TCONS_00064436 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00064436
Unique Name	TCONS_00064436
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2088

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at scaffold_415:300702..308006+
coding sequence from alignment at scaffold_415:300702..308006+

transcript sequence

>TCONS_00064436 ID=TCONS_00064436|Name=TCONS_00064436|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2088bp
TAATTTagcattacgtcatttttccaatggaaatttgaccaaaattatCA
CACAACAGTTGATGACCTCTCACACAACAATCGGTGTCACAACAATTCCA
ATGggaatttgaccaaaattatCACACAACAGTTGATGACCTCTCACACA
ACAATCGGTGTCACAACAATATTTAAAACATTATAATGCATTGGAAATTA
AAGTCAAAACCATTTTCAAAACCAAATGAATAgaaacaACTTTATTATAA
ACTCGTTCCATCAAGGATTATCCTATAAGGAAATTTTGGCCTGTCTATTG
AAGTCATTGAacttggttttaagCTTACGACAACTAAAAAGAATATTGCG
AGATAACAACTTGCGACGCAGAGGAAACAACAATCAAGTGGCCATTGTAA
ATGCTATCCAGTCAGAGCTTCGTGGAGATGGATGTAACCTTGGTTACAGA
AGCATGCACCAAAAATTGATTCTTCGCCATCACCTCAATACATCTCGGGA
ACAAGTAAGATTGTTATTGCTGCACTTAGACCCTCAAGGGGTGGaatcaa
gaaaaagaagaagattgaGAAGAAGAACTTACCATTGCAGAGGACCAAAT
GATGTATGGCATATTGATGGTTATGATAAGCTCAAGCCTTATGGCTTTGC
AGTCCATGGTTGTGTCGATGGCTACTCAAGGAAAGTGTTATGGTTAACTG
TTGGCTCAACAAATAATGATCCAGAAATTATTGCAAAGCATTATTTGGAT
TACGTATCAGAGATTAAAGGAACTGCAAGACGAATTAGGGCTGACTGTGG
AACGGAAAATTCAAATGTTGCTGGAGTGCAGCGGTTTTTCCGATTGCATG
CGGTAGATGAAGACGACAATTTTTCGGGTTTAGAAAGTTTTTTGTATGGC
AAATCGACGTCTAACCAGAGAATAGAAGCATATTGGAGCAGGCTTAGGGG
TGCTGCATCACAGTTCTGGATTAATCTTTtcaaaGACATGCGCGATGCAG
GAGAGCTAGACGAAACAGATGATATCTACAGagaCTGCCTTCGATTCAGT
TTTATGGGATTGGTACAACAATCTTTAGATGATGCAAGACTACTGCATAA
CACACACCGAATTCGGCCATATCCTTTGCAAGAATGCCCAAATGGGAAGC
CAAATATCATTTATGGAATACCAGAAGCTTATGaCACGGTAGACTACAAA
GTTGAAGTGGAAGAAGACGAAATCGGCATCGCACGAGAAGTGACAAAAGA
GCCTTTGGAATTAGGATGTTCAGTTGAGTTTCTCGAACTAGCTAATTTTA
TAATGGAAGAAGAAGGCTTACAAGCTCCGGAAAATGTTGACGAGGCAAAA
ATCCTATACTTTACCTTAACTGCGGTCATTCGTAATGGGCATATATAAAG
ATATTGGTTATTTCTGCAGGCTCTAATATATTGATAGCTATTTTCTGATA
ATATAAAGTAATTTAATTGTGATCCTGATTGTAGTAGTACACATTGTGCA
TAATATAATAAAGTTTGAGGAAAATTTATTGCTCAAGAGGCGTAAGGAAA
TACcttaagtgtattaattttggcgggtacttaatttggtggattggaaa
atttttggcacttggaaatcaaaaattttaatggttttaacttaaaaatg
gtgtttttcgatagaatttctatcctaaaaagattttgttaaatttgacg
ggtatttaatttggcggacggccaatttttaaaattttggcgggtattta
atttggcggattttaaAATCCGccaatttaatccccgccaaaattaatac
acttaGGGTATTTTTGGCTAGCATGTTCTTAGCTATATaacaatttaaaa
actttttgggCATAATCTGGCTTCGTCGTTACAGAGATGGAAAATGTTTT
CAGGTAGATTGTACAAAATTTTTTCCACTCAAATATTTAacgaaaaatct
aattttttcgccattttgatgacgtcaaagGAAAGTGCTTTGGAGCTCAA
ACTTTGACCGATGGTCATTATCAAGATTTgaatgagaaaaattaaaaagt
tgttcaaaaaattgatgacgtcaggaATTGCTTAAAAA

