TCONS_00057575 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00057575
Unique Name	TCONS_00057575
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	6417

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_293:103203..129165-

transcript sequence

>TCONS_00057575 ID=TCONS_00057575|Name=TCONS_00057575|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=6417bp
acaaaatttcagagCTCTATCACAATTTGAAGTATACATGTGATAATCCG
CCCCACTACTAATGTATCCAGGCATATTGAAATTATAATGTTGTTTCATt
atttgaatttaaagtttATAGCATAAATATTGTCCTGGGCCATCTgtttt
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GGAAGGTGCAATTTATCATCCTGGTTGCAGctTTGGACAAGTCACCCAAA
CTGGACGCCGTATCTCAGACTGCCTCATTCTGGAACGTTCTGAAATGATT
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CTGAGATGTCCCAAATGTTAGTAAACAATGAGCCTTACTTCAATCAAATG
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GGGGAGTCGTTTAGATGAGCCTGACCTCGATCTTTCTGGAATGAAGGAAA
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GTTATGGTATTTGCTGTTGTGGAGAAAGCCGGAGCCACCGTCATGTCTGA
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GCGAGTGGACGATTGTCAGTTTGTGTGTATCGCCCAAGAAGATTATTGGA
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GAAATGGTTCGAACGTCCTCAGTTAAAAGATAAAGTTACTAGGGTGATGT
TGCTATGGGTGAACAACCATTATGCGGATTTTGAGGGTGATGTTTACATG
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GGGTCAGCTACGTCTCTTAAATATGGCTTGTTCAGCTAAGTCGAAACCCA
GGATAATCACATTACAACGTCCTTCTAAAGACAGTCGACTTGATTTCTCA
ATCTGCGGTGGCAAAGATCGAGGTTTTCCTATCTTCGTCTCCAAAGTGGA
CACGGTTTCGAAAGCCAGTGATTTGGGATTGAAAAGGGGTGACCAGATAT
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GCTAGTGTTCAACGGAGTTCGTCTGCCGTAAGTTCGTCAAATTCGAAACA
GTCAGGTAAATCAATGACCATGGAAGATCACCATCATCAAAGCCATCGAG
GAAGCAAGGATTTTACTTCAATGAACGGCAGTAAAACACTACCACGTGGC
AAGCaaagaatcaaaattaaaatgccCTTCGGAAAATCTAGCAACACAGA
CCTGACGCGTACGCAATTCCAAAGTGAAGCGGGTGAAGAAATAATCCGAT
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CTTTACAGgaCTTCGACTTGTTTAAGAACGTGGACTCAAGAGAATACATT
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GCAACGAGCATAACATCACCAAACGCGTCAAGCTACTCAAATATTTCATT
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GGGAACGGCTCCcacaaaaacatgataaaatatTCGAGGAATTGAAAGAT
TTGATGGACCCCTCACGTAACATgtcaaaatatcgaaatatgttTACTGG
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ATTCTGTGCCATCGGATACGACCCTTACAAAATGGACTCGATGCAGGATA
ACGTCGGCGACACGTCAAACGTTGCACAATCGGTCGTCAGTATCATGGGC
AACTCTCCCAACCCCAGTCGTCGTGGTCGTGGAAGTCTTGCGATGAAGGA
