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transcript sequence >TCONS_00057620 ID=TCONS_00057620|Name=TCONS_00057620|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=621bp AAACTTTATATAATGTAGGGTTTGTAGAGCTGCCACAGAGATTGACTAGT TTATATCATGTAAAACATCCCAAGGATAGGTTATTTTATGGTAGACTTTA TGCTTGACTTTGGAGAAACGAATGAATTTTTATTGAGGAAATATAATAAT ATTCGAACCTTGATGTTTGAAATATTACTTTTTCATAtgacattttgaat ttgacTACAAGTTTAATATTATCAAAGAATCGTTTGGTTTGGTTGGGTTT TCAAACATAAAGCTTTGTAAGCAATCATGCTTCGGGCAGGAGTGCCAAGC TTCTTGGTCATTTCACGGAGCcgagaaaagaaaataaaagagaaagaatt tcaagaaaatgACATGGAGCCTGGACTATGGGGTCGTACAATCCATAAGG ACCGTGCACGAAGTAAAAGTCCTCGCCCAGGAAGTGGGTCACGGTCAAGA TCACGTGGAGCTAGAGACTCTGTTTTAGACGGTGATTATTATCCGGACGA TGAAACAATTTCGGACGGCTATCGATCAGATGAAAGTGAAGAAGAGCTTG ATGAGTACATTAACGTACCCAATTGCATGCTTGGACAACCATTAAAAGAT TTTGATAGTGGACAAGAAAAT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_294:8174..30389- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00057620 ID=TCONS_00057620|Name=TCONS_00057620|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=22216bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_294:8174..30389- (Clytia hemisphaerica) AAACTTTATATAATGTAGGGTTTGTAGAGCTGCCACAGAGATTGACTAGT
TTATATCATGTAAAACATCCCAAGGATAGGTTATTTTATGGTAGACTTTA
TGCTTGACTTTGGAGAAACGAATGAATTTTTATTGAGGAAATATAATAAT
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CTTTTTGCTTTTCTGTCAGAACCATTTTTTACTTCACTGTCTTTTCTCCT
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TTCAGAAATAAAGCAAAATGCTTTAAAGTTTATCTGTCTGAAATCGTAAG
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GATGCCGGGTATGCTCGAGTCATAAGGGTTCCTTTTTCACACCCTCGTGT
CAAGTCCTTCAAAGTGGTACAAAAACCATTAAAAAGCAATTGAGTCTCTG
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ATTCCGATTCTGGCTTACTGTACTATAAGAGTCTCACCAAAGACTTGAAA
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CCTAGCTCTGCAATACTTTGACTGTGTCCTTAGATTTTTTTGATAGAATT
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TATATTTTACATAAATAGCAGTAGTAGGTAAAAGTAATCTAAGAGTCTTT
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TCGCCTTTCGAAAAGTTCGGTTCACCGCCTCAATATATATTTACGCTAAT
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TCGAGTTAATTTTTCATTCGTCAGCCTACCAAAAACAAAGTAAAACCCCT
GTATCTATGAACTGAACGGGATGACGGAAGGAGCAAGGATTAGAATCCAA
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TCAGCCCTTAAAAGTGACAAACAAAATGACATATTAAATAAAAGTAATCA
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GATGTTTAATGTGCAGCTCCCCATCAACTTTTTTAAAATACACGTTTCTT
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AAGAACAAGTTAAGAATATTATAAGGCTTTGCAGACTCTAAAATGGCCTT
TTTTCTTAAGAAAATGGACAAAAATGCTCACACAATGTTGAAAAATAGAA
CATGTTAAGAACATTTTGAGGCTTAAAACTCAAAAAGTTAAGAATATCCT
AAGGCTTCAAAATTTTTGGATGTTCTTATAAAAAAAAAGTGTAGGTCAAA