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00064436-protein

>TCONS_00064436-protein ID=TCONS_00064436-protein|Name=TCONS_00064436-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=390bp
MNRNNFIINSFHQGLSYKEILACLLKSLNLVLSLRQLKRILRDNNLRRRG
NNNQVAIVNAIQSELRGDGCNLGYRSMHQKLILRHHLNTSREQVRLLLLH
LDPQGVESRKRRRLRRRTYHCRGPNDVWHIDGYDKLKPYGFAVHGCVDGY
SRKVLWLTVGSTNNDPEIIAKHYLDYVSEIKGTARRIRADCGTENSNVAG
VQRFFRLHAVDEDDNFSGLESFLYGKSTSNQRIEAYWSRLRGAASQFWIN
LFKDMRDAGELDETDDIYRDCLRFSFMGLVQQSLDDARLLHNTHRIRPYP
LQECPNGKPNIIYGIPEAYDTVDYKVEVEEDEIGIAREVTKEPLELGCSV
EFLELANFIMEEEGLQAPENVDEAKILYFTLTAVIRNGHI

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_415:300702..308006+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00064436 ID=TCONS_00064436|Name=TCONS_00064436|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7305bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_415:300702..308006+ (Clytia hemisphaerica)
TAATTTagcattacgtcatttttccaatggaaatttgaccaaaattatCA
CACAACAGTTGATGACCTCTCACACAACAATCGGTGTCACAACAATTCCA
ATGggaatttgaccaaaattatCACACAACAGTTGATGACCTCTCACACA
ACAATCGGTGTCACAACAATATTTAAAACATTATAATGCATTGGAAATTA
AAGTCAAAACCATTTTCAAAACCAAATGAATAGTAAGTATTTCTTGTTGC
AAATTGTTTTGGTGAACATAATGTGATTTTTTATTGGGTTAGCTAACCCT
TTCGATTTACACCAGTACGTACCAgcaattataaaaaatataaataaatt
tggTTGTTTGTgacaattttgccaaaaatttttaaaatgcgTCCACTGCA
CTGGACTGCACTGGCATTTGGTCAggcttaaaaaataaatttgactgACT
GACTGGACTGCTCCAGATGTGGATTTCGCTAGCTAtcgacacgctttgct
ctgtacgatttgatttgaaatatcacgtttgttttcacccatccatTTAC
GTTAGAGctgcgtggtgggcagaaaacaatcacgatCTGCTCTCAGGTTA
CAGACTCTGGGCTGCATTCTTTGAAAGTAATACTCTTCAGaccattttat
ttttgattttttaacaaCTGgcatttattttaattttttttttcaggaaa
caACTTTATTATAAACTCGTTCCATCAAGGATTATCCTATAAGGAAATTT
TGGCCTGTCTATTGAAGTCATTGAacttggttttaaggtttgttttACTT
ATCcctttttaaatgtttctttttaaaatatattagaccttttttcaaag
aggacgtcctgttgaataattatgtagtccagccataaaaacaatgataa
agccatgcataattactgtatcatgcatattgtaataattatgcatggtt
ttatcattgtttttctgctggactacttaattattcaacagggtggcggT
CCTACGGACTCGAACAAATTACAATTTTCTCCTTGTTACTCGACTCCTGA
TAAATTGTTAATTGTATGACCAGACGTGCAATTACTGGTTAAATCATCAA
GTTGATTAGACCAAAGACGTGTAACTAGGTGCTTGAGGAAGAAAGGAAAT
