TCONS_00065151 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00065151
Unique NameTCONS_00065151
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length4197

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00065151 ID=TCONS_00065151|Name=TCONS_00065151|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4197bp
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AGGGGTCTCAGACTTCTTACTTTACGCAGCAGGCAGGAGCTGAAGAGCTG
AATAGTTGGAAGATAATCATGGAAGAAAACTCGCAAGATGCCCTCGAGAT
TGATCCATATGATATTATTAATTATGGTGAAAATTTTGAGGAAGAGAACA
CACTGGAATTGCCCGTGGTTAATGATATATACACAAACAACATTCTTGAT
GATATTGCAATTCATCGTGATGTCAATATTACTCAACATGAACATGACGT
GTCCTTTGATCATAATAGTGACAATGACAATAATGGAATCGATGAAAACT
ACAATGATGATGATACTAATTATGACGCAGAAGAGGAAAATTTGTCTCTT
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AAATGTACGGAATGAAAAACTCAAATTGTTTGAAATGACTTTGGATGATT
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TGTGATTTAAGTGAGGACTTTGTCTCAGAAGTCACTGTGGAGGATATTGT
TGGTGAATCGAATAATGATGAAAACGATGAAACGGAATTAAATAGTGAAA
GCGGCGGTTCCTTTGGAAAAGATGGACCACTTTTTGAAGGTAGTGCTATC
ACAATTGCTGGAGCAATGATTCTCATCCTTTCTTATAGCATTCGTTTTTC
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CCGGTTCAAACGTGTAAAACAGAATGAGGAAGGAATCGAAGATATATATG
ATGGATCTTTATATCAGAATAACTGGTCAAAAGGTTGCAATCTTTCAAAC
CCGTACAACATTTCTTTCACTTGGAACACAGACGGTGTTCCATTGTTCAA
ATCGTCTAAAATCTCACTTTGGCCCATCTATCTTGTAATCAATGAACTGC
CACCAAATATACGTTACAAAAGTGAAAACATGATATTTGCTGGGGTGTGG
TACAGTAGTGCTAAACCCGTCACATGGATCTTCTTGGAATCTTTTGTAAA
GGAACTGAAAGAGTTGGAAGCTGGTGTAACAGTTCTTTTAAGACAGTCAA
GTGGTGGTATTGAGGAACTCAAATTGATTAAATGTTTTCTTTTGGTTGGA
ACTTTTGATCTGCCAGCTAAGTCTCTAATTTGTGCCTGCACCCAGTTCAA
CGGAATGTATGGGTGTAATAAGTGTTTACAAACTGGAAAGAGTGTTAAAG
TTTCCGCGAAGGGATCAGTTTGGACTTATCCTTTTGATACCAAGGATCCT
AATGGCCCTAAACGTAATCATGATGATGTTAAATCTGATGCTCTCAAAGG
TTTTCAGCAGGGTAAACCAGTGCAGGGAATGAAGTACCCAACTTGGCTGC
ATAGTTTGAGTGCTTACGATCTCGTGCAAAGTGTTGGAATAGACTACATG
CACGGGTTAGCATTGGGTGTTATGAAACTTCTACTTAAATTATGGTTTTC
AAAAGACTTCAAAAGTGAAAGTTTCTCTTCTCATGATAAGATCGATGTTT
TTGACAAACGCTTAGAAGGAATTAAACCACCAAATGAAATTTCCCGCTTA
CCTCGATCctactcaaaattttctaaggACTGGAAAGCTGCTGAATTTGC
AAATTTTCTATTGCTGTTTGGAATTCCAACGCTCATTGACATTTTGCCAA
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TGTCAAACATTCACCAACTAGTCCATTTGTGTGACGATGTCAGGGAGCTG
GGACCATTATGGACCCACTCTTGCTTCCCCTTTGAGGACAAAAACAAATT
TATATTAAACGTTATCCATGGGTCACAGAAAGTTGAATTCCAACTCACTT