CCCTAAGAAAGCTTACGAAGAATTCCAAACCAGCCGTCGGATACGACAAT
ACCTGGAAAAATTGTCCGGTAAAAGTTATAATGAAAAGGAAATGATGGAA
ATGTCGTATAATTGTGAACCACCCGTCAGTTCACAAAACAGTTTGGCTCG
TCAAAAGAAGCCGAGTTCACCGTTACCATCAGCGGGCGATTTGAAACGTA
AAGAAGAAAGATCTTCCAAATCTTCTACTGATTCAACCAGATCAGTCGAA
TATAGCGAACCAAAGCAAGCCGATAGCTCCACGCCACGAAAGAAACAAGC
ACCTCATCAGTGGAATGACGATCACCACCCAACAGGAAGAGGACCTTTAT
ACTCAGAATCATCGAATAGTATTTCATCGAGGAACGGCTCCTTAAAATCC
ATCACTTCAATCGGCTCAAGAAGTCTTCCACCTTCCTACCAAGAATTTCG
ATCTGAATCACCTCTTAATTATGACGATGATGATCACCATGGACAAGTAT
CGATGGTATAGCGACCTAGCAACCAATCACAATCACGTGGTTATCACGTG
GTCTGGTAATTTTATAATTCGTGACGtcacgatgacgtcattttgtagCG
CATGATGTAATGATAAGACTTATTGTAAGTGGACAAATTTTTATtagtat
ttttattattattaaaaaccAGAACTCTAGAGAAACAGTTTTAGAGAGAA
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ACTATAAACGAGTCCAAATTATAGAAAGGTTCGAATAAGGGAGAGTTTAC
TGCAGAATTTAGTAGAttgattaatatttttttagtgGGACCTGTTATTA
TctttagatattttttctttaatttgtaCATAAATAACTCAATTGCTTAT
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TTATTTTCGGTTCTTTACGGAAcagataaaattaattttctttcgGTCAT
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tgagccttcactGGGGACACTTTAACGGTCGTTTCGCCGGGCCTGAAGTT
GGAATTATTCAAAAATAGAGATGCTACTTTTTTCACGCACGATTGAGGAA
TTTTCATGCCAAAGGTTCCTTGGgattatttttttagaatttataaTTTT
CACAACTAAAATTTCGTCACATTCTTGTCTATTctttagaataattttta
atGTAAGAGTTTTTCCTCATTTGTTTTTCCCTCATCTTACGGACCTTTTA
TTTTCAACATACGTTTGATATTATTGCTGACTCAGCAAGAAGATTTTATT
GCTGATTGCAGTGGCAAGTCCTactttaattatatttttgtacagAACCA
AAAACGAATATAATacatacttttttgaaaaaaataaatacatttatgtg
tcttttcaattttttaatccCTCCACCGGGGGGAGAGTGGGTCAACCAAC
TGACGGTAAGTgcggag

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transcript from alignment at scaffold_293:103203..129165-

Legend: exon

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>TCONS_00057575 ID=TCONS_00057575|Name=TCONS_00057575|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=25963bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_293:103203..129165- (Clytia hemisphaerica)
ACAAAATTTCAGAGCTCTATCACAATTTGAAGTATACATGTGATAATCCG
CCCCACTACTAATGTATCCAGGCATATTGAAATTATAATGTTGTTTCATT
ATTTGAATTTAAAGTTTATAGCATAAATATTGTCCTGGGCCATCTGTTTT
TGTTTAAAGAAAAAAATTGAAAAAGTTAGTTAGGTCCTTATTATCGTTTT
GATTTACAATACAATGTTCATTTCTTACTTGGTTTGCATCATGTCAAATT
GGGGTGAATGAGGGTTCACTAACGTTTGTTCAATACAATATATGCTTCCA
AGGACGTGATCCGATTCTGTTTTCTTCCTTTATTTAATCTAAAATTAAGA
TTTTCAAGTTGTCAATTTATTGATTTTGTTCATAAAGATTTTAAAAACCA
