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transcript sequence >TCONS_00051659 ID=TCONS_00051659|Name=TCONS_00051659|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1785bp CTGGTGGTTGAATTTAGAAGGTTTTGAAGTTTGCACATTTAGGGTCTTGA TTTTTATGATGGTATTGAGACATTTTGTTTCTTCGTTTGTATGAATTCCA AGGTCGTGGCAATCGTCATTTCATCTTTTATCTTAATATTGACACAAACT ACGGACAGTACGCATGCGCTACCACGACACAGAGACATTCGTTCAACGAG CACGGGTAGTAGAAAGGGTCGATTATCAATTACCGTGGTTCGAgaatttt tagataaaaacagTAATCCTGAAGAAGAGATTGAAGCTGTAGAACGGACT TCATTGAGTGTGAGAACCACTTCACTTGGTGCTGGAAGCAGTAGCGTAGG GGAACCATCCCATTCACGGGAACCGACCTGGTTTTCGCGTAATGGATCGa ataatttcaagaaaatgaaaCGACGCAGTCGACGAAAGAGGCAGAAACGC GGAGCAAAAGTTAACACGGATGCTGCTTACATAAGCGAGTTCAAGACGAA CCAAAGAGTATATAAGTATTGCAACAAGTTAGGATTTTGCTTGCGGCTGA ATGCCGATGGGAAGGTCGACGGTACGAGGAACAAAGAGGACCCTTACAct GTCCTGTTATTCGAATCACATGGTAGAAGCATCATACGTATAAAGGGTTA TTACGCCAACAAATATCTAACGATGAATCAGAAGGGTGTGCCAGCAGGCG AAgCTGATCCACATTTTTTCGACAGTTTATTCCGTTTAACAGAAGAAGAA AACAGATGGGACACTATCGCATCATATAAATATTATTTCGAAGAGAAGTT TGATATGCTGGTAGGAATAACAAAAGACGCGCAACTAAAACAACCATGGA AAGCTAGTCCAGGACAATATGCAACTCAATTTTTACCATTACCTTATGAA ATTAAGGATAATTTCGTTGAAGAAATGCGCCTGAAagatcaacaaaagaa atcaacaAAGTAGTTGCTGGATGTGTAGCTTTGTGTTAGTTTAAGCAAGA CAACCGCGTTTAGCAGTGAATTTGGTGAATCTAATGAGATGATGACATCC TAGAGATTGGTTCCATTGGCAGCCAATCCATGATTGAACAGACTTTTTTG TTGCAGAGGCTATGATAAAAAGACTAATGgtctgtttttctttgtttaaa ttTGTGTTCTGAACAGAAGCGATGATCCGGATGTGTTATCCACACAAAAT GATCAAATAGAAGATTTTAGAACGATTGACCACAGAATCAAATGTAACAC ATGACCCAGATTTTTGCAATAAAGTTTTAGCACTACACGTGGGTTTATAC TTGTATACGTCATGGCCTGATGAAAGTTCGAATAatgatttctgaatttt tgaaatttcagtttAAGTTTTCAGTTATGGTCGtttaaattttatttact tCGCGTGGATTtcttgaatgaaaataaaattggaaACCAAGGCTTACAAT CCTAGGtgagaaaatttattttcaatattttttgaaaggaaATTAACAAT ATTGCGTTGTGCTATATAGAAAAAGGACTGGTTTCTAGTTAGGGATTTTA TATCCAATAGAcgtaacattttttttataattaatATCTTAAATTATATT ATGTTTTAAAAGAAAGAGAGAGAGATAGATAAAAGCATAAGTAGTTTCTA ATAAGTTTAAGAAATATATGTGTACAATGTcagatatttatttttataat attacattattattatattatattttttgctccttaaaacttttaaaaaa gaaGTTCTAATTTAATATTTACAAACATAAAAAGC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_202:1082182..1110230- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00051659 ID=TCONS_00051659|Name=TCONS_00051659|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=28049bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_202:1082182..1110230- (Clytia hemisphaerica) CTGGTGGTTGAATTTAGAAGGTTTTGAAGTTTGCACATTTAGGGTCTTGA
