TCONS_00053957 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00053957
Unique Name	TCONS_00053957
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4572

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_237:130750..157414-

transcript sequence

>TCONS_00053957 ID=TCONS_00053957|Name=TCONS_00053957|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4572bp
TTTTTAGTGTTGGACAAACGTGCACGAGATTGTCATTAAAAgagattatt
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attttatttgcatttattagtaaaaaaaaggtttttttatattAAATGGA
AACATCAATTTCTTCatattta

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_237:130750..157414-

Legend: exon

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>TCONS_00053957 ID=TCONS_00053957|Name=TCONS_00053957|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=26665bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_237:130750..157414- (Clytia hemisphaerica)
TTTTTAGTGTTGGACAAACGTGCACGAGATTGTCATTAAAAGAGATTATT
TATTTTTGTTTGTGTCCATTATATTATATCAGAAACATACAGGATGTTAC
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TATTTATTTTTGTTTGTGTCCATTATATNCTCTGAAGTCCTCCTGTTTTT
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TATATCCAAGTTTACTACGAGAATTCTGCAATTGTAATGTTAGAAAGCTG
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GCTATGAAATTTAGATCCAAGTGTACTACGACAATTCTGCAATTGTAATG
TTAGAAAGCTATGAAAATTATATCCAAGTGTACTACGACAATTCTGCAAT
TGTAATGTTAGAAAGCTGTGAAAATTATATCCAAGTGTACTACGACAATT
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AATACATTGTTATGATGTTTTTTACTCCGATAGGACATGTTTAGAATATT
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CAGGCGATACACATTTTTTTTAATAAGAACAAACTATATAAGAACATAAG
GCTTCGATGACCAAAATGTTAAGAACAAGTTAAAAACATTTTAAGACTTC
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GTCTAAATAAATTTGAGATTTTAGGTCACGTAACAAACACTGCTGTGGAA
CGAGGAAATTGAGTGATTATCAGTGATTGACATCATTTTAAAATGAGAAA
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AATGGAGTTTTATGCTGACTGAGACTTTCTCTATCTTATTGATTTCAATG
GTTTTAGCCTTGAAATTTAAAACGATACTTTATGAGGTAAATTTTCACGG
GGATTGAATTTCGCCGATTTTGCGGATTTTGAGGTCATCGGCGAAATTAA
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CAAAGTCTTATTTCTGGTAAAAGAAAGATTAATTTTTAGGTTAAAGCGTT
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TTAGGGAGGAATTTATCAATGCAGTCACTGGGAAATCAAGCAATACAGAA
TGTGTCATATCAAATGCAGATCAAAAAGGCAAAATGAGAAGGATTGATTG
TTTAAGACAAGCTGATAAAGTATGGAGGTAAGACACTGCTCATTTGCTGA
TTATCATTGTGTGTTAATTGTGGTTGCACTAAAATAGTCTATACATATTT
CGATAGAATGATTTTGGAGTAATATCTCGTAAACTTGCTTCTCGATATAA
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ATTTAGATTTATCGGGAATTTTTAAAAGCTCCACGTGGGCCAAAAGATTA
TATCACCCGATCGATTAAAAATTTAGATGTTTTAAGTAGGGGGTAGATAA
ATATAGATCATTGCTGCTTGATTGATTGATTCGAAGCGAGTTTTGAGCAA
TATTCATTAATTTTATGTAATTGATTACGGAAATTGATTTTATTTATAAC
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TTTGGTTGCTAATTTAATTTTTTACCAGTTTATTACCTTCATCTTTAACA
ATCGAATCCAACGCAAACGAATTACCAAAGGGGTAAAACTAATGCTTATT
CATCTCAATGGCATTTAGATTTTTACATAAATCAGAAATCAGATGAAAGA
ATATCTCAAAAATCGCCCTAACAATCTTAAAACTCTTTTTCTTAAAATAA
AAAAGACTAGCTCCTTATCATCTTAATTTTCTCTCTCCTCTAGACTGGAT