AAAAAGTTTACTGATTATAGATAAGATAAGATGCCTGGTCTTCATTTAGC
CTTATTTCCAACCAAGAGTTACTTGTATTGTATCAATTAACAAGTCCATT
ATATATTGCCCTTGCTTATTTAACATTTATGTCTCAAAAATGTCTTTTTG
ATGATGTTTTCAATCAAATATTCCTTTATTTTTCAAAATCTTTTTTTTTA
AGAAATATAGAAAGTTTTGTTGTATGGCTTGTAAAATACATGGTTAATTC
AATATAAAATTAGTTTATTGAAATATAATGCTGCACTTGAAATTAAAAGA
CTTTAAAGAACCTCAAAAGTTGTAATATGACTGATATCAATATATTTGGG
AAGACGTAGATTATTGATTGGAACTATGCCCTATATGAATAGTGGTGCGC
CTGATCATGATTTGGCCACACAGTTTCGACGGCTCCTTGCAACTCCAAAG
GATCTTAGAAGTAGAGAGGTAATTCTAGCCCTTATTACGTGAAATATTTT
TTTAACAATACTTATCAGTAGTGCATTAAGTAAATAAGACATAACATCTT
TTCTTGTATTTTAATGTTTAACATTTTGGATGGCTTTAATTATGTTAGTG
TTAATGTTATCTTAGTGCAAAGATAGAGCATCAGACTACAGCGAGAAAAT
GGGTTTAATCCCTGGCTGGGTCATACCAAAGACTTTATACTACTTAAAGG
TACTTGGGTCGCGCCCTCCCCTATTATTTGGTAAATAGTTTCTCAAAGGA
TCTTTAAGGTTGCCTCCAACTGCACTTGTAGACCAATACTTGTCGTTTCA
ACAGGAGGTGCAAACTATCTATGGTCATCTTCGAGAAATCAAAGTTGTTT
CTAAGTTGCCTGAGGGTGAAGTAAGGAAGATGGCAGAGAATGCACGTTAT
GAAGTTCATGAATCCAATCAAACCATTTATCAGTGAGTTTCCAACTATTT
ATGAACAATGCTTTCTTTTAAAAGATACTGTTAAAATGATTTTATCCCGG
AAAAGATTTTTGCTCAATAATATAATAAGCTTATCCTTTTTGTTATTCAC
TACCAAACACCTTTAGCTCAAAACCTTTTATTTTAAAAAAAGCAGTTGTT
TTACTGAAGGGATGATTTGTGTTTTTCAAAATTTTGGTTGGTTTCATGTT
TCTTTATTTTGTTTATGAATTTAGAGCTCAAGATATTGCAACATGTTGGT
ACATTTTACTGTCAGGCTCCCTGTATTTGGAAGGTGCAATTTATCATCCT
GGTTGCAGGTATTACTTGAATCCTCCTATTTTATTTGGTCTAGGTCTAAT
GTATATAAGGTAGCCTAAGGAATAAGGAATCTTTTGTGTTTTTTATTTAG
CTTCTTTTGATGTTGCATCTATTAATTTTAAACTTTTTCTTGCATTATGA
AACTCACTGAAAATTCTTTTTCATAAGCTCTAGAAGTTCCCTATCATTTT
GTTTACTTTTCACGTGTTAGTATCAAGCTTAACCTAAAATGTTATAGGTG
ATTGTTTCCCTAAAAATCCCTTTCTTTCCCCAAGATATATTGACAACATC
TCAAGTATTACAAGCATTATAAAGTGTGATTACTTACCATTTATTTGTTT
TCATTTTTCTAGCTTTGGACAAGTCACCCAAACTGGACGCCGTATCTCAG
ACTGCCTCATTCTGGAACGTTCTGAAATGATTGTGGTAGGTCTCCAATAA
ATCCTTCAAATAATAACAAAAATCTTTGCTTCTTAGATTATCTAGATAAC
ATTATTTGCATGGAATGAACATCAAATATATTTAATTTTCTCATTTTTCT
TGTTTTTTTCTTGGCTCATCAATAATTCAGCTGAAATGGATAGAGAAATA
TTCAATAATTTATCCCTGAGGTTTAATTTATATTTTTCTCAATACTCCTC
TTCATGGAATATACTTTTTCTTCGCTCAAGGAAAACCTTTTTTCACCACT
CTTGCACTTATCTATCTAAATGTGATATCAAGAATATGTCTACACAGATT
TTATAGAGAAGGTTGTTTTCAAAGTATACATCAGGCCTCTCATGTCTGAA
ATATTTCTCTGATTGTTTGTGTAGTAATGATTTCATGTTGTCTTTTTGTT
TTTTGTTTTGTTTGTTTTTAAAAGAAAACTGAAAGCTCACAAGTGTTTCT
CTGTGTGCTAATGTAGAATATCTCATAATAAGATTTCACGTAATTGACGC
ATCTCAAAATAAAGAAGTGTCAGGCTTTTTTATTTTTATTTTAGTTATTT
TGGCTTGGATTTTATCTATTATTGCTATCTTACTTTCACCATAGATTGAT
