TCONS_00051421 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00051421
Unique Name	TCONS_00051421
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2397

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_201:475364..523027-

transcript sequence

>TCONS_00051421 ID=TCONS_00051421|Name=TCONS_00051421|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2397bp
aattttattttggaaatttgaacaTTGTAAAACACAAATAAAACACAATC
AGGCAATAATAAGATCCACATTCTAGGTAAAGATGTCATCAAAAGAAAAG
GGAGGTCATGGTAaaggcaattatgaaaaatctcaCCGATACAGCTCTGA
AAGGAAAAATAAACCTGGCAATCAGGACAAACGAAAGCAAAGTTCTAGtg
aagaagaaaaagcacagaagaaaaatcaaaagaaagaagaaccCGTGCCA
AAACAAAGTGAAGAACAGCTAGCCAAAGAACAGGAGGAACTTAAAAGACA
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AAGAACTTTCTTCAGACCATTGTTTCATCTGATAAGACATCATTTGCATA
TGCTGCAGTGATTTTAACCATTGTTCGCCACTGTGGTGAAGACATTGCAG
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CTCCCATTGTTAAATGTCATCAATCCAGACCAACAATCCATTTTCCTGTG
TCTTTTCAAAGAATACTATGAAGCCTTATCTAAACATATTGTTGTTTCAC
ACAAAACGCTTCAAAATAGAGaaagacaaaacaaacagaCTATAGGGTTA
AAAGGTGAGTTGCCAGCTGATCGAAAAGAAGCATTTGAGAAAGCACAAAA
GACTCATGAAAAACTTCTGACATCACTGAATTCACTTTCTGAATTATTGG
ATGAGGAAATGCCAGACCTGCCTGAAGATGAACAAAACGAAAGTGAAGAC
ATGGGAACAGTCAACGTTTTCACACCTTTGAAAGGTGTAGAGTATGATTC
AGAGACTGGTCTATGGGAAGATGAGGACACCAGAACATTCTACGAAAAAC
TTGAAGATCTGAAAGAAAAAGTCCCTCAGATATTGTTCAAGGAGTCAACA
ACTTCCACATCGAGCGCCCTTCAAAAGAAACGAAGTGAAAAGAAGAAACA
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TGGATTTTTACGATGATGTTGATGATAATTTTGAGCAAGAAGTACTCGGC
GATGACAACGAGGAAGAAGACCCTACAGTCGGAGGAATGGCCGCACTTGC
TGAAACATATTTCCAAAAACTTCCAACTTGTGTCAATAGAGATTTTATCG
ATCAGGCAtctgaagaatttcttctcaaatTGAACACCAAAGGGAACCGC
AAAAAACTGGTCCGAAATTTATTCACTGTCAACCGGACACGATTGGACTT
GTTGCCATTCTATTCGCGCTTGGTAGCCACTCTGACTCCATGCTTGCCTG
AAATCGCTCCAGATCTTGTTTATCTACTCAAGGGAAGCTTTCTCTCGCAT
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GTTTATCGGTGAATTGACCAAGTTTAAAGTTTGCCCGAAAGCCGAAACTT
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ATGGCATGTAACCTTCTAGAAACTTGTGGACGCTTTCTATATCGTTCACC
TGAATCACACCCAAGAATGTCCGCCCTCTTGGAACAAATGTTGCGCAAGA
AGTCGGCGCATGCGTTTGACGCACGTCACGTGACGATGATTGAAAATGCG
TTCTATTATTGCAATCCACCCGAACGTCAAAAGATTCAACGGAAGATCAG
GCCACCGATGCACGAATACATCCGCAAACTTCTCTACAAAGACTTATCGA
AAACAACAACAGAAAAAGTTCTTCGCCAGATGAGAAAATTGCCCTGGAAA
GAAGAAAAGATCAAACCGTACGCTGTTAAATGCATGATAAACGTTTG

