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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00057383 ID=TCONS_00057383|Name=TCONS_00057383|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2543bp
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aacaaaaagaaaaagaaaggattAAACAAAACATTTGATTTCT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_288:544276..559950- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00057383 ID=TCONS_00057383|Name=TCONS_00057383|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15675bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_288:544276..559950- (Clytia hemisphaerica)
CGGCAAATCTGAAATTTTAGAGCATCGAGCGCAAGTTCTAAAATTTTCGT
CAAAAAGTGCAAAGACCCAGACCAATCGACTCATGATCTTCATGTTGCTC
TACTTTTTGTAAGAATTTGCTTTATGTCTCATATTTAGTTGATTTCTTAA
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TGCAAAATTTAAGAAGTATATATGACTGGAAAATTTCTTTTTTTTCTTTT
TTGACACATTTTTCGAATTTTTCCAAGCTATTTTCCTAACCTTTTTTTTG
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TCCCAAACATTGAAGAAGCCTCTACTAATTAAAGTACATGAGATAAGATA
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AAGACGTGCTTTTCTCGCCGCCATCTTGTATTAGAATGAGAATTATTTTC
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GCTGAACCTGCTTTCAAAAAACGTTTCGCAAACCACTGCTACGAAAAAGA
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GCCGTCACTTGAACAAGTTCACTTTAAAAGTTCACGACACCAAGGACTAA
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GTTGGACGCTGGTTGGTCAGGTTGATTAAATTTAATTTTCTTCTACTTTT
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TTGTTTTCTCATTATTGTTTTCTGTTAAACATTAAATCTTTTTTCCTTTA
AACGTTCCTTCAGCCATATCTGAGTGCCATCATCAGTAAAAAACTTTAAA
AAACTAGCTAAAACTCAATTTTGTTCTTTTTATACGATTTACAATGTTTC
TTTTAGTATTTTTTGGCTTTAATTATGATGCATACATGGTTTTAGGAATT
CTATAGATAGGCTTGTTATGTGCAAAATTTCATTTTTTATTTTAGAATTT
CATTTTTATTAAATTGTTACTTGTTACTTGTATAGGTGTCATGCAAAGTT
CTCAGGTAAGGTTCTTGATGAAGAAACACATCCTCTGTATGATCAAGAGA
AAAAAGAATCTCAACAGGTACTCTTCATGTCATTGATTTTAATTAACTGC
ACCCAGTATATCCATGAAGTTGGGGACCTGGATAGACAACACTGGTTGAG
AGTGATAGGCATTTTTGAAAATATTTTTAAGCTTCTTAAATGCTCTTTGG
ATTTGAGTTGAATAGTTTTGCATGTAACACAGCAATAATGCAGCCCCTAA
GCTTTGATGTTGGATTCTTGGAGATAGATAGTTGGCACAGCTGCCTAGCC
GGGGATTTTCATATTCAATTCACGTTAGGCACTATTACTTTTATCACTTA
CAAACATAGATTATGTAATAGCGTTTCCTTCTCCTTTAAAGGAATAGATT
TTGAGACACTCAAAACTGTTTTAGGTGTCTTTTATCCACCTTGGGAAGTG
TTTTTGAATGTCTTCAAATTTCTGAATAAGACCAACAGTATTTGGACTTC
ATAAACGATTGTATAGTTACACATTCTAATGATCGCAATGAAAATGTTTT
CAAATTTTTTGCCTTTTCAATGGTTGAAATTTTTTGTTCTCTAAATAAGA