CAGCTGTTAATCTAGTTCATTCCCTGCCGGAAATTGTAGAAAACACCATA
ATGAAAGATGAACTACTATATAACTTTTATCTTACTTTGAACAAACGGAA
GCCTGTGTTAGCAGATTCGGCTAAAATAGCAGAGAATATCTATGCGTTGG
GTAAGGTTGAAAGAAAGCAAATACCCGACCTCCTTACCGAACCACTAACC
AATTATTTGGGATATGCTCCAGCTCAAAAAGATGTTTTAGAATTTAAAAG
GATTTCAATCAGCGATAATAAATTCCATTCCACCTCATACACTCGTGTAT
TTCGTCGCGATTCTACGGTTGTGTCATATGGAAGTAAAAGCCATCGAAAT
TTTGGAAGGGTAATGctttattttcaatataatGAAGCAGATTCATCTCA
CACACTGGCTCTTCTACAACCCTTCAAAATTCTTAGTCAGGAATCACACA
TAATTATTGGAAGCTCTGATGAATTAGATTATGAATGTGTACCAGTTTCG
TCTATAATCAGTAAATTATGTTTTATTCGATATGGCGATCTGCAATTTCT
TGTTCACTTACCAAGAGACTATTAATATTACTATTTCAATCCGATTTTTC
atttacaaagtttttcttCTGGTATCTTTTAGGTTTGAGAGTTTGATCAG
AATTAATTCAGTCCTTTTATAGTCATATTTTCTGTTTTCGAGGCCCTTGA
TTGTTGGAAACGAgggattttcatgttctacactCTTTTGTGCGTAATTT
TgtgcatttttgattttttccaaacaaataaaaaaatctggAAAGTGTCT
AGTATATCACTGTAgtataatattttatgttttccTCAAGTACCCCTACA
actaagcacaaaagagtatcCTCACCCCCTATGAACGTTTTTATCTGGAA
GAGCCTGAGTACCCCTACAACTAAGCACAAAAGATCCTTCTTGGCCCAAC
ACCTGTTACACTTTGTCTCAATATTTTGGTTTTGACCTTATCTTAGGTAG
GTGTAATTCAAGTGATAAAGCTTGCATTTCTCTTAGTTGTAATTTATTTG
TTCGCTTTTTTAAtctcaattttcattttgaaaaaacgaaTTTCCCTTAG
CTTTTCCTAGTGTTTTTACCTTAAGGTATATTTACTGTTTCACTATTCTT
ACTATTATACTTCAGCATTAATTGACTGACAAACAAGGTTCTTTGGTCGG
TAGAGATAAGAGATTTTAAAGAGTCCGTCCGCTCTCCTTCGTGGATATTG
ATTTTTACAAGCCTCGTTTAAAACAAATGTTGTCTACTCCCAAAGCATTT
AAAAAATCTACAACAACTCTTCTGTCTAgattatacagggtgtccgtaAA
AAAAGTATCAAGTTTGATGACTAGACTTTTATACAAATTTAGCGAAACAC
acaaaaactttctactcataaaTGTGGTCGACTCGATATTTTTTACAGAC
ACCCTGTAGAGTAATAAAAGGATTGTTGGGCTTTTAACAAGTGTTCTCTT
TCATCACGTTTTTATATAGCATATAGGGTGAATTTTTGTTAGTTTATtcg
taatttaaaaaaaaattattgggctcttccagaaaaaattgggGTGGAgg
gtatattatttttttcaatgttctACCCCTGGTTCCCCCTCCCCTGGGAC
ACGTGTCTTACCTCTAGACAAGCGTTAAATCGACACTaaaatttacccct
ggacaaattCATCCAATGGACATGgcatttttaaggattttttcgatacc
cctggacaatatatcctcacCCCCTATGAACGTTTTtatctggaagagcc
cattgtcaCGATTTCTAATTTTCTATTCGGGATGTAGTTTTTATTCAAAG
ATGTCTGACATATtattataaaataaataaaattaattataaaatca
Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00065151-protein

>TCONS_00065151-protein ID=TCONS_00065151-protein|Name=TCONS_00065151-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=918bp
MEENSQDALEIDPYDIINYGENFEEENTLELPVVNDIYTNNILDDIAIHR
DVNITQHEHDVSFDHNSDNDNNGIDENYNDDDTNYDAEEENLSLAEQITE
HLGDADALDVENVRNEKLKLFEMTLDDFAHEQSIENLLDDEVGECDLSED