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_201:475364..523027-

Legend: exon

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>TCONS_00051421 ID=TCONS_00051421|Name=TCONS_00051421|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=47664bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_201:475364..523027- (Clytia hemisphaerica)
AATTTTATTTTGGAAATTTGAACATTGTAAAACACAAATAAAACACAATC
AGGCAATAATAAGGTAATAACTTTAGCGTTAAAATTTTAGTCTTAAAGTC
ACATTTTAAATAATGTTTTTGATGATTTTTGTATCTGATTATATTTCATT
ATTTATCAATATTCCTTAGATCCACATTCTAGGTAAAGATGTCATCAAAA
GAAAAGGGAGGTCATGGTAAAGGCAATTATGAAAAATCTCACCGATACAG
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CTAGGTGATTTAATTCATTATTCATTATTCATTTTATTTCTATGATGAGA
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AAGCAGGGGATAGTCTATAGCAGGATTTTGTCCAACCTATTCAAAATTAT
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AGCACAGAAGAAAAATCAAAAGAAAGAAGAACCCGTGCCAAAACAAAGTG
AAGAACAGCTAGCCAAAGAACAGGTTAGCAATCAGAATGATAAAAACAAT
CAAAACCTTTTTTTATAACAAAAGCTCTTCTTTTGTTAAAAAACAAAAAT
TTCTTCTATGTTTGTGCAGGTTTGTGTTCAGTGATGCGATATTCTACTTT
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TTGAATTATCAAAATTGCTAGAATTTGTAGGGAAAATTTTCCTATGTTGC
TTTTAGGAGGAACTTAAAAGACAAGCAGAGGAAGAAGAAAAAGAAAGAGA
GCGTCAAAAACTCGAAGATGAAAAGGTAATTTATTAAGTCACATTTAGAG
ATACCCTTTATATACACAGTAACAGAAATGCTTGGAACTTATTTGATAAG
TATGACACTGTTTACTGAAATATTTTTGATCTTTTCATTAAAAGAAAGCA
GCGACAGAGGCCAAAAGTTCAGCAGAAGAGAGAGTGAAAAATCGATTGAA
GCTACGACAGGAAAATGCTGATATTGCAAGTATGATTTTATGAAACTTTT
TTATTTGTTTTATTTAATAATGTACAAAATTTAGAAGGTTAATGCATCAC
ATCACTTATATTATCTTATCTATCTTGGTAGCTGGATGTTCNATTAGAAG
GTTACTACATCTACTTATATTATCTTATCTATCTTGGTTAATAGATGTTT
TTTTTTAATTCTAGACAACAGACCAAATGAAGGCTTCTTTAAAAAATTGG
ATTCATCAATGAAAAAGAACACCACATTTGTAAAGAAATTGGTATGTGCT
CTAGTTTTAAATTTTGTTTATAGAAGTTTGTGAAAGAGTGCATTTAGTGT
AATGTGAAAAGTTTGTGAAAATTGCTTCATCAAAATTCAAAATGGACCAG
GCAATCTGATTCCAAAATTCAGGTGGATTCCTGTGTTCCTGTTTCTTTTC
ACTTGAATGTTTCTTTAATTTCTAACTCATAGAGAACCATGACAGAACAG
CAGCGGGATTCTTTAATTAATGAATTCAATGGTTTGAATCTCAGCAAGTT
CATCCAAGAAGCCGTAACTAATCTAGTTGATGCTAAAATGAAGGTTTGCA
AACAATAATCATTAGGGATTTTAAAAAGTCAAGCAATGAAGAAGACTTAA
AAAATGTCTGCGATTGTTCTAAGTGATGTTTAGCACCAACTTTGGGTTCT
CTTTAATTAATTATCAAAAGGAATTTCTTTTTGTTTTAACTCAACTGTCT
GCAAAAACCATACAAATATATGTTTTGAATTAAAATTTAAAGTGTTAAAA
AGATCCTTAATCAGGCTTTTCAATTTTTCTATCAGTGGATGGAAATTCCT
CTGGTTTAGATGTTTCTTTAGGAATCTGATTTTCTTGCTCACTAATAATC
AATTATAATTGCCTGTATTTACCTATATTCATTAATCTTTAGGTTTCTGA
TGTCAGTGCTGTTGCTGCAATGTGTTCATTGTTTCATCAACGCTATGCAG
AATTTACTCCATTATTTAAAAAGAATTTCAGCAAGAATTTTGATGGAATC
GACTGTAAAGATGAAGATAAAGTAGGGTGTTTTTCCCTGAGTGTTTTTTT
TTTAAGATTACACGACCCAATGATAATTTATTATGATCTGTTTTAGGATT
GCCAAAATATAGAAATTTGCTATGCCTTTTAATCAATCAAGTCCCTCCAC
CATGCAGAATGAAAATAACTGATCATCAAAAGTCTTTAATTTCTTTCTCC
TGAAGTTTTCTCAAAGTGAATATTGATGTTTATCCTGCATTTTTTTTGTC
TTTTCCAGTCAGGCAATGTATCAAAGTTGCGAACATCATTAAGATTACTT
GGAGAGTTGGTTTTGGATGGTGTATATGGCTTAGATAATGGGATCTCACT
TTTAAAGAACTTTCTTCAGACCATTGTTTCATCTGATAAGGTACTTTTAC
ATTTTAGTTTTTCCTTAATCATTAAAACCACTTCCACACCACAACATCAA
