|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00066178 ID=TCONS_00066178|Name=TCONS_00066178|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1272bp TTCATTTTCAGATCTCAAATCACTTTCAATATGAAAACATTAGCCGCCAT TTTAGCATTTGCTTCCATAGCAACAGGGTATACTTTACAGAACTACCAAA AATACAACGATCATTGTCACAGTCTAGAATGTCCACGTTACACTCTCCTT AATAAAACAGAAAACTATGAAGTCAGGAAATATGNGTCTAGAATGTCCAC GTTACACGCTCCTTAATAAAACAGAAAACTATGAAGTCAGGAAATATGAG AGTTTTAAATGGGCCACCGCTTCAAGTCACTCACAAACATTGGACTACAA GCAGGCAAGCAAGGACAACTTCATGAAACTCTTCCGATATATTTCTGGAG CCAACGAACAGAAACAGAAAGTGGAGATGACAGCTCCAGTTCTCGTTCAC ATCCCAGTAACTCAAGGACCTTTCTGTGCTCCTGATTTCACCATGCACTT CTTCGTACCATACAAATTTCAATCTAATCCACCAAAACCATTAAATAACT CTGATAAGGTCAGTATTATGGAGCTTCCAGAAATGACTGTTTTCGTTGCC TCATTCGGAGGTTGGATGGATCAAGAAAAAATCCAACAAAATGGACTCTT ACTTGGGAAAGCCCTTCAAGAAGATGGTATCGCGTTTGATGATTCCCAGA TGTTCACAGCTGGTTATGATTCACCTTTTAGATTGATTGGTAGACATAAT GAAATCATGTTTCTAcctaaagaaaatcaattcaGAGTTtagaattattt attttttgagcaaattttttATATTGTAGATCTAAtttttaatatatatt ttttctgtttCAGTTCTTAattttgtacacgtttttttatgataaCATTT TGAAGATAATATCGTAAAAAGACAAACTTGCAAGCCAACGCTTACTCGAT TCTCAACCTATATACAACCATTaccattttcagattttccgcAGCAAAAG AAATATCATAGCCGATGATCATTCGGtttatcaaaaacacaaatatattt catatatttttaaAGCTTGAAAAGGTACACCCCGTACCACACCCTGCTCA AGTGAACCTTCTCATACGGGGGGAATCTGTAAGCTCTGATATATGACttg catgttttttataagcataccgatgcctgaatttgtctaaaaaatataca tattacaagcatattacTGAGCTTGCTTTTGAGGTGTGTATACAGTACAC GGTCTTCATTCAACAAGTGTAGTAAACAAAAGTATCTTCAAACtgtattt taatttaaaaagaatacaagag Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00066178-protein >TCONS_00066178-protein ID=TCONS_00066178-protein|Name=TCONS_00066178-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=191bp
MKSGNMXLECPRYTLLNKTENYEVRKYESFKWATASSHSQTLDYKQASKD NFMKLFRYISGANEQKQKVEMTAPVLVHIPVTQGPFCAPDFTMHFFVPYK FQSNPPKPLNNSDKVSIMELPEMTVFVASFGGWMDQEKIQQNGLLLGKAL QEDGIAFDDSQMFTAGYDSPFRLIGRHNEIMFLPKENQFRV Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_451:1042611..1058731+ Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00066178 ID=TCONS_00066178|Name=TCONS_00066178|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16121bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_451:1042611..1058731+ (Clytia hemisphaerica) TTCATTTTCAGATCTCAAATCACTTTCAATATGAAAACATTAGCCGCCAT
TTTAGCATTTGCTTCCATAGCAACAGGGTATACTTTACAGAACTACCAAA
AATACAACGATCATTGTCACAGTCTAGAATGTCCACGTTACACTCTCCTT
AATAAAACAGAAAACTATGAAGTCAGGAAATATGNGTCTAGAATGTCCAC
GTTACACGCTCCTTAATAAAACAGAAAACTATGAAGTCAGGAAATATGAG
AGTTTTAAATGGGCCACCGCTTCAAGTCACTCACAAAGTAAGtaaacttt
tttaaagattttattcttgatatgcgtgagtcatttttctagcggaaata
ccctaaaaaagccgggattttacctctctctgttactaaaaatagaaata
cagaggtcaaaaaccggtgcttccgttaaaaaatatgaggtcatcttgac
ttacgcatatcaagaattagcACAAATGCGTGTtaacacacccctgtctt
aTAGCCCTAATGGATTTTTTTCCTtattggggataaaaattcctattgaa
atcccaatggggatagaaatggagtgcaatttttaaatataaaatttcgg