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ILILSYSIRFSLSGEAMSNLLLLIHILLPGGSKIPKTLYMFKKFFSQLKS
PMVFHEFCSYCFTEVQSKEIKICSNCCKEISKSKSYFIEFPIILQLKKFF
RRSDFFESLQYRFKRVKQNEEGIEDIYDGSLYQNNWSKGCNLSNPYNISF
TWNTDGVPLFKSSKISLWPIYLVINELPPNIRYKSENMIFAGVWYSSAKP
VTWIFLESFVKELKELEAGVTVLLRQSSGGIEELKLIKCFLLVGTFDLPA
KSLICACTQFNGMYGCNKCLQTGKSVKVSAKGSVWTYPFDTKDPNGPKRN
HDDVKSDALKGFQQGKPVQGMKYPTWLHSLSAYDLVQSVGIDYMHGLALG
VMKLLLKLWFSKDFKSESFSSHDKIDVFDKRLEGIKPPNEISRLPRSYSK
FSKDWKAAEFANFLLLFGIPTLIDILPNTYLEHFSFLSHAIHTLLRSSIL
PEQINDAEKKLFRFCKEFSKMYGARFELSNIHQLVHLCDDVRELGPLWTH
SCFPFEDKNKFILNVIHGSQKVEFQLTSAVNLVHSLPEIVENTIMKDELL
YNFYLTLNKRKPVLADSAKIAENIYALGKVERKQIPDLLTEPLTNYLGYA
PAQKDVLEFKRISISDNKFHSTSYTRVFRRDSTVVSYGSKSHRNFGRVML
YFQYNEADSSHTLALLQPFKILSQESHIIIGSSDELDYECVPVSSIISKL
CFIRYGDLQFLVHLPRDY
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_433:17566..22705+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00065151 ID=TCONS_00065151|Name=TCONS_00065151|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5140bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_433:17566..22705+ (Clytia hemisphaerica)
CGCAAGTCAAAGTTCAAGGCTAGTTATTCAATAGTGGTAAACTACTCATT AGGGGTCTCAGACTTCTTACTTTACGCAGCAGGCAGGAGCTGAAGAGCTG AATAGTTGGAAGATAATCATGGAAGAAAACTCGCAAGATGCCCTCGAGAT TGATCCATATGATATTATTAATTATGGTGAAAATTTTGAGGAAGAGAACA CACTGGAATTGCCCGTGGTTAATGATATATACACAAACAACATTCTTGAT GATATTGCAATTCATCGTGATGTCAATATTACTCAACATGAACATGACGT GTCCTTTGATCATAATAGTGACAATGACAATAATGGAATCGATGAAAACT ACAATGATGATGATACTAATTATGACGCAGAAGAGGAAAATTTGTCTCTT GCAGAACAAATAACAGAGCACTTGGGTAAAAAATAACAGTCCATTTTTTA TTATGGGGGCGTTTTGGGGGAGGTACttgggcaaaaaggggtacggggat gcttagaggatgagcagaagcctatgtGCGTGCAGAAGTCTATCATACAA CATGAAACTGACCGGTTTATACTGGACAAACTGTAGTTTCCTTTCCAAAA CAACGTAAATCCACTGTGCAACTTGCAGTAGTCAGTGTACTttgcaaaat gaaaatcaagatggcACCCTATACCATCCAAGAAATACATCATTTGCTCT CACTTAAGCGGTCATGGTGTTCAATATAAATTACTTAAAAAACTATATGT TATTCACTGCCCATATACAAAATGTTCCCTTATAAATTGGGATGTTAAAT ATTCTGGGTACGGTCCCGGGGGTGGGGGGGCAGTCGGTTTATAGACCGAC AGCATGTGCGGCGTAAAATTCAGTGCAGTAGAATTTACTGTAAAATCATA CCCTTttagtgcattttttcaaatactataaacccttacagtgcactaaa CTTTAAGGGTTTTTACCATTACTATTATTTACATGAAAAAGAGTGTCAAA GAAGTAACCAGAATCAAGGCGAGATTGAAGATTGGTATCACCTCCTTCAT CTTTAATTCAttctatttcattttttattagaGTTTGGAAATTTGCACTC TTACAatgtatttatcaaaaaacacacccttacagtgcatttcggtTACC TTGAAAAACACACACCCTTAGCTCCCGCACACGCCGTCTGTCATTTTGCC