ATTTCATTTCAAACTTTCAAACTTCATGAAATTAGAGTTCTCAAAATGAT
GTATTATTCTAAACAAGTCACTAGAATTAAAAGTTATATTGGAGCTTGCT
ATCAAAATGTATCAAATTTGCAAGTGTTTTAGTAGTGCTGTCATTTTATT
TTAGACATCATTTGCATATGCTGCAGTGATTTTAACCATTGTTCGCCACT
GTGGTGAAGACATTGCAGGAATTCTACCAAGAAAACACAGGTCTGTACTA
ATAGTGTGACTGATTTAGGCTGAACTTGAAAATGTTGGTAAGTCACCCCA
CTGACCCTACCTGGAAACCTGCCAATCAAAATAACTTATTTCCATTTTAA
AGAAGGAATCTTTTTTATCTTCAAAAATTAAGAATTAAAATCAAAATCTT
TATTTTGTTTGTCTCCCTGTCTTTCCCTTGCCTTGTCTGTCTTGTTGTCT
TTCCATTCTTGCTTTTCTTCCATTTGTACAAGCTAAAGCAAAAGGATAAA
TATGACTCTCAAAAAGTTGTTTCAAACAAAAACTGTTAAACCCTTCCATG
GATAAAATTTCGTAAATTTTTTATACTTTCTGTATAATTTAGTATAAGTT
TTCTCTTTTTAGACATTGGAAAGAAGAGCTTAGAATTGAACTCCCATTGT
TAAATGTAAGATTTCATCTTCAAGCAATACAAGTGCCAGATCTTTGGAAC
CTGTTGTTATTCAGAATGACTGAATTGGTTGCTTTACACACCACAAGTCT
AAAAAACAAAAGCAAAATTCAAGCTAATATTTTGTTTGCCGATAGTTCAT
GGAATTTCGAAAATTTGGTAATGAGTGAGGTTATTCCTGAATCTCTTTGG
AGAATCAAACAAAAAGTCATATGATTTAAAAATATGGAGTTTCAATTTTT
TGATACAGCCCAGGGAGTTTATGTACATGTATTTTTCATTTTCTAAATTT
CATTTTCATTTTATAAGGTCATCAATCCAGACCAACAATCCATTTTCCTG
TGTCTTTTCAAAGAATACTATGAAGCCTTATCTAAACATATTGTTGTTTC
ACACAAAACGCTTCAAAATAGAGAAAGACAAAACAAACAGACTATAGGGG
TAAGACGATTATAGTATTCAATTTTAAGCTTAAAATGTATTCAAAATAAT
CTAGAAGTGGCCATCATATTCTGTTTATGGGGGCTTCCAAGAAGCTGGTA
TTGTGCGGTATTCCGGTATTTGACAGATAAATGACTGATATTGAGAAGTT
TTTGGCCAGTATTTTATGAAAAATTACTAGAATTACGGTATTTTGTACAT
CTGAAAACCCTCCACCTGTTTAGGATAAGGTAAGATGGTGAGCAAAAATT
TTGACCTTTTTTCTGAAAAATATTTGTATAGAATTTTCCTTTGGCATTTG
GTTATTGTATAAAGAGAGTCCAAATAGCTTGAGGAGACCTTAAGGTGGAT
GTGTTAATGAATAATGGTTTCTGTTTTAGAGGTTACACCACACTTGGGAC
CAAACTTTTTTGCATCATTAATGATATTTTCACACTATTTTTGTTTAGTT
AAAAGGTGAGTTGCCAGCTGATCGAAAAGAAGCATTTGAGAAAGCACAAA
AGACTCATGAAAAACTTCTGACATCACTGAATTCACTTTCTGTAAGTTAT
CAAGCATATCATTTTTAAATAAGTACCATAAGTACTCTCAAATTATTAAT
AATTAGTCAGTTTGCAACTAGTCAATGTAGATCCGAGGCTGCCTTTCCCT
TACCTGGCTATCTGATGAAAGGACAGGAGGGCATCTTGATTCTTCTCTTT
AATTAATGAGCATCAAGCAGAGATGCGCCATGTGCTACCTTATTGGAACT
AATTTTCGCTGGAATTAATTTTAGCGTTTTTTGCGGTTTTTCGAGAGTTA
ATAACCGCAAAAATTAATTCCCACGAAATACAATTTTTTCAAATTTTATC
GAAAAATTAAAAAAATCCCTAGGAGAATGAAAGAAAGTTGTCCAAAAAAG
GGCAAAAGTGCGAAAATTAAAACCGACAAAAATTCCAGAATGAAAAAACC
GCAAAAATTAAAACCTGCGAAATGCAATTTTTCAGATATTTTTTTTCGTC
CGCGAAAATTAGTTCCAATAAGGTTCTTTTAAGGTCCTTTTTTGACCAAG
CTGGCATTCAAAACCACAACCTTACCCACCATAGCCGTATCTTCTACCTT
CATGCTACAGTGGCTGAGCAAATTATCAATTTTTCATTACAAAATGACTG
AATTTCTTGATCCAGTGTTTCTTTTACACTTTTGTTCTTATACTGTTTCG
AAAAAAAAATTCTTTATTTCAGGAATTATTGGATGAGGAAATGCCAGACC
TGCCTGAAGATGGTATAATTTTCTATTTTTGAATGCTTTCTGGTCACCTC
TCATTATCTTTGTTTCAAATTTAGCGGACAATTGTTTGAAAAAATATTAG
CTGATAAAATGTAATCATATTTAAAAAGTGAAACATTATGAACCTAGAGT
TACCTGGAGTTACCCTAATTATTATTTTTTGGAAATTTTGTTCTAAAGAA
GTTCTATGTATTACATTTTAGAACAAAACGAAAGTGAAGACATGGGAACA
GTCAACGTTTTCACACCTTTGAAAGGTGTAGAGGTAATAGATCTTAACTT
TGAGATTCAAATTATTTTAATGTGGTTCTAACTTCGAAGGAGATTAATTC
CTAGTACCTTTTATCCTCCTTGCTTTGTTTGAAATACAATGTTTCATGGC
TGAAAATTGTTCTTATTCATTTTGATCTTTGGTCGCTATTTACATCAATC
TGATAAGAAAGGAGTGCGCATTTTATTAAGACTACAATAACTAAAGCTGG
GTTTCCACTATAAAAAGTTTGTTGCAAATACCTGTTCACAAAAAATGTCT