atggggatgaaatcaaagtcatttcTCATTGGGGCTGAAATTCTGGGGAc
ggaatttttgcaaaattttccagtggacaCAGGGGTATGTGTACCTTATT
AAAATctactttttctgaaaattttcagtAGAGTATTATGGAGTACCCAG
AAATGTGTGCCAGGCTTTACTTACGGCTTCTTCCCTTCCTGGTGACTGCT
GTTATATTTaatttggaaaagaaaaaaatcaaaagtcctCTTGGTTTCtg
gcaacctcgtccccgtgaacattatcagtaagcatcaaaaacgCTGATAA
TAAGCTGGGAAGGAGGTTGGGTTTCCGTacttatcggcgatccaaaaaat
atctgtaATCTGCTTGGTTAAAAGaatacaatatatcttgtattttacat
gtacgaAAAGATGTTATTGCATTGTAGCGctctcaggcaaattaaggcac
ATCCAAatttaccataattttttatcaccgtttccacttgtcatagcata
tcacttcatacatcgaaagaagccTATTGGAGTGTAGAACACTGGAATAA
CTGTGCCATAATTAATCTTTTcgcccaaaaaaagatattagacaaaaacc
aaaaaatgctgacgtcagcaaaacttgttttttgaataactccagtttgg
cttatggtatattcatgaaattttaacaaaagttgtatattaataatagg
aacatttttgcataattttttcttgcaaattttgctgacgtcagcagaaa
tcagcaaaatacgaaattttgcaattaagtgctgacgtcagcaaaatttc
aaaaattttctttttcaaaatgatccttttaatggtgtgcaactttggtc
taaatttcatgtttttaccataagccaaactggagttattcaaaaaacaa
gttttgctgacgtcagcattttttggtttttgcctaatatctttttttgg
gtgaaaaaNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNttaattatggcacagcaatt
ccagtgatctacactccaatacgcttctttcgatatatgaagtgatatgc
tatgataagtggaaacggtgataaaaaattgaggtaggtttgaaaaatct
ggacaggccttaatttgcctgagctagcagcaatctaacgtcactttgct
acaaaagtgcccaacaaaaagtacattttttcGATCACCGATGAACCAGT
TAAGGCGGTCCGATAActgtggggggcgtacggttttacggaaatcaggc
aaaattcttacggtatttcggaattctgaaattgtttcggtatcggaaac
ccgtgaatttttgcttcgaaatttcggtattataaagtttttatcccctt
ttttcggaattcatacatgaaaaatcaaaaattagtcaaaacgggggaaa
aaaccccaaaaatcggtatcggaattgcaagtatttttttacggaatttt
ggaaaaattctccggtatttcggaaatcgcaaaccccgtacgcccccccc
atAACTATAACATATTCTCCATTATTTCCCTTCTAGCATTGGACTACAAG
CAGGCAAGCAAGGACAACTTCATGAAACTCTTCCGATATATTTCTGGAGC
CAACGAACAGAAACAGAAAGTGGAGATGACAGCTCCAGTTCTCGTTCACA
TCCCAGTAACTCAAGGACCTTTCTGTGCTCCTGATTTCACCATGCACTTC
TTCGTACCATACAAATTTCAATCTAATCCACCAAAACCATTAAATAACTC
TGATAAGGTAACTTTAAGTGGGTagtacacctttttttataagaacattc
aaattttcgaagccttcggggTTTACAGCATTTCCAGGCACAGGGGAATG
AGCCTCCTGAAAAGGGGGTATACGgccttttttctggaaaagcccaatgt
tcttaaaatgttcttatttttaccaatttCTGAGTATTTGTgtccatttt
ccaaagaaatcataggtgttttaaagttttcaagccttaacttgttctta
acttgttcttaatattttagccttCGAAGCCTCAATGTTACccctgaaaa
taagaatatgatgAGAACAACTCTTCCCTCAAAGTGctaataaaaaataa
gaacaaatatTTTCGACTATTTTAAAAAGAAGAGTTGTGGAGATagccct
gtctcacagccccggtgtaACTTTTTTCGTCAGTGGGATAAAAACTCTTt
ctgaaatcccaatgggaatagaaattctatcgtttaaatgttttaaaggT
TAAGAAATCCAGTGGTGATGGTTTTGGTATGTAGCTttgaaacattgaat
ttcgataGGGACcaggggatgaaatcaaagtcattttcccAGTAGGGCTG
AAAATCCAGGGTATTtctccaccggggacgaaatttttgcctaattttcc
agtggggctggggcccGAGTGGGTCCGTGACACAGGGATGTGTTTATCCT
ATTGAAATCTACTTTCTCTAAAATTTCCAGGTCAGTATTATGGAGCTTCC
AGAAATGACTGTTTTCGTTGCCTCATTCGGAGGTTGGATGGATCAAGAAA
AAATCCAACAAAATGGACTCTTACTTGGGAAAGCCCTTCAAGAAGATGGT
ATCGCGTTTGATGATTCCCAGATGTTCACAGCTGGTTATGATTCACCTTT
TAGATTGATTGGTAGACATAATGAAATCATGTTTCTAcctaaagaaaatc