TTTTTATGATGGTATTGAGACATTTTGTTTCTTCGTTTGTATGAATTCCA
AGGTGCGTATTATTTTGATTATATTTAATTACACCATTGTGTCACAGTCC
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CCTTATTTATTTACTAATCCTTTAGAAAAACGCAAGTACTGTTAAAGGCC
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TGAGACAGGCTTGTACCCTTTTATTTAGTTTAGTAGTTAGGCGTTTCAAG
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TCGACTTTAAAGCTTGATATTTCGCAAACGAGAAAAAATTTTGAAGATCG
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TTTTTAAATCGACTCTAAACTCATTTTCACTCACTTCTTTGGGAAAGTTC
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AAAAGTTATATTTCTTGTAAACGAGGTTTGCCAGATATTGTACCTTTTCT
TATTGCTTCTACCTTACCAATTCTTGGTGATGCCATATTATCTATGTACG
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CTGACATCATTATTTAAAATGTCACTATTATATTTCCTTGTCACAATGCA
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CTTGATCATGCTGATCGATCGGATTTGCCAGGGTTTGGCTAACTTGCTGG
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TTTCCGCACCCATCTGTCAGTCTGTGCATTGTGATACAGAATAACTTGAC
CGCTTCTGTGTTATTACTCCAAAAATAACTTAATATTTGATCTTATTTCT
CCCACGTATACTAGAGAGCTTGAAAGATGTGTGATGAGTTCGGAAATAGC
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TTAAACTTTTGAAGCTCTAGTAGTAGCAAAAAGCTCAAATTTGCAAAATA
CTTGAAAGACTTTTTTTCTCCAAAACTCATCCTGAAGTGTAACTCACAAA
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CGCCATCATCACCGACGGATAAAAACTTATACAGTTGTCGCTCTCTAATT
CGATCTTCAAGGGGAATTGGATTTTCATCGAATAAGGGAGCTTATCGAAT
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GTAGAACGTCAAATTAGAGAGCGTTAACTGTAGTCTTAATTTTGTCACTG
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GCAGAATTTGTGTAGGAGAGCAGATTTTTGTAACACAGTAATTATCTTTT
CGTGGTATTAAAAGATAGTTATAATGACATAAAAATCTGCTCTCCTACAT
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TTCTAACACCAAAACACCGACAGAAATACCGAAATACCTACAAACGTATT
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TGGATACGATAGGATACCCTTGCATAGAATTCATTCTTGATAAAGAAATA
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GTTGCCAATTTCGTCGGTGAGATATCTGGATGTGCTTTTTGATTGAATAA
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GGGTTGAATTAAAACATTTTCATCTTCGTTTTTGGTGGAATCTGGCTGAT