GATCAAGATCTGCTTATTTATTTTTTAACCATTTGGACTGGTCTAGATTG
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TCAGTTTTGCCAAAAACTAGGTTTTTTAAAGGATCGGTTTATTCTCAATA
AGCTCCCAGTGTATTGATGACTAGATTGGAAAAAGTCTTTTTGCTTGTGA
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TGTTTCCGGAAACACTACATCTTTTTATTTTCGCTCTATATAGAATGTTG
TCTGTACAAGTGCTTCGTCACCCTCACTCTGTACAATGTTATCTTTGTTA
GGAATATTTGTACAACTTTTAGCAACTTCTGTTATATCTGCAAAATGCAT
AAACTGCAAGTTCTGGGACGTGTCTTTTAACCTTTATACCGAGTTTATGT
ATGTTTAACCTTTCTTAAAATCACATGAAATTTGTCCAAAATTTGCGGGT
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ACTTGTCCAAAATCGAAAAAAAAAATAATATTGAATTTGCAAAACTGGAA
GATTGTCTTTATAAGTTTTTTTAGGATATTTTTAACTGGACAAGTTGAAA
AAGTGTAAATTTATCCCAAACAAAACTTGGACGAATTTAAAATATGACAT
TGAAAGTCACTCATCCATTAAGAGGAAAAACTATACTCCTTCAATTTTTT
GAGATCTTGACCTTCTGACCCTATTTTTTAAGAAATTAATTTTTATTGTA
TATACCGATTGACCAACCACTACGTTTTTGAAGGTCGTCCTGTAGAACAA
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TGTGTTATTAGTGTTTATTGTACAAAGAACAATCTTTTTTTAGTTGGGTT
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TTTGTTTTAATTTGTTCACTTTTGAATTGTCATTCATAAAAATGTCATGT
TTAGCTAAAAACAAAGGAAAAATGTGTCAAAAAATTGCAGAATTTATGGA
TCTCAGTTGTAAGGCTTTTTCCAAGCAAAATTTTGTTAGAAAGCTCAATT
TTTCTCAAAATTCAACATGCAAGCAGAACATATTTTTTCAAAAACTTCAT
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GCATTTTGTAAAAAATGATTTTTGAAGCCATCAAGAATAAAAGTGGCCCT
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TTCTTTTACATCAGTTTAAGGACTTCTACTTTGGACCAAATAAATTCTAC
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TTTTATTTTACTAATTTTGTACCTAAAATGCCTTAAAATGAGGAGTTAAA
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TCCCTGATTTGCCATTGTGATGAGAAAAAGTGAATTTATAAACTTTATAA
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GTTTATAGTTTCCGTCCAGATTCACCAAAGGCAGTTGCAACGCTGATTTT
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CATTTATTTTCATACTTCCTCCTGTTTCAACCTTTATAAATGTACAAGCA
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CTGCTTCACTTTGAAGCTGAACATTTCTTATACTTACATACGGAAGAAGA
AGACATACAGTACAGTAGACGGTTCACTTTGCTAAATCGAAAAACAATAT
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TTTTTATTTTATGGTAGTTTTTTTTTTAATTATGTCTAACTCTACTCAGA
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CCTTGTTTTTTTCTTTATTTGGAGAAAAATATTTTATTTCTATTGAATAT
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GGAAGCAAGTGAAGAATGATTTTTCTTTTAAGTATGTATATTTTAACAGT
CCATTATTCAATTTGTATTGGCGTTTTCTTTTCGTTTACTCTGTTTTAAT
ACGTATTAAAAGTAACTCGGTTTGTTTTCGAACAGCCTTTATGTTTCCAG