GTAAAGAAGGGACaagcttctcaaaaacaaaatttatttcactgtTTTAC
TAATTATGCATATCCATGTGTTATTGTTTTATTGCTGtagtttttaatta
aattttataTTGAGAACTGCAAAACGCCTATTTAGAGTTGATTTTTCACT
TTCTGTATTCAGCTTATGCACCTTATGTAGAGGTATCTAAAAAAAAAGTG
ATTTAAGTGGGAGTGAAAGGATGGAGAAGATGATAGATATctacaagaaa
aagaaataagatTTGACCTGGAATTGGTTTAaataaaacaaagattttga
ccCAACTGTTTATTCTTAATCTTACTCCAACTtatcttatttattcaaaa
atacctccagggtaatcttccatctgatgtcctatcaacacttaattttg
gtgaaattgatcacaaaactggcaccaggggcaaagctattaaactacta
aaactttcaacggtcaaaaccacaaattttggacttaactctttctctcg
tctttcgtcaaaacaatggaatgagttaATAAATAAAGTTAATAactaat
aaatcatcctgacaCTGATTATCACAACCTTcttgatactgatgaactaa
aatctttagctacaaaattctatttagacaaatacaaagctgaagacgaa
taatctttgtgtgtgtgcGTGTATTGTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNGTGCGTGaacttagtgtgttttcccagggtgggaggg
ggtgggtggtgtaacaggaagaactttataaataaaactactcaaagaaa
ttgtcattaaataaaactaaaaatgtttcttatattcattattttgtgtc
actattaatattatgataatcatttattcattttttctttagttctgtat
aattttttagtttcttctaggttccccatagggtttttttgtaaggggtt
atcctgctgtgttgcagcaaaaatatattcaattcaattcaattcaattc
attcCTCTATGCCTCCATGActtacttttttattcttttttattcttttt
tatttttgatgcaTAAAGTTAAAAAGATTATTCAGAAATAAAGTATATAC
AATATACATAATTATTACACTTCATAGCTTACGACAACTAAAAAGAATAT
TGCGAGATAACAACTTGCGACGCAGAGGAAACAACAATCAAGTGGCCATT
GTAAATGCTATCCAGGTATAATAACGATATCCATAATTATATGCTCTCAA
AACTATGAGTGTGTTGATAAAGTGATTCAGGCAAAAGTAGAatgttaaaa
ttcaaatttactttCTTTAATACAAAATCGAATATATTAATTATAATCTC
TATTTACCTTTAAAAACTGAAGTGTATTTTATATATGTTAAACAACAGCT
TTTATTGCATGCCCCCTCTTTCCAGTCCTTAATGTGACTTAGGATGTGTA
AATTCTTTCACgtcaatttttaacttttaaaactAGAAAAAGTAATTTAC
TTTCCTTCCTAGTCAGAGCTTCGTGGAGATGGATGTAACCTTGGTTACAG
AAGCATGCACCAAAAATTGATTCTTCGCCATCACCTCAATACATCTCGGT
TAAGCCACATTTTAATTTacctatctatctatctatctatctatctatct
atctatctatctatctaatcTAGTTTGTAAATAGAACTCTGATCACTACA
ATAATATTTCGATGTTTAGCAGATCTTTTGCCTTTCACTAAGTCATCATG
GTTGAATTAAAATTCAATACTGTAATTATAATCACAAACCTGTCCATTAC
CATTACCAGCATTACCTTTTTCTGtggattcaaatttctttttggttggt
tttaattgaattttaaaGACTAGATATGGCCATTATGGtcatattttgac
attttagtcccAGTAATTTCAAAACTAAACTTCAGTTGTATAACTAAATG
TCAGTTGTATAATTTTAGCTATTTATTTCTGTAGGGAACAAGTAAGATTG
TTATTGCTGCACTTAGACCCTCAAGGGGTGGaatcaagaaaaagaagaag
