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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00051513 ID=TCONS_00051513|Name=TCONS_00051513|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3446bp
TTAGATTGAGAGATTCAGCAATAAAACTCATAATGGTcaatgtcaaattt
ttattcGTATTACAATGCATCCAAATAATATCAGGTTATATAACTGAGCC
AAGATTCATATACGTCTCGCATAACGCAAACAGCACATACGAAACAGACT
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GAATGCAGCAGTAAAGATACCACATGCTTTAACAATCTCCAGTTATTGTG
ATTCTGAAGGCAATAACATTTGTAACAGATTGGCTATCCTTGAATTCAAG
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tttttttattttcaaaaccaaTTTTTCGATTATATCCCTGGAGAGGTGTC
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tttgtttcaatttaCGCTAGTAAGCAGAGTAGAGTTGAATACCATGGGAA
TGTGTTTTATGACACGGCATTTTCCCTTTCTATTGGTTCAGAGGTTAACA
AAGTAGAGGTGTTGGGGTTGAGTCAACTTATAATCAGAGATTGTTATTTT
GAAGCTACCGACGTCCAGCTTGCAGCTTTTTACCCAGCCAATATCTCCAT
TTCAAATATAACTATGAACATTTCAATGATTGCAATCATGTCCTATGTAT
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TTAATGGACGTTGATTTCAGAACTTCAATATTATCCATGGTCGCCATAAC
gtcaaatattatcaaaatctcTAATTGCACATTCCTAAACAATACAACTC
CGGCTTGGATGCCTTGCGCTTTTTACATCAGTCTTGTAAACGTAAATCCA
TATGAAAATCTACTAATATCCAATGTTACCATAAACTCTGGTAATTTGga
tgaaattaaaaatcttGTTATTTTCGTAGAAAAATTTAGCAATTTTTCGA
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GTGTACAAAATGTGACGGTACAAGCTATAATGCATTTGATCGATCATATG
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CTCTGTCCATATCAAGCATCTTGTGTTAACGGGATCAAAAGTAATGGTAA
TTATTGGGGAATTACTGATCAATCTGGACACGTCACTTTTCACCAATGCC
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TGTATGAACAATCGCCAAGGAAGACTGTGTGGTGGATGCAAGGTCAACCA
TTCGATCAGTTTGTTGAGCTCTAATAATAAATGTGTAGAATCTGAAATTT
GTCAACCGAAATGGTGGTTTTGGTTGATATATGTTGCTGGAATTGTTTTA
GCATTTGTCATTTTGTTATACTATAAAGATGTATTTATTCAAATTAAAGA
TACTTTCTCGAAAAGCATATTCAATAGACCTTCAAACCAACAAGCATTGT
TAAAAACTGAAACGAGTTCTGACACAAATGATGAAATGGACGCTTCTTAC
TTACTAACGGACGAAGACAAAAGAACAGACCAACCGACTGGTCAAACTTC
AACAATGTTCTCTGGTTTAGTCAAAATCACATTCTTTTTCTACCAGACAG
CTTCCATTATTCGCATCAATGCTCCTTCAAGGATAGAATACAAAATGCCG
TATTTCATTGATATTCTAACATCTTTTTTCAACGTCAAAATTGATATCAC
ATCGTCAGATATAATTGAAATATGCCCATTCCAAACCAAAATTGTTGCAG
TCATGGAGCTATTCCGTTTAAGTGTTATTTTTGgagttttctttttgatt
