TCONS_00051285 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00051285
Unique NameTCONS_00051285
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length5734

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00051285 ID=TCONS_00051285|Name=TCONS_00051285|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5734bp
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TTATTATCTCTTTGATGGAATCCATCAGAATGCA
Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00051285-protein

>TCONS_00051285-protein ID=TCONS_00051285-protein|Name=TCONS_00051285-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=365bp
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CQKKKCCKRSAKKHN
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_200:86990..102154+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00051285 ID=TCONS_00051285|Name=TCONS_00051285|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15165bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_200:86990..102154+ (Clytia hemisphaerica)
CTTTGTGTTATTTGGTTTGAATATTGTAAGTGTATTTGGCGAAAAAGCAT ATCCAATGAATGTAGAATACACTGGacagtttaaagtttataaaacttgc tttttgtttgaaattgtcTGATTGCAACCAAGAATATGAAAAAGTTTCAG CCAGAATTACCAGAAAACTatctaaatttattttgtgtttGGCAAATATT TTATGGAGGTGAAATTTAAAATGGTCTTGTTCTATTCTCCTACTTCCCAA GAGCaatgaaattttgatattcttggTTTTGCAAGCATCATCGTTAACCC TCTATTACTTGTTAAGATCCTAGTATCTTATTTTAATGTCTTCTTCGTTT ATCTCTAGATGAACGGTCGTGTGTTGTTAACGTTGGCCCTTTGCGGTCTT ATCCTTTTCGTCCAATTGGACGCAAAAGCCATCAAGCACAAGAAACACAA GAAAACACACATCAAACACAAAAAAGCGGGTAAGTTTCATTGCCATCTAT CTCAAATAGCACTTTTAAAATCTGATATCACTAGTCTGAGTGGATTGCTT TTTGTCAATGCTCTAAATACCCTTTTTCGCTTATTAGGGCTCAGTTTTCT AATTTATGTATTTTCTATTAACAGCCCTCCCACAAGACCCACCAGCACCT GAAGGAGATGCCCCAGCCCCAGATGATGCCGCCGCCCCACCAGCCGGAGA TGCTCCACCAGCAGGAGGCGCCCCACCAGCAGCCGGTGCTGATGATGAAG ATGATGCTGCTGCTCCACCCGCAGCTGCCCCAAAACCAGGTGCAGGAGGT GCTCCACAACAACCAGGACAACAACCAGGACAACCTCCAATCAACCCAAA TGATTTGGACGGTAACGGTGTTGCTGACAATCTTGAGCAACCACAACAAC CTCTCCCAGGACAACCACCAGCACCTGGTGCACCTCCACCagctgaagaa 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Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_200:86990..102154+

>TCONS_00051285 ID=TCONS_00051285|Name=TCONS_00051285|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=4392bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_200:86990..102154+ (Clytia hemisphaerica)
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
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Position
The following features are aligned
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Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00051285 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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