TCONS_00052555 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00052555
Unique NameTCONS_00052555
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length338

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00052555 ID=TCONS_00052555|Name=TCONS_00052555|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=338bp
GGGCgattcactttcgatttcaactcTATTCTCGACTTAAGAAAGGAAAA
AGTCAGCAGCTAAAAAGACAAACAAAACTACTTGAAGATACTTGCCAATA
CTTCTTTAAATTTAGATTAATTGAAGATGTGGAAAACAGGTGTTGATGTC
AAATTAGCAAATACAGATGTTGATGATGATGACTGGGAAACAGATGCTGA
TTTTGTgAATGATGTCAGCGAAGAGCAACAAAGATGGGGTGCGAAAACTA
TTGAAGGTTCTGGAAGAATGGAGGCTTTcagTATGACTGGACTGAGGGAA
GGAGTTACCACAGATCACGAGAAAATAAAGGAAGGTCA
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_218:116755..136324+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00052555 ID=TCONS_00052555|Name=TCONS_00052555|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=19570bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_218:116755..136324+ (Clytia hemisphaerica)
GGGCgattcactttcgatttcaactcTATTCTCGACTTAAGAAAGGAAAA
AGTCAGCAGCTAAAAAGACAAACAAAACTACTTGAAGATACTTGCCAATA
CTTCTTTAAATTTAGATTAATTGAAGATGTGGAAAACAGGTGTTGATGTC
AAATTAGCAAATACAGATGTTGATGATGATGACTGGGAAACAGATGCTGA
TTTTGTggtaatcttttttcaaaacttttttgtgaaagttttttaatttt
attgtcatgaaaaacatttctgATAGACTGAAATATAGTTGTAGTTTAAA
GTACCTAATTAGGGAATTGAACTCTTCAATTGCTTATCAGATTTTTAAAA
GGTACACAGAAAATGATGTggatcattttgatggaagttgattgaatttt
gatacaaaatcttttttgattgtCAAATGATGACAGAAGTGCCGTTTATT
ATTAAAATGAGGAAACATTTGTTGCAAGTACCACTAAGATAAGTGCACCT
TCATATCTCTGAATGGAAGACAATGGAAACAGGCAAGGGTGAAAACTTGT
Gacagtcagttagtcacactagcagtcaggcacatcctggcaaatgaacg
gggtgagcatttgcatggggtatgagtaactatttatttaccatttgaaC
ACTTAAAATACATGAGACGGtatccacaaaataaaaaaggatgGAGACCG
CCTTATAGCCTGGACTAATCATAAAATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGAGATAACCCTGAGCATT
TAAAATGAGTCCAAAGTTTACAGGAATCACAAAAAATAGAGTTGCCTTCA
TTAACTGATTTAGAGCATACTGAGCAAGGATATTGTGTAGGCATAAAGTG
AAACTTACCAATCTTTATTGAGTcaaaacaaagtcaaaaaaaaaagtcaa
aaaaaagaaaaaccatgGAGAAACACCAGAATGAGCTGTGAAAGGAAACT
TTAAAACAAGAATGTAAAAAAGTACGCATGCAgtggtattcgtcacccag
tgtaaatgagataggacgtctcaggctaaaagcgtgaaaatgaataaaaa
tgaacttcaaactgaaagagggaaaaaaggaagaaaactggaaactttat
tttttcNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNtcggcgctatt
acgtcactttcattttcgaccccgttcatttgccaatggtcgcaagtgaa
aaataccccgttcatttgccaggatgtgcctgactgactaGTGTCTCGCC
AAAATGCatcatatcaaagattaatgctgcgaaagtatattgtttacttg
acacttgcaagaaaaaaaatgtgccccaaaacttctaaagggattcatga
aaaaataacccggcactTTTgaatgacattttcaaaaactatgagaaatt
gcctaaaatttgagccatagatgaaataatttaAGCCAAGTAttcaacct
tgaaaactaatttgaagatcaacttcccaagagaaaaagatctaccatca
actgctctaacttgggacgattggttgaaacatgggactggttgatatct
ggtctgtatttttacttacgttaaatctctttgactacaaatttgctttg