tttgcagCAATGCTGGTTTTAAAAGTAATCCGAAATTACCGTAAAACCCA
GCATTTGAGATCTAAATTCATGACCAGATTGAAAGTCGGTTATGTCCAGT
TATTGACTCTTGGTTACGCCGGCATTGCAGTGATATGTATACGGTCAATA
GATTGTATTGAAATAGATGGGGCTTATTATATTTTCTACCAAGCAGAATT
GGAATGTTACCACCAACCATGGCAAATCTTTGCCATGGTTGTAATTGCTG
TTTGGGTCATTCCTTTTCCAATAGTATTGTTTGTTGGGAGTCGCTTCTTA
AGATCATGGAGTATCACACCAAATGAGTTTTTGTTAATTCAAACTTTTCC
TCCGACGGCCCTGGCAATCATTATCAAAAATCATTGTCGTGATAACAGGT
TGAATCAATGGAGTGAGCAAATGTTTAACGAACGAAAACATATTCTAAAT
TACCTTAACGAACCTTTCAGAGAATTTGAAACGAAGGATGATCGCCTTGA
GAGAACTATATGGGAACCGGTATTAATCTTACGTCGATTGATTCTTATAA
TTATTACCACGTTTATCAGGTCACCAATAATGAAACTGTACCCAACTGGT
ATCATATTGGTTTTATTCACGATACATGATTACGTTACAAAACCATTCAA
AGATCACACTCTTAATTTCGTTCAATTGATATCAATGTCCTGTTTAGGAA
TTTTAGTACTCTTTAATATGTTCTGGGCGCTATCAATTAACATAGATATA
TTGGATAATACTGAATTTTACGTTTTTGGAGAGATTTTGCTCGTTTTGGA
GTTAATCATGTTGTTGACACCAATTTGTCTTGTTATGTTTGGTGCTATTT
TCAAATTAGGAAAATGTGTATATAAAGCATGTCTTAGAAAATTAGACTAA
TTTTTATTCAGCTTATCCAATCAGTACATGCTGATACAATAgacacgaac
atcacttgcctcgttttgaaattattgtcatggtgattaactccca Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00051513-protein >TCONS_00051513-protein ID=TCONS_00051513-protein|Name=TCONS_00051513-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=1115bp
RLRDSAIKLIMVNVKFLFVLQCIQIISGYITEPRFIYVSHNANSTYETDC
GTIIHPCQDLQQAINTSNESDSILLDVQYIYIQNAAVKIPHALTISSYCD
SEGNNICNRLAILEFKTHKHSLEISSFSISGNLTIENLSIKIFKTPQNEY
ILFTTTYDNNNSYSSNVTLSKSSVFVPLEVAADFFIFKTNFSIISLERCL
FSSYVNTNYQHSNRKKGLLVNKENVAEPIKRILYISRCKFVKFDLYIDGA
EIEMDFKIIKNTFLESFVSIYASKQSRVEYHGNVFYDTAFSLSIGSEVNK
VEVLGLSQLIIRDCYFEATDVQLAAFYPANISISNITMNISMIAIMSYVS
LGKVIMNLADSKFEGPLTRFESVACHPVVIYNCEFKNTDRGAINIRNSGL
VDIGNTNFNDNYISQMLMDVDFRTSILSMVAITSNIIKISNCTFLNNTTP
AWMPCAFYISLVNVNPYENLLISNVTINSGNLDEIKNLVIFVEKFSNFSN
AVIIRNTSLQCQHSNYYLQGGLKTTHNDFSELWCTKCDGTSYNAFDRSYV
EWNQAGDSLIHNTTCFLCPYQASCVNGIKSNGNYWGITDQSGHVTFHQCP
AFYCCPRLKKCNSYNACMNNRQGRLCGGCKVNHSISLLSSNNKCVESEIC
QPKWWFWLIYVAGIVLAFVILLYYKDVFIQIKDTFSKSIFNRPSNQQALL
KTETSSDTNDEMDASYLLTDEDKRTDQPTGQTSTMFSGLVKITFFFYQTA
SIIRINAPSRIEYKMPYFIDILTSFFNVKIDITSSDIIEICPFQTKIVAV
MELFRLSVIFGVFFLIFAAMLVLKVIRNYRKTQHLRSKFMTRLKVGYVQL
LTLGYAGIAVICIRSIDCIEIDGAYYIFYQAELECYHQPWQIFAMVVIAV
WVIPFPIVLFVGSRFLRSWSITPNEFLLIQTFPPTALAIIIKNHCRDNRL