CTGGTTATGATGATTTTATTCCACGCTACACCATTAGAAAGCACGGATGG
AGAAAGACTGGGAAAAATACCAAGATGTAAACATAAAATATTATGTGTTA
ATCCAGCTCATATATGTATAGTCGCTAAAGAATTGGACCTGTTTTTATCA
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TTCTGCAACTGGTGATAATTGCATGTGTCAGCATTAAAAAGGGTTTTATT
TGTAGCATCGAAGATCAAGATTAATAATGAGGAAATTGGAATTTTGGCGG
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ACATTCGGTAACAAATTTTCTGTGTATATAAAGAACAGCAAAGTATACTG
AATATTTGTCACACTCACAGAGAAAGTTTATGACAAATTCCGTCGAGTAC
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ATCGCGATTGCCGATTTCTTAACATCTGCACTATTCTTTATAAGAGCAAA
CTATATAAGAACGTAAGGCTTTGATAGCCAAAATATCTGGAAGACCCAAT
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AGGCGTCAAGAAAATTTTCAGGCTTAAGATTCAGAAAGTTAGGACCATCC
AAAGGCTTATAAAAACGTTTTGATATTCCTATTAAAAAAACATGTACAGG
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ATGAGTTATTTTTATCAAGAAATGGGAGTAGACTTATAATTTGCTTACCT
AAAAACTACCAATTACTGCGTAAAAAAAGTTTTGATTTGTCTTAATAAGT
GTAATTGTCTTAAACTCTTGAATTTAACTCGAATACCCAGGACATGTCAA
TTATTCTAATAGCTAGAGTTACCAATAGGTTACCAAGATTATATACTCCC
TTTTAATTCAAAATCTCATTATGCAGAGCAAGAATCTCCATTTAAAGGCG
AAAGCGCAAGATATGACACTATATCTCTTTATGATTAAGAATAATTCTTA
TGGGTAAAGACGAGTTTAGGTAAATTTAAATCAAAATCAATGGCATCAAA
TAAACTATGAAGCCACAAAAATAAGGTGGGGCACTTGTCATTTTTTTCTA
CATCTCACAAAATAAACTTGCACAAAAACATTAAGTGTCTCGTCTTATTG
TTTTTAGCAAGTCCGTAAAAATAACATCCTCTTCAATGTCTCCGTCAGAA
CTTTCTTGTGGTACGTGATGATATGACGTCATCATTCATATTCGAGCATT
TGGTAAAAAGAATTGTTGCTATTTTTGTGTGAAAAGTCAAGTCCTTTAAA
TGGAAAATGATGTGTTCACCAAATTTTTAAATTTCTGTCAGAGAAGATTT
CTTTTCTAAAATCTAATTTTTACGTATAAGATATAGGAATTTTCGAAGGC
AAAATTCGGGCTTAAATTTTTTAACAAGAAAAAAAATTGAAAGGTTGCTT
GACTAATTGACTAATTAAGCTAAAAGTTTGTTACATGTATAGGAATCGTT
GTGAAAACAATGAGTTGTTTTTGTTTTTTTGCTTAAAATTTGTTGACTTG
TTTTTTTGGACTTTCCGTCAATAACAGACTCAAAAAAATAACAAACAAAA
TGAGATTCACACACCAATTTTAACCAAAACAAAAACAAAGAGAATCCTTT
TTTCGATTCAGTACTTTCTGTTGTGAAATTTGAACCAAAAATTGTTTGTT
GCTTATTTGTACAATAGTTGACAAAATGCATGTTTGCACTAACTCCTCAA
AAATCACCTAAGAAAATCCAAAGTTTTTAAGCCTTCGGATGTTCTTAACC
TTTTGAAATTTCAGCATTAAAATGTTCTTACTTTCACCATATAAGTATTG
TATAAGTATTTTTTGCAATCTGCTAAGAAATTAAGTTTTTTAAACCCTTA
CAATGATACTCTTAACTTGTTTTTAATATTTTGGACATCGAATCCATGTT
CTTATAGAGTAAAAATGATATCAAAAAATCTTTCAATGTGAAGTTCCGAA
TCAAATACCATATTGTTGATTTTAGAACATCCAGTACTCTCAAGTGTAAA
CATAAGTGCTGACTCTCTCAGAATCTCTTGATAAACAATATAAAGTTGCT
CTCTCTAGCTCTCTCCTAATGTAAACAATTCTACACTTGCAAATTTGAAG
TCAATAAAAATAGAACCTCTCGTTAGAACTTAAACATTTTTAAACAATGG
TTATTGCGTAAATTAGCCCATTAAATGTAAACATTAGGGACCCTTTTTTA
GACCTAACATAAACAAAATGGTAGCACTGTCTTGGAGACTCAAAAGAGAA
CACGTCCCTCTCGGACCCTCAACAGTACTATTTACTTTAAGGTCAAAAGA
CAAACAAAATCAACTCCATGCTCTTACTTTTACAAAGCAAGAAGTCACTT
AACAATTGAAAGTTTTTGATATTTTCCCTAAAATTTTTGAGCCTCTGCGA
CCCCCTCAAAAAAGGCGACAGTGAACTTATAGATAATCCTCTATTGTCAA
CAATGATATGTTGAAATAATGTAAAATGTATAAAATAACTTTCATTTCAT
TTAATTGTTTGTATATGAATTTTGTGCCAATTTTTCATGTTATTTTCAAA
GAATTTGTTGGCAACTTTTAGCATAGGTACAAACTTGTGTAATTATAGAA
AGAGTCTGGGTACTTAATACGATGTCCAGTAAGATAACCGTCCTATGAGA
TAAACTTAAGCTATGATAAAAATGTACAGAAGATTATGAAGTTGATAAAA
TTTCTTAAGTTCAAGGCAAATTGGTATAGGAAAAAATCCTGAATCATACA
AGGTCTTTCATCGATATTTACAGTAAAACATGTTCGAAATTGCAATGTTT