ataactccaccaagtttatcaatcatacttcttcggtCCTCTTAGAGTGG
GCacagacactcgcgtgtgttccactacagatttttttcatattttgata
taaaagcctactcagtgtGGCGTTACAGGAAATGACACTGTTTGtaactt
tgtttgattgattttgttGATGTGTTCAAACTGTAGAAATAAATAACAAA
GGTCTATGAGTattgtgtttataaaaaataagtctaagttcaaaaatgaa
aatgtctgAATTCAATGAAAAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATGGGCGATCT
TGATTGATTCTTCTCCTGTTAGACAATCATCGACATAAACATCTTCATTG
ACGATGCGATAAACTTCAGGATATTGATCTTGAAATAAGTAGGCAATCTG
ACGAAGTCCTCGCTCCGCCTGATTTCCGCTGGATCTGATACAATAGATTA
GTGTTTTGATCACTTTTTCCATTGGTGTCTTTGATGAGTCAAGTTCTGGG
TGCCAAATATAACGCTGATAGCACCAATGGTCTGGGTTGAGGTGGATAGT
GTTGTACATCTTGCATACATCGGTATGTATGCCAATTCTATGAGTTGACC
AGCGTAGCAGTACTTCTTGCAGCTTGTTTAGATTGTTGCTTCCTTTGGCA
AGGCAGTCGTTTAAGCTGTAACCAGATGCGGTAGGGAAGGAAGCATCAAA
TACAATACGACATGGTGTGCTGAGCGAAGTTGATTTTCAAACTGCACGCC
ATGGGATGAAGTTTTGAGTTGAGTTTGCGTGAAGTGATTGACGGATGTCT
TCTGGTAAGTTGCTGACATAATCCACAAAGCCCATGCTNCACCGATGGAT
GCTGGTAAAGATAGGATGCGGACCTCCTATCACTCCTCTACCACCGTTGA
CGTTCTTGAATGGAGATTCGTAAATTGCTAAGCCAGAATGAAGTTGATGT
ATCATCTTAGGGTGATAACGTAAATAACGCATACCGATCATGAGGTGCAC
TTCTCCTCCAACTACTGATGATGGGATGGGAAGTGTCTTTGAATCTCGAC
CAGAGGTTTGATATGATCTTTGGATGTCTTGAAATGGTTCATCGAGTGTG
TAGTGTGGGAAGACAGCAGTGATTTCTTCCATACATGTGCCAGACATTGA
TGCCATTTGACCATTGTGCATGGGTATCTTGACATTGTACGTACCATAGG
TTGAGTGAGTTGTGGTGTTACCAACACCACTGATTTCGATGGATCGAGAT
GATTCTTGAATAGCCAACGGTCCGAGGGATTTCACTGCTGAGTGCTTGAC
AATGAAATCAAAGCAGCCATTGTCGAAGAAGATTGTATATTGACGATTGT
TGATCAGGATTGATTGAAATAAGAAGATACCTTGAGGAACGTCAACATCA
TTTATTGGGTTTGATTTGAAGCAGGCATTCATGAATGACAGGCTGATCTC
CTTGGCAAATGTTGGTAGCCGCAGACTTCTAGTGCAACGTTCCTTGTACT
TCTGCAAAACATCTTTGTTGGCTTGAGTGTCCTTATGTTCTTCGCATACA
AGAACATGTTTTCTTGGGATGTCATTGTCGTGGGATTGATGTGGACAAAC
AAAATCGTGTTGGCAGCGTCCCTCTTTGTGTTTGCCAGTTGATATGTCAG
CCCCTGGATAGAGGCATTGGAAGCAGTAGCCTTTCCCTTTGAGTAGTGAA
AGACGTTTGGCTGGTGTCAGTTCCACGAATTGCTTGCAGGTGTGGTACTG
GATGAGTCGTGTTCCTTTTGGTCCAGATGTTGATANNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCCAAGGTgcaacaa
atttttgtttcatgatttataaattaaattttgtactttttatttttgtt
ttagaaatatattttgataaaagtcactttacactctgatacaagagtat
ggggagaTATGTTGGAAATaaaccttatcggagttttttatttttctaaa
atagcaATGCATTGTGANNcttaggaattcctcgagggaattctattgta
atacactcgaaacaatcccacaatgcatcgcttttttagaaaaatcaaaa
actccaataAGGTCTATTGAATGTGGTGTGGTGATGGTACTCATATGTTC
AGTACCTGCGAGAACGCAAGGTTCTCCCGTAATGTGCgagtatcatcatc
gatacaACAGCACGATtctgatgtgtcgcgagcacagagtACACAATATC
TGGTGGTAAGTgctgtgatttccctatctaggGGTAGGAAACTCTATCCC
GGGAGATAGGGCTCGGTCCGATGTAGcatgggaatccatgctatgatttc
ttcgtTGAtaatactgatggcgaaatgaataGCATAATTTGGGCTGCCAA
TTTGACAGTTGATGAATTAGCCAATGAAAGTTTGTTTTTAGTTTCTATGC
TCAAACTGCTATGTGAGTACTGCGCTTTTTCAACTGtaaaaaatgcgacc
ttatatgAGTCCAAtatcggactcacagctcgaacttgtctgtacacaaa
cccgattctacggctaatttcaaaattcattcccgctacgataatcgtga
