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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00051414 ID=TCONS_00051414|Name=TCONS_00051414|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3228bp AAGAGAAGTTACTGCACTAAATGTATtgcaAAGCAACAAAGTTATTCAAT AGCACTGACGGATTGAAAATAACTGCCAAGGAAAAAGGATTTTAAAggat tttgaaaactcaaagaCTTGCCCTTGGATAGAGGTATTGTTGAGAATTGT TGGGAGGTCTCTAACCACGTGACAtcgtgatgacgtcacaagaaGATGTG TCGCATGCGCACAAACGTAGATCGTCATGGTTGAGATATGGACAACGATT TAGTATTACTGAAGTTTTTCAAAGGAGATTGAGTCGACATCACAGGGATT CTGTCGATTCTATCGACGAGGAACATATAccgaaaaaaatgaattccaAC CGTGAAAGTCTTGATCTGGAGGAGTTTCAGTTTGATGATCCATCAAATCA GTCACAGACAGatggacAGAAGAATATCACAATGAAAGACAAAGATGAGa tGCTTCAAGAACTGAAGAAAGAGAATTTCGACCTCAAACTTCGTCTGTAT ATGACGCAGAAGAACAGCGAGAATGCTGAAGGGAAGGTGGGAGAATACGA ACAGCAATTGGCTGCACTCTTAAACAGTCTTGAAGAACAACAACGACTCT CCGATCAACAAACTAGAGACTTAGAAGAATCGAGACAGCGCGAACGACAG TTGTTGAACGATCAAAAGAAAATGGAGGTCACTATGAAAGAGCAGGATGA ACAAATACACAACCTCTCTCTCAACCTTTCACAAGTTTCCAAAAGTATGC ATAATATCTCATTAAGTAACAAACCAACACATCAATCAACGCCCGTTAGA ACTGCAACGTCAGCATATTTCCATTCCGCCCACCACCATGGCAATGACGG CGATGGAGGTGCAGCGAGCGGGAGTGAATCGGGCGATCACGACACGTCCG CCACAATACGCCATATAAACCACATGAATATTTCACACGTAGCGCCCATG CAGCGCGAACCTCAAGTCGCTTCATCGGTTCCACAAGGCGACCGCTCGCA TCTCCTCGACAACGACCAAGGCTCGAATACGAGTTACACGGAAGGCAATA AATATTTAACAAAGAACTACCATTATCATAACGATAACGATAATCGGACT ATTAACCTCCCGGAAGGACCCCCGGATATCGTCGGTGTAGTCCGACCAAA TAATACAAGGACAGTAGTTGACGTGGAAATACCACCGGAACCGATACAAG AAAAACCGATaccgaaaaagaagaaaaagggtATTATGAAGGTGTTTAAA CTTTGTACAGGGAAGTCCGGACAAGCTAAAGAGTACGCTAAGGATGATAT GTATGTTAAACGAGAACCGGTCAAAGTGACTATGAATACATATTCTAATG AAACATGTAGTTAAGTAAGGAATATTTGTTCGTGGTTATTGATCAAAGAT GCTTGAATCTTCAATTCGAAAGAATGTCGAGCTCTCCTTCTAAAGATGGA TTTGGAGAGGGCGTTAGTTGGAGTATTTTGATTATTCTGATATAGATTTT GACCTTTTGAAAGGGTATCATTAACAGACAACTCGTATCTTCGAATGATT TTCTCATATGTTTAATCCATTGAGTTTACTGACGTGACTCACTCTATTGG AGCTTCATGTGTTTAGTTTCTTAAAGCAATGATCTCTTcttcttattttc aaataaagcagacATCGCGCGGACAAAAAGTTACAGTTCTTTGTGATAAT AATATCAGTTGTGATAATAATATGGTACATGGcgacaaaaaggaaaattt tttataatgGTTGAAATTTATGATTTGACGGTGATAGAAGTCTGGTAACG AGGCTTCTTTTCCCGTTCGCTGATTGGTTGGttgttcattattttttatt gttttatttttaagaactTTTGTGTTGGTTGATTGTAATTACCTTAACGG CCCTATTTCACGCTGGTCGTTATTATGCCAAAGCTCAATTTTTCTATGAT TAGGCCGGCCTTTATTTAATTCTAATCCTGTACACCGGCCCTTGTTACGA CAACGATGAAAAAATAACGTTAATAAGGTCTGGCATAAAAAAGTCAGATA AGTTATTAGTTGTAGTCTGTTCATTATCATTCGGATAATAGTTAACAACT TTTAAGAAGTAGCAAAACcaccattgaaaaaaaaatatgatagCGGACTA TATATATGATTATAAATTAAGCCCCATTTACATACAAACATTGTATAATA ATGTAACCGATAGGGCCAAAGGTGGCCGGTAGGTGTTGACCGTACTACTG GCACTCGGCCCCATTTTAAGAATTAGCAACCTTTAAAGATTACTCTTGGG CGGAAGAGTCTATACTGAATCTCTTTGAAATGAAATAGTGTCACGAATTT TAAACTGATGCTTAGACCAAGTCCACGCCCAAAACGTAACCCATTATTTT AATTGTTAACAATCATGTCGATGTTTTAGAgagataatttattttttaga atatttttttttcgttattttatGATGAATTTTATGGCATACCTTTGCAA GCAAACttggaaacatttttttttatttttcaaaactttgataaAATCTT ATAATGTAGCCCTTATATATTCTTTTActgatgatgtaatgttttatttt gttttaaatttcaatcCTCTATTTTAATAcaaacctttattatttttata tcaTATTCCACAGCTGCCGCTTCTCCCACAACCAGTAATCTTGTAGTAAA TTAGTAAGTTACCAGTAAATTACCTAATTTTTAGcgaaaactaattttgg cgaaaactatttttttgagagctttagaaaaaaattatgagttcTCCTAC CTAGAAAATCATACTTAATTTCGGCGAGGCGatattttttgctaattttg acGAAATTTGGTGAATTTTACCAAATTTGCAAAGATAAGTTCCCGCTAAA ATCAGTTCCATTAAAGGTATTCaaaagattattttgaaattccttTATAT CTTTAAGAATTCTTGAATGATGctctgaaaaattttcttattcttCAGGA AATCCCAAAACACACTTAGTATAACTGAGTTCCCCAAAAATGAATTCTCT GAAGCAAATGTATAACTTACCCTAGTTTTTAATTTGCTAGCTCGGATAat tttctttagttttattGAATAAAGGTGTATATATCTCAATAGCGGTGCCT TGTATCATAGACTTTTATATTCGTTTTAAAACAACAAATAACAAATCAAT TTGAATTGTATACAATATAATTACCGTC Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00051414-protein >TCONS_00051414-protein ID=TCONS_00051414-protein|Name=TCONS_00051414-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=394bp