attgaGAAGAAGAACTTACCATTGCAGAGTAAGGACTTAAAAAAtcgttg
gtttgccgtcacccaaccctagattttggagctGGGTTGGTCGGtcggaa
tttatttttattttagcgattatgaaattttcggccatggaagggttaac
agtttgtttacatttaggtaatttggaataaaaaacagtttttagtCCAG
CCTAATGTTTATGTCATTTTATGGAACTTATGTTATGTACTAAAAATGAA
ATCTCAAACCAAGTAGAAATTTCAAGCTAATCTGAGCTAATTCATATTTT
AATTCAAAGATTGTACactgtttcttttttttatttcttttgtgtAATTA
TGTTCTGACTAAATCTCCTTTTTTTCAGCCATCCTACTCACCCTAGCCTC
TTTCAGTCCGTTGAAACCCACATTGGTAATGGTTTTGCCATTAAAAAAAT
AGTCTGTAAAATAGGTCAAAATATGAGTacagcttgaaaaaaaattgtac
aaatAAGTTTTctaatgttttgtaattttttgagaattcatTTATAGATT
TGGGGCTTAAGCTTTAAGGAGctctctgaaaaaaaaatttgccctgccCC
TACCTCTGGTTGTGACAGTTTATAATCACACAATATCTTCCAGTGAGATT
TGATTTACAAACTTTCAGTGTCAAAGAAACGGTCAAGATCTTCAGTTTTT
Ctatctaaaatttttttccaaagaactttttcctttaaataaattcaacg
atttagatttttttctttcatcaaGGGACCAAATGATGTATGGCATATTG
ATGGTTATGATAAGCTCAAGCCTTATGGCTTTGCAGTCCATGGTTGTGTC
GATGGGTAAATTAAATATGATTAATGATGATTTAAATATAATGATGTGTA
TAAAAgttaaactttaaactaatcAAACATTCATTCACATTGGCGAAGAT
GAAATGTTGAACTAGTTTACTCTAAATTTTAAAAGGGACTGGTTTGTTTA
CgatcttttaaatcaaaaatatagGCATAGAAGTAATTACTCTgggctat
tttgaaaatatcagCACTCTTATTATTTTCAGCTACTCAAGGAAAGTGTT
ATGGTTAACTGTTGGCTCAACAAATAATGATCCAGAAATTATTGCAAAGC
ATTATTTGGATTACGTATCAGAGATTAAAGGTAATATACTCCTCTAGAAA
TAAACTTGAATTGCAAATGAAGAAGAGTGAACGATAAAGCTGGGTGTCCa
ccgataaaattttttttttatttataatggaacaaaaaaaatgcacgata
gggaaaaaaacttttcttcattCCCTATTGCATATTTGTCGACCCTATCA
GGTAAAACATGAGCATTTTGTTCTGAAAATCTGTGTGATCTTTGTTTCAG
AAGcatgtgattttttatttgtgGTGAAAGAATGAATTACTTTTTTGGTG
TACACAAGcttaacaaacaaacaaaataacacAAATCTTTATGCATTACA
AGGATCGAACTCTTTTCAGCACTCAGTTATGACGTTTTTTAAATCAGCCA
CACTGATCATTATGAAATCTTTTATTTAGGAACTGCAAGACGAATTAGGG
CTGACTGTGGAACGGAAAATTCAAATGTTGCTGGAGTGCAGCGGTTTTTC
CGATTGCATGCGGTAGATGAAGACGACAATTTTTCGGGTTTAGAAAGTTT
TTTGTATGGCAAATCGACGTCTAACCAGGTTAATAATTGtgtaattcaaa
ttttcttcagTTAGggcatttccaattttttaaagccACCTAGCTTTGCA
GTTCATTCGTCTTCTAATTAGTTCCAATCTATTATAGTAATCTGACTGAT
CAAATATTTGTTGTTTTATTCTTGCACGTGTGAAATGGCAATTTTCTTCA
ACAAAAGACTTAGAAGTATATTATAAACAATACAATACTTTCTCTAACTT
GAATAGCTAAGACATCGAAATATTTCTTCGAATATACGTGAAATTCGTGG
TATAGAGGGGTCGTGAAAAAATCCAGCATTTACAAATTAATAACTTCATG