GGACTGTCTGGATATATTCTTCTTTATGTGACAGAAGCAAAAATAATGGC
GATGTCAGAGTTAAAACGTTTTCATTTTTTACTCGTTAATCATTTTCGCA
AAAAAAAGACGATTTTTGGGAGGAATAAATTCGCAATATTGACATTCAGC
TTTATTGTTGGTCATAGTCATAGCAAATTTTTATGTAACGTTTTTGTTTT
GATAGTATGATTCAAAGACTGTTTGTTTATTTTGATAGTATGATTCAGAG
ACTGGTCTATGGGAAGATGAGGACACCAGAACATTCTACGAAAAACTTGA
AGATCTGAAAGAAAAAGTCCCTCAGGTAACATTTCTTGATGAGAATGCTT
GTCTTTATTTTCATTTCAAATCAAGGGTATATCATACTATACGGTACGAC
AAAGTTGTTTTTTGCAACTATTCAAAATTGTGAGATTGGCCACCTTCCTT
GACAACAATGAGTAGAAGTCAAAACTAAATCAATGAAGTTCTGAGGTGCA
GACTCTGGGAGACTTACTTTACAATCTTTCTTGTCAAACTTTTGTATGGT
TCAAATTTTGGTTCGAATCTCTGCTTCTTCTAATGTTCCATTTAAGTCAT
GGATAGAGTAAACATGGCTTGGCAGCAGGTTTTAGGTGCCCCCTAAGAAT
TCAGATGACCCCTAAGATTTAGGTAACCCCTGGTTACCAAATATTTTAGG
TGACCCTTAAGCCAATGACACGTCAAATTATTTCGAAAATCCTTTTCATT
CAGACAATCAAACAAATACAACAGTTAATTTAGCTTATTGCTAAATAGAA
TGAATGCCCTAAGAAATAGGAGATAAGCTACCTTAAAGGAAGAAATTTTG
GCGGGAATTTAATTTGGTGGATGAGGGACCTTTTTGTCCAAAAAACGTCA
TTAAAAAAGAAAATACTTGTTGTAAAGCCTGAAATAGCACACATTTGGGG
GAATAAATAGAGCAATTTAAATTTGGCGGGAATTTAATTTGGCGGATTTT
GACCAAATCCCTTGCCAGACAGATTTTTTATCTAAGTAAATGCAACAGGA
TTAAAAAAATTTTACAGATGATATATTAGATACCAAATTTTCAGTTTTAG
ACAGAAGAAAATATTCCATAGTGAAGTTTATGATGAAAGAAAAACAAGTT
CAGAAAAAAATCACCAACCATAGAATCTAGCCCCTAGGTCCATCTAACAA
AAATTTAGGTGACCCCTAACATGGTTAGTCCCCCCTAGTCACAGGCTAAA
ATCAGGTACCAATTGCTGCTCGACCTTTAGGCCCCCCTCAGGCCAGGGGG
GGGGGTTCCAGCCATGGATTACCCGGCTTTAAACCCCGTGAAAACACACC
AAAGACTGTCTAAAAGTCCTAGATTACTGGGCAATCTGCGTAGAATATCG
CCTCTGTCTATCACACTAATTGGTTCCCATTAATCTTGCTTCTTTGCAGA
TATTGTTCAAGGAGTCAACAACTTCCACATCGAGCGCCCTTCAAAAGAAA
CGAAGTGAAAAGAAGAAACATGTCGACCGAAAGCTCCGCCATGATAGTAA
GTAGGGAACGAGGAATCTAGCTTAAAAGTCAAACCATGTTATGGGATCGT
TGTTTTGTGCTTCTTGGCATTTTTAACTCTACACAATTTCTGTATGATTG
GTGTCTGAGCACCATGAAAATCAGAGTTTGAAACAGATATTGTGTCAACT
CTTTATTACATAAATTCTGTAGAAATTGTGCTCCACAGCAGGATCTAGCA
ATTTGTGTTTTATATTAACATTCGAACTTGAACCTGGTTTCTTGAATTAG
AACTACCTTAGGGAAAACAATAAACCTTAAATTCATCAAATTACAGCTTT
TTATGCTTGAGGGGGAGGGGGACGGAGAAGTTTTTGGAGCCAGGATGGGA
ATGGAAAATTTTCATTATAGGCAAGGGGGAGACCCTGAAGGACACTATGA
TTGCACTGAATTCGTTGCCTTCACTTTTTTAAGAATGGGGTAGAGCATTT
AACGACTAAAACTGATTTTTGAAATTTTAAAATGTTTATGAACAATGTTT
GCCATATTGATAAAAAATAAAAAACAACAACATTTAAAATCGGCAAAAGC
TTTTCGGTCTTTCTTTAAGAAATAATCTGGAAGCCGCATTAATTGCCCTT
AAGAGACCACGTCCTTAATGACCAACTCGACTCTGCTCGTTTAATTCTTT
TTAGAAATGGTGTAACATAGATTTTAATAGAAAAGAGACATTCACATATC
CCGTGAGAATGCCTCGTTTCATTTTTAATAGCTTTCTTTTATTACTTTTT
AATGTTTTTAGACGAATAAATTTGTAACTTTTTTGATTTTCAATTTTGCT
ATTCTATAGCACTGATGATGGAAAGACCGAAAAGCTTTTGCTAATTTTAA
ATGTTTTTGTTTTTTATTTTTTTAAATGTTGTTTTGCACAAAGTACCTCA
TAGGTTGTGAAGATAATTTGCATTTTTGGCAATATTTAGATTTCTAAACA
ATTCGTTCATTTTCAGTCAATATGGCGGACGATGATGTCATGGATTTTTA
CGATGATGTTGATGATAATTTTGAGCAAGAAGTACTCGGCGATGGTAAGG
AAGCTTCAAAATGAATTCTCATGCCAAAAATTGTTCTATAGTGTCAGAAG
GATTTTCATACAGCGAATTTGCTAGAGTGATAGTATTTTCTGTATCAAAA
TTCAACATAATTTTAAGAATTTGGGCCAATTAATGGCAATTCTTTGTGTT
AGTTTCAAGTTCTGACTGAAACGAAATACTTTTCTTTGACTATTTTCAAG
GAATCATTGTGTTCTTCTAGGTACGATAGATCTCTATATTAATTTGCAAG
TAATTATGGTCTCACTCTCCTTCCATTCTTTCCCAATGCCTCCAAATAAA