TCCCTTTTTCCCTAGAAAAAATTAAAGTAGCGTTCAAAATATTCTTTATT
AAGCTAAAAACTTGAGGACAAAGCAAGCATGCTGATGACATTAAATAAGA
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AAAGTTTAAAGTGAAGAAGTTTTGTTTGAAAAAAAAAACAGGTTAAAATT
GAGTGGTACGATTGTAAAATTAAAGTGAATAGTCTTAAATTTTTTTTATT
AAATTTAAAATATTTTGTCATTCCATTTTAATTAATTACATTTTGTGTGA
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ATGCATATAGGTAGGCATAGTTTTTCTCAATCAATAAAGACAAAATTTTC
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TCAGTTAATTAAAAGAAATAATTAAAATATTCTAAAAGTCCCTATCATTT
AAAGGCATAATAATTCATAGTTCTTCTCATTCGCCTAATTTTAAGAGATT
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TAATTAATCGAACCAATCGAATGGTATTTTCGAACTTTGTCGAACTTAAT
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TGAATATGACAGACATTACCAATAAGCCAGCACCAGACACAGCATGACAA
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ATTGACCAATCAGAATACGAACAAACCAACTCAAGCAGTTTTATGGGTGT
AGACTGACCTTAACAATGGATGAATTGCATTGTAATTCATAAATCCAGGA
CATGGTAAGCTTGAGAGAGTTTTTGGAGAAGCTATAAAACAATATGTAGA
GCTTCCTTAACCCTTATACCACGAGGGACACGTATATGCTTCCAAAACAA
GCCGAAATACTGAGTCTCAGACTTGAGGCAATAGCTCCTGATTACTTGAT
TTAAAGGCTCATAAACCGAATGCTTTTAGAAAGAGTATACAAATAGCTTT
CCAGTGGTACCAAAACCATCTTCTAAGTCAAAAGCTACAAGCTTTTATGG
CACTTTAAAGTTTTGAATTTCAAAAAAAATAGCGCGCATAAGGATTAATA
CCGTTTGGGAGGGCCTTAAATGTTTTATCACTTCCATTTTATGGACGTTC
AAGAAAACAATGTGGTAGCCGCAGTCTACAGGGAAAACACCTAACAGGTC
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AACCTAACCTAATATGAATGAAATAGAAAGTTATTGGAGCCAGTTGATCA
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CCAGGTCTTAAGTGAATGTTTTCATAACGTTTTTGAAACCCGTCTTTAAT
TTAATTTGTCTTCAGTTATGTTTGAGGTTTAATACAGGGATTAATCTGAT
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TGTTTAAAATTCAAATCGTTTTTAAGAGAGTTATGGGAGAAACTTGCCAA
CGGCATCGAATTATCCACGCTGTCATCGCTAAGGATTTATTAAAAGTAAA
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GTTCTTATAGGAGTGTTATTATATGATGAAAATATGAAAAGTGGGTTTGG
ATTTTATATGATTTTATCTTGTGTTATTAAAATATAATTCCATATAAAAA
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GAAAATCGGTATTTCATTTTGACTTTCGATGTGAACAAGGCGATGTTACC
CAGCAGTTGGTACTCATTGCTGATTCAACGCTATAAGTTTAGCTTCAGTA
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GGTGTATTTCTAAACTTAAACATGGCTTCCATCATTCAAATCTAATTTTA
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GTTTTCAAACAGAAAGAATTCAGACATTATCCATAATAGTTTATTTGTTA
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TCATCATGATATTTGATATAGAATAGAGTGGAGTCTCTATAACTCGAGCA
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TGCAAACAGGAAAAACGCAATGGTCAAAAAATATCATACACATTTTCTTT
TCTAAAAGAGGCTGTTTATCTCATACTCTCAAAAATGAAAATAATAGTCT
GATTTTGTTTTCTTGATTTTTATTTGATGTGAAATCACATTGAAAGATTT
GTTTGTAGTACTTTAGTATTCAAAACATGAGTCAAAAGTAAAGTGGTCTC
TCTTCATACTCTTGAAAAATAAGGTTGACTATGTCATTTGGCTAAGTCAA