TACCCACAAAATGCAGTGCAACTTCCATTTGGGACAAAACCAAATAACTT
AGGCGATGACAAGAGTTTGACACACCAAGTAAAAATCTTTTATACCATCA
AACTCTCCAAATTACATCTCTAAATCTATGCTGAGGCTTCAGACAGTGTG
TAATGGTTAATTCTAACAAGACTATATGAGAATTGAGTGCTATATCTAAT
GTTTTTAAGCTAATGTAAGCTTTATGTTAACTTTCCAAACATCTAAATTA
TATGATTTCTTTCAAGGATCCAAATCTTGCTGAGATGTCCCAAATGTTAG
TAAACAATGAGCCTTACTTCAATCAAATGGCAAGAAAACAGGAACAGAGA
CCGTCAAAACAACACCAAAAACAGCACAGGGGGAGTCGTTTAGATGAGCC
TGACCTCGATCTTTCTGGAATGAAGGAAACTATTGGTAAGTGTTTATCAT
ATCCCTAATAGTAGGGCGCTAAGTCTCAGGTCCCGTGGTAACTTTTATAG
GACTAAACGAAGTCTAATTATATACTAAACTTTGTAATGGAACATGCTTC
GTTTAGTCTATAAAAGTTGCCACCTAGGACCTGAGACTTGGCCCCCTAGT
GTAAGTAAATGTGAATGATTTAAAGATAATTATGCTTTTAAATTTGAATT
GCAGAATGGTTCTCCCAGTTAAGCATTTATCTTTCCACCAAGTGGTTGCA
GTTATGACCCCTGACGGTTACTTATAAAGGGAATGAAACTAAAGTAGATT
GCTATATGGTCATCTGATTTTGCTGTTTGAAAACTGAAAATAGGTTTGGT
TTCATGTACTTCCCGACGCAATCCATATCCCTGACCTTACTCTAGTTTAA
CGAAGTAATAATATGGAGGCAAACTTTCACATTTAATAGGTTTCTTTTGG
AACTTAGCTTTAAAGTGAAATTTAACATGGAAACAAAATTAATAAAAACC
AGTCCTAATTGGAAAATTTGAAGAAGTGTACCATGAGTAAATCACTACTA
CCATCTTCTGGAACAAGTCAGGCAACTCTCCAAAGTTTTTAATCTCAACT
CTTTAAAAAAAGTTAAAAAAAGGATCTACAAACTCATTCCATCATACACA
CTCACAACCATAATCTACTTTGAAAATGTAACTTTTCAAAGGAAGGACGA
TCTAGTATAAACCACACTGAAATCCTATTATAAAAAGTTTCTAACTTGAC
AAAAATTAACAATCTGTTTTGTCTTACATGATCAACAAGACCATCCAATG
GGGATGAAGAAAATTTTACTATTCTAATCTTCATATAGTGTGAAACACTC
TCAAAAACCTTCTCTTTTTAATTTTCATCAAAACTTATTTGTTTTTGTCG
ATATTTCTAATGCTCTTTACTTTAATAAAATATGGTTTGGATTTACATGA
AAATTTCAATGTTCTCAATACTGAACTGACCCAAGACAGGATAAAGACAA
ACTAAGTTGATCAAAATGCTTGTGACTGATGGGAGTCTCTAGATGCAAGT
TATAGATGATGGAGGAAATTAAGCCTCCAAAGAGGATGTTGTTTTCTGCA
AATAAGCCTCACGCCAAACGTCTCAAACACGTGAATACCACTTCTGAGAA
TGAACAGAAAAAAAGGCAAATTGAAAGGCGACAAAGTTTTGATCCAGCCC
CAAATATTTTCACAAGGCTTGGAAGTCTAAGGTCATCCAGGAGACCTGTT
GTCGTTGCATCTGCCTTCCCTAGAATGAATATGACGCGGCTACCCTGGAA
AACAAGGATCATTCGAACCATCTATCCAGTGTTTTTCCACTTCAAAATGA
AATTTCTCAAAACATTCCGTTTACGTTCAGTTCGGACCAATGTGTTTGTA
CCTTATCAACCACCTGCTATTAAGAGTAGGTGAAAAAGTAGATGTTTATT
ATATTTAGTATTTAACTCCATAGCTTCAGCCCCCTTACTTTTTTTTTTGG
GGGGGGGGGCTAAGAAATATTTTGGCAAAATATTTCGGTGGGACCTAGAT
TGTTAGAGACTGTGGGGGCTGTTCAGCTAATTTTAAAAGATCTCTGATCT
TACTATTAAATCAAATATAAAAAGCAAAAGATTTATAAAGATAAATATTA
ATACAAGTAAACTTTAGTTTTCATTTATCAGTACTGTACTCGCATATATT
TTTTATTGACTTCTCTCTACGGAGGCCGGACCTGAAGTGTTAGGGGACCT
AGCACAAGGCAAGTTTTTGGGGGGAGCTAAATTGTTGGGGGATCTTACTT
TGTTGGGGGGAGCTAGAAACCTGGCTGAAGCTATGTAACTCATTGTCAGA