gatacactctggtacagagatacactctggtacagagtaagcTCTGGTAc
agagatacactctggtacagagatacactctggtacagagtaagctcgaa
cccgtcttgtgtacatcaaattataaaaaaacacacgataTGGGTCTCCT
GTCtgcttttcttctctttctctcatcatttatttaaaagataaaagtta
aaaaatgaagaagaaaaaaaaaaatacagagCAAGACATTATCCCGCCCA
CTAGGGCGGGTATGTACTGGTGAGTGTGATTATTTGCGTGCCTtgcgtgc
cctcgtgggtcccgtGGGTTACGTGgctcgtgccctcgtgggttacGTGG
GTCTCGTGCcttcgtgggtccagaaaaaaattacgtgggtatctcgtggg
tccgaaaaaaatttacgtgggtatctcgtgggtccaaaaaaaaattacgt
gggtatctcgtgggtccaaaaaaaatttacgtgggtatctcgtgggtcca
aaaaattTACGTGGGTATCTTGTGGGTCCAAAAAtccactgaattttttt
tggacccacgagatacccacgtaaattttttttggacccacgagataccc
acgAAGGCACgagacccacgagggcacgagcCATGTAACCCACgagaccc
acgagggcacgaaaGGCACGCAAATAATCACACTCACCAGTACATACCCG
CCCTAGTGTACTGTGACCTGGTGACTCCATCTTGTGGCATAAGTTTGTCT
TGTCTGTCACGGTCAGTGTCACGCTCACTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACAAAGCACTGGGATCAGT
TGCATGCAAATCAATGATCGGCAGCATAGTCACGTGGGATTCTGGTAACG
GTTGCCCATTGAAAGTTGCACAAATCCTTGCTCAACCCCAATTAAAATTG
AAGAAACGTAAAGGCTTTTCTGTGCTTTNTAGTACACAAACTGCACTATT
GCTATTTCACATTCATTTGAACAGAACATTTCAACAGAGCGTTTTTTAAA
AGTTCACAAATCCTTGCTCAACCCCAATTAAAATTGAAGAAACGTAAAGG
CTTTTCTGTGCTTCGGGAATTGGCAGCACGTTTTAATCTAAGGTTATAAA
AAGTCATTAGCAATTTTTCTGATGTCAGCAATTCCTATCATTTTCTAAAG
CTAATTGCTATTGTTTCGATAAGGGCTATAAACAATTTTGTAGGAAAGAA
TGTGTGGTTCTAAACTACGTTTGCGTTAAAACTTTGTCGAAAAACATGCT
TTTTTAACagaaattgtcatttttgatgacgtcatcatttttttcggttt
ttttttgaaattttgaattttttaaatactcCTTACCATTCTCAGAGaag
ttttgcaaagtttcaaggtTGTGTCATGAGCCAATCCTGACTTATAGTGA
ACTGTTCAAAAGCCTCTGAAGTGCTCATTttcggaatttagcaaaaatac
cACCTGTCACCATTTtgtcaataactttttttgccCAAGGTGTAAAATGT
GACTCTACCCCTCATTCGAAAGCTggtaaaattatctttccaacggtata
tagaaaccttttatctgaattttttctaggttgacTCTGTTTTCGACCAA
ATTCTACAGGACTATAACACTGATGTTCAATTTCTACAAAACGACCTTGA
TGTGGTGTATCAATGGACATCATTAAACAACATGCAGCTCAATGGCTTGA
AGTTTGAACATCTTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNTTAGGAGAGCTGATTCAAATAGCATCAAAGTCATGGTCCATCA
TCGGATTtctcaaattggatgattgttgagacgaacaaagaagccttcaa
aaagtatggcatgggttgacccgggcgaaggtttgttcacttgccaagtg
aactgttgtgagtgggaatcgaaccttggtcgtctgtacaggaatcaagg
ttgatgtccactataccacaacCCCTCTTttgtgtatcaaagattaatgc
tgcgaaagcgctatatcgtttacttgacttgcaagcaaaaactatgagaa
attacctaaaatttgagccatatgtgaaaaaatttgagccaagccaacct
tgaaaactaatttgaagatcaacttcccaagaaaaagatctaccatcaac
tgctctaacttgggacgattggtcgaaacattgggactggttgatatctg
gtctgtattttcacttatatactgttaaatctctttgacaacaaatttgt
tttgataactccaccaagtttatcaatcatatttcttcgttcctcttaga
gtgcacagacactcgcgtgtgttccactacagttttttttcatattttta
tttaaaagcctactcggtgcgaaagagaaatcgtgtattttttaataact
caaatcaaatgactttggaggttccaTGAAATGGTGGCCCAATtgtcgtc
ccatgttttgtcagatagtcccaaaaatggtagagtagagctgcgagcga
aaCTGCGTACCGTGAaggtgggtaacttgcatcagtggaggctaacatgc
