TCONS_00057620 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00057620
Unique NameTCONS_00057620
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length621

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

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Run BLAST on NCBI

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Legend: exon
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TAATCAATATTGGACTTTGCTGATAACTCATTCCCAAAGACAAAATTGTA TTGTATTCTACAATTGAGATTGTTGTTTTAACGTTCATTTAACGTTATAT GGACGTTGCCTTGACGTTCTGTGTCAGATGGGTACTGTATGGATGTTGTT CTGTAGGACAATAAACAGAGTGACCAATGCCAGACTTTTATTCAGAAATC TACACATTTAACTTTAAAAAGAGGCTACCTATCTTTGATTTACTAATACC AGCTGGGGACTAAATTTCGTATATATATTAACAAAGAAAAAATGCATAAC AAACATTTCCTGAGGTACACTCCTTTTTTTTTAAGAACCAGTAAACATTT GTTGAAGTTCGACTGTTCTTATTTTTTGGCACTTTGAGCCTCAAATTGTT CTTGTCACGTTTTTATTTTAAGGCAATATTGAGGCATTTAAGGCTTTAAA CTTTAATCTAAATAATAATTTCAAATTTTAACTAACCCTAATCTTACTAT TTCAATTCTTAATTTGCCTGAAATTCAGCAAACCAACATCAATCGTTTTT CGGCATTCTTGAGCCTCATTGTTCTTATAAAAAAATAATGTAAAAAGAGC TCTGAATGGGTTTGGAAAGCATTTGAGCTATCAGCATCATAAATGCTCTA TACTTGAGCCCTTTTTGAAAGTCTACAGAATATTATCTTTAAGGATTGAA CACAAAAGAATCTATTAGCCTCCGAAGATTAATTTCTTTATTAAATTTTT TTAAGAAACACACTTTTAAGAAACATGAGGCTCAGAGTGCCTAAAAAGTA AGAAACATCTAAGAAACATGCTTCGGTTTTTTTAAGAACCTTCTAATCCA GCCTTTCATAAGGCTGATTATGTCAAAAAGTTTAGAAACATGTAAGAAAC ATTTAAGGCTCAAAAGGCCAATTTCTTGAGAAACATTGAGGCTTCTTGGT AAAACTAGTTTCTTAAAAAAAAAAAACGTGTACGTGAATTTAAATCCATT TAAGAGTCAAAGTAATAAGAATTGGTTGTAAAGCATGAAAGACCCTAATT TGGCTCCAAAAATGAGAACAGGCTAAGAACAATTTGAAGCTCAAAGTGCC AAAAAATAACAACANAAAAATGAGAACAGGCTAAGAACAATTTGAAGCTC AAAGTGCCAAAAAATAACAACAATCGAGTATCAAGAAAATTTCTGATCTT ATAAAAGAAATGAGTATAAGGCATCAAATAACTTAAATTTGTCTGCAACA TTTGATTCCTACCTACAACTTTAATGTGATAATTTGTTACAAAATTTAGT GTTTTTCCTTTTAAGGACATGTACATTCTCCCCCGTTGTGTCAAAGATGA CGCCTTGTTTTCTTTTCAGATTCCTAACCGTGCATTTTTATAGAACCCTC CTCCTTTTTAATATTTTTTTATATGTCTCTTCTTAAAAAGGTTTTCTACA GAGTACAAAAAAGAGACTTCTTCTTCTTCAACTTCGAATTTCGTTTTTTC GAGTAAGAATGTATGTAGTAAAGTTTATGATTATAGAACACCTGCCTTTC ACTTTATTTTCATTCTTTTAGTGTTTTTTTTTCATTCCGCTCACTTGAAA AGTATTTAATTAAGGTTAAAGATATGTCTGAAAAATCTTACAGTATAAAG CTATGTTTCTCTGAAAACCATTCTTTAATAAAAACAGGTCTAGAGGGGAA AAACATTTATTTGTCTGTTTGGATTACTTCATGTTATTTTTCTCTACAAG TTTTGGAAATTCGACACTTTAAAGTTGTAACATTACGTCATAACAAGGTA TTACAACCGAAGAACGAAAAAAAATGAAATAGAGGAAAAAAATCTTCATT TCTTGGCTTTACATATAAGCTCGAAAAATTATAAGAAATCAAAAAAAATC ACTTTGCTCAATTTTTTTGTCTATAACAACAGTGTTATGATATAAATGTT TTGTTATGTTCTTCCAGGATTTATTCTTATCTAGTTCTTCCAAACTTCCC TCTTTGATTCTTTTTCTCTATATTATGGAAGCTTGTTAGTTGACTATTCA TCTCTTTTCCTATATTTCCTTTATATTTTGTTGTCGATGTTCTTCTTCTA AAAATCTTCATTCCATTCCCTCTATTCTTCAGAAGATTTTTTTTATAAAT ATATATTATTTTTGTTTTCTTTCTTTATTTTTTGTTCTGTACGGTTAATA GAGATGTATGGGAGAGATAATGAACATTAAACAAAATTGTAAATTATATA GGGGGAGAAGAAAAAGGCTCTGTAAATAAACTGGAAAAGAGTAAGGATCA ACTTTTAGCTTACAAAACATTAAACGCATATCTTTACAATCTTTTACAAC AAGCTATACCATTGCATGGCAAAGATTATCACTAAAGTGATTAACATCGT GTCTGAGAGCCATTCCAGAGTAAAAATAACCATGTCTGATGGTTTTGGTA TTTAAAAGTTCAGGAACTTGATTTTAAGGGGTGTCTTCGATTAGCCGTTT AAAAGTTTCTGCTTTGAATTTAATTTTGTTGTATTATTGGAGGATTTGAA GCTGTGATCAACTTTCCTGGATTGAATATTACACTCAAGACTCATTTATT