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ATTCCATTTAATCGGTATTGAAATCATTCTGTGTCCAGTTTGAAAAATCA
AGCCACCAATAATTCGTTAAACGAGACAGAACTAGAAATAACCATTTTCA
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CATTTAATCGGTATTGAAATCATTCTGTGTCCAGTTTGAAAAATCAAGCC
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TATCGTATCAAGCGCCGTTTCTACCAACACGGACAGACAGAAGGGCGGTG
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ATTTCCTGCAGTGAAAGATACAGCTACCAGGTAGTCAGCAAAAAACTCCT
CGCTTTTTATATTTAACGAGACAATAATTACCTTTATCTGATTTCCAAAG
CTGGAAAAAGAACAGGATAGATAATGACATGTCATTAGTTCGACTTAATG
TCTGTAATTTCATTATTCACAGGATTACGTAAAATTAATTATCCTTCTTC
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TATACCAATGGCTGAAGGCTAGAGTCGAATCTTCCATTGAGTTTAAAAGC
CTGAAAGGGCTGGAGATAAATCTTCAACCTTTGTCAAGCAAGAAAAAGTG
AAGCCTTGAGATTTGCGTCAGGATACAAACGTTGGATTAGAAGTAACATT
TACAGAATTTGAAAGTATATAAAACAATGAAAGTGCTAGATTCTATCTGT
TGACCGAAATGTGTGGAAAATTTTGAGGCTTCACTTTTTCTTGCTCCAAG
AGGTTTCAATAATTCACACTCCTGATTTATGGATTTATATCAACATGCAC
GCGTGGTATGTGTGGAAACTGTTTATTGTTAAGAAACCTTCAAAATCTAT
CAGTCACTCCTGTAGTAACAAAGTATCTTCAAAGGCTTGGTGTGTGCTTT
CGGTAGGGGTGTTGATTTAACTGTAAAAGGATTATTTTGTAAGGCATTCG
TTTGATATGATAAGGAATTTTAGTCTACGTGAAATGGTGTTTTCGGTGAT
GATCAGTTCATTGTTATGTTTGACGCTTACTGAAGATTCTAGTGAAATAT
CCTATAAGATTTGGTTTGACATCATGTCTAACAGGACATTGTCATCATTC
TATCCTTCCAGCGCGTGCTGTACTCTCCACTCCCAGATTCCACTGAACAA
TAAAATTAAAGTTTTATGCGTGATTTGCCAACAAAGTATTCACTACTTGG
TCGTCATGGCCAAAAACACATACACAAACATGAAAGTGGGCGAGCTACCG
CCTGCAAGGGCGGGCCTCCTACATCCTGTTTCATCCTGTGACATGTGTCA
ACATAATCTCTTTCGGATATGATTTCTCCAGAGCTGACAACAAACATGAA
TTCGTTCAAGAGTGTACACGTTTTATCACAAGCCTTAGGATGTTCTTAAC
TTTTTAAGTTTCAAACCTAGAAATGTTCTTAAAATGTTCTTATTTTCACC
ATTTTTTGAACATTTTATGCAATTTCTTTCCAAGAAAATGCGTGTCTAAA
GCCTTCAAATTTATTCAAAAATAATTTTTCCATCGAAGCCTCATGTTCTT
ACATAGTCTTATAAAAAAGCGTGTGGGCTACTTAGCTGACACAAAATTTC
ATAATAGCGTCTATTAAACGTCCATATATGGCTCAAATACCGCGAAATAA
ACCGCGAAATAAACGTTGGAAACAACTTTTTTTACCTGCTGGGCACTGAC
AACCACTAAAAAATTCGGTCAGTTATACTTTATGTCAAAGCTGATTAAAA
TGCCAGATTGAAAGTCAATTTCAAAAAAGGGCTCGATTCAATCCGTCGTC
CTAAATGCGGCCCCTTCAGAGCTTTAAACTCAATCAGTAAAGTGACCCGA
TTCAAAGATTTACTTCGTGTATTAAAAAACATTTAACCCCAACATTACTG
TACTCAAAAGCATAGTTTTTGTTCACAAGTCATAAACATCTGAATGTCTC
CCGAATCTTCCGTTTTTTGGCGTTAGCTTTAAATGCTTAAGCACGAAACC
CTAGGTTAAAGTTTCAAGTTGAATGTCTTTCAATTTGAACTTTCACTACC
TATGCTCTTTATAAAGTTAACGAACGCCGTAGATTTAACACACCCATTGA