TTATGAAGGATGGCGGGTGTGCTTCCCTGATTTTAATATCCCTGTAAACA
TAGCTGTTAGCTGTAAAATTCAAGGGAAAGCTGTAAAACCCAAGGGAAAG
CTGTAAAACTCAAGGGATCACTTTGTTTGATTTCTATGTATATATAAATC
TCATAAAGTTCTAATCCTGATAACTCAAAAAAAATTCCCTTTTTCTTTTC
AGTGGACCTTGATTCAGATGATGAAGATGATGTCATGCCAAGTGAGGTTT
GTAAAAACATATTCTTTTTGTTGGTTCATTTCCAGTTCTGGAATCGTTCA
AACAAGGACTGTTCTGTACAGCTCTAATTGTGAAAATAATTTTAAATGTT
TTGGGTGTGATTGATCGCAATCCTCAGACATCTTTGGTGTGTGTGGAGAT
GTGGGCATACTATCACACACCTCAAATGATGCAGTCTGGACTATACAAAA
AATAATTCACATTTCATTTTAACTGTTGAACGTAAGAATAAAGGAAAGCA
AATATAAAATTTTGCCTAGATTACAACCCCAGCCCAAGTCTGACATCACT
ATCAGATGGGAAAAAACTAAATAAACTACTATGGTATACTTTAGAAGGAA
CTAGAACTTTCCCAAACCTTCCCAATGTCAATATTCGACCCTTTATTACA
TTATTTATCACTAAATTTTTAGTCAGCTGTTGTTCGAGATATTGTGCGAG
ATTGTTTGGAAAAAGAGCCTTCAGAAAGAACGGAAAACGACATACGTAAG
TGTTGCCTCACTTTCTCATTCTTGATGACAACTCTTAAAATTGGCTTTTG
GGTTCAATCAGCTAAAACTTCCACTATATTTATTTACTTTTACAGTTAGG
CCTTTTTGAAATGAATGACCTTTTTAGTATAAAGTATAGCCTCACGTCAA
AGCGTAAAAGGAGAAAGGTCTTCTGGAAACTTGTGGAGATGAGATGGATC
CCAAATAAAGATTGACAAACATGTAGTCTAAAATAAATAACTGGAAAATT
TGAAGTGCATCACTTCTTGCAAAGACGTTTAGAAGTTACCCAAAAAAAGA
CTTTCAACAAGATAGGTACCACAAAAAAAATAAGATCTAGAATTCCTCTA
GTGTTATGGGGAAATCTTTGTTAGATTTGGAGTACATAATACCTCATTTT
ATTTTATAACTTTTTTCAGATATACTCATGGACTTCATGCAGCATTTGCC
AGTAAGAAATTCATTGTATTCTTTGACCTGGTTAAGCTTCTCTTTGATAT
ATTTTCCTTATTCTACCTGACTTTCACCCTTAACCAATCTTTTAAAAAAG
TCCTGTTTTGTATTGTAGTTATTACACATAGAGACTCCCATCTGATCTTC
ATATGTTTAGAAACAAGCTTACTATGTCACTGGCAGTGAGTGCAATACGT
TGAGATTAAGTGGGAATCGCCAGAACGACACTTTTTTACTTTCCAAAGAG
AAATTATATCATTTTAATCAAACACTTTTTCACTTTCATTTAGGCCTTCA
ACAGTTTATCACACAACATCAAACTAGAAATGTGTAAAGTTATGGTATTT
GCTGTTGTGGAGAAAGCCGGAGCCACCGTCATGTCTGATAAAGAAGAGGT
GAGCATTCATTCTTCCACCGATTCCTCCACTACCAGAGCAGGGATTTTTT
TAAGTACTTTTTTTATGTCCGTATACCGGCCAAAATACTCAATCTAAGTA
TTAAATGAGATTTTTCTAGCGAAATCTTTTGTTGTTTATGAGCAACAATA
ACTAATTGTTATCTACATATTCAAGAGTTTTTGGGAGCTTCCATAGTGTC
CCCCCCCTGGATTCAGGGGGAATGGGTTTTAAGGCCAAAAAGGACGTATG
GGGGGGGGGGTGAATATGGAAAATTTTGGGAACTCACCAAAATCAATTCA
AAATTGAAAAACATCTGGTTTTATGAGATGATGTTGTGATCAAGAATATC
AAGATCATAGAAGATTTGAGTGTATAGCATTATGCTTCGTTTTTCTTTCA
TTTATTTCAACCAGCAATATTACGGTTTAAAAACAACCATCCTTTCCATC
TATTCTTGAATTAGAACTACTTTAGGGAAAACAATAAGTGTTAAATTCGT
CAAATTACAGCTTTTTATGCTTGAGGGCCGGGAGAAAGAGAAATATTTAG
AGGCAGGGTGGGGAAAAATGAGGGGGTGGAATGGAAAATTTTCATTCTAG
GCATGGGGGAGAGACCCTAAAGGACACCATGGCTTCGCCCTCTGAACACC
CACAAGACCCCCAGCTTCATCAATGTACAGCTTTGCTGAGTAAGTTCCCT
TCCAGGCATATTAGAAATTCACTCCAAGTTTGCAAAAACGACCCTAGCTC
