATTCC
CTCTTGAAAAGCCACTTGTTGAGTGGTATAGTGGTATATTTGTTAGAGAA
AGTTGAAGTACACGCTTCATGTTGGTGTTCTGTCAATATTTTTGTTTACA
GTTGCATAAAATAAGGAAATGATACTTGAGTAGTAAAACAACATTGCTAG
AACAATCGAAGAGTTCTTGAGGGGGAGATTGTAGTTAACGGTAGGGAAAT
AACATTAGACTGGTGTATTGTTTCTTGTCCGTAAATGATTACAAATCAGG
AGTTTTAGATTTCTTACTCTTCTATCGTGGCGTGGTTTTACTTACACGAC
TTTTGCCACAAGAAAAAATCTTAAACCTAGTTTAGTTTTGTAAAATTATT
ATTTATTTTGCAGTCGTAAGCACTTTTTATAGCGGACTTATTATGTAAAG
TGATCATATTNTAAGTAAAATTGTAAAATTATTATTTATTTTGCAGTCGT
AAGCACTTTTTATAGCGGACTTATTATGTAAAGTGGTTTAATCTGTCAAA
ATTGACTGACGCATTTTTCATTGAACTAATGATAAGATTTCTTTTTCATT
TTCTCTTGTTTTCGAAAATGTTGTATTGCTATGCTTTTAATTACACTTTC
GATAATGATGTTCAAAGTATATTTAGTTTAGATAGAAAGCAGTGATATCT
TTTGGCGAAGAAGGAAGATCGTAGTTGTCACAAATGGCATTGTCGTATGG
GTTTTTTGTCTCGAATATATTAGTATCTAGTTTTCTTCAAGTTTTCCGCT
TCTGAGTAGAGTATCGTTAAGTACTTTCGGGTACCTAATAGCCGGGGGGG
GGTAGAAATCTCAAAACTTAAGTGGGGGACGGCTATTCGGTACCCGAGAG
TATGTAATTTTGGGAATTTAATGGATAATCTGGGGTTGATAATAAAAAAA
TTTCACATTACCAAAAAAATGGACAAAGTATTTTTGCTGGTTTATAATAC
TTTGATGAAAATATTGCACAGATCCTGCCTTAGTTCGCCAGGTTATTTTT
TTATGTAACAAGACACTGCAATACACTCTTCTCGAGATGCATAAATTTAT
TGTTGTCCTCGTTTTCAAACAGATTTCATTGCTATAAAATTACATATTCA
CAATGATAATTGTGTTGTTTACACCTCATGTCTCATGAGACATTTTGAAT
CTCAAGTATATACTTTTGTTTTAGAGTTAATGTTTGCCTTTTGGGAATTT
AAATTGGTTTAAATGTATAACTTCATAGCAATGAAATCTGTTTGAAAACG
AGGACAACAATAAATTTATGCATCTCGAGAAGAGTGTATTGACACTTGAA
GAGGACGAACAGAGAGAGGGAGAGAAAGAGAGAAAGGAAAGAAGTGTTTA
TTTAGCTTACGTTATACAAAAAGAGGACTTGGCATAAGTATGTTCTGTGT
GTTTCTGTTTTAAGTAAATCGTCTCGCGCGGATTCAATGTAGTGGTTTTT
CTAGAAGAGTTGATAACCGTTGACTTTTAACTTAATGGTTTTGATTTATG
AAACGAAACGTTCGACCGTTTTTTTAAAGGGGATTTTTCTGTTTTTCTGG
AAAATAGCTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTG
ATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGAT
TGATTGATTGATTGTAAATCCTGTGCTGTACTACGAATTCTGAATTCAAA
TTGACTTCAGAAGACTAGGCCTACAACCAGGAGCACAAGAAACAAAAAAC
TCTACATCGAGTTTTGTGGTTAGATAAACGATGAAACAGTTGCCTTCACC
AGTGAACTGCTCAAAGGTTTTTAAAGAGCCGGGGGGCCTAGATGTGAATG
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TACGTTTCACTTAAAATCAAACTTGGTTGAAAGCCAAACGTAAATCGTGT
GATCCAAGCCACAAAAGACTTCTAATATGAATATTACTGGGTCGATAAAC
TCAAACTTAAGTTTAAGTTGTATTTACTAGAAAGCTTAGGATGGTATGGT
TAACTGTGGTATTGTCCGGTAAAAAATTTATACATAGCGGCCAGCAAAGT
GATTTGGTGAATGGATGATTTCTTAATAAAATTGGTCGATCGGAATGTTT
TCAAAGAATTTTACAGATTGTTAATCTCCAATGTTTATGTTTAACTCATT
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TATATTTTCCTTTATATACGTTTTTTTTTTTAATTGGAAATTCAAATTTT
TGAAGCCTTCGGATGTTCTTAACATGTTCTTATTTTGACCAATTTGCGAA
CTATTTTTGACCATTTTCCTAAGAAATAGGGTGTTTTTGAGTCCACTAAG