NQWSEQMFNERKHILNYLNEPFREFETKDDRLERTIWEPVLILRRLILII
ITTFIRSPIMKLYPTGIILVLFTIHDYVTKPFKDHTLNFVQLISMSCLGI
LVLFNMFWALSINIDILDNTEFYVFGEILLVLELIMLLTPICLVMFGAIF
KLGKCVYKACLRKLD Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_202:712129..717078+ Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00051513 ID=TCONS_00051513|Name=TCONS_00051513|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4950bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_202:712129..717078+ (Clytia hemisphaerica)
TTAGATTGAGAGATTCAGCAATAAAACTCATAATGGTcaatgtcaaattt
ttattcGTATTACAATGCATCCAAATAATATCAGGTAAGCATCTTAAGTC
TGCTGATCAAATTTTCCATATAATAACTATAACGCTTTTAGTCTCGGTAG
GGTTCTAATAAAATCCAGTGCCTTTTTTTGTAATACCCTGTCTCAATAAA
ACCTAGTCTACAGTAGACCCGCtgggattttatcagcctgtggggataaa
aataacggaccagaaatcgatggggattgatagtCCCATCGTTTTTATGA
CTGGAGATTTTAATTCCATTGTGTTCTAGCCCACaaaattcagtagggat
ggaaaaaatagcacaatatttagcagtgaggatttgctgaTCTGATTATT
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ttataaaaagattgaagaattccttcaaaagttataggtaaaagaaaaaa
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Aactagagtataattttccactggggacgatattttggccaatttttcca
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ATAAGTTCAGCAACGGGTTTGGTTGCCACGGCAGACGTTGCTCAGTTTTC
TGTCCTAGTATTTTCATTGGCTTAGAAATCTATCGATAATTGTTTTACAG
GAGCTTTGGGAATTCTCATTATTGCTTCAAAAGACGGAGGATGTTTTAGA
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TTAAAATCAGACAGTGACGGTATTTatagccttattttttgttattatgc
CGGTAAATTTTAACCTCTACAAACTgatgtgacggtgttattattttttt
caattttcgggattccgggattctgACGGGAAAatggtatttcgaacccc
tacaaaccgcCTCAGAAAAAGCAAACATATTTTCAGCAgaaagttcataa
tttttttacttccTAACCTAAACTTGCTAAGGTGACAATTATTGACGAGT
GTTGTGGATCCTGTGGATGGTAGATGGACATTACTTAAATGCACAGAGCC
TATACAAGACCTCCAATTTGCaacttttttcgaatgtttggagccaaGGT
TTTCGGGCTTCAAACATTAGATTTTTTGAGTCACTATAAACTTTTGAAGT
TCTTGCAGTAGGGAATAATCGACTTTGCGTCAGGACACTTGAAATGCTTT
CCttagtttttcagaaaatcgtcaaagtggaactcaccaaGAAATGATAT
GGAAAATCCCAGTTTTTGATGAGGTGCTCGCTATAATGTTCAGAGCAGGC
TGTGGTAATTTCATTTCTTATCTTTCTTTACATTTTAGGTTATATAACTG
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GACTGTGGAACAATTATTCATCCATGTCAAGATTTACAGCAGGCCATCAA
CACATCTAATGAATCAGACTCTATTCTCTTAGATGTTCAATATATCTATA