atagccctcaaatgaatgacctggctagtccttaaaatacaaagNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNaagcggagctgcgtagttgtattttaatgaccagccaggtca
ttcatttgagggctatgcatgttagcctccactgatgcaagttacctgat
ctcatggtagttcttttgttttgaaattttgctgctttgattggtcagtc
atttgatggctatgcaagtttccctccactgatgcaagttacctgatctc
atggtagttcttttgttttgaaattttgctgctttgattggtcagtcatt
tgatggctatgcaagtttccctccactgatgcaagttacccgacttcacg
gtatttcccggaaattttgccggacctcaaacattGACCCATTTatatgt
gcggaattatttttactttagcgtataaacaaggccttaaaaatctaagc
gctgtctcgggaattgaaggACAAaaattggttggttgatattctggctg
gTGCACATTTGTAAtcggtcattttgtctcattttagaagttttcaagtt
ttaattatttgtcttgggaacttgaactcgattcaggtaactctcatcct
tgttgttgcaaacacatcctgtagatgactgatgttgttttttctgaaag
cttgatttcctaggtTGACTAACTGTGTGAGGACCCAGCAACACTGTTAG
AACAcaacagggctgcaaataaatattttagctAGTCATTCGGACATTAG
CTATGTCAGACTGAAATCAATCCATTTGGTCAAATTCAAAATCCTCTCTG
TACTTAAGtctctttttttttatcatcattatcTTTCTGTGgaactttaa
aaaattgggaTTATTTCGGCTACTTTCGTTTGTACATCTCTGAACTTTGT
ACATAAATTCACCTCATAACAAGTCAAAagtagaagaaagaagttttttc
tGATACATTCACCAGGTAATACCGTGACATTGGGTAATTTGCATCAGTGg
caatgaatgacctgtctggtcattaaaatacaaaataaaatcaaaacaaa
aatggtagagtagagctgcaagcgtaGCTGCATAgtaattttgctgcttt
gattggtcattcatttgagggctattcaagtttccctccactgatgcaag
ttacccgacttcacggtagttgttttggagaacgcgacggcctattgaat
aattaattactccacaacagttacctagagacaagataatttatcacatt
ttattggctgagggaaacTAATGTATGTGGAGTCGCGTTCTCCAAACAGT
CAAAACAACTATAAGTTCCAGTATACTTTCATTTTTGAGAGATCCCTCTA
TAAAGAAGCAATAAACAAGCTCTCCTACAAAATAACTTTTGCTGCATGAT
TCTTTGCCTCtctaaaatctttttcattctCTCTCTCATGCTATGTTTAT
ATGAACTCTTCTTAAAAGTCACTTTTTTGCTGCATGCTTCTTCATCTCGC
TTGTTTTCCTAAAATATTTCTccttctctctctctctcctcCTTCTCAAG
TATTTCTACCAGATGAAAGTCTTACTATTAAGcttatgaaataattttat
agTGATTATTTAGTTTTTCTACTGGATTAAAAGCCTTTTTTAATCTATGG
CATTGCACGAAGGAAGAAAGTAGTTTAACATCTTTTTAGACGATCTAGGG
AAAtgtaaatgtcaaaaaattttctaggGGGGCTAGCACCCACCCCAGCT
CAAAATCTGCGCGCTACGCTCGCCAAATCACAAAACATTTCTAAAATCCT
TATTTTCAGCACTGTTGcagctatttttcaaaattttgctaaaTCAGAAA
ACTTGGAGTGCGATTAATCCAGTGACAGATCGCAATGTCATATTTTCTCA
TTTAGCAGGATATATTTTTAAACCTCAATAACAAGCCAACTTTTGAAAGT
CACACAGAAGGCTAATAGATAAGAGTGATCTTGGAACAACTTGTTACAGT
AATaaaccagacggtactaatcaaaTGTTGGATCGTGATTGAAGTAATCA
ATAGAAAGGATTGATAATGACCACCCATCTATCTTATTGGTGATGGAATA
CTCACTCCAGCTCACTCAACTCCaaattatggcattttcttctACCATTT
TCAGTTCATTCGATCATTTAGATTACTTTTCCTTTTCTCCAACCAATCAG
AGTGCCCATGAGTTTCCTGAGGAAACCCAGGGTAAACGCACACAAAATGG
CAGGGTAATTACTGAAGATCATTCTTATGGCACTGTATTTGGtcaaaatt
acaaatttttcACTAATAACTATTTTTCTAATGAGCCCTGTTTTCTACCG
TCTTAGGGGACTGAAGACCACTGAAGTGATCAATTGGTTTATCGAAAGTG
ATTAATAACAATCAATACAATCGAGTCTttgaagggttgttaagaaggtc
atcgaatactcacaatttttctgaagttttggtacttgaaattcgattgt
taatcgataagtGGTCGTTCGATTACTTCaatcattatcgattacttcga
taatcgaatttatTGATTAATACTGTTTGGAATAGAGAAAGCGATTCAAT
AAAAGTTATCTTAGAagcactcttaaaagttacgaagaaagcaattCAAT