AGGCTGCCCTTCCCCTGGGGGTACGGTCTAGTTAGAATATATACCTAGAA TTATATTTCTACCTTACTAAGTTTCAATTTAAGTCCAGCAAACACAATAT GTACATGTTATATGGTATATTTTAATATTGATGACACTTTGATACAATTG TTTCTAATCAAATTTCAGGGGATGCAGATGCACTCGATGTTGAAAATGTA CGGAATGAAAAACTCAAATTGTTTGAAATGACTTTGGATGATTTCGCACA TGAGCAATCAATCGAAAATTTGCTGGATGATGAAGTTGGTGAATGTGATT TAAGTGAGGACTTTGTCTCAGAAGTCACTGTGGAGGATATTGTTGGTGAA TCGAATAATGATGAAAACGATGAAACGGAATTAAATAGTGAAAGCGGCGG TTCCTTTGGAAAAGATGGACCACTTTTTGAAGGTAGTGCTATCACAATTG CTGGAGCAATGATTCTCATCCTTTCTTATAGCATTCGTTTTTCTTTATCT GGTGAAGCTATGTCCAACTTGTTGCTTTTAATACACATTCTTCTACCAGG AGGCTCCAAAATACCTAAAACGCTCTACatgttcaaaaagtttttcagcc aattaaagAGCCCTAtggtttttcatgaattttgttCGTATTGCTTTACA GAAGTCCAgtctaaagaaataaaaatatgtaGTAACTGTTGTAAGGAAAT ATCAAAAAGCAAAAGCTATTTCATCGAATTTCCCATAATTCTGCAACTAA AGAAATTCTTTCGAAGATCAGATTTTTTCGAGAGTCTTCAATACCGGTTC AAACGTGTAAAACAGAATGAGGAAGGAATCGAAGATATATATGATGGATC TTTATATCAGAATAACTGGTCAAAAGGTTGCAATCTTTCAAACCCGTACA ACATTTCTTTCACTTGGAACACAGACGGTGTTCCATTGTTCAAATCGTCT AAAATCTCACTTTGGCCCATCTATCTTGTAATCAATGAACTGCCACCAAA TATACGTTACAAAAGTGAAAACATGATATTTGCTGGGGTGTGGTACAGTA GTGCTAAACCCGTCACATGGATCTTCTTGGAATCTTTTGTAAAGGAACTG AAAGAGTTGGAAGCTGGTGTAACAGTTCTTTTAAGACAGTCAAGTGGTGG TATTGAGGAACTCAAATTGATTAAATGTTTTCTTTTGGTTGGAACTTTTG ATCTGCCAGCTAAGTCTCTAATTTGTGCCTGCACCCAGTTCAACGGAATG TATGGGTGTAATAAGTGTTTACAAACTGGAAAGAGTGTTAAAGTTTCCGC GAAGGGATCAGTTTGGACTTATCCTTTTGATACCAAGGATCCTAATGGCC CTAAACGTAATCATGATGATGTTAAATCTGATGCTCTCAAAGGTTTTCAG CAGGGTAAACCAGTGCAGGGAATGAAGTACCCAACTTGGCTGCATAGTTT GAGTGCTTACGATCTCGTGCAAAGTGTTGGAATAGACTACATGCACGGGT TAGCATTGGGTGTTATGAAACTTCTACTTAAATTATGGTTTTCAAAAGAC TTCAAAAGTGAAAGTTTCTCTTCTCATGATAAGATCGATGTTTTTGACAA ACGCTTAGAAGGAATTAAACCACCAAATGAAATTTCCCGCTTACCTCGAT CctactcaaaattttctaaggACTGGAAAGCTGCTGAATTTGCAAATTTT CTATTGCTGTTTGGAATTCCAACGCTCATTGACATTTTGCCAAATACATA TTTGGAACACTTCTCTTTTCTAAGTCATGCTATCCACACACTTTTGAGAT CTTCAATTTTACCAGAACAAATAAATGATGCCGAGAAAAAGCTATTTAGA TTTTGTAAAGAATTCTCCAAAATGTATGGTGCTCGATTTGAACTGTCAAA CATTCACCAACTAGTCCATTTGTGTGACGATGTCAGGGAGCTGGGACCAT TATGGACCCACTCTTGCTTCCCCTTTGAGGACAAAAACAAATTTATATTA AACGTTATCCATGGGTCACAGAAAGTTGAATTCCAACTCACTTCAGCTGT TAATCTAGTTCATTCCCTGCCGGAAATTGTAGAAAACACCATAATGAAAG ATGAACTACTATATAACTTTTATCTTACTTTGAACAAACGGAAGCCTGTG TTAGCAGATTCGGCTAAAATAGCAGAGAATATCTATGCGTTGGGTAAGGT TGAAAGAAAGCAAATACCCGACCTCCTTACCGAACCACTAACCAATTATT