TCCAGAATGCAGCAGTAAAGATACCACATGCTTTAACAATCTCCAGTTAT
TGTGATTCTGAAGGCAATAACATTTGTAACAGATTGGCTATCCTTGAATT
CAAGACTCACAAACACTCATTGGAAATCAGTTCATTCTCAATTTCAGGGA
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GAATACATCTTATTTACCACCACTTATGACAATAACAATTCATACAGCAG
CAATGTAACTTTGAGCAAGTCAAGCGTTTTCGTACCACTAGAAGTAGCAg
ccgatttttttattttcaaaaccaaTTTTTCGATTATATCCCTGGAGAGG
TGTCTATTCTCTTCATATGTTAATACAAATTATCAACACAGTAATCGTAA
GAAAGGGTTACTTGTCAATAAAGAAAATGTAGCAGAACCaataaaaagaa
ttttataCATTTCCAGATGCAAGTTCGTTAAATTCGATCTTTATATAGAT
GGTGCAGAAATTGAAATggatttcaaaataataaagaacACGTTTCtaga
atcttttgtttcaatttaCGCTAGTAAGCAGAGTAGAGTTGAATACCATG
GGAATGTGTTTTATGACACGGCATTTTCCCTTTCTATTGGTTCAGAGGTT
AACAAAGTAGAGGTGTTGGGGTTGAGTCAACTTATAATCAGAGATTGTTA
TTTTGAAGCTACCGACGTCCAGCTTGCAGCTTTTTACCCAGCCAATATCT
CCATTTCAAATATAACTATGAACATTTCAATGATTGCAATCATGTCCTAT
GTATCATTGGGTAAAGTCATTATGAATTTGGCTGATTCAAAATTCGAAGG
TCCTTTGACTCGATTCGAATCAGTAGCTTGTCACCCAGTAGTCATTTATA
ATTGTGAATTTAAAAACACAGACCGGGGTGCAATAAATATAAGGAATTCA
GGTCTCGTAGATATAGGGAACACAAACTTTAATGATAACTACATCAGTCA
AATGTTAATGGACGTTGATTTCAGAACTTCAATATTATCCATGGTCGCCA
TAACgtcaaatattatcaaaatctcTAATTGCACATTCCTAAACAATACA
ACTCCGGCTTGGATGCCTTGCGCTTTTTACATCAGTCTTGTAAACGTAAA
TCCATATGAAAATCTACTAATATCCAATGTTACCATAAACTCTGGTAATT
TGgatgaaattaaaaatcttGTTATTTTCGTAGAAAAATTTAGCAATTTT
TCGAACGCTGTAATTATCCGAAACACATCATTGCAATGCCAGCACTCGAA
TTATTATCTGCAGGGAGGTTTGAAAACTACTCATAATGATTTTTCTGAAC
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TATGTCGAATGGAACCAAGCTGGAGATTCACTGATCCATAACACAACATG
TTTCCTCTGTCCATATCAAGCATCTTGTGTTAACGGGATCAAAAGTAATG
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TGCCCAGCTTTCTATTGTTGTCCTCGATTAAAGAAATGTAATTCTTATAA
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ATTTGTCAACCGAAATGGTGGTTTTGGTTGATATATGTTGCTGGAATTGT
TTTAGCATTTGTCATTTTGTTATACTATAAAGATGTATTTATTCAAATTA
AAGATACTTTCTCGAAAAGCATATTCAATAGACCTTCAAACCAACAAGCA
TTGTTAAAAACTGAAACGAGTTCTGACACAAATGATGAAATGGACGCTTC
TTACTTACTAACGGACGAAGACAAAAGAACAGACCAACCGACTGGTCAAA
CTTCAACAATGTTCTCTGGTTTAGTCAAAATCACATTCTTTTTCTACCAG
ACAGCTTCCATTATTCGCATCAATGCTCCTTCAAGGATAGAATACAAAAT
GCCGTATTTCATTGATATTCTAACATCTTTTTTCAACGTCAAAATTGATA
TCACATCGTCAGATATAATTGAAATATGCCCATTCCAAACCAAAATTGTT
