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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00052583 ID=TCONS_00052583|Name=TCONS_00052583|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2067bp
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GAATTCTTCAATTCTCA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_218:417295..434873+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00052583 ID=TCONS_00052583|Name=TCONS_00052583|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17579bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_218:417295..434873+ (Clytia hemisphaerica)
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GGCTTTATTCTAACTAGTCAATCATCTAGATTGACAGACCTTTATAAAAT
AAGTAGCTTGGTAATACGATTGCTCAAATGCTATTAAACTCATTTAGAAA
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AGATCATTaacattttctatttttgaatgaTACGATGACACGAATGCCCA
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AGACATGACAGCAGTTTTCTATATTTGGttaattttggctaatttaacAA
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TTTTTTGAAACCTTCTGCTTCAAATTGCATTGCTATTTTCAAGGCAAAAT
TGAGGTCTCTAGGCTTATGTTCATCTCTTATCACTTTGACTCTTTATTTT
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CTAATGAGCTCTTACGCTCTAACCATCCAAATActctaaaaactttttca
atcaaatccATTCTTAAAGTGTACTATGACGAGCGCGAACTTTTATTATA
AGTTAAAAAGTTACCGAAATCGGAAGCTTTTAGTATTGATTTATGTAGAA
TACAATCTCAACTCTTTCAAGGGCATATCACGAAAGTTTGTAATATATAT
TGATATGTAACTACTACAGACGAGTGTCTAACACTCGGACATAACTCATA
ACTCAAAAGACAGATTGCCACGGGAGAGTGGTTTTAATGTATTCAACGAA
TATATTGAGCATTTGCAAGAATAAGCATCAGCGAAAAGCGGATACATGGT
TTGCTAATCTATTTTTAACGCTCCTTCCTTCTAATTCTTCTAATTCGATA
AAATTTGTCCCCTCGATATATCCAGAAACTTAAAATTCACCAATGGTTAT
TTTCCCTCTACCATTACAGATGGATATCAACCTCTTGACAATCAACTTCA
TCTTGATACTGACAACACTTTCAATCACCACACAAACCGTTCAAGCTGGT
GAACAAAAAGGACCTGGCGTACGACACATTTGCGGCAAAGACTTCATCAG
AACCTGGCAAATCCTCTGCAAAATCAAACAACTTAAACGTAACCGTGGTA
GGAAAAGACGTTCTCTTCTTGACGGTAAGTGCTTGATTTATACTTTATTC
TAAACacgtcttttttctttattacttTGAATTTGTGTAGTTTACGTAGC
TAAGCTAAATacaagaaatcaaaatttctgtCCGGAAAACTCTGGCTCTC
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CCAATTTTGTTGTTTGAGTCTATTGCNAAAACTCTGGCTCTCAGGGTTAA
AACTCTTACTTTGATCCAGGGCTACAAAACGGTCTTTCTATGCCAATTTT
GTTGTTTGAGTCTATTGCTCCTAAATTCATCTTTAAGTTCCGACCAAAAA
CTTTTCCTGTGGGAGACAAGCGTGTACGTTTCTTCTTTTGACCACGTGAT
TTATCCTTTCAGATGGCGTTGTTAAAATCAAATCAGCACACGACTTATTG
GACAGCAGAACTGCTAGATCATTTTTAAAAGCTTCCTTATCGGTAAGGAG
TAAACGTTCGATTTACAGTCGAGTGAACACATTAAATGCTTCCGAGGAAT
GTTGCATGGAAGGATGTCGTCTTTCCGAAATCAATGAATACGATTGCTAA
AACATCATGTTTCAGTTGACAGGACTGTATTCATTCAAACTTTAACGGTT
CTAGTATGATCAAAAGAGTCCAGAAAACTCAAAAGCTGGAACAGGTCTTT
TGAAATGGAAATCATGCCATATGATAGGAGGAAATAAGCCTTCGATTGGC
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TTATCATGATGAAAACTCGATACCTATATTTAAATACGTTATCCAAACCT
TTAGTGTAATATCTGACAATATACAGTTTAGTTATAGGTATGCTTTTAGA
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TCTTCGcaagatttttatcaaaaccTATTACCATTAGTGTTTTAAGCCCT
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CAAACTGCCAAGAAAAAGATTCCTTGATGCAATGTTTATGCGAATATTCA
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TGTATAGTCCCCATTTAATCACATTTATCcatttaaatttcttataacca
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GCAGCCAATGAAATGCCTGATGACCCATGCAGTatgtatttttagatttt
acaaTAGGATGCTTTAAGTATATTCGGTATGCAGAATAAAGTAACATAAT
ACAACAACATTTGAATTCTTCAATTCTCA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00052583-exon-scaffold_218-1491911889:417295..417689 | TCONS_00052583-exon-scaffold_218-1491911889:417295..417689 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052583-exon-scaffold_218-1510915933:417295..417689 | TCONS_00052583-exon-scaffold_218-1510915933:417295..417689 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052583-exon-scaffold_218-1575043694:417295..417689 | TCONS_00052583-exon-scaffold_218-1575043694:417295..417689 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052583-exon-scaffold_218-1491911889:432814..433018 | TCONS_00052583-exon-scaffold_218-1491911889:432814..433018 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052583-exon-scaffold_218-1510915933:432814..433018 | TCONS_00052583-exon-scaffold_218-1510915933:432814..433018 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052583-exon-scaffold_218-1575043694:432814..433018 | TCONS_00052583-exon-scaffold_218-1575043694:432814..433018 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052583-exon-scaffold_218-1491911889:433407..434873 | TCONS_00052583-exon-scaffold_218-1491911889:433407..434873 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052583-exon-scaffold_218-1510915933:433407..434873 | TCONS_00052583-exon-scaffold_218-1510915933:433407..434873 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052583-exon-scaffold_218-1575043694:433407..434873 | TCONS_00052583-exon-scaffold_218-1575043694:433407..434873 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_218 | supercontig | scaffold_218:417295..434873 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
