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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00064642 ID=TCONS_00064642|Name=TCONS_00064642|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5240bp
gttaattgcactccaaaccatacgattactagtactaataaaataataaa
ataaaagataaaaagctATTTTGTCTAAGATAGGTACATAATGAGAGAAT
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aaacgacttataaaacgatggagagcgaccattgtattttctttgtttca
gaaaacaatggatgttctagctttgtccgcaaaggacaac Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_420:64101..69340+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00064642 ID=TCONS_00064642|Name=TCONS_00064642|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5240bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_420:64101..69340+ (Clytia hemisphaerica)
gttaattgcactccaaaccatacgattactagtactaataaaataataaa
ataaaagataaaaagctATTTTGTCTAAGATAGGTACATAATGAGAGAAT
TATTCAAAACAGAAGATCAATTAAACTTGCCGTGCCAAAAGAAGGCAAGC
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ATTCTGCAGCTCCTCTTGCAGTTGCAAGTTTTCCAGAGCTAGCTCCAGAT
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CGTTTCTTTATATTCCCAAGAAGGTTGATGTGGCAATAATCTTGCCATTG
CGTCAGCTCTTCTTGCAGTTGCAAGTTCTCCCTGGTAAATAGACATAATT
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aaacgacttataaaacgatggagagcgaccattgtattttctttgtttca
gaaaacaatggatgttctagctttgtccgcaaaggacaac
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00064642-exon-scaffold_420-1491911889:64101..69340 | TCONS_00064642-exon-scaffold_420-1491911889:64101..69340 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00064642-exon-scaffold_420-1510915933:64101..69340 | TCONS_00064642-exon-scaffold_420-1510915933:64101..69340 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00064642-exon-scaffold_420-1575043694:64101..69340 | TCONS_00064642-exon-scaffold_420-1575043694:64101..69340 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_420 | supercontig | scaffold_420:64101..69340 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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