AGATTTAAGCCATTTTCATTTAAAGATTTCCCTTCTCTGTACGCGATAGA
AGGTCAGTCTTAAATTGACATCTGTTCCCTCTCTGATTGATATATGTCCC
CTCTCTTCCTAGACAACGAGGAAGAAGACCCTACAGTCGGAGGAATGGCC
GCACTTGCTGAAACATATTTCCAAAAACTTCCAACTTGTGTCAATAGAGA
TTTTATCGATCAGGTTGGACCATGTATTATTCTATAACAACTTTTACAAA
TACTCAAACTAATGATAAATGAACCAATCAACTCAATTTTAGTATGAGAG
AGATAACATTCCTTTTTTTCGTTATTAGGCATCTGAAGAATTTCTTCTCA
AATTGAACACCAAAGGGAACCGCAAAAAACTGGTCCGAAATTTATTCACT
GTCAACCGGACACGGTGAGAAAATTAATAGCATATACAACAAATCAAATT
ATATCAAGCAAGCAATATATTTTGTTTTCAAAAGATGGAACATGTCATAC
CTTCCACTGACGCTGAATCTTGTTCGTACGTGACGGTTCCGTTTCGCTCC
GAAACGAAATGAAGCCATTCTATTGGTTACATTCAAGTTTGACATCAATT
CTAATCAATGGAATAGCTTCATTTCGTTTCGGAGCGAAACGGAACCGTTA
CCGTCACGTGCGAACATAGCCCAACACTAAAACACGTTTTCGATTTTGCA
TTAATAAATACGCATTGCTTATGACCAACCGAAAGCTCTTTTTCTTATCT
TTTCCCACTTCATCTACAACCCATTGTGGTTCAATAAATAACTCCACCTT
CTTTTTACAGATTGGACTTGTTGCCATTCTATTCGCGCTTGGTAGCCACT
CTGACTCCATGCTTGCCTGAAATCGCTCCAGATCTTGTTTATCTACTCAA
GGGAAGCTTTCTCTCGCATGTAAGATAAATCCACATATATTATATTCCTT
ATGATCACTTGATCAAGCTGACTGCTCACAGATTTCCTTTTGACTAGGGA
CCCTTTGTTGTTTTCTATTTTATACTAGATTTTTAAATATCCAAATTTCA
AAACATTCAAATGTCACTGTTGACGACGAAAATTGAAAACAAAATGGCGG
ATTATTCAACTCTTAAACTGGACACCCTTCTTTTTGAACTTTCAATTAAC
CTTCGTCTTCTCATTCGTCCGTTCGTCTGTTACCAGCTTTTCTTGGGATT
GGCCCATTAGTCTTTTCTGTTTTTTTTGCATAATGATGCAACGACAGTAC
CCAGAAAGGGACCCACGCAAAACAAATTGACCCACGAAAGAAAATTTGAC
CCGTGCAAAAAAATTGCTTCCATAATGGCGGGACTTACGTAAACTATTTT
AAACCGAACTGAAAGATCTGTATATCTTTGGCAAATATAGCATTCACATC
ATTAAGTCCTTCAAATTTTTCGGGCCGGTGAAAACTGGTGAGTTTGGTAC
TCAACTCATTTTTTCATCCATTCAGCTACGCAAGAAAGACCAAATTCATA
CAGAAGCAAAGATCAAAACAGTTCGGTTTATCGGTAAGAAATTTCAATCA
TTGAATTTATTTGTTTCTAATTTTTGTTGACTGCTCTTCTGTAACAAGCT
GCACTCATTCCAGTCAATCAATTATTTAATTTTCCAATTTTTTTGTGAAC
TTAAGGCCGGTCTCCACTTTCGCGCGAAATGAGCGAAAACTTTTTAACGT
TTTTGTAAGGTCTTTGGTCGTTTGAAAAATGAAGCAATCCCATTGGTCAA
AATTGACGTAACGGATGAAAAAAGTTGAACTTCCTTGTTCGCGCGAAACT
TTTTTATGACGTAACCTTTTCTTTAGGCAAAAAAGGTTGAGAAAAAACTG
TCGCCCGTTTCACGCGAAAGTGGAGACCGGCCTTTACTCAGCTATAAATA
ATTATATACATTGGAAAATTGATAGGCTGGTCTCCACTTTCGCGCGAAAT
GGGCGACAGTTTTTTTCTTAACCTTTTTTACCTGAAGAAAAGATTACGTC
ATGAAAAAGTTTTGCGCGATCAAAAAAAAGTTGAAGGAAGTTCTACTTTT
TTAGACCGTTACGTCAATTTCGACCAATGGAATTGCTTCATTTTTCACTG
ATGATGGTGCTCTCTTCAGCCTCTGATACTTCTATTGTGTGGAAACATTG
ACATTTTGTTAATAGCTATATGTTTTTTGTTTACATCCAGGTGAATTGAC
CAAGTTTAAAGTTTGCCCGAAAGCCGAAACTTTGCATTGTTTAAAGGTAT
GTTTACTTTGCTCGGAATAATGATTTCAATTGGGTCGGAAAAATGTCAGA
TTAGGATTGCTTTTACTTGAAATTTATGATTTTTGTGTCGGGTCGTACGG
TCCGACCATTTTCACAAGCTCTGATTTAGATTAGAGGATTGCTTTTGCTT
TAAATATATGATGTTTGTGTCGGGTCGCCGACTGTTTTTTTCAGCCCTGG
TCTTTTTTTTTTATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTACACCCTGACACT
ACTATTTCAAAATCATACAGTTTACTGTAAAATGGTTTCAACAACCCCCC
GTTTCGCATATACGTGTGAGGCAAAAGCACGCGAACCCAATAAACATATA
GAGTTGGTAGGTTGGTGTGTTTCAACAACCCCGTGTCATAATCCGTCCAA
TTTCATCTGGAAACTGGTTTTTACGAGCACATTCCCATTGTTTTGATGGA
AAAAGAAAAGGTTTCCACTAAAAATTGTTAAACGATGATCCAGATGAACT
TGGGGAAAAGGAGCTTGTGTGAAAACAATTGCGCGCGAATCCAATAAAAA
AGAAGAGCCTCTTTCAAGGCTGTATCTCCTTTGAGTTTAACAGAAAAAAG
GTGACTACTGAAACTCGTTGGAAAGAAGCATTTAAGTGGTTCTCATTTTT