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CGTGTTGCCTGCTTTTGGTCGTACTTTATTACTCTTAAATTTTGGTCATA
TCTCTTTACCTTAAAGTATTTTAGTAACCCATTAAATTTAGATTAGTGTT
TGATTGTAGGGACGATATATTTTTGATATACGATAACATTTTCAGAAGTA
TTTTCTGTTTGAAAGTTTTTCTGAAGTTGAACCAATCAATTTTGATATCA
ATAGTTCTTATTAGACTTTAGATCACCAAGAAAACTCCGATTATGATATA
ATGTTCGAATGCTAATTGATTATATTTGATAAGTATTATTGGAAGATTGT
ATTTTAAGGAGAATGAATGGTAGGGGATAAATCTCGCCATATTTGTGTTC
TTATTATTAATCCTACTTTATTCCAATAATTATTTCACTCTTTTAAAGGG
TTCGACTCACTTTATTATTTTCTACAGCATGTGCAAATGATTATTATTAT
TGTGGGAAAAGATTTTGAAGTTTTTATTTTATGGGAAAGGGTTTGAAAGT
TAATCCACTCTTACACTACTAGAGTGAAAATGTTTTTCTCATATTTTCAT
TTAGTGATTGAAGTAGATTTTTAAAGCTTGCCAATGTTTTGTAGGGTCCA
AGAGCAGGTAAAAGTCTTGTACAAACATCAGGTCAATAAAGGGTTGTTCG
TGCTTCTCACTTCGGCTTACTCTACATTTTCGTTTTCTTTTTTATGTTTT
TGTTTTTGTGTGTTTTCTCTCATTTAGACATTCTGTCCGTCTAGTATTGA
TCATTTGAAGTCATTTAATTTGTGTAGCTATCAATCAATATCAGTCAGTT
ACTCTAGTGTCAAAGTGCTGAACACCCCAGAACAATTTAACATTTCTTGT
GTTGACATAATATGCTCTGCCACTTGTTTTTATGGAATCAGAAAACAGGA
ATAGAAGGGATTTTTCATGTACCTTAAAAAAAACTGTTATTTGTAATATC
TTTTTCCACTGATGAATTTATTGAGAAAAACGGTGGTATAGAAAAATGCT
GGGAGAAATCGTGGTCGTGATTCCCGACGTGTCCAATTATCCAAATATGT
TCAATCTCCTCAAATCTTGATATATTATAACTCTTTTATTTTAGCAATCA
GAACAAAAGAAAGATCTAAAAGAAGTCGAAGACAAACTCGGGGACGTTCG
ATTGAAAACACCTGACGATAAAAACAACAACACCCCCGGTGGTAACCAGG
GCAACAAGAAAACCATGGAAACAGAAAATGGCGACGACAACAAGTACAAC
TGTCTCGGAAACTTCGAAATCCAAAAACGTATAGGAAAAGGTCAATTTTC
TGAAGTCTTTCGTGCACGCTGCTTGATCGATAACAGTATTGTAGCGCTGA
AGAAGGTGCAAATCTTTGAAATGATGGATCTAAAGGCGAGGAATGATTGC
ATCAAAGAAATTGATTTGCTCAAATCCTTAAATCATCCCAACGTTATTAA
ATATTTGGCCTCATTTGTGGAAAACAACGAACTGAACATTGTGTTAGAAT
TAGCCGATGCTGGCGATCTATCCAAAATGATTAAACACTTTAAAAAACAG
AAACGTTTGATCCCAGAGAAAACCATCTGGAAATATTTCGTCCAGATCAC
AGCAGCTCTCCAGCACATGCACATCAAAAGAATCATGCATCGAGATATTA
AGCCTGCCAATGTCTTTATAACTGCTAGCGGTATTGTCAAGTTGGGTGAT
TTGGGTCTTGGACGTTATTTCAGCTCACAAACGATAGCTGCACATTCTTT
AGTCGGTAAGAATCAGCCTTTTTCACGTAAACATGATCTTATATCACCTA
TGAACATTACAAAACATATTTTATGGGGCATGGGGGGAAATCTTTTATAG
AGATACGCTTGGGGATCGACGAGCCTTTTCGATATTAGCTCTCTAGTACT
ATCGAACCCTGAAGCAAATTTCATACAAACAATTTAATCTTCTCCCATAA
TCGGAAAAAAATGTTTAGGCTTTTGAAAACCCCCCAACAAAATGAATTAA
ATGATAAATAGCAGCTCGACGCTAAATTCTTTTTTTGTCGGTTATAATTT
CATCTGTAAAGATTTGTTAAGTGGGCCGTAAACTGTAAGCTGTCTATGAT
TTCCTCATTCATTTATCGGAAATGTAGTGTATTCATGTTACATTTTGATG
TAACAGATCTACATGACGTGTTGATTGATTTGTTACATCGTGAAAAGCGT
AAAAACTTAAACGTAAAACTTGGATCATCTTTTAAGATAATTTCCTGATA
CGATTTTTGGGTTTATTTTTCCAATGACGCATTATCTCATCCCTATCTCG
TCATACTAAAGGGTTAACGAGTTCCTTGGCAGTCAGTAATATCCCTGCCC