TATTTTCCTCTTTGATAATTTGGTTTAAGGCAAAAAAGATGTGGCATTAT
TTTGATaaacttattttcttttatagAGAATAGAAGCATATTGGAGCAGG
CTTAGGGGTGCTGCATCACAGTTCTGGATTAATCTTTtcaaagtaaaata
tttctttaaattaCATTTCAAAAACTCGTGATAGAATTTTACCAGATCAT
TAAAAATCGTTTGGTTGGAAGCACAAAATTTGACCTTGCAAAAAGTTCGC
TTGACTTGACTGGGTACTGGGAAATATCTGTGTGCTGGATGGATCCTTTT
CAGATAATTGTTACTAGAActaattttttaatgttttgctTCTCTAAGTA
AGGGATTGTTGCTTGTTCAATTTTGCACGTAAACAATGCCAATACCAGTT
GTAATTAATTATTTGcccatgtcgaaatttcttcgctttgcaaCCCCTTT
CGCGTTGATTCTTTTATTATAGGACATGCGCGATGCAGGAGAGCTAGACG
AAACAGATGATATCTACAGGTATTTTTTAGTCTTAACCAGTAACAGTCAT
TTCACTCTACTAAATACGCTGTGGAATATGTTCTTTAATTTCTGATATTT
CTTCAAATTAAAGTAGTGGACCAGACAATTAATCACCGCCACCTTTTGAT
AGACTTCATAGGTTCTAATTGGTCATACTAGCTTGTAGTAATTTTAGATT
CCATGGGGTTTACATATTGAAGCAGTCAGGTTTGggtatttattcatttt
tcaattttagagaCTGCCTTCGATTCAGTTTTATGGGATTGGTACAACAA
TCTTTAGATGATGCAAGACTACTGCATAACACACACCGAATTCGGCCATA
TCCTTTGCAAGAATGCCCAAATGGGAAGCCAAATATCATTTATGGAATAC
CAGAAGCTTATGGTTAGaatagcttgtttattttcttttttattggtTTT
TGAATCTTAATGTTAACGATTGAGAACTTAAATCACTGGATTATTATTGT
CGTTTCATTATAGTTTTAATATATCGCCGAAAAAAAGTAgcattgaaaaa
tataaaaacagttcacaattattttattaattttcagaACCGCTTCTTAT
TTTGGTACCTGAAATTTTAGGTCACTTATTAcaattattgatatttttag
aCACGGTAGACTACAAAGTTGAAGTGGAAGAAGACGAAATCGGCATCGCA
CGAGAAGTGACAAAAGAGCCTTTGGAATTAGGATGTTCAGTTGAGTTTCT
CGAACTAGCTAATTTTATAATGGAAGAAGAAGGCTTACAAGCTCCGGAAA
ATGTTGACGAGGCAAAAATCCTATACTTTACCTTAACTGCGGTCATTCGT
AATGGGCATATATAAAGATATTGGTTATTTCTGCAGGCTCTAATATATTG
ATAGCTATTTTCTGATAATATAAAGTAATTTAATTGTGATCCTGATTGTA
GTAGTACACATTGTGCATAATATAATAAAGTTTGAGGAAAATTTATTGCT
CAAGAGGCGTAAGGAAATACcttaagtgtattaattttggcgggtactta
atttggtggattggaaaatttttggcacttggaaatcaaaaattttaatg
gttttaacttaaaaatggtgtttttcgatagaatttctatcctaaaaaga
ttttgttaaatttgacgggtatttaatttggcggacggccaatttttaaa
attttggcgggtatttaatttggcggattttaaAATCCGccaatttaatc
cccgccaaaattaatacacttaGGGTATTTTTGGCTAGCATGTTCTTAGC
TATATaacaatttaaaaactttttgggCATAATCTGGCTTCGTCGTTACA
GAGATGGAAAATGTTTTCAGGTAGATTGTACAAAATTTTTTCCACTCAAA
TATTTAacgaaaaatctaattttttcgccattttgatgacgtcaaagGAA
AGTGCTTTGGAGCTCAAACTTTGACCGATGGTCATTATCAAGATTTgaat
gagaaaaattaaaaagttgttcaaaaaattgatgacgtcaggaATTGCTT
AAAAA