GCAGTCATGGAGCTATTCCGTTTAAGTGTTATTTTTGgagttttcttttt
gatttttgcagCAATGCTGGTTTTAAAAGTAATCCGAAATTACCGTAAAA
CCCAGCATTTGAGATCTAAATTCATGACCAGATTGAAAGTCGGTTATGTC
CAGTTATTGACTCTTGGTTACGCCGGCATTGCAGTGATATGTATACGGTC
AATAGATTGTATTGAAATAGATGGGGCTTATTATATTTTCTACCAAGCAG
AATTGGAATGTTACCACCAACCATGGCAAATCTTTGCCATGGTTGTAATT
GCTGTTTGGGTCATTCCTTTTCCAATAGTATTGTTTGTTGGGAGTCGCTT
CTTAAGATCATGGAGTATCACACCAAATGAGTTTTTGTTAATTCAAACTT
TTCCTCCGACGGCCCTGGCAATCATTATCAAAAATCATTGTCGTGATAAC
AGGTTGAATCAATGGAGTGAGCAAATGTTTAACGAACGAAAACATATTCT
AAATTACCTTAACGAACCTTTCAGAGAATTTGAAACGAAGGATGATCGCC
TTGAGAGAACTATATGGGAACCGGTATTAATCTTACGTCGATTGATTCTT
ATAATTATTACCACGTTTATCAGGTCACCAATAATGAAACTGTACCCAAC
TGGTATCATATTGGTTTTATTCACGATACATGATTACGTTACAAAACCAT
TCAAAGATCACACTCTTAATTTCGTTCAATTGATATCAATGTCCTGTTTA
GGAATTTTAGTACTCTTTAATATGTTCTGGGCGCTATCAATTAACATAGA
TATATTGGATAATACTGAATTTTACGTTTTTGGAGAGATTTTGCTCGTTT
TGGAGTTAATCATGTTGTTGACACCAATTTGTCTTGTTATGTTTGGTGCT
ATTTTCAAATTAGGAAAATGTGTATATAAAGCATGTCTTAGAAAATTAGA
CTAATTTTTATTCAGCTTATCCAATCAGTACATGCTGATACAATAgacac
gaacatcacttgcctcgttttgaaattattgtcatggtgattaactccca
Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_202:712129..717078+ >TCONS_00051513 ID=TCONS_00051513|Name=TCONS_00051513|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=6696bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_202:712129..717078+ (Clytia hemisphaerica)
AGATTGAGAGATTCAGCAATAAAACTCATAATGGTcaatgtcaaattttt
attcGTATTACAATGCATCCAAATAATATCAGGTTATATAACTGAGCCAA
GATTCATATACGTCTCGCATAACGCAAACAGCACATACGAAACAGACTGT
GGAACAATTATTCATCCATGTCAAGATTTACAGCAGGCCATCAACACATC
TAATGAATCAGACTCTATTCTCTTAGATGTTCAATATATCTATATCCAGA
ATGCAGCAGTAAAGATACCACATGCTTTAACAATCTCCAGTTATTGTGAT
TCTGAAGGCAATAACATTTGTAACAGATTGGCTATCCTTGAATTCAAGAC
TCACAAACACTCATTGGAAATCAGTTCATTCTCAATTTCAGGGAATTTGA
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ATCTTATTTACCACCACTTATGACAATAACAATTCATACAGCAGCAATGT
AACTTTGAGCAAGTCAAGCGTTTTCGTACCACTAGAAGTAGCAgccgatt
tttttattttcaaaaccaaTTTTTCGATTATATCCCTGGAGAGGTGTCTA
TTCTCTTCATATGTTAATACAAATTATCAACACAGTAATCGTAAGAAAGG
GTTACTTGTCAATAAAGAAAATGTAGCAGAACCaataaaaagaattttat
aCATTTCCAGATGCAAGTTCGTTAAATTCGATCTTTATATAGATGGTGCA
GAAATTGAAATggatttcaaaataataaagaacACGTTTCtagaatcttt