ATGGTACACTTTGAAATATAGACTTCAATCAAAGAAGCTCTACTTGCCAG CTTGGATAAAACGTTGTTTTGACATTCATTTAACGTTATACGTTAGTTAT CGACGTGGATGTCATTGCAACGTTTTGTGTCAGCTTGGCTAATTTATATT ATGCGTAAAATGACCGGGTTTGAAGAATAAAAAAGTTAATCAAATTGGAG TAGAGCGATAATATTTAAAAGGAAAGTTGATCAATTAAGCTTTATCAATA GTTTGGATAATTTCTACGAATGAAATACCGATTTTCTTGAGTAACTTATC ATGTTTTACAATGCATTAAGGTCAACTTACTTTTGTGTTTGAGATTATAG GTGTTTCAGAATAAATTTAAAGTATTAAAGCGATGGTTGTTTTATGTACT GTACTACCTGGACTTTTAAACTATTTCAAGGTCAGCTCACACATATTTTT GCCTTAAGTTCAATAATGTTTTACCGATTGTCATGTATTACCTCTCACCA TCTATTTAGGATAAAAATATTTCCTGGAGATAAAAAAGATACGAACATTA TAATATATAAAGAGGATCATTTTAAATCTTGATCCAGAGAATTTTTTTTT TACATGTATCTGTTTGTTATGCTAGAATACACTTGATGCGAGTGTGTTTC AGAAAAAATACTTGGTGGTAATAATAGTACAAAGAATGCTAGTAATTTAT CCATAATAAATCGTTGTAAATGGTTTGTGAAGGAGATAGACAAGACAAAG TGATTTACTATCCAGAATTGGTGATCTGGTTATAATAAAGCTGGGCAGCA GCAAAAAATCATTTATTTTATTATTTTAAACAAGCAGAAGAAGTATAATT TTGATTGGTTGATAGAGTTGGTCACGTGTTTATTGTGATAAATAGAAAAA GAATAAGAAAATTAAATCAGAAAGAAGGTGTTCGTATAGAGAGAATGAAT TGATTTTGGATGACACTTCGACCGCTCACTTGGACACAGAACCGACATAA CAAATTTCAAAAAACATACATGACATTCACTTTGATACATATTGTTTTCT CCTGATTCATCATTGATCACCCTTAATGATCAAATCATTTTTTTTACATT CATATTGAACTTGAGGAGCAACACACAGTTGTATTCATTTAATTTTGTAA AAAAAAAACTTTTTCAATCGAGTATTCAATTTCTAATTCATCTATAAAAA AATTGTGAAAAAACAATGTTTTACCATGTCGCTAAGGAGAGAAAAGATGA CAAGAAAACTCGAAGGGACAGATCTCGTATCTCTAGTGATTTTGAAAATT TTTCAGACATGGAGCCTGGACTATGGGGTCGTACAATCCATAAGGACCGT GCACGAAGTAAAAGTCCTCGCCCAGGAAGTGGGTCACGGTCAAGATCACG TGGAGCTAGAGACTCTGTTTTAGACGGTGATTATTATCCGGACGATGAAA CAATTTCGGACGGCTATCGATCAGATGAAAGTGAAGAAGAGCTTGATGAG TACATTAACGTACCCAATTGCATGCTTGGACAACCATTAAAAGATTTTGA TAGTGGACAAGAAAAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036340XLOC_036340Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1575043694:30029..30389TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1575043694:30029..30389Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1575043694:8174..8433TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1575043694:8174..8433Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1510915933:30029..30389TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1510915933:30029..30389Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1510915933:8174..8433TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1510915933:8174..8433Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1491911889:30029..30389TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1491911889:30029..30389Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1491911889:8174..8433TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1491911889:8174..8433Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_294supercontigscaffold_294:8174..30389 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.086111 0 0 0 0.221274 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.74792 4.36268 0 0.153127 3.3785 3.15691 5.7571 11.9511 12.1652 7.50801 3.64092 1.13748 0.632499 0.291164
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00057620 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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