ATGGTCCAGGCTGTTTTTAATGCCGACCTTTACAAAAAAGACCCGGTGAC
GAAACCTATATATTCCAGTGGCTGCAAACAAACGTTTTTTTAAGCTCTAA
CTCGTGTGAGTTTAAAATCTCAAATTGCTTTCTTGAACACCATCATTTCA
GGAACTCCTTACTACATGTCACCGGAAAGGATCCACGAAAACGGATACAA
TTTCCGTTCCGATATTTGGTCCCTTGGATGTCTCTTGTTCGAGATGGCTG
CCCTGCAATCACCGTTTTATGGAGATAAGATGAATCTATATTCTTTATGC
AAGAAAATTGAGCAGTGTGATTACCCACCGTTACCTTCAGAATATTACAC
AGACGACTTGCGTAGCCTGGTGGATTTATGCATCAACCCTGACCCGGAAC
AGAGGCCAGATATCGATTACATTCACCAAGTAGCTGAGAAGATGTACGCT
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TATTATCTGCTTGTTTGTGAGAAATACTTCCCAAGCATCTTATGTGAGAG
AACTCACATGAATTAGAATGAAAATGTCATCTCAAGCTCGCTTGTTACTG
CTCATTCTTCTCTGATAATGAAAAACAGGATGGATTGATGATGAACTCAA
TTGTCATTTGACTTGATTCTTTTGAATTCTTTTCTGAATTATGCATTCTT
AAATAGCTTAAGATTTTAAAGTCAGAAGATATTCGCCAAGGATTAAACCT
TCGTGCATATTTTATTTCATTGATATTTAGGTTAAAAAAATAGCTTAGGC
ATTCAAATTAAAGCCATTTTTAACCTACTATGGGACGTTATGTGGCATAG
TCATTGTTGCTTTATCGGTAAATAAATTGTCTATAATAAAATTGTCGGCG
AAAGAATTTGTTGGTTATAAATAATTATCGGCTAAAAAGTATTGTCGGTG
ATTATGTTTTTTTGCAAGTGTTCCTTTATCAGGCTCGCATTATGCTTAGC
ATTCTATTGTTTTCAAACAATAGAGCCATTGTTTAAGTACCAAAAACTGA
GCTTGCGTATGCTTATAAACGTTATGCTTATTAAAGAAAAAACTTGTATT
GCGTCACTTTTTGTCGGCGAATTTTTACCGATAAAGTACATTTTTATCTT
GGTTCTGAACACGGCTTAACTCAGTCACTCAGTTTTAGGGATGTTAAACT
AAGGATTGATTTTAGGGGGGTTGGTAGTTGACTGAATCACACATTATTAT
CAATGTAACAAAAGTGTGATTATTTTAACGGGTATTTTTTAATCTTATTT
TTTATTTTTTTCCTTTAATGAAATTTCCTTTGGGTTTGTTATGTTGTAAA
GCTGTCAAAAAATTTGTTTATAAATAATTTTTTATACATTTATGGTTCTG
CCGTAAAACTAGCTGTCATTAGCTTAGTTTTTCTTTTGGAGCTACATTGA
TATGATATCAATTAAAAACATAATTTTTTTTATAAAAAACTAGAAAAATA
AAAATGTGTTGCCACCTGTATTTTTACGAGTACAGTAAAGAGTCTTGCTT
TCTTGCTATGCTTATATCATTAGCCTAATATTTGTTTGGTATATATCGTA
TCAGCAAGCAGCACAAATTTTAAAAGCAATCCTTTAAAACAACGTTTGTT
GTAAGTGGCGATATATAATCTTTGTCTTTTTAGGTAATAACAAGAAAGGT
TCAAGGTTTAGCGACTGTACTTTTTTATGTCTATTATAATGTAGGTAGCA
AAAATTGAGATTCTATTTTTCTTTGTTGTTGTACACTAATTTTTTTAGTT
TATTAGTTTGGAATGATACGACTTTAATAACTGAAGTTTGTTTGTTTGTT
TTTTGTATTAATTATAAAATGCACATACTAGTAACAAAAAGAAAAAGAAA
GGATTAAACAAAACATTTGATTTCT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00057383-exon-scaffold_288-1575043694:559843..559950 | TCONS_00057383-exon-scaffold_288-1575043694:559843..559950 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00057383-exon-scaffold_288-1575043694:546796..547456 | TCONS_00057383-exon-scaffold_288-1575043694:546796..547456 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00057383-exon-scaffold_288-1575043694:544276..546049 | TCONS_00057383-exon-scaffold_288-1575043694:544276..546049 