AAAGTGCTTAGAAATCCCTGCGGAGGGCTGGGTTCAAGTGTGACAGTAAA
ATGCAGGGATTGCTAATAAAAACATCCTTTTTCTTCTTTCAAATTAATGA
CACATTGCAAATTTTAGCAAGGAGAAATGAATCTTCTCACATTTTAGCTT
GGACTAATTTACCAATTACAAGAGCCGTACACCAGGGCCAACATGGCTAA
ATACAATAGCTTGTATGATACAAATGCACCTTCTTGGCTCTGAAATAACT
TTTTGTTTGATGATACTTTCATAAACGTAAATTAGCATCTAAACATAATG
TGAGCACAAATTTGTGGATAGATTTTTAATTTGGAATGTCGTGATGCACT
GTTATGGCAGTCATTGTATCAAAGTTGAAGACAGGCATTGTATCACATTC
TAAATTTTGTGTTTTTTCATTTTTAGATGGATTCATGGTCAGTGATATTG
AATGGATCGGTTGACATTCTCATCGAAGGAGAAGCACCTGTCTCTCTTCA
TCTGGGTGACGCTTTCGGTGTGCATACCGAGAAAAAGAAAATGTACCATA
AAGGTAAACAACATCTTCCTCAAGTTTGCAAGATTGTTTTGCAGTAATTT
CGAAATATTACATCTCAATTTTCAAAGCAATCTTCTTCAGTCTATTGATT
CCAGGCATAAATTTATCAAACACTCTGAGGTAAAACTCATTGAATCTTAT
TCTTGTAATTTGAACCAGTTACTTTTTCAACTCGGTATTATTCCTTGGTA
GTGTTGTTGAATTGAGTGCAAGGTGATCTGAAAAGTGCCAATTTATTTTG
CTTTCAAAGCAGACGATGAAAGAAGCTTTCTCCTCATTGGTTCTTTACTT
TCTTCCAGGTACAATGCGGACGCGAGTGGACGATTGTCAGTTTGTGTGTA
TCGCCCAAGAAGATTATTGGAGGATTTTTTCACAAGGAGAAGCCAGTTGT
CGTAAAGTGGAAGAAGAAGGCGAGGTTGTCATGGTAACTGAACATCGAGT
TACTGATGGTGGTAGTAGACAAGGTCAAGTCGTTATTAAGGTGTGTGTGT
TTTTTATACCACTTTGGTGCATCTACAGTAAACAAATTAAATCAAATTTT
GAAAAGGTCATGGTAGTAGATGGTAGAGACTATAGATGTTTTAATTTGAG
TTGTTGAGAATTCTTTGTAGATCGCAATATACCTTTATGAATTACTAACA
ATGTGTTTAGTTAGAGAGGTTGACTAAGCTAAGTGAAGTTTGTCTGAATA
TTATTTGACTCATGATGAAGAGATGAAAATTAATGCAATGAATTCGGTTT
TCCATGGAGTCACTTGCTACACATTCAGCCATTACAACACTTATTTACTT
CATTTTCTTTTTCACTCACTTTGCAGGGAACACCTGACCGTCTATTGGAC
CACTTGATGGAAGACCATTCCGTCATCGATCCCACTTACGTCGAGGATTT
TCTTCTGACTTACGTCGTGTTTTTCAACAAACCTCATGATATCGCCTCCA
AGTTGTTGAAATGGTTCGAACGTCCTCAGTTAAAAGATAAAGTAGGTTAT
CTCTCTGTACTATCCTGAAGATTTTCTTTTTCATTTATGGGTTTTTGTCT
TATGGATATTGATATATTCGCACATTAGATTATGTTTTAAGACAGCGCAC
AAGTATTCAGATTCTCTAGCACCTCAACGCCCCTTCCATTTTAAGGAAAC
CTAATGTGACACTAATGAACATGTTACCAAAAATAGACACTTTTGGTTCT
TTTTCTAAAAGGCTCGTTATTTTTTAAATTTTTTAATTGGCAATCTGGTG
AGTAAATCATTACTTAAAATCACTTTTTGGAAATTTATATGTTGTTGACA
ATCAATAAAATAGGTTGAGCAGTTTCTTGTATTAGTAACTCGGTTATTTT
TTTGCACCGCTTCGTTCACTGGTCACTGTCATCCACTATTTTACTTTAAC
CTTTTATTTACCAGGTTACTAGGGTGATGTTGCTATGGGTGAACAACCAT
TATGCGGATTTTGAGGGTGATGTTTACATGGAAACAAGTATGCAACGGTT
TGAATACTTATTGGAAGCAAAGAAAATGGTGGGTCAGCTACGTCTCTTAA
ATATGGCTTGTTCAGCTAAGTCGAAACCCAGGATAATCACATTACAACGT
CCTTCTAAAGACAGTCGACTTGATTTCTCAATCTGCGGTGGCAAAGATCG
AGGTTTTCCTATCTTCGTCTCCAAAGTGGACACGGTTTCGAAAGCCAGTG
ATTTGGGATTGAAAAGGGGTGACCAGATATTAGAAGTCAATGGACATTCA