aattcaGAGTTtagaattatttattttttgagcaaattttttATATTGTA
GATCTAAtttttaatatatattttttctgtttCAGTTCTTAattttgtac
acgtttttttatgataaCATTNcagtggcggcctggcagggggtgcaggg
tgtgcagtgcaccacccagaaagatctgagaggggcgccaaaagagcttt
tcaagggggcgccaaaattttgttgatgtttaattgggcaatTTGGCACG
TTATAGCGCCCCCAGTAAACAAAATAACGTTAATTTTACATTGAAATAAT
GTTATATCTTAACATCACATTCACATCTAGTTTGCAAATTTTTATTATGT
CTGTTCTTGATGTCAATTTGATGTTATTCTGAAATATCATTTCAATGTTT
CACCCAGAGATTTGTTAAATGTTACTTGCAAACATAATTTAAACATTTCG
TTAGAATATAGTTTTAACATTTCATTCGAACATCATTTTAAAATATCCCT
TGAACATCATTTTAACATTTCATTCGAACAtcattttaacttattttttg
aacatcATTTTAACATATCCCTCGAGTATCATTTTAACATTTCTTTTAGA
CATCGATTTTACGTTTCATTTTGACATCAATCCTATGATATATGTTAACA
TAGATTTAACGTGTATGAGGGTATCTTGATTTGACGTGTTCATTTGTCCT
TTTTCTAAcatcacagatatcttatagtTTTGGTGTTTCTTGAACGTTAA
GTTTTGCCGAAATTTCGATTGCACATTTGGATGTTATTTTTGTTCTGGCT
CAAGTTTTGATTCTATGTTTGATCTAGACTTGAGTTTTATTCCTTTTGGA
ATACACGGAAAGTTGAAGTCTGGGTGTAGAAGGTATTATTGCAAGCAAGA
acgaaaagattttattttccaagttcattcttcttttttaataataGAGT
TATGATAAAAATGTCGATGACAAttaaatatttgataaaaaactaaCTAC
AATATTAAGTCTCATAGTAATCACCACAATCACCCACATAATCACTTTCA
ACTCGTTCAAGCAAGTCTTGGTTGGCCACTTCGTTATctaaagtagaaaa
aaataataaaagaatcACAAAAATGTGAATTGACAAATAATTCCATAGGT
AAATTTTACCAGGGAACATTTCACGGCCTTCAACTACACtgaccaaaata
ttattttcgtaATTTAACTTTATTTTGCCAAATCTGAATatgaaatgatt
ttgttttaaaGGATTAAAACGTATATCCGTGCATCTACGGTATTCTAAAA
GTTAGTTTTGCAGACTTTGGTAATTCAAAATATGATCGAGCAAATGCAAG
TGAATATACCCGAAATTTCTTGATGTGAATGAATTTTTCAACAATAAACA
TTTTCCCCGGATAACATTATCCTCGTGTTTCTCCCCGTTGAGGGAATGCT
GTCGGGTTTTTATCATAATATGACGATCTCTTTCATTTTCCCTCCTTTTT
CTCGAATTAAAAATTAGGAGACTTTGCGGACCCGGTGACCTCCCTCCCCA
CTACAGAAACTTTTTAACAACTGTTGTCCCTGTGATAAAAATACCCTTAA
ATTTCTTCCCTAGTGGGAATTCTTCACCGAAATCCCATCTCTATCgggaa
aaactttgaaatttttggacaGTGCACTGAATGTATGAGCTGTTAAGCTA
AAACTTATATCCATAACAACAAAAGTTCTTCTAccctttttggaatttta
gcNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNACATCAGGTAATGCAACGTTTAAAATACGCTAATATTACATCACATTA
GGATGTGAGataaaattgatgtaatctgAACGTCAAATTTACGTCATGTG
TTTACTGGGCCTTCTATgagtacaatgttaattttttttcgcctgcggcg
ctttatTTTACCCTCTTCCATcctttttcttcaactttttcaaaacttct
atCAATATTGAAACCtggtgtatccaccaggggttaaagagaatgtgtcg
cCCTTATGAATTGGGCGTATGAGAGTGCTCTTCCGCGGCCCGCTAGAAAT
GTTTGTTTGACGGATACGAAAGTCAGTTTTCATggaaatccaagatggcg
gctGTTGTTTCATTCGACATCTAAGTTTTGTTGCAAGAAGAGAAATTTAA
CATTATTTAGCAAACTCGATTCGACTCAAATTTATTGCTCATTTTCCCCT
AGCTAcaaatgctcacccccaaaatgagagattgccaaaatgatcaaaat
tttcgctgtggtttttgtggtcttatactgactaactttctccgttttag
aagatcttataagctgtttgacctttcttacaccaaaattttttgcctgc
ggcgccaaaatttgaaagaaCCCTTCTTCCCAACTTCTGCattttggggc
ctctttcagccatgacctttaatggagagtaaagtaagaccagcggcgca
aaagtttaaagattatcagGTAATTCTCCTGATAAGAGTTTTAGAAAGCA
AAAATCTAAATCGACTTACTAGGTATAAAATTTCGATTTCAAAGATtagg
ggcgttactttcaaccagtcactgctcttacagtttaacattttcactta
atgatggagggcgcaaataaggaaaaaaataccaggggcgccaatttcat
agtttgcaccaccaagaaaattaagccaggccgctactgaatatatattt