TGGGATATGCTCCAGCTCAAAAAGATGTTTTAGAATTTAAAAGGATTTCA ATCAGCGATAATAAATTCCATTCCACCTCATACACTCGTGTATTTCGTCG CGATTCTACGGTTGTGTCATATGGAAGTAAAAGCCATCGAAATTTTGGAA GGGTAATGctttattttcaatataatGAAGCAGATTCATCTCACACACTG GCTCTTCTACAACCCTTCAAAATTCTTAGTCAGGAATCACACATAATTAT TGGAAGCTCTGATGAATTAGATTATGAATGTGTACCAGTTTCGTCTATAA TCAGTAAATTATGTTTTATTCGATATGGCGATCTGCAATTTCTTGTTCAC TTACCAAGAGACTATTAATATTACTATTTCAATCCGATTTTTCatttaca aagtttttcttCTGGTATCTTTTAGGTTTGAGAGTTTGATCAGAATTAAT TCAGTCCTTTTATAGTCATATTTTCTGTTTTCGAGGCCCTTGATTGTTGG AAACGAgggattttcatgttctacactCTTTTGTGCGTAATTTTgtgcat ttttgattttttccaaacaaataaaaaaatctggAAAGTGTCTAGTATAT CACTGTAgtataatattttatgttttccTCAAGTACCCCTACAactaagc acaaaagagtatcCTCACCCCCTATGAACGTTTTTATCTGGAAGAGCCTG AGTACCCCTACAACTAAGCACAAAAGATCCTTCTTGGCCCAACACCTGTT ACACTTTGTCTCAATATTTTGGTTTTGACCTTATCTTAGGTAGGTGTAAT TCAAGTGATAAAGCTTGCATTTCTCTTAGTTGTAATTTATTTGTTCGCTT TTTTAAtctcaattttcattttgaaaaaacgaaTTTCCCTTAGCTTTTCC TAGTGTTTTTACCTTAAGGTATATTTACTGTTTCACTATTCTTACTATTA TACTTCAGCATTAATTGACTGACAAACAAGGTTCTTTGGTCGGTAGAGAT AAGAGATTTTAAAGAGTCCGTCCGCTCTCCTTCGTGGATATTGATTTTTA CAAGCCTCGTTTAAAACAAATGTTGTCTACTCCCAAAGCATTTAAAAAAT CTACAACAACTCTTCTGTCTAgattatacagggtgtccgtaAAAAAAGTA TCAAGTTTGATGACTAGACTTTTATACAAATTTAGCGAAACACacaaaaa ctttctactcataaaTGTGGTCGACTCGATATTTTTTACAGACACCCTGT AGAGTAATAAAAGGATTGTTGGGCTTTTAACAAGTGTTCTCTTTCATCAC GTTTTTATATAGCATATAGGGTGAATTTTTGTTAGTTTATtcgtaattta aaaaaaaattattgggctcttccagaaaaaattgggGTGGAgggtatatt atttttttcaatgttctACCCCTGGTTCCCCCTCCCCTGGGACACGTGTC TTACCTCTAGACAAGCGTTAAATCGACACTaaaatttacccctggacaaa ttCATCCAATGGACATGgcatttttaaggattttttcgatacccctggac aatatatcctcacCCCCTATGAACGTTTTtatctggaagagcccattgtc aCGATTTCTAATTTTCTATTCGGGATGTAGTTTTTATTCAAAGATGTCTG ACATATtattataaaataaataaaattaattataaaatca

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_433:17566..22705+

>TCONS_00065151 ID=TCONS_00065151|Name=TCONS_00065151|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=5514bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_433:17566..22705+ (Clytia hemisphaerica)
ATGGAAGAAAACTCGCAAGATGCCCTCGAGATTGATCCATATGATATTAT
TAATTATGGTGAAAATTTTGAGGAAGAGAACACACTGGAATTGCCCGTGG
TTAATGATATATACACAAACAACATTCTTGATGATATTGCAATTCATCGT
GATGTCAATATTACTCAACATGAACATGACGTGTCCTTTGATCATAATAG
TGACAATGACAATAATGGAATCGATGAAAACTACAATGATGATGATACTA
ATTATGACGCAGAAGAGGAAAATTTGTCTCTTGCAGAACAAATAACAGAG