CCTTAAAATGTTCTTAACTTGATCTTAACATTTCGGCCATTGAAGCCTTG
TGTTCTTATAGTTTGTTCTTATGAGAAAAAAAACGTGTAGCCGAACATTC
TGAAGTTTTTGATTTCCCTTCTACGACGTTAAATCAAAAGTTGATAATTT
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GGAAAATAAAAAGATAGAAATCAAAATATTTGAATTGTAAACCGTTTTGA
TGATCCGGAGGCATCATTCAGGTTTTTGATTTCTGGTCGGGGAAGGAAGA
TCATTTTATTTTGTATGTTTTGACAAAATGTTCATCAAAATACAGACCGA
TAGCTGCAATTTTATCTAGTTCCTTAACCATTGAGTATTTGACTGTATGG
TTCTTAGGAAAACATGAGAAATGGTAAATCTTTAACTGGGGAAACTTTAG
TATTCGCTTTTAATATTATTATGATAATTCGGATGACTTCAAAAAACTTT
TATATTGTCCTTAAACTCTATGATGCATTTTAAAATGTCTTTTTTTTTTT
TCAAATTTACATTTTCTGTGCAATTAATGAAATCTTTGCCACCTGATGAT
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GGTTGTGTTATATCATTGAGAGACATCGTCAGCATTTGCTTGTATAGAAG
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GAAAACCTTTATGGCTGTGTATGCTTAAAATTTCTGTCTTCAATGTTTTA
TGAAATTGAATATTATGGTACCTATTTTTCATTTGACTTTTCAAAAGTAT
TTTTGGATGAATTTGAATTTTTTGATGAGGTTTTGGTCTAGAACACGACT
TTTCAAAACAAAGCAGCAACTAGGCTTTTCTAAATGTTTTATTGTTGATG
TGTTTTATATTGTTGATTGGCTTTGGATTTGGGAAATTCCTTTCCTTTTT
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TTGAGTTTGAATCTTTTTTTGCCAATCCTAGGACTTTAAACTTTTTGTAC
AAAGTATTAAACTATATAAAAGAAGATTTCTGGTTTTCATAGATGAGCTA
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GATCAAAATTTAGTTCCTTACATTGCTAATCTGTTCCTTAGTAGATGAAA
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ATAGTCTAAAGATGGTCTTTCTCTAAAGGATTAGATTGTTAGTTTCAGCT
TTTGGCTTAGTTCGTTTTGAATCTTTCTGCCAACGTTGATGGGCTCTCGT
TTATGTCGTGAGTATCCTGTAGCGGATAGAATTGGTTTGATTCAATATTC
TTCTTTTTCTTGATACAGGCTATTTTATGTTCTTTGGATCCTTAATTATT
GGAAGATTGCCAATAAAACTCTATTTTGGATTTTTTTTTGTTTTAAACGA
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TGTGAGGTGTGAGAGAGTTTGATGGAAAATGACTGTGTCCAAAAATACTG
ATATGTTTGACCTCAGTATGTTATGTTAGTGAGTGAAGGTGAAAAAACCT
CTAGTTTTTGAAAATTAAATCTTTACCATATATAAGTCAGTCTTGAGCAG
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GAATTGACCGGATTTTAAATGATATATTTTTGTTCGGGGTTTTATTGTCG
TGATTTTCTGATTCGCGCACATTCACTAGAAATCATTCTACAAAAACACC
GTTGATTTGAATATATGTGCCTTATTCATAGATGATATCGTAGTAGCATT
TTATTTAGCCTTTTAAAAATTTCTAAAAATGAATAATGATATCATTTCAT
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GTCAAAATCATAACTTTTCTTAATGAGTAGATATTTGTCTCTTTTTGCGC
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GATAGAGGCGGTTGCCAGAAAACATATTAAAAAATTTATCTGGAAACGTG
GTCAAAAATAGAAAATGAAAGCAGCGGTTACGAATTTATTTTCCAATCCT
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TTGTCATGAATACGAATCAGGGATGCGATTTCACGATCAAGGTGGTGAAA
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GGTAAAGCAACACGTTGTTGTGAGCGTTCATCTTCCTTTAACACGCATGG