AAATGTGATCTTAGAAGCACTCTtaaaaagttatgaagaaagcaaTTCAA
TAATTTTGATCTCCCTATCCCTGAATAGGTAATTATCCTGAGATAGGTCC
CATGCTGTCCGCATCAGCTGGATCAGCATAATGATTTGTTATCTTTGTTT
AAACAATGATgtgtaatttgaaatttccctacTTGGTGATTAATGAGGTA
AATTCTGAAGTAATTAATATTTTCAATCAAAGTTTAAGGAAATGTGAGCC
AATAAATAGTTATataagaaagaaattcaaagaatttctgtccaactatc
ttctttcaggagattttggTGGTATATACATAATTGAAAAAGATTACTCA
GATTTCAAACTATAAAACATGTTAGCCAATCATCTGATGGAGAGAACTCA
ATTCTATTGACCTTGTTTTCTTTAGAATGATGTCAGCGAAGAGCAACAAA
GATGGGGTGCGAAAACTATTGAAGGTTCTGGAAGAATGGAGGCTTTcagg
taaattattttttatatgaATTTCCGTAGATCATCATTATGATGATATTT
TCTATGAAAAAGGAAAtaagtaattatttttattgtcttttaaaAATCCT
CTTTTACTTTCAGTATGACTGGACTGAGGGAAGGAGTTACCACAGATCAC
GAGAAAATAAAGGAAGGTCA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_033236XLOC_033236Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00052555-exon-scaffold_218-1491911889:116755..116961TCONS_00052555-exon-scaffold_218-1491911889:116755..116961Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00052555-exon-scaffold_218-1510915933:116755..116961TCONS_00052555-exon-scaffold_218-1510915933:116755..116961Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00052555-exon-scaffold_218-1575043694:116755..116961TCONS_00052555-exon-scaffold_218-1575043694:116755..116961Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00052555-exon-scaffold_218-1491911889:136080..136153TCONS_00052555-exon-scaffold_218-1491911889:136080..136153Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00052555-exon-scaffold_218-1510915933:136080..136153TCONS_00052555-exon-scaffold_218-1510915933:136080..136153Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00052555-exon-scaffold_218-1575043694:136080..136153TCONS_00052555-exon-scaffold_218-1575043694:136080..136153Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00052555-exon-scaffold_218-1491911889:136268..136324TCONS_00052555-exon-scaffold_218-1491911889:136268..136324Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00052555-exon-scaffold_218-1510915933:136268..136324TCONS_00052555-exon-scaffold_218-1510915933:136268..136324Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00052555-exon-scaffold_218-1575043694:136268..136324TCONS_00052555-exon-scaffold_218-1575043694:136268..136324Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_218supercontigscaffold_218:116755..136324 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
199.113	205.967	239.77	224.22	280.384	213.064	315.04	360.809	174.742	183.146	139.037	126.381	126.388	137.714	144.14	171.611	152.364	160.824	124.249	166.117	140.131	115.95	96.4913	99.7652	164.173	182.624	139.906	92.9675	163.308	136.218
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00052555 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top