TTTGAAAATATTACGGGACCGAAAGCTATAGACGTTCTCATGTCACATGC
TCATTTATGCGTGATCGTCAAAACAAACACGATAGGATTTAAAGAGGTCA
TTCAACCCAGTATTAAAAAAACCAAAAGTAATAGTTCGTTGACTAAAAGT
AACGGCACTTTGGAGGTGCCAAAAGGTCAGGCTAGTGTTCAACGGAGTTC
GTCTGCCGTAAGTTCGTCAAATTCGAAACAGTCAGGTAAATCAATGACCA
TGGAAGATCACCATCATCAAAGCCATCGAGGAAGCAAGGTTTGCCCACTT
TTTTATGTGTGTTTTGTTTTCTCTTTTTCCTTTTATTAGGCTCCGTTAAA
AAAATTTGTATCTTCCCTAACCGCCGTTGGTACTGCTGCCACTTAAGTTC
AGGGATTTTTCTAAGCTCTTTTTTTGTCCATATACTGGCCAAAATACTCA
ATCTAAGATTGAGTTTTTGAAACTAAATCTAAAATATAAAAGATATTTTC
AAGAAAAATTAAACTTGTTTGCTGTTTACAAACAAAAATATCTACGTATT
CAATTATCTACATATTCAAAATATTTTTGGGATCTTCGCCCTCTGAACAC
CAACCAAACCCCCAGCTTCATCAATATACAGCTTTGCTAAGAAAATTCCC
TTTCAGGCATATTAGAAACTCAATACAAGTTTACAAAAACGGCCTAGCTC
AAAGTGCTTAGAAAATTCCCTGATATAAAGGTTGTTGTTTTTAGCATAAG
GGTATGATTTTCAGTTTCCCAACGCTGACTAAACTAGATTCTCTTCGTTT
GTATTGCCACATGTAGTTCAATCTACTCCTCCTATGATTTTACCAATTCC
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_036304	XLOC_036304	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
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Expression

Values :

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00057575 vs. Swiss-Prot (Human)
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Identity = 267/601 (44.43%), Postives = 394/601 (65.56%), Query Frame = 2

Query:  857 RSREEVQTIYGHLREIKVVSKLPEGEVRKMAENARYEVHESNQTIYQAQDIATCWYILLSGSLYLEGAIYHPGCSFGQVTQTGRRISDCLILERSEMIVI----DYPQNAVQ--------------LPFGTKPNNLGDDKSLTHQDPNLAEMSQMLV--NNEPYFNQMARKQE------QRPSKQHQKQHRGSRLDEPDLDLSGMKETIVXXXXXXXXXVMPSESAVV--RDIVRDCLEKEPSERTENDIHILMDFMQHLPAFNSLSHNIKLEMCKVMVFAVVEKAGATVMSDKEEMDSWSVILNGSVDILIEGEAPVSLHLGDAFGVHTEKKKMYHKGTMRTRVDDCQFVCIAQEDYWRIFSQGEASCRKXXXXXXXXXXXXHRVTD-GGSRQGQVVIKGTPDRLLDHLMEDHSVIDPTYVEDFLLTYVVFFNKPHDIASKLLKWFERPQLKDKVTRVMLLWVNNHYADFEGDVYMETSMQRFEYLLEAKKMVGQLRLLNMACSAKSKPRIITLQRPSKDSRLDFSICGGKDRGFPIFVSKVDTVSKASDLGLKRGDQILEVNGHSFENITGPKAIDVLMSHAHLCVIVKTNTIGFKEVI 2572
            R+ E++ TIY +L  ++++S L E ++R M+  ARYE +  NQ ++ ++ IA CWYILLSGS+ ++G++  P CSFG+    G+R  DCL+LE SEMIV+    D   + +Q              + +  +   + DD  +       A++++M +  N  P    ++  Q          S      ++ +  +  D+DL+ + E  VD + D+E+D     +  +  RD+VR+CLEKEP+++T++DI  L++FM  LPAF +++ +++ E+C VM+F VVE+AGA ++ D +E+DSW VILNG+V+I        +L +G++FG+     K Y  G +RT+VDDCQFVCIAQ+DYWRI +  E +  KVEEEGE+VMV EHR  D  G+R+G +VIK TP+RL+ HL+E+HS++DPTY+EDFLLTY  F   P D+  KLL+WF+   L+DKVTR++LLWVNNH+ DFEGD  M   ++ FE  LE  KM G LRLLN+AC+AK+K R + LQ+ S++S L FS+ GG ++GF IFV  V+  SKA+D GLKRGDQI+EVNG +FENIT  KA+++L ++ HL + VKTN   FKE++
