TCONS_00052327 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00052327
Unique Name	TCONS_00052327
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4443

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_213:186463..202337-

transcript sequence

>TCONS_00052327 ID=TCONS_00052327|Name=TCONS_00052327|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4443bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_213:186463..202337-

Legend: exon

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>TCONS_00052327 ID=TCONS_00052327|Name=TCONS_00052327|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15875bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_213:186463..202337- (Clytia hemisphaerica)
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AAGCCGATCCTGAGCCTCATTATTCTCAAAAAATTGTTCTTATATAAAAA
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TTTTATTTTTTATTTTGAAAGCAATCACAATACCCTTGAAATAACCACAA
TAATTCAAACGGGCCTTGTGAGAATGACAGAAGCCTAACCGTAGCTCGGT
CTTGTTCGGAGACCCATTTTGAAATTATTTTGACTCTTTTAATTCCTTTT
AGTCTTTATTGGCCCTGAAAATCATCAATTTTTGTGTATTTCAAGTTTTG
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AATTGTTTTGAAATTCTCTAATAATCTTTCTTATCCGATTTTGATTGTTC
CGTTTAGCCAGGATAATTAGTGTCGTGTAACAAATTATAAAAAACTGTAA
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TATCTTAAATCAAGGAACCTGTTTAAATCCCAGAATATGAGACTTTTTTT
TAATGCAATGCATTTTTCTTAGGATAAAGAGGAACACCATCGATTCTCAG
AAGATTTGCATCGTTACATGTTGAACAATGGAACACCGATTCTCAAGATA
CCACGTATCGGCTGTGCGCCAGGTAAGGATTGAGGAAAAGCATTTTTNAA
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TTCCTACATTTGAAATAGGTAACTTTTCGTTAGAGGATGAGCCTAAGCTT
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CAATCCACAAAATGAAGGGAAAATGAAAGCAAAAAGGCCTTTAGTCTTAT
GTAAGCAAAATCGTGGCGTAACTTAAAGGTGTAGCATAATTTGCATTGGC
ACCAAAGATAAAAGATGTCGACATCCACACTTAAATTGTTTACTGTTTGA
TGAACTTTCATTATTTTTCACAGTTCTCCTTGATCACAAATTATTTTTTC
TTTGATTTCATTTAGGATGAAGTTGTGGAAGCTAGCCGTCAAGTTGTTGT
GGAATGTTCCAAATTTGCTGCTTGGGAGTGTACATCAAAGATTTGGCATC
AAAGCTATGGGACCACTCTGTATGATGGAGTTGAAGTGGACAAGTTAAAA
GCTCTCAGTAAAAATCAACAGAAAATCATACATAGAAATGATAACTCTCT
CCGAAAAGTGAAAATTTTGAATTTCCCGCAGTACAACCGGTACAAAACAT
GCATCAAAATGCTCAATCTTGGTGTTCCGATGACTTACTTTCAGCTTTTA
GCCAGGGGTGGTTTGGACATCAAGAATTTGAACACTTTGATTTTATTTTC
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ACGTACCAGGTTGGTGAACTTAGATTTCAATTCTGATACAGATCACTTGG
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ATCAAGACAATCGACATCAAATCAAACTCTACGAAACAACCGACTCAAAT
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CGATTGAAATTCATCCGCCACCTCCTGTCAAAAGAGTGGTACTTGATCTT
CCGAAACCTGAGCCTCCTCCTGGGCGAGGCGTACGTGGGAGAGATACGAT
TTGTCATGAAAAAAGAGAATACACATTAAAGGTATTATTTTTTATTTTTT
ATTTTGAAAGCAATCACAATACCCTAGAAATAACCACAATAATTCAAACG
GGCCTTGTGAGAACGACAGAAGCCTAACCGTAGCTCGGACTTGTTCGGAG
ACCCATTTTGAAATTATGTTGACTCTTTTATTTCCTTTTGGTCTTATTTG
GCCCTGAAAATCATCAATTTTTGTGTATTTCAAGTTTTGGTGCGAATCAC