ATTTCATTTTTTACATTAAACTATGAAAATGATCACCCTCGTTAAAATAA
ATCTGAAAATAAATTGAAATAATAAATATGCAAAATCAAGTTTAGCAACT
AAAATCAAGAAGATCCAAAATTGTTTGTCAAGGTTTTACTGTTTCCTGAT
AGACCTTTAAAAATATATATCTTCTTTAAGATTTGGAAAGTTTGACAGTC
ATAACCTTTATTCTATAATATCCGAAAATATAATCAAGACAATAGATACA
CGTGAATTTAGTTTTCAAAGATATTTCTCGAATGTTGGAAAAACGGGTTC
TCCACAGATAATGTTAAAACTTTGCCTTGAAAGAACTTTCGCTGAAAAAA
AATCAAACCCCGTCAATACATAAATAAGTCATACTTTGATACTTATTAAT
TATCAAGTTTTTAATTATTAACATACATTGATTTTGCTGTATTGAATGTC
TTTTTATCCAGTAATTCAAAATTTGTCACTTTTGATTTTCGTAAATCCAG
TTCAAACTTAATCATTCTTCTGGTCGGTGGGTTTGATGTACACGATATCT
TTCAAGTTTCTCAACACTTTCTCTACCACTCTCATGAAACCTAAGAAATT
GGCCAAAATGGAATAAACCATCATCTTCGTATGCTTGACATGGTCGTCAA
TGGAGCCATCTTTGAAAGTCGGCCATACTGATTTATTAGCTGTCACGATC
TGGCCTAATTCGGCCGATGTCTGGCCCTTGGGGTCCCAGTCGTATTTTCC
GATAACCAACTTTCGGAGGTGGTCATCAAGATCACTTTGAATGTGAGTCA
AACCCACTTTTTCATTGTTGAATCGTCTCGAATCCCCGTATTCCGGCCGT
CCGTACAATAAGCGCAACACGTTTTCCATGATTCTCTCAAGCCCAACCAA
AGCAATAGTTTGCGTACAACTCGGGTGTATCCGGATATGGTATTGTCCGG
ATTTCGGTAAAGAGAACATTTGGAATTCTAGATCTGGCGGTAAAGAGAAT
CCCTTCCCCTCAACAAAGTTTTCAGTCAAATACAAGTCAAGTGCATTGAC
TAAATCTTGTACCAGTTTGACTGAAGCATTGTGGATACCATTAGCGATGT
TCCACTGAGTGGCCGTATCTGTGTCGTTAGCAGCAACCATATCTCGCTCA
TCCATATTTGGTTTCTGGTCTCGTTTTCCCAAAATGTCAGCTGCAGCAAT
ATGTGATTCTTCTTTACCCATGTGATGCTGTTTGTTGGATATTGTGTTAC
TTCTCTACAGATGTTTATTATCTTTTAACAAGTGTCATGAAGTGTCTTTT
CACGCCCGCCCTTTTATACAAGACCCTGTCCAGAGAGGGTTTTAAGGGGA
ATTCTTCTAAGAACTATTTGATTGTTTAGTTAACACACAGTGCTTTGTGG
GGTGCCACATTATCAGATTTCAAAAATTTGTTATTATTTCAATCGGGCAA
AATAACTTCCTTTGTTAAAAAGAGATTTACGTAAAATTCAATCATCTGAC
TAACATTTGTGTTTGAAAAGTAATTCTCATATGTTCGCCTGGTTCGACCG
TCTTTAAAATATGGAGGTGTGTTTACCTGGGTCAGAGCATGATCATGTGC
TCGATTGGAATTAACCTAAATTATCGTCATATATGTAGTTTGAAATAAAG
AATTTTGGATTAGCGTTTAAAACGTTTTTAATACGAGTTAATCATTAGAG
ATCAACTCGCCCAACAAGAACATAAATCGATAATTTTAAGTCTTAATTTA
CAATACGATCGTACGGTTATAAGATGACGCAAGAATCTTTCAGCATCAAA
CTTTCAGTAACGGGTTATAGTCTTTTTGGCTGTCGTAGTGTCAATAAAAC
TAGCTAGCACAACATATCTGTTTCACGTCCATCTAACGTTATTAAGACGT
TTTAGATTGGCAATAAGTATCATCAGACTTATTCATTCATAGTCATGAGA
TCTGAGATTAGTCTTGATTTTTCCCTCCAAACGAAATTCGGATAAATTTT
ATATTCTTTAATGTTAGTTTATTTATTTTGATTACTCGATGATTAAAATT
AACTCGCAGCTTCCGATTAAATCTTCAAGCAGTCACGAGGAGGAATATTT
GTCAATTAATTTGAAGTTTGATTTTCCAACAAACGTCTATTTTTCTTTTC
TTTTCTAGGCCGAAGTTTGGGCTATTTGGCATAAAACAGGGTGTCTACGG
GACCTTGAAAACCTTGAAAACCTTGAAAACCTTGAAAATGAACCACCCAA
CCTTGAAAACCTTGAAAACTATCAATTTTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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AAAAAACCGCCTGCGGCGCTAAACCTTTATAACATTTAGAGAATTCCATA
TTTTCCTGTTTCTGTTGCGATTCTGTCGCAATGAATGCAACATATTCTTT
TATCATTAGCTGAGTTTTTGTCACTAATTTTCCGTTTGCATGAGCCCTAA
GAAATCGACTCTTCCCCAATTTTCAAATGGCTTCAGGGCGTCTTGGAATA
ATGGTCGTTCATCAGTAAAATTTCGAGGATTCCTTAAAACAACTCTTTTG
GCAATTGATTTTTGTAAAAAACAAAATCAAAAACAAGGCGTTTTTTAGCC
ATTTGAAAGAGTCAAAATCAAAATTTTCTCTCATCGGCGCAAACCATGGT
TGCGCCTCCTCGGTCACTGTAAACAATTGGTTTTGCTTCTAATTCTTTAT
TTCAACAGTTGGAAGACTAGGGAGCTGGATTTTTTTTTCTGGTATTCTTC
TTGAGAGGGAGATAGGAATTTAACTGTGGAAGTAATTCCCCGGGCACCAA
AAGCGAATAAATTTTATTTGCTGTCCTCTATTTTTCTTTCACCTACCACT
CTGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TTGACGTCGAATGAAGTACCATTGCATTTTATCGAACAAGTTCGTTAGTT
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TCTATTTCAAGTTATTCTAATACTGACCGCGAGAAAACATTTAGGAATTA
TGTCACTATTAGCCTTAAGCGATTCGTATGTATACACAAGGAAAAAGATT
GAAAGGCGTTTTAAATTACACCGTGCTTTTTATGATGAAACGTTTCTTGG
AATGACTTTCAGTCAGTAAATAACTCCAAGAAATTTTTGTTACTTCCGAT
TAATTCTATTTCGGTATCGTATTTGCGTTTTAGATCCTATATATAAACAA
TGCTCGCAATCAAATCGAAGCGCAACCTTAAAAGGAAATATAACAGCCGT
AATGACGACTGCAAACTCCGGTAATTGTCACTTTTGAATAGCGAACCATT
ATGCAAACATCTTTTTCGTGGTCAGCCTTTCTTAATATATCTAACATAAA
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GAGAAATCAAACCGGAAAGATCGGGAAATCGAACCCAACTATCGCGATTA
ATCGGATTTACGCACAATTACAAATGAAAAACACTGATTTTAAGAAACTC
CCTAAACGGAGTTTAATATGAATATTGCGGAATACTATTGGAGACTCGCG
TACAATGAATCTGTATGACTGACGGTAACCTAATACTAGACGTCACGGCT
TTTTTTCTACGCAGTAACGTCTATTCCACTAAGAAACAGAATGAAAAATT
CCGGCTTTTGGTGAGGTGCTCGTTAGACTGACTGTAGAAGAAAAACGGAC
AGCTTCGTTATCACGTGATCAAGTCATCTTTTTTTTGCGTTCATTTTAAA
CCTCTGACAGAATTAGGGCCGGCGTACAACGGAAAGGTGTAAAAACGACC
AAAATTTAGAATTTATAGATCATTTTCAATATTTTCAATAGTTTACCTAT
AAATTATGAAATTGTTAAGGAGTATTTAGTATTTTGAAGCCCGTTTAGTG
ATATTTTGCAGATTTTAATGTTCATAAGCTAAAAAATTCGCCAATGGTGA
GATAACGGCTAGCGTAAAGGGACCGGTGCAAAAGGGGTCGGGGTTTAATT
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TTCAAGTGCTCTAAAGTACAGTTGGAAAGTAGAATTTTAACTCCGAGTTT
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AACCGTTCAAATATGGCTGATAGCCACTGGAAGCCACTTAACCCCTCACG
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AATTCTCGCCCGAGCTTTAAATTCTAAAAAACGTTAAAATACCCAAAATT
GCCAATATATTTCGGTGCTGATTGTGGCTCTCGTATAAATAAACTATAAC
TATAAACTAAATAAACGGTATGCCTCTTAATGTAAATAACTTTTGGCAAT
CAGCTTTGAATTTCGATTAATTCTATCTAATCCTGACCGAGAGAAAATAT
TTGTTGCATTCTATCATTATTGACCTTATTTTTTCTTACACCGTACCCAA
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GTGGTTTTTTCTTGGAATGGCAACAAGTCAGTAAATGACTCCAAGAAACA
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AAGAGCTTCTTAGAATTGTTTTTACATATACGTCCGTGTTCTTCGTTGGG
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GGCCTTGAAGAGCTTCTTAGAATTGTTTTTACATATACGTCCGTGTTCTT
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GTAGAGCATCTGGCTACGGTGTGCAAGGCTGTGGGTTCAACCCCCATCCG
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CTCAGTAATTAAGAGAAGAATCAAGGGTAAGTGGAGAAATCCATAGGGAG
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AACAGGAACGAGTGAAGTTAGATCTTTTGAGTCTGCAAACAGTCAGCTCT
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TAAAGGTCGAATTAAAGAGAGTGAACCGTATATTTTGTTTCGTGACAGGC
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ACACACTCAAAACTACTTCAAATACACTCGAGACTTGACGTAAAACTATT
ATATATTTGTGTCAGGACTTACACCATTTACGCGAATACTCGATGGCATT
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TTAGATTTCAAAAATGTAGTCCTCCAAAACAAAGGAACCGCTAGATACAA
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ACAACGCAACAAGATCCTCACCAACATCCAGCGTGAAGCCCGCGCGGCCG
CGATATGGCTTTCCAAACAGATAAAACAGTACAGCGAGGACAACTTTAAA
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