GAATATTTTCATTCTCTCATGATGTCGTTTTATTGGAGTGCTGTGTTTTG
TTGTGTTATGGTGATGTTTATATTTTGAGAATTGATGAAATATAGATTGA
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GCTACGTTTACACACAAGTGAAGAAATGAAGAAGACTTATAAGAAAAATC
TTACGTAAAAAAAGGTCCCCTAAAAAATTTGGAACGTTTTTTTATGGAGG
AGGGGGAATAAAAAAACTGAGTTATAATAAGACTTATGTCAAGGGGGAAT
TTTTGTTATAGGATTACTGAATTGTGCTGTTTTAAAGAAACCGGCCTTTA
TAAATATTTTGAGAATCAAGCTCGCAAACATAAAGTATAAAAACCTGTGC
GGTTTTTATAGTCACTATACAGGGCCTTATAAAAGGAGAAAAACAAAAAT
AAAGATTATAGTTTCCTTTTTTTGTTATATACTATGGACTGTAGAGCAAT
TTACTATATGGATTTTGGTATATATTGTTGACGTTCTTGTTTCCGCTTTT
TGCATTTATATACCAGGAGCAACAAAATGCTTAACTATGGGGGAAATGCT
CATTTTCTTTATTAAGTGAAATACTGGACGTGTTTTAAAATAAGTGATTT
TAAACAACAGGAATAATTTTATATTTTAAAGATGATTCTTGAAAAAGTGT
TACGCTTTGAATAAAATCTATTGTAATGTAAATCAATCTCCTAAGTACAA
GTACAGATCAAACATATGCTGTTTTCAGGAAAATTGATTAATGTGTGGTT
TTTAGCTTGCCAAATAATTATTCTCAAAACAGCATTTGTTAAAAAATAAA
TTTTATTCAAGAAGTTAATTTCAAATGGCAATTGCAAAACTTCTTCTTTT
AACACGATGAAATAAAATTTATATGAAGAACTTTTTAAAAATTGTATTCG
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TATCAATTTTGGAATTTGATACAGTGATGTATGTTTGCATTTGGTCTCTA
TTTTCTATGGTCTTTAGAAAGTCTAACAAAAACTCGAATCCACTTCAAAA
AAATTTTTTTCTCACCTCATTATAAAAATTCCAAAAAAAACCATTCATTA
TTACGATTTATAGGGGTAGCAGTCATTTTCTGATGCAGCAGTTTTTTTTT
CTCACTAAACCCAAATAAATTGATTATCTTAACATTACTGATTTTCAAAA
CGAAATTCGTTGCCTTGTGGGAATCTTTGAAAGAGAAGAGTACGAACGTC
CTAATTCTGAAACATTGCCATTTTTAATATTTATCTAGGTGCGATTCTCA
AAATGTTCCTCTTCGCAATTCTTTGTGATTTATATAGGGTAAGGACCACG
AATTTACAATAGAAGGACTACATTGCGGTAAAATACGGTAAAATGCAATA
AATAGAGAGAGGAATTCTTTTTGGATTAAGGAAAGTTAGCAACATATATT
TTTTCTTTAGAGATGAAATCTAGATTGTTATCAGGATTTCAACTATTTGA
CTTAAAAGTCATTTAATTTTTCAAAGCTACACTTTTAGTCATATTTAGGA
TGTTTTTCCAAAAACCAACTCTAAATTCTCTTTGAACGAGAAATACCGTA
TTTTCGAGTTATACGAAACTTCAATATACATGATGTAAATAGTGCGGAGG
AAAGAATTAATATATTCCCTTGACGGTCCGCTATCTTTGCTTTATTTTCA
AATAAGAGTTTTTCCATCTTTTTGAAAAATACTATCTAACTCTATGTTGT
CCCATACTTAAAGATCTTTATTTTATTTGACATTGATCTCTTTTAAAGAT
TACGTAATGTTTGTGGCCACCTCTTGATTAAGTATTCACTGCTTAATCAA
TACAACATCACCTCGAACATTCTTCTCCCTTGTATAATTCATTTTAAACT
ATATTTTCTTGGTTTTCAGGTTATAAATCTCGGCCTACTTTATATAGAGA
AACATGGGTTTTTTCTTTCTTAAAGTATGTTATATTCGATAAAATGTTTT
GCTGTGAAAAACCTTTCAATGGTTTTGAAGTAATCTTGCAAAGGTCACGC
TAGTGCTGGGAGACTCTTTACGTATGTACGTAGCATTAAGTACATGTAGG
AGCTTTGGGTAGGGGAGCAAAGGCTTTTGCCCTTCTAATAATTAATTGTT
TGGAAGAGCCAGTGTAGCAAAACCTAGCTATCCTTCCTGTGGCCTAGCGG
TTACTTTCTAAATCATCTGAATGTACTCCACCAAAAGACTTTTTAAATGA
GATTTTAGATAGCGATCTTTGGATTTTGATAAGCTCGTTTAAGACCTTTT
TTAATAGCTTTTAATATGTCTCGAAGTAGAATTTAAAAATCCAAACTTTA
CAGGCTAATTAAAAGATAAAATTGTCAAATAGTTTTTCGATTTTTAGTCG
ATTAAGAAATCTTAATCGATAGAGAAAGCTTATCTGTTAGGGATTTCGTG
TGAGGGTCTCTTTTACATATGTCAATGTTCATATTTTTTTTAGTCTTGAT
GAGGTGATAATTAATGTTTATTATTTTGAGATAACAAACAGCGTAAATAA
AGAAAATAAACTCGATGAGTCGAACACTGGTCAAACTGTCAAGTCAAAAG