GTAATTGCTAGATCTGTTTGCTTCCTCGCGTGTCTAAAGTAAAACACCTG
AGTATCTCGTAAATCAAAAAATGAGCAATCCCCTAAATACCACCTGCGCA
AAGCTAATCAAGAAAAAACTGACGCAAATAAACCATCAATATGTCATCTT
CCAAGAATCTTTCGAAAACACTGCTAACACACTCATTTACACGTTTTTTT
TTTTATAAGAACAAACTATATAAGAACATAAGGCTTCGAGGCCCAAAAAT
TTAAGAACATTCTAAGAACATACTAAGGCTTTGGAGACTTAAAAACATTT
CTTAAAATTTCTTCTTAAGAAATTACATCAAAATTCTCAAAAAATGCTGA
AAATAAGAACATTTTAAGAACATTTTTAGGCTTCAAATCCAAAAAACTAA
GAACATCCGAAGGCTTCAAAAATGTTTGACGTTCTTATAAAAAAAAAAAC
GTGTACCACAAAAGGCAAAACAAACATCTTAGAAATTGATTGATGCGTTT
GTGGCGCAATATTGACATCTATCTAAACCTTGACATTAATTAGCCTGGGG
GCAATTATGCAATTAACCTAGACGTAATCCTGCATGACGTTATCTGGAAT
TTTGTAAGCTGGGTTGAAATGAAGGTCAATGAAGCATTTTTTCCGTTACA
TTAAAGTTCATTTAAGTAACTTTTTTTTAGCCAAACCTCTCTTGGATATC
GGAAATTAACCCTTTAATTTCTCATCTAAAAGACGTGAACCAGCATTGTT
TTCAATCAAATATTTCTAAAGATGTATGTGCTGCAAAGAAAGCGCTAGCT
TGAATCTGTTATCCCGAATAAAGCGCAAATTTTAAGGCTTCTTGCTTGAG
AAAGGTTCCCCTCTTGCCCTTTGGACCAAAACTCAACACAAAAAGGACAA
CAAGCCTATTTTTTCCTGTAAAATGATTGATTCTTCTGGACATTACAGTC
CATCCTAACTATATAAGAAGAGGTAATTATCTATAATTAAGAGTATAACA
TCATATAACATCCCTAACAAAAAATCGTCNCTATAGAAAGCTGACTAACA
TTCTAAAATTAAAAAACAGTAACATTCCTAGCACAAAATCGTCATTATTT
CGCAATTCCTTCAGAATTCTCGTGGCAGCCATTTTACCACACATGTATGT
GTATGTTGTTCGATTGTATGGATTTATTACTCACGATATTCCGGTTTTAT
CGTCGGAACCCAGGTCTTGGAAATCCGATTTTGTACGGAATCAATATGGT
ATCTCATTTCATCCTTATCAATTGTAAGAAACCACATTTCCGGGATTTCC
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AGTGGTCACGTCACATGCACAATTTTGAAGAATTTCCTCCTGAGATGAAA
ATTTCTCCCTGTCCGTGTTCTTGTGACTGGTTTTACGTGATTTACAATGA
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TTGTACATTGCCTAAAGTTTACGCGGTAACGGGTATGTCCGAACCAAATT
AATTTTCATTTGAAAATTCTCCTCCTTTTTGAAGTTTTTACGATCCTTTG
AGAGACTATTTTCTTAATTTTCAAATTTCGCTCCAGATTTCGGAAATTTT
TTCATATTCCGTGATTTTGAAAACTCTTCAGAGACTCGATTGCTGTTGTA
TGGTTTTTGTACCCCTTGAGAGACTTTCGAGTGTCTAAAAAAGAAACCCA
ACTGTTTCACCATACCCGATACAATTTTTGCCTAATTACCACCTCACCCC
GGGATATTTCTCAGTAGATGTTGCTGTTTCTATAATTCAATGTTTCTCAA
AAACAGTTGAGTCATTTTAGCGGCATTTTAGTGAGTTGAGCTGCAAGGGA
AGATAACAGGTGGGTCGTAGGAGGTATTAATTTGAAAATAATTTCGCATG
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GTCTTTCGACCCACGTTTGTGTGGAACCACGGGGTTCATGCATTTCAGAT
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AGTCTGTAAAGCTTAAGGATTGGAATTGTGAAATAGGATAATGCATTGAT
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GTTCATCTAACTGGATCAGGATGTACTGAAGACAGTCTCAGTTTTAAGAA