GAGGTCGAAAATCAATTACGGCTCATTATAATTAGGATTCTGCATCAATT
AAAAAAGAGAACATTAATTAAACAGAGGCAAGTGATTGAAATTATTGACA
TGCCATACCTAATCCATTGACGTCATAGGGTCATTAAGGCTATTCACCCA
TTTTTATAATATTAATTCTCCTTTAAATCGGTGTTATTTTTATATAAGAA
CAAAATGGAATACAGGCTTTTTCCAAGCACCGAACGTGTTCCAATACTTA
ATTCCCAAAGGTCAAACCAGTTAATTTAAAGTAACATTTCAAATAAATTT
GCAAGGNGTTAATTCCCAAAGGTCAAACCAGTCAATTTAATGTAACATTT
CAATTAAATTTGCCATGTCTTTGCCATTGACTATAAAACTACTTTTGCCG
GCCAAAGAAGCTGATTTAATTGCTTTTGGATGAGTGTTCTTCTTAAGGAA
TTGACCATATAACTAACCTGCAAAGGAAATATAAAGTCTAGAAAGACTTG
ATTAAGGCTCTAAATACAAGATTTTAGTTACCAAGGTTGCGTTACTTTAG
CCATCTTGCATCTCGCTGTGCAGGTTGCACAAAAATGAGTAGTGCAATAA
TCGAGTTTCCGAAATGCCTACCCTCCTTTTGAGCTCAATTCCTTAACTTT
TAAATGATGTTCATCTTGAGTAAGATTTGAAGGGTAAAAAAGGATTTCCT
TAATGAACCCTTAATCGCACTGGAATTCACGTGCTTATCAATTACTTATC
ATCCGCTCAGCCTTCAAACACCTGTTATGTTTATTGTGCTGTGCGAGTTT
GTAAAAGTTTGTTTTACCCATGCCATATCTCATCTCTAGGGTTTTTGTTA
CTTAAAGGCTTTGTGGAACAAAGAAAGTTTTGCTTCTTTCTGACCACTTT
TTCAACATTTTTCTTTTTATTTTTCTTATAGAAGTCGTTGGAGAACAACC
CAATATATTAACAACTGGCGTGTTTGAGCGTAAAGAACTAGAAAGATATT
CCAGAGGTATGAATTCTTGTTCCTTTGCCAGTATAACTACGCCATAATAG
GATTTTTCCATATGCCCATGCCTCTAATTTGGTGTCATTCTCTTTGCTAC
TGTAAGGTCAATGTCTTTTTACATATAGTGGGGAGGTCTTAAAAATCATT
TTTTAACTACCAGCTACATTCAAACCTAGCCGAGATTCAAAATATCTAAA
TACTCAAATCAATAGCTGAAATCTTAGCAGCATTATAAACCTGCTAAGTC
ATATTGGATTGAGCTGGATTTGTTTTATTACTATAGTAACGAGCACATGA
TTCCACTTTCAGTTTCATGATTAGAAGGCGCTTTTTTTACAAAAAGGATT
CCTATTGACCAGTAGTTTGTGATTGACGTCAATACAACCATGCCAATTTT
TAATCGCCTAAACACACATTTTTTTACAAAAAGACAAACTATAGTAATAT
ACTCAATTGCAAGCTATAAATAACTTTTGAGGACTAGATCTGTCTCGGAG
ATTTTACCTTGCATGTATACTGGGATCTTTAGAATCTCAAAGATTTTTTT
GCTGATAAATAAAGGAAAAAAGCACTTGTTAATTTATTTCTACTTTCACT
GATACATTTGATTTAAAATTTTCCTTTGAAATTCAATATAAACCAGTAAA
TTATATGGTGAAAAAAAGTAAAAGGAAATATCAAATAACTTCTTCCTTTT
CAACTGATTTTAATCCATTTAAGTCTCCTTTTTGACAAGTGATGACCTAA
TTTTGATAAAAACTAATGTTTTTTTTTCTCGTAACAATTTGAAATAAGAA
CAGATTGAAAGTCAATCGGTTTTAAAATGATTCATGTTTTTATAACTATT
GCTTAAATTGCCGACAATCAGTTCATCTCACAACCAATAAAAATCGCTAA
AATCACCTTAGATATAGTCACATCAAAATCCCACCACGACACCCTAATGT
TTTTTCGAAGTCACACCATCACGTTACACGCTTTTTTTTATATAAGAATA
CACTTTATAAGAATGTCCATGATGAAAATGGCCAAAAAATTAAGAATATT
GTAAGAATATCACCATCATGGAATTTAGCAACTGAACCTAAAAATGCCAT
TTTTAAAGCATTTTAACCTGTAGATTGCCAATTTCGATCTTAACCTAAGA
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TGAAACAACGTTGTGCACGAGCTGGGTTGACAAGATAAGGCAACCTAATA
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


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The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


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Expression

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00053957 vs. Swiss-Prot (Human)
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The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00053957 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00053957 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
NFIC	1.521e-73	53.85	Nuclear factor 1 C-type OS=Homo sapiens GN=NFIC PE...	[more]

You are here

TCONS_00053957 (transcript) - C. hemisphaerica