CACTTGGGGGATGCAGATGCACTCGATGTTGAAAATGTACGGAATGAAAA
ACTCAAATTGTTTGAAATGACTTTGGATGATTTCGCACATGAGCAATCAA
TCGAAAATTTGCTGGATGATGAAGTTGGTGAATGTGATTTAAGTGAGGAC
TTTGTCTCAGAAGTCACTGTGGAGGATATTGTTGGTGAATCGAATAATGA
TGAAAACGATGAAACGGAATTAAATAGTGAAAGCGGCGGTTCCTTTGGAA
AAGATGGACCACTTTTTGAAGGTAGTGCTATCACAATTGCTGGAGCAATG
ATTCTCATCCTTTCTTATAGCATTCGTTTTTCTTTATCTGGTGAAGCTAT
GTCCAACTTGTTGCTTTTAATACACATTCTTCTACCAGGAGGCTCCAAAA
TACCTAAAACGCTCTACatgttcaaaaagtttttcagccaattaaagAGC
CCTAtggtttttcatgaattttgttCGTATTGCTTTACAGAAGTCCAgtc
taaagaaataaaaatatgtaGTAACTGTTGTAAGGAAATATCAAAAAGCA
AAAGCTATTTCATCGAATTTCCCATAATTCTGCAACTAAAGAAATTCTTT
CGAAGATCAGATTTTTTCGAGAGTCTTCAATACCGGTTCAAACGTGTAAA
ACAGAATGAGGAAGGAATCGAAGATATATATGATGGATCTTTATATCAGA
ATAACTGGTCAAAAGGTTGCAATCTTTCAAACCCGTACAACATTTCTTTC
ACTTGGAACACAGACGGTGTTCCATTGTTCAAATCGTCTAAAATCTCACT
TTGGCCCATCTATCTTGTAATCAATGAACTGCCACCAAATATACGTTACA
AAAGTGAAAACATGATATTTGCTGGGGTGTGGTACAGTAGTGCTAAACCC
GTCACATGGATCTTCTTGGAATCTTTTGTAAAGGAACTGAAAGAGTTGGA
AGCTGGTGTAACAGTTCTTTTAAGACAGTCAAGTGGTGGTATTGAGGAAC
TCAAATTGATTAAATGTTTTCTTTTGGTTGGAACTTTTGATCTGCCAGCT
AAGTCTCTAATTTGTGCCTGCACCCAGTTCAACGGAATGTATGGGTGTAA
TAAGTGTTTACAAACTGGAAAGAGTGTTAAAGTTTCCGCGAAGGGATCAG
TTTGGACTTATCCTTTTGATACCAAGGATCCTAATGGCCCTAAACGTAAT
CATGATGATGTTAAATCTGATGCTCTCAAAGGTTTTCAGCAGGGTAAACC
AGTGCAGGGAATGAAGTACCCAACTTGGCTGCATAGTTTGAGTGCTTACG
ATCTCGTGCAAAGTGTTGGAATAGACTACATGCACGGGTTAGCATTGGGT
GTTATGAAACTTCTACTTAAATTATGGTTTTCAAAAGACTTCAAAAGTGA
AAGTTTCTCTTCTCATGATAAGATCGATGTTTTTGACAAACGCTTAGAAG
GAATTAAACCACCAAATGAAATTTCCCGCTTACCTCGATCctactcaaaa
ttttctaaggACTGGAAAGCTGCTGAATTTGCAAATTTTCTATTGCTGTT
TGGAATTCCAACGCTCATTGACATTTTGCCAAATACATATTTGGAACACT
TCTCTTTTCTAAGTCATGCTATCCACACACTTTTGAGATCTTCAATTTTA
CCAGAACAAATAAATGATGCCGAGAAAAAGCTATTTAGATTTTGTAAAGA
ATTCTCCAAAATGTATGGTGCTCGATTTGAACTGTCAAACATTCACCAAC
TAGTCCATTTGTGTGACGATGTCAGGGAGCTGGGACCATTATGGACCCAC
TCTTGCTTCCCCTTTGAGGACAAAAACAAATTTATATTAAACGTTATCCA
TGGGTCACAGAAAGTTGAATTCCAACTCACTTCAGCTGTTAATCTAGTTC
ATTCCCTGCCGGAAATTGTAGAAAACACCATAATGAAAGATGAACTACTA
TATAACTTTTATCTTACTTTGAACAAACGGAAGCCTGTGTTAGCAGATTC
GGCTAAAATAGCAGAGAATATCTATGCGTTGGGTAAGGTTGAAAGAAAGC
AAATACCCGACCTCCTTACCGAACCACTAACCAATTATTTGGGATATGCT
CCAGCTCAAAAAGATGTTTTAGAATTTAAAAGGATTTCAATCAGCGATAA
TAAATTCCATTCCACCTCATACACTCGTGTATTTCGTCGCGATTCTACGG
TTGTGTCATATGGAAGTAAAAGCCATCGAAATTTTGGAAGGGTAATGctt
tattttcaatataatGAAGCAGATTCATCTCACACACTGGCTCTTCTACA