tttttgtttcagttcTTAattttgtacacgtttttttatgataaCATTTT
GAAGATAATATCGTAAAAAGACAAACTTGCAAGCCAACGCTTACTCGATT
CTCAACCTATATACAACCATTaccattttcagattttccgcAGCAAAAGA
AATATCATAGCCGATGATCATTCGGtttatcaaaaacacaaatatatttc
atatatttttaaAGCTTGAAAAGGTACACCCCGTACCACACCCTGCTCAA
GTGAACCTTCTCATACGGGGGGAATCTGTAAGCTCTGATATATGACttgc
atgttttttataagcataccgatgcctgaatttgtctaaaaaatatacat
attacaagcatattacTGAGCTTGCTTTTGAGGTGTGTATACAGTACACG
GTCTTCATTCAACAAGTGTAGTAAACAAAAGTATCTTCAAACtgtatttt
aatttaaaaagaatacaagag Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_451:1042611..1058731+ >TCONS_00066178 ID=TCONS_00066178|Name=TCONS_00066178|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=1728bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_451:1042611..1058731+ (Clytia hemisphaerica) ATGAAGTCAGGAAATATGNGTCTAGAATGTCCACGTTACACGCTCCTTAA TAAAACAGAAAACTATGAAGTCAGGAAATATGAGAGTTTTAAATGGGCCA CCGCTTCAAGTCACTCACAAACATTGGACTACAAGCAGGCAAGCAAGGAC AACTTCATGAAACTCTTCCGATATATTTCTGGAGCCAACGAACAGAAACA GAAAGTGGAGATGACAGCTCCAGTTCTCGTTCACATCCCAGTAACTCAAG GACCTTTCTGTGCTCCTGATTTCACCATGCACTTCTTCGTACCATACAAA TTTCAATCTAATCCACCAAAACCATTAAATAACTCTGATAAGGTCAGTAT TATGGAGCTTCCAGAAATGACTGTTTTCGTTGCCTCATTCGGAGGTTGGA TGGATCAAGAAAAAATCCAACAAAATGGACTCTTACTTGGGAAAGCCCTT CAAGAAGATGGTATCGCGTTTGATGATTCCCAGATGTTCACAGCTGGTTA TGATTCACCTTTTAGATTGATTGGTAGACATAATGAAATCATGTTTCTAc ctaaagaaaatcaattcaGAGTTtagATGAAGTCAGGAAATATGNGTCTA GAATGTCCACGTTACACGCTCCTTAATAAAACAGAAAACTATGAAGTCAG GAAATATGAGAGTTTTAAATGGGCCACCGCTTCAAGTCACTCACAAACAT TGGACTACAAGCAGGCAAGCAAGGACAACTTCATGAAACTCTTCCGATAT ATTTCTGGAGCCAACGAACAGAAACAGAAAGTGGAGATGACAGCTCCAGT TCTCGTTCACATCCCAGTAACTCAAGGACCTTTCTGTGCTCCTGATTTCA CCATGCACTTCTTCGTACCATACAAATTTCAATCTAATCCACCAAAACCA TTAAATAACTCTGATAAGGTCAGTATTATGGAGCTTCCAGAAATGACTGT TTTCGTTGCCTCATTCGGAGGTTGGATGGATCAAGAAAAAATCCAACAAA ATGGACTCTTACTTGGGAAAGCCCTTCAAGAAGATGGTATCGCGTTTGAT GATTCCCAGATGTTCACAGCTGGTTATGATTCACCTTTTAGATTGATTGG TAGACATAATGAAATCATGTTTCTAcctaaagaaaatcaattcaGAGTTt agATGAAGTCAGGAAATATGNGTCTAGAATGTCCACGTTACACGCTCCTT AATAAAACAGAAAACTATGAAGTCAGGAAATATGAGAGTTTTAAATGGGC CACCGCTTCAAGTCACTCACAAACATTGGACTACAAGCAGGCAAGCAAGG ACAACTTCATGAAACTCTTCCGATATATTTCTGGAGCCAACGAACAGAAA CAGAAAGTGGAGATGACAGCTCCAGTTCTCGTTCACATCCCAGTAACTCA AGGACCTTTCTGTGCTCCTGATTTCACCATGCACTTCTTCGTACCATACA AATTTCAATCTAATCCACCAAAACCATTAAATAACTCTGATAAGGTCAGT ATTATGGAGCTTCCAGAAATGACTGTTTTCGTTGCCTCATTCGGAGGTTG GATGGATCAAGAAAAAATCCAACAAAATGGACTCTTACTTGGGAAAGCCC TTCAAGAAGATGGTATCGCGTTTGATGATTCCCAGATGTTCACAGCTGGT TATGATTCACCTTTTAGATTGATTGGTAGACATAATGAAATCATGTTTCT AcctaaagaaaatcaattcaGAGTTtag