ATACCAAGATTCCAAGATGGCGGACGTTGCTACGGCGGAACCATGTTCAG
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AAGAGCCAATCAGGATACTATTTGGCAATAATGCCCAATGGACAGATAAT
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TAAAAGAATTTTATTTGACATAAATTCTTTCCAAAATAAAAACGATGATT
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TATTCATTGAACATAATAGGCTGCAAGACCTCACCAAAACACTCGGGACT
TTACATGAACAGACCGTGCTGATTTTGACTTTTTAAAATGTAATTTCCAT
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TGCGATTACCATTTTAAATGAGCGACACCAAAAAGTTAAAATCAGTATGA
GATTGCCATGTAAACCAGCCCTTAGATGGGGCCCCCTTAGATATGCGTTA
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TGAGATTTTCAATTTTTCATTTTTCAGGATGTTGATAGCGCGGAATGTAT
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CATCCGCATGCGATAGTGATGATAGTCGCGTCAGCTCTATTTGATTGATA
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AAGATGGCGGACGTTGCTACGGCGGAACCATGTTCAGCTTCGTGTTATTG
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TTGATAGCGCGGAATGTATCTTCGAAGAAACGTTAACAGAAAACTTTTTC
AATGTCTACTACTCAGCTATGTATTTGAATAAAAGATGGTGCATAGGATT
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AAGACACTTCTTTTATGATTGAGATTGTACAGCGAAGAGCTTCAACCTCA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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|---|
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_20 | supercontig | scaffold_20:118552..163761 - |
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0008083 | growth factor activity |
GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
| Category |
Term Accession |
Term Name |
| molecular_function |
GO:0008083 |
growth factor activity |
Blast
BLAST of TCONS_00051237 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: FGF12 (Fibroblast growth factor 12 OS=Homo sapiens GN=FGF12 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 86.2705 bits (212), Expect = 5.896e-19 Identity = 46/151 (30.46%), Postives = 81/151 (53.64%), Query Frame = 2
Query: 503 YCMKHSKTARRR----------RFKSQSGYYLAIMPNGQIMGIKDKNSPYIDIDVIPVGADLVKVWGVESELFLMIDDQGQMRGTDVDSAECIFEETLTENFFNVYYSAMYLN----KRWCIGLRNKQQTRSFYRKPKPAKDTSFMIEIVQ 913
+C + RRR R SQ GY+L + P+G I G KD+NS Y ++IPVG +V + GV++ L++ ++ +G + +DV + EC F+E++ EN++ +Y S +Y + W +GL + Q R K + F+ + ++
Sbjct: 54 FCSGRKRPVRRRPEPQLKGIVTRLFSQQGYFLQMHPDGTIDGTKDENSDYTLFNLIPVGLRVVAIQGVKASLYVAMNGEGYLYSSDVFTPECKFKESVFENYYVIYSSTLYRQQESGRAWFLGLNKEGQIMKGNRVKKTKPSSHFVPKPIE 204
The following BLAST results are available for this feature:
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