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_415:300702..308006+

>TCONS_00064436 ID=TCONS_00064436|Name=TCONS_00064436|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=14076bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_415:300702..308006+ (Clytia hemisphaerica)
ATGAATAgaaacaACTTTATTATAAACTCGTTCCATCAAGGATTATCCTA
TAAGGAAATTTTGGCCTGTCTATTGAAGTCATTGAacttggttttaagCT
TACGACAACTAAAAAGAATATTGCGAGATAACAACTTGCGACGCAGAGGA
AACAACAATCAAGTGGCCATTGTAAATGCTATCCAGTCAGAGCTTCGTGG
AGATGGATGTAACCTTGGTTACAGAAGCATGCACCAAAAATTGATTCTTC
GCCATCACCTCAATACATCTCGGGAACAAGTAAGATTGTTATTGCTGCAC
TTAGACCCTCAAGGGGTGGaatcaagaaaaagaagaagattgaGAAGAAG
AACTTACCATTGCAGAGGACCAAATGATGTATGGCATATTGATGGTTATG
ATAAGCTCAAGCCTTATGGCTTTGCAGTCCATGGTTGTGTCGATGGCTAC
TCAAGGAAAGTGTTATGGTTAACTGTTGGCTCAACAAATAATGATCCAGA
AATTATTGCAAAGCATTATTTGGATTACGTATCAGAGATTAAAGGAACTG
CAAGACGAATTAGGGCTGACTGTGGAACGGAAAATTCAAATGTTGCTGGA
GTGCAGCGGTTTTTCCGATTGCATGCGGTAGATGAAGACGACAATTTTTC
GGGTTTAGAAAGTTTTTTGTATGGCAAATCGACGTCTAACCAGAGAATAG
AAGCATATTGGAGCAGGCTTAGGGGTGCTGCATCACAGTTCTGGATTAAT
CTTTtcaaaGACATGCGCGATGCAGGAGAGCTAGACGAAACAGATGATAT
CTACAGagaCTGCCTTCGATTCAGTTTTATGGGATTGGTACAACAATCTT
TAGATGATGCAAGACTACTGCATAACACACACCGAATTCGGCCATATCCT
TTGCAAGAATGCCCAAATGGGAAGCCAAATATCATTTATGGAATACCAGA
AGCTTATGaCACGGTAGACTACAAAGTTGAAGTGGAAGAAGACGAAATCG
GCATCGCACGAGAAGTGACAAAAGAGCCTTTGGAATTAGGATGTTCAGTT
GAGTTTCTCGAACTAGCTAATTTTATAATGGAAGAAGAAGGCTTACAAGC
TCCGGAAAATGTTGACGAGGCAAAAATCCTATACTTTACCTTAACTGCGG
TCATTCGTAATGGGCATATATAAATGAATAgaaacaACTTTATTATAAAC
TCGTTCCATCAAGGATTATCCTATAAGGAAATTTTGGCCTGTCTATTGAA
GTCATTGAacttggttttaagCTTACGACAACTAAAAAGAATATTGCGAG
ATAACAACTTGCGACGCAGAGGAAACAACAATCAAGTGGCCATTGTAAAT
GCTATCCAGTCAGAGCTTCGTGGAGATGGATGTAACCTTGGTTACAGAAG
CATGCACCAAAAATTGATTCTTCGCCATCACCTCAATACATCTCGGGAAC
AAGTAAGATTGTTATTGCTGCACTTAGACCCTCAAGGGGTGGaatcaaga
aaaagaagaagattgaGAAGAAGAACTTACCATTGCAGAGGACCAAATGA
TGTATGGCATATTGATGGTTATGATAAGCTCAAGCCTTATGGCTTTGCAG
TCCATGGTTGTGTCGATGGCTACTCAAGGAAAGTGTTATGGTTAACTGTT
GGCTCAACAAATAATGATCCAGAAATTATTGCAAAGCATTATTTGGATTA
CGTATCAGAGATTAAAGGAACTGCAAGACGAATTAGGGCTGACTGTGGAA
CGGAAAATTCAAATGTTGCTGGAGTGCAGCGGTTTTTCCGATTGCATGCG
GTAGATGAAGACGACAATTTTTCGGGTTTAGAAAGTTTTTTGTATGGCAA
ATCGACGTCTAACCAGAGAATAGAAGCATATTGGAGCAGGCTTAGGGGTG
CTGCATCACAGTTCTGGATTAATCTTTtcaaaGACATGCGCGATGCAGGA
GAGCTAGACGAAACAGATGATATCTACAGagaCTGCCTTCGATTCAGTTT
TATGGGATTGGTACAACAATCTTTAGATGATGCAAGACTACTGCATAACA
CACACCGAATTCGGCCATATCCTTTGCAAGAATGCCCAAATGGGAAGCCA
AATATCATTTATGGAATACCAGAAGCTTATGaCACGGTAGACTACAAAGT
TGAAGTGGAAGAAGACGAAATCGGCATCGCACGAGAAGTGACAAAAGAGC
CTTTGGAATTAGGATGTTCAGTTGAGTTTCTCGAACTAGCTAATTTTATA