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The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


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Expression

Values :

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Blast

[Close]

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Identity = 340/680 (50.00%), Postives = 477/680 (70.15%), Query Frame = 2

Query:  401 RLKLRQENADIANNRPNEGFFKKLDSSMKKNTTFVKKLRTMTEQQRDSLINEFNGLNLSKFIQEAVTNLVDAKMKVSDVSAVAAMCSLFHQRYAEFTPLFKKNFSKNFDGIDCKDEDKSGNVSKLRTSLRLLGELVLDGVYGLDNGISLLKNFLQTIVSSDKTSFAYAAVILTIVRHCGEDIAGILPRKHRHWKEELRIELPLLNVINPDQQSIFLCLFKEYYEALSKHIVVSHKTLQNRERQNKQTIGLKGELPADRKEAFEKAQKTHEKXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXQNESEDMGTVNVFTPLKGVEYDSETGLWEDEDTRTFYEKLEDLKEKVPQILFKESTTSTSSALQKKRSEKKKHVDRKLRHDINMAXXXXXXXXXXXXXNFEQEVLGDDNEEE---------------DPTVGGMAALAETYFQKLPTCVNRDFIDQASEEFLLKLNTKGNRKKLVRNLFTVNRTRLDLLPFYSRLVATLTPCLPEIAPDLVYLLKGSFLSHLRKKDQIHTEAKIKTVRFIGELTKFKVCPKAETLHCLKLLLDNFTHHNIDMACNLLETCGRFLYRSPESHPRMSALLEQMLRKKSAHAFDARHVTMIENAFYYCNPPERQKIQRKIRPPMHEYIRKLLYKDLSKTTTEKVLRQMRKLPWKEEKIKPYAVKCMINV 2395
            R +LR +N +  ++RP E FF +LDSS+KKNT FVKKL+T+TEQQRDSL ++FNGLNLSK+I EAV ++V+AK+K+SDV+    +CSLFHQRYA+F P   + + K+F+    + E+K+ N++KLRT LR + EL + G++    G+SL+   L+ I+++D+ S  + +V+++  RHCG+DIAG++PRK +   E+  +  P   +I+P++Q  F  L KEY+ +L+KH+   H+ LQN ERQN++ +  KGEL  DR + +E+   +++KLL +  SL++LLDE MPDLP+D+    E    +++FTP K  EYD E G+WEDED R FYE L DLK  VP ILFK++  S  +  +  + + K+  + K   +++  DD  ++  +   ++   E+ G D  E+                 T   +  + + + Q+LP CVNRD ID+A+ +F + +NTK NRKKLVR LF V R RLDLLPFY+RLVATL PC+ ++A DL  +L+G F  H+RKKDQI+ E K KTVRFIGELTKFK+  K +TLHCLK+LL +F+HH+I+MAC LLETCGRFL+RSPESH R S LLEQM+RKK A   DAR+VTM+ENA+YYCNPP  +K  +K RPP+ EY+RKLLYKDLSK TTEKVLRQMRKLPW+++++K Y + CMIN+
Sbjct:  141 RKELRSKNQNAPDSRPEENFFSRLDSSLKKNTAFVKKLKTITEQQRDSLSHDFNGLNLSKYIAEAVASIVEAKLKISDVNCAVHLCSLFHQRYADFAPSLLQVWKKHFEA---RKEEKTPNITKLRTDLRFIAELTIVGIFTDKEGLSLIYEQLKNIINADRESHTHVSVVISFCRHCGDDIAGLVPRKVKSAAEKFNLSFPPSEIISPEKQQPFQNLLKEYFTSLTKHLKRDHRELQNTERQNRRILHSKGELSEDRHKQYEEFAMSYQKLLANSQSLADLLDENMPDLPQDKPTPEEHGPGIDIFTPGKPGEYDLEGGIWEDEDARNFYENLIDLKAFVPAILFKDNEKSCQNK-ESNKDDTKEAKESKENKEVSSPDDLELELENLEINDDTLELEGGDEAEDLTKKLLDEQEQEDEEASTGSHLKLIVDAFLQQLPNCVNRDLIDKAAMDFCMNMNTKANRKKLVRALFIVPRQRLDLLPFYARLVATLHPCMSDVAEDLCSMLRGDFRFHVRKKDQINIETKNKTVRFIGELTKFKMFTKNDTLHCLKMLLSDFSHHHIEMACTLLETCGRFLFRSPESHLRTSVLLEQMMRKKQAMHLDARYVTMVENAYYYCNPPPAEKTVKKKRPPLQEYVRKLLYKDLSKVTTEKVLRQMRKLPWQDQEVKDYVICCMINI 816

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00051421 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00051421 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
RENT2	0.000e+0	50.00	Regulator of nonsense transcripts 2 OS=Homo sapien...	[more]

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TCONS_00051421 (transcript) - C. hemisphaerica