AGGGGACTGATGTTTTTTACCTAAGTATTGCGCCCAATAGATAACATTTT
TATTCACCTTGAAGTTTTTGACTGCGCTTTTTGACGATCCACCCTATTTC
TGTTTTGTATTCTAAGTGTTGTTTTTATCTCTTGAATTGTTTTGAAATTC
TCTAATAATCTTTCTTATCCGATTTTGATTGTTCCGTTTAGCCAGGATAA
TTAGTGTCGTGTAACAAATTATAAAAAACTGTAAAAACTTTCAACCGCGG
TAGAAAATTTCGTTGAAAATCCTGCCGTAAAAAATCTGAATTCAATTAGT
CATACGAAATGCTTCTTTCTTCGTTGTGAATTACTTCATTTTTCGAGGTC
TAGAGCAGCTTCTGTGTGAATATTGAAAGTCGTTTCTTGTACAAATCAAT
CAATTCGACGTGTTTGATCTTGTCTTAGCTATGAAGCAAATTTGACACCA
AACGTTTTTTGATAATCTTGTCAAATATAATTAAATGCCAAACCATTTCT
TACTGCGCACTGACTTGAATTGTCCTAGCAGCTTGAACTCAATACTTCTA
ATGATTCCAGGAGAATACCCGGTTGTCTAAAGTCGTCATTCATTCCTTAT
GTGCCATTATTGGAGGCAAGGAAATGCAAGGTATAATTTAAGAGGAAATA
GGATGTTCAGTTGATTTAAAAAAAACCTTATTTTGCGAAAAATCCTTGAA
ACCAGATGTTGTTTTTGTGTCGTCAATATTGCTATCTTAAATCAACCTGT
TTAAATACCAGAATATGAGACTTTTTTTTAATCCAATGAGTTTTTCTTAG
GATAAAGAGGAACACCATCGATTCTCAGAAGATTTGCATCGTTACATGTT
GAACAATGGAACACCGATTCTCAAGATACCACGTATCGGCTGTGCGCCAG
GTAAGGATTGAGGAAAAGCATTTTTTCGTGGTTTTCTGATTATTGCTCTG
TTGATTATTTTTTGCAAATAATGCCTTTATTATGTAATACGATAATTGAA
GTTCTGTTGTTTAGCTTCATTTAACTTCTAATGATTTTCGAAATTAGAAC
ACTTGAATAATTTTGTGTCCATTTCAGATGACGATGGATGTTAGGAAAGT
CTCAAAATTTCTTTTATCCCTGTTTGACCGATTGTCGTTTGCTAAAATAT
TTCTGGAATTCGAAATAAATGCTCAAATTATTTCAATTCCTTTTTTATTC
TTTTTCAAGTCAACCCATTGGTTTTGTACAGAGCTGTCATGGATAGAGGC
GGATTTGCACAGGTGAGATAACCATCCATGATTTATTTATCGTTTAAAAA
ACCTGTACGGGTCAACAATTAACGAAAACCGTGAACGTTTATACGTCTAA
AGTATTCAATAGTGACTTCATATATTAACCCTATTGAGACCCCTGGTATG
ACTGATACCTTTTGGAACAACCCGCAGATTTGACCAGCGTAATCGAGGAC
GGTAAAAGTGCTGATTTACTGTCGTCTTCAGTCCGTATAACTCTATCTAT
CCCTATCCGTCACAGGAAAAACGCCATACATAAACTTGAATTCTTGCAAG
GCTTATGAAAAAGTAGGTGGGAACCAATGGTGTCCCCATCGAACTTAGGA
GGATTTTTTTTCTTGTCAAGCGCTCACCCTGGGCGCTCACTTGTTGCTAT
CATCCTCGAAGGAAGTACTTATGATTTATCATTACGTTTACATAAACCCA
ATTTAAATGATTTTGTGGTCTCGATGCAATATCTAGATTTTAATTCGATT
TTCAAATCGCAATAAGTTTGGCCACTTAAACTAAACTTGAAAACGTTGGG
TCTTTCCTTTGTGACTTTCCATTGTCATCTTGTTGTCAAAATTAGAGAGT
TGATGCGTGTTGTTGTGCTTATAAATCGCTCATATTCTGATTGCGTTGAT
CTTAAGTAAGTATTCAAGCTTCATGTTTTGAACTATCGTTTAATCTGGAG
AATTTTTTAAATTATAAGATTTTTAGCATGTAGTTTTAGAAAGCTCTACG
TACTGGAAATATATACTCGCTACGTATAATCTTTCCATACAATATAAAGA
AACCCGAAAACTGTGTTTGGCCGTTTACGATAGAAAAATGACGCAACCAA
GACTTGTGTGTGTTAAAGGTTTTTCAGTGTATCATTCTTTTTTCGCAGGT
AACATTACATCGTAATTGGCGAGACGTATACGATTGTTTGGGCCATTCCA
CTATGATCACAAACGCTGCTACTGCTACAAGGAAGCTCTATGAACGGTAA
GTACCGTATTACTTCAAATAAAACGCCCGCGCCCCGGGCGTTTATTAATT
CATTTCTTTAGGAGGGGGCATCTAAAAGGAGGGAGAGTTTATTAAATAAT
CTATAATGAAGGTCACTTTTAAATGAAGTGTGAGTTCGAATCATAAGTTA
GAGATGAAAAACAGGTCAAAACCAGTTTGAATTCAAAAAGAATACAATTG
TTATCATATATCTAAAGTTTCTCTTATTATAATTCCTTACATCTACTTGT
ATCAAATAAACTCCCCTCCTGGAGGGGAGGTGTTTATTTGAGGGGGCGTT
TATTGAAAATTATCTCTCAAAAGAGGGGCGTTTAAAATTTGGGATCGTTT
ATACGAAGTAATACAGTACTAAAGCAATTGCCTATACAATCAAATCTCGT
TAATTCAAACTCTATCATACCCATTTATCTTTGATTCGAACTAAAATATT
GGTAAACATTTTCCCTCAGCTGGGAAACCGTATTCGAAAATATTTTCTAT