ACCCTTCAAAATTCTTAGTCAGGAATCACACATAATTATTGGAAGCTCTG
ATGAATTAGATTATGAATGTGTACCAGTTTCGTCTATAATCAGTAAATTA
TGTTTTATTCGATATGGCGATCTGCAATTTCTTGTTCACTTACCAAGAGA
CTATTAAATGGAAGAAAACTCGCAAGATGCCCTCGAGATTGATCCATATG
ATATTATTAATTATGGTGAAAATTTTGAGGAAGAGAACACACTGGAATTG
CCCGTGGTTAATGATATATACACAAACAACATTCTTGATGATATTGCAAT
TCATCGTGATGTCAATATTACTCAACATGAACATGACGTGTCCTTTGATC
ATAATAGTGACAATGACAATAATGGAATCGATGAAAACTACAATGATGAT
GATACTAATTATGACGCAGAAGAGGAAAATTTGTCTCTTGCAGAACAAAT
AACAGAGCACTTGGGGGATGCAGATGCACTCGATGTTGAAAATGTACGGA
ATGAAAAACTCAAATTGTTTGAAATGACTTTGGATGATTTCGCACATGAG
CAATCAATCGAAAATTTGCTGGATGATGAAGTTGGTGAATGTGATTTAAG
TGAGGACTTTGTCTCAGAAGTCACTGTGGAGGATATTGTTGGTGAATCGA
ATAATGATGAAAACGATGAAACGGAATTAAATAGTGAAAGCGGCGGTTCC
TTTGGAAAAGATGGACCACTTTTTGAAGGTAGTGCTATCACAATTGCTGG
AGCAATGATTCTCATCCTTTCTTATAGCATTCGTTTTTCTTTATCTGGTG
AAGCTATGTCCAACTTGTTGCTTTTAATACACATTCTTCTACCAGGAGGC
TCCAAAATACCTAAAACGCTCTACatgttcaaaaagtttttcagccaatt
aaagAGCCCTAtggtttttcatgaattttgttCGTATTGCTTTACAGAAG
TCCAgtctaaagaaataaaaatatgtaGTAACTGTTGTAAGGAAATATCA
AAAAGCAAAAGCTATTTCATCGAATTTCCCATAATTCTGCAACTAAAGAA
ATTCTTTCGAAGATCAGATTTTTTCGAGAGTCTTCAATACCGGTTCAAAC
GTGTAAAACAGAATGAGGAAGGAATCGAAGATATATATGATGGATCTTTA
TATCAGAATAACTGGTCAAAAGGTTGCAATCTTTCAAACCCGTACAACAT
TTCTTTCACTTGGAACACAGACGGTGTTCCATTGTTCAAATCGTCTAAAA
TCTCACTTTGGCCCATCTATCTTGTAATCAATGAACTGCCACCAAATATA
CGTTACAAAAGTGAAAACATGATATTTGCTGGGGTGTGGTACAGTAGTGC
TAAACCCGTCACATGGATCTTCTTGGAATCTTTTGTAAAGGAACTGAAAG
AGTTGGAAGCTGGTGTAACAGTTCTTTTAAGACAGTCAAGTGGTGGTATT
GAGGAACTCAAATTGATTAAATGTTTTCTTTTGGTTGGAACTTTTGATCT
GCCAGCTAAGTCTCTAATTTGTGCCTGCACCCAGTTCAACGGAATGTATG
GGTGTAATAAGTGTTTACAAACTGGAAAGAGTGTTAAAGTTTCCGCGAAG
GGATCAGTTTGGACTTATCCTTTTGATACCAAGGATCCTAATGGCCCTAA
ACGTAATCATGATGATGTTAAATCTGATGCTCTCAAAGGTTTTCAGCAGG
GTAAACCAGTGCAGGGAATGAAGTACCCAACTTGGCTGCATAGTTTGAGT
GCTTACGATCTCGTGCAAAGTGTTGGAATAGACTACATGCACGGGTTAGC
ATTGGGTGTTATGAAACTTCTACTTAAATTATGGTTTTCAAAAGACTTCA
AAAGTGAAAGTTTCTCTTCTCATGATAAGATCGATGTTTTTGACAAACGC
TTAGAAGGAATTAAACCACCAAATGAAATTTCCCGCTTACCTCGATCcta
ctcaaaattttctaaggACTGGAAAGCTGCTGAATTTGCAAATTTTCTAT
TGCTGTTTGGAATTCCAACGCTCATTGACATTTTGCCAAATACATATTTG
GAACACTTCTCTTTTCTAAGTCATGCTATCCACACACTTTTGAGATCTTC
AATTTTACCAGAACAAATAAATGATGCCGAGAAAAAGCTATTTAGATTTT
GTAAAGAATTCTCCAAAATGTATGGTGCTCGATTTGAACTGTCAAACATT
CACCAACTAGTCCATTTGTGTGACGATGTCAGGGAGCTGGGACCATTATG