ATGGAAGAAGAAGGCTTACAAGCTCCGGAAAATGTTGACGAGGCAAAAAT
CCTATACTTTACCTTAACTGCGGTCATTCGTAATGGGCATATATAAATGA
ATAgaaacaACTTTATTATAAACTCGTTCCATCAAGGATTATCCTATAAG
GAAATTTTGGCCTGTCTATTGAAGTCATTGAacttggttttaagCTTACG
ACAACTAAAAAGAATATTGCGAGATAACAACTTGCGACGCAGAGGAAACA
ACAATCAAGTGGCCATTGTAAATGCTATCCAGTCAGAGCTTCGTGGAGAT
GGATGTAACCTTGGTTACAGAAGCATGCACCAAAAATTGATTCTTCGCCA
TCACCTCAATACATCTCGGGAACAAGTAAGATTGTTATTGCTGCACTTAG
ACCCTCAAGGGGTGGaatcaagaaaaagaagaagattgaGAAGAAGAACT
TACCATTGCAGAGGACCAAATGATGTATGGCATATTGATGGTTATGATAA
GCTCAAGCCTTATGGCTTTGCAGTCCATGGTTGTGTCGATGGCTACTCAA
GGAAAGTGTTATGGTTAACTGTTGGCTCAACAAATAATGATCCAGAAATT
ATTGCAAAGCATTATTTGGATTACGTATCAGAGATTAAAGGAACTGCAAG
ACGAATTAGGGCTGACTGTGGAACGGAAAATTCAAATGTTGCTGGAGTGC
AGCGGTTTTTCCGATTGCATGCGGTAGATGAAGACGACAATTTTTCGGGT
TTAGAAAGTTTTTTGTATGGCAAATCGACGTCTAACCAGAGAATAGAAGC
ATATTGGAGCAGGCTTAGGGGTGCTGCATCACAGTTCTGGATTAATCTTT
tcaaaGACATGCGCGATGCAGGAGAGCTAGACGAAACAGATGATATCTAC
AGagaCTGCCTTCGATTCAGTTTTATGGGATTGGTACAACAATCTTTAGA
TGATGCAAGACTACTGCATAACACACACCGAATTCGGCCATATCCTTTGC
AAGAATGCCCAAATGGGAAGCCAAATATCATTTATGGAATACCAGAAGCT
TATGaCACGGTAGACTACAAAGTTGAAGTGGAAGAAGACGAAATCGGCAT
CGCACGAGAAGTGACAAAAGAGCCTTTGGAATTAGGATGTTCAGTTGAGT
TTCTCGAACTAGCTAATTTTATAATGGAAGAAGAAGGCTTACAAGCTCCG
GAAAATGTTGACGAGGCAAAAATCCTATACTTTACCTTAACTGCGGTCAT
TCGTAATGGGCATATATAAATGAATAgaaacaACTTTATTATAAACTCGT
TCCATCAAGGATTATCCTATAAGGAAATTTTGGCCTGTCTATTGAAGTCA
TTGAacttggttttaagCTTACGACAACTAAAAAGAATATTGCGAGATAA
CAACTTGCGACGCAGAGGAAACAACAATCAAGTGGCCATTGTAAATGCTA
TCCAGTCAGAGCTTCGTGGAGATGGATGTAACCTTGGTTACAGAAGCATG
CACCAAAAATTGATTCTTCGCCATCACCTCAATACATCTCGGGAACAAGT
AAGATTGTTATTGCTGCACTTAGACCCTCAAGGGGTGGaatcaagaaaaa
gaagaagattgaGAAGAAGAACTTACCATTGCAGAGGACCAAATGATGTA
TGGCATATTGATGGTTATGATAAGCTCAAGCCTTATGGCTTTGCAGTCCA
TGGTTGTGTCGATGGCTACTCAAGGAAAGTGTTATGGTTAACTGTTGGCT
CAACAAATAATGATCCAGAAATTATTGCAAAGCATTATTTGGATTACGTA
TCAGAGATTAAAGGAACTGCAAGACGAATTAGGGCTGACTGTGGAACGGA
AAATTCAAATGTTGCTGGAGTGCAGCGGTTTTTCCGATTGCATGCGGTAG
ATGAAGACGACAATTTTTCGGGTTTAGAAAGTTTTTTGTATGGCAAATCG
ACGTCTAACCAGAGAATAGAAGCATATTGGAGCAGGCTTAGGGGTGCTGC
ATCACAGTTCTGGATTAATCTTTtcaaaGACATGCGCGATGCAGGAGAGC
TAGACGAAACAGATGATATCTACAGagaCTGCCTTCGATTCAGTTTTATG
GGATTGGTACAACAATCTTTAGATGATGCAAGACTACTGCATAACACACA
CCGAATTCGGCCATATCCTTTGCAAGAATGCCCAAATGGGAAGCCAAATA
TCATTTATGGAATACCAGAAGCTTATGaCACGGTAGACTACAAAGTTGAA
GTGGAAGAAGACGAAATCGGCATCGCACGAGAAGTGACAAAAGAGCCTTT
GGAATTAGGATGTTCAGTTGAGTTTCTCGAACTAGCTAATTTTATAATGG
AAGAAGAAGGCTTACAAGCTCCGGAAAATGTTGACGAGGCAAAAATCCTA
TACTTTACCTTAACTGCGGTCATTCGTAATGGGCATATATAAATGAATAg
aaacaACTTTATTATAAACTCGTTCCATCAAGGATTATCCTATAAGGAAA
TTTTGGCCTGTCTATTGAAGTCATTGAacttggttttaagCTTACGACAA