tgtttcaatttaCGCTAGTAAGCAGAGTAGAGTTGAATACCATGGGAATG
TGTTTTATGACACGGCATTTTCCCTTTCTATTGGTTCAGAGGTTAACAAA
GTAGAGGTGTTGGGGTTGAGTCAACTTATAATCAGAGATTGTTATTTTGA
AGCTACCGACGTCCAGCTTGCAGCTTTTTACCCAGCCAATATCTCCATTT
CAAATATAACTATGAACATTTCAATGATTGCAATCATGTCCTATGTATCA
TTGGGTAAAGTCATTATGAATTTGGCTGATTCAAAATTCGAAGGTCCTTT
GACTCGATTCGAATCAGTAGCTTGTCACCCAGTAGTCATTTATAATTGTG
AATTTAAAAACACAGACCGGGGTGCAATAAATATAAGGAATTCAGGTCTC
GTAGATATAGGGAACACAAACTTTAATGATAACTACATCAGTCAAATGTT
AATGGACGTTGATTTCAGAACTTCAATATTATCCATGGTCGCCATAACgt
caaatattatcaaaatctcTAATTGCACATTCCTAAACAATACAACTCCG
GCTTGGATGCCTTGCGCTTTTTACATCAGTCTTGTAAACGTAAATCCATA
TGAAAATCTACTAATATCCAATGTTACCATAAACTCTGGTAATTTGgatg
aaattaaaaatcttGTTATTTTCGTAGAAAAATTTAGCAATTTTTCGAAC
GCTGTAATTATCCGAAACACATCATTGCAATGCCAGCACTCGAATTATTA
TCTGCAGGGAGGTTTGAAAACTACTCATAATGATTTTTCTGAACTTTGGT
GTACAAAATGTGACGGTACAAGCTATAATGCATTTGATCGATCATATGTC
GAATGGAACCAAGCTGGAGATTCACTGATCCATAACACAACATGTTTCCT
CTGTCCATATCAAGCATCTTGTGTTAACGGGATCAAAAGTAATGGTAATT
ATTGGGGAATTACTGATCAATCTGGACACGTCACTTTTCACCAATGCCCA
GCTTTCTATTGTTGTCCTCGATTAAAGAAATGTAATTCTTATAACGCGTG
TATGAACAATCGCCAAGGAAGACTGTGTGGTGGATGCAAGGTCAACCATT
CGATCAGTTTGTTGAGCTCTAATAATAAATGTGTAGAATCTGAAATTTGT
CAACCGAAATGGTGGTTTTGGTTGATATATGTTGCTGGAATTGTTTTAGC
ATTTGTCATTTTGTTATACTATAAAGATGTATTTATTCAAATTAAAGATA
CTTTCTCGAAAAGCATATTCAATAGACCTTCAAACCAACAAGCATTGTTA
AAAACTGAAACGAGTTCTGACACAAATGATGAAATGGACGCTTCTTACTT
ACTAACGGACGAAGACAAAAGAACAGACCAACCGACTGGTCAAACTTCAA
CAATGTTCTCTGGTTTAGTCAAAATCACATTCTTTTTCTACCAGACAGCT
TCCATTATTCGCATCAATGCTCCTTCAAGGATAGAATACAAAATGCCGTA
TTTCATTGATATTCTAACATCTTTTTTCAACGTCAAAATTGATATCACAT
CGTCAGATATAATTGAAATATGCCCATTCCAAACCAAAATTGTTGCAGTC
ATGGAGCTATTCCGTTTAAGTGTTATTTTTGgagttttctttttgatttt
tgcagCAATGCTGGTTTTAAAAGTAATCCGAAATTACCGTAAAACCCAGC
ATTTGAGATCTAAATTCATGACCAGATTGAAAGTCGGTTATGTCCAGTTA
TTGACTCTTGGTTACGCCGGCATTGCAGTGATATGTATACGGTCAATAGA
TTGTATTGAAATAGATGGGGCTTATTATATTTTCTACCAAGCAGAATTGG
AATGTTACCACCAACCATGGCAAATCTTTGCCATGGTTGTAATTGCTGTT
TGGGTCATTCCTTTTCCAATAGTATTGTTTGTTGGGAGTCGCTTCTTAAG
ATCATGGAGTATCACACCAAATGAGTTTTTGTTAATTCAAACTTTTCCTC
CGACGGCCCTGGCAATCATTATCAAAAATCATTGTCGTGATAACAGGTTG
AATCAATGGAGTGAGCAAATGTTTAACGAACGAAAACATATTCTAAATTA
CCTTAACGAACCTTTCAGAGAATTTGAAACGAAGGATGATCGCCTTGAGA