GACCCACTCTTGCTTCCCCTTTGAGGACAAAAACAAATTTATATTAAACG
TTATCCATGGGTCACAGAAAGTTGAATTCCAACTCACTTCAGCTGTTAAT
CTAGTTCATTCCCTGCCGGAAATTGTAGAAAACACCATAATGAAAGATGA
ACTACTATATAACTTTTATCTTACTTTGAACAAACGGAAGCCTGTGTTAG
CAGATTCGGCTAAAATAGCAGAGAATATCTATGCGTTGGGTAAGGTTGAA
AGAAAGCAAATACCCGACCTCCTTACCGAACCACTAACCAATTATTTGGG
ATATGCTCCAGCTCAAAAAGATGTTTTAGAATTTAAAAGGATTTCAATCA
GCGATAATAAATTCCATTCCACCTCATACACTCGTGTATTTCGTCGCGAT
TCTACGGTTGTGTCATATGGAAGTAAAAGCCATCGAAATTTTGGAAGGGT
AATGctttattttcaatataatGAAGCAGATTCATCTCACACACTGGCTC
TTCTACAACCCTTCAAAATTCTTAGTCAGGAATCACACATAATTATTGGA
AGCTCTGATGAATTAGATTATGAATGTGTACCAGTTTCGTCTATAATCAG
TAAATTATGTTTTATTCGATATGGCGATCTGCAATTTCTTGTTCACTTAC
CAAGAGACTATTAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_040856XLOC_040856Clytia hemisphaericagene
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00065151-proteinTCONS_00065151-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00065151-exon-scaffold_433-1491911889:17566..17990TCONS_00065151-exon-scaffold_433-1491911889:17566..17990Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00065151-exon-scaffold_433-1510915933:17566..17990TCONS_00065151-exon-scaffold_433-1510915933:17566..17990Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00065151-exon-scaffold_433-1575043694:17566..17990TCONS_00065151-exon-scaffold_433-1575043694:17566..17990Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00065151-exon-scaffold_433-1491911889:18934..22705TCONS_00065151-exon-scaffold_433-1491911889:18934..22705Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00065151-exon-scaffold_433-1510915933:18934..22705TCONS_00065151-exon-scaffold_433-1510915933:18934..22705Clytia hemisphaericaexon
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_433supercontigscaffold_433:17566..22705 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.47676 1.26657 2.04475 1.98076 3.86301 2.6734 2.89366 2.94457 2.04657 1.48572 2.9923 1.89593 2.08262 2.51305 1.57607 1.20889 2.22387 1.90976 0.832196 0.682813 2.89003 2.79414 2.60103 2.80984 3.41939 5.31921 0.451339 0.455644 1.42186 1.51907
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR004242Transposase_21
IPR009667DUF1258
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00065151 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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