ATATACCCCAAAATTGATGATGAAGTTAATTGATTTGGCATACATACCCA
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TGTTGAAAGTGAAAGTGGTACCCTAATGCCCCTAATGGTATCCCACTCAA
TGTGGGTCAAAACATTTTAAACGGGAATTTCATTATATTGAAATTGTCTC
ATACAGAATGGGGCTACCATTAGGGGTACTACTTTCTTGAAAACCTTAAT
AAAAAATGGTGGAAGATTTTCAAGGGATTATAGGTTCCTGGCTGCATGCT
GAATTTGGGATGCAGTGGAATATAGGCTAGAACAAATCAAAAAGTTCTAG
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GTAAGCACTTATTGGCATCATTAATTGAAATTAGCGTTCATCGAAATTAA
TTGATAGTTTAATGACCTTTAGTTACACAGTCGCAAAATATTTATCGCTC
CTATGTTTTGCAAATTAAACAAACCTAAGAATACAATAAGAACATTGTAA
GATGATTTTCCCGAAAAATGTTAAGAATATCCATGATGAATTGTAGAACC
AACATTCCTTTATAAAAAAGTATGTATTTAACCTTAAAAATCCTAACAAA
AAGAATTACGGTGGTCTGATTTTAGCTAATTCCTGGTCTCTAAGGGTCAG
TCTTCGTTAAAAATGAATATTCTAAAAGTGCATAGTTGTAGACGGATAAA
ACCTTATTAAATGTTTGAATTGAAATTCAACAAACTTTCTCTTTTGGATA
CTTTGAAAGATCACGGGCATATACAAATTAAGATACAATGTTTAAATAAA
GTTTTTTTAAAACCTATTTTTTGTTCGTTTCCTTATTTTAAAGTAGCATG
CACAAATTAATTAATACATTACAATATGTATCAAGGAACTCAACGAGGTG
GTGAGAAATTTAAAAGTTTCGTATGCCTTAATTTCGCATAATTAGTAGTA
AACGTAATAATTATGCAATATTTTACTATTGGTTAATTTTTACTTCGTTA
CGTCACTTTTATTGTTTTGATGATGATGGCAAGAATAAAAAAGAACCTAC
TTTCCTTATTTTCAAAAACTATTGTCTAATTTTCTCAATCAGGATCTTTG
AATGACGCGCTAGAATTGTTTTAATGAAGGCGCGTTTTATTGTTTTCCAT
GACATTAAGGTAAAAGGTATCATTGACAAGAGTAATGAGTAAAACAAAAA
AATTTCAGAATGTTGTGATCTGATAGGCTAATCATGAATACTTTTTTTAA
AATAGAACCAACTCTCTTTTTCTCTTTCTCAAAAAAAAAACGCTCATAAA
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ACAGTTAAGGGGAAATGCATTTACAATTCGACATAGAATTCATTTCAGCT
TTACTATTTAAACGAAGTACGCTGCGTCTAATTAAATTTGTACAGATAAT
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AATTAACTTGTCGAAAAGAGGGAGTCCGTAAAATTTTAACATCTGGTACA
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ATGATGTATTTCTTACGGCAGGTCGTGGCAATCGTCATTTCATCTTTTAT
CTTAATATTGACACAAACTACGGACAGTACGCATGCGCTACCACGACACA
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CTGGAAGCAGTAGCGTAGGGGAACCATCCCATTCACGGGAACCGACCTGG
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CAAGACTATACTTCATACTGGCATATTGACTTTTCAGGGTGTTAAATTAC
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_202 | supercontig | scaffold_202:1082182..1110230 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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