GAACTATATGGGAACCGGTATTAATCTTACGTCGATTGATTCTTATAATT
ATTACCACGTTTATCAGGTCACCAATAATGAAACTGTACCCAACTGGTAT
CATATTGGTTTTATTCACGATACATGATTACGTTACAAAACCATTCAAAG
ATCACACTCTTAATTTCGTTCAATTGATATCAATGTCCTGTTTAGGAATT
TTAGTACTCTTTAATATGTTCTGGGCGCTATCAATTAACATAGATATATT
GGATAATACTGAATTTTACGTTTTTGGAGAGATTTTGCTCGTTTTGGAGT
TAATCATGTTGTTGACACCAATTTGTCTTGTTATGTTTGGTGCTATTTTC
AAATTAGGAAAATGTGTATATAAAGCATGTCTTAGAAAATTAGACTAAAG
ATTGAGAGATTCAGCAATAAAACTCATAATGGTcaatgtcaaatttttat
tcGTATTACAATGCATCCAAATAATATCAGGTTATATAACTGAGCCAAGA
TTCATATACGTCTCGCATAACGCAAACAGCACATACGAAACAGACTGTGG
AACAATTATTCATCCATGTCAAGATTTACAGCAGGCCATCAACACATCTA
ATGAATCAGACTCTATTCTCTTAGATGTTCAATATATCTATATCCAGAAT
GCAGCAGTAAAGATACCACATGCTTTAACAATCTCCAGTTATTGTGATTC
TGAAGGCAATAACATTTGTAACAGATTGGCTATCCTTGAATTCAAGACTC
ACAAACACTCATTGGAAATCAGTTCATTCTCAATTTCAGGGAATTTGACG
ATAGAGAACCTTTCGATAAAGATTTTCAAGACCCCTCAGAATGAATACAT
CTTATTTACCACCACTTATGACAATAACAATTCATACAGCAGCAATGTAA
CTTTGAGCAAGTCAAGCGTTTTCGTACCACTAGAAGTAGCAgccgatttt
tttattttcaaaaccaaTTTTTCGATTATATCCCTGGAGAGGTGTCTATT
CTCTTCATATGTTAATACAAATTATCAACACAGTAATCGTAAGAAAGGGT
TACTTGTCAATAAAGAAAATGTAGCAGAACCaataaaaagaattttataC
ATTTCCAGATGCAAGTTCGTTAAATTCGATCTTTATATAGATGGTGCAGA
AATTGAAATggatttcaaaataataaagaacACGTTTCtagaatcttttg
tttcaatttaCGCTAGTAAGCAGAGTAGAGTTGAATACCATGGGAATGTG
TTTTATGACACGGCATTTTCCCTTTCTATTGGTTCAGAGGTTAACAAAGT
AGAGGTGTTGGGGTTGAGTCAACTTATAATCAGAGATTGTTATTTTGAAG
CTACCGACGTCCAGCTTGCAGCTTTTTACCCAGCCAATATCTCCATTTCA
AATATAACTATGAACATTTCAATGATTGCAATCATGTCCTATGTATCATT
GGGTAAAGTCATTATGAATTTGGCTGATTCAAAATTCGAAGGTCCTTTGA
CTCGATTCGAATCAGTAGCTTGTCACCCAGTAGTCATTTATAATTGTGAA
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AGATATAGGGAACACAAACTTTAATGATAACTACATCAGTCAAATGTTAA
TGGACGTTGATTTCAGAACTTCAATATTATCCATGGTCGCCATAACgtca
aatattatcaaaatctcTAATTGCACATTCCTAAACAATACAACTCCGGC
TTGGATGCCTTGCGCTTTTTACATCAGTCTTGTAAACGTAAATCCATATG
AAAATCTACTAATATCCAATGTTACCATAAACTCTGGTAATTTGgatgaa
attaaaaatcttGTTATTTTCGTAGAAAAATTTAGCAATTTTTCGAACGC
TGTAATTATCCGAAACACATCATTGCAATGCCAGCACTCGAATTATTATC
TGCAGGGAGGTTTGAAAACTACTCATAATGATTTTTCTGAACTTTGGTGT
ACAAAATGTGACGGTACAAGCTATAATGCATTTGATCGATCATATGTCGA
ATGGAACCAAGCTGGAGATTCACTGATCCATAACACAACATGTTTCCTCT