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1491911889:1042611..1042897 | TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1491911889:1042611..1042897 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1510915933:1042611..1042897 | TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1510915933:1042611..1042897 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1575043694:1042611..1042897 | TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1575043694:1042611..1042897 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1491911889:1044847..1045067 | TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1491911889:1044847..1045067 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1510915933:1044847..1045067 | TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1510915933:1044847..1045067 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1575043694:1044847..1045067 | TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1575043694:1044847..1045067 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1491911889:1045791..1046128 | TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1491911889:1045791..1046128 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1510915933:1045791..1046128 | TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1510915933:1045791..1046128 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1575043694:1045791..1046128 | TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1575043694:1045791..1046128 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1491911889:1058306..1058731 | TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1491911889:1058306..1058731 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1510915933:1058306..1058731 | TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1510915933:1058306..1058731 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1575043694:1058306..1058731 | TCONS_00066178-exon-scaffold_451-1575043694:1058306..1058731 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_451 | supercontig | scaffold_451:1042611..1058731 + |
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
Term | Definition |
IPR006917 | SOUL_haem-bd |
Blast
BLAST of TCONS_00066178 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: HEBP2 (Heme-binding protein 2 OS=Homo sapiens GN=HEBP2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 126.716 bits (317), Expect = 1.202e-33 Identity = 66/165 (40.00%), Postives = 98/165 (59.39%), Query Frame = 2
Query: 227 NYEVRKYESFKWATASSHSQTLDYKQASKDNFMKLFRYISGANEQKQKVEMTAPVLVHIPVTQGPFCAPDFTMHFFVPYKFQSNPPKPLNNSDKVSIMELPEMTVFVASFGGWMDQEKIQQNGLLLGKALQEDGIAFDDSQMFTAGYDSPFRLIGRHNEIMFLPK 721
+YE+R Y KW + S S +D+ A + F KL YI G NE++ K++MTAPV ++ GPF T+ ++P + Q +PP+PL + V I + EMTVFV SF G+ +K Q+ L L L+EDG FD+ +TAGY+SP +L+ R+NE+ + K
Sbjct: 37 SYEIRHYGPAKWVSTSVES--MDWDSAIQTGFTKLNSYIQGKNEKEMKIKMTAPVTSYVEPGSGPFSESTITISLYIPSEQQFDPPRPLESD--VFIEDRAEMTVFVRSFDGFSSAQKNQEQLLTLASILREDGKVFDEKVYYTAGYNSPVKLLNRNNEVWLIQK 197
The following BLAST results are available for this feature:
|