Sbjct:   20 RTPEDLNTIYSYLHGMEILSNLREHQLRLMSARARYERYSGNQVLFCSETIARCWYILLSGSVLVKGSMVLPPCSFGK-QFGGKRGCDCLVLEPSEMIVVENAKDNEDSILQREIPARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCSIASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEIDRTDPLQGRDLVRECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGQELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVCIAQQDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHSIVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKGFGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRNNTHLALTVKTNIFVFKELL 619

HSP 2 Score: 342.813 bits (878), Expect = 1.966e-95
Identity = 187/426 (43.90%), Postives = 291/426 (68.31%), Query Frame = 2

Query: 2984 DLNSQVIKVYRGDHTSRFFVLTKDTSAREVVQTAIDAFGITDHSTKSYFLCQVTVTEDGLIKQXXXXXXXXXXXXXISLNGRYYIKSSI-SEGPLPDEVAQEIAREANLTLLQLSPLEIAKELSLQDFDLFKNVDSREYIYNLFEEKNERKSKNLRSVEQTTNVEMYWVISEICNEHNITKRVKLLKYFIKVAKFCKDFKNYNSMYALISGLENTAVSRLKNTWERLPQKHDKIFEELKDLMDPSRNMSKYRNMFTGERCYPPLIPWFPIVKKDITFLHLGNKTHVDGLVNFEKLRMIAKEVRRVCKFCAIGYDPYKMDSMQDNVGDTSNVAQSVVSIMGNSPNPSRRGRGSLAMKDPKKAYEEFQTSRRIRQYLEKLSGKSYNEKEMMEMSYNCEPPVSSQNSLARQKKPS-----SPLP--SAG 4237
            D+  QVI+V++ D  S + +++KDT+A+EVV  A+  FG+T  ++ +Y LC+V+VT +G+IKQRRL D  + LA+RI LNGRYY+K+++ +E    DE AQE+ +E+ L++LQLS +E+A +LS++DFDLF+N++  EYI +LF+  ++  + +L+  E   N E +WV SEI  E N  KR+K++K+FIK+A  C++ KN+NSM+A+ISGL   +V+RL+ TWE+LP K++K  ++L+D+ DPSRNM+KYRN+ + +   PP+IP FP+VKKD+TFLH GN + VDGLVNFEKLRMI+KE+R+V +  +   DP  M   +     ++N   +++ + G +    +R R S ++ + KK YE+ Q +R+++QYL  L  ++  EK  M MS   EP   +      +K+ +     SP+P  SAG
Sbjct:  747 DIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTG-ASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRSLSQGSTN--SNMLDVQGGAHK--KRARRS-SLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQM-MSLQWEPAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAG 1165

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00057575 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00057575 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
RPGF6	5.685e-141	44.43	Rap guanine nucleotide exchange factor 6 OS=Homo s...	[more]

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TCONS_00057575 (transcript) - C. hemisphaerica