TAAATAATGGATTAAAACAAAAACAAACAAAATTCTACCTAGCTAAAATA
AACTTGTCTGTCTAATTTCGTTTTTCACTTGACTTTTTACTTAAAACATA
CTTATTTCACCAACAAGGGAAATTTAAGGCAGAAAAATGGGCGTTAAAAG
TAAAAATAATTCACTTAAAAACTTAGAATTGTCCACTCACTTCATTGAAA
AAGATAGTCCCTTGATCAGTTTTGTCCTATTCTCGGAATGTAAAAGGTAA
AACAAAAGCAATAGGCCAAATTCTAATAATGTTACAGTAATCGATTGGCG
TTATCATCCACTACTTCAGGACTCCGTAGAAGCGTCAATACAGAATTGTG
TTCTGAAAATTATCAATTCATGTGACAAATTTTGATGTTCTTTCTTCTTA
CCTGGCTAAATTTTTTAATTCTTTGAACAGACAATTTGACCTAAATCGAC
ATTTTTAAGGAGATTAAGCTAAAGTGGGAAAGAAAAAAAAGATATTATTT
TTATCGAAGATGTGGAGACCTACTTCAAAACCTCTATATCAATGGACAGA
ATATGACGTATACTTTAGAGGGATTAAGTTGAAAGAAATTCGAATCTCCT
GATTTTAAAGAAATTTCCGATTGATCATCTGGTGTAACAAAAATAAGTGG
TTTAAAGGAATAATTGAATAAACTGTCAAAGTCATGATAATAACGAGTCT
TAAATAATTTCTTTATAACAGTGAGTGAGCCTTAGTTGCTCCATAAATGG
AGGATTTGCACTTTGAGCATAAAATCAGAGAAAAGCTTTGAAAGGACTTC
CTCGTAAATTGAATAAAACAATTTTAAAACGTATCATGTATCATTCTAAG
CGTTAACGTTAAGAACCTTAGAGTATCCATTTTTTAAAGGATCCTTAAAA
GCCAAATCTCTTTATCATTCTAGACTATGAACCAAATTGGTCTCAGTTAC
TAAATATGGCACATATCTATAGGTTTTATTTTTTGATAAGATCTTCATTT
TTCTCATTTCAAAATTGACGTCATATTCAGTCAATCGAATCTCCAATAGA
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TTTTCGAGAAATATCACGTGGGTTGTTTTATATATTCAATATGAAGAAAA
ACATTTTAACAAATTAAGGTTTTCGCTGGCACGTTGAGAATAAATCAACT
GGCTACGTACGAGCAACCAATTAAAACCAAATATTAGTCAATTCACTTTT
TTTACAATATCAATCGATTAAGGATAATAGAAAGTAAAACGAAAATTCTA
CTCTTTTACAACTTTTAAAAGAGCATTTGGAATAATATCAATATGGCTCA
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AAGCCTTACAATCATTCAGTTTTGGAAAATGTTTAGATAAAAGAAATTGG
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TACATTAACGTACCCAATTGCATGCTTGGACAACCATTAAAAGATTTTGA
TAGTGGACAAGAAAAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1575043694:30029..30389 | TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1575043694:30029..30389 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1575043694:8174..8433 | TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1575043694:8174..8433 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1510915933:30029..30389 | TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1510915933:30029..30389 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1510915933:8174..8433 | TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1510915933:8174..8433 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1491911889:30029..30389 | TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1491911889:30029..30389 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1491911889:8174..8433 | TCONS_00057620-exon-scaffold_294-1491911889:8174..8433 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_294 | supercontig | scaffold_294:8174..30389 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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