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00057383-exon-scaffold_288-1510915933:559843..559950 | TCONS_00057383-exon-scaffold_288-1510915933:559843..559950 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00057383-exon-scaffold_288-1510915933:546796..547456 | TCONS_00057383-exon-scaffold_288-1510915933:546796..547456 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00057383-exon-scaffold_288-1510915933:544276..546049 | TCONS_00057383-exon-scaffold_288-1510915933:544276..546049 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00057383-exon-scaffold_288-1491911889:559843..559950 | TCONS_00057383-exon-scaffold_288-1491911889:559843..559950 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00057383-exon-scaffold_288-1491911889:546796..547456 | TCONS_00057383-exon-scaffold_288-1491911889:546796..547456 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00057383-exon-scaffold_288-1491911889:544276..546049 | TCONS_00057383-exon-scaffold_288-1491911889:544276..546049 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_288 | supercontig | scaffold_288:544276..559950 - |
Blast
BLAST of TCONS_00057383 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: NEK7 (Serine/threonine-protein kinase Nek7 OS=Homo sapiens GN=NEK7 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 483.411 bits (1243), Expect = 4.031e-164 Identity = 217/273 (79.49%), Postives = 254/273 (93.04%), Query Frame = 1
Query: 250 DNKYNCLGNFEIQKRIGKGQFSEVFRARCLIDNSIVALKKVQIFEMMDLKARNDCIKEIDLLKSLNHPNVIKYLASFVENNELNIVLELADAGDLSKMIKHFKKQKRLIPEKTIWKYFVQITAALQHMHIKRIMHRDIKPANVFITASGIVKLGDLGLGRYFSSQTIAAHSLVGTPYYMSPERIHENGYNFRSDIWSLGCLLFEMAALQSPFYGDKMNLYSLCKKIEQCDYPPLPSEYYTDDLRSLVDLCINPDPEQRPDIDYIHQVAEKMYA 1068
D YN L NF I+K+IG+GQFSEV+RA CL+D VALKKVQIF++MD KAR DCIKEIDLLK LNHPNVIKY ASF+E+NELNIVLELADAGDLS+MIKHFKKQKRLIPE+T+WKYFVQ+ +AL+HMH +R+MHRDIKPANVFITA+G+VKLGDLGLGR+FSS+T AAHSLVGTPYYMSPERIHENGYNF+SDIWSLGCLL+EMAALQSPFYGDKMNLYSLCKKIEQCDYPPLPS++Y+++LR LV++CINPDPE+RPD+ Y++ VA++M+A
Sbjct: 25 DMGYNTLANFRIEKKIGRGQFSEVYRAACLLDGVPVALKKVQIFDLMDAKARADCIKEIDLLKQLNHPNVIKYYASFIEDNELNIVLELADAGDLSRMIKHFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSALEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSKTTAAHSLVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLYSLCKKIEQCDYPPLPSDHYSEELRQLVNMCINPDPEKRPDVTYVYDVAKRMHA 297
The following BLAST results are available for this feature:
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