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TTGTTAAATTTGATTATATGTTGTAGGTAATCGTAGCTTTTCCTCTGGCT
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TCTTATCAAGATTAAAAGTCTTTCTCTTTTTATGTAACTGGGCGTTCTAG
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CTGCGCGCAATATAATCAATAATAGAAAGAAAGAGTGAAAACAAAATGGC
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GAGTGTAACTCAACCAAAGATAATTTAGTATCAAATTCTCATATTAAAAA
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TAGTGTGCTGACATCATCTTAATTTCTTTTTTGCTTTCGACACAATTTTT
AATGCGATAGTATGTATGCTAACCAAAATATTTCTTTTTGATAAAAAAAA
CTTTATAAATGTTATATAACATATCAAAATTTCTTTATTGTGACCTCGTA
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CTCAGGCTCACACTGCGTTATACTACATAATATCTCTTCATCTTCTCTAC
TATACTATTCCAGAAGAATCGTAGTAGCCTCTACTCAGATACAAAGGAAA
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CGTAATTCATTTGGAAATATCTTGGACCACATTGAAACAGACATGATTTA
TAAAGTGACGGTCATTTTTTTTTCGTAAAGCTTCGAGACAAAAAAAGATC
CTCGTAAATCTGAATAATTCAAAATAGATAGACAATACGACAGAGGGGTC
ATGCAGTTACTATGTGAACACTTTGACACTTAGTACGTGGTGGTGTAACA
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TCGAAGAAAAATTGAGTTGTTTTTGGAAAAATATCTGAAATTTTTCCATG
AAAATAAATTTTTTGTCATATTTATGAAAATAGAAATCGTGGAATGCTTT
GATAGTGACTTAAACCAAGTATATAAACTTATTCCAACAATTCTTTTAAA
TACAAAAATCAAAAAAAGATTTTGACCAGTGGGTATGCCTCATATCTAAA
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GAGAAATCTTCCAAAATGGCAGTTACTCATCATAGTGTCACGAAGTAACT
GCATGACCTCCCCCCTGAATACGAGTGCACCAACTCCAATTTAGTAGCGA
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CCAACAGCTTATAGGTTGCAAGTGACGTATCGACTGATTTTACGTCACTT
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TCTTGGTTGTTTTTAGGGCGTGATTATGTCATATGCCTGTTAGGGCTTAT
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TTTTATTTTTAAGAACTTTTGTGTTGGTTGATTGTAATTACCTTAACGGC
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GGAAGAGTCTATACTGAATCTCTTTGAAATGAAATAGTGTCACGAATTTT
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ATTGTTAACAATCATGTCGATGTTTTAGAGAGATAATTTATTTTTTAGAA
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TGAATTGTATACAATATAATTACCGTC Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_201:390596..419922- >TCONS_00051414 ID=TCONS_00051414|Name=TCONS_00051414|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=7110bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_201:390596..419922- (Clytia hemisphaerica) GTGCAGCGAGCGGGAGTGAATCGGGCGATCACGACACGTCCGCCACAATA CGCCATATAAACCACATGAATATTTCACACGTAGCGCCCATGCAGCGCGA ACCTCAAGTCGCTTCATCGGTTCCACAAGGCGACCGCTCGCATCTCCTCG ACAACGACCAAGGCTCGAATACGAGTTACACGGAAGGCAATAAATATTTA ACAAAGAACTACCATTATCATAACGATAACGATAATCGGACTATTAACCT CCCGGAAGGACCCCCGGATATCGTCGGTGTAGTCCGACCAAATAATACAA GGACAGTAGTTGACGTGGAAATACCACCGGAACCGATACAAGAAAAACCG ATACCGAAAAAGAAGAAAAAGGGTATTATGAAGGTGTTTAAACTTTGTAC AGGGAAGTCCGGACAAGCTAAAGAGTACGCTAAGGATGATATGTATGTTA AACGAGAACCGGTCAAAGTGACTATGAATACATATTCTAATGAAACATGT AGTTAAAATGCTGAAGGGAAGGTGGGAGAATACGAACAGCAATTGGCTGC ACTCTTAAACAGTCTTGAAGAACAACAACGACTCTCCGATCAACAAACTA GAGACTTAGAAGAATCGAGACAGCGCGAACGACAGTTGTTGAACGATCAA 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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_201 | supercontig | scaffold_201:390596..419922 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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