CTAAAAAGAATATTGCGAGATAACAACTTGCGACGCAGAGGAAACAACAA
TCAAGTGGCCATTGTAAATGCTATCCAGTCAGAGCTTCGTGGAGATGGAT
GTAACCTTGGTTACAGAAGCATGCACCAAAAATTGATTCTTCGCCATCAC
CTCAATACATCTCGGGAACAAGTAAGATTGTTATTGCTGCACTTAGACCC
TCAAGGGGTGGaatcaagaaaaagaagaagattgaGAAGAAGAACTTACC
ATTGCAGAGGACCAAATGATGTATGGCATATTGATGGTTATGATAAGCTC
AAGCCTTATGGCTTTGCAGTCCATGGTTGTGTCGATGGCTACTCAAGGAA
AGTGTTATGGTTAACTGTTGGCTCAACAAATAATGATCCAGAAATTATTG
CAAAGCATTATTTGGATTACGTATCAGAGATTAAAGGAACTGCAAGACGA
ATTAGGGCTGACTGTGGAACGGAAAATTCAAATGTTGCTGGAGTGCAGCG
GTTTTTCCGATTGCATGCGGTAGATGAAGACGACAATTTTTCGGGTTTAG
AAAGTTTTTTGTATGGCAAATCGACGTCTAACCAGAGAATAGAAGCATAT
TGGAGCAGGCTTAGGGGTGCTGCATCACAGTTCTGGATTAATCTTTtcaa
aGACATGCGCGATGCAGGAGAGCTAGACGAAACAGATGATATCTACAGag
aCTGCCTTCGATTCAGTTTTATGGGATTGGTACAACAATCTTTAGATGAT
GCAAGACTACTGCATAACACACACCGAATTCGGCCATATCCTTTGCAAGA
ATGCCCAAATGGGAAGCCAAATATCATTTATGGAATACCAGAAGCTTATG
aCACGGTAGACTACAAAGTTGAAGTGGAAGAAGACGAAATCGGCATCGCA
CGAGAAGTGACAAAAGAGCCTTTGGAATTAGGATGTTCAGTTGAGTTTCT
CGAACTAGCTAATTTTATAATGGAAGAAGAAGGCTTACAAGCTCCGGAAA
ATGTTGACGAGGCAAAAATCCTATACTTTACCTTAACTGCGGTCATTCGT
AATGGGCATATATAAATGAATAgaaacaACTTTATTATAAACTCGTTCCA
TCAAGGATTATCCTATAAGGAAATTTTGGCCTGTCTATTGAAGTCATTGA
acttggttttaagCTTACGACAACTAAAAAGAATATTGCGAGATAACAAC
TTGCGACGCAGAGGAAACAACAATCAAGTGGCCATTGTAAATGCTATCCA
GTCAGAGCTTCGTGGAGATGGATGTAACCTTGGTTACAGAAGCATGCACC
AAAAATTGATTCTTCGCCATCACCTCAATACATCTCGGGAACAAGTAAGA
TTGTTATTGCTGCACTTAGACCCTCAAGGGGTGGaatcaagaaaaagaag
aagattgaGAAGAAGAACTTACCATTGCAGAGGACCAAATGATGTATGGC
ATATTGATGGTTATGATAAGCTCAAGCCTTATGGCTTTGCAGTCCATGGT
TGTGTCGATGGCTACTCAAGGAAAGTGTTATGGTTAACTGTTGGCTCAAC
AAATAATGATCCAGAAATTATTGCAAAGCATTATTTGGATTACGTATCAG
AGATTAAAGGAACTGCAAGACGAATTAGGGCTGACTGTGGAACGGAAAAT
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_040406	XLOC_040406	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
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Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
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Expression

Values :

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Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR012337	RNaseH-like_dom

Vocabulary: **Molecular Function**
Term	Definition
GO:0003676	nucleic acid binding

GO Annotation

GO Assignments

This transcript is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
molecular_function	GO:0003676	nucleic acid binding

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00064436 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00064436 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00064436 (transcript) - C. hemisphaerica