GTTGAATCTTTTTCTTATTCGAGGAAATGTTCCCTTTTAATCTTTAGAAT
GTTGCTTCCCTACGAGAACCACATGCGTAGTAACCCTGGGAACCCTGGGA
AAAGAATCAGTGACAAACGCGCTCACCAAGCCACCCTACCAAAATTCAGT
TCCAATGATCTTATACGACCTCGAGAACATTTTGAACACAAGAATCCTGA
GCAACAGACACACAGACAACAGCAACAACCTATCGTTATCGCACCAAAAG
TCCCGCATGTTAATAGTATGCCACAAAACGCAGTTAACAGTGCGGAAAAT
CTCTCTATTTCCTTAATGATGTCCAAACAACGTGGTCGCCCGTCTAAGAA
ATTCCGTAACCAAATCGAAAAATTACGGTCTCGTCAAACGATGCAACTCA
ACGAAGAACAGCAACACGCCCCGATGTTTGCAGGTAAAACCGCGCGCCTA
CCACCCCGCAAACAACCCTGGGTTAATGAACTTAACGTTGATATTGCTTC
GCGTCAGCACACGGAAGTGCCAATGTCTTCAAACCCCGCATTTCGCAATA
AAGATAAAGAAAGGCGGTTAAGTGATAGCTCAGATATAGAGCTTATTTCT
CCGCGTCGGGGCACGGAGATCCACTCGCCGCTTCGCCAGGGACGCCGAAT
ATACCCTTCAACTAAAGATTCAGTGGGTACCTCGTCAAGTGGAACGAACG
GGTTTGTTCCGGACGCTTTTGTATCAAATGTACACAACTCTACGGATAAA
GAGCAGCCTAATTCACAGAAAAAAGGTCAATGCGAGTTCAAAATTCAATC
AGTGCGTAGCTTAGCAACAGTTGACGAAAACAAGCCTTCATCTTCACAGC
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CGGGAAAACAACCTACTCAGAAAGCAATGTTCCGCGATGCTGGATTTTCG
ATGCGGACTTTTCGACACGATCAATCTGCAGACAACACTTCGTACAAAAT
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CGCATTTGAATAGAGGTTACCGTGAAATTCCGGGACAATATCCAGTTATT
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ATAGCCCACCAAATGGTACTCTTGTTTACGGTCGTGTGCAACCGCGCTAC
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TTAAATACATCGATCCGCCGGCACAATCAGTTCAAAAGTGGCCTGCTGGT
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TGAATAGGTCGATGAAAATGTTTTATTTAGTGCTTTGTTTGTTTGTTCAG
AATATCTCTCGTAGTTTTGATTTTTCGAAATTTTTTAATTTTTTATGTAA
TACTTTTTACTTCGCTTGAATGATCAGGAACAAATGCTTTCTCCTTCAGA
TGCTTCTATATTTCGCCTGATTGGTAGTCTGAATCGCAGACCTCTATAGA
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GTCTATATACTTAGCTTTTCAAAGTAATATTGTTGCCTGTTTGGTCGATT
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ATCATGGACATTCTTATAAAGTGTATTCTTATTTTAAAAAAGCGTGTACA
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CATAAAACCCTAAAACAATCTTTATTTTTTCCTCTTTTCAGTTTTACTAT
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GAAGCACTTTCCCTGCTCTCTTTTATTTGTCACTTGTTTTATTTTCTCAT
AATCAGTAGCATTCAATGACTAGAGAAACATTTAGTGGTATTTTAAACCT
AGATCTTGAGCTATTTTGTCACTCC

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_033089	XLOC_033089	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_213	supercontig	scaffold_213:186463..202337 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.000366677	0.596447	0.323535	1.83503e-08	0.0298052	0.00305822	0.0703535	0.00104211	6.07429e-05	4.82539e-08	4.20965e-05	0.0029753	8.37726e-06	6.7967e-06	1.22221e-06	1.64565e-06	0.000828793	1.13303e-06	1.26088	1.73423e-08	0.0241538	1.11979e-07	0.0589379	0.000759953	0.00045129	0.00125487	0.13271	0.0826633	0.00624686	1.31291

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00052327 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00052327 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00052327 (transcript) - C. hemisphaerica