GTCCATATCAAGCATCTTGTGTTAACGGGATCAAAAGTAATGGTAATTAT
TGGGGAATTACTGATCAATCTGGACACGTCACTTTTCACCAATGCCCAGC
TTTCTATTGTTGTCCTCGATTAAAGAAATGTAATTCTTATAACGCGTGTA
TGAACAATCGCCAAGGAAGACTGTGTGGTGGATGCAAGGTCAACCATTCG
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ACCGAAATGGTGGTTTTGGTTGATATATGTTGCTGGAATTGTTTTAGCAT
TTGTCATTTTGTTATACTATAAAGATGTATTTATTCAAATTAAAGATACT
TTCTCGAAAAGCATATTCAATAGACCTTCAAACCAACAAGCATTGTTAAA
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TAACGGACGAAGACAAAAGAACAGACCAACCGACTGGTCAAACTTCAACA
ATGTTCTCTGGTTTAGTCAAAATCACATTCTTTTTCTACCAGACAGCTTC
CATTATTCGCATCAATGCTCCTTCAAGGATAGAATACAAAATGCCGTATT
TCATTGATATTCTAACATCTTTTTTCAACGTCAAAATTGATATCACATCG
TCAGATATAATTGAAATATGCCCATTCCAAACCAAAATTGTTGCAGTCAT
GGAGCTATTCCGTTTAAGTGTTATTTTTGgagttttctttttgatttttg
cagCAATGCTGGTTTTAAAAGTAATCCGAAATTACCGTAAAACCCAGCAT
TTGAGATCTAAATTCATGACCAGATTGAAAGTCGGTTATGTCCAGTTATT
GACTCTTGGTTACGCCGGCATTGCAGTGATATGTATACGGTCAATAGATT
GTATTGAAATAGATGGGGCTTATTATATTTTCTACCAAGCAGAATTGGAA
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GGTCATTCCTTTTCCAATAGTATTGTTTGTTGGGAGTCGCTTCTTAAGAT
CATGGAGTATCACACCAAATGAGTTTTTGTTAATTCAAACTTTTCCTCCG
ACGGCCCTGGCAATCATTATCAAAAATCATTGTCGTGATAACAGGTTGAA
TCAATGGAGTGAGCAAATGTTTAACGAACGAAAACATATTCTAAATTACC
TTAACGAACCTTTCAGAGAATTTGAAACGAAGGATGATCGCCTTGAGAGA
ACTATATGGGAACCGGTATTAATCTTACGTCGATTGATTCTTATAATTAT
TACCACGTTTATCAGGTCACCAATAATGAAACTGTACCCAACTGGTATCA
TATTGGTTTTATTCACGATACATGATTACGTTACAAAACCATTCAAAGAT
CACACTCTTAATTTCGTTCAATTGATATCAATGTCCTGTTTAGGAATTTT
AGTACTCTTTAATATGTTCTGGGCGCTATCAATTAACATAGATATATTGG
ATAATACTGAATTTTACGTTTTTGGAGAGATTTTGCTCGTTTTGGAGTTA
ATCATGTTGTTGACACCAATTTGTCTTGTTATGTTTGGTGCTATTTTCAA
ATTAGGAAAATGTGTATATAAAGCATGTCTTAGAAAATTAGACTAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
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Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_202 | supercontig | scaffold_202:712129..717078 + |
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
| Term | Definition |
|---|
| IPR012334 | Pectin_lyas_fold |
| IPR011050 | Pectin_lyase_fold/virulence |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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