TCONS_00051414 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00051414
Unique NameTCONS_00051414
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length3228

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00051414 ID=TCONS_00051414|Name=TCONS_00051414|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3228bp
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Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00051414-protein

>TCONS_00051414-protein ID=TCONS_00051414-protein|Name=TCONS_00051414-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=394bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_201:390596..419922-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
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>TCONS_00051414 ID=TCONS_00051414|Name=TCONS_00051414|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=29327bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_201:390596..419922- (Clytia hemisphaerica)
AAGAGAAGTTACTGCACTAAATGTATTGGTGTGATTTTTGAATTTCACCT TTGTTAAATTTGATTATATGTTGTAGGTAATCGTAGCTTTTCCTCTGGCT GCTCTTATTCTGGTGAGGAGTTCTTAAACATAGACCGGTATTCATGATTC ATTGACAGTAGAGAATAGAATAAAATTTAAATAAATTGTTTTAAACACAA TTTTTACTGGAACTCTTACATAAGCCACATTATTTGATCAGCAAATCCCT TGATGATGATGATTTCGCATCGCAGCGTTTTATTATTTGGAGTGTGGTCC AAAAGTTTTTACCACTTATCATAAAAACTTTTGAATTAATTTCCGGATTA TCTAAATTCTCCAAGAGTGAGATCCAAAACTGCAGTTTCCTTACTTCATT TGGTTTGTAGAGCACTCCTTCTTAGATGTCCCATGGTATCCCTTTGATGA ATAGAGTAACATCGATATGTTAAAAAACGTTAAATGATGATTCGGCCTAA AAACATTACTTATAGGAACCCCAAGTATTAATCTTGTATCTCTAAAATCT TTGTCATAAACAAAGATGACCCTTTTCGCTTTTGACCAATGGAAACGATT ACCCTTCAGTACTGGCTAATAATATTTGTCTTTTCTCGAGCTTTCAATAA ATTTCTTTAAGTTTAACTTGCACTTTACTGTATAAAGAAGTTCTTATAAA GCAAACAAAAATTTATTGTACATTCTAACACACATTTTTTATATTTTTTA GCAAAGCAACAAAGTTATTCAATAGCACTGACGGATTGAAAATAACTGCC AAGGAAAAAGGATTTTAAAGGATTTTGAAAACTCAAAGACTTGCCCTTGG ATAGAGGTATTGTTGAGAATTGTTGGGAGGTCTCTAACCACGTGACATCG TGATGACGTCACAAGAAGATGTGTCGCATGCGCACAAACGTAGATCGTCA 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GAAATTTGGATTTGAGGGAATCTCTTGCTCTCGGATACCTAAAAGCTGGC TGGGGGTTGGAATAAGCGGGGAGTTTGAATAAGCGGGGAGTTGGAAAAAA TCTCAAAACTTAATAAGCGGGGGGTTGGAATAAAAATGTCCTGGGTGGAA AATTTTTGAAAGATTAATTAGCGGGGGGCGGCTATTAGGTACCCAAAAGT AATTTCTACTGTTATCTCCTAATCAGAAGTTTGAGGCTTTTGAGGCAAAA TTAAAAACAGGACGGTTTAGAACCCGGAGTTCCTAGGTCCAGACATGCCG ATGCATGATTGAAAAATCGAGCGATCATCAGCAAACCTTTTGGATAATAT TTATATGTAGACCACAGGAAAACCTGCCCAATTAAATCGAAAACAACAAA ATCGGTTAAAATTTAAATGTACAAAATTATTTATGACTTGATTGTAGGAA GATTGACCAATTACATTTCTTGATAGATTAACCATCTGTATGTAAAGCCC GCTCGTCTGATCACTCAACACTTTTCAGAAAATACATCAGCATTTTTTGA CAGATTTTGAATCATTTTTTCATTCCTAAAAACATCGAAACCAGTTTAAA ATAATTTTAGGAAAGAGAAAGCAGAATTTTTCAACTCACAAGATCCCTTG AAATGTTGTACATTGAAAATTAAAAACTTTGATATCTTTCCTGGACAAGA AACGAAACCTTAAATTCTTACTTATGACGAAAAAATATTTTATTTTTAGA TACACGCTTTTTTTTTATAAGAATGGTGTAAATTCATTTCATCATGGATA TTTTTAACGTTTTTGGGAAAACATTACAGCATTCTTAGGTTAGGATCCTA ATTCAGACTAGATTAAACATACATACGTATCAAGCATAAAATGGCATTTT TGTGAAAGGAGTGAGCCTTACTTTGGGGGTAATTGACAATTTATAATTGA 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Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_201:390596..419922-

>TCONS_00051414 ID=TCONS_00051414|Name=TCONS_00051414|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=7110bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_201:390596..419922- (Clytia hemisphaerica)
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AAGAAAATGGAGGTCACTATGAAAGAGCAGGATGAACAAATACACAACCT
CTCTCTCAACCTTTCACAAGTTTCCAAAAGTATGCATAATATCTCATTAA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Values :
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00051414 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
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